Gordon Freeman
Частым аргументом в спорах было то, что эта критика основана на ожидании элементов из других шутеров от первого лица. Во время разработки "Doom 3" часто сравнивали с другой столь же ожидаемой игрой — "Half-Life 2". Кроме того, некоторые вовсе восприняли Doom 3 как её клон, обращая внимание на использование фонарика в качестве дубинки для ближнего боя, напоминающее принцип действия монтировки. Также было заострено внимание на сходство в сюжете — морпех, как и Гордон Фримен, путешествовал из одного измерения в другое, а во время игры встречаются выжившие учёные и сотрудники базы. В дополнении "" появилось новое оружие — гравихват, напоминающий гравипушку из Half-Life 2, из-за которого начали обвинять id Software в плагиате.