Jabarkan Melanjutkan pengajian dari Abu Bakar Hamzah dalam bahasa melayu

Berikutan pemecatannya dari PAS, Abu Bakar meninggalkan Malaysia pada tahun 1976 untuk lawatan sambil belajar ke Timur Tengah, Afrika Utara dan Eropah. Akhirnya beliau memilih untuk belajar di Universiti of Kent, England dan lulus dengan ijazah Sarjana Falsafah dalam bidang Hal Ehwal Asia Tenggara. Beliau terus belajar untuk ijazah Ph.D. dalam bidang Perundangan di Universiti yang sama.

Pada tahun 1978, Abu Bakar bertugas sebagai Pengarah Pusat Bahasa Arab dan Tamadun Islam di Yayasan Pengajian Tinggi Islam Kelantan, Nilam Puri. Selepas enam bulan berkhidmat beliau terpaksa berhenti kerana kerajaan negeri tidak dapat melanjutkan Program Tamadun Islam. Selanjutnya beliau berkhidmat sebagai Pensyarah Kontrak di Akademi Islam, Universiti Malaya, Kuala Lumpur (1984-1986) dan sebagai Pensyarah Kontrak di Jabatan Pengajian Arab dan Tamadun Islam, Fakulti Pengajian Islam, Universiti Kebangsaan Malaysia hingga tahun 1990.

Beliau diterima semula ke dalam PAS pada Februari 1983 dan dilantik sebagai Jawatankuasa Agung PAS pada 1983 di bawah pimpinan Haji Yusuf Rawa. Pada Muktamar PAS 1985, beliau bertanding bagi jawatan Presiden PAS menentang Haji Yusuf Rawa dan Naib Presiden, tetapi kedua-duanya kalah.