アメリカ連合国議会
ロバート・E・リーは総司令官（General-in-Chief）に指名された唯一の将官である。これは戦争も終盤になった1865年1月23日にアメリカ連合国議会によって創設されたが、1862年2月27日には議論になってもいた。ジェファーソン・デイヴィスは、そのような将軍ならば「大統領の意思なくして1軍あるいは複数の軍を指揮」できることになると考え、その年3月14日に議会に対してその地位を創ることについて拒絶を意思表明し（さらに拒否権を使った）。デイヴィスは戦争を通じて総司令官の責任の大半を自分で果たし、軍事作戦の管理者と総司令官の両方として行動した。