Coba jelasin Variasi Strain dari Mycobacterium tuberculosis dong

Genotyping strain berguna dalam penyelidikan wabah tuberkulosis, karena memberikan bukti kepada penyidik untuk mencegah penularan dari orang ke orang. Pertimbangan situasi di mana orang A mengidap tuberkulosis dan yakin dia tertular dari orang B. Jika bakteri yang diisolasi dari setiap orang termasuk jenis yang berbeda, maka penularan dari B ke A secara definitif tidak terbukti. Namun, jika bakterinya adalah strain yang sama, maka ini mendukung (tetapi tidak secara definitif membuktikan) hipotesis bahwa B menginfeksi A.

Sampai awal 2000-an, strain M. tuberculosis diketik dengan pulsed field gel electrophoresis (PFGE). Sekarang telah digantikan oleh variable numbers of tandem repeats (VNTR), yang secara teknis lebih mudah untuk dilakukan dan memungkinkan diskriminasi yang lebih baik antar strain. Metode ini memanfaatkan adanya sekuens DNA berulang dalam genom M. tuberculosis.

Tiga generasi tipe VNTR untuk M. tuberculosis dicatat. Skema pertama, disebut pengulangan tandem tepat, hanya menggunakan lima lokus, tetapi resolusi yang diberikan oleh lima lokus ini tidak sebaik PFGE. Skema kedua, disebut mycobacterial interspersed repetitive unit, memiliki kemampuan membedakan sama bagus dengan PFGE. Generasi ketiga (mycobacterial interspersed repetitive unit - 2) menambahkan sembilan lokus lagi sehingga totalnya menjadi 24. Hal ini memberikan derajat resolusi yang lebih besar dari PFGE dan saat ini menjadi standar untuk typing M. tuberculosis. Namun, sehubungan dengan sisa-sisa arkeologi, bukti tambahan mungkin diperlukan karena kemungkinan kontaminasi dari bakteri tanah terkait.

Resistensi antibiotik pada M. tuberculosis biasanya terjadi karena akumulasi mutasi pada gen yang menjadi target antibiotik atau perubahan titrasi obat. M. tuberculosis dianggap multidrug-resistant (MDR TB) jika ia telah mengembangkan resistensi obat terhadap rifampisin dan isoniazid, yang merupakan antibiotik terpenting yang digunakan dalam pengobatan. Selain itu, M. tuberculosis yang resisten terhadap obat secara ekstensif (TB XDR) ditandai dengan resistensi terhadap isoniazid dan rifampisin, ditambah fluoroquinolone dan setidaknya satu dari tiga obat lini kedua yang dapat disuntikkan (yaitu, amikacin, kanamycin, atau capreomycin).