Jabarkan Musim 2013–2014 dari Mario Götze

Pada 11 Agustus 2013, Götze memulai debutnya bersama Bayern München, sebagai pemain yang menggantikan Mitchell Weiser pada menit ke-60. Götze mencetak dua gol, membantu kemenangan Bayern dengan skor 4–1 atas juara Hungaria Győri ETO di pertandingan persahabatan. Dia memulai debut Bundesliga pada pertandingan kandang melawan 1. FC Nürnberg pada 24 Agustus, dengan kemenangan 2–0 bagi Bayern. Pada 19 Oktober, Götze bermain sebagai pemain pengganti dan memberikan dua assist untuk membantu Bayern dari defisit satu gol menjadi kemenangan dengan skor akhir 4–1 atas 1. FSV Mainz 05.

Pada 23 Oktober 2013, Götze mencetak gol kompetisi pertama untuk Bayern dalam kemenangan 5–0 pada pertandingan babak grup Liga Champions melawan Viktoria Plzeň di Allianz Arena. Dia juga memberi assist kepada Bastian Schweinsteiger pada pertandingan tersebut. Pada 26 Oktober, Götze menggantikan Toni Kroos pada menit ke-25 dan mencetak skor Bundesliga pertama untuk Bayern München melalui sundulan pada kemenangan 3–2 atas Hertha BSC. Pada 2 November, dia kembali di lini utama dalam pertandingan tandang melawan TSG 1899 Hoffenheim dengan kemenangan 1–2. Pada 23 November, Götze bermain sebagai pemain pengganti dan mencetak gol pertama dari kemenangan tandang 0–3 atas klub lamanya Borussia Dortmund. Dia tidak merayakan selebrasi gol demi menghormati Dortmund. Dalam pertandingan berikutnya melawan CSKA Moskwa, Götze mencetak gol kedua dari kemenangan tandang 3–1 dalam pertandingan babak grup Liga Champions UEFA 2013–2014. Pada 7 Desember, Götze membantu Bayern dengan mencetak gol pada menit terakhir, serta memberi assist kepada Thomas Müller, dalam kemenangan tandang telak 7–0 atas Werder Bremen. Pada 17 Desember, Götze mencetak gol jarak jauh pada menit ke-47 melawan juara AFC Guangzhou Evergrande, membantu kemenangan 3–0 untuk Bayern dan lolos ke babak Final Piala Dunia Antarklub FIFA 2013. Pada pertandingan tersebut dia bermain sebagai pemain pengganti pada menit ke-80. Di pertandingan final, Bayern memenangkan pertandingan dengan skor 2–0.

Pada 24 Januari 2014, Götze dimainkan sebagai "false 9" dan mencetak gol pertama di paruh kedua musim melawan Borussia Mönchengladbach, dengan kemenangan 0–2 untuk Bayern. Pada 25 Maret, dia mencetak gol untuk kemenangan 3–1 atas Hertha BSC, memastikan Bayern menjadi juara Bundesliga. Pada 3 Mei, dia mencetak dua gol dan memberi dua assist dalam kemenangan tandang 1–4 atas Hamburger SV. Pada 17 Mei, dia bermain selama 120 menit penuh melawan klub lamanya Borussia Dortmund di pertandingan Final DFB-Pokal 2014. Bayern menang 2–0 pada perpanjangan waktu, memenangkan gelar kedua pada musim ini. Musim pertama Götze bersama Bayern menghasilkan kesuksesan dan frustasi sekaligus, mencetak 15 gol.