세종대학교
2003년 세종대학교 조교수가 된 뒤, 2003년 3월부터 2019년 4월까지 세종대학교에서 행정학과 교수로 근무했고 2003년 3월부터 2007년 8월 세종대학교 산업대학원 교학부장, 부동산경영학과 주임교수로 활동했고, 2008년 3월부터 2009년 2월에는 세종대학교 도시부동산대학원 대학원 주임교수로 재직했다. 2014년 2월부터 같은 해 11월까지 한국도시연구소 소장을 역임했다. 변창흠은 2014년 11월에 박원순 서울특별시장에 의해 학자 출신으로는 처음으로 서울주택도시공사 사장으로 임명되면서 세간의 주목을 받았다. 하지만 각종 개혁 정책에도 불구하고 2017년 11월에 자신이 블랙리스트 논란에 연루되자 사임했다.