Университет Райса
Своё образование она получила в Хьюстоне. Шеннон Уокер окончила среднюю школу «Вестбари», а затем Университет Райса получила учёные степени: сперва бакалавра наук по физике (1987), а затем магистра (1992) и доктора философии (1993) по астрофизике. Защитила диссертацию по теме «Взаимодействие солнечного ветра с атмосферой Венеры».