Jabarkan Seibu dari S-TRAIN (Seibu)

Keempat istilah di atas semuanya dimulai dengan huruf "S", oleh karena itu dinamai "S-Train".

Logo memiliki tiga warna berbeda, masing-masing dengan makna unik.  Bagian atas huruf "S" berwarna hijau, menandakan kehijauan di sepanjang Garis Chichibu;  bagian bawah "S" berwarna biru, menandakan Garis Minatomirai, yang juga berwarna biru;  dan teks "S-TRAIN" berwarna abu-abu, menandakan urbanisasi di sekitar Shibuya dan Toyosu, yang dilayani kereta.