Jabarkan Batas-batas Wilayah dari Bojongsari, Alian, Kebumen

Utara: Desa Surotrunan dan Kecamatan Poncowarno

Selatan: Kecamatan Kebumen dan Kecamatan Poncowarno

Desa Bojongsari sebagian besar memiliki wilayah dataran rendah sebagian kecil dataran tinggi berupa lereng perbukitan berada di sisi utara dan timur. Namun secara umum topografinya berupa dataran rendah bergelombang. Ketinggian wilayah berada di antara 20-120 meter di atas permukaan air laut. Bagian barat dilintasi oleh sungai besar yaitu Sungai Kedungbener dan dibagian selatan terdapat sungai kecil yang dikenal dengan nama Kalen Lodang. Sehingga wilayah barat dan selatan merupakan wilayah rawan banjir Wilayah Desa Bojongsari banyak digunakan sebagai lahan perswahan terlebih terdapat saluran irigasi induk dari Waduk Wadaslintang dan Sungai Lukulo yang membelah desa ini.