Jabarkan Selayang pandang dari Gendo Ikari

Di NERV, Gendo bertanggung jawab atas penelitian yang dilakukan dalam Proyek Evangelion dan Proyek Instrumentalitas Manusia. Dia adalah ayah dari Children Ketiga, Shinji Ikari. Di awal seri, hanya Rei Ayanami yang dapat berinteraksi dengannya.

Gendo adalah seorang ilmuwan dan politisi brilian yang bekerja dengan rajin untuk organisasinya. Namun, dia adalah seorang yang tidak berperasaan sekaligus seorang ayah yang dingin dan jauh terhadap putranya. Dia juga tidak ragu untuk menggunakan dan menyingkirkan orang lain untuk mencapai tujuannya:

"Gendo adalah tipe orang yang dapat melihat dan memikirkan kesejahteraan organisasi secara keseluruhan. Dengan kata lain, dia akan melakukan apa saja untuk dapat berhasil. Dia mengambil tindakan drastis dan ekstrem, dengan cara bersih maupun kotor, dengan menjadi kawan maupun lawan, untuk mencapai tujuannya sendiri. Dalam beberapa kejahatannya, dia tidak peduli dengan Shinji."

Pernyataan terakhirnya di The End of Evangelion mengungkapkan penyesalannya serta motif atas perilakunya yang kejam. Dia bermaksud menggunakan Third Impact untuk menjadi seperti dewa dan menciptakan masa depan yang lebih baik bagi kemanusiaan bersama dengan istrinya Yui Ikari, yang dia maksudkan untuk bergabung kembali pada akhir Instrumentalitas. Namun, ketika Rei menentangnya, ia menyadari bahwa upayanya sia-sia dan bahwa ia mengabaikan keinginan Yui yang sebenarnya. Dia bermaksud membawa masa depan yang lebih cerah bagi putra mereka, Shinji, yang telah dikorbankan Gendo untuk membawa Yui kembali. Intinya, impian dan pendirian Yui ia dilanggar untuk membangkitkan Yui kembali. Dia juga takut kasihnya kepada Shinji malah akan menyakiti Shinji, dan karenanya menjauhkan diri dari Shinji. Tak lama kemudian, dalam urutan sureal, Unit 01 ditampilkan memegang Gendo menggunakan tangannya sebelum memenggal kepala Gendo. Kamera kemudian menunjukkan bagian bawah tubuh Gendo masih berdiri sedangkan bagian atasnya tubuhnya terputus.

Dalam waralaba film Rebuild of Evangelion, peran dan tindakannya secara keseluruhan (setidaknya terhadap film pertamanya) tetap konsisten.