UEFA Intertoto Cup
Jugando en una competición europea por primera vez en 1990, el Nea Salamina fue derrotado en la primera ronda por el Aberdeen Football Club. El equipo jugó en la Copa Intertoto de la UEFA en 1995 y 1997. En la Copa Intertoto de la UEFA 2000, el equipo se clasificó para la segunda ronda, con dos victorias contra el albanés KS Vllaznia Shkodër, pero fueron eliminados en Viena por el FK Austria Viena, 3–0.