Jabarkan Pencarian pola dari Persejajaran sekuen jamak

Pola suatu area dari berbagai sekuen dapat diacu dari sebuah katalog. Pola tersebut dapat menyatakan fungsi yang mirip dari sekuen yang dianalisis. Contoh, suatu protein A memiliki pola yang mirip dengan enzim tertentu, sehingga dapat diprediksikan fungsi protein A mirip dengan enzim tersebut.

Blok yang diproduksi oleh server BLOCKS dari sekuen yang belum disejajarkan

Server BLOCKS dapat mengekstraksi area yang mirip dan tidak senjang untuk membuat sebuah blok. Server yang sama dapat juga mencari blok pada set dari sekuen yang belum disejajarkan, input sekuen-sekuen, dan menjaga database blok yang besar.

Metode emotif dari analisis motif

Metode ini sangat berbeda tetapi sangat berguna untuk mengidentifikasi motif dalam sekuen protein. Dari database BLOCKS dan database HSSP, set dari karakteristik substitusi asam amino dari persejajaran ditemukan.

Metode statistik untuk membantu persejajaran