Jabarkan Efek Hidrofobik dari Pelipatan protein

Meminimilasir rantai samping hidrofobik yang berinteraksi dengan air merupakan kunci dari efek hidrofobik. Efek hidrofobik merupakan fenomena dimana rantai dari protein melipat kedalam bagian inti protein (menjauhi lingkungan berair). Pada lingkungan beriari, molekul air cenderung berkumpul disekitar area yang hidrofobik, sehingga menurunkan entropi. Ketika bagian hidrofobik protein mulai melipat kedalam, air yang sebelumnya berkumpul akan menyebar kemabli sehingga meningkatkan entropi. Banyaknya rantai samping hidrofobik yang masuk ke dalam intin akan berkontribusi secara signifikan terhadap kestabilan protein karena gaya van der Waals yang akan terbentuk

Efek hidrofobik ini hanya akan terbentuk dalam lingkungan yang berair dengan adanya molekul amfipatik yang memiliki gugus hidrofobik yang banyak. Pada protein dengan pola pelipatan globular, asam amino yang hidrofobik cenderung tersusun secara berselang-seling, alih-alih terdistribusi acak atau berkelompok. Namun, protein yang dibuat secara de novo cenderung terdistribusi acak.