Jabarkan Mantan pengguna dari Boeing 747-400

Daftar berikut juga termasuk maskapai yang sempat menggunakan pesawat ini dalam jangka waktu singkat, selain maskapai pengguna utama.

Kecelakaan pertama 747-400 terjadi pada 4 November 1993, ketika China Airlines Penerbangan 605 yang terbang dari Taipei menuju Bandara Kai Tak di Hong Kong, mendarat 640 m melewati daerah pendaratan di landasan pacu dengan angin dari samping berkecepatan 20 hingga 38 knot. Ditambah dengan dimatikannya autobrake dan speed brake yang sudah dilipat, pengereman manual dan pembalik daya dorong mesin tidak mampu mencegah pesawat meluncur ke Pelabuhan Victoria. Tidak ada yang mengalami luka serius, namun pesawat tidak dapat digunakan lagi. Kecelakaan kedua terjadi pada 31 Oktober 2000, ketika Singapore Airlines Penerbangan 006 yang terbang dari Singapura menuju Los Angeles dengan perhentian di Taipei, menabrak peralatan konstruksi bandara saat melakukan lepas landas dalam cuaca buruk dari landasan pacu yang ditutup di Bandara Chiang Kai-shek. Pesawat habis terbakar dan menewaskan 79 penumpang dan empat awak. Penyebab kecelakaan tersebut adalah kesalahan pilot yang mengarahkan pesawat ke landasan pacu yang salah.

747-400F telah mengalami empat kecelakaan. Pada 3 September 2010, UPS Airlines Penerbangan 6, sebuah 747-400F yang terbang dari Dubai menuju Köln, jatuh sekitar 25 menit setelah lepas landas. Awak pesawat menyatakan keadaan darurat akibat kebakaran dalam penerbangan, dan setelah gagal mencoba melakukan pendaratan, tidak dapat melihat instrumen pesawat karena asap yang memasuki kokpit. Masker oksigen di pesawat tersebut tidak memiliki penyaring asap yang baik dan kedua pilot kehabisan oksigen. Pesawat menghantam daratan dengan kecepatan tinggi dan menewaskan kedua pilot. Kesimpulan dari kecelakaan tersebut adalah api yang berasal dari baterai ion litium, dan FAA memutuskan untuk membatasi kapasitas baterai litium yang dapat dibawa oleh pesawat. Pada 28 Juli 2011, Asiana Airlines Penerbangan 991, sebuah 747-400F yang terbang dari Seoul menuju Shanghai, jatuh ke Samudra Pasifik di lepas pantai Pulau Jeju setelah melaporkan masalah teknis akibat kemungkinan kebakaran dalam penerbangan. Kedua pilot tewas dalam kecelakaan tersebut. Pada 29 April 2013, National Airlines Penerbangan 102, sebuah 747-400BCF, jatuh ketika lepas landas dari Pangkalan Udara Bagram, Afghanistan dan menewaskan ketujuh awak pesawat. Kecelakaan tersebut disebakan oleh berpindahnya titik berat pesawat ke belakang pada saat lepas landas akibat bergeraknya kendaraan militer yang diangkut pesawat. Pada 16 Januari 2017, Turkish Airlines Penerbangan 6491, sebuah 747-400F yang dioperasikan ACT Airlines, jatuh ke permukiman warga ketika pilot berupaya mendaratkan pesawat dalam cuaca berkabut di dekat Bandara Manas di Bishkek, Kirgiztan. Sebanyak 39 orang tewas, yang terdiri dari empat awak pesawat and 35 orang di darat.

Insiden lain yang melibatkan 747-400 tidak menyebabkan kerusakan parah pada pesawat. Pada 15 Desember 1989, KLM Penerbangan 867, sebuah 747-400M yang terbang dari Tokyo menuju Amsterdam dengan perhentian di Anchorage, Alaska, terbang melalui awan vulkanik tebal dan menyebabkan kerusakan serius pada pesawat serta penggantian keempat mesin pesawat. Pada 23 Juli 1999, seorang pria menusuk pilot hingga tewas dalam pesawat 747-400D yang beroperasi sebagai All Nippon Airways Penerbangan 61 dari Tokyo menuju Sapporo. Pria yang berusaha membajak pesawat tersebut berhasil ditahan oleh awak lainnya dan pesawat mendarat dengan selamat. Pada 23 September 1999, Qantas Penerbangan 1 yang terbang dari Sydney menuju London dengan perhentian di Bangkok, meluncur keluar landasan pacu setelah pesawat mendarat 1.000 meter melewati daerah pendaratan di landasan pacu Bandara Don Mueang selama badai dan hujan deras, menyebabkan kerusakan pada pesawat dan sejumlah penumpang terluka. Pada 31 Januari 2001, pilot Japan Airlines Penerbangan 907, sebuah 747-400D yang terbang dari Tokyo menuju Naha, melakukan manuver mendadak di udara untuk menghindari tabrakan dengan DC-10-40 Japan Airlines akibat masalah instruksi dari petugas ATC; sejumlah penumpang dan awak dalam pesawat 747-400D mengalami luka akibat manuver mendadak tersebut dan juga terdapat kerusakan pada interior kabin. Pada 9 Oktober 2002, Northwest Airlines Penerbangan 85 yang terbang dari Detroit menuju Tokyo, melakukan pendaratan darurat di Anchorage setelah rudder bagian dari bawah sirip vertikal pesawat mengalami kerusakan. Pada 25 Juli 2008, Qantas Penerbangan 30 yang terbang dari Hong Kong menuju Melbourne, mendarat darurat di Manila dengan lubang di bagian kanan depan bawah badan pesawat; tidak ada yang terluka dalam insiden tersebut dan penyelidik menemukan kemungkinan penyebabnya adalah ledakan dari tabung oksigen darurat.