Jabarkan Kepala Madrasah dari MA Negeri 2 Bantul

1968 - 1984  dipimpin oleh Rusiman, BA

1985 - 1989 dipimpin oleh Drs. Mustaqiem

1989 - 1990 dipimpin oleh Djendro Wahono, BA

1990 - 1992 dipimpin oleh Rohani, BA

1992 - 1996 dipimpin oleh Drs. Marlan

1996 - 1998 dipimpin oleh Drs. Yuwono Tri Sutrisno

1998 - 2007 dipimpin oleh Drs. H. Tulus Yasir

2007 - 2009 dipimpin oleh Drs. H. Budirejo, M.A.

2009 - 2010 dipimpin oleh Drs. H. Imam Nooryanto, M.Pd.

2010 - 2015 dipimpin oleh Drs. H. In Amullah, M.A.

2015 - 2018 dipimpin oleh Abdul Ghofur, S.Ag., M.Pd.

2018 - sekarang Drs. H. Ulul Ajib M.Pd