Jabarkan Klasifikasi dari Avemetatarsalia

Pada tahun 1986, Jacques Gauthier mendefinisikan nama Ornithosuchia (yang sebelumnya diciptakan oleh Huene) untuk klad berbasis batang termasuk semua Archosauria yang lebih berkerabat dekat dengan burung dibanding buaya. Pada tahun yang sama, Gauthier juga menciptakan dan mendefinisikan klad berbasis simpul yang sedikit lebih terbatas, Ornithodira, mencakup nenek moyang bersama terakhir dari dinosaurus dan pterosaurus dan semua keturunannya. Paul Sereno pada tahun 1991 memberikan definisi Ornithischia yang berbeda, salah satunya dengan tegas menambah Scleromochlus. Kelompok ini mungkin sempat menjadi lebih besar daripada Ornithodira menurut Gauthier. Pada 1999 Michael Benton menyimpulkan bahwa Scleromochlus tentunya tidak termasuk Ornithodira menurut gambaran asli Gauthier, jadi ia menamai klad berbasis cabang untuk maksud ini: Avemetatarsalia, dinamai berdasarkan burung (Aves), anggota klad yang terakhir selamat, dan sendi pergelangan kaki metatarsus yang dulunya merupakan ciri khas dari kelompok tersebut. Avemetatarsalia dulunya didefinisikan sebagai kelompok yang mencakup seluruh Avesuchia yang lebih dekan ke Dinosauria daripada Crocodylia. Pada tahun 2005, Sereno menyatakan opini bahwa Ornithodira bukanlah konsep yang berguna, sedangkan Avemetatarsalia merupakan konsep yang berguna. Pada 2001, klad yang sama diberi nama "Panaves" (, dari bahasa Yunani  + Latin ), diciptakan oleh Jacques Gauthier. Ia mendefinisikannya sebagai klad Archosaurus terbesar dan paling inklusif yang mencakup Aves (burung, dikaitkan ke Vultur gryphus) namun tidak dengan Crocodylia (dikaitkan ke Crocodylus niloticus). Gauthier memasukkan Aves, Dinosauria lain, seluruh Pterosauria, dan pelbagai Archosauria dari periode Trias, termasuk Lagosuchus dan Scleromochlus, dalam kelompok ini.

Dalam tinjauan klasifikasi Archosaurus tahun 2005, Phil Senter mencoba menyelesaikan kumpulan terminologi yang saling bertentangan dengan memberi prioritas ketat pada nama berdasarkan kapan dan bagaimana mereka pertama didefinisikan. Senter mencatat bahwa Ornithosuchia, nama terawal yang digunakan untuk kelompok total Archosauria yang lebih dekat ke burung dibanding buaya, harus menjadi nama yang valid untuk kelompok tersebut dan memiliki hak mendahului nama yang lebih baru dengan definisi identik, seperti Avemetatarsalia dan Pan-Aves. Meskipun ini telah diikuti oleh beberapa peneliti, peneliti lain melanjutkan penggunaan Avemetatarsalia dan Ornithodira, atau telah jarang mengikuti Senter. Misalnya, Mike Taylor (2007) mencatat, bahwa hal ini "tidak diinginkan" karena mungkin tidak memasukkan famili eponimnya Ornithosuchidae, dan mempertanyakan faedah dari menggunakan prioritas sebelum Phylocode diimplementasikan untuk mengaturnya. Faktanya, nama Ornithosuchia mungkin dianggap "ilegal" dalam PhyloCode karena nama tersebut tidak termasuk takson eponim sebagai bagian dari definisi.

Kladogram menurut Nesbitt et al. (2017), dengan nama klad dari Cau (2018).

Kammerer et al. (2020) dan Ezcurra et al. (2020) mendukung hipotesis alternatif mengenai kekerabatan Lagerpetidae. Mereka ditafsirkan sebagai Pterosauromorpha non-pterosaurus. Filogeni ini akan memperpendek celah morfologis dan kronologis yang dirasa ada diantara pterosaurus dan burung-batang lainnya dan menjelaskan asal usul kelompok ini. Bennett (2020) membantah bahwa Scleromochlus, sebuah genus yang pernah dianggap sebagai kerabat Ornithodira atau bahkan Pterosauromorpha basal, dan menganggap bahwa sebenarnya hewan ini adalah archosauriform (kemungkinan termasuk anggota Doswelliidae).