Jabarkan Geografi dari Nakatonbetsu, Hokkaido

Terletak di bagian selatan subprefektur Sōya, kota ini tidak menghadap langsung ke laut. Kota ini terletak di daerah pegunungan dan dikelilingi oleh gunung-gunung yang menjulang di hampir semua sisinya. 80% wilayah kota adalah hutan.

Gunung: Gunung Poronupuri (841m), Gunung Shirikoma (529m), Gunung Panke (632m), Gunung Pinnesiri (704m).

Sungai: Sungai Tonbetsu, Sungai Hiragauchi, Sungai Peichian, Sungai Aino, Sungai Itchannai.