Jabarkan Kosmologi dan eskatologi dari Origenes

Salah satu ajaran utama Origenes adalah ajaran prawujud jiwa, yakni ajaran bahwa sebelum menciptakan jagat raya indrawi, Allah terlebih dahulu menciptakan seluruh kecerdasan tak berjasad (). Mula-mula semua jiwa ini hanya berkhidmat dan mengasihi khaliknya, tetapi seiring meredupnya pijaran api ilahi, hampir semua kecerdasan nirjasad ini lambat laun jenuh berkhidmat kepada Allah, dan kasih mereka terhadap-Nya pun "meredup" (). Ketika Allah menciptakan jagad indria, jiwa-jiwa yang sebelumnya sudah wujud tanpa jasad ini pun mengejawantah. Jiwa-jiwa yang paling redup rasa kasihnya terhadap Allah mengejawantah menjadi roh-roh jahat. Jiwa-jiwa yang lumayan redup rasa kasihnya terhadap Allah mengejawantah menjadi jiwa manusia, yang nantinya akan menitis ke dalam raga. Jiwa-jiwa yang tidak begitu redup rasa kasihnya terhadap Allah mengejawantah menjadi para malaikat. Akan tetapi ada satu jiwa yang tetap berkhidmat secara sempurna kepada Allah, dan manunggal dengan Sabda (Logos) Allah melalui kasihnya yang sempurna terhadap Allah. Logos pada akhirnya menitis ke dalam raga dan dilahirkan ke dunia oleh Perawan Maria, menjadi Allah sekaligus manusia, Yesus Kristus.

Origenes mungkin saja percaya dan mungkin pula tidak percaya pada ajaran Plato tentang metempsikosis ("transmigrasi jiwa" alias reinkarnasi). Origenes secara tegas menolak "ajaran palsu perihal transmigrasi jiwa-jiwa ke raga-raga", tetapi mungkin yang ia tolak adalah jenis transmigrasi tertentu. Geddes MacGregor berpendapat bahwa Origenes tentunya percaya pada metempsikosis karena selaras dengan pandangan eskatologinya, dan tidak pernah secara tegas dinafikan dalam Alkitab. Kendati demikian, Roger E. Olson menolak anggapan bahwa Origenes percaya pada reinkarnasi sebagai suatu kesalahpahaman gerakan Zaman Baru terhadap ajaran-ajaran Origenes. Sudah tentu Origenes menolak pandangan filsafat stoa mengenai jagat raya yang berulang, yang secara langsung bertentangan dengan pandangan eskatologinya.

Origenes percaya bahwa seluruh dunia pada akhirnya akan memeluk agama Kristen, "karena dunia terus-menerus mendapatkan semakin banyak jiwa." Ia percaya bahwa Kerajaan Surga belum datang, tetapi setiap orang Kristen wajib menghadirkan realitas akhir zaman tersebut dalam kehidupannya sehari-hari. Origenes menganut paham kesemestaan, yang mengajarkan bahwa semua manusia pada akhirnya akan mencapai keselamatan, tetapi hanya sesudah dimurnikan dari dosa-dosanya oleh "api ilahi". Sejalan dengan tafsir kias Origenes, "api ilahi" bukanlah api secara harfiah, melainkan dukacita mendalam karena menyadari dosa-dosa diri sendiri. Origenes juga senantiasa bersikap hati-hati dengan menegaskan bahwa keselamatan semesta hanyalah suatu kemungkinan, bukan ajaran yang sudah baku. Hieronimus mengutip kalimat yang konon berasal dari Origenes, yakni "sesudah akhir zaman dan pemulihan fitrah segala sesuatu yang hanya berlangsung satu kali, Gabriel akan seharkat dengan Iblis, Paulus akan seharkat dengan Kayafas, dan anak-anak perawan akan seharkat dengan para pelacur." Kendati demikian, Hieronimus tidak secara sengaja mengubah kutipan-kutipan agar membuat Origenes tampak lebih mirip seorang ahli bidah, dan Origenes sendiri jelas-jelas menegaskan dalam Surat kepada Sahabat-Sahabat di Aleksandria bahwa Setan dan roh-roh jahat pengikutnya tidak ikut mengambil bagian dalam keselamatan pada akhir zaman.