Депортиво Перейра
Летом 2013 года Аранго перешёл в «Униаутонома». 6 сентября в матче против «Депортиво Перейра» он дебютировал за новую команду. 10 сентября в поединке против «Боготы» Хоан забил свой первый гол за «Униаутонома». По итогам сезона Аранго помог клубу выйти в элиту.