二級結構
在很多RNA分子，二級結構對RNA正常功能非常重要，有時甚至於較序列重要。這可以幫助用於分析非編碼RNA。RNA二級結構可以用電腦來提升預測準確性。，而其他生物信息學的應用會使用一些二級結構的概念來分析RNA。