Jabarkan Kematian dan persemadian dari Sellapan Ramanathan dalam bahasa melayu

Nathan diserang penyakit angin ahmar pada pagi 31 Julai 2016 dan dimasukkan ke Unit Rawatan Rapi, Hospital Besar Singapura. Beliau meninggal dunia pada 22 Ogos 2016 pada pukul 9:48 malam (UTC+8) pada usia 92 tahun di hospital tersebut  setelah berada dalam keadaan koma selama 3 minggu. Nathan meninggalkan balu Puan Urmila Nandey, seorang anak perempuan dan lelaki serta tiga orang cucu.

Sebagai tanda penghormatan, Kerajaan mengarahkan Bendera Kebangsaan akan dikibarkan separuh tiang dari semua bangunan kerajaan dari 23 hingga 26 Ogos. Jadad Nathan terletak di Dewan Parlimen pada 25 Ogos untuk membolehkan orang ramai memberi penghormatan.

Pada 26 Ogos, pengebumian negeri diadakan untuk menghormati Nathan. Jasadnya disampaikan oleh pengangkut senapang 25 pukulan seragam dari Gedung Parlimen ke Pusat Kebudayaan Universiti Kebangsaan Singapura (NUS). Perarakan pengebumian negara itu diluluskan oleh tanda-tanda penting dalam hidupnya, termasuk Dewan Bandaraya, di mana beliau telah menghadiri tiga Perarakan Hari Kebangsaan; Fullerton Hotel Singapore, dahulunya Bangunan Fullerton yang telah menempatkan Jabatan Laut di mana beliau bekerja; Dan NTUC Centre, mengingatkan zaman Nathan dalam pergerakan buruh Speaker yang menyampaikan madah pada pengebumian negeri termasuk Perdana Menteri Lee Hsien Loong dan Duta Bertanggungjawab Tommy Koh dan Gopinath Pillai. Muzik dimainkan pada majlis termasuk lagu "Thanjavooru Mannu Eduthu" ("Pasir Thanjavur") dari filem Tamil Porkkaalam (Zaman Keemasan, 1997), tentang pembuat anak patung yang membentuk anak patung seorang wanita cantik dengan pasir, tanah liat dan air dari tanah yang berbeza, dan akhirnya memberikan kehidupan kepada anak patung itu. Ia adalah lagu kegemaran Nathan ketika beliau melihatnya sebagai metafora untuk warisan pelbagai bangsa Singapura.

Pengebumian negeri diikuti oleh pembakaran mayat secara tertutup was followed di Pembakaran Mayat Mandai..