Jabarkan Sejarah dari Sungai Sebuku dalam bahasa melayu

Pada kurun ke-19, sungai ini pernah dianggap sebagai sempadan paling selatan pengaruh Kesultanan Sulu di pulau Borneo, dengan itu ada dinyatakan dalam perjanjian 1878 yang kini menjadi pertikaian dalam tuntutan Filipina ke atas pantai timur Sabah.

Pada penghujung abad ke-19, sungai ini sekali lagi menjadi titik pertelingkahan antara Syarikat British Borneo Utara dan kerajaan Belanda di Borneo. Ini adalah kerana kerajaan British mengambil Sungai ini sebagai sempadan paling selatan antaranya dengan Belanda, manakala Belanda pula menganggap sempadan itu berada lebih ke utara iaitu di Batu Tinagat, Tawau. Perselisihan ini diselesaikan pada tahun 1899 dengan mengambil jalan tengah (kompromi), di mana sempadan yang dipersetujui terletak di perantaraan dua-dua tempat tersebut.