Jabarkan Pemunculan dari Misato Katsuragi

Di awal anime, Misato adalah  dari Departemen Operasi Taktis Nerv. Sebagian besar keputusan penting dalam pertempuran antara Eva melawan Malaikat dibuat di bawah komandonya. Dia mengambil tanggung jawab penuh atas hasil yang mungkin terjadi. Dia juga mengasumsikan perwalian Shinji Ikari pada saat Shinji tiba di Tokyo-3, begitu juga dengan Asuka di kemudian waktu. Kepribadiannya terlihat sangat santai dan ceroboh, tetapi sebagai seseorang yang profesional dia terbukti memiliki karakter kepemimpinan yang hebat serta keuletan. Kesetiaannya kepada Nerv tampaknya tak terhancurkan, meskipun dia tidak mengetahui niat Nerv yang sebenarnya, selain tujuan utamanya dalam menghancurkan Malaikat. Setelah keberhasilannya dalam "Operasi Yashima", operasi militer sangat mahal yang direncanakan olehnya yang salah satu rencananya adalah menggunakan sistem energi seluruh Jepang untuk menghancurkan Malaikat kelima, Ramiel, dia dipromosikan menjadi  .

Misato menjalin hubungan dengan Ritsuko Akagi dan pacar Ryoji Kaji pada saat mereka bertiga masih kuliah. Seiring jalannya cerita, beberapa rincian masa lalu Misato terungkap. Dia berada di Antartika pada saat Second Impact untuk menemani ayahnya, Dr. Katsuragi, pemimpin ekspedisi Katsuragi. Dr. Katsuragi berusaha melindungi Misato dengan menempatkannya dalam kapsul pelindung (menyerupai Entry Plug) tepat sebelum dirinya sendiri terbunuh. Kapsul itu menyelamatkan hidup Misato, tetapi lukanya meninggalkan bekas luka besar di dadanya. Dua tahun setelah Second Impact, Misato terlihat berada di kapal yang membawa Kozo Fuyutsuki dan Gendo Ikari ke reruntuhan Antartika. Setelah menemui Misato di kamarnya, Fuyutsuki diberitahu bahwa Misato tidak pernah berbicara sejak Second Impact. Kebisuan selektifnya hilang saat dia mulai kuliah, dan sejak saat itu dia mulai menjadi lebih sosial dan banyak bicara. Ritsuko menyebutkan di sanalah Misato menebus waktunya yang telah terbuang.

Pekerjaan Misato sebelum bekerja di Nerv tidak diceritakan, tetapi di manga, pekerjaan terakhirnya adalah terlibat dalam eksperimen genetik pada hewan, dan Pen Pen adalah hasil dari salah satu eksperimen tersebut. Dia memilih menjaga Pen Pen sebagai hewan peliharaan daripada membiarkannya disuntik mati, dan mengkonversi kulkas menjadi tempat tidur hangat baginya. Hubungannya dengan Kaji tampaknya agak rumit, melibatkan perasaan cinta, nafsu, kecemburuan, dan mengasosiasikannya dengan ayahnya, terlepas dari cinta segitiga aneh yang melibatkan Ritsuko. Dalam jalannya cerita, Misato menemukan bahwa Kaji, selain bekerja untuk Nerv, diam-diam juga bekerja untuk Agen Intelijen Jepang. Misato mengancam akan membunuhnya jika dia tidak menghentikan rencana sabotasenya. Namun berkat Kaji juga, Misato mulai menyadari apa rencana rahasia Nerv dan Seele, terutama Rencana Pelengkapan Umat Manusia.