Jabarkan Penerimaan dari Duke Nukem: Manhattan Project

Versi PC menerima "ulasan yang umumnya disukai", dan versi iOS menerima ulasan "campuran", sedangkan versi Xbox 360 menerima "ulasan yang umumnya tidak disukai", menurut situs web agregator pengulas Metacritic. GameSpy menyebut versi PC "Game arcade platform yang apik dengan harga yang wajar ... menangkap Duke dengan sempurna; kinerja sistem yang hebat; penggunaan 3D yang cerdas." GameSpot lebih netral terhadap versi PC yang sama, dengan mengatakan, "Langsung dan terlihat bagus ... levelnya sangat besar, dan sebagian besar memiliki beberapa jalur yang dapat Anda ambil." IGN menyebut versi PC tersebut sebagai "judul yang dipoles, dicoba, dan benar... layak untuk direkomendasikan, terutama mengingat titik harga yang tajam dan antihero yang sudah dikenal." Situs web yang sama, bagaimanapun, mengkritik versi Xbox 360, menyebutnya "penipuan dibandingkan [untuk] apa lagi yang ada di pasar" dan "satu batu dari masa lalu Anda yang lebih baik diabaikan."

Manhattan Project menjadi runner-up untuk penghargaan tahunan "Best Budget Game on PC" dari GameSpot, yang diraih oleh Serious Sam: The Second Encounter.