自然系統
首批樹鴨亞科由卡爾·林奈於其著作《自然系統第10版》中描述，當中包括紅嘴樹鴨和黑嘴樹鴨。於1837年，威廉·約翰·斯溫森命名了樹鴨屬，以與其他水鳥分辨，其模式種是胸斑樹鴨，當時托馬斯·賀斯菲特以學名"Anas arcuata"稱之。