Coba jelasin Plot dari Isle of Dogs dong

Di masa mendatang di Jepang, virus flu anjing menyebar ke seluruh populasi anjing. Wali kota Megasaki City yang baru dan diktator, Kobayashi (Kunichi Nomura), menandatangani surat ketetapan membuang semua anjing ke Pulau Sampah meskipun seorang ilmuwan bernama Profesor Watanabe (Akira Ito) bersikeras bahwa ia hampir menemukan obatnya. Anjing pertama yang dibuang adalah Spots (Liev Schreiber), anjing milik keponakan Wali kota Kobayashi yang yatim piatu bernama Atari Kobayashi (Koyu Rankin).

Enam bulan kemudian, Atari mencuri pesawat dan terbang ke Pulau Sampah dengan harapan menemukan Spots. Setelah pendaratan darurat, ia diselamatkan oleh lima anjing yang dipimpin oleh Chief (Bryan Cranston). Mereka memutuskan untuk membantu Atari menemukan Spots meskipun Chief, mantan anjing pengembara, tidak ingin bersekutu dengan manusia. Ketika mereka percaya bahwa Spots meninggal beberapa bulan sebelumnya saat kandangnya gagal dibuka setelah tiba di Pulau Sampah, mereka segera mengetahui bahwa terjadi kekacauan di sana dan bahwa Spots mungkin masih hidup. Setelah berkelahi dengan tim penyelamat yang dikirim oleh Wali kota Kobayashi untuk menjemput Atari dan atas desakan seekor anjing betina bernama Nutmeg (Scarlett Johansson), Chief terpaksa memutuskan untuk menemani Atari beserta anjing lainnya untuk mencari Spots. Mereka mencari nasihat dari dua anjing bijak, Jupiter (F. Murray Abraham) dan Oracle (Tilda Swinton), yang memberitahu mereka tentang suku kanibal anjing yang dikabarkan berada di bagian pulau yang terpencil.

Sementara itu, Profesor Watanabe menemukan obat untuk menyembuhkan flu anjing, tetapi ia diracuni oleh Wali kota Kobayashi. Mahasiswa pertukaran Amerika Serkat, Tracy Walker (Greta Gerwig), mencurigai adanya konspirasi dan mulai menyelidiki kasus ini. Pada akhirnya, Tracy berhadapan dengan asisten ilmuwan Yoko Ono (Yoko Ono), mantan rekan Profesor Watanabe, yang membenarkan kecurigaan Tracy dan memberikan dosis terakhir obat yang tersisa kepada Tracy.

Dalam perjalanan, Atari dan Chief berpisah dari anjing lainnya. Atari memandikan Chief, yang memberitahu bahwa bulunya benar-benar putih dengan bintik-bintik hitam, tetapi Chief menjadi kotor selama hidupnya sebagai anjing pengembara. Memperhatikan kesamaan antara Chief dan Spots, Atari menyadari bahwa Chief adalah jenis anjing yang mirip dengan Spots yang sangat langka. Chief mengingat kembali kehidupnya sebagai bagian dari sampah di mana semua saudaranya meninggal dan hanya satu saudaranya yang masih hidup. Chief mulai berubah dan menjalin ikatan dengan Atari ketika mereka melanjutkan perjalanan mereka. Mereka bergabung kembali dengan anjing lainnya yang sempat berpisah dan menemukan suku kanibal anjing, tetapi mereka disergap oleh tim penyelamat Wali kota Kobayashi sekali lagi. Spots datang dengan pasukan kecil anjing yang menangkis tim penyelamat tersebut. Spots mengungkapkan bahwa ia diselamatkan oleh suku kanibal setelah tiba di Pulau Sampah dan kemudian menjadi pemimpin mereka. Spots juga menegaskan bahwa Chief adalah saudaranya dan meminta untuk mengalihkan tugas perlindungannya terhadap Atari kepada Chief di mana keduanya setuju.

Seekor burung hantu tiba dan membawa kabar bahwa Wali kota Kobayashi berencana untuk memerintahkan pemusnahan total semua anjing di Pulau Sampah pada pemilihan ulang yang akan segera terjadi. Atari dan semua anjing di Pulau Sampah memutuskan untuk kembali ke Megasaki City untuk menghentikan Wali kota Kobayashi. Pada acara pemilihan Wali kota Kobayashi, ia bersiap untuk memberikan perintah, tetapi Tracy menyebarkan bukti tentang korupsi yang dilakukan oleh Wali kota Kobayashi dan keberadaan obat flu anjing. Atari dan anjing-anjing juga datang dan memastikan obatnya berhasil. Wali kota Kobayashi mulai berubah, tetapi tangan kanannya, Mayor Domo (Akira Takayama), bersikeras melakukan pemusnahan semua anjing. Pertarungan pun terjadi di mana tombol "eksekusi" ditekan, tetapi racun itu menjadi bumerang bagi para penyerang berkat teman hacker Tracy.

Dalam pertarungan, Atari dan Spots terluka parah. Salah satu ginjal Atari gagal berfungsi, tetapi Wali kota Kobayashi, yang mengakui kesalahannya, menyumbangkan ginjal miliknya untuk menyelamatkan Atari. Dengan undang-undang pemilihan wali kota, Megasaki City dipimpin oleh Atari dan ia memutuskan bahwa anjing diizinkan untuk bergabung ke dalam masyarakat. Tracy dan Atari menjadi pasangan kekasih, lalu Chief bersatu kembali dengan Nutmeg dan menjadi penjaga Atari. Meskipun ia diduga tewas, Spots pulih dari luka-lukanya dan diam-diam membesarkan anak-anaknya di bawah rumah keluarga Kobayashi.