Jabarkan Benfica dari Ederson Moraes

Pada 27 Juni 2015, Ederson bergabung dengan juara Portugal Benfica. Kemudian, pada bulan Juli, ia secara resmi menandatangani kontrak lima tahun dengan klub, dalam sebuah kesepakatan senilai € 500.000, dan menetapkan klausul pembebasan € 45 juta. Rio Ave akan mempertahankan 50% dari hak ekonomi penjaga yang akan datang. Pada musim 2015–16, Ederson dimulai sebagai pilihan kedua di lini untuk tim pertama, yang dibela oleh rekan senegaranya dan Júlio César internasional. Ederson pertama kali memainkan beberapa pertandingan di Segunda Liga dengan tim cadangan dan di Taça da Liga dengan skuad utama, sebelum bermain di Liga Primeira pada 5 Maret 2016 melawan rival lokal Sporting CP, menggantikan Júlio César yang cedera. Benfica memenangkan derbi Lisbon 0-1 dan mengambil tempat pertama Liga Primeira. Dia kemudian akan menjadi bagian dari sebelas kemenangan lagi yang akan menyegel gelar liga ke-35 dan ketiga Benfica secara beruntun. Lima hari kemudian, ia memainkan final Taça da Liga melawan Marítimo, yang Benfica menang 6–2. Selain itu, ia memainkan tiga pertandingan dalam kampanye Liga Champions UEFA, di mana Benfica mencapai babak perempat final. Di musim berikutnya, ia memenangkan treble Primeira Liga, Taça de Portugal dan Supertaça Cândido de Oliveira.