Jabarkan Prof. R.A. Soehardi,S.H. dari Universitas Atma Jaya Yogyakarta

Drs. A.J. Liem Sioe Siet

Prof. Drs. Oey Liang Lee

Awalnya sebagai cabang Universitas Atma Jaya Jakarta, kemudian memisahkan dan menjadi independen di bawah Yayasan Slamet Rijadi pada tanggal 31 Agustus 1973. Dimulai dengan meminjam ruang kelas di IKIP Sanata Dharma, kini Universitas Sanata Dharma, pembangunan gedung kampus sendiri selesai pada tahun 1980 yang berlokasi di Jalan Demangan Baru 28, berseberangan dengan Universitas Sanata Dharma. Dengan semakin berkembangnya jumlah mahasiswa, pada tahun 1990 bertepatan dengan pesta peraknya, rektorat dan Fakultas Teknik menempati gedung baru di Jalan Babarsari. Pada tahun 1995, Fakultas Ekonomi dan Program Magister juga menempati gedung baru, di seberang gedung rektorat, juga di Jalan Babarsari Yogyakarta.

Universitas Atma Jaya Yogyakarta telah terakreditasi "UNGGUL" berdasarkan surat Keputusan Direktur Dewan Eksekutif Badan Akreditasi Nasional Perguruan Tinggi BAN-PT No. 335/SK/BAN-PT/Ak.KPPT/V/2023. Universitas ini mendapat peringkat keenam perguruan tinggi swasta terbaik di Indonesia versi Quacquarelli Symonds (QS) Asian University Rankings (AUR) 2022.