과학부
2010년 기준으로 매니토바대학교만의 독특한 조직인 유니버시티 1(교양학부) 외에 농업·식품과학부, 농학스쿨, 건축학부, 예술스쿨, 클레이턴 H.리들 환경·지구·자원학부, 치위생학부, 치의학부, 교육학부, 공학부, 인간생태학부, I.H.애스퍼 경영스쿨, 운동과학·레크리에이션경영학부, 교육학부, 법학부, 재활의학부, 의학부, 음악학부, 간호학부, 약학부, 과학부, 사회사업학부, 확장교육부, 대학원부에서 다양한 학부·대학원과정을 제공한다. 이와 함께 기숙형 부속대학인 세인트존스대학(영국국교회 계통), 세인트폴스대학(가톨릭 계통), 세인트앤드루스대학(우크라이나동방정교회 계통), 유니버시티 칼리지(무종파)가 각각의 특성에 따라 학생들에게 편의를 제공한다. 위니펙 시내에 주 캠퍼스인 포트게리 캠퍼스와 보너타인 캠퍼스(Bannatyne)가 있다.