Jabarkan Menulis dan karya dari Ibn Warraq

Pada masa perkara Rushdie, Ibn Warraq memperhatikan bahwa sering ada serangan kritis terhadap agama Kristen dan Yahudi, tetapi tidak pernah pada Islam, yang - menurut Warraq - mencoba mengendalikan setiap aspek kehidupan individu, memberikan "tidak ada ruang untuk berpikir mandiri." Dia mengharapkan berbagai intelektual di Barat untuk membela Rushdie dan nilai-nilai seperti kebebasan berekspresi, tetapi "bukannya membela Rushdie dan haknya atas kebebasan berekspresi, mereka mengutuknya; mereka menyalahkan korban." Karena itu, Warraq mulai menulis untuk Free Enquiry Magazine, publikasi humanis sekuler Amerika, tentang topik-topik seperti Mengapa Saya Bukan Muslim. "Kedaulatan dalam Islam," kata Warraq dalam sebuah wawancara tahun 2006, "terletak pada Tuhan, sedangkan dalam hak asasi manusia, dalam demokrasi, misalnya, kedaulatan terletak pada manusia. Dan, hak asasi manusia, deklarasi universal hak asasi manusia, pada beberapa kesempatan, berbenturan dengan berbagai aspek hukum Islam, terutama dalam perlakuan terhadap perempuan dan non-Muslim. " Selain itu, Warraq menyatakan keprihatinan tentang kebebasan beragama: "Dalam Islam, Anda tidak memiliki hak untuk meninggalkan agama Anda. Anda terlahir sebagai seorang Muslim dan itu saja. Kemurtadan, artinya, meninggalkan agama Anda dalam Islam, Dapat dihukum mati."

Ibn Warraq terus menulis dengan beberapa karya memeriksa historiografi dari Al-Qur'an dan Muhammad. Buku-buku lain membahas topik nilai-nilai humanis sekuler di kalangan umat Islam. Dalam The Origins of The Quran: Esai Klasik tentang Kitab Suci Islam, Ibn Warraq memasukkan beberapa penelitian Theodor Nöldeke.

Pada 2005, Warraq menghabiskan beberapa bulan bekerja dengan Christoph Luxenberg, yang menulis tentang penafsiran Sura vs. Arab tentang ayat Alquran.

Pada Februari 2006, ia berpartisipasi dengan beberapa spesialis lain di Konferensi Peringatan Pim Fortuyn tentang Islam di Den Haag (17–19 Februari 2006).

Pada bulan Maret 2006, sebuah surat yang ia tandatangani bersama berjudul MANIFESTO: Bersama-sama menghadapi totaliterisme baru dengan sebelas orang lainnya (terutama Salman Rushdie) diterbitkan sebagai tanggapan atas protes keras dan mematikan di dunia Islam di sekitar kontroversi kartun Jyllands-Posten Muhammad.

Meskipun ia tidak menganut agama tertentu, ia memiliki pendapat yang lebih tinggi tentang humanisme daripada Islam. Dia adalah pendiri Lembaga Sekularisasi Masyarakat Islam (ISIS). Terlepas dari kritiknya terhadap Islam, ia tidak berpandangan bahwa Islam tidak dapat direformasi; dan dia bekerja dengan Muslim liberal di kelompoknya. Dia menggambarkan dirinya sebagai seorang ateis atau seorang agnostik.

Tak lama setelah 9/11, penulis pidato George W. Bush David Frum, yang dikenal karena menciptakan istilah "Axis of Evil", menjamu Ibn Warraq pada jam makan siang satu setengah jam di Gedung Putih.

Karya-karya op-ed Warraq telah muncul di The Wall Street Journal dan The Guardian di London, dan ia telah berbicara kepada badan-badan pemerintahan di seluruh dunia, termasuk PBB di Jenewa.

Pada tahun 2007, ia berpartisipasi dalam KTT Islam Sekuler St. Petersburg, Florida bersama dengan para pemikir dan reformasi Muslim lainnya seperti Ayaan Hirsi Ali, Wafa Sultan, dan Irshad Manji. Kelompok ini merilis Deklarasi St Petersburg, yang mendesak pemerintah dunia untuk, antara lain, menolak hukum Syariah, pengadilan fatwa, pemerintahan ulama, dan agama yang disetujui negara dalam segala bentuknya; dan untuk menentang semua hukuman karena penistaan dan penyesatan, yang mereka yakini melanggar Pasal 18 Deklarasi Universal Hak Asasi Manusia.

Pada Oktober 2007, Warraq berpartisipasi dalam debat IQ2 di London dengan Douglas Murray, David Aaronovitch, Tariq Ramadan, William Dalrymple, dan Charles Glass.