Jabarkan Imammat (1969-1992) dari Paus Fransiskus

Pada tahun 1967 Bergoglio memulai studi teologinya di Fakultas Filsafat dan Teologi San Miguel dan pada tanggal 13 Desember 1969 ditahbiskan menjadi imam oleh Uskup Agung Ramon Jose Castellano. Dia menjabat sebagai master novis untuk provinsi di sana dan menjadi profesor teologi.

Bergoglio menyelesaikan tahap terakhir pelatihan spiritualnya sebagai Yesuit, tertianship, di Alcalá de Henares, Spanyol, dan mengambil kaul terakhir sebagai Yesuit, termasuk kaul kepatuhan keempat untuk misi oleh Paus, pada 22 April 1973. Ia diangkat sebagai pemimpin provinsi dari Serikat Yesus di Argentina pada bulan Juli itu, untuk masa jabatan enam tahun yang berakhir pada tahun 1979. Pada tahun 1973, tak lama setelah ditunjuk sebagai pemimpin provinsi, dia telah melakukan ziarah ke Yerusalem tetapi masa tinggalnya dipersingkat oleh pecahnya Perang Yom Kippur. Setelah masa jabatannya selesai, pada tahun 1980 ia diangkat sebagai rektor Fakultas Filsafat dan Teologi San Miguel tempat ia belajar. Sebelum mengambil penunjukan baru ini, dia menghabiskan tiga bulan pertama tahun 1980 di Irlandia untuk belajar bahasa Inggris, tinggal di Pusat Jesuit di Institut Teologi dan Filsafat Milltown, Dublin. Dia bertugas di San Miguel selama enam tahun sampai tahun 1986 ketika, atas kebijakan atasan jenderal Jesuit Peter Hans Kolvenbach, dia digantikan oleh seseorang yang lebih selaras dengan tren dunia dalam Serikat Yesus yang menekankan keadilan sosial, bukan daripada penekanannya pada religiusitas populer dan karya pastoral langsung.

Dia menghabiskan beberapa bulan di Sekolah Pascasarjana Filsafat dan Teologi Sankt Georgen di Frankfurt, Jerman, untuk mempertimbangkan kemungkinan topik disertasi. Dia memutuskan untuk mengeksplorasi karya teolog Jerman / Italia Romano Guardini, khususnya studinya tentang 'Kontras' yang diterbitkan dalam karyanya tahun 1925 Der Gegensatz. Namun, ia harus kembali ke Argentina sebelum waktunya untuk melayani sebagai seorang bapa pengakuan dan pembimbing rohani bagi komunitas Jesuit di Córdoba. Diyakini bahwa selama di Jerman, dia melihat lukisan Bunda Maria, Untier of Knots di Augsburg dan membawa salinan lukisan itu ke Argentina, tetapi dalam sebuah wawancara untuk mingguan Jerman Die Zeit pada tahun 2017, Paus Fransiskus menyatakan bahwa dia tidak pernah pernah ke Augsburg. Sebagai siswa di sekolah Salesian, Bergoglio dibimbing oleh pastor Katolik Yunani Ukraina Stefan Czmil. Bergoglio sering bangun berjam-jam sebelum teman sekelasnya untuk melayani Liturgi Ilahi untuk Czmil.

Bergoglio diminta pada tahun 1992 oleh otoritas Yesuit untuk tidak tinggal di rumah Yesuit, karena ketegangan yang terus berlanjut dengan para pemimpin dan cendekiawan Yesuit, rasa "perbedaan pendapat" Bergoglio, pandangan tentang ortodoksi Katoliknya dan penentangannya terhadap teologi pembebasan, dan karyanya sebagai uskup pembantu Buenos Aires. Sebagai seorang uskup dia tidak lagi tunduk pada atasan Yesuitnya. Sejak saat itu, dia tidak mengunjungi rumah Yesuit dan berada dalam "keterasingan virtual dari Yesuit" sampai setelah pemilihannya sebagai paus.