Jabarkan Penerus Mouseion dari Perpustakaan Aleksandria

Berdasarkan bukti-bukti yang terpencar, pada abad ke-4, sebuah lembaga yang disebut "Mouseion" mungkin telah didirikan kembali di tempat yang berbeda di Aleksandria. Namun, tidak ada satu keterangan pun mengenai lembaga ini. Lembaga ini mungkin memiliki beberapa buku, tetapi skalanya jelas tidak dapat dibandingkan dengan Perpustakaan Besar Aleksandria. Pada akhir abad ke-4, perpustakaan Serapeion mungkin memiliki koleksi buku terbesar di Aleksandria. Pada dasawarsa 370-an dan 380-an, Serapeion juga masih menjadi tempat peziarahan bagi penganut paganisme.

Selain memiliki perpustakaan terbesar di Aleksandria, Serapeion masih berfungsi sebagai kuil dan bahkan di situ juga terdapat ruangan-ruangan kelas untuk para filsuf yang mau mengajar. Serapeion cenderung menarik para pengikut aliran neoplatonisme Iamblikos. Kebanyakan dari para filsuf ini tertarik dengan bidang teurgi, yaitu kajian ritual kultus dan praktik agama esoterik. Filsuf Damaskios yang beraliran neoplatonisme (hidup sekitar tahun 458–setelah tahun 538) mencatat bahwa seorang lelaki yang bernama Olimpos datang dari Kilikia untuk mengajar di Serapeion, dan ia mengajarkan murid-muridnya dengan penuh semangat mengenai aturan pemujaan dewa secara tradisional dan praktik keagamaan kuno. Ia memerintahkan murid-muridnya untuk memuja dewa-dewa dengan cara lama, dan mungkin ia juga mengajarkan mereka teurgi.

Pada tahun 391, sekelompok pekerja Kristen di Aleksandria menemukan peninggalan Mithraion kuno. Mereka memberikan beberapa benda yang dipakai untuk pemujaan kepada Uskup Aleksandria Teofilos. Teofilos memerintahkan agar benda-benda tersebut diarak di jalanan untuk diejek dan diolok-olok. Kaum pagan di Aleksandria pun murka, terutama para pengajar filsafat neoplatonisme dan teurgi di Serapeion. Para guru di Serapeion mengangkat senjata dan melancarkan serangan gerilya terhadap warga Kristen di Aleksandria bersama dengan murid-murid mereka dan para pengikut lainnya. Dalam serangan ini, mereka membunuh banyak orang hingga akhirnya mereka terpaksa mundur. Kaum Kristen membalasnya dengan menyerang dan menghancurkan Serapeion, walaupun sebagian dari barisan tiangnya masih berdiri hingga abad ke-12. Namun, tidak ada catatan sejarah mengenai kehancuran Serapeion yang menyebutkan soal keberadaan sebuah perpustakaan, dan sumber-sumber yang ditulis sebelum Serapeion dihancurkan menyebut keberadaan buku dengan menggunakan kala lampau, sehingga kemungkinan Serapeion sudah tidak memiliki koleksi buku yang besar ketika tempat ini dihancurkan.