Fernando de Noronha
20 февраля экспедиция прибыла к вулканическому острову Фернанду-ди-Норонья, где Дарвин сделал описание флоры и фауны и исследовал геологию. Через неделю, 28 февраля, они прибыли в город Баия, ныне — штат Баия, город Сальвадор, Бразилия. Дарвина очень захватила природа окрестных земель. Он осмотрел обширные территории вокруг города, описав геологию и рельеф. В частности им были продолжены начатые Гумбольдтом во время своего путешествия в Южную Америку исследования сиенитовых пород, которые были «покрыты чёрным веществом как до блеска натёртые графитом». Не мог Дарвин не осмотреть местных животных и растений. Провёл значительные наблюдения за рыбой-ежом "Diodon antennatus" и определил, что эта маленькая рыбка, когда попадает в желудок акулы, может проесть его стенки и даже бок хищного животного, при этом убивая его. 18 марта корабль «Бигль» отплыл из Баии, продолжив кругосветное путешествие.