Generalisierte Markov Modellierung : Modellierung irreversibler β Amyloid Peptid Dynamik unter Mikrowelleneinfluss Zur Notwendigkeit einer Generalisierung der Markov Modellierung Anwendung: Modellierung der Aβ40 Konformationsdynamik Mikrowelleneinfluss auf die Proteinkonformationsdynamik. Markov State Models (MSM) sind der Goldstandard zur Modellierung biomolekularer Dynamik da sie die Identifizierung und Analyse metastabiler Zustände ermöglichen. Die robuste Perron Cluster Cluster Analyse (PCCA+) ist ein verbreiteter Spectral Clustering Algorithmus der für das Clustering hochdimensionaler MSM verwendet wird. Da die PCCA+ auf reversible Prozesse beschränkt ist wird sie zur Generalisierten PCCA+ (G PCCA) verallgemeinert die geeignet ist nichtreversible Prozesse aufzuklären. Bernhard Reuter untersucht hier mittels G PCCA die nichtthermischen Auswirkungen von Mikrowellen auf die Proteindynamik. Dazu führt er molekulardynamische Nichtgleichgewichtssimulationen des Amyloid β (1–40) Peptids durch und modelliert diese. Der Inhalt Zur Notwendigkeit einer Generalisierung der Markov Modellierung Anwendung: Modellierung der Aβ40 Konformationsdynamik Mikrowelleneinfluss auf die Proteinkonformationsdynamik Die Zielgruppen Dozierende und Studierende der Fachgebiete Biophysik und informatik Theoretische Chemie Computerchemie sowie Mathematik Praktisch Tätige in der Forschung und Entwicklung in diesen Fachgebieten Der Autor Bernhard Reuter forscht in der Gruppe Methoden der Medizininformatik an der Eberhard Karls Universität Tübingen und der Gruppe Computational Molecular Design am Zuse Institut Berlin. Ein Schwerpunkt seiner Forschung ist die Simulation und Modellierung biomolekularer Nichtgleichgewichtssysteme. Er entwickelt u.a. datenbasierte Methoden zur Modellierung biomolekularer Nichtgleichgewichtsprozesse.