トゥーレ協会
テレビアニメ版最終話で門の向こうの世界（現実世界）へ飛ばされたエドワード・エルリックは18歳になり、錬金術世界・アメストリスへ戻るためにロケット工学を研究していたが、先の見えない現実に焦燥していた。その頃、エドの同居人にして「自らの手でロケットを作りたい」と夢見る少年、アルフォンス・ハイデリヒは、パトロンを得て念願のロケット製作に着手する。しかし、その裏には謎の組織・トゥーレ協会の陰謀が隠されていた。