Jabarkan Pengisi suara dari Suzume

Akari Miura sebagai Suzume muda

Makoto Shinkai menggagas ide tentang Suzume ketika dia melakukan perjalanan keliling Jepang untuk memberikan presentasi tentang karya-karyanya di masa lalu. Dia berkata, "Di Jepang, sudah menjadi kebiasaan untuk mengadakan jichin-sai atau upacara peletakan batu pertama, sebelum pembangunan gedung atau rumah baru dimulai, tetapi kami tidak melakukan apa pun saat menutupnya." Makoto menyadari bahwa terdapat banyak area kosong atau terbengkalai di Jepang akibat menurunnya angka kelahiran dan populasi yang semakin menua sehingga dia berpikir untuk menulis sebuah cerita tentang "tempat yang ditinggalkan". Hasilnya, film ini secara tak terelakkan berubah menjadi film tentang perjalanan mengunjungi berbagai tempat.

Gempa bumi dan tsunami Tōhoku pada tahun 2011, memberikan pengaruh terhadap tema-tema dalam film ini. Meskipun komet Tiamat dalam Your Name dan konsep Weathering with You merupakan ide yang dipengaruhi oleh bencana alam, Shinkai merasa bahwa ia harus "mengekspresikan dampak yang [dia] rasakan melalui gempa bumi dan tsunami, daripada terus menggambarkannya sebagai perumpamaan." Dia khawatir bahwa ingatan orang-orang akan bencana tersebut mulai menjadi "kabur" seiring berjalannya waktu. Dengan menggambarkan gempa bumi dan tsunami dalam film atau novelnya, dia juga dapat berbagi kenangannya dengan para remaja yang tidak mengetahui tentang bencana tersebut. Makoto juga mengutip Kiki's Delivery Service dan novel Kafka on the Shore karya Haruki Murakami serta cerita pendek  sebagai inspirasi untuk film ini.

Makoto dan stafnya mempersiapkan film ini sejak Januari hingga Maret 2020. Mereka mulai mengembangkan naskah film pada bulan April, yaitu saat pemerintah Jepang mengumumkan keadaan darurat sebagai akibat dari pandemi COVID-19. Dalam sebuah wawancara dengan TV Asahi, Makoto menyebutkan bahwa pandemi memiliki pengaruh yang tidak terlalu besar terhadap produksi film tersebut. Namun, dia mengatakan bahwa "suasana hati saat itu sangat membekas di dalam naskah", dan menambahkan bahwa film ini akan memiliki tema pascakepunahan. Sōta yang kemudian berubah menjadi kursi mengacu pada perasaan Shinkai yang terjebak selama pembatasan COVID-19. Setelah menyelesaikan naskah pada bulan Agustus, papan cerita dibuat dari bulan September 2020 hingga Desember 2021. Sementara itu, produksi animasi dimulai pada bulan April 2021. Film ini secara resmi diluncurkan dalam konferensi pers pada 15 Desember 2021. Staf film ini terdiri atas Masayoshi Tanaka sebagai desainer karakter, Kenichi Tsuchiya sebagai sutradara animasi, dan Takumi Tanji sebagai direktur seni. CoMix Wave Films dan Story Inc. diumumkan sebagai produser film ini. Pada bulan Oktober 2022, Shinkai mengumumkan bahwa produksi film tersebut telah selesai.