Jabarkan Tanggapan publik dari Saint Young Men

Saint Young Men menerima Penghargaan Kebudayaan Osamu Tezuka tahun 2009 untuk Manga Karya Pendek. Edisi tahun 2009 dari buku panduan terbitan Takarajimasha berjudul Kono Manga ga Sugoi!, yang menyurvei orang-orang dan tokoh dalam industri manga dan penerbitan, menyebutnya sebagai seri manga terbaik untuk pembaca pria. Saint Young Men dinominasikan untuk kategori "Komik Terbaik" pada Festival Komik Internasional Angoulême. Karena kepopulerannya, edisi-edisi majalah Morning 2 terjual habis di kios-kios majalah. Oleh karena itu, pada bulan Mei 2009 Kodansha mulai menyediakan majalah tersebut dalam versi daring pada hari yang sama setelah terbit. Seri ini masuk dalam jajaran 20 teratas seri manga terlaris di Jepang pada tahun 2009, 2011, dan 2013. Sebelas volume pertama masuk dalam daftar 50 manga terlaris di Jepang pada tahun terbitnya masing-masing. Hingga bulan Juni 2018, manga ini telah terjual sebanyak 16 juta kopi di Jepang. Manga ini juga ditampilkan di British Museum pada tahun 2011. Pada tahun 2014, The Daily Dot melaporkan terjadinya peningkatan penggemar dari Barat yang menyebarkan beragam gambar berformat GIF dari seri ini yang disebarkan via Tumblr.

Penulis komik Paul Gravett memilih seri ini sebagai salah satu komik terbaik Jepang tahun 2008, sedangkan penulis Shaenon Garrity dan Jason Thompson memilih Saint Young Men sebagai salah satu judul manga yang paling diinginkan untuk memperoleh lisensi pada tahun 2010. Kritikus manga Jepang, Kaoru Nagayama, menyebut bahwa manga ini "menyenangkan untuk dibaca" serta memuji Arakawa karena mempertahankan karakter dan sifat—kebaikan hati—Yesus dan Buddha yang sebenarnya bahkan ketika dihadapkan dengan kejahatan. Carlo Santos dari Anime News Network mengkritik gaya seni Saint Young Men dan mempertanyakan kapasitas dari manga ini untuk berkembang menjadi sesuatu yang lain daripada "Yesus dan Buddha yang bergaul, sementara orang-orang normal melakukan hal-hal memalukan pada mereka". Santos mengeluhkan fakta bahwa berbagai perbedaan filosofis serta kepribadian Yesus dan Buddha tidak dieksplorasi lebih lanjut. Namun Santos memuji unsur komedi dalam seri ini—menyebutkan bahwa komedinya tergolong sederhana dan berkata, "kecemerlangan Saint Young Men bukan berasal dari fakta bahwa manga ini meremehkan dua agama besar dunia secara sengaja, tetapi dengan menyoroti kebiasaan-kebiasaan dari dunia sekuler ketika tokoh-tokoh agama terkenal ini ditempatkan di dalamnya". Menurutnya, seri ini tidak kehilangan kapasitasnya untuk membuat pembaca tertawa seiring dengan perkembangan alur ceritanya, tidak seperti manga lainnya. Jolyon Baraka Thomas dari The Guardian memuji keandalan semua "lelucon visual dan permainan kata-kata" dalam seri karya Nakamura ini, dan menulis: "Cerita karyanya bukanlah suatu pengenalan terhadap doktrin-doktrin keagamaan yang menyulitkan, juga tidak menampilkan banyak penjelasan secara terang-terangan terkait peranan agama-agama dalam masyarakat zaman sekarang".