サンフランシスコ海軍造船所
およそ1年半後、シーライオンは姉妹艦のパーチ ("USS Perch, SS-313") と共に輸送潜水艦への転換が指定された。1948年4月にサンフランシスコ海軍造船所に入渠し、8ヶ月間に及ぶ転換作業が行われた。この作業で魚雷発射管と前部エンジンは撤去され、前方機関室および前後の魚雷室は123名の兵士を収容できる様に変更された。また、それらのスペースは貨物室としても使用できる様設計された。士官室は作戦室として使用できる様設計変更され、司令塔は後方に拡張された。また、LVTを収容できる様、大きな円筒状の収容室が艦後方に装着された。