مملكة صقلية
ترجع أصول جامعة مالطا إلى "الكلية المالطية" (باللاتينية: Collegium Melitense)، التي تأسست سنة 1592 وكان يديرها اليسوعيون. وبعد قمع اليسوعيين في مملكة صقلية (التي كانت مالطا آنذاك من توابعها)، استولى مانويل بينتو دا فونسيكا ـ قائد فرسان مالطة ـ على ممتلكاتهم في مالطا، ومنها تلك الكلية، واستخدمت هذه الممتلكات في تأسيس جامعة بموجب مرسوم وقعه بينتو في 22 نوفمبر 1769.