Jabarkan Orde Dannebrog, 1913 (Denmark). dari Hideyo Noguchi

Orde Isabella the Catholic, 1913 (Spain).

Orde Polar Star, 1914 (Sweden).

Tokyo Imperial University - Doctor of Science, 1914.

Orde Matahari Terbit, Gold Rays with Rosette, 1915.

Imperial Award, Imperial Academy (Japan) - 1915.

Central University of Ecuador, 1919 - (Ekuador).

Universitas Nasional San Marcos, 1920 - (Peru)

Sekolah Kedokteran Merida - "Doctor Honoris Causa en Medicina y Cirugía", 1920 - (Mekisiko)

Universitas Guayaquil, 1919 - Ekuador.

Universitas Yale, 1921 - (Amerika Serikat).

Jasad Noguchi dikembalikan ke Amerika Serikat dan dimakamkan di Pemakaman Woodlawn, New York City.

Pada tahun 1928, Pemerintah Jepang menganugerahinya Order of the Rising Sun, Gold and Silver Star yang merupakan penghargaan tertinggi kedua dari delapan kelas penghargaan yang ada.

Pada tahun 1979, Noguchi Memorial Institute of Medical Research (NMIMR) didirikan dengan dana yang diberikan Pemerintah Jepang. Institut ini berada di Universitas Ghana di Legon, utara pinggiran kota Accra.

Potret Dr. Noguchi menghiasi uang kertas Jepang 1000 yen sejak tahun 2004. Selain itu, bangunan rumah tempatnya dilahirkan dan dibesarkan telah dilestarikan dan dijadikan museum di dekat Inawashiro.

Nama Noguchi diabadikan di Meksiko sebagai Centro de Investigaciones Regionales Dr. Hideyo Noguchi di Universidad Autónoma de Yucatán.