Jabarkan 2003 dari Piala J.League

Semua enam belas tim J1 ambil bagian. Kashima Antlers dan Shimizu S-Pulse dikecualikan dari babak penyisihan grup karena mereka berpartisipasi di Liga Champions AFC. Empat belas tim sisanya dibagi menjadi empat grup, dua grup berisi empat tim dan dua grup lainnya berisi tiga tim. Tim teratas masing-masing grup dan tim peringkat kedua grup yang berisi empat tim serta Kashima dan Shimizu lolos ke babak sistem gugur. Babak gugur dimainkan dalam dua pertandingan (kandang dan tandang) kecuali final di mana pemenang ditentukan dalam satu pertandingan.