Chen Shui-bian
이듬해인 2000년에 실시된 총통 선거에서 그는 겉으로는 국민당의 롄잔 후보를 지원했지만 실제로는 급진적 독립주의자인 민주진보당의 천수이볜 후보를 지지하였다. 이로 인해 그는 국민당에서 축출되었고 대만단결연맹이라는 정당을 창당하여 민주진보당 천수이볜에 협력한 바 있다. 퇴임 후에는 일본 야스쿠니 신사에 직접 참배하기까지도 해서 국민당과 그가 지원하던 민주진보당, 그리고 중화인민공화국 정부가 그의 야스쿠니 신사 참배를 강도높게 비난하기도 하였다.