Jabarkan 2000-an dari Cargill

Warren Staley menjadi CEO Cargill dan melanjutkan ekspansi Cargill sehingga berhasil pulih. Pada tahun 2002, Cargill mencatatkan penjualan tahunan lebih dari $50 miliar, dua kali lipat dari kompetitor terdekatnya, Archer Daniels Midland, dan mempekerjakan 97.000 orang di lebih dari 1.000 lokasi produksi di 59 negara. Pada tanggal 1 Juni 2007, Staley digantikan oleh Gregory R. Page. Page kemudian digantikan oleh Dave MacLennan sebagai CEO dan chairman Cargill pada bulan Desember 2013.

Laba triwulanan Cargill berhasil melebihi $1 miliar untuk pertama kalinya pada tanggal 29 Februari 2008 ($1,03 miliar). Peningkatan sebesar 86% didapat dari kelangkaan bahan makanan global serta berkembangnya industri biofuel yang meningkatkan permintaan atas bisnis utama Cargill di bidang komoditas dan teknologi pertanian.

Pada bulan Oktober 2011, Departemen Kehakiman Amerika Serikat mengumumkan bahwa seorang spesialis bioteknologi Cargill telah terbukti bersalah mencuri informasi dari Cargill dan Dow AgroSciences. Kexue Huang, seorang berkebangsaan Tiongkok, terbukti telah mengirimkan rahasia dagang ke Tiongkok.

Pada bulan November 2011, Cargill menyelesaikan akuisisi Provimi dengan harga €1.5 miliar (US$2,1 miliar).

Pada tanggal 1 April 2012, Cargill menyelesaikan akuisisi sebuah pabrik pakan anjing dan kucing di Emporia, Kansas milik American Nutrition.

Pada bulan Desember 2014, Cargill menyelesaikan pembangunan pabrik kakao dengan investasi sebesar $100 juta di Gresik, Jawa Timur.

Pada tahun 2016, Cargill mengumumkan rencananya memindahkan kantor pusat Protein Group dari gedung tua di pusat kota Wichita, Kansas ke sebuah gedung baru di dekat kawasan Kota Tua Wichita. Gedung baru senilai $60 juta ini dibangun di atas lahan gedung yang sebelumnya menjadi markas The Wichita Eagle, yang kemudian dihancurkan.