Каноническое право
В то время в МСДУ в течение трех лет изучались следующие предметы: Богослужебный устав, Знаменное пение, История знаменного пения, Церковнославянский язык, Священное Писание Нового Завета, Священное Писание Ветхого Завета, Катехизис, Святоотеческое богословие, Патрология, История древней Церкви, История русской Церкви, История старообрядчества, Каноническое право, Религиоведение, Древнерусская литература, Старообрядческая литература, Церковное искусство, Церковная педагогика. В течение осеннего семестра 2006 года студенты старших курсов Московского Духовного училища изучали новую дисциплину «Введение в церковную журналистику».