五島列島
釣魚台列嶼與長崎縣的五島列島同處於東海大陸棚邊緣，構成臺灣-宍道褶曲帶，其中黄尾屿和同在此褶曲帶上的臺灣的彭佳嶼均屬第四紀的小規模玄武岩質火山島。釣魚台列嶼所在的大陸棚邊緣海床地區水深介乎140-160米，沖繩海槽（又稱「黑水溝」）位於釣魚台列嶼以南約10海浬，該處海床地形突變至水深1000米以上。