Coba jelasin Lihat Juga dari Aileu dong

Pada tahun 1903, pemberontakan yang dilakukan di Aileu melawan penguasa kolonial gagal.  Pada Januari 1912, Aileu berfungsi sebagai pangkalan Portugis melawan pemberontakan di Manufahi.

Antara tahun 1942 dan 1945, Jepang menduduki Timor Portugis.  Pada tanggal 31 Agustus 1942, kota ini diserbu oleh Colunas Negras, sekutu Timor dari penjajah Jepang. Lima tentara Portugis, serta beberapa pegawai negeri dan misionaris tewas.  Sebuah peringatan di Aileu memperingati pembantaian di hari itu.

Tentara Indonesia mendirikan kamp relokasi di Aileu untuk orang Timor Timur pada akhir tahun 1979. Pada awal September, selama krisis Timor Timur 1999. Penduduk dari berbagai suco di daerah itu diusir dari rumah mereka oleh milisi Indonesia. Suco Seloi Craic dihancurkan pada tanggal 6 September, rumah-rumah dibakar dan ternak disembelih.

Pada akhir 1999, ada rencana sementara untuk menjadikan Aileu sebagai ibu kota Timor Leste yang baru merdeka. Namun ditolak karena rakyat lebih memilih Dili sebagai ibu kota.