Jabarkan Reaksi Ali dari Serangan pada rumah Fatimah

Dipercayai secara luas bahwa Ali berbai'at kepada Abu Bakar setelah kematian Fatimah. Ali disebut telah menarik klaimnya bahwa dirinya kalifah yang sah, demi tujuan persatuan umat Islam ketika telah jelas bahwa umat Muslim tidak secara luas mendukung niatnya. Secara khusus, Ali dikatakan telah menolak proposal untuk secara paksa mengejar kekhalifahan, termasuk tawaran dari Abu Sufyan. Beberapa saat setelahnya, mengacu pada kekhalifahan Abu Bakar, sebuah syair mulai beredar di kalangan Bani Hasyim yang diakhiri dengan, "Sungguh kita telah benar-benar diperdaya." Ali melarang penyair untuk membacanya, menambahkan bahwa kesejahteraan Islam lebih dia cintai ketimbang apa pun.

Sangat berbeda dengan ketika Muhammad masih hidup, Ali tidak aktif secara publik di masa kekhalifahan Abu Bakar, Umar, dan Utsman. Perubahan sikap Ali ini dianggap sebagai bentuk bagaimana Ali tidak mengakui kepemimpinan ketiga Khalifah tersebut. Ketika Ali dilaporkan menyarankan kepemimpinan Abu Bakar dan Umar dalam masalah pemerintahan dan keagamaan, saling ketidak-percayaan dan permusuhan antara Ali dengan Abu Bakar dan Umar terekam dengan baik. Salah satu contoh dari perbedaan pandangan mereka dapat dilihat secara jelas ketika proses pemilihan dewan di tahun 644 di mana Ali menolak untuk mengikuti keputusan kedua Khalifah pertama tersebut.

Argumen umum dari pihak Sunni adalah bahwa Ali tidak mungkin untuk melanjutkan hubungannya dengan Umar apabila Umar pernah melakukan serangan ke rumahnya. Tanggapan tipikal dari pihak Syi'ah adalah bahwa Ali telah menyerah dari haknya dan menahan diri demi kebaikan Islam.

Umar tewas dibunuh pada tahun terakhir kekhalifahannya, yang mana kekhalifahannya dilanjutkan oleh Utsman yang dalam pemerintahannya, meningkatkan usaha penyeragaman teks Al-Qur'an melihat banyaknya perbedaan pembacaan ataupun isi dari Al-Qur'an dari kalangan umat muslim yang satu dengan yang lainnya, Utsman pun mengumpulkan 4 orang untuk mengumpulkan ayat-ayat Al-Qur'an dan dikoleksi menjadi satu kitab lalu membakar mushaf-mushaf yang tidak sesuai dengan yang ia kumpulkan. Ini mendapat penentangan keras dari kalangan sejumlah sahabat Muhammad, seperti Ibnu Mas'ud yang yakin bahwa versi ayat-ayat Qur'an yang dipegangnya adalah sesuai seperti yang disampaikan Muhammad kepadanya. Utsman tewas dibunuh ketika pemberontakan yang dilancarkan oleh rakyatnya. Yang mana kekhalifahannya dilanjutkan oleh Ali yang mana ditolak mentah-mentah oleh putri Abu Bakar dan istri favorit Muhammad, Aisyah, yang kemudian melancarkan Perang Jamal. Kubu Aisyah kalah pada perang tersebut dan Aisyah pun dikembalikan ke tempat tinggalnya. Sepupu dari Utsman, Muawiyah kemudian melancarkan Perang yang dikenal sebagai Perang Siffin terhadap Ali, yang berujung pada arbitrase kebuntuan. Ali tewas beberapa saat setelahnya dibunuh oleh Ibnu Muljam yang dianggap melakukannya untuk membalaskan dendam dari pertempuran Nahrawan.