Coba jelasin Masalah layanan dari The Pirate Bay dong

Pada Mei 2007, TPB diretas. Mereka meretas basis data dengan total lebih dari 1,5 juta pengguna. TPB mengeklaim bahwa data pengguna tersebut tidak berharga dan bahwa kata sandi dan email telah dienkripsi dan di- hash. Beberapa blog menyatakan bahwa kelompok yang dikenal sebagai AUH (Arga Unga Hackare, bahasa Swedia untuk "Peretas Muda yang Marah") dicurigai melakukan serangan tersebut; namun, AUH menyatakan di surat kabar Computer Sweden bahwa mereka tidak terlibat dan akan membalas dendam pada mereka yang bertanggung jawab atas serangan itu.

Pada 27 April 2009, TPB mengalami masalah konektivitas kabel optik IPv4. Ada spekulasi bahwa ada pemadaman paksa oleh kaum anti-pembajakan Swedia, lalu ditanggapi TPB dengan menambahkan rincian kontak kepada pengacara kelompok anti-pembajakan Swedia ke catatan basis data RIPE-nya. Situs dan forumnya masih tersedia melalui IPv6 pada saat itu.

Pada tanggal 24 Agustus 2009, salah satu penyedia hulu The Pirate Bay diperintahkan untuk menutup layanan oleh pengadilan Swedia sebagai tanggapan atas tindakan perdata yang diajukan oleh beberapa perusahaan hiburan termasuk Disney, Universal, Time Warner, Columbia, Sony, NBC, dan Paramount. Dalam blognya ini menyebabkan peladen menjadi down 3 jam; tetapi, beberapa pengguna tidak dapat mengakses situs segera setelah relokasi karena kesulitan teknis yang tidak terkait. Situs ini sepenuhnya beroperasi kembali untuk semua orang dalam waktu 24 jam.

Pada tanggal 6 Oktober 2009, salah satu penyedia IP transit ke The Pirate Bay memblokir semua lalu lintas TPB yang menyebabkan gangguan bagi sebagian besar pengguna di seluruh dunia. Pada hari yang sama, situs tersebut dilaporkan aktif lagi dengan IP di CyberBunker, yang terletak di Belanda. Tidak diketahui apakah TPB sebenarnya terletak di CyberBunker atau apakah mereka menggunakan layanan CyberBunker yang merutekan alamat IP CyberBunker ke pusat data mana pun di seluruh dunia. Rute-rute ini tidak terlihat oleh dunia luar.

CyberBunker mendapat perintah pengadilan pada 17 Mei 2010, membuat situs tersebut luring sebentar; kemudian pada hari itu, hosting dipulihkan oleh Partai Bajak Laut Swedia. Mantan juru bicara Pirate Bay, Peter Sunde, berkomentar bahwa sekarang akan sangat sulit untuk menghentikan situs tersebut karena sekarang akan dilihat sebagai sensor politik jika ada yang mencoba untuk menutupnya.

Pada tanggal 8 Juli 2010, sekelompok peretas Argentina berhasil menjebol panel administrasi The Pirate Bay melalui pelanggaran keamanan melalui back-end. Mereka berhasil menghapus berkas torrent dan mengekspos alamat IP, email, dan kata sandi hash-MD5 pengguna. Pirate Bay dibuat luring untuk peningkatan. Pengguna yang mengunjungi situs web mendapat sambutan: "Upgrading some stuff, database is in use for backups, soon back again. Btw, it's nice weather outside I think."

Pada 16 Mei 2012, TPB terkena serangan DDoS besar, menyebabkan situs tersebut sebagian besar tidak dapat diakses di seluruh dunia selama sekitar 24 jam. TPB mengatakan bahwa mereka tidak tahu siapa yang berada di balik serangan itu, meskipun "memiliki kecurigaan".

Pada tanggal 5 Mei 2015, The Pirate Bay luring selama beberapa jam, diduga karena tidak mengonfigurasi sertifikat SSL-nya dengan benar.