Shin Bet
En el 2002, Ayalon finalizó sus 5 años en el mando de la organización y fue sustituido por Avi Dichter. Dichter, un excomando de las fuerzas especiales del Sayeret Matkal y un agente experimentado, le devolvió al Shabak la buena reputación que anteriormente había perdido y se estrechó la relación de trabajo entre este grupo de inteligencia, el Tzahal y la policía israelí. La prensa extranjera insinuó que el Shabak trabajaba fuertemente con la unidad elite de contraterrorismo israelí YAMAM. Dichter era el jefe del Shabak cuando la Intifada de Al-Aqsa se agudizó. Él manejó y supo reaccionar rápidamente a los cambios e hizo que el Shabak fuera un jugador prominente en la guerra de Israel contra los terroristas palestinos después del fracaso de las conversaciones de Camp David en el año 2000. El Shabak envió información de inteligencia al Tzahal y otras fuerzas de seguridad con el fin de prevenir atentados terroristas suicidas antes de que sean efectuados. Esto por lo general fue realizado con detenciones preventivas y el despliegue de bloqueos de camino en los territorios palestinos cuando había una alarma seria de atentados. Además de prevenir ataques suicidas en Cisjordania mediante detenciones y operaciones especiales, el Shabak estaba trabajando firmemente con la Fuerza Aérea Israelí (IAF) para localizar y matar a los cabecillas y líderes de grupos terroristas palestinos con certeros ataques selectivos. Las blancos fueron comandantes de campo y líderes de facciones militantes palestinas, principalmente los miembros de Hamás, Jihad islámica, las Brigadas de los Mártires Al-Aqsa, el Fatah y al-Qaeda. Estos asesinatos, llamados “apuntar y matar”, son hechos donde generalmente se efectúan mediante ametralladoras de helicópteros, donde los comandantes de la Fuerza Aérea Israelí y los agentes del Shabak se sitúan juntos en el centro del comando donde supervisan la operación. Las tareas del Shabak produjeron éxitos considerables cuando sabían donde estaría disponible el blanco para un ataque selectivo y después dieran la orden a la Fuerza Aérea Israelí, asegurando a los pilotos cuáles son los terroristas buscados (esa parte de la operación se denomina “identificación e incriminación”). La actividad extremadamente eficaz del Shabak durante la segunda Intifada incrementó su reputación entre los expertos israelíes del público y del contraterrorismo.