蛋白质结构
蛋白质结构预测的进展通过两年一届的蛋白质结构预测技术的关键测试（CASP）实验来进行评估。在这项实验中，来自全球各地的研究人员尝试从氨基酸序列中得到蛋白质结构。这项实验有时竞争十分激烈，得分高的小组被认为是最高端蛋白质结构预测研究的事实上的标准制定者。Rosetta@home所基于的Rosetta程序，自1998年的CASP3实验上开始被使用。在2004年的CASP6上，Rosetta创造了历史，在它为CASP目标蛋白质T0281提供的模型中，首次生成了接近原子级精度的"ab initio"蛋白质结构预测。"Ab initio"不使用的信息，而必须依赖于序列同源信息以及蛋白质内的模拟物理交互，因此被认为是一类特别难以预测的蛋白质结构。Rosetta@home自2006年CASP7上开始被使用。在CASP7上，它在每个类别的预测中都成为最好的预测器之一。而高质量的预测需要来自Rosetta@home众多志愿者提供计算资源。不断增多的计算资源使Rosetta@home能够对构象空间（一个蛋白质可以被假设具有的可能的形状）更多的区域进行取样，根据“黎文索尔佯谬”（Levinthal paradox），采样数量会随着蛋白质长度的增长而呈指数增长。