National and Kapodistrian University of Athens
カポディストリアスは現在のギリシャでも大きな尊敬を集めている。例えばアテネ大学の正式名称は、エスニコン・ケ・カポディストリアコン・パネピスティーミオン・アスィノン（国民カポディストリアス・アテネ大学）といい、彼の名を冠している。この他、旧500ドラクマ紙幣や現在の20レプタ（ユーロセント）硬貨には彼の肖像が描かれ、1990年代後半の地方制度改革には彼の名が用いられた。