Jabarkan Rencana rute perjalanan dari Chūō Shinkansen

Rute perjalanan direncanakan melewati banyak daerah berpenduduk jarang di Pegunungan Alpen Jepang (Pegunungan Akaishi), namun memiliki jarak yang lebih pendek dari rute Tōkaidō Shinkansen saat ini dan penghematan waktu melalui rute yang lebih cepat merupakan kriteria yang lebih penting bagi JR Central daripada memiliki stasiun di kota besar. Rute akan memiliki radius kurva minimum 8.000 m (26.000 kaki) dan gradien maksimum 4%. Ini jauh lebih banyak daripada jalur-jakur Shinkansen pendahulu yang mencapai 3%.

Rute yang direncanakan adalah petak antara Nagoya dan Osaka termasuk pemberhentian di Nara. Pada tahun 2012, politisi dan pemimpin bisnis di Kyoto mengajukan petisi kepada pemerintah pusat dan JR Central untuk mengubah rute melewati kota mereka.  Gubernur Prefektur Nara mengumumkan pada November 2013 bahwa ia telah mengkonfirmasi kembali niat Kementerian Transportasi untuk merutekan segmen tersebut melalui Nara.

Namun JR Central mengumumkan pada Juli 2008 bahwa Chūō Shinkansen akan dimulai di Stasiun Shinagawa, Tokyo, dengan alasan kesulitan dalam pembebasan lahan di dekat stasiun Tokyo dan Shinjuku untuk stasiun maglev.

Laporan JR Central tentang Chūō Shinkansen telah disetujui oleh panel Partai Demokrat Liberal pada Oktober 2008, yang mengesahkan tiga rute yang diusulkan untuk Maglev. Menurut artikel berita Japan Times, JR Central mendukung rute yang lebih cepat dan membutuhkan biaya lebih sedikit untuk membangun daripada dua rencana lainnya, yang kemudian didukung oleh Prefektur Nagano. Dua rencana terakhir memiliki jalur yang berayun ke utara antara stasiun Kōfu dan Nakatsugawa untuk melayani area di dalam Nagano. Pada bulan Juni 2009, JR Central juga mengumumkan hasil penelitian yang membandingkan tiga rute, memperkirakan pendapatan dan waktu perjalanan, yang menunjukkan yang paling menguntungkan adalah Rencana C terpendek, dengan terowongan panjang di bawah Pegunungan Alpen Jepang. Dewan Kebijakan Transportasi untuk Kementerian Pertanahan, Infrastruktur, Transportasi dan Pariwisata menyimpulkan pada tanggal 20 Oktober 2010 bahwa Rencana C akan menjadi yang paling hemat biaya. JR Central mengumumkan bahwa satu stasiun akan dibangun di masing-masing Prefektur Yamanashi, Gifu, Nagano, dan Kanagawa. Pada tanggal 31 Oktober 2014, Kementerian Pertanahan, Infrastruktur, Transportasi dan Pariwisata Jepang menyetujui Rencana C untuk pembangunan. Konstruksi akhirnya resmi dimulai pada 17 Desember 2014.