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但是杨鹏的回应并没有平息网络上的质疑。实名认证为新浪微博“吴法天”公开质疑：“《基金会管理条例》第二十九条明确规定：‘公募基金会每年用于从事章程规定的公益事业支出，不得低于上一年总收入的70%’，壹基金章程第五十二条也做了同样的规定... 壹基金秘书长杨鹏通过微博回应，介绍了壹基金是如何‘慢工出细活’，却没有说明为何他们的拨付不符合他们自己的章程规定。中国公益研究院院长王振耀说那是限制性资产，不受70%限制。可限制性资产是暂时不能动的资产。你壹基金自己制定五年规划，规定第一年拨付4000多万，其余的就成限定性资产了？这不是循环论证吗？你民政部的前官员也不能随意解释啊。”并且也有网友发现壹基金和原是民政部社会福利与慈善促进司司长王振耀存在利益输送，并且把善款输入王石为名誉会长的深圳登山协会.有媒体评论“背后的利益集团试图在民间建立自己的声誉，实现排挤当前体制的目的。为未来进一步影响民众的心理做准备。壹基金背后绝对没这么简单，左右媒体、压制反对声音，这不是一个慈善基金应该有的实力”；“壹基金拨款让中国公益研究院与美国NGO联合办学，培训人才，学习美国基金先进经验”；“一个新加坡亿万富豪，不远万里，来到中国，让中国穷人捐钱给他去做善事，这事听起来咋那么别扭。”