Депортиво Мальдонадо
По итогам чемпионата 2010 года, в котором Виллиан Жозе забил 6 голов, «Гремио Баруэри» вылетел из Серии А, а футболист стал игроком уругвайского «Депортиво Мальдонадо», который впоследствии многократно отдавал его в аренду бразильским и испанским клубам. В феврале 2011 года Виллиан Жозе присоединился к «Сан-Паулу». В первом сезоне там он уступал место в стартовом составе Луису Фабиано и Дагоберто.