Jabarkan Wolfsburg dari Edin Džeko

Setelah pindah ke Wolfsburg, Džeko langsung membuat penampilan yang memukau dengan mencetak lima gol dari 11 pertandingan. Ia disebut oleh Sportal sebagai penyerang terbaik di paruh awal Bundesliga musim 2007-08. Pada akhir musim pertamanya di Jerman, Džeko mengemas delapan gol dan tujuh assist. Sedangkan Wolfsburg menempati posisi lima klasemen akhir, lolos kualifikasi Liga Eropa UEFA musim 2008–09.

Setelah Wolfsburg merekrut seorang pemain Bosnia lain, Zvjezdan Misimović, performa Džeko melesat pada musim keduanya. Menjelang tutup musim pada Mei 2009, Džeko mencetak hat-trick saat melawan TSG Hoffenheim dan kembali mencetak hat-trick lainnya pada gawang Hannover 96 dua pekan kemudian. Wolfsburg pun akhirnya memenangi gelar Bundesliga pertama mereka. Džeko mencetak total 26 gol dan 10 assists di liga dari 32 pertandingan. Menduduki tempat kedua top scorer Bundesliga, dibawah teman seklubnya, Grafite. Keduanya menjadi duet penyerang paling sukses dalam sejarah Bundesliga.

Pada Piala DFB, ia mencetak enam gol dari dua pertandingan. Ia juga mencetak empat gol dan dua assist dari delapan pertandingan pada Liga Eropa UEFA. Atas penampilannya tersebut, ia dinobatkan sebagai Pemain Terbaik Tahunan Bundesliga. Walaupun mendapat tawaran menarik dari AC Milan, Džeko tetap memilih untuk bertahan dan memperpanjang kontrak hingga Juni 2013.

Ia mencetak gol pertamanya di ajang Liga Champions UEFA pada September 2009, ketika kalah 2-1 melawan Manchester United di Old Trafford. Ia menjadi salah satu dari 30 pemain yang masuk nominasi Ballon d'Or 2009 dan menjadi top scorer Bundesliga pada musim 2009–10 dengan raihan 22 gol.

Pada 28 Agustus 2010, Džeko menjadi pencetak gol liga terbanyak dalam sejarah klub dengan catatan 59 gol dari 96 penampilan. Memecahkan rekor milik Diego Klimowicz yang mencetak 57 gol dari 149 pertandingan.