Jabarkan Borussia Dortmund dari Pierre-Emerick Aubameyang dalam bahasa melayu

Pada 4 Julai 2013, Aubameyang menyertai finalis Liga Juara-Juara, Borussia Dortmund dengan kontrak lima tahun.  Dia membuat penampilan kompetitif pertama untuk kelab barunya pada 27 Julai 2013 menentang Bayern Munich dalam DFL-Supercup, menggantikan Jakub Błaszczykowski pada separuh masa kedua dimana Dortmund menang 4–2.

Pada 10 Ogos 2013, Aubameyang membuat penampilan pertama Bundesliga dan menjaringkan gol hatrik menentang FC Augsburg. Dalam proses itu, Aubameyang juga menjadi pemain Gabon pertama untuk beraksi dalam Bundesliga. Pada 27 November 2013, Aubameyang menjaringkan gol pertamanya dalam Liga Juara-Juara Eropah ketika menang 3–1 ke atas Napoli dalam peringkat kumpulan.

Pada 13 Ogos 2014, Aubameyang menjaringkan gol kedua Borussia Dortmund ketika kemenangan 2–0 ke atas Bayern Munich dalam DFL-Supercup. Selepas menjaringkan gol itu, dia meraikan dengan memakai topeng Spider-Man. Dalam perlawanan Dortmund yang seterusnya, kemenangan 4–1 ke atas Stuttgart Kickers dalam pusingan pertama DFB-Pokal, Aubameyang menjaringkan dua gol pada separuh masa kedua dan membuat bantuan gol kepada Adrián Ramos. Pada 13 September, Aubameyang menjaringkan gol pertama Bundesliga untuk musim itu, menjaringkan gol ketiga Dortmund ketika kemenangan 3–1 ke atas SC Freiburg. Tiga hari kemudian, Aubameyang menjaringkan gol kedua Borussia Dortmund ketika kemenangan 2–0 ke atas Arsenal dalam perlawanan pertama peringkat kumpulan Liga Juara-Juara.