Jabarkan Gerakan Reformed Injili dari Stephen Tong

Tong mengamati bahwa banyak gereja telah dipengaruhi oleh filsafat duniawi, dan gereja yang setia pada ajaran Alkitab yang asli sangat jarang. Pada tahun 1984, ia memulai Gerakan Reformed Injili dengan tujuan menjawab tantangan dari gerakan Kharismatik dan juga Liberalisme.

Tong mengadakan seminar-seminar teologi seperti Seminar Pembinaan Iman Kristen (SPIK) untuk memperkenalkan teologi Reformed kepada orang-orang di Jakarta. Seminar pertamanya, "Iman dan Agama", dihadiri oleh sekitar 1.200 perserta, dan seminar-seminar berikutnya dihadiri oleh masing-masing 1.800 peserta, 2.600 peserta, 3.200 peserta, dan 3.600 peserta. Ia kemudian mengadaptasi seminar-seminar tersebut menjadi buku-buku dan multimedia. Seminar-seminar SPIK menjadi awal bagi Lembaga Reformed Injili Indonesia (LRII), yayasan yang ia dirikan bersama Pdt. Caleb Tong dan Pdt. Yakub Susabda pada tahun 1986.

Pada tahun 1986, Tong mendirikan Sekolah Teologi Reformed Injili (STRI) untuk orang awam di Surabaya. Pada tahun 1987, ia memulai sekolah teologi serupa di Jakarta, pada tahun 1988 di Malang, dan pada tahun 1989 di Palembang, Bandung, Semarang, Solo, dan Yogyakarta.

Pada tahun 1989, Tong mendirikan Gereja Reformed Injili Indonesia (GRII) untuk menegakkan gereja yang "berbasiskan teologi Reformed, dengan mimbar yang menyampaikan khotbah ekspositoris, dan jemaat yang berkomitmen mengabarkan Injil". Saat ini, ia menggembalakan GRII Pusat yang berada di Kemayoran, Jakarta Pusat. Ia secara pribadi merancang Katedral Mesias, yang proposalnya membutuhkan waktu 15 tahun untuk disetujui.

Pada tahun 1996, ia mendirikan sebuah seminari untuk gerejanya, Institut Reformed, di Jakarta. Institut Reformed kemudian berganti nama menjadi Sekolah Tinggi Teologi Reformed Injili Internasional (STTRII). Pada tahun 2008, STTRII dipindahkan ke Reformed Millennial Center (RMCI) di Jakarta. STTRII telah menandatangani MoU dengan Westminster Theological Seminary (2011), Theologische Universiteit Kampen (2014), dan Theologische Universiteit Apeldoorn (2017).

Ia juga mendirikan Reformed Institute for Christianity and 21st Century di Washington D.C., Amerika Serikat.