Apa itu genomik komparatif?

Inti dari analisis genom komparatif adalah pembentukan korespondensi antara gen (analisis orthologi) atau fitur genomik lainnya dalam organisme yang berbeda. Peta intergenomik inilah yang memungkinkan untuk melacak proses evolusi yang bertanggung jawab atas divergensi dua genom. Banyak peristiwa evolusi yang bertindak di berbagai tingkat organisasi membentuk evolusi genom. Pada tingkat terendah, mutasi titik mempengaruhi nukleotida individu. Pada tingkat yang lebih tinggi, segmen kromosom besar mengalami duplikasi, transfer lateral, inversi, transposisi, penghapusan dan penyisipan. Pada akhirnya, seluruh genom terlibat dalam proses hibridisasi, poliploidisasi dan endosimbiosis, yang sering mengarah pada spesiasi yang cepat. Kompleksitas evolusi genom menimbulkan banyak tantangan menarik bagi pengembang model matematika dan algoritma, yang menggunakan spektrum algoritma, teknik statistik dan matematika, mulai dari pendekatan, heuristik parameter tetap, dan algoritma berdasarkan model Monte Carlo untuk mendeteksi sekuensi protein. Banyak masalah untuk analisis rantai probabilitas didasarkan pada model ini untuk algoritma dan algoritma penugasan yang tepat berdasarkan model homologi Markov dan algoritma untuk mendeteksi sekuensi keluarga.