Babak gugur Liga Champions UEFA 2003–2004

Babak gugur Liga Champions UEFA 2003–2004 berlangsung dari 24 Februari 2004 hingga final di Arena AufSchalke di Gelsenkirchen, Jerman pada 26 Mei 2004. Babak sistem gugur melibatkan 16 tim yang finis di dua teratas di masing-masing grup mereka di babak grup. Waktunya adalah CET/CEST, sesuai daftar UEFA.