Sotho people
Au début de l'année 1858 les tensions avec les Basotho s'accroissent et la guerre semble inévitable. Les finances de l'État libre sont basses et Boshof a de grandes difficultés à organiser les forces armées et à acheter des armes. Pour acheter cinquante fusils à six livres pièce, il doit demander à payer en six mois. Les tensions aboutissent à une déclaration de guerre des Boers aux Basotho, en ; c'est la guerre de Senekal, qui dure de mars à juin. L'assistance du Transvaal et l'intervention de la colonie du Cap semblent inévitables. Le gouvernement de l'État libre demande au gouverneur de la colonie du Cap, George Grey, de servir d'intermédiaire avec les Basotho. La médiation aboutit au traité d'Aliwal North du , qui définit les frontières entre l'État libre et les terres basotho, entre autres dispositions légales. En , Boshof fait savoir qu'il veut partir en congé au Natal pendant plusieurs mois et il finit par quitter Bloemfontein en , fatigué par son travail. Le traité signé avec les Basotho ne met pas fin aux escarmouches concernant les frontières. Une coopération plus étroite avec la colonie du Cap n'est pas à l'ordre du jour pour les Britanniques et, en outre, les partisans de l'union avec le Transvaal soutiennent Marthinus Wessel Pretorius, président du Transvaal, qu'ils veulent voir prendre la tête des deux républiques boers. Boshof ne revient pas de son congé et il remet sa démission définitive en .