南海
日本與菲律賓關係主要因為日本海上經濟貿易與交通線會通過南海海域相關，日本為了確保在南海海域的海上航道安全與在南海的自由航行權，加強與南海海域相關國家的交流。南海海域相關東南亞國家因為中國針對南海島礁的軍事化建設引發南海爭議，南海周邊與中國發生島礁領土爭議衝突的菲律賓也期望透過日本的介入，平衡中國在南海的影響力。