Daftar museum di Kalimantan Timur

Berikut adalah daftar museum di Kalimantan Timur berdasarkan data dari Asosiasi Museum Indonesia dan Kemendikbud. Terdapat total 7 museum di Kalimantan Timur yang terdaftar di Kemendikbud. Daftar museum ini diurutkan berdasarkan kabupaten dan abjad sebagai berikut: