Jabarkan Sebagai samurai dan kuge dari Klan Minamoto

Klan Minamoto terdiri dari 21 percabangan klan yang secara garis besar dapat dibagi menjadi dua golongan: klan Minamoto yang menjadi samurai dan klan Minamoto yang menjadi kuge (aristokrat istana).

Seiwa Genji yang dikenal sebagai klan samurai berasal dari keturunan Kaisar Seiwa. Klan ini berasal dari wilayah Kinai dan menyebar ke seluruh provinsi di Jepang. Keturunan Minamoto no Mitsunaka terbagi tiga, menjadi Settsu Genji (klan Minamoto asal Settsu), Yamato Genji, dan Kawachi Genji yang menetap di Kawachi.

Kawachi Genji merupakan klan Minamoto yang terkenal sebagai klan samurai. Minamoto no Yoshiie (Hachiman Tarō Yoshiie) merupakan garis utama keturunan Kawachi Genji, dan keturunannya yang bernama Minamoto no Yoritomo mendirikan Keshogunan Kamakura. Sebutan untuk klan Seiwa Genji dan percabangannya yang menjadi samurai adalah Buke Genji (klan Minamoto samurai). Walaupun Settsu Genji terus bertahan, sebagian anggota Settsu Genji membentuk klan yang disebut Tada Genji dan sebagian lagi membentuk Mino Genji. Begitu pula halnya dengan Kawachi Genji yang sebagian anggotanya membentuk Ishikawa Genji, Kai Genji, Hitachi Genji, Shimotsuke Genji (klan Ashikaga), dan Kōzuke Genji (klan Nitta).

Selain Seiwa Genji, klan Minamoto lain yang menjadi samurai adalah Saga Genji termasuk garis keturunan Minamoto no Tōru (putra ke-12 Kaisar Saga). Keturunan Saga Genji yang menjadi samurai adalah klan Watanabe yang menetap di Provinsi Settsu, sedangkan keturunan Kaisar Uda yang menjadi samurai sebagai klan Ōmi Genji (Sasaki Genji).

Klan Minamoto yang sukses sebagai aristokrat (kuge) adalah Murakami Genji yang berasal dari keturunan putra Kaisar Murakami. Klan Minamoto generasi pertama (putra-putri kaisar yang menjadi warga biasa) banyak mendapat kemudahan menjadi pejabat istana, sedangkan generasi kedua (cucu kaisar yang menjadi warga biasa) tidak lagi mendapat kemudahan seperti generasi pertama. Seusai zaman Heian, keturunan kaisar yang tidak berhak atas tahta banyak yang menjadi biksu dan biksuni. Nama klan Minamoto pun hampir-hampir tidak dipakai lagi hingga sampai pada zaman Edo, dan klan Minamoto (Genji) berubah menjadi nama keluarga Minamoto.