ペリービルの戦い
それでもグラントの経歴はシャイローの戦いの後で一時的に傷ついた。ヘンリー・ハレックはその軍隊を結集して再編し、グラントは副司令官という権力の無い地位に就けた。4月下旬と5月に、ハレックが自ら指揮する北軍は緩りとコリンスに向かい、それを包囲して占領した。一方ミシシッピ川の水陸協働部隊が南軍の河川防衛船隊を破壊し、テネシー州メンフィスを占領した。ハレックは全北軍の総司令官に昇進し、東部へ出発すると共に、グラントが指揮に戻った。グラントはミシシッピ川を下って軍を進めビックスバーグを包囲した。1863年夏のビックスバーグの降伏とポートハドソンの陥落の後は、ミシシッピ川が北軍の支配下になり、南軍は2つに分断された。ミシシッピ軍の指揮はブラクストン・ブラッグに任され、ブラッグは4月6日付けで大将に昇進した。1862年の秋に、ブラッグはケンタッキー州侵略軍を率い、ペリービルの戦いの後で撤退するという結果になって失敗した。