Сан-Луис Кильота
В 2010 году Федерико перешёл в «О’Хиггинс». 31 января в матче против «Сан-Луис Кильота» он дебютировал за новую команду. По окончании сезона Эльдуайен покинул клуб и присоединился к «Унион Эспаньола». 11 сентября 2011 года в матче против «Коло-Коло» Федерико дебютировал в новой команде.