Jabarkan |} dari Babak gugur Liga Eropa UEFA 2012–2013

Chelsea menang 5–4 secara agregat.

4–4 secara agregat. Basel menang 4–1 melalui adu penalti.

Fenerbahçe menang 3–1 secara agregat.

Benfica menang 4–2 secara agregat.

Cat. 9: Rubin Kazan memainkan pertandingan kandangnya di Luzhniki Stadium, Moscow tidak di stadion kandangnya, Tsentralnyi Stadion, Kazan.

Cat. 10: Pertandingan Lazio v Fenerbahçe dimainkan tanpa penonton sebagai hukuman dari UEFA menyusul insiden pada Babak 32 besar saat melawan Borussia Mönchengladbach tanggal 21 Februari 2013.