Jabarkan Plot dari Mega Man X5 dalam bahasa melayu

Dalam permainan video ini, ketua Maverick iaitu Sigma berjaya dihidupkan kembali setelah kalah dalam pertembungan dalam permainan video Mega Man X4. Sigma memulakan kajian terhadap asal usul serta reka bentuk Mavrick Hunter Zero dan membuat keputusan ingin mencari kuasa terpendam yang terdapat pada Zero yang akan digunakan untuk memusnahkan X. Pada permulaan, Sigma berlawan dengan Maverick Hunter dan berniat untuk tewas supaya virus Maverick dapat disebarkan di Bumi dan menyebabkan kekacauan.

Sementara itu, Sigma mengupah seorang pejuang Reploid iaitu Dynamo untuk membuatkan Eurasia berlanggar dengan Bumi. Maverick Hunter hanya mempunyai 16 jam sahaja untuk menghalang pelanggaran itu. Untuk menghentikan pelanggaran itu, mereka mempunyai 2 pilihan. Pilihan pertama adalah menembak meriam berkuasa tinggi diberi nama Enigma ke kawasan Eurasia dan memusnahkannya. Jika tembakan meriam ini gagal menghancurkan Eurasia, mereka mempunyai pilihan kedua iaitu menghantar kapal angkasa ke Eurasia, mengawal gerakan kawasan Eurasia supaya tidak berlanggar dengan Bumi dan memusnahkannya. Untuk menaikkan peluang kedua-dua pilihan ini, X dan Zero perlu untuk mencari barang-barang tambahan yang terdapat dalam setiap peringkat dengan bantuan beberapa Maverick Hunter lain iaitu Alia, Douglas dan Signas.

Kejayaan meriam Enigma adalah berlaku secara rawak di dalam permainan ini. Selepas insiden ini, virus baru telah muncul di Bumi, di mana menurut Alia, virus itu merupakan gabungan di antara virus Sigma dan hidupan yang terdapat di Eurasia. Plot selepas ini bergantung kepada kejayaan meriam Enigma dan kapal angkasa menembak dan menghancurkan Eurasia sebelum berlanggar dengan Bumi. Jika Eurasia berjaya dihancurkan, X dan Zero akan meneruskan misi mencari punca kepada penyebaran virus tersebut dan jika mereka gagal menghancurkan Eurasia atau masa 16 jam yang ditetapkan tamat, Eurasia akan berlanggar dengan Bumi dan menyebabkan Bumi hampir musnah dan juga mengakibatkan Zero dijangkiti virus tersebut. Selepas lokasi punca virus ini ditemui, X dan Zero memasuki ke kubu di bawah tanah untuk meneruskan siasatan. Di sini X dan Zero bertemu sesama sendiri dan akibat daripada saling tidak mempercayai antara satu sama lain, mereka melawan sesama sendiri.