Jabarkan Konfirmasi infeksi SARS-Cov-2 dari Tes amplifikasi asam nukleat

Tes amplifikasi asam nukleat digunakan untuk konfirmasi standar infeksi SARS-CoV-2 akut. Deteksinya didasarkan pada sekuensing virus khusus, seperti real time reverse-transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR). Tes amplifikasi asam nukleat menargetkan genom SARS-CoV-2. Sekuens khusus sarbecovirus juga menjadi target yang wajar, karena saat ini belum diketahui terjadi penyebaran SARS-CoV-1 secara global. Pada asai yang tersedia di pasaran, interpretasi hasil harus dilakukan sesuai instruksi penggunaan. Tes amplifikasi asam neukleat akan menghasilkan diagnostik yang optimal dengan setidaknya dua target genom SARS-CoV-2 yang tidak terkait. Namun, algoritma sederhana dengan satu target pembeda tunggal dapat digunakan pada wilayah-wilayah dengan persebaran SARS-CoV-2 secara meluas. Selain itu, strategi memantau mutasi yang dapat berdampak pada kinerja dipersiapkan saat menggunakan asai dengan target tunggal.

Asai tes amplifikasi asama nukleat telah tersedia secara umum. Beberapa sistem tes amplifikasi asam nukleat memiliki kemampuan tes secara otomatis dan menyeluruh. Kerjanya dimulai dari pemrosesan sampel, kapasitas ekstraksi, amplifikasi, hingga pelaporan RNA. Di wilayah-wilayah dengan kapasitas laboratorium yang terbatas, sistem-sistem tersebut memberikan akses pada tes. Selain itu, sistem-sistem tersebut memberikan hasil yang cepat saat digunakan untuk tes di dekat pasien. Validasi data dari sebagian asai ini sekarang sudah tersedia. Penggunaan asai-asai ini di tempat-tempat tertentu memerlukan staf yang cukup terlatih dengan penilaian kinerja langsung pada tempat tersebut. Penggunaan asai juga melibatkan sistem pemantauan kualitas. Tes amplifikasi asam nukleat dapat dibantu dengan metode amplifikasi atau deteksi tambahan yang dapat bermanfaat seperti CRISPR, teknologi amplifikasi asam nukleat isotermal dan asai mikrolarik molekuler. CRISPR dapat membantu dalam menarget klaster urutan berulang palindrom pendek berjarak reguler. Sedangkan teknologi amplifikasi asam nukleat isotermal dapat berupa amplifikasi isotermal mediasi lingkar transkripsi balik (RT-LAMP). Peningkatan akses pada tes SARS-CoV-2 dilakukan dengnan validasi kinerja analitis dan klinis asai-asai, demonstrasi potensi kegunaan operasional, pembagian cepat data, serta pengkajian darurat atas peraturan tentang tes berkinerja baik yang dapat diproduksi. Hasil tes amplifikasi asam nukleat positif lemah secara hati-hati diinterpretasi, karena beberapa asai terbukti menghasilkan sinyal palsu dengan nilai Ct yang tinggi.  Pengambilan sampel pasien harus diulang dan pasien dites laga apabila hasil tes terbukti invalid atau diragukan. RNA harus diekstraksi kembali dari sampel awal jika sampel-sampel tambahan dari pasien tidak tersedia, lalu dites lagi oleh staf yang berpengalaman. Hasilnya dapat dikonfirmasi melalui tes-tes amplifikasi asam nukleat alternatif atau pengurutan virus jika beban virusnya cukup tinggi. Setiap hasil yang tidak terduga di laboratorium harus memperoleh konfirmasi dari laboratorium referensi.