Jabarkan Sejarah dari Onkogenomika

Era genomika dimulai pada 1990-an, dengan dibuatnya urutan DNA dari banyak organisme. Pada abad ke-21, penyelesaian Proyek Genom Manusia memungkinkan studi genom fungsional dan memeriksa genom tumor. Kanker adalah fokus utama.

Era epigenomika sebagian besar dimulai baru-baru ini, sekitar tahun 2000. Salah satu sumber utama perubahan epigenetik adalah mengubah metilasi pulau-pulau CpG di daerah gen promotor (lihat metilasi DNA pada kanker). Sejumlah metode yang dirancang baru-baru ini dapat menilai status metilasi DNA pada kanker, dibandingkan dengan jaringan normal. Beberapa metode tersebut menilai metilasi CpG yang terletak di berbagai kelas lokus, termasuk pulau-pulau CpG, pantai, dan rak-rak serta promotor, badan gen, dan wilayah antar gen. Kanker juga merupakan fokus utama studi epigenetik.

Akses menuju pengurutan genom kanker yang menyeluruh penting untuk penelitian kanker (atau genom kanker) karena:

Mutasi adalah penyebab langsung kanker dan menentukan fenotipe tumor.

Akses ke sampel jaringan kanker dan normal dari pasien yang sama dan fakta bahwa sebagian besar mutasi kanker mewakili peristiwa somatik, memungkinkan identifikasi mutasi spesifik kanker.

Mutasi kanker bersifat kumulatif dan terkadang terkait dengan stadium penyakit. Metastasis dan resistensi obat dapat dibedakan.

Akses menuju profil metilasi penting untuk penelitian kanker karena:

Epi-driver, bersama dengan Mut-driver, dapat bertindak sebagai penyebab langsung kanker

Epimutasi kanker bersifat kumulatif dan terkadang terkait dengan stadium penyakit