Chinese Civil War
La commune de Wuqiu faisait partie, à l'origine, du comté de Putian dans lequel bon nombre de ses habitants émigrèrent. Après la fin de la Guerre civile chinoise en 1949, Wuqiu fut déconnectée de Putian et en elle fut provisoirement réaffectée au comté de Kinmen. Dès la création du Comité des Affaires Militaires en , la commune a vu l'établissement d'une base militaire solide et complète. Le contrôle de l'archipel et des autres îles environnantes fut partagé entre le Kuomintang et les guerillas anti-communistes.