Coba jelasin Karier internasional dari Axel Werner dong

Pada tahun 2013, Werner dipanggil oleh timnas Argentina U-17 untuk membela timnas di ajang Piala Dunia U-17 FIFA 2013, sebagai pelapis untuk Augusto Batalla. Ia hanya tampil dalam satu pertandingan di turnamen tersebut, pada saat timnya mengalami kekalahan 1–4 atas Swedia pada 8 November.

Pada 1 Juli 2016, Werner dipanggil untuk bermain di Olimpiade Musim Panas sekaligus menggantikan tempat Batalla, yang tidak diperbolehkan oleh klubnya, River Plate untuk membela tim nasional yang bermain di ajang Olimpiade.