Parti populaire slovène
C'est à cette occasion qu'il redevient ministre des Affaires étrangères, grâce à une alliance de centre droit conduite par Andrej Bajuk, le 7 juin. Du fait d'un désaccord sur la législation électorale, Peterle quitta le Parti populaire slovène peu de temps après son union avec les chrétiens-démocrates et rejoint le nouveau parti Nouvelle Slovénie-Parti populaire chrétien (NSi-KLS). La coalition est cependant défaite aux élections législatives du 15 octobre.