Jabarkan Layanan dari Shinkansen

Tōkaidō, San'yō, dan Kyushu Shinkansen

Nozomi (ekspres, yaitu berhenti di stasiun paling sedikit, Tōkaidō dan San'yō)

Hikari (semi-ekspres, yaitu berhenti di stasiun terpenting, Tōkaidō dan San'yō)

Hikari Rail Star (semi-ekspres, San'yō)

Kodama (lokal, yaitu berhenti di semua stasiun di sepanjang jalur, Tōkaidō dan San'yō)

Sakura (semi-ekspres, San'yō dan Kyushu)

Mizuho (ekspres, San'yō dan Kyushu)

Tōhoku, Hokkaido, Yamagata, dan Akita Shinkansen

Hayabusa (ekspres, Tōhoku & Hokkaido, menggunakan kereta seri E5/seri H5)

Hayate (lokal, Tōhoku & Hokkaido. Layanan ekspres dihentikan tahun 2019)

Toki / Max Toki (semi-ekspres, Jōetsu)

Tanigawa / Max Tanigawa (lokal, Jōetsu)

Asahi / Max Asahi (dihentikan)

Kyushu dan Nishi Kyushu Shinkansen

Tōhoku, Hokkaido, Jōetsu, dan Hokuriku Shinkansen

Tidak ada daftar kecelakaan yang berakibat fatal dalam pengoperasian Shinkansen sejak sekitar 40 tahun yang lalu. Namun ada beberapa orang terluka dan satu kefatalan dikarenakan pintu yang menjepit penumpang atau barang mereka. Selain itu ada beberapa percobaan bunuh diri oleh penumpang. Karena itu beberapa stasiun telah memasang pagar pelindung. Meskipun begitu tetap saja ada percobaan bunuh diri oleh penumpang yang memanjat pagar pengaman tersebut.

Untuk menghadapi gempa bumi kereta ini dilengkapi dengan sistem pendeteksian yang akan memberhentikan kereta bila gempa bumi terdeteksi. Pada gempa bumi Chuetsu di Oktober 2004 sebuah Shinkansen yang dekat dengan pusat gempa lepas dari relnya, tetapi tidak ada penumpang yang terluka. Kereta generasi berikutnya, FASTECH 360 akan memiliki sayap rem penahan angin (yang mirip dengan kegunaan telinga) untuk membantu proses pemberhentian bila gempa bumi terdeteksi.