Jabarkan Kehidupan pribadi dari Stephen Hillenburg

Hillenburg menikah dengan Karen, koki yang mengajar di sekolah memasak. Pasangan ini memiliki anak bernama Clay (lahir 1998). Hillenburg pernah tinggal di Pasadena, California, dan sedang tinggal bersama keluarganya di San Marino di California Selatan. Hobinya adalah berselancar, snorkeling, selam scuba dan memainkan "musik rock yang berisik" di gitarnya. Dia juga melukis "seascape nyata" berdasarkan "sesuatu yang terjadi" dan berkata bahwa "ada sesuatu yang pribadi tentang itu." Hillenburg adalah fan besar band Australia Tame Impala. Dia memanggil mereka "anak muda ini menginvestigasi ulang rock psychedelic, dan itu tidak terlihat ironik."

Berdasarkan koleganya, Hillenburg adalah "seorang pekerja keras perfeksionis." Kenny memanggilnya "peselancara/seniman/animator/biologis laut manis, penuh perasaan ini." Julia Pistor, produser The SpongeBob SquarePants Movie dan wakil presiden senior Nickelodeon Movies, berkata bahwa "Dia sangat pemalu. Dia tidak ingin orang-orang tahu tentang kehidupan atau keluarganya. Dia sangat lucu, orang bersahaja dengan rasa humor kering yang memilih keluarganya dulu dan menjaga kami pada kaki kami dalam menjaga integritas perusahaan kami."

Hillenburg menganggap Jules Engel (1909–2003), mentornya di CalArts, sebagai "Ayah Seni"nya. Hillenburg diterima Engel ke dalam institut karena dia terkesan dengan karya Hillenburg. Dalam produksi The SpongeBob SquarePants Movie, Engel meninggal pada umur 94. Hillenburg memutuskan untuk mendedikasikan film itu untuk mengenangnya dan berakta bahwa "Dia benar-benar adalah orang artistik paling berpengaruh dalam hidupku."