Jabarkan Jun dari 2009 di Malaysia dalam bahasa melayu

1 Jun – TV3 meraikan hari ulang tahunnya yang ke-25.

2 Jun – Bumbung Stadium Sultan Mizan Zainal Abidin di Kuala Terengganu runtuh.

3 Jun – Mohd Najib bin Abdul Razak melawat China buat kali pertama dan bermesyuarat dengan Perdana Menteri Wen Jiabao.

6 Jun – Arwah isteri Perdana Menteri Malaysia kelima Abdullah bin Ahmad Badawi, Endon Mahmood, dianugerahkan Seri Setia Mahkota (SSM) yang membawa gelaran "Tun" oleh Yang di-Pertuan Agong Tuanku Mizan Zainal Abidin.

16 Jun – "Jeneral" dan pemimpin kepada pertubuhan haram Pasukan Khas Persekutuan Malaysia (PKPM), Nor Azami Ahmad Ghazali ditangkap di Taman Gombak Jaya, Selangor, bersama-sama dengan 42 orang.

17 Jun – Wabak Influenza A H1N1:

Jangkitan setempat pertama influenza A (H1N1) dilaporkan melibatkan kes ke-19 kerana orang itu tidak mempunyai riwayat perjalanan ke negara yang mengalami selesema.

18 Jun – Wabak Influenza A H1N1:

Timbalan Perdana Menteri Malaysia, Tan Sri Muhyiddin Yassin mengisytiharkan bahawa semua pelawat dan warga Malaysia yang pulang dari luar negara perlu mengisi borang pengisytiharan kesihatan berikutan pandemik influenza A (H1N1) di seluruh dunia.

21 Jun – Lee Chong Wei, pemain badminton terbaik di dunia dari Malaysia, memenangi Siri Super Indonesia selepas menewaskan Taufik Hidayat, pemain handalan Indonesia.

22 Jun – Wabak Influenza A H1N1:

SJKC Jalan Davidson, sebuah sekolah rendah aliran Cina di Kuala Lumpur, menjadi sekolah pertama ditutup, akibat virus influenza A (H1N1).

22 Jun – Satelit MEASAT-3a dilancarkan dari Kosmodrom Baikonur, Kazakhstan.

26 Jun-28 Jun – Datuk Siti Nurhaliza mengadakan persembahannya di konsert SATU Konsert Eksklusif Dato' Siti Nurhaliza di Istana Budaya.