Jabarkan Pengambilalihan oleh Lufthansa dari Swiss International Air Lines

Pada awal operasinya, maskapai ini selalu mengalami kerugian, hingga pada tahun 2006 Swiss membukukan laba sebesar 220 juta dolar AS. Untuk efisiensi (dan persiapan pengambilalihan oleh Lufthansa), maskapai ini menstandardisasi armada utamanya dengan hanya mengoperasikan pesawat Airbus. Kenudian, pada 22 Maret 2005, Lufthansa menyatakan akan mengambil alih Swiss yang diharapkan tuntas pada 2007 dengan integrasi operasi Swiss dengan Lufthansa mulai akhir 2005. Swiss bergabung dengan Star Alliance pada 1 April 2006.

Setelah diambilalih oleh Lufthansa Group, armada regional berupa Embraer ERJ dan Saab dari era Crossair diubah menjadi Avro RJ, yang diterbangkan oleh anak perusahaan yang sepenuhnya dimiliki, Swiss Global Air Lines. Sisa armada dirasionalisasi dan sekarang sebagian besar terdiri dari pesawat Airbus, selain Boeing 777.

Swiss juga menegosiasikan kembali kontrak pemasok mereka, termasuk penanganan di darat, pemeliharaan, layanan makanan, dan tenaga kerja. Pemegang saham Swiss menerima opsi berbasis kinerja untuk saham mereka. Pembayaran dilakukan pada tahun 2008, dan jumlahnya tergantung seberapa baik saham Lufthansa dibandingkan dengan saham pesaing. Lufthansa terus mempertahankan Swiss sebagai merek terpisah.

Pada 18 Agustus 2011, Swiss memperkenalkan logonya yang baru yang menyerupai logo Swissair yang sudah tidak beroperasi.