Jabarkan |} dari Liga Champions UEFA 2012–2013

Babak ketiga kualifikasi ini dibagi menjadi dua bagian yaitu satu untuk para juara liga disebut "Jalur Juara" dan peserta yang lolos namun bukan juara liga disebut "Jalur Liga", kedua jalur tersebut dipisah dalam proses pengundian babak ketiga dan play off. Klub yang kalah pada kedua jalur akan mengikuti Babak play off Liga Eropa UEFA 2012–13.

Pengundian untuk babak ketiga dilakukan pada tanggal 25 Juli 2012. Pertandingan pertama dimainkan pada tanggal 31 Juli dan 1 Agustus 2012, dan pertandingan kedua dilaksanakan pada 7 dan 8 Agustus 2012.