Jabarkan Solo organ dari Jean Guillou

Fantaisie, op. 1 (1952. Mainz: Schott, 2005)

18 Variations, op. 3 (1956. Mainz: Schott, 2005)

Sinfonietta, op. 4 (1958/direvisi pada 2005. Mainz: Schott, 2005)

Ballade Ossianique No. 1 ("Temora"), op. 8 (1962/1967 diterbitkan oleh Leduc, Paris, sbg "Pour le tombeau de Colbert"/direvisi pada 2005. Mainz: Schott, 2005)

Toccata, op. 9 (1962/direvisi pada 2004. Mainz: Schott, 2004)

6 Sagas, op. 20 (1970. Mainz: Schott, 2005)

Ballade Ossianique No. 2 ("Les Chants de Selma"), op. 23 (1971/diterbitkan pada 1971 oleh Leduc, Paris, sbg "Allen"/direvisi pada 2005. Mainz: Schott, 2005)

La Chapelle des Abîmes, op. 26 (1973. Mainz: Schott, 2005)

Scènes d'enfants, op. 28 (1974. Mainz: Schott, 2005)

Jeux d'Orgue, op. 34 (1978. Wina: Edisi Universal, 1984)

Suite pour Rameau, op. 36 (1979. Boston, MA: Edisi Wayne Leupold, 1994)

Saga No. 7, op. 38 (1983. Wina: Universal Edition, 1984)

Sonate en trio No. 1, op. 40 (1984. Paris: Durand, 1985)

Chamades!, op. 41 (1984. USA: H. T. FitzSimons, 1984)

Impromptu, untuk solo pedal op. 42 (1985. Wina: Edisi Universal, 1988)

Hypérion ou la Rhétorique du Feu, op. 45 (1988. Boston, MA: Edisi Wayne Leupold, 1996)

Säya ou l'Oiseau Bleu, op. 50 (1993. Mainz: Schott, 2004)

Éloge, op. 52 (1994. Boston, MA: Edisi Wayne Leupold, 1995)

Alice au pays de l'orgue untuk organ dan narator, op. 53 (1995. Mainz: Schott, 1998)

Pensieri pour Jean Langlais, op. 54 (1995. USA: H. T. FitzSimons, 1996)

Instants, op. 57 (1998. Mainz: Schott, 2015)

Pièces furtives, op. 58 (1998. Mainz: Schott, 2000)

Hymnus, op. 72 (untuk mengenang P. Japp Reuten) (2008. Mainz: Schott, 2009)

Regard, op. 77 (2011. Mainz: Schott, 2013)

Enfantines, op. 81 (2013. Mainz: Schott, 2015)

Sonate en trio No. 2, op. 82 (2013. Mainz: Schott, 2014)

Sonate en trio No. 3, op. 83 (2013. Mainz: Schott, 2014)

Macbeth – Le lai de l'Ombre, op. 84 (2009. Mainz: Schott, 2016)

Psyché, op. 87 (1978-2015. Tidak diterbitkan)

Périple, op. 87 (2016. Tidak diterbitkan)

Pensieri pour Claude Bernard, tanpa Opus (Tidak diterbitkan)