阿克萨清真寺
许多穆斯林，以生活在阿拉伯国家的穆斯林为主，视第三圣殿的修建为对伊斯兰教的公然冒犯。因为圣殿山上已有阿克萨清真寺和圆顶清真寺存在，而犹太人则认为阿克萨清真寺立于原圣殿的废墟上。今天大部分穆斯林将这一地区视为圣地，并坚持认为自己对这一地区拥有主权，甚至否认圣殿山与犹太教圣殿的任何联系进而拒绝承认犹太人进入这一地区的权利。自东耶路撒冷被以色列当局占领以来，穆斯林中的原教旨主义者常常呼吁对进入圣殿山的非穆斯林教徒使用武力。