Jabarkan Konflik atas kebebasan teologi dari Konferensi Waligereja Amerika Latin

Dukungan CELAM untuk teologi pembebasan tidak disukai oleh Vatikan dan Paus Paulus VI, yang mencoba memperlambat gerakan setelah Konsili 1962-1965. Kardinal Antonio Samoré, yang bertanggung jawab atas hubungan antara Kuria Roma dan CELAM sebagai pemimpin Komisi Kepausan untuk Amerika Latin, diperintahkan untuk mengakhiri orientasi ini.

Dengan terpilihnya Alfonso López Trujillo pada tahun 1972 sebagai sekretaris jenderal CELAM, kaum konservatif menguasai organisasi ini, pada saat yang sama ketika mereka mulai mendapatkan kembali kendali atas Kuria Romawi. Dianggap sebagai papabile di Konklaf Kepausan 2005, López Trujillo tetap menjadi sekretaris jenderal CELAM sampai tahun 1984. Namun, pada Konferensi CELAM di Puebla tahun 1979, lebih dari tiga bulan setelah pemilihan Karol Wojtyla sebagai Paus Yohanes Paulus II reorientasi konservatif CELAM ditanggapi dengan oposisi yang kuat dari bagian progresif klerus, yang mendefinisikan konsep tersebut dari "pilihan preferensial untuk orang miskin". Namun, Paus Yohanes Paulus II terus menggunakan frasa tersebut dalam ensikliknya tahun 1987 Sollicitudo rei socialis. Kardinal Joseph Ratzinger, kemudian Paus Benediktus XVI, dituduh membawa kembali otoritas Vatikan di Dunia Ketiga. Pada tahun 1984 dan 1986, Tahta Suci dua kali mengutuk unsur-unsur teologi pembebasan, khususnya unsur-unsur Marxis.

Dalam perjalanannya ke Nikaragua, Yohanes Paulus II dengan keras mengutuk apa yang dia juluki sebagai "Gereja populer" (yaitu "komunitas gerejawi dasar" yang didukung oleh CELAM) dan menentang kecenderungan klerus Nikaragua untuk mendukung Sandinistas, bersikeras pada otoritas tunggal Vatikan.