Apa itu DNA sequence assembly?

Dalam bioinformatika, perakitan urutan mengacu pada penyelarasan dan penggabungan fragmen dari urutan DNA yang lebih panjang untuk merekonstruksi urutan asli. Hal ini diperlukan karena teknologi sekuensing DNA mungkin tidak dapat'membaca' seluruh genom sekaligus, tetapi membaca potongan kecil antara 20 dan 30.000 basa, tergantung pada teknologi yang digunakan. Biasanya, fragmen pendek (baca) hasil dari sekuensing shotgun genomik DNA, atau transkrip gen (ESTs). Masalah perakitan urutan dapat dibandingkan dengan mengambil banyak salinan buku, melewati masing-masing melalui shredder dengan pemotong yang berbeda, dan mengombinasikan teks buku kembali hanya dengan melihat potongan-potongan yang dihancurkan. Selain kesulitan yang jelas dari tugas ini, ada beberapa masalah praktis tambahan: asli mungkin memiliki banyak paragraf yang diulang, dan beberapa potongan mungkin dimodifikasi selama penghancuran untuk memiliki kutipan ketik. Beberapa buku mungkin juga ditambahkan, dan mungkin tidak dapat dikenali sama sekali, dalam shredder.