旧约圣经
1895年，施约瑟夫妇再度回到上海。由于日本的印刷更有效率，1897年，施约瑟夫妇移居日本东京。1899年和1902年，他的北京官话旧约圣经和文理新旧约圣经先后在东京印行。此后他又准备制作串珠注释版。1906年10月15日，施约瑟因糖尿病而離世，享年75歲。