日圓
2018年度（平成30年度）一般會計中的農林水產省所管之歲出預算為2兆1303億5399萬7千日圓。依組織細分為農林水產本省1兆5367億2950萬3千日圓（佔全體約72.1%）、本省檢査指導機關157億7492萬4千日圓（0.1%）、農林水產技術會議661億6677萬9千日圓（3.1%）、地方農政局822億3300萬1千日圓（3.9%）、北海道農政事務所47億4322萬4千日圓（0.2%）、林野廳2858億7798萬8千日圓（13.4%）、水產廳1388億2902萬8千日圓（6.5%）。本省預算主要有農林水產基盤整備事業費4382億8600萬日圓、食料安定供給關係費9924億2738萬2千日圓。