Jabarkan Pengakuan dari Shinya Yamanaka

Tahun 2007 Yamanaka mendapat penghargaan Time Person of the Year edisi majalah Time Yamanaka juga masuk dalam nominasi finalis Time 100 tahun 2008.

Pada tahun 2010, Yamanaka mendapat penghargaan Kyoto atas jasanya dalam pemrograman ulang sel-sel dewasa kulit prekursor pluripotential.

Pada bulan September 2010, ia mendapat penghargaan atas hasil kerjanya dalam bidang biologi dan sel punca.

Yamanaka masuk dalam daftar satu dari 15 ilmuwan Asia yang berpengaruh versi majalah Asian Scientist pada 15 Mei 2011.

Bulan Juni 2011 ia mendapat penghargaan perdana McEwen Award for Innovation; ia berbagi hadiah $100.000 dengan Kazutoshi Takahashi.

Pada bulan Juni 2012, ia mendapat penghargaan Millennium Technology Prize atas hasil kerjanya dalam hal sel punca. Ia berbagi hadiah 1,2 juta euro dengan Linus Torvalds, pembuat sistem operasi Linux