Jabarkan 2013 dari Apink

Pada Januari 2013, Apink merekam single lain bersama dengan Beast untuk mempromosikan Skoolooks. Pada tanggal 5 Januari, di konser AIA K-POP 2013 di Hong Kong, grup ini menampilkan beberapa lagu mereka bersama dengan grup Cube Entertainment lainnya, 4Minute dan Beast. Pada April 2013, Play M Entertainment merilis pernyataan bahwa Hong Yoo-kyung meninggalkan grup karena jadwal pendidikan dan Apink akan terus berlanjut sebagai grup beranggotakan enam orang tanpa menambahkan anggota baru.

Mini album ketiga mereka, Secret Garden, dan musik untuk lagu utamanya, "NoNoNo", dirilis pada 5 Juli 2013. "NoNoNo" adalah single dengan peringkat tertinggi mereka, memuncak hingga menduduki nomor 2 di Billboard's K-Pop Hot 100. Pada November 2013, di Mnet Asian Music Awards 2013, A Pink menerima penghargaan the Next Generation Global Star. Pada bulan Desember, Apink berkolaborasi dengan Beast, 4Minute, BTOB, G.NA, Roh Ji-hoon, Shin Ji-hoon dan Kim Kiri untuk merilis "Christmas Song". Di bulan yang sama, mereka merekam single kolaborasi dengan B.A.P, berjudul "Mini" untuk Skoolooks. Pada Juli 2013, Apink terpilih sebagai duta kehormatan untuk Seoul Character & Licensing Fair 2013.