Jabarkan Hidrografi dari Gurun Karakum

Gurun ini dialiri Sungai Murghab dan Tejen yang mengalir ke barat dari Pegunungan Hindu Kush, dan membuang air ke padang gurun, menyediakan air untuk irigasi.

Gurun ini juga dilintasi saluran irigasi terbesar kedua di dunia, Kara Kum Canal yang mengalirkan air dari Amu Darya ke selatan gurun. Kanal ini mulai dibangun pada tahun 1954, dengan panjang 1375 km, dan membawa 13-20 km³ air setiap tahunnya. Kebocoran kanal telah menciptakan danau dan kolam di sepanjang kanal dan kenaikan air tanah telah menyebabkan salinasi tanah yang meluas.