Кукута Депортиво
Серхио Сантин начинал карьеру футболиста в уругвайском клубе «Данубио». В 1980 году он перешёл в колумбийскую команду «Кукута Депортиво», а в 1981 году — в колумбийский «Атлетико Насьональ». В 1984 году Сантин вернулся на родину, став игроком «Пеньяроля».