Jabarkan Presiden dari Milton Obote

Sebagai perdana menteri, Obote dan Idi Amin (saat itu wakil komandan angkatan bersenjata) terlibat dalam rencana penyelundupan emas. Obote membubarkan parlemen saat para anggotanya meminta dilakukan penyelidikan. Ia kemudian melakukan kudeta terhadap Mutesa, yang mengkritiknya dalam kasus tersebut, dan menyatakan dirinya sebagai presiden pada 2 Maret 1966. Pemerintahannya yang sosialis tidak disukai negara-negara Barat dan banyak mengalami masalah dalam bidang militer. Pada tahun 1971, Amin menggulingkan pemerintahannya dan ia melarikan diri ke Tanzania.

Pemerintahan Amin sendiri juga digulingkan pasukan Tanzania pada tahun 1979. Pada pemilu tahun 1980, partai UPC pimpinan Obote berhasil menang, tetapi lawan-lawannya menuduhnya curang dalam pemilu. Hal ini mengakibatkan pemberontakan yang dipimpin oleh Yoweri Museveni. Sekitar 100 hingga 300 ribu orang meninggal dunia dalam konflik antara kedua pihak tersebut.