Jabarkan Rekonstruksi dan pemberontakan pascaperang dari Chechnya

Pemberontak Chechnya terus memerangi pasukan Rusia dan melakukan serangan. Pada bulan Oktober 2002, 40-50 pemberontak Chechnya merebut teater Moskow dan menyandera sekitar 900 warga sipil. Krisis berakhir dengan 117 sandera dan 50 pemberontak tewas, sebagian besar karena aerosol yang tidak diketahui yang dipompa ke dalam gedung oleh pasukan khusus Rusia untuk melumpuhkan orang-orang di dalamnya.

Menanggapi meningkatnya terorisme, Rusia memperketat cengkeramannya di Chechnya dan memperluas operasi anti-terorisnya di seluruh wilayah. Rusia memasang rezim Chechnya pro-Rusia. Pada tahun 2003, sebuah referendum diadakan pada sebuah konstitusi yang mengintegrasikan kembali Chechnya ke dalam Rusia tetapi memberikan otonomi terbatas. Menurut pemerintah Chechnya, referendum disahkan dengan 95,5% suara dan hampir 80% jumlah pemilih. The Economist skeptis terhadap hasilnya dengan alasan bahwa "sedikit di luar Kremlin menganggap referendum itu adil".

Pada September 2004, pemberontak separatis menduduki sebuah sekolah di kota Beslan, Ossetia Utara, menuntut pengakuan kemerdekaan Chechnya dan penarikan mundur Rusia. 1.100 orang (termasuk 777 anak-anak) disandera. Serangan itu berlangsung selama tiga hari, mengakibatkan kematian lebih dari 331 orang, termasuk 186 anak-anak. Setelah pengepungan sekolah tahun 2004, presiden Rusia Vladimir Putin mengumumkan reformasi keamanan dan politik, menutup perbatasan di wilayah Kaukasus dan mengungkapkan rencana untuk memberi pemerintah pusat lebih banyak kekuasaan. Dia juga bersumpah untuk mengambil tindakan lebih keras terhadap terorisme domestik, termasuk serangan pendahuluan terhadap separatis Chechnya. Pada 2005 dan 2006, pemimpin separatis Aslan Maskhadov dan Shamil Basayev terbunuh.

Sejak 2007, Chechnya diperintah oleh Ramzan Kadyrov. Pemerintahan Kadyrov dicirikan oleh korupsi tingkat tinggi, catatan hak asasi manusia yang buruk, penggunaan penyiksaan secara luas, dan kultus kepribadian yang berkembang. Tuduhan pembersihan anti-gay di Chechnya awalnya dilaporkan pada 1 April 2017.

Pada April 2009, Rusia mengakhiri operasi kontra-terorismenya dan menarik sebagian besar tentaranya. Pemberontakan di Kaukasus Utara berlanjut bahkan setelah tanggal tersebut. Imarah Kaukasus sepenuhnya mengadopsi prinsip-prinsip kelompok jihadis Salafi melalui kepatuhannya yang ketat terhadap ketaatan Sunni Hanbali terhadap interpretasi literal Al-Qur'an dan Sunnah.