Jabarkan Aktiviti Jemaah Islamiyah dari Zulkifli Abdul Hir dalam bahasa melayu

Pada 2001 beliau dicari bersama Mohd. Rafi Udin, 34 ; pendakwah bebas rakyat Indonesia, Abdus Samad Abud @ Kiai Abu Bakar Basyir, 62 ; Hambali @ Nurjaman @ Riduan Isamuddin ; Zid Saharani Mohamad Esa, 29 ; dan Taufik Abdul Halim yang ditangkap oleh polis Indonesia selepas cuba mengebom pusat membeli-belah Atrium di Jakarta pada 1 Ogos 2001.  KMM pernah dikaitkan dengan pembunuhan Ahli Dewan Undangan Negeri kawasan Lunas, Dr. Joe Fernandez pada 9 November 2010.  Beliau juga dikaitkan dengan rompakan Southern Bank di Petaling Jaya pada Mei 2001 dan letupan bom kui Hindu di Jalan Pudu pada 2000.

Seorang lagi pakar membuat bom ,  Dr Azahari Husin terbunuh pada 9 November 2005.

Marwan dikaitkan dengan beberapa serangan pengeboman di Bali, Indonesia pada 2002 yang mengorbankan 202 orang.Sejak 2003, beliau dipercayai berada di selatan Filipina dan terselamat dalam beberapa siri serangan ke atas kumpulan militan di Kepulauan Laminusa pada Mac 2010 dan Oktober 2011 di wilayah Sulu.