Jabarkan Penjualan Pokémon Yellow dari Pokémon Red, Blue, dan Yellow

Di Jepang, permainan tersebut terjual sebanyak 1.549.000 unit pada tahun 1998, menjadikannya permainan video terlaris ketiga di Jepang pada tahun 1998.

Sebelum dirilis di Amerika Utara, Nintendo memperkirakan bahwa permainan tersebut akan menghasilkan $75 juta pada musim liburan tahun 1999. Bundel Game Boy Color Pokémon Yellow diprediksi akan menjadi mainan paling populer kedua pada musim liburan tersebut. Di Amerika Utara, permainan ini menerima sekitar 150.000 pemesanan pra-penjualan. Bundel tersebut debut di peringkat ke-2 dalam penjualan permainan video dan menduduki peringkat ke-1 satu minggu kemudian. Kartrid standar terjual lebih dari 600.000 unit dalam minggu pertamanya dan satu juta kopi dalam waktu sepuluh hari, menjadikannya permainan genggam terlaris dalam waktu tercepat saat dirilis. Pokémon: The First Movie, sebuah film yang dirilis pada waktu yang sama dengan Yellow, diharapkan dapat meningkatkan penjualannya. Seorang juru bicara Nintendo menyebutkan bahwa permintaan tinggi terhadap Game Boy Color selama musim Natal tahun 1999 disebabkan oleh Yellow. Pada bulan Desember, Donkey Kong 64 berada di peringkat teratas di atas Pokémon Yellow dan Gran Turismo 2 dalam daftar bulanan.

Gwenn Friss dari Cape Cod Times menyebutnya sebagai salah satu barang paling populer pada musim Natal 1999, membandingkannya dengan mainan Natal populer dari tahun-tahun sebelumnya seperti Furby dan Tickle me Elmo. Thomas Content dari USA Today mengulang perbandingan tersebut, dengan mengomentari bahwa Yellow "siap mengalahkan" mereka. Ia menambahkan bahwa Yellow, bersama dengan Red dan Blue, bertanggung jawab atas peningkatan penjualan Game Boy dari 3,5 juta unit pada tahun 1998 menjadi 8 juta unit pada tahun 1999. The Idaho Statesman menyebutnya sebagai "judul baru paling populer untuk Game Boy Color". Pokémon Yellow adalah permainan video terlaris ketiga di Amerika Utara pada tahun 1999, dengan empat peringkat teratas lainnya ditempati oleh judul-judul Pokémon lainnya. Permintaan terhadap Yellow menyebabkan Target mengeluarkan permintaan maaf karena tidak dapat memenuhi "permintaan yang belum pernah terjadi sebelumnya". Toko-toko yang diwawancarai oleh CNET kehabisan stok Yellow. Seorang juru bicara FuncoLand menyebutkan penurunan penjualan disebabkan oleh kelangkaan Game Boy Color dan Pokémon Yellow.

Untuk peluncurannya di Eropa, sebanyak 2 juta unit dikirim ke seluruh benua tersebut pada bulan Juni 2000, termasuk 500.000 di Britania Raya. Yellow menjadi judul Pokémon terlaris dengan penjualan tercepat di Britania Raya. Di negara ini, permainan tersebut menerima penghargaan Double Platinum dari ELSPA untuk penjualan lebih dari 600.000 unit dan menghasilkan lebih dari £20 juta atau $30.000.000 (setara dengan $51.000.000 pada tahun 2022). Di Jerman, Yellow menerima penghargaan Double Platinum dari Verband der Unterhaltungssoftware Deutschland (VUD) untuk penjualan di atas 400.000 kopi pada awal tahun 2001.