Jabarkan Genoa dari Matteo Ferrari

Sehubungan dengan berakhirnya kontrak dengan Roma pada akhir musim 2008, club seperti AC Milan, Inter Milan, Juventus, Fiorentina, Genoa dan Manchester City berlomba untuk mendapatkan Matteo Ferrari. Pada akhirnya Ia memutuskan untuk bergabung dengan Genoa pada musim Serie A 2008-09. Ia memulai debutnya di Serie A 2008/09 pada 31 Agustus 2008 dengan menuai kekalahan 1-0 melawan Catania. Bermain di Genoa, Ia memiliki masalah dengan tindak kedisiplinan, di mana ia mendapat 6 kartu kuning dan 2 kartu merah. Matteo Ferrari mendapat kartu merah pertama saat bermain melawan Catania pada 25 Janurai 2009. Sedangkan kartu merah kedua ia dapatkan saat bermain melawan Sampdoria pada 3 Mei 2009.