Kungliga Vitterhets Historie och Antikvitets Akademien
Holm war seit 1867 Mitglied der Königlich Dänischen Akademie der Wissenschaften und seit 1904 korrespondierendes Mitglied der Preußischen Akademie der Wissenschaften. Auch der schwedischen Kungliga Vitterhets Historie och Antikvitets Akademien, der Königlichen Gesellschaft der Wissenschaften in Uppsala und der Norwegischen Akademie der Wissenschaften gehörte er an.