Jabarkan Bayern Munich dari Bouna Sarr

Pada tanggal 5 Oktober 2020, Sarr bergabung dengan klub Bundesliga Bayern Munich dengan kontrak selama empat tahun. Sarr membuat debutnya untuk Bayern dalam babak pertama DFB-Pokal pada tanggal 15 Oktober dan memberikan dua assist kepada pemain baru lainnya, Eric Maxim Choupo-Moting, saat klub mengalahkan tim divisi lima 1. FC Düren dengan skor 3–0. Pada tanggal 25 Agustus 2021, dia mencetak gol pertamanya untuk klub dalam kompetisi yang sama, pada babak pertama musim berikutnya, ketika Bayern menghancurkan klub divisi lima Bremer SV dengan skor 12–0.