Coba jelasin 2006–sekarang dari Silja Line dong

Mei 2006 menyaksikan penjualan Silja Line ke Tallink Estonia. Perdagangan SuperSeaCats antara Helsinki dan Tallinn tidak dimasukkan dalam penjualan karena pembelian mereka akan memberi Tallink posisi pasar dominan pada rute tersebut, yang akan mengakibatkan regulator persaingan Finlandia dan Estonia tidak menyetujui penjualan tersebut. Akibatnya, Sea Containers, setelah hampir setahun sebelum mengumumkan niat mereka untuk menghentikan bisnis feri sepenuhnya, terus mengoperasikannya di bawah merek SuperSeaCat. Pada akhir tahun 2006 organisasi pertanahan Tallink dan Silja Line direorganisasi di Finlandia sehingga Tallink Finland dan Superfast Finland digabungkan menjadi Oyj Silja Abp, yang sekarang menangani semua operasi Tallink/Silja di Finlandia. Tak lama kemudian Oyj Silja Abp diubah namanya menjadi Tallink Silja Oy. Demikian pula organisasi pertanahan di Swedia menjadi Tallink Silja AB.

Tallink menyatakan bahwa hal itu bertujuan untuk memisahkan merek Silja Line dari Tallink. Namun, sebagian besar pemasaran Silja Line di Finlandia dan Swedia sejak pengambilalihan dilakukan dengan nama gabungan Tallink Silja.

Pada bulan Juli 2008, kapal Tallink  menggantikan Festival Silja di rute Turku–Mariehamn–Stockholm. Galaxy ditandai ke Swedia dan teks Silja Line dilukis di sisi lambungnya. Logo Tallink tetap ada di corongnya dan corak kapal berdesain Navitrolla, yang berbeda dengan corak kapal Silja lainnya, tidak diubah. Silja Festival, meski tetap terdaftar dengan nama yang sama, pada gilirannya dipindahkan ke rute Tallink Stockholm–Riga, corongnya dicat ulang Warna Tallink dan teks yang dilukis Tallink di sisinya.

Pada bulan Oktober 2009, Managing Director Silja Line (Tallink Silja Oy), Keijo Mehtonen, pensiun dan Margus Schults ditunjuk untuk jabatan tersebut.

Pada bulan Februari 2013  berganti rute dengan , dengan Baltic Princess sekarang ditempatkan di rute Turku–Stockholm dan Silja Europa di Helsinki–Tallinn kapal pesiar.

Pada Juli 2022, Tallink mengumumkan bahwa MS Galaxy akan ditarik pada September 2022 dari layanan Turku–Stockholm setidaknya selama tujuh bulan. Satu bulan kemudian, diumumkan bahwa kapal saudara Galaxy pada rute yang sama, MS Baltic Princess, pada saat yang sama akan mengabaikan panggilan di Mariehamn dan Stockholm, dan malah menelepon di Långnäs dan Kapellskär. Tallink menyatakan bahwa perubahan ini bersifat sementara dan layanan penuh akan dilanjutkan setelah penurunan pasar.