Jabarkan Organ dengan instrumen lainnya dari Jean Guillou

Colloque No. 2 untuk Organ dan Piano, op. 11 (1956-1964/direvisi pada 2005. Mainz: Schott, 2005)

Colloque No. 4 untuk organ, piano dan dua perkusi, op. 15 (1966/direvisi pada 2006. Mainz: Schott, 2006)

Intermezzo untuk Seruling dan Organ, op. 17 (1969. Mainz: Schott, 2008)

Versi untuk tiga organ (1969. Tidak diterbitkan)

Versi untuk dua organ (1990. Tidak diterbitkan)

Versi untuk organ dengan dua pemain (2009. Mainz: Schott, 2016)

Colloque No. 5 untuk Organ dan Piano, op. 19 (1969/direvisi pada 2005. Mainz: Schott, 2005)

Sonate untuk Terompet atau Biola dan Organ, op. 25 (1972. Tidak diterbitkan)

Concerto untuk Biola dan Organ,  op. 37 (1982. Tidak diterbitkan)

Colloque No. 6 untuk Organ dan dua Perkusi, op. 47 (1989. Tidak diterbitkan)

Fantaisie concertante untuk Violoncello dan Organ, op. 49 (1991. Mainz: Schott, 2009)

Fête untuk Klarinet dan Organ, op. 55 (1995. Mainz: Schott, 2008)

Écho untuk Flute, Klarinet, Kuintet senar, Paduan suara, Piano dan Organ, op. 60 (1999. Mainz: Schott)

L’Ébauche d’un souffle (Konser untuk Terompet dan Organ), op. 64 (1985. Mainz: Schott, 2016)

Colloque No. 7 (Konser untuk Piano dan Organ), op. 66 (1998. Mainz: Schott, 2011)

Colloque No. 8 untuk Marimba dan Organ, op. 67 (2002. Mainz: Schott, 2008)

La Révolte des Orgues untuk delapan organ portatif, organ besar, dan perkusi, op. 69 (2005. Mainz: Schott, 2007)

Colloque No. 9 untuk organ dan seruling pan, op. 71 (2008. Mainz: Schott, 2009)

Répliques untuk organ besar dan organ positif, op. 75 (2009, Mainz: Schott, 2011)

Colloque No. 10 untuk terompet tunggal, tujuh terompet, organ dan perkusi, op. 86 (2016, Mainz: Schott, 2017)

Inventions (Organ concerto No. 1) untuk Organ dan orkestra kamar, op. 7 (1960. Paris: Leduc, 1970)

Concerto héroïque ( Organ concerto No. 2) untuk Organ dan orkestra, op. 10 (1963/direvisi pada 2005. Mainz: Schott, 2005)

Organ Concerto No. 3 untuk Organ dan string orkestra, op. 14 (1965. Paris: Leduc, 1972)

Organ Concerto No. 4 untuk Organ dan orkestra, op. 31 (1978. Tidak diterbitkan)

Organ Concerto No. 5 ("Le Roi Arthur") untuk Organ dan kuintet brass, op. 35 (1979/direvisi pada 2010. Mainz: Schott, 2012)

Concerto 2000 untuk Organ dan orkestra besar, op. 62, (2000. Mainz: Schott)

Organ Concerto No. 6 untuk Organ dan orkestra besar, op. 68 (2002. Mainz: Schott)

Organ Concerto No. 7 untuk Organ dan orkestra, op. 70 (2006. Mainz: Schott, 2007)