Jabarkan Borussia Dortmund dari Pierre-Emerick Aubameyang

Tanggal 4 Juli 2013, Aubameyang bergabung dengan finalis Liga Champions Borussia Dortmund pada kontrak lima tahun. Dia membuat debut kompetitif untuk klub barunya pada 27 Juli 2013 melawan Bayern Munich di DFL-Supercup, menggantikan Błaszczykowski di kedua setengah dari kemenangan 4-2 Dortmund.

Pada tanggal 10 Agustus 2013 Aubameyang membuat debut Bundesliga dan mencetak hat-trick ke gawang FC Augsburg, termasuk satu gol dari tembakan pertamanya di liga. Dalam proses ini, Aubameyang juga menjadi pemain Gabon pertama yang bermain di Bundesliga.