Jabarkan Yagyū Shinkage-ryū dari Shinkage-ryū

Kamiizumi tidak mempunyai anak dan meninggalkan properti dan perguruannya ke muridnya yang bernama Yagyū Sekishusai Muneyoshi (柳生 石舟斎 宗厳 1507–1606). Muneyoshi kemudian menjadi kepala perguruan kedua Shinkage-ryū pada tahun 1566, dan selanjutnya mendirikan perguruannya sendiri, Yagyū Shinkage-ryū. Dia dikenal sebagai ahli pedang yang luar biasa, dan menjabat sebagai instruktur anggar shogun Ashikaga pada abad ke-15 dan yang juga shogun terakhir dari dinastinya, Ashikaga Yoshiaki (足利 義昭, 1537–1597). Setelah Muneyoshi memberikan sebuah demonstrasi ke shogun Tokugawa, Tokugawa Hidetada (徳川 秀忠, 1579–1632), dari teknik "mengambil pedang" dengan tangan kosong (mutō-dori) yang sudah dia kembangkan, keluarga Yagyū menjadi instruktur anggar resmi dari keshogunan Tokugawa.