Pola molekuler terkait patogen

Molekul-molekul ini dapat disebut sebagai motif molekul kecil yang lestari dalam kelas mikrob. Mereka dikenali oleh reseptor toll-like (TLR) dan reseptor pengenal pola lainnya (PRR) pada tumbuhan dan hewan. Sejumlah besar jenis molekul yang berbeda dapat berfungsi sebagai PAMP, termasuk glikan dan glikokonjugat. PAMP mengaktifkan respons imun bawaan, melindungi inang dari infeksi, dengan mengidentifikasi beberapa molekul nonself yang dilestarikan. Bakterial lipopolisakarida (LPS), suatu endotoksin yang ditemukan pada membran sel bakteri gram negatif, dianggap sebagai kelas prototipe PAMP. LPS secara khusus dikenali oleh TLR4, sebuah reseptor pengenalan sistem imun bawaan. PAMP lainnya termasuk bakteri flagellin, asam lipoteikoat dari bakteri gram positif, peptidoglikan, dan asam nukleat varian biasanya terkait dengan virus, seperti unting ganda RNA (dsRNA), dikenali oleh TLR3 atau motif CpG yang tidak termetilasi, dikenali oleh TLR9. Meskipun istilah "PAMP" relatif baru, konsep bahwa molekul yang berasal dari mikrob harus dideteksi oleh reseptor dari organisme multisel telah ada selama beberapa dekade, dan referensi ke "reseptor endotoksin" ditemukan dalam banyak literatur yang lebih tua.