Текнико Университарио
Леон начал карьеру в клубе «Норте Америка». В 2011 году Луис перешёл в «Индепендьенте дель Валье». 24 июля 2011 года в матче против «Депортиво Куэнка» он дебютировал в эквадорской Примере. 22 апреля 2012 года в поединке против «Текнико Университарио» Луис забил свой первый гол за «Индепендьенте дель Валье». В 2016 году он помог клубу выйти в финал Кубка Либертадорес.