Jabarkan Aliran gen pasca-domestikasi dari Asal-usul anjing domestik

Sejak domestikasi, anjing telah melakukan perjalanan bersama manusia di sebagian besar planet ini, sering terjadi hibridisasi dengan canidae liar setempat. Ini telah menghasilkan pola kompleks pencampuran kuno dan baru ini di antara canidae liar dan domestik.

Beberapa penelitian telah menemukan keragaman yang lebih besar dalam materi genetik anjing dari Asia Timur dan Tengah dibandingkan dengan Eropa dan telah disimpulkan bahwa anjing berasal dari daerah ini, meskipun tidak ada bukti arkeologis yang mendukung kesimpulan tersebut. Salah satu alasan perbedaan ini adalah pencampuran berkelanjutan antara populasi berbeda anjing dan serigala di Dunia Lama serta Baru setidaknya selama 10.000 tahun terakhir, yang telah mengaburkan materi genetik dan telah membingungkan para peneliti dalam menentukan asal-usul anjing. Alasan lain adalah tidak ada populasi serigala modern yang terkait dengan serigala Pleistosen yang pertama kali didomestikasi. Dengan kata lain, kepunahan serigala yang merupakan nenek moyang langsung anjing telah menyulitkan upaya untuk menentukan waktu dan tempat domestikasi anjing.Lihat lebih lanjut:aliran gen pasca-domestikasi Campuran Anjing-Serigala

Ada bukti pencampuran antara populasi anjing dan serigala regional, kecuali pada Dataran Tinggi Tibet dan pada serigala Dunia Baru. Pencampuran ini telah terjadi sepanjang sejarah dan ketika anjing melebar melintasi lanskap. Ada beberapa populasi anjing yang menunjukkan pencampuran baru dengan serigala.

Analisis filogenetik menunjukkan bahwa haplotipe mDNA anjing modern dikelompokkan menjadi empat klad monofiletik dengan dukungan statistik yang kuat, dan ini telah ditunjuk oleh peneliti sebagai klad AD. Studi lain yang termasuk sampel spesimen yang lebih luas telah melaporkan dua klad Asia Timur E-F yang langka dengan dukungan statistik yang lebih lemah. Pada tahun 2009, sebuah penelitian menemukan bahwa haplogrup A, B dan C terdapat dalam 98% anjing dan ditemukan terdistribusi secara universal di seluruh Eurasia, menunjukkan bahwa mereka adalah hasil dari satu peristiwa domestikasi, dan bahwa haplogrup D, E, dan F jarang terjadi dan tampaknya merupakan hasil dari hibridisasi regional dengan serigala lokal pasca domestikasi. Haplogrup A dan B berisi subklad yang kelihatannya merupakan hasil dari hibridisasi dengan serigala pasca-domestikasi, karena dalam setiap haplotipe masing-masing subklad ini adalah hasil dari pasangan serigala betina/anjing jantan.

Haplogrup A: Termasuk 64-65% dari anjing. Haplotipe subllad a2-a6 berasal dari hibridisasi serigala-anjing pasca-domestikasi.

Haplogrup B: Termasuk 22-23% dalam anjing. haplotip subklad b2 berasal dari hibridisasi serigala-anjing pasca-domestikasi.

Haplogrup C: Termasuk 10-12% dalam anjing.

Haplogrup D: Berasal dari hibridisasi serigala-anjing pasca-domestikasi di subklad d1 (Skandinavia) dan d2 (Asia Barat Daya). Haplotipe hibrida subkade Skandinavia utara d1 berasal 480-3.000 tyl dan ditemukan di semua jenis Sami yang terkait: Lapphund Finlandia, Lapphund Swedia, Lapponian Herder, Jamthund, Elkhound Norwegia dan Elkhound Hällefors. Urutan serigala betina yang berkontribusi pada mereka belum cocok di Eurasia dan cabangnya berakar secara filogenetik dalam urutan yang sama dengan Anjing Altai (bukan leluhur langsung). Haplotipe hibrida subklad d2 ditemukan pada 2,6% anjing Asia Barat Daya.

Haplogrup E: Berasal dari hibridisasi serigala-anjing pasca-domestikasi di Asia Timur, (distribusi langka di Asia Tenggara, Korea dan Jepang).

Haplogrup F: Berasal dari hibridisasi serigala-anjing pasca-domestikasi di Jepang. Sebuah penelitian terhadap 600 spesimen anjing hanya menemukan satu anjing yang urutannya mengindikasikan hibridisasi dengan kepunahan serigala Jepang.

Tidak diketahui apakah hibridisasi ini merupakan hasil dari seleksi manusia untuk ciri-ciri fenotipik dari populasi serigala lokal atau hasil dari introgres alami ketika anjing meluas ke seluruh Eurasia.

Pada tahun 2018, sebuah penelitian menemukan sejumlah kecil nenek moyang anjing di 62% spesimen serigala Eurasia, terlihat bahwa hibridisasi telah terjadi di berbagai skala waktu dan bukan hanya baru-baru ini, namun sebaliknya hampir tidak ada pencampuran terdeteksi di Amerika Utara. Ada pembauran spesimen anjing jantan ke dalam serigala, tetapi juga satu hibrida terdeteksi yang merupakan hasil dari serigala jantan bersilangan dengan anjing betina. Serigala mempertahankan perbedaan fenotipnya dari anjing, yang menunjukkan hibridisasi berfrekuensi rendah. Kesimpulannya adalah bahwa fenotipe bukanlah indikasi "kemurnian" dan definisi serigala murni bersifat ambigu. Anjing-anjing liar di seluruh Eurasia menunjukkan perbedaan dari serigala. Studi lain menemukan bahwa gen β-defensin yang bertanggung jawab atas bulu hitam serigala Amerika Utara adalah hasil dari satu pembauran dari anjing di Yukon berumur antara 1.600-7.200 tyl. Studi ini mengusulkan bahwa anjing asli Amerika awal adalah sumbernya.