Ejército de Liberación de Kosovo
Çeku pertenece a la etnia albanesa. Sirvió como oficial en el Ejército croata durante la guerra contra la secesión de la denominada República de la Krajina Serbia, y fue comandante militar del Ejército de Liberación de Kosovo durante la guerra de Kosovo en 1999, y luego mandó el Cuerpo de Protección de Kosovo bajo la administración de las Naciones Unidas de Kosovo.