Jabarkan 2006 dari Nicole Vaidišová

Vaidišová meraih gelar keenamnya pada turnamen Tier 3 di Strasbourg. Pada bulan Juni, Vaidišová meraih semifinal di Prancis Terbuka. Ia mengalahkan petenis peringkat pertama dunia pada saat itu, Amelie Mauresmo,6-7, 6-1, 6-2 pada babak keempat dan Venus Williams 6-7, 6-1, 6-3 di perempat final. Tetapi, Vaidišová kalah dari Svetlana Kuznetsova, 7-5, 6-7, 2-6. Pada turnamen Wimbledon, ia terhenti di babak keempat, ia dikalahkan oleh Li Na. Vaidišová sekarang setidaknya mencapai babak 16 besar pada tiap turnamen Grand Slam.

Pada bulan Juli, Vaidišová menyumbangkan 2 angka untuk Republik Ceko pada saat melawan Prancis dalam Play-off World Group I di Fed Cup. Bagaimanapun, Republik Ceko kalah 3-2 dari Prancis. Vaidišová mencapai semifinal pada turnamen di Stanford, kalah 7-5, 6-2 dari Kim Clijsters. Vaidišová kemudian mencapai semifinal pada turnamen Tier 1 di San Diego, tetapi ia dikalahkan Clijters lagi. Setelah sukses di San Diego, Vaidišová mencapai peringkat ke-9, menjadi petenis yang termuda ke-12 dalam sejarah untuk menapaki peringkat 10 besar pada umur 17 tahun, 3 bulan, dan 2 minggu.

Pada AS Terbuka, ia kalah dari Jelena Jankovic di babak ketiga. Pada turnamen di Beijing, ia kalah di babak kedua dari Ai Sugiyama setelah pada babak pertama ia mendapatkan bye.

Vaidišová mengakhiri tahun 2006 dengan peringkat ke-10.