José II de Austria
En el siglo XVII el convento fue vuelto a la Orden Franciscana pero no era en buenas condiciones y seguía a arruinarse. En el año 1611 se cayeron las bóvedas encima de la iglesia de San Francisco y desde ese tiempo servía como cementerio.En el año 1782 (durante el gobierno de José II de Austria) el convento fue cancelado y vendido. Nuevos dueños reconstruyeron el convento a pequeňos pisos para pobres, almacenes y talleres.