University of Kansas
2008年，马库斯·莫里斯同哥哥马基夫·莫里斯一起进入堪萨斯大学，在大一赛季他可以得到7.4分和4.7个篮板，篮板数排在大十二联盟大一新生中的第一位。第二年他能得到12.8分6.1个篮板，56.1%的命中率也排在大十二联盟球员中的第一位，帮助堪萨斯大学获得大十二联盟锦标赛的冠军。2010年3月18日，NCAA第一轮对阵理海大学，15投12中砍下26分10个篮板帮助球队获胜，也入选了大十二联盟最佳阵容第二队。