性別重置手術
在失去外部器官后，幻肢是一种常见的，通常是痛苦的经历。Ramachandran（2008）发现，虽然近三分之二的順性別男性手术切除了阴茎后會有幻肢的現象，但是跨性別女性經歷性別重置手術后只有三分之一的人會有幻肢。然而，这项研究忽略了單純截肢及性別重置手術之間的差異。截肢時连接阴茎和大脑的神经會被切断，而性別重置手術中一些阴茎和阴囊可以再次使用以产生阴道腔，阴唇和阴蒂。在这种情况下，生殖器连接到大脑的神经會有一些保持完整的功能。三分之二的跨性別男性报告了从童年开始幻想阴茎的感觉，浮現出勃起和其他现象。