Jabarkan Keluarga dari William Muir

Dia adalah saudara dari indolog John Muir. Ia menikah dengan Elizabeth Huntly Wemyss pada tahun 1840 (meninggal 1897), dan memiliki lima putra dan enam putri; empat putranya bertugas di India, dan salah satunya, Kolonel A. M. Muir (meninggal 1899), adalah Pejabat Politik untuk Baluchistan Selatan, dan bertindak sebagai Residen Inggris di Nepal ketika dia meninggal. Seorang putri, Jane, menikah dengan Kolonel Andrew Wauchope dan tinggal di Kastil Edinburgh.

Muir selalu menaruh minat pada masalah pendidikan, dan terutama melalui pengerahan tenaganya perguruan tinggi pusat di Allahabad, yang dikenal sebagai Perguruan Tinggi Pusat Muir, dibangun dan diberkahi. Universitas Muir kemudian menjadi bagian dari Universitas Allahabad. Pada tahun 1884 Muir terpilih sebagai presiden Royal Asiatic Society. Pada tahun 1885 ia terpilih sebagai kepala sekolah Universitas Edinburgh menggantikan Sir Alexander Grant, dan menjabat hingga tahun 1903, ketika ia pensiun.

Pada tanggal 7 Februari 1840, ia menikahi Elizabeth Huntly (1822–1897), putri James Wemyss, kolektor Kanpur, dan bersama-sama mereka memiliki 15 anak. Dia meninggal di Edinburgh, dan dimakamkan di Dean Cemetery. Makam itu terletak di teras selatan bawah yang tersembunyi.