Jabarkan Wilayah barat dari Divisi Utama Liga Indonesia 2005

Arema Malang (Promosi dari Divisi Satu)

Persekabpas Pasuruan (Promosi dari Divisi Satu)

PSDS Deli Serdang (Promosi Dari Divisi Satu)

Persegi Gianyar (Promosi dari Divisi Satu)

Persema Malang (Promosi dari Divisi Satu)

Persiba Balikpapan (Promosi dari Divisi Satu)

Persibom Bolaang Mongondow (Promosi dari Divisi Satu)

Persijap Jepara (Promosi dari Divisi Satu)

Persmin Minahasa (Promosi dari Divisi Satu)

Petrokimia Putra Gresik (Promosi dari Divisi Satu)

Tim-tim yang lolos ke babak 8 besar adalah:

Wilayah Barat: Persija Jakarta, Arema Malang, PSIS Semarang, PSMS Medan

Wilayah Timur: Persipura Jayapura, PSM Makassar, Persik Kediri, Persebaya Surabaya

Babak 8 Besar dilaksanakan pada 16, 18 dan 21 September dan dibagi dalam dua grup:

Grup Barat: Stadion Utama Gelora Bung Karno, Jakarta: Persija, Persebaya, PSM, PSIS

Grup Timur: Stadion Mandala, Jayapura: PSMS, Arema, Persipura, Persik

Catatan: Sehari sebelum pertandingan hari terakhir dilaksanakan, Persebaya mengundurkan diri dengan alasan bahwa keamanan para pendukungnya (yang dikenal dengan nama Bonek) tidak dapat terjamin lagi. Permintaan pengunduran diri disampaikan sendiri oleh Ketua Umum Persebaya yang juga merupakan Wali kota Surabaya, Bambang D.H.. Akibatnya, Persebaya dihukum tidak boleh mengikuti kompetisi liga nonamatir di lingkungan PSSI selama dua tahun berturut-turut serta denda sebesar Rp. 25 juta. Setelah melalui banding, hukuman ini lalu dikurangi menjadi 16 bulan.