ウェストバージニア大学
モーガンタウンはウェストバージニア州を代表する州立総合大学、ウェストバージニア大学が本部キャンパスを置く大学町である。同学は1867年創立で、学部生約21,000人、大学院生約7,000人を抱える大規模大学である。同学はダウンタウンの北側にメインキャンパスを構えているほか、市北部にも広大なエバンズデール・キャンパスおよび保健学キャンパスを有している。エバンズデール・キャンパスには工学部・農学部の校舎や学生寮が置かれている。保健学キャンパスには医学部・歯学部・保健学部の校舎、大学病院、およびマウンテニアー・フィールドが立地している。同学のスポーツチーム、マウンテニアーズはNCAAのディビジョンIに属するビッグ・イースト・カンファレンスに所属している。ダウンタウン、およびウェストバージニア大学の各キャンパスはモーガンタウンの新交通システム、モーガンタウン・パーソナル・ラピッド・トランジット (PRT) で結ばれている。