ポール・アレン
アレン脳科学研究所の設立資金1億ドルは、2003年に、マイクロソフトの共同設立者の一人であるポール・アレンから提供（寄付）された。それ以外にも公的セクターや民間からの様々な資金援助を受けている。2012年にポール・アレンは、研究所に対しさらに3億ドルの追加援助を行った。