수인선
2012년 분당선 선릉 ~ 왕십리 연장 개통과 기흥 ~ 망포 연장 개통에 대비하여 도입되었으며, 중기형 35134 ~ 35140편성이 해당된다. 2011년 10월 ~ 2012년 4월까지 제작됐다. 바닥무늬가 동일 세대의 311000호대 초기 사양으로 변경되었고, 6량 중 M, T 각 1량씩을 한국철도공사 321000호대 전동차 6량화로 인해서 발생하는 잉여차량을 부수차로 전환 사용하여 각각 반입되었다. 그러나 코레일이 2014년까지 중앙선 잉여차량들을 원위치 시켜 321000호대 전동차 전 차량을 8량으로 재환원 한다는 계획을 발표하여 중앙선 잉여차량들이 분리되어 빠져 나감에 따라 휴차되었다가 2014년 4월부터 동년 7월까지 35134 ~ 35140편성 모두 2량씩 (총 14량) 신조되어 반입되었다. 수인선 직결 운행에 대비하여, ATS·ATC 자동 전환 시스템으로 개량하였다. 반입은 순차적으로 이어지지 않았는데, 2012년 3월 31일 35138편성이 반입되고 4월 14일 35134편성이 반입되었다. 신조차량 반입 역시 순차적으로 진행되지 않았다. 2014년 10월 7일 35135편성이, 10월 8일 35134편성이 반입되었다. 2013년 분당선 수원 연장과 2016년 수인선 오이도 ~ 인천 연장 개통에 대비하기 위하여 2013년에 도입되었으며 분당선 후기형 35141 ~ 35143편성과 수인선 후기형 35169 ~ 35172편성이 이에 해당된다. 각각 2013년 1~3, 7~10월까지 제작됐다. 헤드램프가 LED로 반입되었으며, 선두차 측면 코레일 로고 및 객실 안내 스티커가 변경되었다. 또한 분당선 및 수인선 직결 운행을 염두에 두고, ATC·ATS 자동 전환 시스템이 기 탑재되어 있다. 수인선 후기형 35169 ~ 35172편성은 중앙선 6량화로 인해 잉여객차가 환원되면서 35134 ~ 35140편성이 휴차되자 잠시 분당선에서 영업시운전을 진행한 바 있다.