Coba jelasin Hilangnya jong dari Jong (kapal Nusantara) dalam bahasa melayu dong

Anthony Reid berhujah bahawa kegagalan jong dalam memerangi kapal-kapal Barat yang lebih kecil dan tangkas dapat meyakinkan para pembuat kapal Jawa bahawa jong yang besar tetapi kurang tangkas menghadapi terlalu banyak risiko selepas Portugis memperkenalkan pertempuran laut gaya Eropah, sehingga kapal-kapal yang mereka bina kemudiannya lebih banyak kecil dan laju. Dari pertengahan abad ke-16 pasukan maritim di Nusantara mula menggunakan kapal pertempuran baru yang tangkas dan dilengkapi dengan meriam yang lebih besar: Dalam pelbagai serangan yang dilancarkan ke Melaka Portugis selepas kekalahan Pati Unus, mereka tidak lagi menggunakan jong, tetapi sebaliknya digunakan lancaran, ghurab, dan ghali. Jong-jong yang belayar di Nusantara setelah tahun 1600-an mempunyai kapasiti muatan hanya 20–300 tan, dengan kemungkinan purata 100 tan, tetapi masih terdapat beberapa dari mereka yang boleh membawa 200 hingga 300 last beban (sekitar 360–400 hingga 540–600 tan metrik) pada awal tahun 1700-an.

Hilangnya tradisi maritim Jawa adalah akibat dasar kerajaan Jawa sendiri selepas kekalahan mereka terhadap Portugis dalam serbuan Melaka, yang kemudian memberi tumpuan kepada kekuatan tentera darat. Selain itu, sikap menindas Amangkurat I dari Mataram terhadap kota kota pesisir utara Jawa. Amangkurat I memerintahkan pelabuhan ditutup dan kapal-kapal dimusnahkan untuk mengelakkan bandar-bandar pesisir daripada menjadi kuat dan memberontak. Ini menghancurkan ekonomi Jawa dan kekuatan maritimnya yang dibina sejak zaman Medang sampai Majapahit, dan Mataram berubah menjadi negara agraris.

Pejabat Perdagangan Hindia Belanda (VOC), Batavia Daghregister, melaporkan pada tahun 1677 bahawa penduduk Mataram di Jawa Tengah dan Jawa Timur kekurangan kapal sendiri bahkan untuk keperluan yang diperlukan, dan sangat tidak peduli dengan laut. Selepas tahun 1700-an, peranan jong telah digantikan oleh jenis kapal Eropah, yaitu bark dan brigantine, yang dibuat di galangan kapal tempatan di Rembang dan Juwana (dulunya tempat pembinaan jong). Kapal jenis ini boleh mencapai kargo 400–600 tan, dengan purata 92 last (165.6–184 tan metrik). Orang Belanda juga menyedari kemahiran orang Jawa dalam pembuatan kapal, pada abad ke-18 limbungan-limbungan kapal di Amsterdam menggunakan orang Jawa sebagai mandor. Pada tahun 1856, John Crawfurd menyatakan bahawa aktiviti pembuatan kapal Jawa masih wujud di pantai utara Jawa, dengan limbungan kapal diawasi oleh orang Eropah, tetapi semua pekerja Jawa. Kapal yang dibina pada abad ke-19 mempunyai tan maksimum 50 tan dan terutamanya digunakan untuk pengangkutan sungai.