Babak gugur Liga Champions AFC 2012

Babak gugur Liga Champions AFC 2012 adalah babak ketiga dari Liga Champions AFC 2012 yang berlangsung sejak 22 Mei hingga 10 November 2012. 16 tim berhak mengikuti babak ini setelah melaju dari babak grup untuk menentukan pemenang turnamen. Babak ini menggunakan sistem gugur yang dimainkan dalam satu atau dua pertandingan. Pada babak 16 besar, hanya satu pertandingan yang dimainkan dan diselenggarakan oleh setiap juara grup melawan juara kedua dari grup lainnya. Dalam babak perempat final dan semifinal, pertandingan dimainkan dua kali dengan sistem kandang-tandang. Pertandingan final diselenggarakan oleh salah seorang finalis yang ditentukan melalui pengundian. Peraturan gol tandang, perpanjangan waktu, dan adu penalti digunakan jika diperlukan untuk menentukan pemenang. Dalam pengundian, jika terdapat dua klub dari negara yang sama, maka mereka dapat tidak saling berhadapan pada babak perempat final, tetapi jika terdapat lebih dari dua klub, mereka dapat saling berhadapan pada perempat final.