미토콘드리아 DNA
미토콘드리아 DNA 분석에 의하면, 소노마나무밭쥐와 흰발밭쥐가 붉은나무밭쥐보다 더 근연 관계를 갖고 있다. 이와 같은 사실은 흰발밭쥐를 나무밭쥐속의 가장 기저 종으로 추정했던 이전의 제안과 상반된다.