Jabarkan 2005–08 dari Lionel Messi dalam bahasa melayu

Pada 24 Jun 2005, Messi menandatangani kontrak pertama beliau sebagai pemain senior semasa hari ulangtahun kelahirannya yang ke-18. Dalam kontrak tersebut, Messi merupakan pemain Barcelona sehingga tahun 2010, dua tahun kurang berbanding kontrak yang ditandatangani sebelumnya, dan klausa perpindahan dinaikkan sehingga €150 juta. Dua bulan kemudian, beliau akhirnya diturunkan dalam kejohanan pra-musim Joan Gamper Trophy pada 24 Ogos. Diletakkan dalam kesebelasan utama buat pertama kali, beliau menerima pengiktirafan atas prestasi yang mengagumkan menentang kelab Juventus di bawah bimbingan Fabio Capello ketika itu, menerima tepukan gemuruh daripada penyokong-penyokong yang hadir di Camp Nou. Walaupun Capello membuat permintaan untuk meminjam Messi, terdapat bidaan dari kelab Inter Milan untuk mendapatkan khidmat beliau, di mana mereka sanggup membayar klausa perpindahan tersebut serta menaikkan gajinya sehingga tiga kali ganda. Menurut Joan Laporta, itu adalah satu-satunya masa di mana kelab berdepan risiko kehilangan Messi, namun begitu Messi memilih untuk kekal. Pada 16 September, kontrak beliau dikemaskini untuk kali kedua dalam masa tiga bulan dan dipanjangkan sehingga tahun 2014.

Disebabkan isu berkenaan status perundangan di dalam Persekutuan Bola Sepak Diraja Sepanyol, Messi terlepas peluang pada permulaan musim La Liga, namun begitu pada 26 September, beliau memperolehi status kerakyatan Sepanyol dan layak untuk bermain. Memakai jersi bernombor 19, beliau beransur-ansur meletakkan dirinya sebagai pemain sayap kanan utama, yang membentuk trio penyerang bersama Ronaldinho dan penyerang Samuel Eto'o. Beliau selalunya diletakkan dalam kesebelasan utama dalam beberapa perlawanan utama seperti perlawanan El Clásico pertamanya menentang Real Madrid pada 19 November, serta kemenangan Barcelona ke atas Chelsea dalam pusingan 16 kejohanan UEFA Champions League, di mana beliau menunjukkan prestasi terbaiknya. Selepas beliau menjaringkan 8 gol dalam 25 perlawanan, termasuklah gol pertamanya dalam Champions League, beliau terpaksa menghabiskan musim lebih awal, akibat kecederaan hamstring koyak semasa perlawanan kedua menentang Chelsea pada 7 Mac 2006. Messi bekerja keras untuk memulihkan kecergasannya sebelum perlawanan akhir Champions League, namun begitu pada hari perlawanan, 17 Mei, beliau terpaksa diketepikan. Messi berasa sangat kecewa sehinggakan beliau tidak menyambut kemenangan pasukannya menentang Arsenal di Paris, perkara yang membuatkan beliau menyesal di kemudian hari.

Di sebalik penurunan prestasi pasukan Barcelona secara keseluruhan, Messi yang pada ketika itu berumur 19 tahun meletakkan dirinya sebagai antara pemain terbaik di dunia pada musim 2006-07. Telah dikenali sebagai idola di kalangan penyokong fanatik Barcelona, culés, beliau menjaringkan 17 gol dalam 36 perlawanan dalam kesemua kejohanan. Namun begitu, beliau berterusan mengalami kecederaan serius; mengalami patah tulang metatarsal pada 12 November 2008 menyebabkan beliau diketepikan selama tiga bulan. Beliau pulih dari kecederaan, tepat pada masa Barcelona menentang Liverpool dalam pusingan 16 Champions League, namun diketepikan. Dalam perlawanan liga, sumbangan gol beliau semakin meningkat di penghujung musim; 11 daripada 14 golnya datang dari 13 perlawanan terakhir. Pada 10 Mac 2007, beliau menjaringkan hat-trick dalam perlawanan El Clásico, pemain pertama yang melakukannya dalam masa 12 tahun, yang membawa kepada keputusan seri 3-3 sama dalam masa tambahan. Peranan penting beliau bersama Barcelona diterjemahkan dalam bentuk kontrak yang baru ditawarkan, di mana gajinya dinaikkan secara mendadak.

Selepas Ronaldinho hilang sentuhannya, Messi menjadi pemain bintang terbaru Barça pada umur 20 tahun, digelar sebagai "Messiah" oleh media-media Sepanyol. Prestasi yang ditunjukkan pada tahun 2007 membolehkan beliau menerima beberapa pengiktirafan; wartawan mengundi beliau di tempat ketiga untuk anugerah Ballon d'Or, di belakang Kaká dan tempat kedua Cristiano Ronaldo, serta pengurus dan kapten pasukan kebangsaan di seluruh dunia mengundi beliau di tempat kedua untuk anugerah Pemain Terbaik Dunia FIFA, di belakang Kaká. Walaupun beliau telah menjaringkan 16 gol dalam musim 2007–08, beliau berdepan dengan kecederaan pada separuh kedua musim tersebut akibat hamstring koyak pada 15 Disember. Beliau kembali beraksi dan menjaringkan dua gol menentang Celtic dalam pusingan 16 Champions League, dan merupakan penjaring gol terbanyak pada ketika itu dengan enam gol, namun begitu mengalami kecederaan pada perlawanan kedua pada 4 Mac 2008. Walaupun diberi amaran oleh staf perubatan, Rijkaard tetap menurunkan Messi yang mengundang kepada kritikan kapten pasukan, Carles Puyol, terhadap media Sepanyol yang memberi tekanan kepada Messi untuk bermain dalam setiap perlawanan. Di akhir musim, Barcelona menduduki tempat ketiga dalam liga, disingkirkan dari pusingan separuh akhir Champions League oleh pemenang kejohanan, Manchester United serta tiada trofi yang dimenangi.

Selepas dua musim tanpa sebarang kejuaraan, Barcelona memerlukan rombakan, yang membawa kepada pemergian Rijkaard dan Ronaldinho serta Messi diberikan jersi bernombor 10. Beliau menandatangani kontrak baru pada bulan Julai 2008, dengan gaji tahunan sebanyak €7.8 juta, merupakan pemain termahal kelab. Sebelum bermulanya musim baru, kecederaan otot yang kerap berlaku sehingga diketepikan sejumlah lapan bulan di antara tahun 2006 hingga 2008 yang dihadapi Messi merupakan kebimbangan utama Barcelona. Untuk memerangi masalah ini, kelab memperkenalkan kaedah latihan baru, nutrisi dan gaya hidup serta mendapatkan ahli fisioterapi peribadi beliau, di mana ahli fisioterapi ini akan bersama-sama Messi semasa dipanggil untuk menyertai pasukan kebangsaan. Hasil dari kaedah ini, Messi tidak kerap mengalami kecederaan serius selama empat tahun, membolehkan beliau menunjukkan prestasi terbaiknya. Walaupun beliau mengalami kecederaan pada awal tahun, prestasi yang ditunjukkan pada tahun 2008 membolehkan beliau sekali lagi diundi tempat kedua dalam anugerah Ballon d'Or dan Pemain Terbaik Dunia FIFA, kedua-duanya dibelakang Cristiano Ronaldo.