Jabarkan Abad ke-20 sampai sekarang dari Gereja Kelahiran

Lorong penghubung Gua Santo Hieronimus dengan Gua Kelahiran diperlebar pada bulan Februari 1964, agar lebih leluasa dilalui para pengunjung. Stanley Slotkin, usahawan asal Amerika Serikat, yang saat itu sedang mengunjungi Gereja Kelahiran, membeli pecahan batu gamping, sampah proyek pelebaran lorong, sebanyak lebih dari satu juta butir kerikil tak beraturan dengan panjang kira-kira . Kerikil-kerikil itu dijual bebas dalam kemasan salib plastik, dan diiklankan di infomersial-infomersial tahun 1995.

Sekitar 50 orang pejuang Palestina berlindung di dalam Gereja Kelahiran ketika diburu oleh Bala Pertahanan Israel. Orang-orang Kristen di dalam Gereja Kelahiran mengizinkan pejuang-pejuang bersenjata itu berlindung di dalam gedung gereja, bahkan memberi mereka makanan, air minum, serta perlindungan dari pasukan militer Israel yang ditempatkan di luar gedung gereka. Media massa Israel mengabarkan bahwa orang-orang Kristen yang terjebak di dalam gedung gereja telah dijadikan sandera, tetapi warga jemaat yang berada di dalam Gereja Kelahiran mengatakan bahwa para pejuang Palestina bersikap sopan terhadap mereka maupun terhadap gedung gereja.

Tirai Gua Kelahiran terbakar pada tanggal 27 Mei 2014, dan menimbulkan sedikit kerusakan pada gedung gereja.

Para pemilik bersama Gereja Kelahiran melakukan usaha renovasi besar-besaran semenjak bulan September 2013, yang direncanakan tuntas pada tahun 2019 (baca Restorasi (2013–2019)).