Jabarkan Timbalan Perdana Menteri dari Muhyiddin Yassin dalam bahasa melayu

Muhyiddin dilantik sebagai Timbalan Perdana Menteri pada 9 April 2009, ketika Najib mengambil alih daripada Abdullah Ahmad Badawi dan melancarkan kabinet pertama Najib.

Menyambung sebagai Menteri Pendidikan, beliau mengumumkan keputusan untuk mengembalikan pengajaran matematik dan sains dalam semua sekolah rendah dan menengah kerajaan.

Muhyiddin memecah kontroversi pada Mac 2010 dengan menyatakan bahawa beliau adalah "Melayu" terlebih dahulu daripada "Malaysian first" (). Beliau juga mengatakan bahawa tidak ada yang salah dengan kaum lain yang melakukan perkara yang sama; sebagai contoh, bangsa Cina boleh menuntut diri mereka sebagai "Cina yang pertama, rakyat Malaysia kedua; dan sama untuk bangsa India. Pada 13 Julai 2010, beliau berkata bahawa sesiapa sahaja bebas untuk membentuk persatuan, termasuk versi Cina atau kaum Cina Perkasa. Perdana Menteri Najib mencantas pertahanan Muhyiddin, menafikan bahawa kenyataannya tidak konsisten dengan konsep "1Malaysia" yang dipromosikan oleh kerajaan.

Semasa rombakan kabinet Najib pada 28 Julai 2015, beliau digugurkan daripada jawatannya sebagai Timbalan Perdana Menteri. Pemecatan itu berlaku selepas Muhyiddin telah membuat kenyataan umum dan kritikal mengenai pengendalian Najib terhadap skandal 1Malaysia Development Berhad. Najib menyatakan pemecatan Muhyiddin, dan pemecatan kontemporari lain-lain Menteri yang kritis terhadap kepimpinannya, adalah untuk mewujudkan lebih banyak "pasukan bersatu". Muhyiddin kekal sebagai timbalan presiden UMNO, tetapi selepas terus mengkritik UMNO, beliau akhirnya dipecat oleh majlis tertinggi parti pada Jun 2016.Muhyiddin kekal tidak bersalah, mengekalkan bahawa beliau tidak pernah mengkhianati parti itu, dan berjanji untuk terus bertahan.