Tolong jelaskan mengenai Sumber famili protein dari Famili protein

Terdapat banyak basis data biologi yang mencatat contoh famili protein dan mengizinkan pengguna untuk mengidentifikasi jika protein yang baru diidentifikasi termasuk famili yang diketahui. Berikut beberapa contohnya:

Pfam - Basis data penyebarisan dan HMM famili protein,

PROSITE - Basis data domain, famili, dan situs fungsional protein,

PIRSF - Sistem Klasifikasi Superfamili,

PASS2 - Penyebarisan Protein sebagai Superfamili Struktural v2 - PASS2@NCBS,

SUPERFAMILY - Perpustakaan HMM yang merepresentasikan superfamili dan basis data (superfamili dan famili) anotasi untuk semua organisme tersekuensi secara penuh,

SCOP dan CATH - klasifikasi struktur protein ke dalam superfamili, famili, dan domain.

Secara serupa, terdapat banyak algoritme pencarian basis data, sebagai contoh:

BLAST - Pencarian kesamaan urutan DNA,

BLASTp - Pencarian kesamaan urutan protain,

OrthoFinder  - Metode cepat, berskala, dan akurat untuk penggugusan protein ke dalam famili (ortogrup).