مملكة نافارا
سعى زوجها خلال هذه الفترة الذي رجع مرة أُخرى إلى العقيدة البروتستانتية إلى أن تنضم مارغريت إليه في مملكة نافارا، ومع ذلك رفضت والدتها وشقيقها هنري حول ذهابها إلى نافارا، خوفاً من أن تصبح رهينة في يد الهوغونوتيين أو أن تقوم بتجديد التحالف بين زوجها ودوق ألونسون، ومع ذلك تم إقناع والدتها كاثرين بأن هذا يمكن أن يدفع تغيير زوجها دينه مرة أخرى واستخدم ابنتها كطعم لجذبه إلى باريس.