Jabarkan Henri (1551–1553), Adipati Beaumont dari Antoine dari Navarra

Henri IV (1553 – 1610)

Louis (1555 – 1557), Comte Marle

Catherine (1559–1604), menikah dengan Henri II, Adipati Lorraine pada 1599.

Dengan gundiknya, Louise de La Béraudière du Rouhet, Antoine memiliki seorang putra:

Charles, Uskup Agung Rouen dari 1554 hingga 1610.

Antoine tampaknya tidak memiliki keyakinan agama yang nyata dan secara resmi berganti agama beberapa kali. Pergantian keyakinannya ke Katolik memisahkannya dari istrinya dan dia mengancam akan menolaknya. Dia berselingkuh dengan Louise de La Béraudière du Rouhet, "la belle Rouet," dengan siapa dia memiliki seorang putra, Charles III de Bourbon (1554 – 1610) yang menjadi uskup agung Rouen.