DNAリガーゼ
デオキシリボ核酸（DNA）の、アデニン (A) とチミン (T)、グアニン (G) とシトシン (C) が対をなして結合する特性と、DNA鎖を操作する酵素（様々な制限酵素や、DNAリガーゼ、DNAポリメラーゼ）を利用する。解答候補となる多数のDNA鎖を同時に生成するという意味で一種の超並列計算をする系である、と見る向きもある。