Jabarkan Media (Uskup-delegasi Jan Baxant) dari Konferensi Waligereja Ceko

Pelayanan spiritual di ketentaraan, penjara, polisi dan petugas pemadam kebakaran (Zdeněk Wasserbauer)

Iustitia et Pax (Keadilan dan Perdamaian), minoritas dan migran (Václav Malý)

Misi dan evangelisasi baru (Jan Graubner)

Budaya dan warisan (Antonín Basler)

Kerjasama dengan Komisi Konferensi Waligereja Uni Eropa () (Jan Vokál)

Nepomucenum (Seminari Ceko di Roma) (Jan Vokál)

Karya Alkitab Katolik Ceko (Zdeněk Wasserbauer)

Amal dan layanan sosial (Jan Graubner)

Ketua Sekretaris Jenderal Konferensi Waligereja, anggota CBC. Dia bertanggung jawab kepada Sekretaris, Sekretaris Eksekutif, pusat pers dan bagian profesional. Pada bulan Februari 2010, Sekretariat memiliki bagian khusus: Penerjemahan, ekonomi, hukum, pendidikan agama, katekese, pemuda dan penginjilan pastoral.