아라곤 왕국
페르난도는 펠리페 1세의 정책과 이질적인 문화를 좋게 여기지 않았다. 페르난도는 레오노르 1세 데 나바라의 이복 자매의 손녀이자 루이 12세의 조카인 제르멘 드 푸아와 1505년 10월 19일 프랑스 왕국 블루아에서 재혼하였다. 아라곤의 새로운 상속인을 카스티야에서 분리하려는 그의 희망은 실현되지 않았다. 이는 그의 사위 펠리페 1세가 거부하였고, 그의 손자인 카를로스 1세가 아라곤의 왕위와 통치권을 상속하였다. 페르난도의 아들 히로나 공작 후안이 1509년 5월 3일에 태어났으나 몇 시간 만에 사망하고 말았다. 후안은 카스티야 왕국 바야돌리드의 성 바울 수녀원에 묻혔다가 아라곤 군주들의 전통적인 매장소인 아라곤 왕국 카탈루냐 빔보디이포블레트의 포블레트 수도원으로 이장되었다.