Bureau of Indian Affairs
Поуп вернулся на запад и с отличием служил во время Апачской войны. Он приобрёл себе политических врагов в Вашингтоне, высказываясь о том, что индейские резервации управлялись бы более эффективно, будь они в ведении военных, а не коррумпированного Бюро по делам индейцев. Он породил споры, призывая к лучшему и более гуманному отношению к коренным американцам. Вместе с тем записано множество его высказываний во время Индейских войн, где он призывает истреблять индейцев самым жестоким образом.