Q:

Теперь за не принятую правку снимают репу? 

Сегодня смотрю помимо всего прочего -2.  Думаю кто-то проголосовал против.  Да нет никто не голосовал.  А ссылка на -2 на вопрос, который я недавно редактировал.  
Теперь за не принятую правку снимают репу? 

A:

Что-то поменялось, видимо.  Или баг. 
Нашёл вот такой вопрос с ответом от сотрудника: Репутация при откате не должна теряться. 
Задал на MSE вопрос по этому кейсу. 
Есть вот такое обсуждение:

...if the edit was previously approved, it will be marked Rejected and the previously-applied edit will be rolled back (complete with a comment in the revision history that describes what happened).  If the editor earned +2 reputation for the edit, that will be retracted. 

Если откатывает автор или модератор, то снимают 2 репутации.