Ganda putra pada Kejuaraan Tenis Meja Dunia 1999

Ganda putra pada Kejuaraan Tenis Meja Dunia 1999 adalah edisi ke-45 dari kejuaraan ganda putra. Kong Linghui dan Liu Guoliang berhasil memenangkan gelar setelah mengalahkan Wang Liqin dan Yan Sen di final dengan skor 3-2.