伊豆群島
在江戶時代，江戶中心運河網密布，水運在江戶的交通及物流中有著極為重要的地位。但在20世紀後，由於都市化的進展，東京都心的水路網快速縮小，大量水路被填平或改為暗渠，用於修建道路。現在東京都主要的水運交通是連接本土和伊豆群島、小笠原群島的航路。郵政局在1875年開設了東京和伊豆群島之間的命令航路。1891年，東京灣汽船開設了東京和伊豆群島之間的自由航路。現在東京都本土和伊豆群島之間的航運由負責運營。東京都本土和小笠原群島之間的定期航路開始於1876年，但在1942年受太平洋戰爭影響而暫停。現在東京都本土和小笠原群島之間的航運由負責運營。