Jabarkan Kampus I dari Universitas Papua

Kampus I UNIPA, Amban, Manokwari

Fakultas Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam

Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan

Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan

Kampus II UNIPA, Aimas, Sorong

Fakultas Teknik Pertambangan dan Perminyakan

Kampus II UNIPA Sorong di Aimas (Diresmikan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan pada tanggal 10 Mei 2014)

Kampus III UNIPA Waisai, Raja Ampat

Program Studi D3 Ekowisata, Fakultas Perikanan dan Ilmu Kelautan

Kampus III UNIPA Raja Ampat di Waisai (Lokakarya pengembangannya telah dilakukan pada tanggal 14 Agustus 2014 di Waisai) Saat ini pengembangan dan pembangunan Kampus III Raja Ampat di Waisai sedang berlangsung.