Jabarkan Kontra-reformasi dari Reformasi Protestan di Swiss

Sementara Gereja resmi tetap pasif selama awal Reformasi, Provinsi-provinsi Katolik Swiss mengambil langkah-langkah awal dalam mempertahankan gerakan baru. Mereka mengambil kekuasaan hukum dan keuangan atas para klerus, menetapkan aturan-aturan perilaku yang tegas bagi para imam, melarang pergundikan, dan mereservasi hak menominasikan para imam dalam tempat pertama, yang sebelumnya ditugaskan oleh keuskupan. Mereka juga melarang pencetakan, pendistribusian, dan kepemilikan traktat-traktat reformis; dan melarang kajian Ibrani, serta Yunani (dalam mengakhiri penelitian independen atas sumber-sumber Alkitab). Secara keseluruhan, langkah-langkah ini berhasil, yang tidak hanya mencegah penyebaran Reformasi ke wilayah Katolik, tetapi juga membuat Gereja bergantung pada negara dan secara umum memperkuat kekuatan otoritas sipil.

Provinsi-provinsi Katolik yang mempertahankan dominasi terhadap Gereja Katolik, setelah Konsili Trente (1545 - 1563), meskipun mereka telah menerima posisi tersebut. Mereka menentang rencana Carolus Borromeus dalam pembentukan keuskupan baru di Swiss tengah. Namun, mereka ikut serta dalam program pendidikan Trente. Pada tahun 1574, sekolah Yesuit pertama didirikan di Lucerne. Pada tahun 1579, sebuah universitas Katolik Collegio helvetico bagi para imam Swiss, didirikan di Milan. Kemudian pada tahun 1586, sebuah duta paus dibuka di Lucerne. Capuchin juga terpanggil; sebuah biara kapusin didirikan pada tahun 1581 di Altdorf.

Sejalan dengan upaya-upaya mereformasi Gereja Katolik ini, provinsi-provinsi Katolik melanjutkan upaya peng-Kristen-an daerah-daerah yang telah beralih menjadi Protestan. Selain perubahan ulang di wilayah-wilayah umum, provinsi-provinsi Katolik di awal tahun 1560 percobaan pembatalan Reformasi di Glarus, di mana pemeluk Katolik merupakan minoritas.

Lima provinsi Katolik membentuk sebuah aliansi militer dengan Paus dan Adipati Savoy yang notabene beragama Katolik, dan mendapat dukungan dari Aegidius Tschudi, yaitu seorang Landammann (kepala magistrate) dari Glarus. Tetapi karena kekurangan uang, mereka tidak dapat melakukan intervensi di Glarus. Pada tahun 1564, mereka menetapkan sebuah perjanjian yang mengatur pemisahan agama-agama di Glarus. Saat ini terdapat dua majelis legislatif (Landsgemeinde) di provinsi, yang satu adalah seorang Katolik dan yang lainnya adalah seorang Protestan, serta Glarus mengirim satu perwakilan Katolik dan satu perwakilan Protestan ke Tagatzung .

Jakob Christoph Blarer von Wartensee yaitu seorang Uskup dari Basel, memindahkan kekuasaannya ke Porrentruy di pegunungan Jura pada tahun 1529, ketika Basel berubah menjadi Protestan. Pada tahun 1581, keuskupan tersebut kembali ke lembah Birs yang terletak di sebelah barat daya Basel. Di dalam Appenzell, di mana kedua pengakuan hidup berdampingan secara damai, kegiatan-kegiatan kontra-reformasi yang dimulai dengan kedatangan Saudara Capuchin menghasilkan perpecahan di antara provinsi tersebut pada tahun 1597 menjadi Appenzell Innerrhoden yang Katolik dan Ausserrhoden yang Protestan, yang keduanya memiliki satu suara di Tagsatzung.