Jabarkan Menjadi bupati dari Setjoadiningrat VIII

Pada masa awal pemerintahannya, Raden Setjo menitikberatkan pembangunan pada sektor pertanian. Pengairan pada waktu itu masih mudah dikarenakan pepohonan di hutan-hutan Pegunungan Wonosalam masih rimbun. Pembangunan juga diarahkan kepada penggalakan penanaman karet dan tebu, karena pada saat itu permintaan pasar dunia terhadap dua komoditas tersebut sangat besar.

Pada sekitar tahun 1941-1942 (awal Perang Dunia II), ayahnya Soeroadiningrat V, memasuki masa pensiun. Dan pada saat itu Jepang mulai menduduki Jawa. Dimulai dari pendaratan tentara ke-16 Jepang di beberapa tempat sepeti Teluk Banten, Eretan (Jawa Barat) dan di Kragan. Divisi-48 yang mendarat di Kragan lalu menyebar ke tiga jurusan, satu kolone menuju ke Semarang, satu lagi menuju ke Surabaya dan sisanya (Kolone Sakguchi) menuju ke Cilacap. Kolone yang menuju Surabaya lalu menyebar ke daerah-daerah disekitarnya termasuk Jombang. Kedatangan Jepang tersebut pada awalnya dielu-elukan oleh para pemuda, karena Jepang menganggap diri sebagai "saudara tua" bangsa Indonesia dan juga masyarakat mepercayai ramalan Jayabaya (raja Kediri) yang berbunyi "kelak akan datang jago kate dari arah timur laut, berpakaian seperti klaras (daun pisang kering) yang akan membebaskan Nusantara". Namun, seiring berjalannya waktu, Jepang menjadi kejam dan beringas. Keadaan di Jawa menjadi kacau, termasuk di Jombang. Kekacauan ini ditandai dengan langka dan mahalnya barang-barang dan kebutuhan pokok. Bahkan Jepang memprovokasi masyarakat untuk menjarah toko-toko dan usaha-usaha milik etnis Tionghoa di Jombang. Inilah masa-masa tersulit kepemimpinan Raden Setjo. Raden Setjo bersama Mbah Jimbrak, Lurah Gambang (Desa Plumbongambang, Kecamatan Gudo) menyarankan ayahnya beserta keluarga untuk mengungsi ke Desa Gempollegundi (sekarang termasuk dalam wilayah Kecamatan Gudo) selama empat hari untuk menghindari kekejaman Jepang. Pada masa pendudukan Jepang ini, Raden Setjo masih dipertahankan sebagai pemimpin di Jombang. Bahkan putranya, Raden Panji Willy Soedjono mendapat didikan militer dari Jepang dan menjadi Shodanco (Letnan).

Pada saat Jepang dikalahkan Sekutu, menyerah dan hengkang dari Nusantara, Belanda kembali menduduki Jawa Timur. Mantan Residen Surabaya, Dr. Van Der Plass, meminta kepada Raden Setjo untuk tetap menjadi bupati di Jombang sebagai kepanjangan tangan Belanda. Hal ini sempat membuat tidak senang pihak-pihak yang pro-Republik yang mengira Raden Setjo merupakan figur pro-Belanda. Pada kenyataannya, kesediaannya adalah bentuk strategi agar pembelaannya terhadap para pejuang tidak diketahui Belanda. Secara kasatmata, ia tetap terlihat pro-Belanda, namun ia tetap menjalin komunikasi dengan para pejuang melalui kurir yang datang malam hari. Si kurir menyampaikan kebutuhan para pejuang dan Raden Setjo menyediakan semua yang diperlukan, seperti persenjataan yang dibeli di pasar gelap.

Ketika pertempuran melawan Belanda (Agresi Militer Belanda) meletus secara sporadis di Mojoagung. Istri Raden Setjo, Raden Ayu Poppy menggalang aksi dapur umum di belakang Pendapa Kabupaten untuk mendukung perjuangan. Setiap hari, truk-truk sisa pendudukan Jepang datang ke Pendapa membawa bahan-bahan makanan dan sayur-mayur dari para lurah dan rakyat di Kabupaten Jombang, lalu membawa kembali ke garis depan pertempuran.