Zinc finger
Smoothened (Smo)は、12回膜貫通タンパク質であるPatched（パッチト）の下流にありヘッジホッグ（Hh）のシグナルがないときにはPatchedに抑制されているが、Patchedにヘッジホッグが結合するとPatchedの抑制が外れてSmoothenedが活性化し、ジンクフィンガー型転写因子のGli（ショウジョウバエではCubitus interruptus (Ci)）を賦活する。転写因子Gliの標的となる遺伝子としては、サイクリンD1・D2、N-Myc、Bcl-2、Vegf、Snail1、Elk2、PDGFRαなどがある。Smoothenedの活性化にはステロール類が必要であり、Smoothenedにステロールが結合すると活性型のコンフォメーションに変化すると考えられる。そのため、コレステロールの代謝に異常があるスミス・レムリ・オピッツ症候群ではヘッジホッグ経路に異常が生じる。