Jabarkan Pelayanan di rantau Nusantara dari Francis Xavier dalam bahasa melayu

Francis Xavier tiba di Melaka pada Oktober 1545 dan melayani masyarakat setempat di kota itu sambil menunggu kapal untuk membawanya ke Makassar. Setelah tiga bulan sia-sia menunggu, Xavier membatalkan niatnya untuk ke Makassar dan pada 1 Januari 1546 telah bertolak ke Pulau Amboina dimana beliau telah tinggal sehingga bulan Jun. Xavier kemudian mengunjungi pulau-palau yang lain di Kepulauan Maluku seperti Ternate dan Morotai. Tidak lama selepas hari Paskah pada tahun yang sama, Xavier kembali ke Amboina dan kemudiannya kembali semula ke Melaka. Pada masa ini, Xavier telah mengutuskan surat kepada Raja John III yang menceritakan kehampaannya terhadap golongan elit di Goa dan meminta supaya Pasitan () dimulakan di Goa. Namun demikian, Pasitan Goa hanya dimulakan lapan tahun selepas Xavier wafat.

Usaha pelayanan Francis Xavier di Kepulauan Maluku membawa impak yang besar dikalangan masyarakat setempat sehingga beliau digelar sebagai Hawari Timur (). Hasil daripada pelayanan Xavier dari tahun 1546-1547 dikalangan penduduk Pulau Amboina, Ternate dan Morotai, agama Kristian bertapak di wilayah-wilayah tersebut dan kini menjadi agama terbesar di wilayah Nusa Tenggara Timur, Indonesia (91% penduduk wilayah ini beragama Kristian) .

Pada bulan Disember 1547, Francis Xavier bertemu dengan Anjiro, seorang samurai Jepun yang berasal dari Kagoshima yang pada masa itu sedang berteduh dibawah lindungan Portugis kerana dituduh membunuh di Jepun. Anjiro telah mendengar khabar tentang Francis Xavier dan berusaha untuk bertemu dengan beliau. Hasil daripada perbualan diantara Francis Xavier dengan Anjiro, Xavier sedar bahawa masyarakat Jepun mempunyai budaya yang agak maju dan beliau meminta supaya Anjiro membantunya sebagai pengantara dan penterjemah beliau untuk pelayannya di Jepun. Anjiro dibaptiskan oleh Francis Xavier dan mengambil nama baru, Pablo de Santa Fe.

Sebelum bertolak ke Jepun, Francis Xavier berangkat pulang ke Goa pada bulan Januari 1548 bagi membantu menyesuaikan mubaligh-mubaligh Jesuit yang baru tiba. Pentadbiran Kolej Teologi Santa Fe di Goa dialihkan kepada mubaligh-mubaligh Jesuit dan dibawah pentadbiran Francis Xavier, menjadi pusat latihan katekis dan paderi tempatan dari Keuskupan Goa yang pada masa itu merangkumi wilayah-wilayah diantara Tanjung Harapan, Afrika Selatan sehingga ke negeri China. Xavier juga telah menghantar dua orang mubaligh Jesuit, Francisco Peres dan Roque de Oliveira, ke Melaka untuk mengasaskan sebuah sekolah di kota tersebut yang kemudian dikenali sebagai Kolej St. Paul ( dan ). Kolej ini berfungsi sehingga kejatuhan Melaka ke tangan Belanda pada tahun 1641  .

Pada 15 April 1549, Francis Xavier bertolak dari Goa ke Jepun bersama-sama dengan dua orang mubaligh Jesuit, Cosme de Torrès dan João Fernandes, Anjiro berserta dengan dua orang lagi berbangsa Jepun yang dibaptis olehnya. Mereka sempat bersinggah sementara di Melaka dan mengunjungi kota Canton, China semasa perjalanan mereka.