神户大学
1969年，五百旗头真去广岛大学政治经济学部担任助手，后来晋升为讲师、助理教授，1976年，他晋升为教授。1977年，担任該大学法学部教授。1981年，五百旗头真自广岛大学退官、神户大学法学部教授。1998年，他担任日本政治学会理事长，直到2000年。之后，他担任同法学研究系·国际合作研究系教授。2007年，五百旗头真从神户大学退职，只担任神户大学名誉教授，同时担任防卫省防卫大学校校长。2012年，他从該大学校退任，国分良成繼任。