Campeonato Carioca
Welinton spielte in der Jugend ab 2007 für Flamengo Rio de Janeiro. 2009 gewann er mit Flamengo in seiner ersten Profisaison die Staatsmeisterschaft von Rio de Janeiro und wurde Brasilianischer Meister. Bis zu seinem Transfer 2017 wurde er vom Verein insgesamt vier Mal ausgeliehen.