جامعة روكفلر
نال كارول في عام 2010 جائزة ستيفن جاي جولد من جمعية دراسة التطور. حصل في عام 2012 على ميدالية بينجامين فرانكلين في علوم الحياة من معهد فرانكلين لاقتراحه وإظهاره أن تنوع وتعدد الحياة الحيوانية يرجع بشكل كبير إلى اختلاف تنظيم الجينات نفسها بدلاً من حدوث طفرات على تلك الجينات. حصل في عام 2016 على جائزة لويس توماس من جامعة روكفلر.