Jabarkan Fonim dari Bahasa Jepun Awal Pertengahan dalam bahasa melayu

Perubahan fonologikal utama adalah ciri-ciri dari tempoh ini:

Perubahan dari konsonan pranalisasi ke konsonan disuara

Penambahan dari vokal panjang dan suku kata ditutup  ke inventori suku kata

Elisyen dari sesetengah konsonan dalam sesetengah persekitaran

Perubahan dalam waktu dari waktu-suku kata ke waktu-Mora

Sedangkan Bahasa Jepun Kuno membuat 88 kelainan suku kata, Kuno Akhir mengurangkan kiraan itu ke 66.

Kelainan yang paling nyata adalah kehilangan dari Jōdai Tokushu Kanazukai, dimana membezakan antara dua jenis dari -i, -e, dan -o. Manakala permulaaan dari kehilangan ini boleh sediakala dilihat pada pengakhiran dari Bahasa Jepun Kuno, ia telah hilang awal sepenuhnya dalam Bahasa Jepun Kuno Akhir. Fonim akhir yang akan dihilangkan adalah /ko1/ dan /ko2/.

Semasa abad ke-10, /e/ and /ye/ digabung ke /e/ while /o/ and /wo/ digabung ke /o/ pada abad ke-11.