Jabarkan Tahun ekspansi dari Copa Airlines

Ekspansi dilanjutkan pada dekade 1990an, dengan layanan yang dimulai menuju Buenos Aires, Argentina; Santiago, Chili; Bogotá, Kolombia; Havana, Kuba; Guayaquil, Ekuador; Lima, Peru; Mexico City, Meksiko; Caracas, Venezuela; dan kota penting Amerika Latin lainnya.

Pada tahun 1998, Continental Airlines membeli 49% saham maskapai, mwnandai dimulainya aliansi pemasaran dan operasi komprehensif. Pada 19 Mei 1999 Continental meningkatkan kepemilikan sahamnya hingga menjadi 51%. Sejak saat itu, maskapai mengadopsi logo dan corak pesawat yang mirip dengan Continental dalam usaha untuk memperlihatkan aliansi mereka, dan berpartisipasi dalam program frequent flyer OnePass. Namun, dalam hubungan dengan penawaran saham perdana pada Desember 2005, Continental mengurangi investasinya dari 49% menjadi sekitar 27.3% dan setelah penawaran yang dilakukan pada tahun 2006, Continental kemudian menekan investasinya hingga hanya sekitar 10.0%.

Pada tahun 2000, Copa Airlines membuka layanan penerbangan menuju Los Angeles, Cancún, dan Orlando, beresama juga penerbangan menuju São Paulo; tahun 2001 maskapai mulai terbang menuju Quito, Ekuador. Pada tahun 2004 maskapai memulai layanannya menuju Bandar Udara Internasional John F. Kennedy di New York City. Diumumkan juga pada bulan Agustus tahun yang sama bahwa mereka membuka aliansi codeshare dengan maskapai Meksiko, Mexicana de Aviación, yang berlangsung hingga tahun 2007.

Pada 1 Juni 2005, Copa mengumumkan bahwa telah membeli 90% saham dari maskapai penrbangan domestik Kolombia AeroRepública, yang telah lebih awal mengumumkan akan membuka perjanjian codeshare dengan mereka. Maskapai juga mengumumkan rencananya untuk membuat AeroRepública menjadi maskapai penrbangan terbesar kedua di Kolombia. Rencananya adalah dengan meningkatkan destinasi domestik, melakukan modernisasi armada, dan memulai destinasi internasional pertama maskapai tersebut. Beberapa hari kemudian, Copa Airlines diumumkan sebagai salah satu dari empat anggota baru dari aliansi SkyTeam, yang diperkirakan akan bergabung pada bulan September 2007.

Pada 15 Desember 2005, Copa Holdings, S.A., sebuah perusahaan pemegang saham dari Copa Airlines, memulai sebuah IPO sebanyak 14 juta lembar di New York Stock Exchange dan menjadi maskapai penerbangan Amerika Latin keempat yang memperdagangkan sahamnya di bursa efek. Tiga maskapai lainnya adalah LAN Airlines dari Chili dan maskapai Brasil, Gol Transportes Aéreos dan TAM Linhas Aéreas.

Tahun 2006 Copa Airlines memgumumkan memulai layanan menuju enam destinasi baru: Manaus, Brasil, Maracaibo, Venezuela,Montevideo, Uruguay, Rio de Janeiro, Brasil, San Pedro Sula, Honduras, dan Santiago de los Caballeros, Republik Dominika

Sebagai tambahan, Copa Airlines juga menerima 6 Embraer 190 dan 2 Boeing 737 pada tahun 2006 dan terpilih lagi sebagai "Maskapai Penerbangan Terbaik di Meksiko, Amerika Tengah, dan Karibia" oleh Skytrax.

Tahun 2007, Copa Airlines menambahkan destinasi baru menuju Córdoba, Argentina, Guadalajara, Meksiko, Punta Cana, Republik Dominika dan Washington D.C., Amerika Serikat

Copa Airlines menerima 4 Embraer 190 dan 2 Boeing 737 (seri-800) tahun dan terpilih lagi sebagai "Maskapai Penerbangan Terbaik di Meksiko, Amerika Tengah, dan Karibia" oleh Skytrax.

Selama tahun 2008, Copa menambahkan lima destinasi baru dan menerima 4 Embraer 190 dan 1 Boeing 737-800. Destinasi baru tersebut adalah:Port of Spain, Trinidad dan Tobago, Belo Horizonte, Brasil, Valencia, Venezuela, Oranjestad, Aruba dan Santa Cruz de la Sierra, Bolivia

Pada bulan Mei 2008, Continental Airlines menjual sisa 4.38 juta saham Copa senilai $35.75 setiap lembar, dengan harga berssih sekitar $149.8 juta.

Pada waktu yang sama, Copa chief executive Pedro Heilbron di forum pimpinan maskapai penerbangan ALTA di Cancun mentayakan bahwa Copa Airlines telah memutuskan untuk meninggalkan SkyTeam dan dalam pebicaraan eksklusif dengan Star Alliance.

Selama tahun 2009, Copa Airlines menambahkan 1 Boeing 737-800 ke armadanya.

Copa Airlines mengumumkan bahwa mereka akan meninggalkan SkyTeam pada 24 Oktober 2009, pada waktu yang sama dengan rekannya Continental Airlines meninggalkan SkyTeam.

Pada 16 Juli 2009, maskapai penerbangan Panama Copa Airlines mengumumkan pesanan pasti untuk 13 Boeing 737-800 yang akan dikirimkan dengan penanda khas Boeing yang baru, "Sky Interior".

Pada tahun yang sama, Copa Airlines menambahkan dua Boeing 737-800. Rencananya adalah menerima 9 pesawat lagi pada tahun 2010, di mana 2 diantaranya telah dikirimkan.

Pada 1 September 2010, Copa Airlines memastikan akan memulai layanan menuju St. Maarten pada 18 Desember 2010. Penerbangan akan dilakukan langsung dari Panama City, Panama, melayani pulau tersebut dua kali seminggu. Sebuah pesawat Boeing 737-800 akan digunakan untuk penerbangan ini.

Pada 10 November 2010, Copa Airlines akhirnya bergabung dengan Star Alliance pada pertengahan 2012 untuk bertemu dengan rekan tuanya, Continental Airlines dan menjadi maskapai penerbangan Panama pertama yang bergabung dengan Star Alliance.

Pada 30 November 2010, Copa Airlines dan Boeing mengumumkan pembelian dua puluh dua pesawat Boeing 737-800, direncanakan akan dikirim pada tahun 2015 dan 2018, dengan opsi untuk membeli sepuluh lagi Boeing 737-800, dengan nilai sekitar $1.7 miliar. Ini merupakan pesanan pesawat terbesar dalam sejarah Copa.