Jabarkan Naik ke tahta dari Muhammad VI dari Granada

Sejak awal masa kekuasan Muhammad V, el Bermejo sudah terlibat dalam upaya konspirasi menjatuhkan sultan untuk bisa memberi jalan bagi Ismail II. Maryam, ibu dari Ismail II, ikut serta dalam persekongkolan ini. Ia memiliki kontrol besar atas kekayaan kerajaan setelah wafatnya Yusuf I. Ia sering kali mengunjungi anak perempuannya yang juga menikah dengan el Bermejo, dan dalam pertemuan tersebut, mereka merencanakan kudeta.

Adanya dukungan finansial besar dari Maryam memungkinkan el Bermejo mengumpulkan 100 pasukan untuk melancarkan kudeta pada 23 Agustus 1359, tanggal bagus yang sudah diperkirakan oleh ahli astrologi. Saat itu malam Ramadhan, mereka menggempur tembok Alhambra, istana yang dibentengi tebal yang melindungi keluarga Nasrid. Sebagian tembok ini sudah mulai rusak dan tidak diperbaiki, sehingga menguntungkan mereka. Dalam pemberontakan ini, mereka berhasil membunuh Menteri Utama, hajib Abu Nu'aym Ridwan, di depan keluarganya sendiri. Rumahnya diruntuhkan dan kekayaannya yang besar dirampas.

Muhammad V yang sedang berada di luar Alhambra, melarikan diri ke kota di timur, Guadix, setelah gagal merebut kembali istana. Para pemberontak menyepakati Ismail II yang masih berusia dua puluhan tahun menjadi Sultan baru.

Ahli sejarah Ibn al-Khatib mencatat bahwa Ismail II adalah pemimpin yang sangat lemah. Ia bergantung kepada perlindungan dan pengaruh el Bermejo. El Bermejo perlahan tapi pasti menjadi penguasa sesungguhnya di balik layar, sementara Muhammad V diasingkan ke Afrika Utara setelah berkali-kali gagal mengembalikan pengaruhnya dari Guadix.

Tapi dengan segera Ismail II pun tak akur dengan el Bermejo. Sebelum Sultan sanggup berbuat apapun untuk menyingkirknnya, el Bermejo mendahului dengan kudeta pada tanggal sekitar 24 Juni atau 13 Juli 1360, tak sampai setahun setelah pengangkatan Ismail II.  Pasukan el Bermejo mengepung menara tempat Sultan berlindung. Ismail II menyerah, dan menawarkan pengasingan diri secara sukarela sebagai bagian perjanjian damai. Tapi karena ketakutan akan dikhianati, el Bermejo mengirim Ismail II ke penjara bawah tanah (tabaq). Di sana ia dibunuh dan dipenggal. Kepalanya dipamerkan ke khalayak ramai. Saat menemukan Qays, adik Ismail, ia melakukan hal serupa. Tubuh mereka dimasukkan ke karung dan juga dilempar ke tengah publik. Nasib sama menghampiri menteri-menteri Ismail II.

Ahli sejarah Francisco Vidal Castro memperkirakan tindakannya ini didasari ketakutan bahwa keluarga kerajaan terdahulu akan digunakan untuk melawannya, sebagaimana dulu Ismail II juga melakukan hal serupa terhadap Muhammad V.

Muhammad VI berkuasa sebagai seorang tiran dan membunuhi semua yang ia curigai bersimpati dengan Muhammad V, dipadukan dengan sikapnya yang buruk. Akibatnya banyak keluarga kerajaan yang melarikan diri ke Morocco atau Castile. Ia membuat perjanjian dengan Sultan Mariniyah di Moroko, Abu Salim Ibrahi, bahwa Abu Salim harus mencegah sekuat tenaga Muhammad V menyeberang kembali ke Semenanjung Ibera. Sebagai balasan, Muhammad VI akan menahan pangeran pemberontak dari Moroko yang meminta suaka di Granada.