Jabarkan Guru-gurunya dari Kholil al-Bangkalani

Syekh Kholil pernah berguru kepada beberapa ulama, di antaranya:

K.H. Muhammad Nur di Pondok Pesantren Langitan, Tuban

K.H. Nur Hasan di Pondok Pesantren Sidogiri, Pasuruan

Syekh Nawawi al-Bantani di Mekkah

Syekh Utsman bin Hasan Ad-Dimyathi

Sayyid Ahmad bin Zaini Dahlan di Mekkah

Syeikh Mustafa bin Muhammad Al-Afifi Al-Makki di Mekkah

Syeikh Abdul Hamid bin Mahmud Asy-Syarwani di Mekkah

Syekh Hasan Genggong atau lebih dikenal Kiai Hasan Genggong selengkapnya Haddratus Syekh al-Arifbillah KH. Mohammad Hasan bin Syamsuddin bin Qoyiduddin Al-Qodiri Al-Hasani (nama lain: Kiai Hasan Sepuh, lahir di Sentong, Krejengan, Probolinggo, 27 Rajab 1259 Hijriah / 23 Agustus 1843 Masehi - meninggal di Genggong, 11 Syawal 1374 H / 1 juni 1955 M) dianggap sebagai mujaddid dan Syekh Naqshbandi terkemuka dari Indonesia. Ia merupakan santri angkatan pertama saat Syaikhona Kholil datang dari pengembaraan ilmu di Mekkah.