Jabarkan Jawatan presiden dari Sellapan Ramanathan dalam bahasa melayu

Semasa pilihan raya presiden 1999, dua bakal calon lain yang didapati tidak layak secara perlembagaan, Nathan dipilih sebagai Presiden pada 18 Ogos 1999. Pemilihannya disokong oleh Menteri Kanan Lee Kuan Yew dan bekas Presiden Wee Kim Wee. Nathan menggantikan presiden Singapura kelima, Ong Teng Cheong, dan mengangkat sumpah pada 1 September 1999.

Nathan melancarkan inisiatif pengumpulan dana amal tahunan Cabaran Presiden pada tahun 2000. Berlanjutan pada tahun 2012 oleh penggantinya, Presiden Tony Tan Keng Yam, sehingga 2016 kira-kira S $ 160 juta telah dikumpul oleh pergerakan itu.

Untuk pilihan raya presiden 2005, Jawatankuasa Pilihan Raya Presiden (PEC) mengisytihar Nathan sebagai satu-satunya calon yang layak pada 13 Ogos, menolak tiga lagi permohonan berdasarkan daripada kriteria permohonan. Lantas, Nathan telah dipilih tanpa syarat untuk penggal kedua pada 17 Ogos 2005. Beliau telah mengangkat sumpah untuk penggal kedua pejabat pada 1 September 2005, dan setakat 2016, ialah satu-satunya orang yang berkhidmat dalam dua penggal sebagai Presiden.

Pada 21 Januari 2009, Nathan secara dasarnya meluluskan permintaan kerajaan untuk menarik $ 4.9 bilion dari rizab kewangan negara sebelum ini untuk membiayai Pakej Ketahanan Kerajaan yang terdiri daripada dua skim yang bertujuan untuk memelihara pekerjaan dan perniagaan semasa kemelut kewangan: Skim Kredit Pekerjaan yang menyediakan Majikan dengan bantuan kewangan untuk membayar gaji pekerja; Dan Inisiatif Berkongsi Risiko Khas, yang membantu syarikat bersaiz sederhana untuk mendapatkan kredit. Inilah kali pertama kuasa budi bicara Presiden telah dilaksanakan untuk tujuan ini. Kelulusan rasmi Presiden terhadap pengunduran itu kemudiannya ditandakan dalam dua pemberitahuan bertarikh 13 Mac 2009.