Prince of Wales
1788年國王再次發病，夏洛特嚇壞了。范妮·伯尼說她曾聽到王后喃喃自語：“我又會變成什麼樣子呢？”（What will become of me?）。後來威爾士親王（即她的大兒子喬治四世）告訴她國王將被安排到邱居住，而她則要住到女王宮或溫莎去，虽然最終她堅持與國王同行，但國王發病期間就算在邱也不得不分居。威爾士親王和她之間因權力鬥爭產生了齟齬。夏洛特懷疑威爾士親王打算叫沃倫醫生宣佈國王已經發瘋并藉此奪取攝政權，而威爾士親王的大臣們則說夏洛特打算讓威利斯醫生先宣佈國王精神正常，在國王任命她為攝政後再宣佈其精神失常。1789年攝政法案正式宣佈若國王完全精神失常，則威爾士親王為攝政，但夏洛特擁有幼子撫養權和國王的看護權。藉助這個法案，夏洛特拒絕讓威爾士親王單獨與喬治三世見面。二人之間的矛盾在國王康復後依然愈演愈烈，她甚至沒有邀請威爾士親王參加國王康復後舉辦的慶祝音樂會。直到1791年3月夏洛特才與她的兒子和解。