琉球大學
該中心導入了琉球大學的比嘉照夫教授所開發的EM菌（Effective Microorganisms），為酵母菌、乳酸菌、光合菌等多種細菌的共生群。他們將其廣泛運用在育苗用土、基肥、灌溉用水等處。另外，他們也有提供自然農法研修，比起大仁農場的一年或兩年，自然農法中心為八個月，分為蔬菜、水稻、育種三個課程。