伯爵戦争
伯爵戦争が勃発すると、彼はシェラン島やフュン島の征服に成功し、支配者として受け入れられたものの、リューベックがデンマーク王位に関心を持つメクレンブルク＝シュヴェリーン公アルブレヒト7世（）を同盟に参加させたことから、同盟内に亀裂が生じた。クリスチャン3世はユラン半島やフュン島を奪回し、シェラン島攻略に動いた。アルブレヒト7世が降伏するまで、クリストファーはコペンハーゲンで抵抗したものの、最終的には降伏、クリストファーのデンマークにおける立場はなくなった。