Indonesia Soccer Championship U-21 2016

Indonesia Soccer Championship U-21 2016 adalah kompetisi untuk usia maksimal 21 musim pertama Indonesia Soccer Championship U-21 yang diikuti oleh 18 klub junior dari Indonesia Soccer Championship A. Kompetisi dimulai pada tanggal 31 Juli 2016. Pada pertengahan Juli, PT. GTS sekalu penyelenggara memutuskan laga pembuka bermain pada tanggal 6 Agustus. Jadwal ini kemudian diundur hingga 12 Agustus agar bertepatan dengan jadwal dimulainya Liga 3. PS TNI memenangkan gelar musim pini pada 13 Desember 2016 setelah mengalahkan Bali United dengan skor 6–1 pada pertandingan final.