U-Bahn Tokio
Zahlreiche Züge verkehren nicht von und nach Shinjuku, sondern werden im Yoyogi-Uehara auf die Chiyoda-Linie der U-Bahn Tokio durchgebunden. Diese wiederum leitet im Bahnhof Ayase auf die Jōban-Linie der JR East in Richtung Toride weiter, sodass manche Verbindungen Strecken dreier verschiedener Bahngesellschaften befahren. Ferner werden umsteigefreie Verbindungen zwischen Shinjuku und Hakone-Yumoto an der Hakone-Tozan-Linie angeboten. Zu den beiden Zweigstrecken (Enoshima- und Tama-Linie) sind durchgehende Zugläufe die Regel. Im Nahverkehr auf der Odawara-Linie gibt es eine Zweiteilung mit unterschiedlich dichtem Angebot, bei der üblicherweise in Hon-Atsugi umgestiegen werden muss.