المؤتمر الوطني الأفريقي
انتخِب موتلانتي أمينًا عامًا لحزب المؤتمر الوطني الأفريقي في مؤتمر مافكينج في ديسمبر 1997، وإيمبيكي رئيسًا له. كان مسؤولًا عن ضمان تنفيذ حزب المؤتمر الوطني الأفريقي لسياساته وبرامجه. كان وما زال ملتزمًا بفكرة وجوب اتباع المساءلة الصارمة من قبل مسؤولي حزب المؤتمر الوطني الأفريقي. في المجلس الوطني العام لحزب المؤتمر الوطني الأفريقي في بورت إليزابيث في عام 2000، انتقد قلة التشاور والمناقشات بين الحكومة وحزب المؤتمر الوطني الأفريقي. هناك وجهة نظر منتشرة على نطاق واسع من الزملاء والمقربين منه أن إيمبيكي قوضه على نحو خطير لسنوات، لكن موتلانتي أنكر ذلك.