Jabarkan Hubungan dengan universiti serantau dari Universitas Diponegoro dalam bahasa melayu

Badan ini menjalin kerjasama dengan 12 buah universiti di Malaysia. Namun pada bulan Ogos 2009, Rektor Universiti Susilo Wibowo menyatakan bahawa cawangan universiti ini di Semarang sudah berhenti menerima pelajar Malaysia bagi tahun akademik 2009-10. ,  Hal itu turut mendapat perhatian penerbitan University World News edisi Global. . Perkara ini diputuskan walaupun pegawai pendidikan Indonesia menggesa ia dibatalkan, dengan mendakwa "Kami tahu akibatnya."  Kementerian Pendidikan Malaysia tidak lama kemudian mengeluarkan Undip dari daftar universiti yang diiktiraf untuk para mahasiswa kedoktorannya karena universiti tersebut dianggap gagal memenuhi persyaratan dari Malaysia Medical Council (MMC). Universitas Andalas (Unand) Sumatera Barat menyatakan ia tidak menurut tindakan Universitas Diponegoro tersebut.