Jabarkan Sekembalinya di Geneva (1541–1549) dari Jean Calvin dalam bahasa melayu

Konsistori adalah sebuah peradilan gerejawi yang terdiri atas sejumlah penatua dan pendeta yang diberikan kuasa untuk mempertahankan ketertiban di dalam gereja dan  antara para anggotanya. Pelanggaran merentang dari menyebarkan doktrin yang salah hingga pelanggaran moral, misalnya berdansa dengan liar dan menyanyi dengan buruk. Bentuk-bentuk penghukuman biasanya lunak—pelanggar dapat disuruh menghadiri khotbah-khotbah yang disampaikan secara terbuka atau kelas-kelas katekisasi. Perlu diingat konteks geopolitik yang lebih luas dari lembaga ini sebelum kita menilainya. Kaum Protestan pada abad ke-16 seringkali dikenai tuduhan oleh pihak Katolik bahawa mereka menciptakan doktrin-doktrin baru dan bahawa inovasi seperti itu mahu tidak mahu menyebabkan kemerosotan akhlak dan, pada akhirnya, kehancuran masyarakat itu sendiri.

Calvin mendakwa bahawa beliau ingin menegakkan legitimasi moral dari gereja yang diperbarui sesuai dengan programnya, namun juga meningkatkan kesihatan dan kesejahteraan individu, keluarga, dan masyarakat. Dokumentasi yang baru-baru ini ditemukan mengenai jalannya Konsistori memperlihatkan setidak-tidaknya perhatian terhadap kehidupan rumah tangga dan kaum perempuan pada khususnya. Untuk pertama kalinya kaum laki-laki yang serong dihukum sama kerasnya dengan kaum perempuan, dan Konsistori sama sekali tidak memperlihatkan toleransi terhadap pemukulan atau penyiksaan terhadap pasangan (khususnya istri). Peranan Konsistori ini kompleks. Badan ini membantu mentransformasikan Geneva menjadi kota yang digambarkan oleh reformator Scotland John Knox sebagai "sekolah Kristus yang paling sempurna yang pernah ada di muka bumi sejak zaman para nabi."

Para pengkritik seringkali menganggap Konsistori sebagai lambang pemerintahan teokratis Calvin. Namun, tampaknya Calvin tidak bermaksud menggunakan Konsistori untuk mencapai tujuan-tujuan politiknya dan untuk mempertahankan kontrolnya terhadap kehidupan awam dan keagamaan di Geneva. Calvin bergerak dengan cepat untuk menjawab pertanyaan apapun yang diajukan tentang tindakan-tindakannya. Kejadian yang paling menonjol adalah kasus Pierre Ameaux dan Jacques Gruet. Calvin enggan menahbiskan orang-orang Geneva, karena beliau lebih suka memilih pendeta dari arus para imigran Perancis yang masuk ke kota itu dengan maksud semata-mata mendukung program pembaruan Calvin. Ketika Pierre Ameaux mengeluh tentang praktik ini, Calvin menganggapnya sebagai serangan terhadap kewibawaannya sebagai seorang pendeta, dan beliau membujuk dewan kota untuk memaksa Ameaux untuk berjalan mengelilingi kota dengan berpakaian rambut dan memohon belas kasihan di lapangan-lapangan terbuka. Jacques Gruet memihak dengan sejumlah keluarga Geneva lama, yang menentang kekuasaan dan metode-metode Konsistori. Beliau dipersalahkan dalam suatu insiden di mana seseorang menempatkan sebuah plakat di salah satu gereja di kota itu, yang berbunyi: "Bila orang telah terlalu banyak menderita, balas dendam pun akan dilakukan." Calvin menyetujui bahawa Gruet disiksa sampai mati, dengan tuduhan bahawa beliau telah bersekongkol dengan sebuah komplotan Perancis untuk menyerang kota itu.

Pada 1553, dengan persetujuan Calvin, Michael Servetus dihukum mati terbakar pada sebuah tiang atas tuduhan menyebarkan ajaran sesat. Servetus dipandang banyak Unitarian sebagai salah seorang pendiri agama mereka. Calvin sendiri meminta dewan - namun gagal - agar hukuman mati itu diubah dari hukuman bakar dengan hukuman mati dengan pedang. Rincian historis dapat ditemukan dalam Schaff. Calvin tetap pada posisinya hingga beliau meninggal. Hukuman mati Servetus merupakan sebuah argumen utama yang digunakan untuk menyerang Calvin sejak masa hidupnya hingga sekarang, meskipun sejumlah sejarahwan percaya bahawa "Calvin hanya sial, dan bukannya bersalah besar karena intoleransi di antara para Reformator. Beliau dan Servetus adalah orang-orang yang paling banyak diserang pada abad ke-16. Nama baik Calvin telah dijelek-jelekkan, sementara Servetus telah terlalu jauh dibersihkan dari kesalahan jauh melampaui titik tolak abad ke-16, bukan abad ke-19."

Pada 1559 Calvin mendirikan sebuah sekolah khusus - collège -  untuk mendidik anak-anak serta rumah sakit untuk merawat orang miskin. Tempat sekolah ini dipilih pada tanggal 25 Mac 1558 dan sekolah itu dibuka tanggal 5 Jun tahun berikutnya. Sekolah ini diuruskan dalam dua bahagian: sekolah gramatika yang disebut collège atau schola privata dan sekolah lanjutan yang disebut académie atau schola publica. Banyak profesor disaring agar mendapatkan orang yang sesuai dijadikan pengajar; Theodore Beza dilantik sebagai irektor institut ini. Dalam masa lima tahun ia didirikan, terdapat sejumlah ada 1.200 orang murid pada sekolah gramatika dan 300 orang murid pada sekolah lanjutan. Sekolah besar ini lama-kelamaan dipecahkan bagi menumpukan kepada bidang tersendiri: sekolah gramatika atau collège akhirnya menjadi "Collège Calvin", salah satu sekolah persiapan perguruan tinggi di Geneva; manakala sekolah académie menjadi Universiti Geneva.