Jabarkan Visi : dari Pengadilan Tinggi Agama Jayapura

Terwujudnya Pengadilan Tinggi Agama Jayapura Yang Agung

Menjaga Kemandirian Pengadilan sewilayah Pengadilan Tinggi Agama Jayapura.

Memberikan Pelayanan Hukum Yang Berkeadilan Kepada Masyarakat Pencari Keadilan.

Meningkatkan Kualitas Kepemimpinan Peradilan sewilayah Pengadilan Tinggi Agama Jayapura

Meningkatkan Kredibilitas dan Transparansi Peradilan sewilayah Pengadilan Tinggi Agama Jayapura.

Pengadilan Tinggi Agama Jayapura dibentuk dengan SK Menteri Agama RI No. 95 tahun 1982 tanggal 28 Oktober 1982, tentang pembentukan 5 (lima) PTA Cabang, termasuk diantaranya PTA Cabang Jayapura. Kurang lebih satu tahun sejak terbentuknya Kantor Pengadilan Tinggi Agama Jayapura tepatnya Pada tanggal 11 Pebruari 1984,  telah resmi dibuka dan beroperasi untuk  melaksanakan tugas melayani kepentingan masyarakat para pencari keadilan khususnya umat islam dalam bidang keperdataan di tingkat banding dan juga sebagai kawal depan Mahkamah Agung RI.

Pengadilan Tinggi Agama Jayapura semula berkantor di Kantor Departemen Agama Jayapura pada tahun 1984 kemudian telah dibangun kantor PTA di Jalan Kotaraja, yang telah ditempati sejak tanggal 14 Nopember 1985  sampai Tahun 2010, dan Gedung Kantor Baru Pengadilan Tinggi Agama Jayapura berlokasi di Jalan Baru Kotaraja berdampingan dengan Kantor Badan Kepegawaian Negara (BKN).