Polish Football Association
Posteriormente Boniek fue vicepresidente de la Asociación Polaca de Fútbol ("Polski Związek Piłki Nożnej"), y en julio de 2002 aceptó el trabajo de seleccionador de su país. Dimitió en diciembre del mismo año, después de solo 5 partidos (2 victorias, 1 empate y 2 derrotas) con la selección polaca. Actualmente es presidente de honor de la PZPN.