オランダ領ニューギニア
トムソンはと強い絆を結び、。1941年、彼は陸軍を説得して、ヨルング族の男性たちからなる特別偵察隊である (NTSRU) の編成を実現した。これには族長ウォング (Wonggu) の息子たちも加わり、オーストラリア大陸の北部海岸線への日本軍の攻撃を撃退する一助とされた。1943年に至り、戦闘地域がオーストラリアより北方へ遠のいていくと、特別偵察隊は解散となり、トムソンは空軍に戻った。オランダ領ニューギニアでの作戦行動中に重傷を負い、以降の第二次世界大戦中は、病院で過ごし、そのまま空軍を除隊となった。