Серро Портеньо
Альмирон — воспитанник клуба «Серро Портеньо». 10 марта 2013 года в матче против столичного «Депортиво Капиата» он дебютировал в парагвайской Примере. 19 апреля в поединке против «Рубио Нью» Мигель забил свой первый гол за «Серро Портеньо». В 2013 году Альмирон помог команде выиграть чемпионат Парагвая.