Jabarkan Kekaisaran Samaniyah dari Tajikistan

Kekaisaran Samaniyah, 819 sampai 999, memulihkan Persia dan memegang kendali atas wilayah tersebut dan memperbesar kota-kota Samarkand dan Bukhara (kedua kota tersebut saat ini menjadi bagian dari Uzbekistan) yang menjadi pusat kebudayaan Iran dan wilayahnya dikenal sebagai Khorasan. Kekaisaran berpusat di Khorasan dan Transoxiana; pada jangkauan terbesarnya meliputi Afghanistan modern, sebagian besar Iran, Tajikistan, Turkmenistan, Uzbekistan, Kyrgyzstan, sebagian Kazakhstan, dan Pakistan. Empat bersaudara Nuh, Ahmad, Yahya, dan Ilyas mendirikan negara Samanid. Masing-masing dari mereka memerintah wilayah di bawah kekuasaan Abbasiyah. Pada tahun 892, Ismail Samani (892–907) menyatukan negara Samanid di bawah satu penguasa, sehingga secara efektif mengakhiri sistem feodal yang digunakan oleh Samanid. Di bawahnya juga Samaniyah menjadi independen dari otoritas Abbasiyah. Kekhanan Kara-Khanid menaklukkan Transoksiana (yang kira-kira sama dengan Uzbekistan modern, Tajikistan, Kirgizstan selatan, dan Kazakhstan barat daya) dan memerintah antara tahun 999 dan 1211. Kedatangan mereka di Transoksiana menandai pergeseran definitif dari dominasi Iran ke Turki di Asia Tengah, tetapi lambat laun Kara-khanid berasimilasi dengan budaya Muslim Perso-Arab di wilayah tersebut.

Pada abad ke-13, Kekaisaran Mongol menyapu Asia Tengah, menginvasi Kekaisaran Khwarezmia dan menjarah kota-kota, menjarah dan membantai orang di mana-mana. Turko-Mongol penakluk Tamerlane mendirikan Kekaisaran Timuriyah di dalam dan sekitar Tajikistan modern dan Asia Tengah, dan menjadi penguasa pertama Dinasti Timuriyah.