Jabarkan Kejatuhan dari Jat Airways

Tahun 1992, Republik Federal Sosialis Yugoslavia pecah dan Perang Yugoslavia dimulai. sebagai maskapai penerbangan nasional dari Yugoslavia, dan dipecah oleh perang sipil, JAT dipaksa untuk menghentikan semua operasi domestiknya. Resolusi No. 757 yang disetujui oleh Dewan Keamanan PBB pada 20 Mei 1992 memberikan sanksi ekonomi kepada Serbia dan Montenegro. Untuk pertama kali seja Perang Dunia II, penerbangan internasional dipaksa untuk berhenti. Hal ini diikuti oleh keputusan Italia dan Jerman untuk menghentikan setiap perjalanan dengan Yugoslavia: pada 21 Desember 1991 - Jerman (pasar terbesar untuk JAT di Eropa dengan 7 penerbangan harian dan 40 juta Mark Jerman keuntungan tiap tahun), diikuti oleh Italia pada 10 Januari 1992. Amerika Serikat memulai embargo perjalanan udara dengan Yugoslavia pada 2 Mei 1992: Penerbangan terakhir JAT ke Amerika adalah menuju Chicago dan New York City. Hari tersebut, manajemen JAT memutuskan untuk mengubah rute penerbangan jarak jauh menuju Kanada. Namun, Kanada segera mengikuti langkah Amerika, dan operasi penerbangan di Amerika Utara akhirnya dihentikan.

Pada waktu tersebut, JAT hanya mengoperasikan penerbangan domestik menuju Beograd, Podgorica, Tivat, Niš, Priština dan - untuk jangka waktu singkat - Bandar udara Užice-Ponikve (banyak diantaranya yang merupakan destinasi yang merugi). Akhirnya, tahun 1994, JAT membuka beberapa penerbangan internasional, dengan pesawat dalam corak baru (setelah Uni Eropa membuka embargo). Tahun 1998, JAT memesan 8 Airbus A319, dimana ini terlihat sebagai gerakan politik sang presiden. Jadwal pengiriman sebenarnya adalah Juni 2000 namun waktu tersebut ditunda hingga total dana $23.5 juta dibayar kepada Airbus sedangkan Jat berharap untuk mengubah pesanan tersebut kepada maskapai penerbangan lain. Segera setelah itu semua penerbangan dihentikan karena Eropa memulai larangan baru dan Yugoslavia mengalami pengeboman selama 78 hari.

Pada April 2000, direktur utama Žika Petrović dibunuh dalam eksekusi ala mafia, di depan rumah keluarganya di Beograd.

Pada awal tahun 2007, Jat Airways memulai negosiasi dengan Airbus dalam usaha untuk mengubah pesanan (6 Airbus A319 dan 2 Airbus A318 daripada 8 Airbus A319).