大粛清
しかし、大粛清期に勢力をつけてきたトロフィム・ルイセンコとスターリンに批判される。マラーは1940年にアメリカに帰国したことで難を逃れたが、ヴァヴィロフはルイセンコの陰謀で大粛清による犠牲となった。マラーは帰国後にアマースト大学で教職に就き、マンハッタン計画の顧問となったが、1945年に任命を解かれる。