Jabarkan Para pelayar Nusantara dari Jong (kapal Nusantara) dalam bahasa melayu

Kepulauan Nusantara terkenal dengan produksi jong-jong besar. Apabila pelayar Portugis mencapai perairan Asia Tenggara pada awal tahun 1500-an, mereka mendapati kawasan ini dikuasai oleh kapal-kapal Jong Jawa. Kapal perdagangan Jawa ini menguasai laluan rempah yang penting, antara Maluku, Jawa dan Melaka. Kota pelabuhan Melaka pada masa itu adalah bandaraya Jawa. Terdapat banyak peniaga Jawa dan nakhoda kapal yang menetap dan pada masa yang sama mengawal perdagangan antarabangsa. Banyak tukang kayu Jawa yang mahir dalam membina limbungan kapal di bandar kota terbesar di Asia Tenggara. Bukti kepakaran orang Jawa di bidang perkapalan juga ditemukan pada relief Candi Borobudur yang menggambarkan perahu bercadik—disebut sebagai "Kapal Borobudur".

Untuk melintasi lautan, orang Austronesia membina lugsail seimbang (atau yang biasa disebut layar tanja), mungkin dibangunkan daripada versi tiang tetap layar cakar ketam. Sistem layar jong yang biasa digunakan pada kapal China mungkin telah dibangunkan daripada layar tanja.

Pada zaman Majapahit, hampir semua komoditi dari Asia ditemukan di Jawa. Hal ini disebabkan oleh perdagangan laut yang luas yang dilakukan oleh kerajaan Majapahit yang menggunakan berbagai jenis kapal, terutama jong, untuk berdagang ke tempat yang jauh. Ma Huan (penterjemah Cheng Ho) yang mengunjungi Jawa pada tahun 1413, menyatakan bahawa pelabuhan-pelabuhan di Jawa menjual barang dan menawarkan perkhidmatan yang lebih lengkap daripada pelabuhan lain di Asia Tenggara. Juga di era Majapahit penjelajahan Nusantara mencapai pencapaian terbesarnya. Ludovico di Varthema (1470–1517), dalam bukunya Itinerario de Ludouico de Varthema Bolognese menyatakan bahawa orang Jawa selatan berlayar ke "tanah yang jauh ke selatan" sehingga mereka tiba di sebuah pulau di mana satu hari hanya berlangsung empat jam dan "lebih sejuk daripada di mana-mana bahagian dunia". Penyelidikan moden telah menentukan bahawa tempat ini terletak sekurang-kurangnya 900 batu nautika (1666 km) di selatan titik paling selatan Tasmania.

Orang Austronesia menggunakan sistem navigasi yang kukuh: Orientasi di laut dilakukan dengan menggunakan pelbagai tanda semula jadi yang berbeza, dan dengan menggunakan teknik astronomi yang sangat khas yang disebut star path navigation. Pada dasarnya, para navigator menentukan haluan kapal ke pulau-pulau yang dikenali dengan menggunakan posisi terbitnya dan terbenamnya bintang-bintang tertentu di atas cakrawala. Pada era Majapahit, kompas dan magnet digunakan, dan kartografi (ilmu pemetaan) dikembangkan. Pada tahun 1293 M Raden Wijaya membentangkan peta dan rekod sensus kepada penyerang Yuan Mongol, menunjukkan bahawa pembuatan peta telah menjadi bahagian rasmi urusan kerajaan di Jawa. Penggunaan peta yang penuh dengan garis membujur dan melintang, garis rhumb, dan jalur rute langsung yang dilalui oleh kapal dicatat oleh orang Eropah, sehingga orang Orang Portugis menganggap peta Jawa sebagai peta terbaik pada awal tahun 1500-an.

Ketika orang Portugis menguasai Melaka (1511), mereka mendapat sebuah peta dari mualim Jawa yang juga menampilkan bahagian di benua Amerika. Mengenai peta itu, kata Albuquerque:

... peta besar mualim Jawa, yang mengandung Tanjung Harapan, Portugal dan tanah Brazil, Laut Merah dan Teluk Persia, Cengkeh, navigasi China dan Gore, dengan laluan rumbia dan laluan langsung yang boleh diambil oleh kapal, dan kawasan pedalaman, dan bagaimana kerajaan bersempadan antara satu sama lain. Bagi hamba, Yang Maha Mulia akan sangat gembira melihat ia mempunyai nama dalam tulisan Jawa, tetapi saya mempunyai seorang Jawa yang boleh membaca dan menulis, saya menghantar karya ini kepada Yang Mulia, yang mengesan Francisco Rodrigues dari yang lain, di mana Yang Mulia benar-benar dapat melihat di mana orang China dan Gore (Jepun) tiba, dan tentu saja kapal anda perlu pergi ke Kepulauan Cengkeh, dan di mana lombong-lombong emas ada, dan pulau Jawa dan Banda, asal buah pala dan bunga pala, dan negeri Raja Siam, dan juga penghujung pelayaran orang Cina, arah  yang dilaluinya, dan bagaimana mereka tidak berlayar lebih jauh.— Afonso de Albuquerque, dalam surat untuk raja Manuel I dari Portugal, 1 April 1512.

Sebuah catatan Portugis menerangkan bagaimana orang Jawa sudah mempunyai kemahiran pelayaran yang maju dan telah berkomunikasi dengan Madagaskar pada tahun 1645:

Orang Jawa sangat berpengalaman dalam seni navigasi, sehingga mereka dianggap sebagai pelopor seni paling kuno ini, walaupun banyak yang menunjukkan bahwa orang China lebih berhak menerima anugerah ini, dan menegaskan bahwa seni ini diteruskan dari mereka ke Jawa. Tetapi yang pasti orang Jawa yang pernah belayar ke Tanjung Harapan dan berhubung dengan pulau São Lourenço (San Laurenzo—Madagaskar), di mana kini terdapat ramai orang asli berkulit coklat di pulau itu yang mirip orang Jawa yang mengatakan bahawa mereka adalah keturunan orang Jawa.— Diogo do Couto, Decada Quarta da Asia

Penyelidikan pada tahun 2016 menunjukkan bahawa orang Malagasi mempunyai hubungan genetik kepada pelbagai kumpulan etnik Nusantara, terutamanya dari selatan Borneo. Sebahagian daripada bahasa Malagasi diperoleh daripada bahasa Ma'anyan dengan kata pinjaman daripada bahasa Sanskrit, dengan semua pengubahsuaian linguistik tempatan melalui bahasa Jawa atau Melayu. Orang Ma'anyan dan Dayak bukan pelaut dan menjadi penanam padi kering manakala beberapa orang Malagasi adalah petani padi basah, jadi besar kemungkinan mereka dibawa oleh orang Jawa dan Melayu dalam armada perdagangan mereka, sebagai buruh atau hamba. Aktiviti perdagangan dan perhambaan orang Jawa di Afrika menyebabkan pengaruh yang kuat terhadap pembinaan perahu di Madagaskar dan pantai Afrika Timur. Ini ditunjukkan dengan kewujudan cadik dan oculi (hiasan mata) pada perahu Afrika.