Jabarkan Daftar jalur Shinkansen dari Shinkansen

Dalam praktiknya, jalur Tōkaidō, San'yō, dan Kyushu membentuk jalur barat/selatan yang bersebelahan dari Tokyo, karena layanan kereta itu beroperasi antara jalur Tōkaidō dan San'yō dan antara jalur San'yō dan Kyushu, meskipun jalur tersebut dioperasikan oleh perusahaan yang berbeda.

Jalur Tōkaidō Shinkansen tidak terhubung secara fisik dengan jalur Tōhoku Shinkansen di Stasiun Tokyo, karena dioperasikan oleh perusahaan terpisah dan memiliki peron terpisah. Oleh karena itu, tidak ada layanan yang melalui antara jalur tersebut. Semua layanan ke utara dari Tokyo berjalan di sepanjang Tōhoku Shinkansen hingga setidaknya Ōmiya.

Dua jalur lebih jauh, dikenal sebagai Mini-shinkansen (ミニ新幹線), juga beroperasi dengan meningkatkan jalur yang telah ada:

Yamagata Shinkansen (Fukushima – Shinjō)

Akita Shinkansen (Morioka – Akita)

Terdapat dua jalur dengan sepur standar (standard gauge) yang secara teknis tidak diklasifikasikan sebagai jalur Shinkansen namun dengan pelayanan Shinkansen:

Jalur Hakata Minami (Hakata – Hakata-Minami)

Jalur Gala-Yuzawa – secara teknis merupakan cabang dari Jalur Jōetsu – (Echigo-Yuzawa – Gala-Yuzawa)