Jabarkan diri. dari Deportasi Tatar Krimea

Namun, tak semua orang Tatar Krimea ikut membantu Jerman; contohnya, Ahmet Özenbaşlı sangat menentang pendudukan Jerman dan menjalin hubungan rahasia dengan gerakan perlawanan Soviet untuk menyediakan informasi politik dan strategis. Banyak orang Tatar Krimea yang juga bergabung ke dalam kelompok-kelompok partisan, seperti gerakan Tarhanov yang terdiri dari 250 orang Tatar yang bertempur sepanjang tahun 1942 hingga kehancuran kelompok ini. Terdapat pula 25.033 orang Tatar Krimea yang mengabdi untuk Tentara Merah selama Perang Dunia II. Delapan orang Tatar Krimea bahkan diangkat sebagai Pahlawan Uni Soviet. Selain itu, meskipun terdapat lebih banyak orang-orang Tatar Volga yang berkolaborasi dengan Jerman (tercatat sekitar 35.000–40.000 sukarelawan untuk Blok Poros), mereka tidak diganjar hukuman kolektif apapun. Banyak pula etnis-etnis lain yang menjadi kolaborator Nazi, termasuk orang Rusia dan Yahudi, sehingga terdapat kemungkinan bahwa orang-orang di wilayah pendudukan di rekrut secara paksa.

Secara keseluruhan, lebih dari 130.000 orang tewas selama pendudukan Semenanjung Krimea oleh Blok Poros. Nazi melakukan penindasan yang brutal dan menghancurkan lebih dari 70 desa yang dihuni oleh sekitar 25% populasi Tatar Krimea. Ribuan orang Tatar Krimea dipindahkan untuk dijadikan "pekerja paksa dari timur" (Ostarbeiter) di pabrik-pabrik Jerman di bawah naungan Gestapo, sehingga Jerman Nazi tidak lagi didukung oleh orang-orang Tatar Krimea. Nazi sendiri menganggap Tatar Krimea dan berbagai suku bangsa lainnya sebagai "ras rendah". Pada April 1944, Tentara Merah berhasil memukul mundur pasukan Blok Poros dari semenanjung tersebut.

Saat pasukan Nazi mundur dari Krimea, kebanyakan hiwi, anggota keluarga mereka, dan semua orang yang berkaitan dengan Komite Muslim turut dievakuasi ke Jerman dan Hungaria atau Dobruca oleh Wehrmacht dan tentara Rumania, dan di situ mereka bergabung dengan divisi Turk Timur. Banyak pejabat Soviet yang mengakui bahwa orang-orang Tatar Krimea yang "bersalah" telah dievakuasi, dan mereka menolak klaim bahwa orang-orang Tatar Krimea telah mengkhianati Uni Soviet secara massal. Namun, setelah mundurnya pasukan Jerman, suara-suara yang menuntut penghukuman orang-orang Tatar semakin bertumbuh. Keberadaan Komite Muslim di Berlin yang dibentuk oleh Edige Kirimal dan para anggota diaspora Turki dan Dobruca lainnya juga semakin memperburuk citra orang Tatar Krimea di mata pemerintah Soviet. Selain itu, dengan mengaitkan orang Tatar Krimea dengan Turki, kaum nasionalis "Turki Krimea" semakin memperparah kecurigaan.