Promoter inti

Promoter inti adalah area pada gen sel eukariota yang disebut pulau CpG, yang terdiri dari kotak TATA, INR, kotak GC, kotak CCAAT, BRE, MTE, DCE dan DPE. Promoter inti merupakan tempat awal terjadinya proses transkripsi oleh RNA polimerase II dan tempat proses transkripsi tersebut dikendalikan. Hingga saat ini, hanya kotak TATA dan INR yang dapat mengarahkan proses inisiasi transkripsi oleh RNA polimerase II dengan akurat. Promoter ini dapat menginisiasi dua jenis transkripsi: Inisiasi terfokus, jika transkripsi dimulai dari sebuah nukleotida atau di dalam sebuah kluster dari beberapa nukleotida. Promoter inti dengan inisiasi terfokus ditandai dengan adanya kotak TATA dan DPE.
Inisiasi terdispersi, jika transkripsi dimulai serentak pada banyak promoter inti yang melibatkan lebih dari 50 nukleotida. Model inisiasi ini ditemukan pada hampir 2/3 makhluk vertebrata. Gen yang terkendali cenderung untuk memiliki promoter inti terfokus, sedangkan gen konstitutif sering kali memiliki promoter inti yang terdispersi. Oleh sebab itu, pada vertebrata, promoter inti terfokus ditemukan pada fraksi gen yang pendek namun memiliki fungsi biologis yang sangat vital.