Jabarkan Beasiswa dari SMA Negeri 3 Yogyakarta

Beasiswa yang disediakan di SMA 3 Yogyakarta antara lain:

Beasiswa untuk 35 siswa/i SMAN 3 Yogyakarta

Beasiswa untuk 24 putra/i guru karyawan SMAN 3 Yogyakarta

Beasiswa dari Pemerintah dan Swasta

Beasiswa Warung Spesial Sambal SS

Medali Emas dalam Olimpiade Fisika Asia Pasifik dan medali perunggu Olimpiade Fisika Internasional pada tahun 2003 (Tri Wiyono Darsowiyono)

Medali Perunggu dalam Olimpiade Kimia Internasional di Jerman pada tahun 2004 (Lisendra Marbelia)

Medali Emas Bidang Matematika (Kristo), dua Medali Perak Bidang Komputer (Anugerah Galang Persada dan Hanson Prihantoro Putro), Medali Perunggu Bidang Matematika (Ifan Hanif), Medali Perunggu Bidang Kimia (Rendra Prasetya), Medali Perunggu Bidang Biologi (Sofia Imaculata), Medali Perunggu Bidang Komputer (Wiradeva Arif Kurniawan), Medali Perunggu Bidang Komputer (Dominikus Damas Putranto), dalam Olimpiade Sains Nasional 2005

Medali perunggu dalam Olimpiade Matematika Asia Tenggara atas nama Kristo

Wakil Indonesia dalam Olimpiade Matematika Internasional 2005 di Mexico (Kristo)

Medali Perak dalam 2005 Olimpiade Kimia Internasional di Taiwan atas nama Rendra Prasetya

Honorable Mention dalam Olimpiade Fisika Asia Pasifik di Kazakhstan tahun 2006 dan medali perak dalam olimpiade Fisika Internasional pada tahun 2007 (Yoshua Michael Maranatha)

Wakil Indonesia dalam Olimpiade Matematika Internasional 2007 di Vietnam (Nugroho Seto Saputro)

Medali Emas Bidang Fisika (Ahmad Ataka Awwalur Rizqi), Medali Perak Bidang Komputer (Mirza Widihananta), dan Medali Perunggu Bidang Astronomi (Mirna Jatiningrum) dalam Olimpiade Sains Nasional 2009

Medali Perunggu pada Asian Physics Olympiad (APhO) 2010 di Taiwan atas nama Ahmad Ataka Awalur Rizqi

Medali Emas dalam International Earth Science Olympiad atau Olimpiade Kebumian ke-4 tahun 2010 di Yogyakarta atas nama Rio Priandri Nugroho

Medali Perak Bidang Komputer (Alfian Rismawan), Medali Perunggu Bidang Kimia (Maria Fransiska P) dalam Olimpiade Sains Nasional 2012

Medali Perak OPSI (Olimpiade Penelitian Siswa Indonesia) 2012 atas nama Rahmadani Puji Lestari dan Amalina Kurnia Sari

Medali Perak dalam International Geography Olympiad (iGeo) 2021 atas nama Rubens Phenola Setiawan

Prestasi Tingkat Nasional dan Internasional yang lain

Sandra Forestyana sebagai anggota Paskibraka Nasional Tahun 2006, dan Nisma Aulia serta Lecia Mona, sebagai anggota cadangan

Joshua Michael Maranata, peserta terbaik dalam bidang Fisika Ujian A-Level Cambridge University

Fadhil Ahmad Qamar, sebagai salah satu panelis dalam World Cultural Economic Forum yang diselenggarakan oleh International Child Art Foundation (2008)

Koala Band (Padz Band #6) Juara I Nasional Honda Beat RBT Blast 2008

Fadhilah Atika, Juara I Nasional Cabang Karate dalam Olimpiade Olah Raga Siswa Nasional (OOSN) 2009

Dien Ardiansyah Putra, Juara I Asia Pasifik Cabang Renang Gaya Punggung 2009

Juara 2 Bidang Vokal dalam Festival Lomba Seni Siswa Nasional (FLS2N) 2012 atas nama Fatwa Januarya

Crisna Noven Pratama sebagai anggota Paskibraka Nasional tahun 2015

Muhammad Widya Hudiya Wijaya sebagai anggota Paskibraka Nasional tahun 2018