Jabarkan Protein partner dari Kompleks eksosom

Selain sembilan protein eksosom inti, dua protein lain sering dihubungkan dengan kompleks pada organisme eukariotik. Salah satunya adalah Rrp44, suatu RNase hidrolitik yang termasuk dalam famili RNase R dari eksoribonuklease hidrolitik (nuklease yang menggunakan air untuk memutuskan ikatan nukleotida). Selain sebagai enzim eksoribonukleolitik, Rrp44 juga memiliki aktivitas endoribonukleolitik, yang berada dalam domain protein yang terpisah. Pada ragi, Rrp44 dihubungkan dengan semua kompleks eksosom dan memiliki peran penting dalam aktivitas kompleks eksosom ragi. Diketahui manusia memiliki protein homolog Rrp44, tetapi tidak ditemukan bukti hingga waktu yang lama bahwa homolog ini dihubungkan dengan kompleks eksosom manusia. Hingga akhirnya pada 2010, ditemukan bahwa manusia memiliki tiga homolog Rrp44, dua di antaranya dapat dihubungkan dengan kompleks eksosom. Kedua protein ini kemungkinan besar mendegradasi substrat RNA yang berbeda karena terdapat pada lokasi yang berbeda, satu dilokalisasi di sitoplasma (Dis3L1) dan satunya lagi di nukleus (Dis3).

Protein partner kedua yang umum yaitu Rrp6 (dalam ragi) atau PM/Scl-100 (pada manusia). Seperti Rrp44, protein ini merupakan eksoribonuklease hidrolitik, tetapi protein masuk dalam famili protein RNase D. Protein PM/Scl-100 paling sering merupakan bagian dari kompleks eksosom dalam inti sel, tetapi juga dapat membentuk bagian dari kompleks eksosom sitoplasma.