Jabarkan Karya tulis dari Sindhunata dalam bahasa jawa

Putri Cina, Penerbit Gramedia Pustaka Utama (2007)

Segelas Beras untuk Berdua, Penerbit Buku Kompas (2006)

Dari Pulau Buru ke Venesia, Penerbit Buku Kompas (2006)

Petruk Jadi Guru, Penerbit Buku Kompas

Kambing Hitam:Teori Rene Girard,Penerbit Gramedia Pustaka Utama (2006)

Burung-burung di Bundaran HI,Penerbit Buku Kompas

Ekonomi Kerbau Bingung, Penerbit Buku Kompas

Bola di Balik Bulan, Penerbit Buku Kompas (2002)

Bola-bola Nasib, Penerbit Buku Kompas

Air Mata Bola, Penerbit Buku Kompas

Ilmu Ngglethek Prabu Minohek (2004)

Mengasih Maria: 100 taun Sendangsono (2004) - editor

Kreteg Air Mata: Tragedi Manusia Pengungsi Timor Timur (2003)

Long and Winding Road, East Timor (2001)

Pendidikan: Kegelisahan Sepanjang Zaman: Pilihan Artikel Basis (2001) - editor

Membuka Masa Depan Anak-anak kita: Mencari Kurikulum Pendidikan Abad XXI (2000)

Menggagas Paradigma Baru Pendidikan: Demokratisasi, Otonomi, Civil Society, Globalisasi (2000) - editor

Sumur Kitiran Kencana: Karumpaka ing Sekar Macapat Déning D.F. Sumantri Hadiwiyata (2000)

Tak Entèni Keplokmu: Tanpa Bunga dan Telegram Duka (2000)

Menjadi Generasi Pasca-Indonésia: Kegelisahan Y.B. Mangunwijaya (1999) - editor

Pergulatan Intelektual dalam Era Kegelisahan: Mengenang Y.B. Mangunwijaya (1999) - editor

Sayur Lodeh Kehidupan: Teman dalam Kelemahan (1998) - editor

Sisi Sepasang Sayap: Wajah-wajah Bruder Jesuit (1998)

Ndhèrèk Sang Dèwi ing Èrèng-èrènging Redi Merapi (1995)

Hoffen auf den Ratu-Adil: das eschatologische Motiv des "Gerechten Königs" im Bauernprotest auf Java während des 19. und zu Beginn des 20. Jahrhunderts (1992) - Disertasi

Baba Bisa Menjadi Indonesier: Bung Hatta, Liem Koen Hian, dan Sindhunatha, Menyorot Masalah Cina di Indonésia (1988)

Anak Bajang Menggiring Angin (1983, Gramedia)