Jabarkan Kehidupan awal dari Francisco Borgia

Ia dilahirkan di Kadipaten Gandía, Valencia, pada tanggal 28 Oktober 1510. Ayahandanya adalah Juan Borgia, Adipati ke-3 Gandía, putra Giovanni Borgia, putra Paus Alexander VI (Rodrigo Borgia). Ibundanya Juana, putri Alonso d'Aragón, Uskup Agung Zaragoza, yang merupakan putra tidak sah Raja Ferrando II d'Aragón. Saudaranya, Tomás de Borja y Castro, juga menjadi imam, menjadi Uskup Málaga, dan kemudian Uskup Agung Zaragoza.

Meskipun sebagai seorang anak ia sangat saleh dan ingin menjadi seorang biarawan, keluarganya mengirimnya ke istana Karl V, Kaisar Romawi Suci (yang juga Raja Carlos I dari Spanyol), di mana ia disambut sebagai seorang kerabat. Dia membedakan dirinya di sana, menemani Kaisar dalam beberapa kampanye.