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자바 EE는 자바의 기본적인 기능을 정의한 자바 SE에 웹 서버 역할을 추가한 것으로 자바 애플리케이션을 동작시킬 수 있는 컨테이너 등을 표준화한 스펙이다. 자바 EE 표준준수 웹 애플리케이션 서버는 자바 EE 스펙을 수용하는 웹 애플리케이션 서버이다.