범죄 수사
2003년, 당시 대통령이었던 블라디미르 푸틴은 연방 국경청을 연방보안국 소관으로 이동시키고, 연방정부통신정보국의 일부 기능, 연방세무경찰청이 실시하고 있던 금융 범죄 수사 기능의 일부를 연방보안국에 부여해 권한을 대폭 강화시켰다. 이를 두고 일부에서는 러시아 정부가 연방보안국의 권한을 옛 소련의 국가보안위원회와 유사한 수준으로 되돌리려는 것이 아니냐는 우려를 나타냈었다.