宋教仁
3月20日，宋教仁在上海滬寧車站遇刺，兩天後重傷不治。3月22日，孫在長崎獲悉宋教仁在上海被刺消息。暗殺宋教仁的人，從查獲之宋案兇手與北京來往電文中，有觀點認為主使行刺的是袁，而直接布置暗殺的則是國務總理趙秉鈞。也有觀點認為凶手是陳其美，還有觀點認為孫的嫌疑最重，以宋教仁被暗殺和善後大借款為藉口。