Jabarkan Fakultas dari Universitas PGRI Yogyakarta

Setiap fakultas dipimpin oleh dekan dibantu oleh tiga pembantu dekan, dekan juga sebagai ketua Senat Fakultas, serta Program Studi dipimpin oleh Ketua Program Studi.

Lembaga dan pusat yang dimiliki UPY adalah lembaga pengabdian masyarakat dan pusat penelitian. Unsur pelaksana administrasi terdiri dari biro-biro, bagian-bagian dan bentuk lain yang dianggap perlu. Biro yang dimiliki UPY adalah BAU, BAAK RENSI, dan Biro Keuangan, yang masing-masing mempunyai bagian-bagian. Unsur penunjang terdiri dari UPT, laboratorium, poliklinik dan bentuk lain yang dianggap perlu. UPT yang dimiliki UPY yaitu UPT perpustakaan, UPT komputer, UPT bahasa. Laboratorium dikelola masing-masing program studi. Bentuk laboratorium sesuai dengan program studi yang mengelola (Lab. Sejarah, Lab Pertanian, dll).