Jabarkan Dinas militer dari Josef Mengele

Ideologi Nazisme menggabungkan elemen antisemitisme, kebersihan ras, dan eugenika, dan dikombinasi dengan semangat pan-Jermanisme dan territorial ekspansionisme teritori dengan tujuan meraih sebanyak mungkin Lebensraum (ruang hidup) bagi rakyat Jerman. Jerman Nazi melakukan usaha meraih wilayah baru ini dengan menyerang Polandia dan Uni Soviet, dan mendeportasi atau membunuh etnis Yahudi dan Slavia yang hidup di dalamnya, yang dimana oleh Nazi mereka dianggap lebih rendah dari Ras Arya.

Mengele bergabung dengan Partai Nazi pada 1937 dan Schutzstaffel (SS; pasukan pertahanan) pada 1938. Ia mendapatkan pelatihan dasar pada 1938 bersama dengan Gebirgsjäger (pasukan infanteri ringan pegunungan) dan dipanggil untuk berdinas di Wehrmacht (angkatan bersenjata Nazi) pada Juni 1940, beberapa bulan sebelum pecahnya Perang Dunia II. Ia lalu menjadi sukarelawan pada bidang medis di Waffen-SS, cabang pasukan tempur SS, dimana disana ia berpangkat SS-Untersturmführer (letnan dua) di batalyon medis hingga November 1940. Ia kemudian ditugaskan ke SS-Rasse- und Siedlungshauptamt (Markas Pusat Urusan Ras dan Pemukiman SS) di Poznań, yang bertugas mengevalusi kandidat untuk proses Jermanisasi.

Pada Juni 1941, Mengele dipindah tugaskan ke Ukraina, dimana ia dianugerahi Salib Besi kelas kedua. Pada Januari 1942, ia bergabung dengan Divisi Panser SS ke-5 Wiking sebagai perwira medis. Setelah menyelamatkan dua tentara Jerman dari tank yang terbakar, ia dianugerahi Salib Besi kelas satu, dan Lencana Luka hitam, dan Medali Kepedulian Rakyat Jerman. Ia dinyatakan tidak fit untuk dinas selanjutnya setelah terluka dalam pertempuran didekat Rostov-on-Don. Setelah kesembuhannya, ia kembali ke Markas Pusat Urusan Ras dan Pemukiman SS di Berlin, dan melanjutkan pekerjaan dengan von Verschuer, yang sekarang menjadi direktur Institut Kaisar Wilhelm untuk Antropologi, Keturunan Manusia, dan Eugenika. Mengele dipromosikan sebagai SS-Hauptsturmführer (kapten) pada April 1943.