Jabarkan Prophets of War dari Systematic Chaos

"Prophets of War" ditulis oleh James LaBrie, lirik terinspirasi pada buku Joseph C. Wilson Politik Kebenaran''. Lirik berbicara tentang kemungkinan motif tersembunyi di balik Perang Irak. Judul adalah permainan kata, dimana "prophets" of the war, juga bisa menjadi "profit" from the War.

The Ministry of Lost Souls

Dengan panjang 14:57, "The Ministry of Lost Souls" adalah lagu terpanjang kedua di album. Melalui lirik lagu, Petrucci menceritakan seseorang yang meninggal dalam proses menyelamatkan seorang wanita dari tenggelam. Namun, wanita yang diselamatkan penuh dengan "penyesalan dan kesedihan" sampai dia mampu untuk kembali bersatu dengan penyelamat nya. Judul untuk awal lagu selama rekaman yaitu, "Schindler Lisp" dan itu adalah lagu keempat yang ditulis.