Jabarkan Masyumi dan Revolusi Nasional dari Fakih Usman dalam bahasa melayu

Pada 9 Mac 1942 Gabenor-Jeneral Tjarda van Starkenborgh Stachouwer dan ketua Jeneral Tentera Hindia Belanda Diraja Belanda Hein ter Poorten menyerah kepada Empayar Jepun, yang telah menyerang Hindia pada bulan sebelumnya. Akibatnya, Hindia Belanda berada di bawah kawalan Jepun. Orang Jepun melarang semua bentuk organisasi, dan MIAI dibubarkan pada bulan Mei. Ia telah diperbaharui pada 5 September 1942 berikutan pertemuan 30 ulama di Hotel Des Indes di Jakarta, dan diiktiraf oleh kerajaan pendudukan sebagai satu-satunya organisasi Islam di negara ini. Pada akhir tahun 1943, organisasi itu dinamakan semula sebagai Parti Majlis Syura Muslimin Indonesia atau Masyumi. Fakih telah dijadikan ahli lembaga penasihat yang ditaja oleh Jepun, atau Syu Sangi In, untuk Surabaya. Beliau memegang jawatan ini sehingga akhir pendudukan, serentak berkhidmat di lembaga Masyumi.

Selepas pengeboman atom Hiroshima dan Nagasaki dan pengisytiharan kemerdekaan Indonesia pada bulan Ogos 1945, Jepun mula menarik diri dari republik yang baru lahir. Kerajaan republik Indonesia, yang berpusat di Jakarta dan termasuk Sukarno sebagai presiden dan Mohammad Hatta sebagai wakil presiden, mulai mengambil alih infrastruktur dari Jepun yang berangkat. Menjelang September 1945, bagaimanapun, pasukan bersekutu British dan Belanda mula memasuki kepulauan itu, dengan harapan dapat membina semula status quo ante. British pada mulanya memberi tumpuan kepada Jawa dan Sumatera dan cuba untuk mengelakkan konfrontasi bersenjata dengan pasukan Republikan; Sementara itu, Belanda menghabiskan bulan pertama setelah penyerahan Jepun menuntut kembali pulau timur dengan bantuan dari Australia.

Fakih, yang telah memulakan hubungan dengan pemerintah republik, telah mengambil bahagian dalam Persidangan Islam Indonesia (Muktamar Islam Indonesia) di Yogyakarta dari 7 hingga 8 November 1945. Sebagai hasil dari pembicaraan ini, Masyumi menjadi partai politik yang mewakili kepentingan Islam. Walaupun Fakih kembali ke Gresik selepas persidangan itu, dia dan keluarganya tidak lama lagi berpindah ke Malang akibat meletusnya pertempuran di Surabaya antara tentara Republikan dan pasukan British yang ditugaskan untuk memulangkan tawanan perang Belanda.

Di Malang, Fakih bekerja dengan Masjkur dan Zainul Arifin untuk memulakan perlawanan bersenjata untuk bertarung dalam revolusi melawan orang Eropah yang kembali. Beliau berkhidmat sebagai timbalan ketua dalam arahan rintangan ini, yang terdiri daripada unit Islam yang dilatih Jepun Sabilillah dan Hizbullah. Selepas Belanda melancarkan Operasi Kraai pada Disember 1948, Fakih dan keluarganya melarikan diri ke Surakarta, di mana ia kembali aktif di Muhammadiyah. Fakih, yang berkhidmat sebagai Timbalan Pengerusi di bawah Bagus Hadikusumo, sering berkeliaran di antara Surakarta dan ibu pejabat organisasi di Yogyakarta.