Klasifikasi tumbuhan paku

Pemahaman klasik tumbuhan paku adalah mencakup semua kormofita berspora. Sejak tahun 2004, seiring dengan disertakannya data molekuler berdasarkan sekuens tertentu dari DNA plastid, pemahaman modern mengenai tumbuhan paku mengalami perubahan yang cukup besar. Kelompok Lycopodiinae ternyata memisah terlebih dahulu dari semua kormofita lain, dan tumbuhan paku lainnya, bersama-sama dengan tumbuhan berbiji, menjadi "sepupu" dari kelompok ini. Penemuan ini menyebabkan pemahaman klasik dipertanyakan keabsahan evolusionernya. Karena itu, diperkenalkan pengelompokan tumbuhan paku dalam "arti sempit", yang tidak mencakup Lycopodiinae. Klasifikasi tumbuhan paku berikut ini menggabungkan Lycopodiophyta dan Pteridophyta. Cakupan ini parafiletik, tetapi inilah pemahaman yang digunakan selama ini dan cukup mudah untuk difahami, berdasarkan penampilan fisik. Divisio: Lycopodiophyta dengan dua kelas yang masih lestari: Lycopodiopsida dan Isoëtopsida. Divisio: Pteridophyta dengan empat kelas monofiletik yang masih lestari: Psilotopsida, mencakup Ophioglossales.
Equisetopsida
Marattiopsida
Polypodiopsida Divisio ini mencakup semua tumbuhan yang biasa dikenal sebagai paku sejati atau paku benar.
Berikut adalah klasifikasi lengkap menurut Smith et al. (2006):