Jabarkan Musim 2012-13 dari Jupp Heynckes dalam bahasa melayu

Bayern memulakan musim 2012-13 dengan kejayaan menewaskan Borussia Dortmund 2-1 dalam DFL-Supercup. Ia merupakan satu keputusan yang memberangsangkan apabila Bayern tewas dalam tiga pertemuan dengan die Schwarzgelben pada musim-musim sebelumnya. Kempen Bundesliga Bayern bermula dengan lapan kemenangan berturut-turut.

Pada 16 Januari 2013, Bayern mengumumkan bahawa bekas pengurus Barcelona, Pep Guardiola akan menggantikan Heynckes pada Julai 2013. Pengurus Besar Bayern, Uli Hoeneß seterusnya menyatakan Heynckes tidak membuat keputusan untuk meninggalkan Bayern namun tindakan kelab yang menginginkan perkhidmatan Guardiola. Selepas perlawanan liga disambung berikutan percutiam musim sejuk, Bayern memenangi 14 perlawanan berturut-turut dari bulan Januari dan seterusnya sebelum dinobatkan sebagai juara Bundesliga pada 6 April 2013. Seterusnya, Bayern menjadi pasukan terawal merangkul Bundesliga selain memecahkan beberpa rekod lain ketika musim ini antaranya pengutipan mata tertinggi (91), kemenangan berturut-turut terpanjang (14), kemenangan tertinggi dalam satu musim (29), perbezaan gol terbanyak dalam satu musim (+80) dan jumlah gol dibolos paling sedikit dalam satu musim (18). Pasukan ini turut menjaringkan gol dalam setiap perlawanan dan hanya menempuhi satu kekalahan.

Pada 23 Februari 2013, Heynckes mengendali Bayern dalam perlawanan ke-1000 Bundesliganya sebagai seorang pemain dan pengurus sekali gus menjadikan beliau sebagai insan kedua yang melakukan kemunculan tertinggi dalam sejarah Bundesliga. Pada 14 Mei 2013, beliau mengendali perlawanan Bundesliga yang dianggap buat kali terakhir. Lebih dramatik lagi, perlawanan tersebut berlangsung di Borussia Mönchengladbach, kelab di mana Heynckes memulakan karier dan berkhidmat selama 20 tahun sebagai pemain dan pengurus.

Dalam saingan Liga Juara-Juara, Bayern menumbangkan Barcelona pada peringkat separuh akhir selepas menang 7-0 menerusi agregat untuk melangkah ke perlawanan akhir. Heynckes membawa Bayern menewaskan pesaing ketat kelab, Borussia Dortmund 2-1 di Stadium Wembley. Heynckes menjadi pengurus keempat (selepas Ernst Happel, Ottmar Hitzfeld dan José Mourinho) untuk meraih Liga Juara-Juara bersama dua kelab berbeza.

Pada 1 Jun 2013, Heynckes mengendali Bayern buat kali terakhir pada perlawanan akhir DFB-Pokal menentang VfB Stuttgart. Bayern akhirnya menang 3-2 dan melengkapkan "treble" dalam satu siri musim. Bekas kapten Bayern dan pasukan Jerman Barat, Franz Beckenbauer yang membawa die Roten merangkul tiga trofi Piala Eropah berturut-turut pada era 1970an, mengungkapkan pasukan Bayern di bawah kendalian Heynckes adalah "pasukan terbaik Bayern selamanya" dan pandangan ini turut disertai bekas penyerang legenda Bayern, Karl-Heinz Rummenigge.

Pada 4 Jun 2013, Heynckes mengumumkan bahawa beliau tidak akan menjadi pengurus kelab ketika musim 2013-14.