Coba jelasin Tahun 2009 dari Jurina Matsui dong

Pada Maret 2009, Matsui bergabung secara resmi dengan Tim S yang terdiri dari 16 orang. Ketika dibentuk unit musiman AKB Idoling!!!, ia diikutsertakan menyanyi singel perdana "Chuushiyou ze!".

CBC memulai acara radio untuk SKE48, SKE48 Kanransha e Youkoso" ("Selamat Datang di Kincir Ria SKE48"), 6 April 2009. Acara baru itu menampilkan Jurina Matsui sebagai bintang utama hingga 29 Juni 2009.

Sebagai anggota Tim S, Matsui turut serta dalam rekaman singel perdana SKE48, "Tsuyoki Mono yo" dirilis 5 Agustus 2009.

Ia kembali dipilih sebagai anggota senbatsu AKB48 untuk singel ke-12 "Namida Surprise!". Matsui dipasang di posisi paling depan-tengah bersama Atsuko Maeda. Dalam pemilihan senbatsu untuk singel ke-13, Matsui menduduki urutan ke-19 sekaligus berhak ikut dalam rekaman. Ia berturut-turut ikut dalam singel AKB48, mulai dari singel ke-11 hingga ke-14, dari "10nen Zakura", "Namida Surprise!", "Iiwake Maybe" hingga "River". Pada acara malam tahun baru Kouhaku Uta Gassen ke-60, 31 Desember 2009, ia tampil bersama AKB48.