Ла Экидад
Инестроса — воспитанник футбольной академии клуба «Атлетико Насьональ». 1 сентября 2011 года в матче против «Ла Экидад» он дебютировал в колумбийской Примере. В своём дебютном сезоне Инестроса стал чемпионом Колумбии. Фреди не смог полностью адаптироваться в основной команде, а также получил травму. В начале 2012 года он перешёл в «Ла Экидад». 5 февраля в матче против «Бояка Чико» Инестроса дебютировал за новую команду. 18 июня в поединке против «Санта-Фе» он забил свой первый гол за «Ла Экидад».