Jabarkan Plot dari Pathaan

Pada tahun 2019, Pemerintah India mencabut Pasal 370 Konstitusi India, yang memberikan status khusus untuk Jammu dan Kashmir. Berita tersebut memengaruhi Pakistani jenderal yang terkena kanker, Qadir, yang memutuskan untuk membalas dendam terhadap India. Dia menandatangani kontrak dengan Jim, yang memimpin "Outfit X", sebuah organisasi teroris swasta. Sementara itu, Pathaan, mantan agen RAW, dan perwira seniornya Nandini Grewal membuka sebuah unit yang dijuluki unit "Joint Operations and Covert Research" (JOCR), untuk merekrut mantan agen RAW yang dipaksa untuk pensiun karena trauma atau cedera masa lalu, tetapi ingin mengabdi pada negara.

Dengan persetujuan sekretaris bersama RAW, Kolonel Sunil Luthra, Pathaan dan timnya menuju ke Dubai untuk menghentikan rencana Pakaian X untuk menyerang Presiden India di sebuah konferensi ilmiah. Namun, mereka menyadari bahwa rencana sebenarnya mereka adalah untuk menculik dua ilmuwan, Dr. Farooqui dan Dr. Sahani sebagai gantinya dan informasi yang mereka terima tentang serangan yang akan segera terjadi terhadap Presiden adalah tipu muslihat untuk menyesatkan mereka. Jim menyerang konvoi ilmuwan dan Pathaan mencoba menghentikannya. Perkelahian pun terjadi, di mana Jim berhasil melarikan diri dengan Dr. Sahani. Saat tanya jawab di agensi, Luthra mengungkapkan bahwa Jim adalah mantan agen RAW, yang dianugerahi Vir Puraskar atas keberaniannya setelah agensi tidak dapat menemukan tubuhnya ketika teroris Somalia membunuh istri dan anaknya yang belum lahir dalam negosiasi yang gagal. Dia rupanya memalsukan kematiannya untuk membalas dendam terhadap agensi dan negara karena tidak menyelamatkan keluarganya.

Sementara itu, Pathaan mengetahui tentang kata sandi yang dijuluki "Raktbeej" dan juga bahwa orang mati di Dubai adalah mantan agen dan uang mereka ditransfer dari rekening Rubina Mohsin (Rubai), seorang dokter Pakistan di Spanyol. Dia melakukan perjalanan ke Spanyol dan ditangkap oleh anak buah Jim, di mana dia juga mengetahui bahwa Rubai adalah mantan agen ISI. Saat Jim meninggalkan tempat persembunyiannya, Rubai menyerang anak buah Jim dan kabur bersama Pathaan. Rubai mengungkapkan bahwa Raktbeej ada di Moskow, tempat mereka pergi untuk mencurinya sebelum Jim melakukannya. Namun, Rubai mengkhianati Pathaan dan membuatnya ditangkap oleh polisi. Terungkap bahwa Jim menggunakan Rubai untuk membuat Pathaan mencuri Raktbeej untuk dirinya sendiri. Pathaan ditangkap dan dibawa ke penjara dengan kereta api, tetapi diselamatkan oleh Avinash Singh "Tiger" Rathore.

Tiga tahun kemudian, Pathaan melakukan perjalanan ke Afrika dan menangkap antek Jim, Raafe. Dia bertemu Nandini dan mengungkapkan tentang Jim yang membeli dua misil pedang, sementara Nandini mengungkapkan lokasi Rubai di Paris. Pathaan bertemu Rubai, yang mengungkapkan bahwa Raktbeej adalah virus cacar yang bermutasi, yang dikembangkan secara paksa oleh Dr. Sahani yang tertawan di bawah perintah Jim. Dia juga mengungkapkan rasa bersalah karena mengkhianati Pathaan tanpa mengetahui bahwa negaranya akan merencanakan serangan keji seperti itu. Mereka melakukan perjalanan ke lab Jim di Siberia dan berhasil memulihkan satu bola yang berisi virus dengan susah payah, sementara Jim kabur dengan bola lainnya. Luthra dan Nandini mencapai lab Jim untuk membawa bola itu kembali ke India untuk mengembangkan vaksin. Luthra juga menangkap Rubai karena kesetiaannya dipertanyakan.

Di Institut Penyakit Menular India (IICD), Dr. Farooqui mendemonstrasikan bola tersebut kepada Nandini. Jim memanggil mereka dan mengungkapkan bahwa bola tersebut telah menyebarkan virus di fasilitas tersebut. Para ilmuwan yang terinfeksi, bersama Nandini mati di fasilitas tersebut dengan menembak diri mereka sendiri, untuk mengekang penyebaran virus. Kemudian, fasilitas tersebut dihancurkan dalam ledakan yang terkendali. Jim memberikan ultimatum untuk mengevakuasi tentara India dari Kashmir dalam waktu 24 jam. Pathaan menginterogasi Raafe tentang lokasi misil tersebut, dan mengetahui bahwa misil tersebut terletak di Afghanistan. Setelah menyelamatkan Rubai, mereka memancing rekan Jim ke dalam jebakan, dan menyerang markas Jim. Qadir dibunuh oleh Rubai setelah dia mengaktifkan misil yang mengandung virus tersebut. Pathaan mengejar Jim dengan jetpack dan mereka berdua menabrak sebuah kabin.

Sementara itu, Rubai menonaktifkan rudal tersebut, tetapi menemukan bahwa Raktbeej tidak berada di dalam rudal tersebut, melainkan di dalam pesawat penumpang, yang akan mendarat di Delhi. Dia memberi tahu Pathaan, yang menemukan bahwa Jim memiliki detonatornya. Luthra memanggil kontrol lalu lintas udara untuk mencegah pesawat mendarat di Delhi. Di dalam kabin, Pathaan dan Jim bertarung secara brutal, mengakibatkan kabin tersebut mulai meluncur dari tebing. Meski ditikam oleh Jim, Pathaan mencuri detonatornya, menonaktifkan Raktbeej dan melempar Jim keluar dari kabin karena fondasinya akan segera rusak. Sementara Jim memegang papan, Pathaan mengambilnya Vir Puraskar, menganggapnya tidak layak untuk itu. Dia menginjak dan mematahkan papan yang dipegang Jim, mengakibatkan dia jatuh ke kematiannya. Setelah itu, Pathaan dikembalikan ke RAW dan dijadikan sebagai kepala JOCR, sementara Nandini secara anumerta dianugerahi Vir Puraskar untuk keberaniannya.

Dalam adegan mid-credit, Pathaan dan Tiger terlihat merenungkan tentang pensiun dan menyarankan agen muda yang dapat menggantikan mereka, tetapi akhirnya memutuskan untuk terus melawan ancaman itu sendiri.