Сан-Луис Кильота
Летом 2016 года Мора перешёл в «Универсидад де Чили». 30 июля в матче против «Сантьяго Уондерерс» он дебютировал за новую команду. 13 августа в поединке против «Сан-Луис Кильота» Фелипе забил свой первый гол за «Универсидад де Чили». 12 марта 2017 года в матче против своего бывшего клуба «Аудакс Итальяно» Мора сделал хет-трик. По итогам сезона он помог клубу выиграть чемпионат, а также стал лучшим бомбардиром первенства и национального кубка.