Jabarkan This Dying Soul dari Twelve-step Suite

"This Dying Soul" menampilkan bagian dari seri empat dan lima ("Reflections of Reality (Revisited)" dan "Release"). Ini adalah lagu kedua di album Train of Thought. Rich Wilson (wartawan penulis biografi resmi Dream Theater, Lifting Shadows), menjelaskan trek ini sebagai kelanjutan dari lirik dan musik "The Glass Prison".

Lagu ini juga berisi beberapa referensi lirik lagu The Mirror, yang paling jelas pada bait "Hello mirror, so glad to see you my friend, it's been a while" (bait ini kemudian akan muncul dalam "Repentance" dan mirip dengan bait "Hello Victoria, so glad to see you, my friend" dalam "lagu Regression"). Juga, pada bagian pertama, berjudul "Reflections of Reality (Revisited)" referensi dari bait The Mirror "Reflections of reality are slowly coming into view". Dan bait "Now it's time to stare the problem right between the eyes" mirip dengan bait dari lagu The Mirror, "Let's stare the problem right in the eye". Bagian lima ("Release") dalam fitur lagu dimulai dengan riff yang sama dengan bagian kedua ("Restoration") di lagu "The Glass Prison".

The Root of All Evil

"The Root of All Evil" terdiri dari bagian seri enam dan tujuh ("Ready" dan "Remove"). Ini merupakan trek pembuka pada album Octavarium dan lagu terpendek dari semua seri. Wilson menganggap lagu ini sebagai "sebuah pola dasar trek Dream Theater, pencampuran riff yang rapi dan berat dengan beberapa momen progresif."