National Soccer League 1999–2000

National Soccer League 1999–2000 adalah edisi ke-24 dari penyelenggaraan National Soccer League, turnamen liga sepak bola tertinggi di Australia. South Melbourne merupakan juara bertahan setelah menjadi juara pada edisi sebelumnya. Pada kompetisi reguler, Perth Glory menjadi pemuncak klasemen. Musim ini dimenangkan oleh Wollongong Wolves, setelah mengalahkan Perth Glory pada pertandingan final dengan skor 3–3. Medali Johnny Warren diraih oleh pemain Wollongong Wolves, Scott Chipperfield, sementara medali Joe Marston diraih oleh pemain Wollongong Wolves, Scott Chipperfield. Pemain Adelaide City, Damian Mori menjadi pencetak gol terbanyak dengan raihan 22 gol.