Jabarkan Hidrologi dari Sungai Fly

Sungai ini mengalir melalui hutan ngarai di hulunya, sedangkan lembah memperluas dalam perjalanannya lebih rendah, melintasi dataran dan rawa-rawa. Sungai Fly juga merupakan bagian dari perbatasan antara Provinsi Barat dan Provinsi Papua Selatan. Ada satu bagian yang melintas ke bagian barat garis bujur 141° Timur. Untuk mengkompensasi perolehan tanah ini untuk Papua Nugini, batas selatan sungai Fly sedikit ke timur garis bujur 141° Timur, dan karena kesepakatan ini, Indonesia mempunyai hak untuk menggunakan sungai Fly sampai ke muaranya sebagai sarana transportasi.

Anak-anak sungai utama ke sungai Fly adalah Sungai Strickland dan Sungai Ok Tedi.

Dekat muaranya, aliran sungai Fly menemui suatu tidal bore, di mana suatu pasang laut tinggi mendorong air sungai ke arah hulu sampai perubahan pasang surut terjadi. Rentang wilayah tidal bore ini masih belum terdokumentasi. Daerah muara mempunyai lebar 53 kilometer (33 mil).

Sungai ini sering terjadi banjir dan akibatnya tidak ada pemukiman umum dari berbagai ukuran di sekitar sungai ini.