Coba jelasin Kembali menjadi akademisi dari Musliar Kasim dong

Setelah menyelesaikan jabatan wakil menteri, ia kembali mengajar di kampus Unand. Pada 13 Agustus 2016 ia diangkat menjadi Rektor Universitas Baiturrahmah hingga 2020. Ia menggantikan rektor sebelumnya, Prof. Ir. Firdaus Rivai, M.Sc. Pada 16 Agustus 2020, ia kembali diangkat menjadi Rektor Universitas Baiturrahmah untuk periode kedua hingga 2024.

Musliar menjabat Ketua Ikatan Cendekiawan Muslim Indonesia (ICMI) Sumatra Barat periode 2018–2023 menggantikan Prof. Dr. Marlis Rahman. Ia diangkat oleh Direktur Jenderal Pendidikan Tinggi Kemdikbud RI Prof. Nizam menjadi Dewan Pendidikan Tinggi periode 2021–2026 sebagai satu-satunya perwakilan Sumatra dan salah satu dari dua perwakilan dari luar Jawa.