Saratoga, New York
1777년 9월, 링컨은 새러토가 근처에 있던 호레이쇼 게이츠의 부대에 합류하여 새러토가 전투에 참전했다. 그러나 뒤꿈치에 머스켓 총알을 맞은 상처 때문에 새러토가 전투에서는 큰 역할을 하지 못했다. 이때의 상처로 한쪽 다리가 짧은 상태가 되었다. 이 상처가 아물자 링컨은 1778년 9월에 남부 방면 군의 지휘관에 임명되었다. 링컨은 1779년 10월 9일의 조지아의 사바나 공격에 참가, 사우스캐롤라이나의 찰스턴으로 철수를 하도록 만들었다. 링컨에게는 운이 나빴지만, 찰스턴 시내로 몰려 포위를 당했다.