Zambezi Region
Тогда же, в 1994, Мишаке Муйонго стал одним из основателей сепаратистской Армии освобождения Каприви. В своей политике Муйонго сделал акцент на расширение автономии Каприви, вплоть до полной независимости. Конфликт в Каприви обострился в 1998 году и в 1999 перерос в масштабные столкновения. Сепаратисты потерпели поражение.