Jabarkan GO! Chrono Stone dari Inazuma Eleven

Semuah turnamen sepak bola usia remaja baru, Football Frontier International Versi 2 (FFI-V2) akan segera digelar. Jepang pun menyiapkan tim nasional terbaiknya. Namun, pelatih tim nasional Jepang Shinsei Inazuma Japan, Kuroiwa Ryuusei, hanya menyiapkan tepat 11 orang untuk menjadi tim nasional Jepang. Itu berarti tidak ada pemain cadangan. Segera setelah pengumuman nama-nama pemain, diadakan pertandingan persahabatan antara Shinsei Inazuma Japan melawan Akademi Teikoku. Secara mengejutkan, Shinsei Inazuma Japan takluk dengan mudah dengan skor 1 - 10 dari Akademi Teikoku. Kemudian, terkuak bahwa 8 dari 11 pemain Shinsei Inazuma Japan tidak memiliki latar belakang sepak bola, bahkan ada yang sama sekali tidak memiliki latar belakang olahraga lain. Ditambah dengan konspirasi FFI-V2 ini, yang sesungguhnya adalah kompetisi sepak bola antarplanet —yang mana jika bumi kalah dalam kompetisi ini, maka bumi akan dihancurkan—, akankah Shinsei Inazuma Japan atau Earth Eleven menyelamatkan bumi?