Jabarkan Isi cerita dari Neon Genesis Evangelion

Berlatar waktu tahun 2015, Bumi mengalami perubahan drastis akibat bencana katastropik yang dinamakan "Second Impact". Bencana itu terjadi karena sebuah meteor menghantam bumi dan mengakibatkan naiknya permukaan laut di seluruh dunia. Namun, sesungguhnya narasi bahwa Second Impact disebabkan oleh meteor tersebut merupakan propaganda untuk menyembunyikan fakta bahwa bencana ini disebabkan oleh eksperimen pada satu makhluk cahaya raksasa yang dikenal sebagai Angel pertama bernama Adam. Secara tidak langsung kejadian ini juga mengakibatkan kemusnahan beberapa negara kepulauan. Akibatnya, iklim dunia berubah drastis.

Seorang remaja bernama Shinji Ikari datang ke kota Tokyo untuk memenuhi permintaan ayahnya. Tetapi harapannya untuk dapat diterima dan diakui oleh ayahnya kandas saat dia mengetahui bahwa tujuan dirinya dipanggil hanya untuk mengendalikan EVA, yaitu makhluk biomekanis humanoid yang merupakan senjata untuk melawan Angel. Awalnya Shinji menolak, karena ia belum pernah mengendalikan EVA. Selain itu, tujuannya datang bukan untuk dimanfaatkan oleh ayahnya.

Hatinya luluh saat melihat Rei Ayanami, yang tetap berusaha menjadi pilot meski mengalami luka parah. Demi melindungi yang lain sekaligus menunjukkan eksistensi dirinya, Shinji menaiki sang makhluk (EVA-01) yang ternyata bisa dia kuasai dengan cepat. Saat pertempuran pertamanya sebagai pilot, dia dapat melihat satu sisi lain EVA, yang bisa berubah menjadi "berserk" dan menghabisi musuh dengan sadis. Semakin jauh cerita, Shinji bukan hanya mengendalikan EVA untuk menghadapi monster besar yang menyerang kota Tokyo. Dia juga harus melawan musuh terbesar yang berada di dalam dirinya sendiri.

Pilot pertama EVA yang ditemuinya adalah Rei Ayanami yang dijuluki The First Child (anak pertama), kemudian datang Asuka yang sangat hiper dengan julukan The Second Child, sedangkan Shinji adalah The Third Child. Ada dua pilot lain, yakni sahabat Shinji sendiri yaitu Toji, dan remaja yang dikirim oleh SEELE yaitu Kaworu Nagisa.

Sosok Shinji pada versi manga dan anime sedikit berbeda. Dalam anime, Shinji terkesan sebagai sosok yang kelam dan cenderung tidak peduli pada dirinya apalagi pada orang sekitar. Sosoknya dibuat sedikit lebih ceria dalam versi manga.

Perbedaan pada kedua versi juga terdapat pada konten manga yang tidak ada dalam anime. Potongan-potongan cerita yang hilang dalam anime sedikit terjawab oleh manga. Contohnya adalah seperti apa yang Shinji mimpikan pada saat dia diserang oleh Angel kelima yang bernama Ramiel, dan lain-lainnya.