北港溪（賽德克語：Yayung Qnahaqun；闽南语：Pak-kang-khe）位於台灣中西部，屬於中央管河川，為雲林縣與嘉義縣的界河。流域面積則有645.21平方公里，遍及雲林縣十個鄉鎮，分別為斗六市、斗南鎮、虎尾鎮、土庫鎮、大埤鄉、元長鄉、北港鎮、口湖鄉、水林鄉、古坑鄉；還有嘉義縣六個鄉鎮：溪口鄉、新港鄉、六腳鄉、東石鄉、大林鎮、梅山鄉。主流河長約82.00公里，為全國第十長河流，全溪蜿蜒漫長，雨、旱季水位高低明顯。


歷史 在完稿於清康熙三十八年至四十三年（1699-1704年）的《康熙臺灣輿圖》上，今北港溪並未標出名稱，其上游僅繪出石龜溪、三疊溪兩條主要支流，但其方位與今相較南北倒置；今虎尾溪則尚未出現。輿圖中北側另一獨立水系濁水溪的下游繪出西螺溪、虎尾溪兩條分流，但當時的虎尾溪係指今舊虎尾溪。
在完稿於乾隆二十二年至二十六年（1757-1761年）的《乾隆臺灣輿圖》上，石龜溪、三疊溪方位已改為與今相同。輿圖中濁水溪分流虎尾溪的下游已再形成虎尾新溪（今新虎尾溪）、虎尾舊溪（今舊虎尾溪）兩條分流，而且虎尾舊溪明顯為主流。
嘉慶七年（1802年）七月，大雨數日，濁水溪洪水向南在他里霧地區沖出一條新的溪流，經由鹿藔通往笨港（今北港），再以「新虎尾」稱之，即今北港溪上游的虎尾溪。不過該河道在道光、同治年間的輿圖仍未出現，直到光緒年間的輿圖才繪出。
該次改道使得北港溪成為濁水溪的下游分流之一，而且水患破壞了北港溪畔的笨港聚落。三疊溪北側的幾條溪流包括大湖口溪、石牛溪、石榴班溪等，原本都是獨流入海。在乾隆、嘉慶年間的幾次水患裡，被併入而成為虎尾溪的支流。1911年興建堤防切斷濁水溪分流至北港溪的水道，北港溪始回復為獨立的水系。
1959年在台灣發生的嚴重災難——八七水災，北港溪上游地區降水量最多，洪水淹過堤防，沖向虎尾、斗南、斗六、土庫、北港等地，造成嚴重災害。隔年受到雪莉颱風影響，也發生了嚴重的水患。


源頭 北港溪主流上游為虎尾溪，其源頭眾多，最遠源頭為支流海豐崙溪上游尖山坑溪的源頭，位於雲林縣古坑鄉海拔857公尺的樟湖山西北坡；全流域海拔最高的源頭為支流大湖口溪的源頭，位於古坑鄉海拔1,305公尺的大尖山附近；而傳統資料上的源頭則為林內鄉、斗六市邊界上海拔222公尺的七星嶺。


流域概述 北港溪最遠源流名為尖山坑溪，發源於雲林縣古坑鄉樟湖山西北坡，向西北方流至荷包厝後，改稱海豐崙溪。續流至斗六市海豐崙後，注入虎尾溪本流，流至溪口鄉柴林腳與三疊溪滙合後，始稱為北港溪。
北港溪支流甚多，較大者為三疊溪、大湖口溪、石牛溪。是雲嘉平原的主要灌溉河川，孕育作物有稻米、花生、糖和黃麻。最後在雲林縣口湖鄉出海。由於北港溪上游，阿里山一帶的水土皆因觀光、農業大量開發，使得北港溪的土壤沉積相當嚴重，加以下游流域廢水汙染也相當嚴重，其中養豬廢水佔了45%、生活污水有35%、工業廢水則占15%，在2006年環保署發表水質檢測調查報告時，北港溪有47.2%的河段為嚴重污染（在石榴班橋以下之河段，水質皆遭到嚴重污染，此段污染程度高達83%），比2004年的43%，增加4.2%。
北港溪和朴子溪的出海口間所形成的區域為鰲鼓濕地，屬於台糖公司所有，濕地上有水田、旱田、防風林、草澤、深水沼澤、泥質灘地等棲地類型。每年9月到次年5月是賞鳥期，觀察記錄指出水鳥約有70種，鷸科有23種，加上其他鳥類約可觀察到154種以上的鳥類。由於濕地曾計畫設立工業區，而引發當地居民與環保人士的對立，當地居民組織「趕鳥隊」，影響賞鳥活動，後因嘉義縣政府的環境評估報告無法通過，開發案暫時擱置。


