ピール・ムハンマド
バラク・ハンの没後はアブドゥッラーフ2世が権力を握り、一族の最長老であった伯父のピール・ムハンマドをハン位に就かせ、1561年にピール・ムハンマドが亡くなると、父のイスカンダルをハン位に就かせて自らは陰で政権を牛耳った。1557年には首都をサマルカンドからブハラに遷す（ブハラ・ハン国）。1583年、イスカンダルが亡くなるとアブドゥッラーフ2世はついにハン位に就き、シャイバーニー朝の中央集権化を推し進めた。1584年にアム川上流のバダフシャンを占領すると、1588年にはヘラート、ホラーサーンを支配下に入れ、1593年/1594年にヒヴァ・ハン国領のホラズム地方を征服し、中央アジア南部をその版図とした。こうしてシャイバーニー朝の最盛期を築いたアブドゥッラーフ2世であったが、彼は1598年に亡くなる。