長野新幹線
2019年10月12日至13日颱風海貝思吹襲日本本州期間，由於大雨氾濫造成千曲川堤防潰堤，位於長野縣長野市的長野新幹線車輛中心因此被洪水淹沒，而停放於車輛中心內的E7系8列及W7系2列共10列新幹線列車、120節車廂亦因淹水受損。受損車輛數量占北陸新幹線全部E7/W7系車輛的三分之一。10月17日，JR東日本宣布與JR西日本合作修復受淹沒路段，長野新幹線車輛中心恢復運作前，暫時借用JR西日本的做為列車檢修用。10列受損列車在詳細檢查後，發現車廂地板下的動力系統與煞車系統皆遭受洪水淹沒，而車廂內絕大部分的座椅從椅面到扶手也皆已浸水；考量安全性與安定性，JR東日本總經理（社長）於同年11月6日表示該公司擁有的E7系8列編組將直接報廢，並檢討將堪用零件作再利用於代替新造車，JR西日本也於同日表示已啟動該公司擁有之W7系兩列泡水車的報廢手續。上越新幹線的1列E7系后备车會調往北陸新幹線使用，而原訂投入上越新幹線的5列製造中的E7系新车（F23至F27編組）也將改為投入北陸新幹線，並延後除役E4系電力動車組。