大雄寶殿
羅漢寺的主體建築為大雄寶殿，高三丈六尺（約12米），面積130平方米，在東涌新市鎮發展前，一海之隔的屯門也能看見。大雄寶殿供奉釋迦、彌陀和藥師。羅漢寺也設有觀音殿和地藏殿，以及名為海會塔的骨灰龕位。羅漢寺亦保留羅漢巖這個天然岩洞供奉十八羅漢，以及羅漢泉這個天然山泉。