도사 번
고베 해군 조련소 소장 카츠 카이슈와 영국 해군 교관 채용 문제로 만났고, 영국 군함 스납프 호(후일의 바실리스크 호)로 하코다테를 돌아 동해 방면으로 남하 후, 니이가타현, 사도 섬, 노토 반도 등을 돌아보고 나가사키를 경유해 오사카로 일본을 일주했다. 이카루스 호 사건으로 영국 수병이 살해된 것과 일본의 기독교 탄압에 대해 알게된 그는, 막부 측에 이카루스 호 사건의 책임을 강하게 추궁하는 한편, 사건 용의자들이 도사 번 출신 탈번 낭인들로 의심돼, 도쿠시마 번을 경유해 도사 번에 가 도사 번 참정 고토 쇼지로(後藤象二郎)와 주로 회담했다. 그는 막부와 교토 조정 양측의 방해에도 불구하고 효고 항 개항 및 오사카 자유시장 설치를 밀어붙였다. 1867년 말 도쿠가와 요시노부가 평화적으로 정권을 일황에게 반환하고 왕정복고의 대호령이 내려졌다. 파크스 영사는 이 때 퇴임 쇼군 도쿠가와 요시노부를 다시 배알했다.