Свобода и Независимость
После возвращения в Польшу Францишек Непокульчицкий продолжил подпольную деятельность против коммунистических властей. Служил в качестве заместителя командира зоны Юг организации «Свобода и Независимость». В ноябре 1945 года был избран третьим Президентом организации «Свобода и Независимость».