Jabarkan Rektor IAIN Imam Bonjol dari Mahmud Yunus

Sebagai pegawai Departemen Agama, Yunus kerap diundang mengikuti kunjungan kerja ke luar negeri. Pada 1961, ia melawat ke sembilan negara Islam: Mesir, Saudi Arabia, Syria, Libanon, Yordania, Turki, Irak, Tunisia, dan Maroko. Kunjungan ini ditujukan untuk mempelajari pendidikan agama di negara-negara tersebut. Pada April 1962, Yunus menghadiri sidang Majelis A'la Istisyari Al-Jami'ah Al-Islamiyah di Madinah atas undangan Raja Saud dari Arab Saudi melalui Kedutaan Besar Arab Saudi di Jakarta. Dalam Muktamar Buhutsul Islamiyah di Universitas Al-Azhar, ia berturut-turut hadir pada 1964, 1965, 1966, dan 1967. Pada salah satu penyelenggaraan muktamar, Yunus mengemukakan makalah berjudul "Al-Israiliyyat fit Tafsir wal Hadits".

Sejak 1963, Yunus menjadi Dekan Fakultas Tarbiyah IAIN Syarif Hidayatullah Cabang Padang yang baru didirikan. Tiga tahun berselang, fakultas ini bersama tiga fakultas lain diresmikan menjadi IAIN Imam Bonjol. Yunus dilantik sebagai rektor pertama IAIN tersebut pada 29 November 1966 sampai jelang pensiun pada 1 Januari Tahun 1971.

Sebelum pensiun, Yunus masih melakukan lawatan keluar negeri, terakhir menghadiri Majelis A’la Istisyari Al-Jami’ah Al-Islamiyah di Madinah pada 1969. Namun, sepulang dari kunjungan itu, kesehatannya mulai menurun dan ia beberapa kali masuk rumah sakit. Pada 15 Oktober 1977, ia memperoleh gelar doktor kehormatan di bidang ilmu tarbiyah dari IAIN Syarif Hidayatullah atas perjuangannya dalam pengembangan pendidikan Islam di Indonesia. Yunus meninggal dunia di kediamannya, Kebon Kosong, Kemayoran, Jakarta dalam usia 82 tahun pada 16 Januari 1982. Jasadnya dimakamkan di kompleks pemakaman IAIN  Syarif Hidayatullah Jakarta.