Jabarkan Musim 2019–2020 dari Thomas Müller

Pada 2 November 2019, Müller membuat penampilan kompetitifnya yang ke-500 untuk Bayern, menjadi pemain Bayern ke-10 yang mencapai angka ini sejak promosi klub ke Bundesliga pada tahun 1965. Bulan berikutnya, ia menjadi pemain pertama yang mencatatkan 11 assist di paruh pertama musim Bundesliga, mencapai rekor baru dalam kemenangan 2-0 timnya atas Wolfsburg. Pada 7 April 2020, Müller menetapkan perpanjangan kontrak yang membuatnya bertahan di Bayern hingga 2023.  Dia mencatatkan assist ke-20 musim Bundesliga dalam pertandingan tandang melawan Bayer 04 Leverkusen pada matchday 30, memecahkan rekor assist terbanyak dalam satu musim, yang sebelumnya dipegang oleh Kevin De Bruyne dan Emil Forsberg.  Dia memberikan assist lain dalam pertandingan tandang melawan Wolfsburg pada Matchday 34, untuk menyelesaikan musim dengan rekor 21 assist.

Pada 14 Agustus, Müller mencetak dua gol dan memberikan assist dalam pertandingan perempat final Liga Champions UEFA 2019–2020 melawan FC Barcelona, ​​yang berakhir dengan kemenangan 8–2. Kemudian, Bayern menang 1-0 atas Paris Saint-Germain F.C. di final, yang menandai gelar Liga Champions keenam klub dan gelar Liga Champions kedua Müller. Dia menyelesaikan musim dengan mencetak 8 gol dalam 33 pertandingan liga, dua gol dalam enam pertandingan Piala Jerman, dan 4 gol dalam 10 pertandingan Liga Champions.