Jabarkan Animasi dari SpongeBob's Atlantis SquarePantis

Dalm film ini, ada 33 menit animasi. Para animator di Nickelodeon Animation Studio di Burbank, California membuat sketsa dari cerita selama setahun. Paul Tibbitt, supervising produser seri yang juga showrunner menjelaskan "Kami adalah salah satu yang menggunakan cara lama, seperti yang mereka biasa lakukan dulu pada masa Warner Brothers."

Dua minggu produksi pertama digunakan untuk membuat cerita. Pada minggu ketiga dan keempat, para artis membuat papan cerita. Setelah satu minggu berdialog dan merevisi cerita berdasarkan usulan internet, tim produksi mulai menyelesaikan papan cerita.

Kemudian semuanya dibuat animatik, kemudian dikirimkan kepada Stephen Hillenburg, pembuat SpongeBob untuk penyetujuan. Tibbit berkata "Dia melihat seluruh episode(...) Dialah yang paling tahu SpongeBob(...)"

Desain, latar belakang, model warna terakhir disiapkan. Pada saat yang sama pengarahan animasi selesai. Pada minggu ke-21, komponen-komponen dikirimkan ke Rough Draft Studio di Seoul. Setelah 13 minggu, film dikirimkan kembali ke Nickelodeon Animation Studio.