일본 열도
펭귄 마을의 유일한 학교인 펭귄 촌립 중학교는 시골 학교이기 때문에 학생 수가 적어 학년당 한 개의 학급만이 존재하며, 입학 시험이 없다. 물방개 섬의 존재는 시리즈 별로 조금씩 다르게 설정되어 있으나, 원작인 단행본에서는 물방개 섬을 일본 열도 앞바다에 위치한 섬으로 설정되어 있다.