Доминиканцы
В XIII веке базилика стала главным храмом миланских доминиканцев, первые братья были направлены сюда в 1219 году самим святым Домиником. В 1227 году Сант-Эусторджо официально передана Ордену проповедников. Доминиканцы провели большую работу по восстановлению и расширению церкви. В XIV—XV веках с правой стороны от главного нефа к церкви были пристроены многочисленные капеллы знатных итальянских семейств, некоторые из которых признаны шедеврами ренессансного искусства.