Jabarkan Pengecualian dari tim nasional dari Thomas Müller

Pada 5 Maret 2019, pelatih tim nasional Joachim Löw mengonfirmasi bahwa ia akan merencanakan tanpa Müller di masa mendatang, bersama dengan rekan setim klubnya Jérôme Boateng dan Mats Hummels.[216]  Müller mengatakan setelah keputusan tersebut bahwa dia "marah dan terkejut" mengapa Löw memutuskan untuk mencoret dia dan rekan setimnya di Bayern.[217]  Namun, setelah Löw kemudian mengakui pada Maret 2021 bahwa dia sedang mempertimbangkan untuk membatalkan keputusannya dan mengizinkan pemain yang sebelumnya dilarang untuk ambil bagian dalam UEFA Euro 2020 mendatang, Müller menegaskan dia "pasti siap" untuk kembali ke tugas internasional, menyatakan keinginannya untuk menang, gelar lainnya bersama Jerman.[218]

Kembali ke tim dan Euro 2020

Pada 19 Mei 2021, Müller, bersama dengan Hummels, dimasukkan ke dalam skuad 26 pemain terakhir Jerman untuk UEFA Euro 2020, mengakhiri periode lebih dari dua tahun dikeluarkan dari tim nasional.[219]  Di babak 16 besar Euro 2020, Müller melewatkan peluang satu lawan satu melawan Inggris ketika skor 1-0 untuk yang terakhir;  namun, Inggris akhirnya mengalahkan Jerman 2-0.[220]  Oleh karena itu, Müller memainkan 15 pertandingan di Kejuaraan Eropa tanpa mencetak gol apapun.