가고시마 본선
JR 큐슈의 역에는 규슈 신칸센 가고시마 루트와 재래선인 가고시마 본선, 호히 본선 합계 3개 노선이 운행하고 있다. 호히 본선은 이 역이 종점이지만, 열차 운행상은 이 역을 발차하는 열차가 하행, 이 역에 도착하는 열차가 상행으로 다루어진다. 재래선으로의 이 역의 소속 노선은 가고시마 본선이다. 또, 가고시마 본선 우토 역을 기점으로 하는 삼각선의 열차가 모두 이 역을 시발・종착으로서 운행되고 있어 2011년 9월 1일부터 당역-미스미 역간에 「아마쿠사미스미 선」이라는 애칭이 사용되고 있다.