Jabarkan Penangkapan dan hukuman mati dari Jacques de Molay

Mendengar bahwa terdapat rumor dan tuduhan dalam Tarekat Kenisah, Raja Philippe menginginkan Kesatria Kenisah ditangkap dan harta Tarekat untuk disita sehingga masuk dalam kas kerajaan dan Ia dapat bebas dari hutangnya terhadap Tarekat yang telah menumpuk. Pada tanggal 14 September, Phillippe mengirimkan perintah rahasia kepada agen kerajaan ke seluruh Perancis untuk mempersiapkan diri dalam melakukan penangkapan besar-besaran terhadap kesatria Kenisah di seluruh negeri. Sebelum penangkapan dilakukan, Jacques de Molay berada di Paris dan menjadi pengusung jenazah dalam penguburan Catherine dari Courtenay, istri Pangeran Charles dari Valois dan ipar Raja Philippe. Sehari setelahnya, yaitu tanggal 13 Oktober 1307, Molay ditangkap beserta kesatria lainnya di loji utama di Paris. Philipe melakukan penangkapan atas tuduhan ajaran sesat.

Pada saat interogasi di Universitas Paris pada tanggal 24 dan 25 Oktober, Molay mengaku bahwa inisiasi di Tarekatnya melibatkan "penolakan Kristus dan penginjakan salib". Dia juga dipaksa untuk menulis sebuah surat untuk mengajak kesatria Kenisah lain mengakui perbuatannya. Di bawah tekanan Philippe IV, Paus Klemens V memerintahkan penangkapan seluruh kesatria Kenisah di seluruh Negara Kristen.

Paus masih ingin mendengarkan kesaksian dari Molay dan memerintahkan dua kardinal ke Paris pada bulan Desember 1307. Di hadapan kardinal, Molay menarik kembali pengakuannya. Karena hal itu, terjadi pertikaian kekuasaan di antara raja dan paus, yang kemudian terselesaikan pada bulan Agustus 1308, di mana kedua pihak sepakat untuk melakukan penyelidikan terpisah.  Paus kemudian mengeluarkan bulla kepausan, Faciens misericordiam, sebuah prosedur untuk menuntut Tarekat yang membedakan penuntutan anggota Tarekat secara tersendiri dengan penuntutan keseluruhan Tarekat. Paus Klemens kemudian mengadakan konsili di Vienne pada tahun 1310 untuk menentukan nasib Tarekat Kenisah. Sementara itu, pejabat tinggi Tarekat, termasuk Molay, akan diadili oleh Paus.

Di istana kerajaan di Chinon, Molay kemudian diinterogasi kembali oleh kardinal dan disaksikan oleh agen kerajaan. Dia kemudian kembali mengaku seperti pada saat interogasi pertama. Pada bulan November 1309, Komisi Kepausan untuk Kerajaan Prancis memulai audiensi. Pada saat audiensi, Molay kembali menarik pengakuannya dan menolak tuduhan yang ditujukan pada Tarekatnya. Pada akhirnya, Philippe menggunakan pengakuan paksa pada tahun 1307 untuk menjatuhkan hukuman mati pada Molay dan 54 kesatria Kenisah lainnya pada tanggal 10-12 Mei 1310.

Konsili Vienne yang ingin diadakan Paus kemudian ditunda sampai dua tahun dikarenakan pengadilan terhadap petinggi Tarekat yang berlangsung lama. Pada akhirnya, Konsili Vienne kembali diadakan pada tahun 1312. Melalui konsili tersebut, Tarekat Kesatriaan Kenisah secara resmi dibubarkan oleh perintah paus pada tanggal 22 Maret 1312.

Jacques de Molay dieksekusi mati dengan cara dibakar bersama dengan Geoffrey de Charney, seorang pemimpin kesatria Kenisah dari Normandia. Eksekusi dilakukan di Ile des Javiaux, di Sungai Seine, Paris. Diperkirakan Molay dieksekusi pada tanggal 11 Maret 1314, meskipun beberapa riset juga menuliskan tanggal eksekusi pada 18 Maret 1314.