Truite arc-en-ciel
La végétation présente dans le bassin du Columbia est très variée, allant de la Pruche de l'Ouest ("Tsuga heterophylla") au Thuya géant de Californie ("Thuja plicata") dans les régions humides à l’Armoise tridentée ("Artemisia tridentata") dans les régions arides. Le bassin fournit un habitat pour 609 espèces fauniques connues, comme le Pygargue à tête blanche ("Haliaeetus leucocephalus"), le Loup ("Canis lupus"), le Grizzli ("Ursus arctos horribilis"), le Lynx du Canada ("Lynx canadensis"), la Sterne caspienne ("Hydroprogne caspia"), le Spermophile du Columbia ("Spermophilus columbianus"), la « Limace-banane » ("Ariolimax columbianus"), le Wapiti ("Cervus canadensis") ou le Cerf à queue blanche de Colombie ("Odocoileus virginianus leucurus"). Parmi les espèces endémiques au bassin se trouve "Petrophyton cinerascens", une plante de la famille des Rosacées. Le fleuve et ses affluents accueillent le Saumon coho ("Oncorhynchus kisutch"), le Saumon nerka ("Oncorhynchus nerka"), le Saumon royal ("Oncorhynchus tshawytscha"), le Saumon kéta ("Oncorhynchus keta") mais aussi la Truite arc-en-ciel ("Oncorhynchus mykiss"), l'Esturgeon blanc ("Acipenser transmontanus"), l'Omble à tête plate ("Salvelinus confluentus") et le Ménomini des montagnes ("Prosopium williamsoni").