Jabarkan Teknologi dari Onkogenomika

Pengurutan DNA: Pengurut berbasis pirosekuensing menawarkan metode yang relatif murah untuk menghasilkan data pengurutan.

Hibridisasi Genom Komparatif Berjajar: Teknik ini mengukur perbedaan jumlah salinan DNA antara genom normal dan kanker. Ini menggunakan intensitas fluoresensi dari sampel berlabel fluorescent, yang digabungkan ke probe yang dikenal pada microarray.

Analisis microarray oligonukleotida representasional: Mendeteksi variasi jumlah salinan menggunakan fragmen genomik tercerna-restriksi yang diamplifikasi yang dihibridisasi dengan oligonukleotida manusia, mencapai resolusi antara 30 dan 35 kbit/dtk.

Digital Karyotiping: Mendeteksi variasi jumlah salinan menggunakan tag genomika yang diperoleh melalui enzim restriksi restriksi. Tag ini kemudian ditautkan ke dalam ditag, digabungkan, dikloning, diurutkan, dan dipetakan kembali ke genom referensi untuk mengevaluasi kerapatan tag.

Kromosom Bakteri Artifisial (BAC)-end sequencing (end-sequence profiling): Identifikasi breakpoint kromosom dengan membuat perpustakaan BAC dari genom kanker dan mengurutkan ujung-ujungnya. Klon BAC yang mengandung penyimpangan kromosom memiliki urutan akhir yang tidak memetakan ke daerah yang sama dari genom referensi, sehingga mengidentifikasi breakpoint kromosom.