Atrato River
Западная Кордильера служит главным водоразделом между бассейнами Тихого и Атлантического океана. Западные склоны горного хребта относятся к тихоокеанскому региону Колумбии с впадающей в Тихий океан рекой Сан-Хуан, в качестве главной водной артерии; в то время как восточная часть массива принадлежит бассейну Карибского моря через реки Каука и Магдалена. Северная и северо-западная части хребта с реками Атрато и Сину также относятся к бассейну Атлантики. Западная Кордильера отделена от прибрежных гор Баудо долиной реки Атрато.