صلاح جديد
سرعان ما نشأ صراع على السلطة بين الفصيل المدني بقيادة عفلق والبيطار و منيف الرزاز واللجنة العسكرية بقيادة صلاح جديد و حافظ الأسد. مع تدهور العلاقات بين الفصيلين، نظمت اللجنة العسكرية انقلاب عام 1966، الذي أطاح بالقيادة الوطنية بقيادة الرزاز وعفلق وأنصارهم. قسم انقلاب عام 1966 حزب البعث بين حزب البعث (الفصيل العراقي) و حزب البعث (الفصيل السوري).