Jabarkan Operasi udara dari Militer Australia dalam konfrontasi Indonesia–Malaysia

AU Australia juga terlibat dalam Konfrontasi Indonesia-Malaysia. Selama tahun 1960-an empat skuadron terbang Australia berbasis di Pangkalan Butterworth di Malaysia sebagai bagian dari FESR. Unit terbesar adalah Sayap Nomor 78, yang terdiri atas Skuadron Sabre No. 3 dan Skuadron No. 77. Unit lainnya yaitu Skuadron No. 2, yang mengoperasikan pesawat pembom Canberra dan beberapa pesawat angkut Dakota, serta Skuadron No. 5 yang dilengkapi helikopter UH-1 Iroquois. Sayap Nomor 78 dan Skuadron No. 2 telah berbasis di Butterworth sejak tahun 1958. Skuadron No. 5 tiba pada 1964, sebagai respons atas salah satu permintaan bantuan dari Pemerintah Malaysia.

Pendaratan pasukan terjun payung di Johor selama September 1964 menyebabkan ketegangan meningkat. Di bawah 'Rencana Addington,' pesawat pembom V milik Australia berbasis di Pangkalan Darwin di Australia utara untuk menyerang fasilitas udara Indonesia jika target di Malaysia diserang. Ketika Pemerintah Australia khawatir pendaratan parasut bisa menyebabkan peperangan terbuka, mereka memerintahkan AU mereka untuk memindahkan pesawat Sabre 16 dari Skuadron No. 76, yang berbasis di Pangkalan Williamtown, ke Darwin. Tujuan dari ini adalah untuk melindungi Darwin terhadap serangan dari pesawat pembom Il-28 milik Indonesia saat perang. Barisan tentara baterai anti-pesawat juga dikerahkan ke Darwin, serta tambahan pilot dan awak darat Sabre dan dikirim ke Butterworth untuk memperkuat Sayap Nomor 78. Pesawat Sabre tiba pada 8 September dan tetap dalam level peringatan tinggi hingga 17 Oktober. Setelah ketegangan mereda, Skuadron No. 76 mulai kembali ke Williamstown pada 20 Oktober. Aturan pengerahan pejuang Australia di Malaysia dikendurkan sebagai akibat dari pendaratan di Johore, untuk memungkinkan setiap pesawat Indonesia segera diatasi, yang mungkin teridentifikasi positif sedang berada di wilayah udara Malaysia atau Singapura.

Pesawat AU Australia juga membantu operasi darat selama Konfrontasi. Yang dilakukan oleh Skuadron No. 5 antara tahun 1964 dan 1966, termasuk mengangkut pasukan Australia, Malaysia dan Singapura selama operasi melawan Indonesia di Semenanjung Malaysia. Pesawat mereka juga secara rutin mengangkut pasukan dan perlengkapan antara semenanjung Malaysia dan Kalimantan. Pesawat Hercules C-130 Australia melakukan antaran reguler antara Darwin dan Butterworth, meskipun Indonesia mencabut izin bagi pesawat untuk terbang melalui wilayah udaranya pada Juli 1964. Detasemen Saber Sayap Nomor 78 mulai beroperasi di pulau Labuan di Kalimantan pada September 1965 untuk meningkatkan pertahanan udara RAF di wilayah itu. Status waspada untuk pesawat di Butterworth berkurang pada akhir Konfrontasi dan Indonesia kembali mengizinkan pesawat Australia untuk melewati wilayah udaranya. Antara tahun 1969 dan 1972 Australia menyumbangkan pesawat Sabre, serta dukungan teknis dan pelatihan, kepada angkatan udara Indonesia dan Malaysia.