종의 기원
《종의 기원》("The Origin of Species")이 출판되었을 때, 피츠로이는 당황했고, 《진화론》의 발전에 자신이 기여한 역할을 생각하고 분명 죄책감에 빠져 있었다. 폭풍에 관한 주제를 발표하기 위해 1860년 6월 30일 열린 옥스포드 영국학술회의에 참석했는데, 그곳에서 성공회 주교인 새뮤얼 윌버포스 주교가 다윈을 비난하는 것을 들었다. 면담을 하는 동안(헉슬리와 후커가 반론을 시작하기 전에), 피츠로이는 일어나 성서를 들고 관중에게 "사람보다 하느님을 믿자"라고 호소했다. 《종의 기원》은 그에게 "심각한 고통"을 주었다고 말하고, 관중은 가만히 앉아서 같이 저주했다.