Saya mau tau Sengkuni 2019 (2019). dari Emha Ainun Nadjib

Mlungsungi (2022). Disutradarai bersama oleh Jujuk Prabowo, Fajar Suharno, Untung Basuki, dan Meritz Hindra.

Waliraja Rajawali (2022). Dipentaskan oleh Teater Perdikan dan Gamelan KiaiKanjeng.

Rayya, Cahaya di Atas Cahaya (2011). Ditulis bersama Viva Westi.

Kerajaan Indonesia (2006). Diterbitkan oleh Zaituna.

Indonesia Apa Adanya (2016). Diterbitkan oleh Mizan.

Hidup Itu Harus Pintar Ngegas dan Ngerem (2016). Diterbitkan oleh Noura Publishing.

Urusan Laut Jangan Dibawa Ke Darat (2018). Diterbitkan oleh Pustaka Narasi.

Allah Tidak Cerewet Seperti Kita (2019). Diterbitkan oleh Noura Publishing.

Islam Itu Rahmatan Lil Alamin Bukan Untuk Kamu Sendiri (2020). Diterbitkan oleh Noura Publishing.

Kalau Kamu Ikan, Jangan Ikut Lomba Terbang (2021). Diterbitkan oleh Noura Books.

Berserahlah, Biarkan Allah Mengurus Hidupmu (2022). Diterbitkan oleh Noura Books.

Tuhan Aku Berguru Kepada-Mu (1980). Dimusikpuisikan berrsama Teater Dinasti di Taman Ismail Marzuki (TIM).

Isro` Mi’roj Yang Asyik (1986). Dimusikpuisikan di UGM, Yogyakarta.

Talbiyah Cinta (1996). Dipentaskan di RCTI.

Jangan Cintai Ibu Pertiwi (2001).

Perahu Retak (1995). Seluruh lirik ditulis oleh Cak Nun, dan lagu oleh Frangky Sahilatua.

Dangdut Kesejukan (2001). Syair ditulis oleh Cak Nun.

September 1991, Cak Nun menerima penghargaan Anugerah Adam Malik di Bidang Kesusastraan yang diberikan Yayasan Adam Malik. Penyerahan anugerah ini diselenggarakan di Gedung Sekretariat ASEAN, Jakarta. Keputusan anugerah ini berdasarkan hasil seleksi lima orang juri, yaitu Rosihan Anwar, Adiyatman, Lasmi Jahardi, Wiratmo Soekito, dan Amy Prijono.

Bulan Maret 2011, Cak Nun memperoleh Penghargaan Satyalancana Kebudayaan 2010 dari Negara Kesatuan Republik Indonesia. Menurut Menteri Kebudayaan dan Pariwisata (Menbudpar) Jero Wacik, penghargaan diberikan berdasarkan pertimbangan bahwa penerimaya memiliki jasa besar di bidang kebudayaan yang telah mampu melestarikan kebudayaan daerah atau nasional serta hasil karyanya berguna dan bermanfaat bagi masyarakat, bangsa, dan negara. Penerimaan penghargaan ini diwakili oleh putranya, Noe Letto.

Pada pergelaran Festival Film Indonesia (FFI) 2012, Cak Nun dinominasikan dalam kategori penulis Cerita Asli Terbaik untuk cerita film Rayya, Cahaya di Atas Cahaya. Film ini juga mendapatkan dua nominasi lain yaitu Tio Pakusadewo sebagai Pemeran Utama Pria Terbaik, dan Christine Hakim sebagai Pemeran Pendukung Wanita Terbaik.

Dalam Kongres HIPIIS (Himpunan Pengembangan Ilmu-Ilmu Sosial) ke-10 yang diselenggarakan tahun 2017, Cak Nun memperoleh HIPIIS Social Sciences Award 2017 karena dipandang sebagai contoh ilmuwan sosial yang objektif dan mandiri, serta merupakan sosok yang kritis, independen, dan produktif. Cak Nun memperoleh penghargaan ini bersama ilmuwan Prof. Dr. R. Siti Zuhro M.A.