Edwin M. Stanton
ウェルズは合衆国海軍の再建には成功したものの、リンカーン政権内での立場はあまり良好ではなかった。ウェルズの反イギリス的な感情はしばしばウィリアム・スワード国務長官と対立し、またウェルズの保守的な姿勢はサーモン・チェイス財務長官やエドウィン・スタントン陸軍長官と衝突を引き起こした。ウェルズはリンカーン大統領の後任のアンドリュー・ジョンソン大統領の下でも海軍長官に任命されたが、戦後復興について大統領と政策の不一致を見せ、1868年に民主党に加わった。だがジョンソン大統領が弾劾裁判にかけられると、一転してジョンソン大統領支持を打ち出し、水面下での妥協を試みた。そして弾劾裁判でジョンソン大統領が弾劾を免れると、ウェルズは大統領の任期満了となる1869年まで海軍長官を務めた。