Charles Edward Stuart
1745年8月、秋の授業再開を待っていたとき、チャールズ・エドワード・ステュアート（ジェームズ2世の孫、国外追放されたジェームズ3世の息子）が反乱を起こした。ハットンの勉学の邪魔になったばかりでなく、エディンバラの市民に多大な影響を及ぼした。1747年の末、パリに移り、パリ大学で、医学の勉強を続けた。1749年9月には、ライデン大学で医学の学位を得た。この時の論文は「マイクロコスモスの血液と循環」と題するもので、のちに地球についても「循環」という考え方を適用した。