Coba jelasin Yoshi Oida sebagai Ichizo dari Silence (film 2016) dong

Nana Komatsu sebagai Mónica (Haru)

Ryo Kase sebagai João (Chokichi)

Béla Baptiste sebagai Dieter Albrecht

Dalam sebuah wawancara dengan America Magazine pada Desember 2016, Scorsese menyatakan bahwa ia, kali pertama, membaca novel Shūsaku Endō pada 1989 saat diundang oleh Akira Kurosawa ke Jepang untuk berakting sebagai peran utama dari salah satu cuplikan dalam film Kurosawa Dreams. Scorsese menjelaskan dalam wawancara tersebut tentang bagaimana ia membaca novel tersebut saat dalam perjalanan antara bandara dan hotel di Jepang dimana ia berperan sebagai Vincent Van Gogh dalam film Kurosawa.

Silence dianggap merupakan sebuah "proyek yang disenangi" dari Scorsese dan telah dikembangkan sejak 1990, dua tahun setelah perilisan film paling kontroversial Scorsese, The Last Temptation of Christ, yang juga sangat bertemakan keagamaan. Scorsese pertama kali membaca novel tersebut pada 1989 dan mengambil hak film tersebut pada masa setelahnya. Saat ditanya kenapa ia masih meminati proyek tersebut selama lebih dari 26 tahun, Scorses menyatakan: "Saat kau makin tua, gagasan datang dan pergi. Pertanyaan, jawaban, kehilangan jawaban lagi dan pertanyaan lain, dan ini yang benar-benar aku pahami. Ya, perfilman dan orang-orang dalam hidupku dan keluargaku adalah yang paling berpengaruh, namun tetap saja aku makin tua, terdapat hal lain... Silence tetap menjadi suatu hal yang aku gambarkan dalam cara ini. Ini menjadi sebuah obsesi, ini telah dilakukan... ini adalah sebuah kisah nyata yang menakjubkan dan kuat, sebuah cerita seru dalam sebuah cara, namun ini sejalan dengan pertanyaan-pertanyaan tersebut."

Pada 2009, dengan dimulainya produksi, Scorsese dan kru produksi datang ke Nagasaki, Jepang, mengunjungi tempat-tempat asli yang tersaji sebagai latar belakang novel Endō. Penjelajahan lokasi tambahan dilakukan di Kanada. Namun, Silence memasuki keadaan neraka pengembangan tak lama setelahnya, dan Scorsese memutuskan untuk lebih dulu mengerjakan Shutter Island dan Hugo. Pada Desember 2011, Scorsese menyatakan bahwa Silence akan menjadi film berikutnya. Pada bulan Maret, meskipun ia awalnya menundanya dan kemudian mengurungkannya, Scorsese kembali befokus pada film The Wolf of Wall Street dan juga memutuskan untuk segera menyutradarai Silence. Namun, pada waktu itu, publisit Scorsese menyatakan bahwa Silence akan muncul lebih dulu. Pada bulan Mei, film tersebut diambil produser lainnya dalam Cecchi Gori Pictures yang baru bangkit, yang menempatkan proyek tersebut mula-mula pada daftar film mendatangnya.  Cecchi Gori terlibat dalam pra-produksi untuk Silence, namun tahun-tahun persengketaan hukum tak terkait telah mengganggu keterlibatannya dengan film tersebut.

Setelah pemfilman The Wolf of Wall Street dilakukan pada Januari 2013, Scorsese menolak untuk menyusulnya dengan film apapun selain Silence. Pada 19 April 2013, Scorsese mengumumkan bahwa ia akan memulai produksi Silence pada 2014, setelah 23 tahun tertunda. Irwin Winkler diumumkan sebagai produser pada hari yang sama, sementara Randall Emmett dan George Furla akan membiayai produksinya melalui perusahaan mereka Emmett/Furla Films. Corsan Films milik Paul Breuls juga dikabarkan mendanai produk tersebut. Selain itu, film tersebut diumumkan akan mengambil gambar di Taiwan.

Produser Irwin Winkler menyatakan bahwa pilihan pemfilman di Taiwan adalah karena berbiaya rendah. "[Film tersebut] sangat, sangat menghabiskan biaya, dan ini memerlukan biaya, karena ini terjadi pada tahun 1670 di Jepang. Kami beruntung dan mengetahui soal Taipei, dan di dalam dan di sekitaran Taipei dan Taiwan, kami menemukan lokasi-lokasi besar. Harganya sangat murah, dan kami bisa membuatnya untuk sebuah harga." Winkler menyatakan bahwa biaya ramping tersebut memaksa beberapa pemeran dan kru, termasuk dirinya sendiri, untuk berkarya dengan biaya yang minimum: "Dan semua aktor, Liam Neeson, Adam Driver, setiap orang berkarya berskala. Marty berkarya berskala, Aku berkarya di bawah skala. Kami memberikan uang kembali." James Martin, seorang imam Yesuit dan sarjana Katolik terpublikasi, bekerja sama dengan para pembuat film untuk mewujudkan penggambaran akurat dari Yesuit.