Jabarkan Manchester City dari Pep Guardiola

Pada 1 Februari 2016, Manchester City menandatangani kontrak dengan Guardiola selama tujuh tahun untuk awal musim 2016–17. Guardiola mendatangkan beberapa pemain penting di musim panas, termasuk gelandang lkay Gündoğan dari Borussia Dortmund dan Nolito dari Celta Vigo, pemain sayap Leroy Sané dari Schalke 04, dan bek John Stones dari Everton. Dia juga secara kontroversial menggantikan kiper lama City Joe Hart dengan Claudio Bravo dari mantan klubnya Barcelona; setelah Hart gagal membuat Guardiola terkesan di pra-musim, dia dipinjamkan ke Torino sebelum akhir jendela transfer dan tidak akan pernah tampil lagi untuk klub.

Manchester City kehilangan pertandingan pra-musim pertama Guardiola 1-0 dari mantan timnya Bayern Munich. Pada 13 Agustus 2016, Guardiola meraih kemenangan dalam pertandingan pertamanya di musim Liga Premier, saat City menang 2-1 melawan Sunderland. Pada 11 September 2016, Guardiola memenangkan derby Manchester pertamanya sebagai manajer dalam kemenangan 2-1 di Old Trafford;  ini juga merupakan kemenangan keenamnya melawan manajer "saingan"-nya José Mourinho. Pada akhir September 2016, Guardiola telah memenangkan semua dari sepuluh pertandingan pertamanya yang bertanggung jawab atas Manchester City dan timnya berada di puncak klasemen Liga Premier, dengan keunggulan empat poin atas Tottenham Hotspur yang berada di posisi kedua. Meskipun ia kemudian menderita kekalahan pertamanya sebagai manajer City dalam kekalahan 2-0 dari Tottenham, timnya tetap unggul satu poin di tabel liga menjelang jeda internasional.

Bentuk City menurun setelah jeda internasional;  hasil imbang di kandang melawan Southampton pada 23 Oktober 2016 membuat Guardiola menyamai rekor manajerialnya dalam lima pertandingan tanpa kemenangan. Performa buruk City berlanjut di Piala EFL, tersingkir menyusul kekalahan 1-0 dari Manchester United. Ini adalah pertandingan keenam Guardiola tanpa kemenangan di semua kompetisi, menjadikannya performa terburuk dalam karir manajerialnya. Manchester City akan kalah 4-0 dari Everton pada 15 Januari 2017; ini adalah kekalahan manajerial terbesar Guardiola di kompetisi domestik. City tersingkir di babak 16 besar Liga Champions oleh Monaco dengan gol tandang setelah bermain imbang agregat 6-6.  Pertandingan leg kedua adalah pertandingan ke-100 sebagai manajer di kompetisi Eropa, dan dia mencapai rekor itu dengan rekor terbaik dari manajer mana pun, menghasilkan 61 kemenangan dan 23 seri (satu seri lebih baik dari pemegang rekor sebelumnya, mantan manajer Guardiola. di Barcelona, Louis van Gaal).

Menyusul kekalahan dari Arsenal di semi-final Piala FA, Guardiola mengakhiri musim tanpa trofi – pertama kali ini terjadi dalam karir manajerialnya.  Di tengah teriakan busuk yang diberi label "penipuan, penipuan", ia menyatakan bahwa peran kepelatihan di City "mungkin menjadi tim terakhirnya" sebagai manajer dan menyatakan tidak memenangkan trofi, dari empat yang tersedia untuk City, merupakan  "kegagalan". Namun, dia mengutarakan keinginannya untuk meningkatkan musim berikutnya.