自由、平等、博愛
1894年經滂尼发秀介紹加入卡蒂普南。1896年8月26日卡蒂普南在巴林塔瓦克起義，阿奎納多於31日在甲米地響應起事，擊潰甲米地的西班牙正規軍，佔領了甲米地全境，因此名聲大噪。後來，阿奎納多與滂尼发秀發生嚴重矛盾。1896年10月31日，阿奎納多發表《自由、平等、博愛》文告，提出將在「解放地區」成立臨時革命政府，隻字不提卡蒂普南，公開對抗卡蒂普南的章程綱領。1896年12月，卡蒂普南總部遷往甲米地，阿奎納多拒不服從滂尼发秀的指揮，導致革命陣營分裂。後在西班牙的強勢進攻下，卡蒂普南革命受創，於1897年2月退往北呂宋。1897年3月22日，在特赫洛斯大會（）上，任主席的阿奎納多帶領支持自己的「馬格達洛委員會」決議解散卡蒂普南，成立革命政府，阿奎納多當選為總統。然而滂尼发秀拒不承認大會的決定。1897年5月10日，阿奎納多一派逮捕了滂尼发秀，並以「反政府罪」將其處決。