Локомотив-НН
В качестве игрока выступал за команды «Норма» и «Электроника» (Таллин). Свою тренерскую карьеру начал ещё в советское время. Под руководством Бондаренко команда «Норма» стала первым чемпионом Эстонии. В дальнейшем, специалист неоднократно работал с клубом «Нарва-Транс» и входил в тренерский штаб сборной Эстонии. В России Бондаренко возглавлял клуб «Локомотив-НН». Помимо этого, тренер руководил клубами из Финляндии и Швеции.