Jabarkan Sebagai kapal penelitian dari Sōya (PL107)

Pada tahun 1950, Sōya menerima perbaikan komprehensif dalam persiapan untuk mengabdi sebagai kapal penelitian khusus Antartika pertama milik Jepang. Pada tahun 1956, modifikasi lanjutan termasuk penggantian mesin uapnya dengan mesin diesel kembar serta pemasangan dek helikopter untuk membawa helikopter ringan. Pada tahun 1957, bibir kapal bagian depan dibangun dilanjutkan tahun 1958 dengan perbaikan lebih lanjut yang menambah dek helikopter kedua yang lebih besar di atas dek sebelumnya.

Sōya mengemban misi-misi ke Antartika antara tahun 1956 dan 1962. Pada pelayaran keduanya tahun 1958, kapal ini menjadi viral ketika krunya menyelamatkan personel yang terdampar di stasiun penelitian Showa saat musim dingin sudah mendekat. Evakuasi tersebut tidak mencakup anjing misi, sehingga 15 husky Karafuto-Ken terpaksa ditinggalkan untuk berjuang sendiri di tengah hamparan es. Musim semi berikutnya kapal ini kembali dan menemukan dua ekor anjing masih hidup, lalu dinamai Taro dan Jiro. Kisah kedua anjing tersebut menyebar ke seluruh dunia berkat dua film: Nankyoku Monogatari (dirilis di Amerika Serikat sebagai Antartica) dan adaptasi oleh Disney dalam film Hollywood Eight Below. Sōya sendiri sempat mengalami kesulitan selama berada di Antartika, termasuk terjebak di dalam es dan membutuhkan bantuan dari kapal pemecah es Amerika Serikat bernama .

Ketika pensiun dari misi di Antartika, Sōya menjadi kapal penyelamat pemecah es untuk Badan Keselamatan Maritim Jepang. Pada masa ini, Sōya berbasis di Hokkaido.