Jabarkan Wafat dari Abu Bakar bin Muhammad as-Segaf Gresik

Setelah menghabiskan sisa usianya untuk menyebar ilmu, Habib Abu Bakar wafat di Gresik pada 17 Dzulhijjah 1376 atau 15 Juli 1957 dalam usia 88 tahun atau beberapa sumber lain mengatakan 91 tahun, dimakamkan di kompleks pemakaman Masjid Jami' Gresik. Sebelum wafat, ia sempat menunaikan puasa selama 15 hari.

Untuk mengenang perjuangannya sebagai seorang ulama, tradisi haul untuk memperingati hari kewafatannya selalu diadakan setiap tahun yang biasanya bertepatan pada tanggal 17 Dzulhijjah. Pusat acara di fokuskan di kediamannya di Jalan KH. Zubair dan Masjid Jami' Gresik depan alun-alun. Acara ini selalu menjadi magnet bagi ribuan peziarah yang datang dari banyak penjuru negeri khususnya masyarakat Jawa Timur maupun para tokoh-tokoh politik.