希伯來聖經
因為馬吉安拒絕《希伯來聖經》，一些基督徒相信馬吉安是反猶主義者。事實上，現今「馬吉安主義」一詞，常會指一些反猶主義的教會。另一方面，馬吉安並不稱基督徒為取代論的「新以色列」，亦從未曾引用《希伯來聖經》來支持自己的觀點。但是，馬吉安從未曾顯示他是一個反猶太主義者，他只是反對猶太人的經典而已。