Tschadbecken
Koui liegt nahe der Grenze zu Kamerun auf einer Höhe von etwa im Quellgebiet eines Zuflusses des Logone Occidental, der in das Tschadbecken entwässert. Der Ort liegt inmitten des Yadé-Massiv, in dem auch der höchste Berg der Zentralafrikanischen Republik liegt.