Jabarkan 1993–2000 dari Tallink

Tallink menjadi perusahaan yang sepenuhnya dimiliki oleh Estonia pada tahun 1993, ketika Palkkiyhtymä menjual sahamnya di perusahaan Tallink dan MS Tallink kepada ESCO. Pada masa ini, perusahaan-perusahaan lain sedang mengembangkan diri di lalu lintas Helsinki–Tallinn yang menguntungkan, termasuk Estonian New Line, yang dimiliki oleh [[Inreko] yang berbasis di Tallinn. ESCO dan Inreko merasa tidak ada gunanya bersaing satu sama lain dan pada bulan Januari 1994, Tallink dan Inreko Laeva AS digabung menjadi AS Eminre. Tallink tetap menjadi nama pemasaran armada perusahaan. Kemudian di tahun yang sama Inreko membeli MS Nord Estonia dari EstLine (anak perusahaan ESCO dan Nordström & Thulin Swedia), mengganti namanya menjadi  dan menempatkannya di dia di lalu lintas Helsinki – Tallinn untuk Tallink. Inreko juga membawa serta dua hydrofoil cepat, HS Liisa dan HS Laura yang mulai melayani di bawah merek Tallink Express.  Pada tahun 1994, Tallink juga mencoba lalu lintas dari Estonia ke Jerman untuk pertama kalinya, dengan dua feri sewaan  dan  yang ditempatkan pada rute Helsinki – Tallinn–Travemünde.

Pada bulan September 1994, operasi AS Eminre dibagi menjadi dua perusahaan, satu yang menangani lalu lintas ke Jerman (yang segera ditutup) dan AS Hansatee yang mengambil lalu lintas Helsinki–Tallinn dan nama Tallink. ESCO adalah mitra dominan di Hansatee, menguasai 45% saham, sedangkan Inreko hanya memiliki 12,75% (sisanya 42,25% milik Eesti Ühispank, Estonia). Pada tahun 1995, Hansatee membawa feri besar pertama ke lalu lintas Helsinki–Tallinn ketika mereka mencarter MS Mare Balticum dari EstLine dan mengganti namanya menjadi . Menyusul berbagai perselisihan antara ESCO dan Inreko (terutama tentang harga sewa Vana Tallinn), Inreko menjual saham AS Hansatee mereka kepada ESCO pada bulan Desember 1996. Pada saat yang sama Inreko menjual hidrofoil Tallink Express ke Linda Line, Estonia, dan mulai mengoperasikan Vana Tallinn di lalu lintas Helsinki–Tallinn dengan nama TH Ferries.

Pada tahun 1997, kapal feri besar kedua dibawa ke lalu lintas Tallink ketika perusahaan tersebut mencarter  dari Stena Line. Untuk menggantikan hidrofoil yang hilang, Hansatee membeli kapal katamaran ekspres baru pada bulan Mei 1997, yang diberi nama . Pada waktu ini jelas bahwa dua feri besar dibutuhkan untuk lalu lintas antara Helsinki dan Tallinn, dan ketika sewa Normandia berakhir pada bulan Desember 1997, Tallink membeli MS Lion King dari Stena Line, yang memasuki lalu lintas pada bulan Februari 1998 sebagai . Pada bulan Juli tahun yang sama, Tallink membeli kapal barang  yang membuka jalur dari Paldiski ke Kapellskär, Rute pertama Tallink ke Swedia. Pada bulan Oktober, MS Tallink asli, yang tidak lagi mematuhi peraturan keselamatan modern, dijual. Dua bulan kemudian Hansatee membeli kapal feri cepat pertama mereka yang mampu mengangkut mobil, .