Jabarkan Merebut ibu kota dari Antiokhos XI Epifanis

Menurut Eusebius, kedua kakak beradik ini menjarah Mopsuestia dan menghancurkannya untuk membalaskan dendam kakak mereka, SeleukosVI. Pernyataan Eusebius ini kemudian diragukan para sejarawan, karena menurut sebuah prasasti yang berasal dari Mopsuestia, Republik Romawi pada 86 SM memberikan kekebalan kepada kegiatan pemujaan Isis dan Serapis di kota tersebut. Setelah Mopsuestia, AntiokhosXI meninggalkan FiliposI di Kilikia dan bergerak bersama pasukannya menuju Antiokhia, ibu kota Seleukia. Ia berhasil mengusir AntiokhosX keluar dari kota tersebut pada tahun 93 SM. Sejarawan-sejarawan kuno tidak pernah menyebutkan bahwa AntiokhosXI telah berkuasa di Antiokhia; mereka malah menerangkan bahwa AntiokhosXI bertempur melawan AntiokhosX dan kemudian mengalami kekalahan. Seorang sejarawan dan biarawan Romawi Timur dari abad ke-6 Ioannes Malalas, yang secara umum dianggap tidak dapat dipercaya oleh para sejarawan, dalam catatannya menyebutkan bahwa AntiokhosXI pernah memerintah di Antiokhia. Pada akhirnya, fakta bahwa AntiokhosXI berhasil merebut Antiokhia dibuktikan melalui sebuah koin yang dicetak di Antiokhia, yang dipublikasikan pada tahun 1912.

FiliposI tidak berkedudukan di Antiokhia dan AntiokhosXI mencetak mata uangnya sebagai penguasa tunggal. FiliposI tetap memegang gelar sebagai raja dan menetap di Kilikia. Ahli numismatika Edward Theodore Newell memperkirakan bahwa pemerintahan AntiokhosXI hanya berlangsung beberapa minggu di Antiokhia. Namun, ahli numismatika Oliver Hoover meyakini bahwa Antiokhos XI mungkin berkuasa selama beberapa bulan; kesimpulan ini didasarkan pada rata-rata penggunaan cetakan mata uang setiap tahunnya. Menurut Malalas, Raja Antiokhos Filadelfos (yakni AntiokhosXI) membangun kuil untuk dewa Apollo dan dewi Artemis di Dàphne, mendirikan dua patung emas yang melambangkan para dewa, serta memberikan hak suaka kepada siapa saja yang berlindung di dalam kuil. Keterangan ini tidak tepat, karena kuil tersebut terbukti sudah ada pada masa pemerintahan Antiokhos III ( SM). Walaupun begitu, sejarawan Glanville Downey mengamati gaya penulisan Malalas dalam bahasa Yunani dan mengusulkan bahwa arti kata "membangun" dalam tulisan Malalas adalah memugar atau membangun kembali, yang menandakan bahwa pendahulu AntiokhosXI mungkin telah menghancurkan kuil tersebut dan melebur patung emasnya.