Jabarkan Mata pelajaran agama dari Mahmud Yunus dalam bahasa melayu

Jawatan Pengajaran Sumatera Barat dikepalai oleh Saaduddin Jambek menerima cadangan beliau agar mata pelajaran agama diterapkan mulai 1 April 1946 di seluruh Sumatera Barat.

Pada November 1946 bertugas di Pematangsiantar sebagai Kepala Bagian Agama Islam Jawatan Agama Provinsi Sumatera. Kursus untuk diberikan kepada guru-guru agama di Pematangsiantar.

Semasa Darurat Republik Indonesia, Yunus mendirikan Madrasah Tsanawiyah di Sumatera dan dipersetujui oleh Menteri Agama . Sekolah Menengah Pertama Islam (SMPI) didirikan di Sumatera Barat dan dikendali secara swasta.

Pada tahun 1950, Yunus mencadangkan kurikulum di Sumatera diselaraskan dengan kurikulum nasional. Hasilnya pendidikan agama Islam baru dapat diberikan untuk kelas IV sampai kelas VI tingkat sekolah rendah dan kekal hingga sekarang.

Dekan Akademi Dinas Ilmu Agama

Pada 8 Julai 1945, Sekolah Tinggi Islam (STI) didirikan di Jakarta. Pada 1946, STI dipindahkan ke Yogyakarta. STI ditukar menjadi Universiti Islam Indonesia (UUI) pada 22 Mac 1948. Fakulti Agama UII ditukar kepada Perguruan Tinggi Agama Islam Negeri (PTAIN) Yogyakarta.

Pada 1 Jun 1957, Jabatan Agama mendirikan Akademi Dinas Ilmu Agama (ADIA) di Jakarta dan Yunus dilantik sebagai rektor pertama ADIA. Tahun 1960,nama PTAIN ditukar kepada Institut Agama Islam Negeri (IAIN).

Selaku Dekan Fakulti Tarbiyah di IAIN (1960), beliau berkunjung ke Mesir, Arab Saudi, Syria, Lebanon, Jordan, Turki, Iraq, Tunisia dan Marokko (1961). Pada 1962 diundang oleh Raja Sa'ud hadir ke Madinah Tahun-tahun 1964, 1965, 1966, dan 1967 beliau ke Mesir. Beliau menulis buku "Al-Israiliyyat fit Tafsir wal Hadits" dan mendapat perhatian para peserta.

Beliau dilantik sebagai rektor pertama IAIN Imam Bonjol (1967-1970). Pada 15 Oktober 1977, beliau memperoleh gelar doktor kehormatan di bidang ilmu tarbiyah dari IAIN Jakarta .