ブルハーヌッディーン・ラッバーニー
バダフシャーン州はの幹部のブルハーヌッディーン・ラッバーニーの出身地であり、アフマド・シャー・マスードの出身地にも隣接していた為、イスラム協会の拠点の1つだった。ラッバーニーは1993年にカーブルでアフガニスタン・イスラーム国の大統領に就任したが、すぐに内戦が始まった。1996年にターリバーンはカーブルを占領し、1997年から1998年にかけて近隣のクンドゥーズ州やバルフ州、バグラーン州の州都を次々と占領した。バダフシャーン州でもイスラム聖職者の反乱が起きたので、ラッバーニーはタジキスタンに亡命した。1998年の2月と5月にはとの地震が発生し、バダフシャーン州やタハール州を中心に数千人の住民が死亡した。バダフシャーン州ではその後も2002年から2011年までの約10年間で、3回の中規模地震と1回の大規模地震が発生している。無人の山中で地震が発生し被害が無い事も多いが、2002年3月のアフガニスタン北部地震（Mw7.4）ではバダフシャーン州やタハール州で300戸の住宅が被害を被った。