Jabarkan Dugaan dari Michael Rockefeller

Diyakini bahwa Rockefeller tenggelam atau diserang oleh buaya atau hiu. Karena praktik pemburuan kepala dan kanibalisme masih ada di beberapa wilayah Asmat pada tahun 1961, beberapa orang berspekulasi bahwa Rockefeller mungkin telah dibunuh dan dimakan oleh orang-orang Suku Asmat.

Pada tahun 1969, jurnalis Milt Machlin melakukan perjalanan ke Papua untuk menyelidiki hilangnya Rockefeller. Machlin menolak beberapa laporan yang menduga Rockefeller yang masih hidup sebagai tawanan atau sebagai sosok mirip Kurtz di hutan, tetapi Machlin berargumen bahwa bukti tidak langsung mendukung pendapat bahwa dia telah dibunuh. Otsjanep, suatu tempat yang diperkirakan menjadi tempat berlabuh Rockefeller bila berhasil sampai ke pantai, para tetuanya telah dibunuh oleh polisi Nugini Belanda pada tahun 1958, sehingga menjadi alasan bagi orang-orang asmat membalas dendam kepada orang-orang kulit putih. Baik kanibalisme maupun pemburuan kepala di Asmat hanya menjadi bagian dari siklus balas dendam yang menjadi tradisi suku-suku di Papua. Ada kemungkinan bahwa Rockefeller menemukan dirinya sendiri sebagai korban tak sengaja dari motif balas dendam semacam itu yang dimulai oleh polisi Nugini Belanda. Insiden ini dijelaskan dalam "Dance of the Warriors", volume kedua dari seri dokumenter Ring of Fire oleh Blair bersaudara.

Sebuah buku berjudul Rocky Goes West oleh penulis Paul Toohey mengklaim bahwa, pada 1979, ibu Rockefeller menyewa seorang penyelidik swasta untuk pergi ke Papua dan mencoba menyelesaikan misteri hilangnya Rockefeller. Keabsahan cerita telah dipertanyakan, tetapi Toohey mengklaim bahwa penyelidik swasta membarter mesin perahu dengan tengkorak tiga lelaki yang diklaim suku Asmat sebagai satu-satunya lelaki kulit putih yang pernah dibunuh. Penyelidik kembali ke Kota New York dan menyerahkan tengkorak-tengkorak ini kepada keluarga, yakin bahwa salah satunya adalah tengkorak Rockefeller. Jika peristiwa ini benar-benar terjadi, keluarga tidak pernah mengomentarinya. Namun, program History Channel Vanishings melaporkan bahwa ibu Rockefeller membayar hadiah sebesar US$250.000 kepada penyelidik yang menawarkan bukti akhir apaka Michael Rockefeller masih hidup atau mati.

Dalam film dokumenter Keep the River on Your Right, Tobias Schneebaum menyatakan bahwa ia berbicara dengan para kanibal Asmat yang mengaku menemukan Rockefeller di tepi sungai dan memakannya.

Buku 2014 tentang kehilangan Rockefeller

Pada tahun 2014, Carl Hoffman menerbitkan buku berjudul Savage Harvest: A Tale of Cannibals, Colonialism, and Michael Rockefeller's Tragic Quest for Primitive Art, yang membahas tentang penelitian tentang kehilangan Rockefeller secara misterius dan diduga telah mati. Selama beberapa kunjungan ke desa-desa di daerah itu, Hoffman mendengar beberapa cerita tentang orang-orang dari Otsjanep yang membunuh Rockefeller setelah dia berenang ke pantai. Kisah-kisah yang mirip dengan kesaksian yang dikumpulkan pada 1960-an, kebanyakan hanya menjelaskan tentang segelintir orang-orang Asmat yang berdebat dan akhirnya memutuskan untuk membunuh Rockefeller setelah berenang ke pantai, sebagai aksi balas dendam atas insiden 1958 tentang orang-orang Asmat tewas dibunuh oleh polisi Nugini Belanda. Segera setelah pembunuhan Rockefeller, desa-desa terjangkit wabah kolera dan orang-orang desa itu percaya bahwa itu adalah karma karena membunuh Rockefeller. Ketika Hoffman meninggalkan salah satu desa untuk terakhir kalinya, dia menyaksikan seorang pria memerankan adegan pembunuhan, Hoffman berhenti untuk merekamnya. Ketika diterjemahkan, pria itu mengatakan:  "Jangan menceritakan kisah ini kepada orang lain atau desa lain, karena kisah ini hanya untuk kita. Jangan bicara. Jangan berbicara dan menceritakan kisah ini. Saya harap Anda mengingatnya dan Anda harus menyimpan ini untuk kami. Saya harap. Saya harap. Kisah ini hanya untuk anda. Jangan berbicara dengan siapa pun selamanya kepada orang lain atau desa lain. Jika orang bertanya ke Anda, jangan jawab. Jangan bicara dengan mereka, karena cerita ini hanya untuk Anda. Jika Anda mengatakannya kepada mereka, Anda akan mati. Saya khawatir Anda akan mati. Anda akan mati; orang-orangmu akan mati, jika kamu menceritakan kisah ini. Anda menyimpan cerita ini di rumah Anda; untuk dirimu sendiri, aku berharap, selamanya. Selama-lamanya. . . ."   Pada tahun 1978, seorang ahli geologi Kanada yang mengunjungi Asmat bertemu dengan seorang misionaris bernama Otto Konig yang menunjukkan kepadanya arloji dan kacamata Rockefeller dan menegaskan bahwa ia telah dibunuh dan dimakan.