Jabarkan Olympique Lyonnais dari Florent Malouda

Lyon kemudian merekrut Malouda tahun 2003. Bersama Juninho, Michael Essien, dan Mahamadou Diarra, Malouda membangun lini tengah Lyon. Malouda kemudian dipanggil untuk memperkuat tim nasional Prancis.

Di musim 2006–07 Malouda berhasil membawa Lyon menjadi juara Ligue 1 untuk ke-enam kalinya secara beruntun. Ia juga berhasil membuat 10 gol dan menjadi Pemain Terbaik musim tersebut.

Malouda meyatakan ia akan hengkang dari Lyon di akhir musim 2006–07. Chelsea, Liverpooll dan Real Madrid tertarik untuk merekrut Malouda.