Jabarkan Akuisisi oleh Indigo Partners dari Frontier Airlines

Pada bulan Oktober 2013, Republic Airways Holdings resmi menandatangani perjanjian dengan Indigo Partners untuk menjual Frontier Airlines dengan harga $145 juta. Menurut Indigo, transaksi ini akan membuat Frontier menjadi maskapai berbiaya rendah yang lebih baik lagi. Pada bulan Desember 2013, Indigo Partners LLC, melalui sebuah afiliasi, akhirnya menyelesaikan pembelian Frontier Airlines dari Republic Airways Holdings. Kantor pusat Frontier akan tetap berada di Denver. Republic Airlines pun tidak lagi menerbangkan Embraer 190 miliknya dengan nama Frontier, mulai tanggal 1 Januari 2014.

Pada tahun 2014, Frontier mengumumkan bahwa mereka akan berevolusi menjadi maskapai berbiaya ekstra rendah. Frontier juga berencana untuk menutup beberapa rute dan merumahkan sejumlah pegawai di penghubungnya di Denver. Pada tanggal 16 Januari 2015, Frontier mengumumkan bahwa mereka akan menutup layanan call centernya di Denver dan Milwaukee, sehingga 1.300 pegawai harus dirumahkan. Frontier lalu menyewa Sitel, sebuah perusahaan penyedia call center untuk menggantikannya.

Pada bulan Mei 2015, Indigo dan Frontier mengumumkan berhentinya David Siegel sebagai CEO. Ia sebelumnya juga telah menyerahkan jabatan presidennya ke Barry Biffle, mantan petinggi di Spirit Airlines. Tetapi, Frontier tidak langsung menunjuk pengganti Siegel dan lebih memilih untuk membagi tugas Siegel ke Biffle dan Bill Franke, direktur Indigo. Biffle menyatakan bahwa hal ini disebabkan adanya masalah operasional akibat berhentinya Siegel.