Jabarkan Dejima sekarang dari Dejima

Laut di sekeliling Dejima direklamasi pada tahun 1940 sewaktu renovasi pelabuhan Nagasaki, sehingga Dejima sudah menjadi satu dengan kota Nagasaki. Di wilayah sekitar Dejima dipasang marka pembatas, agar wisatawan masih bisa merasakan Dejima sebagai sebuah pulau.

Pemerintah kota Nagasaki memiliki anggaran 17 miliar yen untuk merekonstruksi Dejima. Pekerjaan rekonstruksi dimulai sejak tahun sejak 1996. Tahap I berupa renovasi 5 bangunan termasuk kediaman wakil kepala kantor perdagangan VOC selesai tahun 2000. Dalam tahap II yang selesai 1 April 2006 berhasil diselesaikan jalur perairan untuk keluar masuk kapal Belanda, sejumlah 5 bangunan termasuk rumah Kapitan (rumah Opperhoofd, kepala kantor perdagangan), kantor pejabat pengawas sekaligus wakil perdagangan pihak Jepang, serta gudang gula dan minuman keras.

Bila proyek rekonstruksi selesai, parit akan digali di sekeliling Dejima, dan bentuk asal Dejima yang seperti kipas lipat akan dikembalikan seperti semula.