Jelaskan Reaksi berantai polimerase dari Tes amplifikasi asam nukleat

Reaksi berantai polimerase merupakan suatu reaksi enzimatik yang dapat menggandakan untai DNA secara selektif dalam proses in vitro. Bahan yang diperlukan berupa sepasang primer oligonukleotida spesifik yang membatasi fragmen DNA tertentu.  Selain itu, diperlukan konsentrasi ensim Tag polymerase, dNTPs, Mg2+, dan cetakan DNA. Reaksi berantai polimerase merupakan metode yang berguna untuk analisis DNA. Perbedaan dalam berbagai variabel yang mengontrol jalannya reaksi membuat reaksi amplifikasi pada reaksi berantai polimerase bersifat eksponensial. Hasil reaksi dipengaruhi oleh bahan yang digunakan, tahap denaturasi, tahap aniling, polimerisasi, periode waktu dan jumlah siklus dan laju penyusunan dimer primer, serta kontaminan DNA. Proses amplifikasi metode reaksi berantai polimerase bagian DNA dengan menggunakan primer yang telah diketahui urutan basanya. Dengan menggunakan analisis mikrosatelit, pemeriksaan DNA dapat dilakukan secara mudah dan cepat. Analisis utamanya dilakukan pada DNA sidik jari. Reaksi berantai polimerase dapat mengamplifikasi lokus-lokus pada mikrosatelit yang memiliki ukuran alel yang kecil (kurang dari 300 pasangan basa) dan pada sampel yang mengalami degradasi.

Mikrosatelit merupakan daerah-daerah DNA dengan panjang unit-unit pengulangan kurang dari 1 kb (kilobasepair). Karena sampel yang telah terdegradasi pun dapat dianalis, maka amplifikasi dengan mudah dilakukan dengan reaksi berantai polimerase. Pengulangan yang sedikit hanya menghasilkan perbedaan alel dari individu heterozigot dengan ukuran yang sama. Keberagaman jumlah pengulangan dalam penanda mikrosatelit di antara individu memberikan efektifitas tujuan identifikasi manusia. Penanda mikrosatelit menjadi lebih baik pada ukuran alel mikrosatelit yang kecil. Penanda ini digunakan dalam aplikasi forensik saat DNA yang rusak sangat banyak. Penyelesaian amplifikasi reaksi berantai polimerase dari sampel-sampel DNA yang rusak menjadi lebih mudah pada ukuran penanda yang lebih kecil. Selama reaksi berantai polimerase, DNA yang dibutuhkan relatif dalam jumlah yang sangat sedikit. Reaksi berantai polimerase juga dapat melakukan amplifikasi meski tingkat kesegaran DNA relatif lebih rendah.  Teknik ini lebih unggul dibandingkan dengan teknik Polimorfisme Panjang Berkas Restriksi yang selama ini digunakan dalam pemeriksaan DNA forensik. Reaksi berantai polimerase merupakan penemuan dari Kary Mullis pada tahun 1985 yang mengatasi persoalan yang terkait dengan jumlah dan kualitas DNA.