Jabarkan Konflik dengan PKI memuncak dari Parti Murba dalam bahasa melayu

Pada April 1964, Parti Murba mencadangkan supaya sistem satu parti diperkenalkan di Indonesia, meminta sokongan daripada Presiden Sukarno untuk idea itu. Tujuan asas rancangan itu adalah untuk menghapuskan PKI sebagai kuasa politik yang bebas. Parti-parti seperti Parti Nasional Indonesia dan Nahdatul Ulama membantah cadangan tersebut, dan akhirnya Parti Murba gagal meyakinkan Sukarno untuk menyokong cadangan tersebut.   Walau bagaimanapun, cadangan itu mendapat tidak banyak sokongan daripada sektor tentera.  Kemudian pada tahun yang sama, apabila Presiden Sukarno menyatakan kesediaannya untuk memasukkan PKI dalam kerajaan, Parti Murba merupakan salah satu parti yang menyuarakan penentangannya.

Dalam tempoh ini, Parti Murba menjadi sasaran umum oleh PKI. Dalam kempen besar-besaran anti-kenaikan harga, PKI memilih menteri Parti Murba Adam Malik dan Chaerul Saleh sebagai bertanggungjawab. Isu-isu yang telah membangkitkan kemarahan PKI ialah perkara pakatan Parti Murba dengan sektor anti-Komunis dan pegawai tentera anti-Sukarno, sokongan Parti Murba untuk import filem AS dan hubungan rahsia Soviet-Murba.

Tindakan keras terhadap Parti Murba

Pada 6 Januari 1965, kerajaan mengisytiharkan bahawa kegiatan Parti Murba telah 'dibekukan' dan Pemimpin Parti Murba telah ditangkap. 'Pembekuan' Parti Murba berikutan larangan Sukarno terhadap 'Badan Mempromosikan Sukarnoisme' (BPS, di mana tokoh-tokoh terkemuka Parti Murba telah memainkan peranan utama).  Melalui aktivitinya di BPS (yang menjurus ke arah mematahkan pengaruh politik PKI), Parti Murba telah bergerak di luar sempadan politik konsep Nasakom Demokrasi Terpimpin Sukarno.  Sukarno percaya bahawa kempen BPS telah dimanipulasi oleh Agensi Perisikan Pusat AS.

Diikuti oleh 'pembekuan' Parti Murba, PKI meneruskan serangan ganas terhadap parti itu. PKI mengisytiharkan bahawa Parti Murba adalah parti ' Trotskyites ' dan 'agen imperialis '. Tuntutan dibangkitkan supaya menteri Parti Murba dipecat daripada kerajaan, akhbar pro-Murba ditutup dan ahli Parti Murba dipecat daripada kesatuan wartawan dan struktur separuh rasmi yang lain.

Di bawah rejim Orde Baru

Selepas pergolakan politik 1965–1966, Parti Murba meneruskan aktivitinya. Nasib baik, ia mampu mengekalkan poket kecil pengaruh.  Pada Februari 1966, Adam Malik menjadi Menteri Luar Negeri dan Timbalan Perdana Menteri di bawah Sukarno dalam kabinet Dwikora II & Dwikora III sehingga Julai 1966.

Di bawah pemerintahan Suharto, parti-parti politik 'Orde Lama' yang masih hidup telah didesak untuk menyatukan diri mereka menjadi dua blok politik iaitu satu Islam dan satu 'sekular'. Parti Murba termasuk dalam kategori terakhir dan pada bulan Mac 1970 telah ditubuhkan Kumpulan Pembangunan Demokratik ( Kelompok Persatuan Pembangunan ) yang terdiri daripada Parti Murba, Partai Nasional Indonesia (PNI), Liga Penyokong Kemerdekaan Indonesia (IPKI), Parti Murba. Parti Katolik dan Parti Kristian Indonesia (Parkindo).

Parti Murba mengambil bahagian dalam pilihan raya parlimen 1971 . Parti itu telah mendapat 48,126 undi di seluruh negara (0.1%), dan gagal memenangi sebarang kerusi.

Pada 10 Januari 1973, Parti Murba dan ahli Kumpulan Pembangunan Demokratik yang lain digabungkan untuk menjadi  Parti Demokratik Indonesia.