Jabarkan Ekstrakurikuler dari Kolese Kanisius

Canimount (CM), ekstrakurikuler pecinta alam

Tunggal Hati Seminari (THS), ekstrakurikuler pencak silat berimankan Katolik.

Canisius English Forum (CEF), forum debat bahasa Inggris untuk SMA, Canienglish [SMP]

Canisius Science Club (CSC), kelompok ilmiah

Canicart, ekstrakurikuler menggambar kartun manga

Canisius Red Cross (CRC), palang merah

Canimass [SMP] dan Canipress [SMA], ekstrakulikuler jurnalistik

Canisius Wind Ensemble, kelompok alat musik tiup

Koor terdiri dari Persevera (SMA Kanisius), Perseviam (SMA Kanisius-SMK Santa Theresia), dan Ursula Canisius Voice (SMA Kanisius-SMA Santa Ursula)

Canisius Multimedia (CMM), ekstrakurikuler multimedua

Komunitas - komunitas non ekstrakurikuler

Proses belajar mengajar atau intrakurikuler di Kolese Kanisius dilaksanakan pada hari Senin hingga Jumat untuk siswa SMA dengan jam belajar dari pukul 07:00 sampai 14.45 WIB (Senin-Kamis), 07.00 sampai 14.00 WIB (Jumat). Kegiatan ekstrakurikuler, seni wajib budaya,dan muatan lokal dilaksanakan setelah jam intrakurikuler.

Untuk siswa SMP, jam belajar dimulai pada pukul 07:00 sampai 13:30 WIB (Senin-Jumat) dan hari Sabtu libur.