Jabarkan Kerajaan Howard dari Malcolm Turnbull dalam bahasa melayu

Ketika mengumumkan rombakan kabinet pada 24 Januari 2006, Perdana Menteri, John Howard menaikkan Turnbull dari ke Setiausaha Parlimen dengan tanggungjawab khas untuk air ketika kemuncak kemarau Australia 2000an. Dalam kapasiti baru ini, beliau melaporkan terus kepada Perdana Menteri. Pada 26 September 2006, Howard mengumumkan penubuhan dalam Jabatan Perdana Menteri dan Kabinet, "Pejabat Sumber Air" baru untuk menangani masalah kemarau di Australia. Turnbull diberi tugas untuk menguruskan pejabat ini sehingga dia dinaik pangkatkan oleh Howard sebagai Menteri Alam Sekitar dan Sumber Air pada bulan Januari 2007.

Dalam kedudukan beliau sebagai Menteri Alam Sekitar, Turnbull meluluskan cadangan Bell Bay Pulp Mill bernilai AUD1.7 bilion di utara Tasmania, berdekatan Launceston. Kelulusan Turnbull untuk projek Bell Bay Pulp Mill oleh Gunns Ltd datang pada 4 Oktober 2007 dan diikuti laporan oleh ketua saintis Kerajaan, Jim Peacock atas kemungkinan impak alam sekitar oleh projek itu, yang memerlukan projek itu untuk menepati 48 syarat "ketat alam sekitar".

Pada bulan Februari 2007, Turnbull dikritik kerana menerima elaun kerajaan AUD175 semalam dan membayar kepada isterinya sebagai sewa semasa tinggal di rumah bandar miliknya di Canberra.

Semasa kempen pilihan raya 2007, Turnbull mengumumkan bahawa Kerajaan pada masa itu akan menyumbang AUD10 juta kepada penyiasatan sebuah teknologi Rusia yang belum dicuba bertujuan untuk mencetuskan hujan daripada atmosfera walaupun tiada awan. Perbadanan Hujan Australia membentang dokumen penyelidikan itu ditulis dalam Bahasa Rusia, dijelaskan oleh seorang penyelidik Rusia yang bercakap kepada pakar-pakar tempatan dalam Bahasa Rusia. Walaupun Turnbull mendakwa Perbadanan Hujan Australia berpangkalan di Australia, siasatan mendedahkan bahawa ia 75 peratus dimiliki Switzerland. Ia juga didedahkan bahawa pihak berkepentingan dalam Perbadanan Hujan Australia, Matt Handbury, adalah anak saudara kepada Rupert Murdoch. Turnbull enggan menjawab soalan-soalan mengenali sumbangan Handbury kepada Forum Wentworth, organisasi mengumpul dana utama untuk kempen pilihan raya 2007 Turnbull.

Pada tahun 2007, Turnbull menjanjikan bahawa  kerajaan beliau, jika dipilih, akan memberikan manfaat kematian pasangan sama-seks dalam skim persaraan Komanwel, janji yang sama yang dibuat tiga tahun sebelum itu, semasa kempen pilihan raya persekutuan 2004.