Jabarkan Ekosistem dari Pulau Pamujan Besar

Terumbu karang dapat ditemukan di sekitar Pulau Pamujan Besar pada kedalaman 1–4 m. Akan tetapi, penelitian tahun 2017 menemukan bahwa tutupan karang hidup di perairan pulau ini tergolong buruk (12%) di sebelah utara dan sedang (41%) di sebelah selatan. Penelitian tersebut menemukan 17 genus karang di perairan di sekitar pulau ini di antaranya adalah genus Acropora, Porites, dan Fungia namun berbeda dengan penelitian lain dari tahun 2000 yang menemuk dominasi genus Montipora. Cnidaria zoantharia dari genus Parazoanthus yang cenderung invasif terhadap terumbu karang banyak ditemukan di perairan sebelah utara pulau sementara di sebelah selatan yang banyak ditemukan adalah porifera dari genus Clathria dan tunicata Didemmum molle. Ekosistem mangrove dengan luas sekitar 10,2 hektare dapat ditemukan di pulau ini.