Jabarkan Hubungan filogenetik dari Koanoflagelat dalam bahasa melayu

Koanoflagelat tergolong dalam Chrysophyceae sehingga kajian Hibberd pada tahun 1975. Pembinaan semula filogenetik molekul terkini bagi hubungan dalaman koanoflagelat membolehkan polarisasi evolusi watak dalam klad. Serpihan besar gen pengekodan SSU nuklear dan LSU ribosom RNA, alpha tubulin dan protein kejutan haba 90 digunakan untuk menyelesaikan hubungan dalaman dan kekutuban watak dalam koanoflagelat. Setiap daripada empat gen menunjukkan keputusan yang sama secara bebas dan analisis set data gabungan (bercantum) bersama-sama dengan jujukan daripada spesies lain yang bersaudara rapat (haiwan dan kulat) menunjukkan bahawa koanoflagelat diyakini bersifat monofiletik dan disahkan tarafnya sebagai hidupan unisel wujud yang paling rapat bersaudara dengan haiwan.

Sebelum ini, Choanoflagellida terbahagi kepada tiga keluarga ini berdasarkan komposisi dan struktur periplasnya: Codonosigidae, Salpingoecidae dan Acanthoecidae. Ahli-ahli keluarga Codonosigidae kelihatan tidak mempunyai periplas apabila diperhatikan dengan mikroskop cahaya, tetapi mungkin mempunyai lapisan luar halus yang hanya boleh dilihat melalui mikroskop elektron. Keluarga Salpingoecidae terdiri daripada spesies yang sel-selnya terbungkus dalam theca teguh yang terlihat melalui mikroskop cahaya dan elektron.  ini ialah penutup yang dirembeskan yang kebanyakannya terdiri daripada selulosa atau polisakarida lain. Bahagian-bahagian ini kini dikenali sebagai parafiletik dengan evolusi tumpu meluas bagi bentuk-bentuk ini. Keluarga koanoflagelat ketiga, iaitu Acanthoecidae, telah disokong sebagai kelompok monofiletik. Klad ini mempunyai sinapomorfi sel yang ditemui dalam lorika seperti bakul, memberikan nama alternatif "Koanoflagelat Lorikat". Lorika Acanthoecidae terdiri daripada serangkai jalur-jalur kosta silika yang disusun menjadi corak lorika khusus spesies."

Pokok koanoflagelat berdasarkan filogenetik molekul terbahagi kepada tiga klad yang disokong dengan baik. Klad 1 dan Klad 2 masing-masing terdiri daripada gabungan spesies yang secara tradisinya dikaitkan dengan Codonosigidae dan Salpingoecidae, manakala Klad 3 terdiri daripada spesies daripada kelompok taksonomi yang diklasifikasikan sebagai Acanthoecidae. Pemetaan ciri-ciri watak pada filogeni ini menunjukkan bahawa leluhur sepunya terakhir koanoflagelat ialah organisma marin dengan kitaran hidup yang mempunyai peringkat sesil dan motilberbeza.