Danubio F.C.
Формильяно — воспитанник клуба «Данубио». 21 августа 2011 года в матче против «Рентистаса» он дебютировал в уругвайской Примере. 1 сентября 2012 года в поединке против столичного «Прогресо» Фабрисио забил свой первый гол за «Данубио». В 2014 году Формильяно помог клубу выиграть чемпионат.