Jabarkan Perang Klon (2008–2014, 2020) dari Darth Vader

Anakin adalah karakter utama di semua musim The Clone Wars. Sebagai Ksatria Jedi, ia memimpin Legiun ke-501 dalam misi dengan tuannya Obi-Wan dan muridnya Ahsoka Tano selama perang. Beberapa tindakan Anakin yang dilakukan karena kepedulian terhadap Ahsoka melanggar kode Jedi, seperti menyiksa tahanan yang mungkin mengetahui lokasinya saat dia hilang.[98] Sepanjang seri ada beberapa referensi untuk Anakin akhirnya jatuh ke sisi gelap, termasuk visi masa depannya sebagai Darth Vader di musim ketiga, dan kekecewaan dengan Dewan Jedi setelah mereka salah menuduh Ahsoka mengebom Kuil Jedi di musim kelima. Sementara dia kemudian dimaafkan setelah pelakunya ditemukan, dia tetap memilih untuk meninggalkan Jedi Order. Anakin muncul sebagai Vader di adegan terakhir dari seri terakhir, beberapa saat setelah Revenge of the Sith. Dia menyelidiki lokasi jatuhnya Penghancur Bintang Ahsoka, yang runtuh selama pertempurannya dengan pasukan kloningnya setelah Darth Sidious mengeluarkan Order 66, mengubah kloning itu melawan Jedi. Menemukan lightsaber di antara reruntuhan, Vader berasumsi bahwa mantan Padawannya telah tewas dan pergi dengan lightsaber.