Jabarkan Darurat ke-2 (1968-1975) dari Yuen Yuet Leng dalam bahasa melayu

Namun usaha penyergapan pegawai polis unit Cawangan Khas di negeri-negeri atau daerah tunggal seberang sempadan Thailand (kawasan-kawasan seperti Kedah, Perlis, daerah Hulu Perak serta Kelantan) pada tahun 1968 telah berjaya, tetapi peningkatan aktiviti Komunis di kawasan wilayah sempadan selatan Thailand yang semakin parah, akibat daripada kesan itu, darurat ke-2 bermula dan berlarutan selama 21 tahun sehingga 1989.

Pada tahun 1970, ACP (kemudian terus dinaikkan pangkat ke SAC) Yuen telah ditugaskan ke Sarawak untuk pertama kali (beliau hanya kembali 11 tahun kemudian pada tahun 1981 sebagai Pesuruhjaya Polis Negeri sehingga tahun 1983) di mana ancaman komunis daripada Parti Komunis Kalimantan Utara (NKCP) semakin meningkat. Pada awal 1972, tiga komander tentera Parti Komunis Kalimantan Utara berjaya dihapuskan di sempadan Malaysia-Indonesia.

Beliau kembali ke Kuala Lumpur pada masa yang sama, tetapi pada lewat tahun 1972, Yuen kembali ditugaskan di Sibu, Sarawak sebagai Ketua Cawangan Khas IPD Sibu, PDRM Kontinjen Sarawak merangkap Ketua Perisikan Gabungan dengan tugas menghapuskan ancaman gerila komunis. Ini dicapai dengan pembentukan Komander Keselamatan Rejang (RASCOM). Dengan itu, seramai 500 bekas pengganas kembali ke pangkuan masyarakat.

Beliau selepas itu kembali ke Bukit Aman pada akhir tahun 1974 sebagai Timbalan Pengarah Cawangan Khas Bukit Aman. Selepas itu, beliau memulakan rancangan strategik taktikal dan perang melawan pengganas dengan pengkhususan membanteras pertubuhan komunis bawah tanah.

Ketua Polis Perak, Kuala Lumpur, Pahang dan Kelantan (1975-1981)

Pada tahun 1975, bencana melanda di Perak. Ketua Polis Negeri (CPO) ketika itu yang sedang berkhidmat, DCP Datuk (kemudian dianugerahkan Tan Sri secara anumerta) Khoo Chong Kong telah mati dibunuh oleh pengganas komunis secara tiba-tiba. Pada November tahun 1975, Yuen mengambil alih tugas sebagai CPO Perak sehingga Januari tahun 1977, iaitu selama setahun dua bulan.

Selepas jangka masa setahun setengah hingga dua tahun, beliau dipindahkan lagi ke Kuala Lumpur untuk berkhidmat sebagai Ketua Polis Negeri (CPO) untuk jangkamasa dua tahun dari bulan Januari tahun 1977 sehingga bulan Januari tahun 1979, lepas itu dipindahkan serta dinaikkan pangkat sebagai Ketua Polis Negeri (CPO) Pahang dari bulan Januari tahun 1979 sehingga bulan Januari tahun 1981 dan seterusnya dipindahkan sekali lagi ke negeri Kelantan dalam jawatan yang sama untuk tempoh dua bulan dari Januari sehingga Mac 1981 sebelum berpindah balik ke negeri Sarawak pada bulan April 1981.