Jabarkan Rute paling ramai dari Bandar Udara Internasional Skopje

Taksi ke Skopje tersedia. Ada juga layanan bus yang menghubungkan bandara dan kota dengan beberapa pemberhentian.

Pada tanggal 24 Juli 1992, sebuah pesawat Antonov 12BK dari Volga-Dnepr Airlines jatuh di pegunungan di desa Lisec dekat Tetovo dalam perjalanan menuju Bandara Skopje, insiden ini terjadi setelah para kru menyimpang dari jalur saat mencoba untuk menghindari badai petir, karena DME di Bandara Skopje tidak berfungsi. Akibat dari insiden tersebut, semua penumpang yang berjumlah 8 orang meninggal dan pesawat dihapuskan.

Pada tanggal 5 Maret 1993, Palair Macedonian Airlines Penerbangan 301, sebuah pesawat Fokker 100 dalam perjalanan menuju Zurich jatuh beberapa detik setelah lepas landas dari landasan pacu 34. Investigasi kecelakaan menentukan penyebab kecelakaan itu diakibatkan oleh kegagalan awak pesawat untuk menjinakan deiced sebelum keberangkatan. Dari 97 orang di dalamnya, 83 meninggal.

Pada 12 Januari 2008, sebuah pesawat Mil Mi-17 dari Angkatan Udara Makedonia, berangkat dari Mostar dalam perjalanan ke Bandara Skopje, jatuh di sebuah bukit dekat Katlanovsko Blato dalam kabut tebal dan terbakar. Semua 11 penumpang tewas dan helikopter itu dihapuskan.

Pada 13 Februari 2009, Austrian Airlines dengan nomor Penerbangan OS780 yang menggunakan pesawat Bombardier Dash 8 Q400 penerbangan terjadwal dari Skopje ke Wina, gagal menarik kembali roda pendaratan setelah lepas landas dan melakukan pendaratan darurat di Bandara Skopje.

Pada tanggal 14 November 2011, sebuah penerbangan pribadi menggunakan pesawatSocata TBM700N (TBM850) dari Bandara Maastricht Aachen ke Skopje, menabrak beberapa puncak pohon dan mendekati cahaya saat mendarat dan melewatkan aspal panjang landasan pacu dan menyentuh turun di atas rumput. Kelima penumpang selamat tanpa cedera. Pesawat mengalami kerusakan parah dan dikirim ke Daher-Socata di Bandara Tarbes-Lourdes-Pyrénées untuk diperbaiki.

Pada tanggal 11 Februari 2012, Czech Airlines Penerbangan 848, sebuah penerbangan terjadwal dengan pesawat Boeing 737-55S dari Praha ke Skopje, melakukan pendaratan darurat di Skopje, karena laporan asap yang keluar dari pesawat. Petugas pemadam kebakaran bandara dan ambulans terkejut. Pesawat mengalami kerusakan ringan dan semua penumpang selamat tanpa cedera.

Pada 6 September 2016, sebuah pesawat Piper PA-34-200T Seneca II jatuh di dekat Vetersko, Veles saat mendarat di Skopje, menewaskan semua 6 penumpang. Pesawat itu dihapuskan.