Jabarkan Penghargaan dari Ahmad Najib Burhani

Setelah lulus meraih gelar doktoral, disertasinya mendapat penghargaan The Professor Charles Wendell Memorial Award  pada tahun 2013 dari almamaternya. Pada tahun 2020, Burhani mendapatkan tiga penghargaan, yaitu sebagai 100 tokoh terkemuka UIN Syarif Hidayatullah yang merupakan penghargaan kolaborasi antara Kementerian Agama dan UIN Syarif Hidayatullah.

Penghargaan kedua, yaitu  menjadi salah satu dari 75  Ikon Prestasi Pancasila di bidang Sains dan Inovasi atas penelitian-penelitiannya yang memuat isu tentang masalah-masalah yang terjadi pada kelompok minoritas. Penghargaan ketiga, yaitu sebagai Peneliti Terbaik di Bidang Ilmu Pengetahuan Sosial dan Humaniora. Penghargaan ini diberikan oleh Lembaga Ilmu Pengetahuan Indonesia (LIPI) dan diserahkan oleh Menristek-Dikti, Bambang Brodjonegoro, pada HUT LIPI di Bogor pada 26 Agustus 2020.

Pada tahun 2021, Burhani kembali mendapatkan Muhammadiyah Award dalam pengabdiannya di bidang ilmu pengetahuan dan teknologi. Penghargaan ini diberikan oleh Pimpinan Pusat Muhammadiyah pada acara Milad ke-109 di Universitas Muhammadiyah Yogyakarta pada 18 November 2021 yang dihadiri oleh Presiden Joko Widodo.