Jabarkan Karya Tulis dari Oman Fathurrahman

Sebagai akademisi, ia telah menulis sejumlah buku dan artikel, antara lain Menyoal Wahdatul Wujud: kaus Abdurrauf Singkel di Aceh Abad ke-17 (1999), Khazanah naskah: Panduan Koleksi Naskah Indonesia se-Dunia (1999, co-author dengan Henri Chambert-Loir), Tarekat Syatariyah di Minangkabaui (2003), Katalog Naskah Ali Hasjmy Aceh (2007, bersama Munawar Holil), Katalog Naskah dayah Tanoh Abee Aceh Besar (2010, bersama Toru Aoyama dkk.), A Provisional Catalogue of Southeas Asian Kitabs of Sophia University (2010, co-author dengan Midori Kawashima), Ithaf al-Dhaki: Tafsir Wahdatul Wujud bagi Muslim Nusantara (2012), Filologi Indonesia: Teori dan Metode (2015), Shattariyah Silsilah in Aceh, java, and the Lanao area of Mindanao (2016).