Jabarkan Pengoperasian di Indonesia (2007-2020) dari Kereta rel listrik Tokyo Metro seri 5000

KRL ini dioperasikan di Indonesia sejak tahun 2007, bersama dengan Toyo Rapid seri 1000. Indonesia merupakan satu-satunya pengguna kereta ini di luar Jepang. Meskipun aslinya KRL ini terdiri dari 10 kereta dalam 1 rangkaiannya, namun karena keterbatasan panjang peron KRL ini diperpendek menjadi 8 kereta dalam 1 rangkaiannya. Akhirnya, 2 kereta sisa yang tidak digunakan dari masing-masing rangkaian disimpan dan menjadi donor suku cadang sebelum akhirnya ditumpuk di Stasiun Purwakarta, bersama kereta-kereta sisa dari rangkaian Toyo Rapid seri 1000.

Sejak awal kedinasannya, KRL ini berdinas di seluruh lintas di Jabodetabek, namun KRL ini lebih sering berdinas di Bogor, Bekasi, dan juga lintas Serpong-Parungpanjang, meskipun saudaranya seri 1000 lebih sering melayani lintas Bekasi. Setelah penyeragaman layanan KRL (dimana layanan Ekspres dihapuskan dan layanan Commuter Line yang pada dasarnya sama seperti Ekonomi AC dijadikan layanan standar untuk KRL di Jabodetabek), KRL ini melayani perjalanan Commuter Line di semua lintasan Jabodetabek.

Seiring dengan menuanya kereta ini, rangkaian 5016F pun pensiun pertama kali pada tahun 2014 untuk menjadi sumber suku cadang mengingat kondisi KRL yang tua menyebabkan KRL ini tidak luput dari kanibalisasi komponen dan suku cadang. Sejak 2015, biasanya KRL ini juga lebih sering beroperasi di jalur Jatinegara-Bogor/Depok mengingat di jalur Bogor/Depok/Bekasi-Jakartakota perannya telah tergeser oleh KRL JR East 205.

Pensiunnya KRL ini berlanjut dengan pensiunnya rangkaian 5009F dan pada akhirnya hanya rangkaian 5017F yang tersisa hingga sekarang. Sebelumnya, rangkaian 5017F sempat menghilang pada September 2019 lalu dan dirumorkan sudah pensiun dari dinasnya di Indonesia, namun ini merupakan kepanikan sesaat karena pada 10 Oktober 2019, rangkaian 5017F sudah berdinas kembali dengan roda baru. Akhirnya, karena perannya sudah tergeser oleh KRL JR East 205, dan juga karena usianya sudah tua, 5017F akhirnya berhenti beroperasi pada Januari 2020 dan kini sudah ditanahkan di Stasiun Pasirbungur.