穀氨酸
小脑深部核团的抑制性输入主要来自小脑皮层的普金耶细胞。这些抑制性输入的神經傳導物質为GABA。小脑深部核团的兴奋性输入主要来自苔蘚纖維(Mossy fibers)和爬行纖維(Climbing fiber)的穀氨酸输入。但是兴奋性输入源仍有争议。