Jabarkan Andrés Soriano III: 1986–1998 dari San Miguel Corporation

Setelah Revolusi ESDA pada 1986, Corazón Aquino, sepupu Cojuangco yang diasingkan menjadi Presiden Filipina. Aquino menang karena menumpang kemarahan publik atas pembunuhan suaminya Benigno Aquino Jr., pada 1983. Salah satu orang yang disalahkan atas kematiannya adalah Cojuangco, yang terbang pada pesawat yang sama dengan Marcos ke Hawai pada 1986. Pemerintahan Aquino mengasingkan saham Cojuangso di SMC dan menyetujui kepemimpinan Andrés Soriano III, anak dari Almarhum Soriano untuk menjalankan perusahaan walaupun saham Soriano di SMC tidak lebih dari 1%.

Soriano menjalankan kampanye untuk mengambil kembali warisan keluarga, tetapi ketika ia mencoba membeli kembali saham yang ditinggalkan, dirinya dihalangi oleh Pemerintahan Aquino melalui Presidential Commission on Good Government (PCGG). PCGG mengambil kendali (tetapi bukan kepemilikan sah) 51,4% saham dan menolak untuk melepaskannya. Pemerintah menegaskan bahwa saham tersebut dikuasai secara ilegal. PCGG meneruskan kepemilikan saham SMC hingga awal 1990an, tetapi memberikan kontrol secara de facto kepada Soriano melalui kontrak manajemen dengan ANSCOR. Soriano meneruskan program ekspansi perusahaan, membeli kepemilikan saham mayoritas dari La Tondeña, Inc., produsen utama minuman keras di Filipina pada 1987 dan menambahkan produksi daging sapi dan babi (Monetery Meats) pada operasi makanan perusahaan pada 1988.

Soriano memulai program ambisius untuk melakukan ekspansi secara global, berharap untuk memperluas bisnis ke negara lain dan memitigasi efek ekonomi Filipina yang tidak stabil. Dia juga ingin menghindari persaingan dengan produsen bir besar dunia seperti Anheuser-Busch and Miller dari Amerika Serikat, Kirin dari Jepang, dan BSN dari Prancis.

Soriano mengalokasikan dana sebesar $1 miliar untuk program strategi internasional selama liam tahun yang berfokus untuk membentuk operasional domestik, kemudian berlanjut kepada mendapatkan lisensi dan mengekspor, produksi di luar negeri, dan akhinrya mendistribusikan produk-produk non bir.

Langkah berikutnya adalah desentralisasi dengan membentuk struktur perusahaan holding, dimana 18 operasi non-bir diposisikan sebagai anak perusahaan. Reorganisasi perusahaan ini membebaskan bisnis dari belenggu birokrasi konglomerasi. Dalam upaya untuk mencapai efisiensi optimal, SMC mengurangi total pekerjanya sebesar 16% dari 39.138 pekerja pada 1989 menjadi 32.832 pekerja pada 1993.

Dengan kondisi pasar lokal yang sudah "dikondisikan", SMC beralih untuk langkah selanjutnya untuk ekspansi internasional SMC, lisensi dan ekspor bir. Walaupun perusahaan telah mengekspor bir hampir sepanjang sejarah, upaya ini semakin meningkat secara drastis pada akhir 1980an. Ekspor bir SMC tumbuh 150% dari 1985 ke 1989, dan merek SMC melakukan ekspor ke 24 negara termasuk pasar kunci di Asia selain itu juga ke Amerika Serikat, Australia, dan Timur Tengah.

Setelah merek berdiri secara stabil di pasar tertentu, SMC mulai mendirikan fasilitas produksi, terkadang berdiri sendiri dan terkadang bermitra dengan pengusaha lokal. Pada 1995, SMC memiliki pabrik di Hong Kong, Tiongkok, Indonesia, Vietnam, dan memiliki mitra linsensi di Taiwan, Guam, dan Nepal.

Terlepas dari pertengkaran terkait dengan kepemilikan SMC (tidak termasuk masalah endemik pada operasional di Filipina), penjualan perusahaan berlipat ganda menjadi 12,23 miliar peso pada 1986 menjadi 68,43 miliar peso pada 1994. Penghasilan bersih meningkat dua kali lebih cepat, dari 1,11 miliar peso menjadi 11,86 peso pada periode yang sama, walaupun operasi di luar negeri (secara keseluruhan) belum menghasilkan keuntungan.

Pada 1996 SMC membeli keseluruhan saham pada anak usahanya di Hong Kong , San Miguel Brewery Hong Kong Ltd. Pada bulan April tahun yang sama, unit pembotolan domestik minuman ringan SMC yaitu Coca-Cola Bottlers Philippines, Inc. bergabung ke dalam Coca-Cola Bottlers Philippines, Inc. (CCA) yang berbasis di Australia. Akibatnya, SMC bertukar 70% sahamnya di operasinya di Filipina dengan 25% saham di CCA yang beroperasi di 17 negara. CCA kemudian mendivestasi operasinya ke perusahaan berbasis di Britania Raya bernama Coca-Cola Beverages plc. (menyebabkan saham saham SMC di CCA menjadi 22%).

Dari tahun 1995 sampai dengan 1997, SMC mengalami kemunduran pada bisnis di Filipina, sementara operasional di luar negeri belum menghasilkan keuntungan. Profit yang didapatkan terjun bebas. Oleh karena itu, perusahaan melakukan restrukturisasi besar terhadap bisnis makanan yang merugikan. Bisnis susu dan Es Krim Magnolia digabung dengan grup Nestlé Filipina, untuk membentuk Magnolia-Nestlé Corporation. Di akhir 1998, saham SMC di perusahaan patungan tersebut diakusisi oleh Netslé. SMC juga keluar dari sektor makanan siap saji dan mengurangi operasi pada bisnis tambak undang. Pada akhir 1997, perusahaan mulai merasakan efek dari krisis ekonomi Asia.