Jabarkan Musim 2008–09 dari Martin Škrtel dalam bahasa melayu

Škrtel memulakan langkah baik untuk musim 2008-09 dengan bermain semua perlawanan liga dan kecuali satu perlawanan selepas Daniel Agger diletakkan di kesebelasan utama. Pada 5 Oktober 2008, beliau mengalami kecederaan lutut serius selepas jatuh ketika dicabar oleh Ched Evans pada lewat perlawanan menentang Manchester City. Liverpool memenangi perlawanan itu 3-2 tetapi beliau menerima rawatan dan kembali semula enam minggu kemudian.

Pada 28 Disember 2008, Škrtel kembali daripada kecederaan dan menjadi pemain gantian ketika Liverpool menang 5-1 ke atas Newcastle United. Beliau menjadi pemain utama Liverpool pada separuh kedua musim dan pasukannya menduduki tempat kedua Liga Perdana dengan mengutip 86 mata.