Crocodylus acutus
La herpetofauna es también muy variada, con 19 especies de ranas, 5 tortugas, 24 lagartos, como la iguana verde ("Iguana iguana"), 41 serpientes, una salamandra y dos cocodrilos: el cocodrilo americano ("Crocodylus acutus") y el cocodrilo de Morelet ("Crocodylus moreletii"). Hay varias serpientes venenosas: la serpiente de coral ("Micrurus altirostris"), la cascabel centroamericana ("Crotalus simus"), así como las víboras mano de piedra ("Atropoides nummifer"), chatilla de la selva ("Porthidium nasutum"), y especialmente la barba amarilla o terciopelo ("Bothrops asper").