Jabarkan Phobia (2005–2007) dari Breaking Benjamin

Setelah kepergian Jeremy Hummel, Breaking Benjamin mengikuti audisi lima belas drummer, di antaranya Chad Szeliga menonjol karena kemampuannya sebagai pemain panggung dan fakta bahwa ia memiliki "keterampilan pemecahan masalah yang serius", menurut Burnley. Album grup berikutnya, Phobia, sekali lagi diproduksi oleh Bendeth dan merupakan yang pertama direkam dengan Szeliga. Konsep album ini didedikasikan untuk berbagai fobia Burnley. Sampul album menggambarkan seorang pria bersayap tergantung di atas landasan pacu, yang mewakili ketakutan penyanyi untuk terbang. Burnley juga menderita kecemasan kematian, ketakutan akan kegelapan, kecemasan mengemudi, dan hipokondria. Burnley mengutip ketakutannya terbang sebagai alasan mengapa dia tidak tampil di luar negeri, dengan mengatakan, "Saya akan pergi sejauh perahu akan membawa saya", meskipun pada saat itu label rekaman band tidak memfasilitasi perjalanan dengan perahu. Lagu "Intro" dan "Outro" Phobia menampilkan efek suara dari interkom bandara, turbulensi pesawat, pintu mobil, dan kepanikan orang banyak.

Phobia dirilis pada 8 Agustus 2006, untuk kesuksesan komersial. Album ini terjual lebih dari 131.000 eksemplar dalam minggu pertama penjualannya dan memuncak di No. 2 di Billboard 200. Album ini meraih emas pada 8 November 2006, kemudian platinum pada 21 Mei 2009. Single utamanya, "The Diary of Jane", memuncak di No. 2 di tangga lagu Mainstream Rock Songs dan merupakan singel tercepat yang ditambahkan ke daftar putar radio dalam sejarah Hollywood Records, kemudian menerima sertifikasi platinum ganda pada 24 November 2015. "Breath", singel kedua rekaman itu, menghabiskan tujuh minggu di No 1 di chart Mainstream Rock Songs, dan meraih platinum pada 24 November 2015. Single ketiga, "Until the End", memuncak di No 6 di chart yang sama, dan menjadi singel emas pada Februari 11, 2014.

Pada bulan Februari 2007 untuk mendukung Phobia, AXS TV (kemudian dikenal sebagai HDNet) menayangkan konser Breaking Benjamin selama satu jam dari Stabler Arena di Bethlehem, Pennsylvania. Rekaman siaran disertakan pada DVD Phobia yang dirilis ulang pada bulan April, disebut sebagai "The Homecoming". Sebuah video musik dibuat untuk "Breath" yang dibuat dari cuplikan penampilan lagu tersebut di acara tersebut. Breaking Benjamin diikuti dengan tur Musim Semi dan Musim Gugur bersama Three Days Grace, ditemani oleh Puddle of Mudd selama tur Musim Semi, dan Seether, Skillet, dan Red selama tur Musim Gugur.

Phobia menerima sambutan kritis yang beragam. Ini menerima pujian untuk komposisi umum dan musik tetapi menerima kritik karena kurangnya orisinalitas. Corey Apar dari AllMusic menemukan album itu "tidak ada apa-apanya jika tidak konsisten," dan sementara umumnya mengenai disk dengan sentimen positif, mencatat kurangnya perbedaan dari "paket post-grunge/alt-metal lainnya" selain dari "pesona tertentu" . Spence D. IGN memberikan ulasan negatif pada disk, mengutip kebosanan dan kurangnya perbedaan vokal, merasa bahwa "persimpangan hard rock dan introspeksi berorientasi emo" grup adalah "bukan hal yang buruk, tetapi juga bukan hal yang sangat berkesan atau membumi- menghancurkan satu juga." Namun, penulis memuji kemampuan bermusik Fink, Klepaski, dan Szeliga, yang pada akhirnya memberikan album ini skor 5,7 dari 10. Entertainment Weekly menilai album C+ dan mencatat tema-tema yang sarat kecemasan, dengan mengatakan, "seperti kecemasan patologis, itu dilakukan dengan ahli, dengan chorus yang luas dan riff epik – bukan itu yang penting, ketika, seperti, kita semua akan mati kedinginan dan sendirian.”