Coba jelasin Penemuan dari Lokiarchaeota dong

Dilakukan analisis sampel sedimen dari inti gravitasi yang diambil pada tahun 2010 di lembah retakan di punggung bukit Knipovich di Samudra Arktik, dekat situs ventilasi hidrotermal Kastil Loki. Analisis metagenomik dilakukan dengan menargetkan horison sedimen tertentu, yang sebelumnya terbukti mengandung banyak sekali garis keturunan archaea baru. Hasil urutan genetik tidak berasal dari sel yang diisolasi, seperti yang akan dihasilkan pada analisis konvensional, namun hasil tersebut merupakan kombinasi fragmen genetik. Hal tersebut dikarenakan kepadatan sel yang rendah dalam sedimen. Hasil dari analisis ini yaitu 92% komposit genom lengkap, dengan kelebihan komposit 1,4 kali lipat yang disebut Lokiarchaeum.

Analisis metagenomik ini menentukan keberadaan genom organisme dalam suatu sampel. Namun, organisme itu sendiri tidak dikultur hingga bertahun-tahun kemudian. Pada tahun 2019, suatu kelompok Jepang melaporkan isolasi dan kultivasi strain Lokiarcheota untuk pertama kalinya.

Filum Lokiarchaeota ini diusulkan berdasarkan analisis filogenetik menggunakan satu set gen pengkode protein yang sangat lestari. Nama Lokiarchaeota mengacu pada Loki, dewa pengubah bentuk Norse. Nama ini diambil  dari tempat dimana sampel genom pertama kali berasal, yaitu kompleks ventilasi hidrotermal.  Loki dalam literatur digambarkan sebagai "sosok yang sangat kompleks, membingungkan, dan ambivalen yang telah menjadi katalis dari kontroversi ilmiah yang tak terselesaikan yang tak terhitung jumlahnya". Nama ini diberikan sebagai analogi dari Lokiarchaeota yang menjadi perdebatan tentang asal-usul eukariota.

Sebuah kelompok peneliti Jepang melaporkan tengah melakukan penumbuhan kultur strain Lokiarcheota di laboratorium. Strain yang saat ini dinamakan sebagai Candidatus Prometheoarchaeum syntrophicum strain MK-D1 diamati memiliki hubungan sintrofik dengan dua mikroba pengkonsumsi hidrogen, yaitu bakteri pereduksi sulfat dari genus Halodesulfovibrio dan metanogen dari genus Methanogenium. Organisme strain MK-D1 menghasilkan hidrogen sebagai produk samping metabolik yang kemudian dikonsumsi oleh sintrof simbiosis. Strain ini juga tampaknya mengatur membran eksternal menjadi struktur kompleks dengan menggunakan gen pada MK-D1 yang juga dimiliki oleh eukariota. Asosiasi dengan alphaproteobacteria tidak diamati. Alphaproteobacteria sendiri diperkirakan merupakan organisme yang menurunkan gen mitokondria. Meskipun begitu, keberadaan mitrokondria pada MK-D1 menunjukkan bahwa MK-D1 dan sintrofnya mungkin merepresentasikan contoh simbiosis archaea-bakteria yang mirip dengan yang endosimbiosis mitokondria pada kemunculan eukariota. Penelitian di balik laporan ini kini telah diterbitkan setelah dilakukan penelaahan sejawat.