Jabarkan Kembali sebagai kepala eksekutif dari Duan Qirui

Karena Feng Yuxiang melakukan kudeta Beijing yang mengakibatkan kekalahan Wu Peifu dan Kelompok Zhili sehingga memaksa mereka untuk mundur ke selatan. Zhang Zhoulin yang menang secara tak terduga malah menunjuk Duan Qirui sebagai Kepala Eksekutif baru negara itu pada 24 November 1924. Pemerintahan baru yang dipimpin Duan dengan enggan diterima oleh Kelompok Zhili karena tanpa memiliki pasukannya sendiri, Duan sekarang dianggap sebagai pilihan yang netral. Selain itu, alih-alih jadi "Presiden" Duan sekarang disebut "Ketua Eksekutif," menyiratkan bahwa posisi itu hanya sementara dan lemah secara politik. Duan meminta Sun Yat-sen dan Kuomintang di selatan untuk memulai lagi perundingan menuju penyatuan Tiongkok kembali. Sun menuntut agar "Perjanjian Tidak Adil" dengan kekuatan asing harus ditolak dan bahwa majelis nasional baru akan dibentuk. Sambil tunduk pada tekanan publik, Duan menjanjikan majelis nasional baru dalam tiga bulan; namun dia tidak bisa secara sepihak membuang "Perjanjian Tidak Adil," karena kekuatan asing telah membuat pengakuan resmi atas rezim Duan bergantung pada penghormatan terhadap perjanjian ini. Sun meninggal pada 12 Maret 1925 dan negosiasi jadi berantakan lagi.

Dengan kekuatan militernya yang berantakan, pemerintah Duan sangat bergantung pada Feng Yuxiang dan Zhang Zuolin. Mengetahui bahwa keduanya tidak rukun, dia diam-diam mencoba untuk bermain satu sisi melawan yang lain. Pada tanggal 18 Maret 1926, sebuah unjuk rasa diadakan untuk melawan pelanggaran yang dilakukan oleh pihak asing terhadap kedaulatan Tiongkok dan insiden baru-baru ini di Tianjin melibatkan kapal perang Jepang. Duan mengirim polisi militer untuk membubarkan para demonstran, dan dalam huru-hara yang terjadi mengakibatkan 47 orang pengunjuk rasa tewas dan lebih dari 200 terluka, termasuk Li Dazhao, salah satu pendiri Partai Komunis Tiongkok. Peristiwa itu kemudian dikenal sebagai Pembantaian 18 Maret. Bulan berikutnya Feng Yuxiang kembali memberontak, kali ini melawan Kelompok Fengtian, dan menggulingkan Duan, yang terpaksa melarikan diri ke Zhang untuk mencari perlindungan. Zhang, yang mulai bosan dengan urusan gandanya, menolak mengembalikannya setelah merebut kembali Beijing. Sebagian besar Kelompok Anhui sudah memihak Zhang. Duan Qirui mengasingkan diri ke Tianjin dan kemudian pindah ke Shanghai di mana dia meninggal pada 2 November 1936.