Kommunalfinanzen
Ecker hatte danach als Stadtrat mehrere Ämter in der Stadtverwaltung von Augsburg inne, unter anderem war er zuständig für Finanzen der Stadt (Kämmerer) sowie Personal und Sport. Außerdem war er in den Jahren 2006 bis 2012 Aufsichtsrat beim FC Augsburg. Ecker gilt als Fachmann für Kommunalfinanzen; seit 1990 ist er Experte für Kommunalfinanzen im Bayerischen Innenministerium, zudem gab er Fachveröffentlichungen heraus.