Lyme disease
ヤマトマダニは日本特有のボレリア属細菌である"Borrelia japonica"を保有する事で知られる。ただし、この菌は病原性の弱い弱毒菌、ないし無毒菌であると考えられている。また、ヤマトマダニはライム病を引き起こす病原菌である"B. burgdorferi"（広義）を媒介しないと考えられているが、2014年に台湾でライム病を引き起こすボレリアが本種から同定された。