Jabarkan Lintas aktif dari Jalur kereta api Solo Balapan–Kertosono

Lintas utara Jawa' Gundih–Solo Balapan

Percabangan langsir ke arah Depo Pertamina Madiun

Madiun–Ponorogo dengan percabangan menuju Badegan

! colspan=8|BH 308Jembatan Bengawan Solo Jurug

! colspan=8|Awal jalur eletrifikasiAkhir jalur eletrifikasi

! colspan=4|BH 150Jembatan Kali Sawur !! colspan=4|Perbatasan Provinsi Jawa TengahPerbatasan Provinsi Jawa Timur

Percabangan nonaktif ini—mulai Stasiun Magetan hingga Lanud Iswahyudi—dibangun pada tahun 1939-1940 oleh Staatsspoorwegen'' (SS), bersamaan dengan dibangunnya Lanud Iswahyudi. Jalur ini memiliki panjang kurang lebih 5 km—berdampingan maupun bersilangan dengan jalur lori tebu PG Purwodadi—yang dikhususkan untuk mengangkut avtur atau bahan bakar pesawat yang dipasok oleh Pertamina menuju Landasan Udara Iswahyudi. Seiring dengan berjalannya waktu dan berkembangnya moda transportasi darat roda karet, Pertamina lebih memilih mendistribusikan avtur dengan menggunakan truk karena lebih efektif dan fleksibel sehingga jalur ini resmi ditutup tahun 2004.

Percabangan menuju Depo Pertamina Madiun

Percabangan ini dahulu merupakan percabangan menuju Pabrik Gula Rejo Agung dengan panjang lintasan kurang lebih 1,2 kilometer yang digunakan untuk mengangkut tetes tebu dari dalam pabrik gula dengan ditarik oleh lokomotif uap D52. Namun, jalur ini diperpendek dengan panjang kurang lebih 800 m untuk menghubungkan Stasiun Madiun dengan Depo Pertamina (Terminal BBM) Madiun. Jalur ini tepat berada di depan PT INKA dan bersebelahan dengan Jalan Yos Sudarso. Jalur ini dikhususkan untuk mengangkut kereta ketel BBM menuju Terminal BBM Madiun.

Untuk keperluan langsiran kereta api ketel, dijalankan lokomotif CC201, CC203, dan CC206. Jalur ini merupakan jalur kereta api pinggir jalan raya yang masih aktif selain ruas Purwosari–Solo Kota.