Jabarkan Murid bimbingan dari Yūjirō Motora

Motora memiliki beberapa orang di bawah bimbingannya yang kemudian menjadi akademisi terkenal di Jepang. Salah satunya adalah Matsumoto yang membantunya membangun laboratorium psikologi di Tokyo Imperial University. Matsumoto adalah orang di balik berdirinya laboratorium psikologi formal kedua di Jepang dan pendiri Asosiasi Psikologi Jepang. Laboratorium kedua itu dibentuk oleh Matsumoto pada tahun 1906 di Universitas Kyoto. Matsumoto jugalah yang menggantikan posisi Motora di Tokyo Imperial University nantinya.

Salah seorang mahasiswa bimbingan Motora yang kemudian mendirikan laboratorium psikologi dan menerbitkan buku psikologi pertama di Cina adalah Chen Daqi.

Yoshihide Kubo adalah orang yang mengadaptasi tes intelegensia Binet-Simon untuk digunakan di Jepang. Kubo menjadi murid Motora di Tokyo Imperial University sebelum dia melanjutkan pendidikannya di Universitas Clark. Setelah lulus, Kubo bergabung dengan Universitas Hiroshima dan memfokuskan diri dalam penelitian tentang intelegensia. Penelitian Kubo ini dilanjutkan oleh Tohru Watanabe yang juga merupakan murid Motora sekaligus orang yang menciptakan tes intelegensia kolektif pertama di Jepang. Murid Motora yang lain adalah Hiroshi Hayami yang membawa paham behaviorisme ke Jepang dan menjadi rektor di Universitas Keijō Imperial.

Selain di bidang psikologi, Motora juga memiliki murid yang akhirnya lebih dikenal di bidang parapsikologi yaitu Tomokichi Fukurai. Fukurai adalah seorang dosen yang mengajarkan mata kuliah psikologi abnormal di Tokyo Imperial University. Namun, Fukurai kemudian lebih tertarik untuk mempelajari fenomena fisik seperti kewaskitaan atau dunia ramal-meramal, padahal hal semacam ini tidak lagi dianggap di Amerika Serikat. Ketika pada tahun 1910 Fukurai bersikeras bahwa dia telah bertemu dengan tiga peramal wanita, Motora mengingatkannya untuk tidak lagi berkecimpung di bidang parapsikologi. Demi menghormati gurunya, Fukurai tidak memublikasikan penelitiannya tersebut. Baru setahun setelah Motora meninggal, Fukurai menerbitkan buku yang sangat kontroversial tentang peramal. Matsumoto yang menggantikan posisi Motora, berusaha menghentikan kerusakan di departemen psikologi akibat perbuatan Fukurai. Dia meminta Fukurai meninggalkan departemen psikologi. Matsumoto juga menghapus semua hal yang berhubungan dengan parapsikologi dari kurikulum pendidikan psikologi dan hanya fokus terhadap fenomena psikologi yang penilaiannya dapat diukur. Skandal Fukurai ini menyebabkan hambatan dalam perkembangan psikologi klinis di Jepang.

Selain berkecimpung di bidang psikologi, beberapa murid Motora juga menekuni bidang seni rupa. Di bidang kaligrafi, ada Mantaro Kido yang juga melakukan penelitian tentang aplikasi seni terhadap psikologi pendidikan. Selain itu ada Naoteru Ueno yang merupakan pemimpin Osaka Municipal Museum of Art dan presiden Tokyo University of the Arts. Pengganti posisi Motora di Tokyo Imperial University juga merupakan presiden Kyoto Prefectural School of Arts and Crafts.