ニホンザル
調査では、2010年晩秋に洞窟内に全く無かったニホンザルの糞が、年を越した2011年早春に大量に現れた。このことから、ニホンザルは洞窟を真冬の寒さをしのぐために利用していると考えられる。また、洞窟内のニホンザル化石の年代測定では、弥生時代のものが見られたことから、古くから洞窟利用が行われてきたと判明した。