Jabarkan 2002-2003 dari Yamaha YZR-M1

2002 adalah musim pertama yang memungkinkan 990 cc 4-tak membalap bersama 500 cc 2-tak. Dalam perubahan dari YZR500 mereka, Yamaha merancang YZR-M1 (untuk "Mission One") dengan mesin inline-4 karena format tersebut dianggap memiliki keseimbangan terbaik dengan rangka. Selain itu, Yamaha ingin mempertahankan handling superior YZR500, sehingga mesin M1 dirancang agar sesuai dengan sasis yang dikembangkan di sekitar struktur dasar YZR500. M1 dilengkapi dengan sistem manajemen mesin elektronik yang mengontrol pengereman mesin yang ada pada 4-tak. Mesin baru memiliki 5 katup per silinder, diasup oleh karburator dan dimulai dengan perpindahan 942 cc; di paruh kedua musim itu berkembang hingga batas regulasi 990 cc. Desain rangka juga berkembang sepanjang musim, dengan penyesuaian posisi pemasangan mesin dan perubahan bentuk tangki bahan bakar.

M1 diuji coba dan dikembangkan oleh Max Biaggi, John Kocinski, Norihiko Fujiwara dan Kyoji Namba sepanjang tahun 2001. Itu dilombakan di musim 2002 oleh Biaggi dan Carlos Checa di tim pabrikan, dan menjelang akhir musim M1 juga diberikan kepada Norifumi Abe, Olivier Jacque dan Shinya Nakano. Biaggi meraih dua kemenangan dan menempati posisi kedua di klasemen akhir seperti yang dilakukan Yamaha di kejuaraan pabrikan.

Pada tahun 2003, mesin beralih dari karburasi ke injeksi bahan bakar, dan sistem kontrol rem mesin diganti dengan Sistem Kontrol Idle yang secara otomatis menyesuaikan bukaan katup throttle pada dua dari empat silinder untuk meningkatkan stabilitas dan penanganan selama deselerasi. Pembalap M1 adalah Checa, Alex Barros, Olivier Jacque, Marco Melandri, Shinya Nakano dan Norifumi Abe, dan tidak ada kemenangan dan Yamaha berada di urutan ketiga dalam kejuaraan pabrikan.