First Battle of Bull Run
ストーンは5月14日に第14アメリカ歩兵連隊の大佐に指名され、その年の8月には5月17日付けで北軍の准将に昇進した。6月から7月に掛けての第一次ブルランの戦いの作戦で、ロバート・パターソン少将のシェナンドー軍で1個旅団を指揮した。その秋にはポトマック川上流の浅瀬を警護する1個師団（監視軍団と呼ばれた）を指揮した。