Red deer
Le territoire communal est partiellement inclus dans la zone naturelle d'intérêt écologique, faunistique et floristique (ZNIEFF) des , classée également zone Natura 2000 et zone importante pour la protection des oiseaux (ZICO). D'une superficie de , elle couvre sur le territoire de Saint-Martin-Longueau le sud du village près du lieu-dit de "la" "Fontaine Froide". Cette ZNIEFF abrité plusieurs espèces protégées comme la Fougère des marais ("Thelypteris palustris"), le Jonc bulbeux ("Juncus bulbosus"), la Gentiane pneumonanthe ("Gentiana pneumonanthe"), la Bondrée apivore ("Pernis apivorus"), le Martin-pêcheur d'Europe ("Alcedo atthis") et le Cerf élaphe ("Cervus elaphus").