基因表現
超級強化子會與許多與轉錄調控相關的蛋白結合，並常用於調控高表現量的基因表現與超級強化子相關的基因表現會特別對擾動敏感，可能控制細胞狀態的轉換，這也導致由超級強化子調控的基因常對影響轉錄的小分子較為敏感。