Jabarkan 1933–1945 dari Deutsche Bank

Setelah Adolf Hitler berkuasa sebagai Reich Ketiga, Deutsche Bank pun memberhentikan tiga orang pimpinannya yang berlatar belakang Yahudi pada tahun 1933. Deutsche Bank kemudian berperan dalam upaya aryanisasi perusahaan milik orang Yahudi, dengan beranggapan bahwa pemilik perusahaan yang di-"aryanisasi" telah mengetahui tentang status Yahudi mereka sebelumnya. Menurut sejarawannya sendiri, bank ini terlibat dalam 363 penyitaan hingga bulan November 1938. Pada tahun 1938, bank ini mengakuisisi Mendelssohn & Co. asal Jerman. Selama perang, Deutsche Bank menyerap bank lain yang jatuh ke tangan Jerman selama menduduki Eropa Timur. Deutsche Bank juga menyediakan fasilitas perbankan untuk Gestapo, serta meminjamkan dana untuk membangun kamp Auschwitz dan fasilitas IG Farben di dekatnya.

Selama Perang Dunia II, Deutsche Bank bertanggung jawab mengelola Bohemian Union Bank di Prague, yang memiliki cabang di Protektorat dan di Slovakia, Bankverein di Yugoslavia (yang kini telah dibagi menjadi dua perusahaan, masing-masing satu di Serbia dan Kroasia), Albert de Barry Bank di Amsterdam, National Bank of Greece di Athena, Creditanstalt-Bankverein di Austria dan Hungaria, Deutsch-Bulgarische Kreditbank di Bulgaria, dan Banca Comercială Română di Bucharest. Bank ini juga memiliki cabang di Istanbul, Turki.

Pada tahun 1999, Deutsche Bank resmi mengkonfirmasi bahwa mereka terlibat di kamp Auschwitz. Pada bulan Desember 1999, Deutsche Bank dan sejumlah perusahaan besar asal Jerman yang lain pun setuju untuk memberi kompensasi sebesar US$5,2 milyar kepada para penyintas Holocaust. Sebelumnya, Pejabat Amerika Serikat mengancam akan melarang Deutsche Bank membeli Bankers Trust dengan harga $10 milyar jika tidak berkontribusi pada kompensasi tersebut. Sejarah Deutsche Bank selama Perang Dunia II kemudian didokumentasikan oleh sejarawan independen yang dipekerjakan oleh bank ini.