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Epidendrum robustum Cogn. in C.F.P.von Martius & auct. suc. (eds.), (1906).

Epidendrum rocalderianum P.Ortiz & Hágsater, (1999).

Epidendrum rolfeanum F.Lehm. & Kraenzl., (1899).

Epidendrum romanii Hágsater & Dodson, (1993).

Epidendrum roncanum Dodson & R.Vásquez, (1989).

Epidendrum rondoniense L.C.Menezes, (1990) : Rondonia Epidendrum

Epidendrum rostratum Garay & Dunst., (1961).

Epidendrum rotundifolium Hágsater & Dodson, (2001).

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Epidendrum rubioi Hágsater & Dodson, (1993).

Epidendrum ruizianum Steud., (1840) : Ruiz's Epidendrum

Epidendrum ruizlarreanum D.E.Benn. & Christenson, (2001).

Epidendrum rupicola Cogn. in C.F.P.von Martius & auct. suc. (eds.), (1898).

Epidendrum samaipatense Dodson & R.Vásquez, (1989).

Epidendrum sarcochilum Lindl. & Rchb.f., (1854).

Epidendrum sarcodes Lindl., Fol. Orchid. (1853).

Epidendrum sarcostalix Rchb.f. & Warsz., (1854).

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Epidendrum scabrum Ruiz & Pav., (1798).

Epidendrum scharfii Hágsater & Dodson, (1993).

Epidendrum schizoclinandrium D.E.Benn. & Christenson, (2001).

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Epidendrum schunkei D.E.Benn. & Christenson, (1998).

Epidendrum secundum Jacq., (1760) :  Elongated Lip Epidendrum. Subgen. Amphiglottium, Sect. Schistochila, Subs. Tuberculata (Reichenbach, p. 395)

Epidendrum semiteretifolium D.E.Benn. & Christenson, (1995).

Epidendrum septumspinae D.E.Benn. & Christenson, (2001).

Epidendrum serpens Lindl. in G.Bentham, (1845) : Serpent Epidendrum

Epidendrum sertorum Garay & Dunst., (1972).

Epidendrum silvae Hágsater & V.P.Castro, (1999).

Epidendrum silvanum V.P.Castro & Chiron, (2003).

Epidendrum siphonosepalum Garay & Dunst., (1972).

Epidendrum skutchii Ames, F.T.Hubb. & C.Schweinf., (1936).

Epidendrum sobralioides Ames & Correll, (1943) : Sobralia-Like Epidendrum

Epidendrum socorrense Rchb.f. & Warsz., (1854).  Subgen. Amphiglottium, Sect. Schistochila, Subs. Tuberculata (Reichenbach, p. 396)

Epidendrum sophronitis Lindl. & Rchb.f., (1857).

Epidendrum sophronitoides F.Lehm. & Kraenzl., (1899) : Sophronitis-Like Epidendrum

Epidendrum sotoanum Karremans & Hágsater (2010)

Epidendrum spathulipetalum Hágsater & Dressler, (2001).

Epidendrum sphenoglossum F.Lehm. & Kraenzl., (1899).

Epidendrum spicatum Hook.f., (1851). Subgen. Amphiglottium, Sect. Schistochila, Subs. Carinata (Reichenbach, p. 389)

Epidendrum spilotum Garay & Dunst., (1976).

Epidendrum spinescens Lindl., (1853).  Subgen. Amphiglottium, Sect. Schistochila, Subs. Tuberculata (Reichenbach, p. 392)

Epidendrum stalkyi Carnevali & G.A.Romero in G.A.Romero & G.Carnevali, (2000).

Epidendrum stamfordianum Bateman, (1839) : Stamford's Epidendrum

Epidendrum stellidifforme Hágsater & Dodson, (2001).

Epidendrum stenophyllum Hágsater & Dodson, (1993).

Epidendrum stevensonii Hágsater & Dodson, (2001).

Epidendrum stolidium Hágsater (2005) (formerly Oerstedella ornata)

Epidendrum storkii Ames, (1924) : Stork's Epidendrum

Epidendrum strobiliferum Rchb.f., (1859) :  Pine Cone Epidendrum.  Subgenus Epidendrum Lindl. Section Planifolia Rchb.f. Subsection Spathacea Rchb.f. (Reichenbach, pp. 399–400)

Epidendrum strobiloides Garay & Dunst., (1966).