Джонни Кейдж
Несмотря на то, что игра стала хитом, некоторым фанатам МК не понравилось, то что из игры были исключены традиционные и популярные персонажи серии, такие, как Рейден, Джонни Кейдж, Рептилия и Скорпион. По сути, это была первая игра серии, в которой не было разноцветных ниндзя (Саб-Зиро не считается, так как его внешность была полностью изменена по сравнению с предыдущими играми серии). Такой подход к серии оказался невостребованным фанатами игры, и поэтому воины-ниндзя вернулись в обновлении Ultimate Mortal Kombat 3. Также многим фанам не понравились новые арены для битв, которыми стали улицы, метро и другие обычные для городов места, в отличие от арен из первых двух частей игры, в которых были сильны фэнтезийные и восточные мотивы.