Guinea pig
岩豚鼠屬曾被認為是水豚科（Hydrochoeridae）的生物，和豚鼠分在一起。後來的種系發生研究顯示其關係與水豚更為接近，因此又被劃分到了豚鼠科中。Woods 和 Kilpatrick（2005）將其分在水豚亞科下，認為其在中新世中期從水豚中分化出來獨自進化。