데이터 마이닝
화학정보학의 기본적인 응용은 화합물과 관련된 정보를 저장하고 색인하고 정보를 검색하는 것이다. 저장된 정보를 효율적으로 검색하는 것은 데이터 마이닝, 정보검색, 정보 추출 및 기계 학습과 같은 정보과학에서 다루는 주제들을 포함한다. 관련 연구 주제는 다음과 같다: