Jabarkan Masa tua dari He Qi

Karena He Qi memperoleh ketenaran dari keberhasilannya menaklukkan suku-suku setempat yang resah di kawasan Jiangdong, ia mulai ikut serta dalam beberapa pertempuran melawan rival Sun Quan, Cao Cao, panglima perang yang menguasai pemerintahan pusat Dinasti Han Timur pada tahun-tahun terakhir dinasti tersebut. Pada tahun 215, He Qi bertempur di Pertempuran Sungai Xiaoyao ketika Sun Quan memimpin pasukannya menyerang Hefei, yang memiliki pertahanan kuat dan dipimpin oleh jenderal terkenal Cao Cao, Zhang Liao, dan beberapa jenderal lainnya. Pasukan Sun Quan menderita kekalahan telak melawan Zhang Liao dan koleganya di pertempuran tersebut dan nyaris tertangkap ketika melarikan diri. Dalam pertempuran itu, salah satu perwira Sun Quan, Xu Sheng, kehilangan tombak panjangnya saat bertempur. He Qi kebetulan menemukan tombak Xu Sheng dan mengembalikannya.

Pada tahun 216, Cao Cao memberikan pada You Tu, seorang pemimpin lokal di Kekomandanan Poyang (鄱陽郡), segel kekuasaan dan menyuruhnya memulai sebuah pemberontakan. Tiga wilayah di dalam Kekomandanan Poyang menuruti panggilan pemberontakan You Tu. Menanggapinya, Sun Quan memerintahkan He Qi dan Lu Xun memadamkan pemberontakan tersebut. Mereka berhasil melakukannya dan membunuh beberapa ribu pemberontak. Setelah itu, He Qi tinggal di perbatasan di sepanjang Sungai Yangtze di antara wilayah Sun Quan dan Cao Cao untuk berjaga-jaga terhadap serangan musuh.

Setelah berakhirnya Dinasti Han Timur pada tahun 220, He Qi terus mengabdi pada Sun Quan, yang akhirnya menjadi penguasa otonom di negaranya, yaitu Wu Timur di China selatan. Di pihak lain, anak Cao Cao, Cao Pi, merebut tahta dari kaisar Han terakhir dan mendirikan negara Cao Wei di China utara. Antara tahun 222 dan 223, pasukan Wu dan Wei berhadapan dalam Pertempuran Dongkou. Pasukan Wei yang dipimpin oleh Cao Xiu mengalahkan angkatan laut Wu yang dipimpin oleh Lü Fan yang baru saja terkena bencana alam dan kehilangan beberapa kapal. Ketika pasukan Wu mengkhawatirkan datangnya serangan Cao Xiu, bala bantuan Wu yang dipimpin oleh He Qi tiba di Dongkou. Karena pasukan He Qi tiba terlambat, armada lautnya tidak terkena badai yang menghancurkan banyak kapal Lü Fan. Selain itu, He Qi yang terkenal sering boros mendekorasi kapalnya dan memperlengkapi pasukannya dengan persenjataan terbaik. Cao Xiu terkejut ketika melihat tampilan mewah armada He Qi yang bersinar-sinar. Yakin bahwa armada Wu lebih kuat, maka Cao Xiu memerintahkan pasukan Wei mundur, hal ini menyelamatkan Lü Fan dan sisa pasukannya dari kebinasaan. Ketika Sun Quan mendengar perkara ini, ia mempromosikan He Qi ke jabatan Jenderal yang Menjaga Belakang (後將軍).

Pada bulan Juni tahun 223, Jin Zong (晋宗), seorang perwira militer Wu, membelot ke Wei dan merebut kendali Wilayah Qichun (蕲春縣) melalui suatu pemberontakan. Sun Quan memerintahkan He Qi dan Hu Zong (胡綜) untuk memimpin pasukan, bersama dengan Mi Fang, Xianyu Dan (鮮于丹) dan Liu Shao (劉邵) sebagai bawahan mereka, untuk menyerang dan merebut kembali Wilayah Qichun. Namun, mereka memutuskan untuk mundur karena cuaca yang sangat panas dan gagal merebut Wilayah Qichun. Setelah itu, Jin Zong lengah, maka pasukan Wu mengambil kesempatan tersebut untuk melancarkan serangan tiba-tiba. Pada pertempuran tersebut, He Qi menangkap Jin Zong hidup-hidup dan merebut kembali Wilayah Qichun. He Qi kemudian meniggal karena sakit pada tahun 227.