DNA 복제
대부분의 사람들이 부작용으로 발전한다. 일반적인 부작용으로는 백혈구감소증, 식욕 부진, 구토, 탈모, 출혈성 방광염이 포함된다. 그 밖의 심각한 부작용으로는 암, 불임, 알레르기, 폐섬유증의 위험성 증가이다. 시클로포스파미드는 알킬화제 및 질소 머스터드계 약물에 속한다. DNA 복제, RNA 생성을 간섭함으로써 동작하는 것으로 간주된다.