Пласа Колония
Вальер — воспитанник клуба «Пласа Колония» из своего родного города. 19 апреля 2014 года в матче против «Рочи» он дебютировал в уругвайской Сегунде. В 2015 году Факундо помог клубу выйти в элиту. 15 августа в матче против «Рентистас» он дебютировал в уругвайской Примере. В своём первом сезоне он помог клубу завоевать серебряные медали чемпионата. 19 марта в матче против «Суд Америка» Вальер забил свой первый гол за «Пласа Колония».