Jabarkan Imam Besar dari Yonatan Apfus

Yonatan rupanya menggunakan masa damai ini untuk keuntungan yang baik, karena ia segera memiliki kekuatan besar. Peristiwa eksternal penting membawa buah desain kaum Makabe. Hubungan Demetrios I Soter dengan Attalus II Philadelphus dari Pergamum (memerintah 159 - 138 SM), Ptolemaios VI dari Mesir (memerintah 163 - 145 SM) dan penguasa bersamanya, Kleopatra II dari Mesir, memburuk.

Mereka mendukung saingannya penuntut tahta, Alexander (Alexandros) Balas, yang mengaku putra Antiokhos IV Epifanes dan sepupu pertama dari Demetrios.

Demetrios sekarang dipaksa untuk memanggil pulang garnisun Yudea, kecuali yang di benteng Akra di Yerusalem dan di Beth-zur. Ia juga membuat tawaran untuk loyalitas Yonatan, yang diizinkannya untuk merekrut tentara dan mengambil para sandera yang ditahan di benteng Akra. Yonatan dengan senang hati menerima ketentuan ini dan bertempat tinggal di Yerusalem pada tahun 153 SM. Dia segera mulai membentengi kota itu.

Alexander Balas juga menghubungi Yonatan bahkan lebih menguntungkan. Termasuk pengangkatan resmi sebagai Imam Besar di Yerusalem. Yonatan menarik dukungan dari Demetrios dan mendeklarasikan kesetiaan kepada Alexander. Yonatan adalah anggota pertama dari dinastinya yang mendapatkan penunjukan sebagai "Imam Besar". Gelar itu tidak hanya nominal. Yonatan resmi menjadi pemimpin umatnya dan kaum Helenistik tidak bisa lagi menyerangnya tanpa konsekuensi berat. Pada Hari Raya Pondok Daun 153 SM, Yonatan mengenakan pakaian Imam Besar dan menjalankan tugas resmi untuk pertama kalinya. Tidak diketahui siapa yang digantikan oleh Yonatan sebagai Imam besar, meskipun beberapa ahli menyarankan bahwa ini adalah Guru Kebenaran, yang kemudian menjadi pendiri Eseni. Dalam teori ini, Yonatan dianggap "Imam yang Jahat".

Jonathan memilih berpihak pada  Alexander Balas, karena tidak percaya kepada Demetrius, yang dalam surat keduanya membuat janji-janji bahwa sukar ditepati dan mengakui hak-hak istimewa yang hampir mustahil. Demetrios kemudian kehilangan takhtanya dan nyawanya pada tahun 150 SM. Alexander Balas menang dan menjadi satu-satunya penguasa Kekaisaran Seleukia. Ia diberi kehormatan lebih dalam bentuk pernikahan dengan Cleopatra Thea, putri sekutu-sekutunya Ptolemaios VI dan Kleopatra II.

Pernikahan berlangsung di Ptolemais di hadapan Ptolemaios VI. Yonatan diundang tapi tiba setelah upacara pernikahan saat perayaan sedang berlangsung. Ia muncul dengan hadiah bagi kedua raja, dan diizinkan untuk duduk sederajat di antara mereka; Balas bahkan mengenakan jubah kerajaannya sendiri padanya dan juga memberikan kepadanya kehormatan yang tinggi. Dia tidak mau mendengarkan pihak Helenistik yang masih menuduh Jonathan, tapi mengangkat Jonathan sebagai strategos dan "meridarkh" (yaitu, gubernur sipil di provinsi; rincian ini tidak ditemukan dalam catatan Yosefus), dan mengantarkannya kembali dengan kehormatan ke Yerusalem.