Jabarkan Kematian dan peninggalan dari Mikhael Komnenos Doukas

Mikhael sendiri tidak hidup lebih lama dari keberhasilan ini: pada akhir tahun 1214 atau 1215, ia dibunuh dalam tidurnya di Velegrada oleh seorang pelayan bernama Rhomaios. Menurut sejarahwan Ioannes V. Denda, "apakah dia dipekerjakan untuk melakukan tindakan itu, dan, jika demikian, oleh siapa tidak diketahui". Karena satu-satunya anak laki-lakinya yang masih hidup adalah putra tidak sah dan masih bocah, Mikhael digantikan oleh saudara tirinya, Theodoros. Theodoros telah melayani Nicea, dan Mikhael telah meminta Laskaris untuk mengirimnya ke Epirus karena posisi putranya sendiri lemah. Dalam acara tersebut, Theodoros tidak hanya mengesampingkan Mikhael II muda, tetapi menurut hagiografi St. Theodora dari Arta, mengirimnya dan ibundanya untuk diasingkan di Peloponnesos selama masa pemerintahannya. Theodoros terbukti penguasa yang kuat dan suka perang, sangat memperluas negara Epirus dan menangkap Tesalonika pada tahun 1224, di mana ia dimahkotai sebagai kaisar. Bangkitnya Kekaisaran Tesalonika Theodoros berakhir tiba-tiba dengan kekalahan dan ditangkap oleh orang-orang Bulgaria di Pertempuran Klokotnitsa pada tahun 1230, yang memungkinkan Mikhael II untuk kembali ke Epirus dan memulihkan domain ayahandanya.

Mikhael meletakkan dasar-dasar negara Epirus, dan memulai dinasti, Komnenoi-Doukai, yang akan memerintah Epirus sampai 1318, ketika wangsa Orsini Italia mengambil alih. Anggota keluarga juga memerintah atas Thessalia, dan untuk sementara menggugat gelar kekaisaran sebagai penguasa Tesalonika dari tahun 1224 sampai penangkapannya oleh orang-orang Nicea pada tahun 1246. Tampaknya selama masa hidupnya, Mikhael adalah seorang penguasa populer dengan rakyatnya; uskup metropolit kontemporer Nafpaktos, Ioannis Apokafkos, memuji Mikhael sebagai "Noah baru", di sisi siapa para pengungsi kataklisme Latin menemukan tempat perlindungan. Uskup Agung kontemporer Ohrid Dimitrios Chomatinos bahkan memperkirakan bahwa setidaknya setengah, jika tidak sebagian besar, dari mereka yang melarikan diri dari Konstantinopel, menemukan perlindungan di Epirus, termasuk banyak aristokrasi senator. Masih lebih banyak berasal dari Peloponnesos, melarikan diri dari kekuasaan Latin di sana. Apokafkos juga memuji dia atas pembauran dan refortifikasi kota Ioannina, di mana banyak dari para pengungsi itu menetap; kota kemudian mulai memilih Malaikat Tertinggi Mikhael sebagai santo pelindungnya untuk menghormatinya.