美國魚類及野生動物管理局
為了保護利金河流域棲息地的多樣性，（KDFWR）在2005年的一份報告內明確地把流域界定為三個鳥類優先保護區，以集中保護濕地鳥種、草地鳥種及林地鳥種。由於棲息地退化，加上河流渠道化及水壩建設、土地管理不善、入侵物種以及過度捕撈等因素，流域內淡水貽貝的數目正在下降。為了增加流域內淡水貽貝的種群數量，KDFWR會於魚類實驗室內養殖貽貝，並定期把牠們放入流域的各條溪流內。此外，KDFWR又把流域定為雙殼貝類保護區，以保護11種被聯邦政府列為稀有／瀕危物種的貽貝，以及一個被美國魚類及野生動物管理局評為河流流域內最後也是最好的貽貝種群。2007年，非牟利組織以美國魚類及野生動物管理局及肯塔基州自然保護區委員會的撥款，購入鄰近河流的約0.4平方公里（100英畝）的土地，以保護鄰近的淡水貽貝棲息地，並通過種植原生植物來恢復植被。美國農業部轄下的亦推出一項屬於自願參與性質的「濕地保護區計劃」，旨在為地主提供保護、恢復及增加其土地上濕地的機會。2008年，KDFWR把河流流域一部分指定為「特別關注區域」，以吸引地主參與計劃。