Jabarkan Kasus hukum dari Harun Yahya

Selain gugatan fitnah terkait Kebohongan Holocaust, Oktar terlibat pula dalam banyak kasus lainnya. Meskipun sebagian besarnya tidak berkaitan dengan kreasionisme atau agama, juru bicara BAV mengatakan bahwa Oktar digugat "karena gagasan-gagasannya.” Pada musim panas tahun 1986, Oktar ditahan menyusul pernyataannya "Saya berasal dari bangsa Ibrahim dan etnis Turki" dalam sebuah wawancara di surat kabar. Menurut New Humanist, Oktar ditahan karena menyebarkan revolusi teokrasi. Dia ditahan selama 19 bulan, meskipun tidak pernah dituntut secara resmi.

Pada tahun 1991, Oktar ditahan atas kepemilikan kokain. Oktar membela diri dengan mengatakan bahwa kokain tersebut dimasukkan ke dalam buku-buku di perpustakaannya oleh petugas keamanan, yang juga mengisi makanannya dengan kokain. Dia kemudian dibebaskan.

Sejumlah akademisi yang mengajarkan teori evolusi dilecehkan, diancam, dan difitnah melalui selebaran BAV yang menyebut mereka "Maois." Pada tahun 1999, enam pemrotes memenangkan gugatan hukum terhadap BAV terkait tuntutan fitnah tersebut, dan mereka masing-masing memperoleh $4.000.

Pada tahun 1999, Oktar dituntut dan ditahan karena melakukan ancaman demi keuntungan pribadi dan membuat organisasi dengan tujuan melakukan kejahatan. Pihak pengacara BAV mengklaim bahwa sejumlah HAM dilanggar dalam operasi polisi tersebut, termasuk penggunaan kekerasan pada penangkapan dan proses selanjutnya. Proses peradilan berlangsung selama lebih dari dua tahun. Dalam prosesnya, sebagian besar penuntut menarik kembali gugatannya, akbatnya kasus ini ditutup sedangkan Oktar dan para anggota BAV lainnya dibebaskan.

Kasus tahun 1999 dibuka kembali pada tahun 2008. Tuntutan dari pihak jaksa, yang disebarkan oleh surat kabar Cumhuriyet, mengklaim adanya pemerasan dan penyuapan oleh BAV. Di antaranya adalah bahwa BAV dituduh memanfaatkan anggota perempuannya untuk memikat pemuda dari keluarga kaya dengan janji kepuasan seksual asalkan mereka mau menghadiri acara-acara tertentu. Diklaim bahwa kegiatan seksual ribuan orang direkam dengan kamera tersembunyi untuk tujuan pemerasan. Anggota yang ingin keluar diancam akan disebarkan rekaman seksnya. Hakim Ketua mengumumkan dalam persidangan pada tanggal 29 Februari 2008, bahwa kesaksian yang diperoleh melalui cara-cara yang melanggar hukum tidak dapat dianggap sebagai bukti berdasarkan Pasal 148 hukum pidana.

Oktar dituduh membuat organisasi ilegal demi kepentingan pribadi. Dia dan 17 anggota organisasinya dihukum tujuh tahun penjara. Oktar lalu mengajukan banding atas putusan tersebut. Pada bulan Mei 2010, Pengadilan Banding membatalkan putusan itu dan membebaskan Oktar dan para anggotanya dari tuduhan.