水系主要河川 以下由下游至源頭列出水系主要河川，其中粗體字為主流河道：

北港溪：雲林縣、嘉義縣
新街排水：雲林縣水林鄉、北港鎮
埤子頭大排：嘉義縣新港鄉、溪口鄉、民雄鄉
柳構大排：嘉義縣新港鄉、溪口鄉、民雄鄉
民雄大排：嘉義縣新港鄉、溪口鄉、民雄鄉
客仔厝大排：雲林縣北港鎮、元長鄉、土庫鎮
三疊溪：嘉義縣溪口鄉、雲林縣大埤鄉、嘉義縣大林鎮、民雄鄉、梅山鄉
延潭大排：雲林縣大埤鄉
華興溪（舊名石龜溪、到孔山溪）：嘉義縣溪口鄉、大林鎮、雲林縣大埤鄉、斗南鎮、古坑鄉、嘉義縣梅山鄉
早知溪：嘉義縣大林鎮
番尾坑溪：雲林縣古坑鄉
中林溪：嘉義縣大林鎮、梅山鄉
大埔美溪：嘉義縣大林鎮、梅山鄉
麻園溪：嘉義縣大林鎮、梅山鄉
葉子寮溪：嘉義縣大林鎮、梅山鄉
南靖溪：嘉義縣梅山鄉
九芎坑溪：嘉義縣梅山鄉
虎尾溪：雲林縣元長鄉、大埤鄉、土庫鎮、虎尾鎮、斗南鎮、斗六市、莿桐鄉、林內鄉、古坑鄉
大湖口溪：雲林縣大埤鄉、斗南鎮、古坑鄉
石牛溪：雲林縣虎尾鎮、斗南鎮、斗六市、古坑鄉
崙子溪：雲林縣斗南鎮、古坑鄉
嵌頂溪：雲林縣古坑鄉
松柏坑溪：雲林縣古坑鄉
雲林溪：雲林縣斗南鎮、斗六市、古坑鄉
芭蕉溪：雲林縣斗六市、古坑鄉
乾溪（斗六東溪）：雲林縣斗六市、林內鄉
海豐崙溪：雲林縣斗六市、古坑鄉
尖山坑溪：雲林縣古坑鄉
大埔溪（當地人稱外湖溪口以下為石榴班溪）：雲林縣斗六市、林內鄉
外湖溪：雲林縣斗六市
石榴班溪（當地人稱梅林溪口以下為林子頭溪，以上為埤子頭溪）：雲林縣斗六市、古坑鄉
牛埔仔溪：雲林縣斗六市
楓樹湖南溪：雲林縣斗六市
咬狗溪：雲林縣斗六市
梅林溪（內林溪）：雲林縣斗六市、古坑鄉
石仔坑溪：雲林縣古坑鄉
黃德坑溪：雲林縣古坑鄉
圳頭坑溪：雲林縣古坑鄉


主要橋樑 以下由河口至源頭列出主流上之主要橋樑：


= 北港溪河段 =
雲嘉大橋（省道台61線、台17線共線）
松山大橋
媽祖大橋
北港大橋（省道台19線）
北港觀光大橋
北港女兒橋
高鐵北港溪橋（台灣高鐵）
崙子橋（縣道145甲號）


= 虎尾溪河段及其支流 =
無名橋（鄉道雲86線）
聯美大橋（鄉道雲173線）
土庫大橋（縣道158甲號）
省道台78線虎尾溪橋（省道台78線）
興南大橋
虎尾鐵橋（舊台糖鐵路）
平和橋（縣道158號）
國道1號虎尾溪橋（國道1號）
虎尾溪橋（省道台1線）
新榮橋（省道台1丁線）
榮橋
竹圍大橋
施瓜寮橋（縣道154乙）
萬年橋（鄉道雲85線）
德安橋


 大湖口溪河段  豐岡橋（鄉道雲86線）
溝心橋（鄉道雲179線）
善陀橋（鄉道雲181線）
大湖口溪橋（省道台78線）
大湖口溪橋（國道1號）
善浩橋（鄉道雲85線）
善進橋（斗南鎮南昌西路）
大湖口溪橋（省道台1線）
大湖口溪橋（台鐵縱貫線 (南段)）
自治橋（斗南鎮信義路）
大湖口溪三號橋（省道台78線）
崙仔橋
南勢橋（鄉道雲189線）
東耕橋（鄉道雲194線）
興昌橋（省道台3線）
大湖口溪橋（國道3號）
光華橋（鄉道雲210線）
公館橋（鄉道雲212線）
光山橋（鄉道雲209線）


 石牛溪河段  雙東大橋（鄉道雲84線）
石牛溪橋（國道1號）
小東橋（斗南鎮大同路）
石牛溪橋（省道台1線）
石牛溪橋（台鐵縱貫線 (南段)）
善功橋（鄉道雲82線）
省道台78線石牛溪河川橋（省道台78線）
柴裡橋（省道台3線）
溪洲仔橋（鄉道雲193線）
水碓南橋（縣道154乙號）
國道3號石牛溪橋（國道3號）
大埔橋（縣道154甲號）


 海豐崙溪河段  海豐崙溪橋（台鐵西部幹線）
海豐崙橋（省道台3線）
斗山橋（鄉道雲214線）
重光橋（鄉道雲215線）
東和橋（鄉道雲213線）
豬母墓橋
東圳橋
國道3號海豐崙溪橋（國道3號）
荷北橋


 = 尖山坑溪河段  =
觀音山橋
地母橋（縣道149甲號）
建德橋（縣道149甲號）
土地公橋（縣道149甲號


 林子頭溪河段  林子頭溪橋（台鐵縱貫線 (南段)）
石榴班橋（省道台3線）


 石榴班溪河段  竹圍三號橋（斗六市中興路）
石榴班橋（台鐵縱貫線 (南段)）
石榴橋（省道台3線）


= 三疊溪及其支流 =
和平橋（縣道157號）
溪口橋（縣道162號）
三疊溪橋（國道1號）
三疊溪橋（省道台1線）
三疊溪橋（台鐵縱貫線 (南段)）
中正橋（縣道162乙）


 華興溪河段  石龜溪橋（國道1號）
石龜溪橋（省道台1線）
倒孔山溪橋（台鐵縱貫線 (南段)）
華興橋（鄉道雲187線）
石龜溪橋（國道3號）
雲祥橋（省道台3線）
新興橋（鄉道雲205線）
廣水橋（鄉道雲207線）
心慈橋（縣道149號）


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八七水災


參考資料 外部連結 （繁體中文）讓我們看河去(重要河川)-- 北港溪-經濟部水利署