Jabarkan Pengoperasian sebagai museum dari Museum Kereta Api Sawahlunto

Pada tahun 2002-2003, tambang batu bara Ombilin yang dioperasikan oleh PT Bukit Asam Tbk. terpaksa ditutup karena habisnya batu bara. Kehabisan batu bara ini menyebabkan jalur kereta apinya juga mangkrak. Pada tahun 2004-2005, PT Kereta Api memutuskan bekerja sama dengan Pemerintah Kota Sawahlunto untuk membuka museum perkeretaapian. Museum ini menempati bekas Stasiun Sawahlunto, diresmikan pada tanggal 17 Desember 2005 oleh Wakil Presiden Jusuf Kalla.

Untuk mempromosikan museum ini, lokomotif endemik Divre II, E1060 yang sempat menjalani preservasi di Museum Kereta Api Ambarawa dan menarik kereta wisata Ambarawa–Bedono diputuskan untuk dikembalikan lagi ke Sumatra Barat atas usul Pemerintah Kota Sawahlunto untuk dioperasikan sebagai kereta api baru yang diberi nama "Mak Itam" (dalam bahasa Minangkabau berarti "Paman Hitam"). Mak Itam hanya melayani relasi Sawahlunto–Muarakalaban, p.p. Di luar relasi tersebut, Mak Itam pernah menjadi ikon dari Tour de Singkarak 2012 dan bahkan mengangkut rombongan peserta ajang sepeda tersebut.

Pada saat yang sama, kereta wisata Danau Singkarak yang mulai diperkenalkan pada 21 Februari 2009 hanya dijalankan ke Padang Panjang dari Stasiun Sawahlunto. Namun kereta api wisata ini berhenti beroperasi pada tahun 2014 karena sepi peminat sehingga jalur ini otomatis nonaktif. Bahkan meski pemesanannya melalui sistem carteran, kereta ini sangat sepi peminat sehingga armada kereta serta lokomotif penariknya "terjebak" di Depo Lokomotif Solok.

Pada tanggal 6 Juli 2019, tambang batu bara Ombilin ditetapkan oleh UNESCO sebagai Situs Warisan Dunia. KA Mak Itam kembali beroperasi pada Desember 2022 setelah dilakukan perbaikan prasarana jalur Muarokalaban-Sawahlunto. Sebagai salah satu dari tiga perusahaan BUMN yang berkolaborasi dengan KAI dalam reaktivasi ini, kini Biofarma memegang hak penamaan stasiun Sawahlunto. Pada papan huruf yang tertera di seberang stasiun kini tertera nama Stasiun Sawahlunto Biofarma.