Sportivo Luqueño
Нери Барейро начинал свою карьеру футболиста в парагвайском клубе «Либертад». Вторую половину 2007 года он провёл за парагвайский «Спортиво Лукеньо», а с начала 2008 года выступал за «Такуари». В 2012 году Барейро вновь играл за «Либертад».