Натрон
Малый фламинго предпочитает мелководные прибрежные лагуны, внутренние солёные и щелочные озёра. В Азии большие скопления птиц обитают на мелководных побережьях морских заливов и в маршах Большого Качского Ранна. В Африке крупные смешанные колонии (вместе с розовым фламинго), насчитывающие до нескольких сотен тысяч особей, отмечены на солёных и солонцеватых озёрах Магади, Натрон, Накуру, Туркана, Богория и Найваша. При этом розовый фламинго составляет менее 10 % от популяции фламинго в Африке. В сравнении с розовым фламинго малый часто выбирает водоёмы с более щелочной водой, что обусловлено характером питания. Из-за особенностей диеты более 95 % птиц обитают в 12 основных компактных регионах, включающих 73 участка.