Jabarkan 2008-2009 dari Karim Benzema

Benzema memulai musim baru dengan mencetak dua gol ke gawang Toulouse di laga pertama. Tiga pekan kemudian, ia mencetak gol melawan rival sesama Rhône-Alpes, Grenoble, dan Saint-Étienne, dan mencetak sebuah gol melawan Nice, yang dia buat melalui tendangan penalti pada menit-menit akhir. Lyon memenangi semua laga tersebut. Karena itulah, presiden Aulas menolak semua tawaran transfer dari tim besar dan memasang harga 100 juta euro untuknya. Ia juga menjadi model sampul versi Prancis untul permainan video FIFA 2009, bersama Franck Ribéry.

Ia mencetak gol ketujuh pada 29 Oktober, dalam sebuah kemenangan 2-0 atas Sochaux. Ia kembali mencetak gol di laga selanjutnya melawan Le Mans. Ia adalah salah satu pencetak gol terbanyak di fase grup Liga Champions UEFA 2008-09 dengan torehan lima gol, terdiri atas dwigol melawan Steaua Bucureşti, dua gol dari dua laga melawan Fiorentina, dan sebuah gol melawan Bayern Munich di laga terakhir.

Setelah jeda musim dingin, Benzema tak mencetak gol di tiga laga pertama sebelum kemudian mencetak gol kesebelas di musim tersebut melawan Nice, di mana mereka menang 3-1. Dia kembali mencetak gol dua pekan kemudian melawan Nancy dalam kemenangan 2-0. Sembilan pertandingan selanjutnya, performa Benzema (dan Lyon) jatuh bebas (kalah empat kali, seri tiga kali dan hanya menang dua kali), dan Benzema hanya bisa mencetak dua gol dari sembilan laga tersebut. Performa buruk tersebut membuat Lyon kehilangan tempat di puncak klasemen dan tersisih dari perburuan gelar juara, dan kemudian mengakhiri rekor juara 7 kali berturut-turut, di mana Benzema turut memenangi empat gelar.