Jabarkan Beşiktaş dari Burak Yılmaz

Burak ditransfer ke Besiktas pada 14 Juni 2006.Pada musim pertamanya bermain, Burak mencetak 5 gol dari 30 pertandingan, namun performanya menurun pada musim 2007/2008. Pada Januari 2008, Burak ditukar dengan Filip Holosko ke Vestel Manisaspor