アメリカ戦略軍
艦隊総軍は、合衆国本土に本拠を置くこと、本土防衛部隊としての性格を有することから、作戦系統上は北アメリカ地域を管轄する地域別統合軍である北方軍の下に置かれているが、発足当初は同じくフォース・プロバイダーとしての役割を有する陸軍の陸軍総軍（FORSCOM）、空軍の航空戦闘軍団（ACC）、海兵隊の海兵隊総軍（MARFORCOM）とともに、特定の管轄地域を持たない機能別統合軍である統合戦力軍（USJFCOM）の下に置かれていた。2011年に統合戦力軍が廃止されたことにより現体制に改められ、現在に至っている。必要に応じアメリカ戦略軍とも協力を行う。