髄膜炎菌
形質転換は高度に進化した複雑なプロセスであり、細菌の表面や膜、細胞質にある複数のタンパク質が、形質転換するDNAと相互作用している。"Neisseria"属には、制限修飾系が数多く存在することが知られている。例えば"N. meningitidis"では複数のタイプII制限修飾系が知られており、サブ系統によってその特異性が異なっている。この特異性は、クレード間における形質転換を阻害する、バリアのような役割を果たす。ルリアは自伝で、このような制限修飾系の機能を「不親切の極端な例」(”an extreme instance of unfriendliness”)と呼んだ。今日では、このような制限修飾系がもたらす効果は、髄膜炎菌における系統的隔離および種分化の主要な推進力になっていると考えられている。CaugantとMaiden は、髄膜炎菌が持つ制限修飾系が、非常に近縁な系統との遺伝的交換を可能にすると同時に、異なる系統に属する髄膜炎菌間の遺伝的交換を減らす（ただし完全ではない）可能性があることを示唆した。このような理由から、制限修飾系は利己的な遺伝的要素とみなされることもあり、系統の独立性の維持に貢献していると考えられる。