Uzbek League
ウズベキスタンが独立を果たした1992年以降、クラブはウズベク・リーグに参加している。ナフバホールはFCブニョドコル、ネフチ・フェルガナと並び、2部に降格していない3つのクラブの一つである。1996年、ナフバホール・ナマンガンはウズベク・リーグで初優勝を果たした。また、1999年にはウズベキスタン・スーパーカップでも優勝を果たしている。