Jabarkan Tanggapan awal Israel dari Pembunuhan Muhammad ad-Durrah

Posisi IDF berubah seiring waktu, dari mengakui bertanggung jawab pada tahun 2000 menjadi mencabut pengakuannya pada tahun 2005. Saat Enderlin menghubungi mereka sebelum ia menyiarkannya, tanggapan pertama IDF menyatakan bahwa warga Palestina "memanfaatkan kepolosan wanita dan anak-anak," sehingga ia memutuskan untuk tidak menyiarkannya.

Pada tanggal 3 Oktober 2000, kepala operasi IDF, Mayor-Jenderal Giora Eiland, berkata bahwa sebuah penyelidikan internal mengindikasikan bahwa tembakan tersebut berasal dari para tentara Israel. Pada saat baku tembak, para tentara tersebut menembak dari celah-celah kecil di tembok pos mereka; Jenderal Yom-Tov Samia, kepala Komando Selatan IDF pada waktu itu berkata bahwa mereka tidak memiliki jarak pandang yang baik, dan menembak ke arah yang mereka yakini sebagai sumber tembakan. Eiland pun menyatakan permintaan maaf: "Ini adalah sebuah insiden mematikan, sebuah peristiwa yang sangat kami sayangkan."

Sekretaris Kabinet Israel, Isaac Herzog, menyatakan bahwa Israel telah berusaha untuk berbicara dengan Palestina. Ia juga menyatakan bahwa sebenarnya pasukan keamanan Palestina dapat mengintervensi untuk menghentikan baku tembak.