Депортиво Мальдонадо
Аллан начал карьеру выступая за молодёжные составы клубов «Мадурейра», «Депортиво Мальдонадо» и «Васко да Гама». В 2009 году последние подписали с ним полноценный контракт. 5 сентября в матче против «Атлетико Гоияниенсе» Аллан дебютировал в Серии Б. В том же году он помог клубу выйти в Серию А. В 2011 году Аллан завоевал Кубок Бразилии в составе «Васко». 11 марта 2012 года в поединке против своего родного клуба «Мадурейра» он забил свой первый гол.