Jabarkan Shinji Ikari Raising Project dari Gendo Ikari

Dalam adaptasi manga dari video game, Gendo ditampilkan dalam kesan humor, tidak seperti versi anime-nya. Kejenakaannya, sering membuat Shinji malu, sering berakhir dengan dia dipukul oleh Yui. Selama pemadaman di NERV, ia menyorotkan obornya untuk menakut-nakuti, yang segera membuatnya mendapat pukulan keras dari Yui. Pada lain waktu, ketika Gendo membaca koran, Yui bertanya kepadanya apakah dia menyampaikan Shinji apa yang diperintahkan Yui pada Gendo. Respons Gendo adalah berkeringat dan gemetar dengan gugup dan adegan berakhir dengan efek suara Yui memukul Gendo. Gendo juga ditampilkan menjadi sosok yang agak karismatik di sini, memindahkan beberapa anggota staf NERV (terutama yang laki-laki) untuk membantu dengan rencana "mengayuh untuk daya".

Selain itu, "persaingan ayah-anak" yang dirasakan antara Gendo dan Shinji dalam kepenggemaran Evangelion diparodikan di sini, karena keduanya memutuskan untuk "bersaing" untuk melihat siapa yang bisa mengayuh lebih cepat. Kontes ini sebenarnya adalah cara untuk menghasilkan listrik untuk markas NERV, yang sedang terkena pemadaman. Insiden ini juga memberi penghormatan kepada anime aslinya, di mana Gendo membantu dalam peluncuran manual EVA melawan Malaikat yang menyerang. Baik Fuyutsuki dan Rei ditampilkan berbagi pekerjaan sebelum keluar karena kelelahan.