Jabarkan Pimpinan dari Institut Agama Islam Negeri Madura

Drs. H. Munir, SA, sebagai dekan pertama (20 Juli 1966 s/d 01 Maret 1970;

Drs. H. Djawahir Syamsuri sebagai dekan kedua (01 Maret 1971 s/d 12 Oktober 1983);

Drs. H. Bustami Said, dekan ketiga (12 Oktober 1983 s/d 01 November 1991);

Drs. H. Dimjati, dekan keempat (10 November 1991 s/d 21 Agustus 1998);

Drs. H. Moh. Zaini, sebagai pemimpin kelima dengan sebutan ketua setelah beralih status menjadi STAIN (21 Agustus 1998 s/d 24 Juli 2000);

Drs. H. Bustami Said, ketua keenam (24 Juli 2000 s/d 11 Agustus 2004)

Dra. Hj. Mariatul Qibtiyah, AR., M.Ag, ketua ketujuh (10 Agustus 2004 s/d 23 Oktober 2008);

Dr. Idri, M.Ag., ketua kedelapan (23 Oktober 2008 s/d 24 Oktober 2012).

Dr. H. Taufiqurrahman, M.Pd., Ketua kesembilan (25 Oktober 2012 s/d 24 Oktober 2016).

Dr. H. Mohammad Kosim, M.Ag. (7 Oktober 2016 s/d 20 April 2018)