Great Barrier Reef
运输事故也是一个紧迫的问题，因为有几条商业航运路线都经过大堡礁。大堡礁海洋公园管理局（Great Barrier Reef Marine Park Authority，GBRMPA）估计大约6000艘长度在50米（164英尺）以上的大船会经过大堡礁这条路线。从1985年到2001年，有11起船只相撞事故和20起船只搁浅在大堡礁内航线事故。人为失误是造成运输事故的主要原因。