Jabarkan Wilayah dari Konfederasi Amerika

Warga di Mesilla dan Tucson di bagian selatan Wilayah New Mexico membentuk konvensi pemisahan diri, yang memilih untuk bergabung dengan Konfederasi pada 16 Maret 1861, dan menunjuk Dr. Lewis S. Owings sebagai gubernur teritorial baru. Mereka memenangkan Pertempuran Mesilla dan mendirikan pemerintahan teritorial dengan Mesilla sebagai ibu kotanya. Konfederasi memproklamirkan Konfederasi Wilayah Arizona pada 14 Februari 1862, di utara paralel ke-34 . Marcus H. MacWillie bertugas di kedua Kongres Konfederasi sebagai delegasi Arizona. Pada tahun 1862 Kampanye Konfederasi New Mexicountuk mengambil bagian utara wilayah AS gagal dan pemerintah teritorial Konfederasi di pengasingan dipindahkan ke San Antonio, Texas.

Pendukung Konfederasi di barat trans-Mississippi juga mengklaim sebagian Wilayah Indian setelah Amerika Serikat mengevakuasi benteng dan instalasi federal. Lebih dari setengah tentara Indian Amerika yang berpartisipasi dalam Perang Saudara dari Wilayah India mendukung Konfederasi; pasukan dan satu jenderal terdaftar dari masing-masing suku. Pada 12 Juli 1861, pemerintah Konfederasi menandatangani perjanjian dengan negara-negara India Choctaw dan Chickasaw . Setelah beberapa pertempuran, pasukan Persatuan menguasai wilayah tersebut.

Wilayah Indian tidak pernah secara resmi bergabung dengan Konfederasi, tetapi menerima perwakilan di Kongres Konfederasi. Banyak orang Indian dari Wilayah diintegrasikan ke dalam unit Tentara Konfederasi reguler. Setelah tahun 1863 pemerintah suku mengirim perwakilan ke Kongres Konfederasi : Elias Cornelius Boudinot mewakili Cherokee dan Samuel Benton Callahan mewakili orang Seminole dan Creek . Bangsa Cherokeesejalan dengan Konfederasi. Mereka mempraktekkan dan mendukung perbudakan, menentang penghapusan, dan takut tanah mereka akan disita oleh Persatuan. Setelah perang, wilayah Indian dibubarkan, budak kulit hitam mereka dibebaskan, dan suku-suku kehilangan sebagian tanah mereka.