Jabarkan Deep Space Nine dari Benjamin Sisko

Pada tahun 2369, Sisko ditugaskan ke sektor Bajor untuk memimpin stasiun Deep Space Nine dan untuk membantu perbaikan Bajor dari Pendudukan orang Cardassia yang baru saja usai, menggembalakan mereka ke kemungkinan mendapatkan keanggotaan United Federation of Planets. Sisko dan anaknya, Jake tinggal di stasiun luar angkasa DS9. Mengenali bahwa stasiun luar angkasa itu bukanlah suatu "lingkungan ideal" untuk memelihara seorang anak, Sisko memikirkan untuk mengundurkan diri dari tugasnya di Starfleet. Kehadiran Jean-Luc Picard, yang memberikan briefing misi tersebut menambah rasa tidak nyaman Sisko. Sisko terus memiliki rasa benci kepada Picard terhadap perannya, meskipun terpaksa, dalam kematian istrinya.

Pada kunjungan pertama Sisko ke Bajor, seorang Kai Bajoran, Opaka Sulan, menyebut dia sebagai "duta dari para Prophets" dan memberi dia salah satu dari Tears of the Prophets, Sebuah Orb yang bersinar dan misterius yang diceritakan berasal dari para Prophets Bajor. Dengan mempelajari orb tersebut dan fenomena luar angkasa yang terjadi di dekat Bajor, Jadzia Dax menemukan lokasi aktivitas yang tidak biasa di Denorios Belt. Setelah menyelidikinya, Dax dan Sisko menemukan lubang cacing pertama yang stabil; ujung dari lubang cacing tersebut berakhir di Kuadran Gamma. Setelah menggunakan lubang cacing tersebut untuk yang kedua kali, Sisko dan Dax bertemu dengan alien-alien misterius yang hidup di dalam lubang cacing itu. Para orang Bajoran yang religius percaya bahwa lubang cacing dan alien-alien itu adalah "candi surgawi" mereka dan Prophet. Alien-alien ini ada di luar waktu linear. Pertemuan Sisko yang pertama kali dengan alien-alien itu canggung dan sulit untuk kedua pihak; tapi pertemuan itu membantu Sisko untuk menyadari bahwa ia tidak pernah mengizinkan dirinya untuk pergi dari kepahitan dan kedukaan dari kehilangan istrinya, dan juga kemarahannya kepada Picard. Setelah keluar dari lubang cacing, Sisko mengambil kesempatan untuk maju dan memimpin DS9 dan mengadopsi sikap yang lebih tidak bermusuhan kepada Picard sebelum keberangkatannya.

Setelah DS9 dipindahkan ke pinggiran lubang cacing untuk mengklaimnya sebagai milik Bajor, stasiun itu menjadi tempat perkumpulan aktivitas sains, komersial dan politik yang baru.

Penemuan lubang cacing memperkuat gagasan Opaka dan orang-orang Bajor lain bahwa Sisko adalah Emissary of the Prophets, sebuah gelar dan tanggung jawab yang pada awalnya tidak disukai Sisko. Namun, Sisko akhirnya menghangat dan akhirnya memeluk perannya yang telah ditakdirkan dalam kepercayaan orang Bajor.

Saat Sisko memimpin Defiant ke dalam lubang cacing untuk mencegat sebuah armada Dominion, para Prophet ikut campur. Sisko, pada titik ini, belum memenuhi takdirnya; untuk memastikan Sisko tetap hidup, para Prophet menghapus para pasukan Dominion dari keberadaan mereka.