Jabarkan Komander dari Majlis Pertahanan Croatia dalam bahasa melayu

April 1992 hingga  ?, Brigadier Jeneral Milivoj Petković;

? hingga  November 1993, Mejar Jeneral Slobodan Praljak;

November 1993 hingga ?, Leftenan Jeneral Ante Roso;

? hingga Ogos 1994 Mejar Jeneral Milivoj Petkovic;

Ogos 1994 hingga November 1995, Mejar Jeneral Tihomir Blaskic.

HVO berpusat di bandar Mostar dan dibahagikan kepada empat buah kor/zon operasi (OZ): 1OZ/Tenggara (Herzegovina) dan 2OZ/Barat Laut Herzegovina, 3OZ/Bosnia Tengah dan 4OZ/Posavina. Sementara tiga buah zon pertama dikumpulkan bersama, Posavina yang terpencil di utara Bosnia pada tebing sungai Sava di sekeliling Orašje dan hanya bergantung pada sokongan daripada Croatia. Terdapat juga sebuah ibu pejabat HCO di enklaf Bihac yang bekerjasama dengan Kor ke-5 ABiH. Setiap OZ mengawal 8-14 buah briged infantri, sebuah batalion polis tentera dan sebuah "Batalion Serangan Ringan".

HVO juga terdiri daripada Rejimen Ante Bruno Busic bersaiz briged yang dianggotai oleh tentera sepenuh masa, dua buah batalion infantri bebas, sebuah batalion artileri anti pesawat ringan, Pasukan Khas dan unit-unit artileri.