Jabarkan Pengawasan Fregat dari Kampanye Jawa 1806–1807

Usaha Pellew meluncurkan pasukan besar pada 1806—pada awalnya direncanakan untuk melawan Isle de France, bekerjasama dengan Laksamana Muda Sir Thomas Troubridge sebelum sasarannya berubah jadi Jawa—tertunda oleh pengalihan tugas Angkatan Laut Kerajaan untuk memadamkan Pemberontakan Vellore. Juga, Pellew mengirimkan beberapa fregat ke Laut Jawa untuk mengawasi daerah tersebut, menyerang perkapalan Belanda dan melaporkan keadaan skuadron Belanda yang menetap di Batavia. Kapal-kapal pertama yang berangkat antara lain fregat 32 meriam  di bawah pimpinan Kapten Edward Elphinstone dan "brig" dengan 18 meriam di bawah Komandan Edward Troubridge, anak dari Laksamana Troubridge. Elphinstone awalnya berlayar melalui Kepulauan Maluku pada bulan Juni dan Juli dengan beberapa keberhasilan, dan pada 25 Juli ia menemukan empat kapal Belanda berlayar melalui Selat Selayar. Waspada akan angkatan laut yang lebih besar, Elphinstone mengamati kapal-kapal Belanda pada malam hari dan di pagi hari tanggal 26 Juli ia mengidentifikasi kapal-kapal tersebut: 1 fregat, 1 korvet, 2 kapal dagang, termasuk satu East Indiaman besar. Dengan respons kepada kapal-kapal Inggris, komandan Belanda N. L. Aalbers membentuk konvoinya menjadi formasi perang, berharap bisa mencegah Elphinstone mengambil keuntungan. Inggris tidak mundur dan Greyhound menyerang fregat Belanda Pallas secara langsung ketika Harrier melewati antara fregat dan kapal dagang di barisan berikutnya, menyapu mereka bersama. Dalam 40 menit, Pallas menyerah dan Harrier berhasil mengejar dan menangkap kedua kapal dagang tersebut ketika korvet Belanda kabur ke pantai Sulawesi, menghindari pengejaran.

Di belakang kesuksesan Elphinstone, fregat kedua masuk lautan Belanda,  di bawah Kapten Peter Rainier (keponakan Laksamana Rainier) berlayar di atas Laut Jawa sepanjang bulan Oktober. Di sana Rainer menemukan kapal "ship of the line" Belanda tengah berlayar ke timur dari Batavia, kecuali , yang telah karam di Kepulauan Seribu pada 18 Mei dengan matinya dua awak. Ia juga paham bahwa fregat Belanda  sedang menjalani perbaikan di pelabuhan terbuka di Pulau Onrust dekat pelabuhan Belanda. Berlayar dengan maksud menginvestigasi, Caroline tiba dari pelabuhan pada 18 Oktober, tetapi menemui dua brig Belanda yang membunyikan alarm, membiarkan Phoenix masuk ke pelabuhan utama. Tanpa gentar, Rainier, berlayar ke pangkalan laut Batavia dan ia menemukan sejumlah kapal perang kecil dan fregat  di sana. Kapal-kapal yang lebih kecil saling menepi daripada melawan kapal Inggris yang lebih besar, tetapi Kapten Claas Jager di Maria Riggersbergen menyerang Caroline. Dalam pertarungan sepanjang 30 menit, kapal Belanda dikalahkan dan ditangkap, Rainier mengirim para narapidana ke tepi pantai dan melepas fregat tersebut, yang di kemudian hari dinamai HMS Java.