Jabarkan 1500 - 1900 dari Kabupaten Jombang dalam bahasa melayu

Selepas kejatuhan Majapahit, agama Islam mula tersebar dari pesisir utara Jawa Timur ke seluruh kawasan. Jombang kemudian menjadi sebahagian Kerajaan Mataram Islam. Seiring dengan kelemahan pengaruh Mataram, penjajah Belanda menjadikan Jombang sebagai sebahagian wilayah Syarikat Hindia Timur Belanda pada akhir abad ke-17, dan kemudiannya sebagai sebahagian Hindia Belanda. Kelompok etnik Cina juga berkembang. Kuil Hong San Kiong di Gudo yang konon dibina pada tahun 1700 masih berfungsi sehingga sekarang, dan sejumlah kawasan kelompok-kelompok etnik Tionghoa dan Arab majoriti sekarang masih dapat ditemukan.

Pada tahun 1811, Kabupaten Mojokerto yang merangkumi wilayah yang kini merupakan Kabupaten Jombang diasaskan. Jombang merupakan salah satu residen di dalam Kabupaten Mojokerto. Bahkan Trowulan yang merupakan pusat Kerajaan Majapahit diliputi dalam kawedanan (onderdistrict afdeeling ) Jombang.

Alfred Russel Wallace (1823-1913), naturalis Inggeris yang merumuskan Teori Evolusi dan yang terkenal kerana Garis Wallace, pernah mengunjungi dan bermalam di Jombang ketika mengkaji keanekaragaman bentuk hidup Indonesia.