Atalanta B.C.
ولد ماركو موتا في مدينة ميراتي في إقليم لومبارديا الإيطالية، وبدأ مسيرته الكروية مع نادي أتالانتا عام 2003 ليشارك مع فريق شباب أتالانتا. وكان أول ظهور لماركو موتا في الدوري الإيطالي بتاريخ 9 يناير 2005 ضد نادي روما عندما دخل بديلا لريكاردو مونتوليفو في الدقيقة الـ 65.