Jabarkan X2 (2003) dari X-Men (seri film)

Dalam film tersebut, Kolonel William Stryker mencuci otak dan mengintrogasi Magneto yang sedang berada di dalam penjara tentang alat pencari mutan milik Profesor Xavier, Cerebro. Stryker menyerang X-Mansion, dan mencuci otak Xavier untuk menentukan lokasi setiap mutan di planet ini agar dapat membunuh mereka semua. Para X-Men harus bekerjasama dengan Brotherhood untuk mencegah rencana genosida berskala dunia milik Stryker.

Hayter dan Zak Penn dipekerjakan untuk menulis naskah mereka sendiri untuk sekuel yang akan Singer pilih, dengan rencana agar film ini dapat dirilis pada bulan Desember 2002. Michael Dougherty dan Dan Harris dikontrak untuk menulis ulang naskah pada bulan Februari 2002, yang menghasilkan sekitar 26 draft dan 150 on-set. Pengambilan gambar dasar dimulai pada bulan Juni 2002 di Vancouver, Kanada dan berakhir pada bulan November 2002. Film ini dirilis pada 2 Mei 2003.

X-Men: The Last Stand (2006)

Dalam film tersebut, sebuah perusahaan farmasi telah mengembangkan obat yang dapat menean gen mutan, yang menyulut kontroversi dalam komunitas para mutan. Magneto menyatakan perang pada manusia dan mengambil senjatanya sendiri: Phoenix, yang dibangkitkan dari mantan anggota X-Man, Jean Grey. Pertempuran akhir antara X-Men (sekarang dipimpin oleh Storm) dan Brotherhood akhirnya terjadi, dan Wolverine harus menerima bahwa untuk menghentikan Jean Grey, ia harus membunuhnya.

Singer awalnya diharapkan untuk meproduksi film ini berturut-turut dengan film keempat, meskipun akhirnya ia keluar pada tahun 2004 untuk menyutradarai Superman Returns. Penn dan Simon Kinberg dikontrak pada bulan berikutnya. Salah satu cerita Astonishing X-Men milik Whedon "Gifted", dan sebuah obat yang dapat menyembuhkan mutasi akhirnya disarankan sebagai alur cerita utama dalam film ini. Matthew Vaughn ikut bergabung sebagai direktur pada bulan februari 2005, namun mengundurkan diri karena jadwal produksi yang dipercepat. Brett Ratner kemudian dikontrak sebagai direktur pada bulan Juni. Pengambilan gambar awal dimulai pada bulan Agustus 2005 di Vancouver, Kanada, dan berakhir di Januari 2006. film ini dirilis pada 26 Mei 2006.