Battle of Fallen Timbers
1790年、ウィリアム・クラークは兄のジョージ・クラークに続いて市民軍に参加し、いくつかの局地的戦闘に参加した。1792年には正規軍の中尉に任ぜられ、アンソニー・ウェインの軍団に配属された。クラークはここで4年間の遠征に参加し、フォールン・ティンバーズの戦いなどに参加した。またこの間、クラークの指揮下にはメリウェザー・ルイスがいた。