Jabarkan Islamisasi dan penjajahan Mongol dari Afganistan

Sebelum abad ke-19, wilayah barat laut Afganistan dinamakan Khurasan. Dua dari empat ibu kota Khurasan (Herat dan Balkh) sekarang berada di Afganistan, sedangkan wilayah Kandahar, Zabulistan, Ghazni, Kabulistan, dan Afganistan membentuk perbatasan antara Khurasan dan Hindustan.

Muslim Arab membawa Islam ke Herat dan Zaranj pada 642 EL dan mulai meluas ke timur; penduduk-penduduk asli yang mereka temui menerimanya sementara yang lain menolak dan memberontak. Tanahnya secara kolektif dikenal oleh orang Arab sebagai al-Hind karena hubungan budayanya dengan India Raya.  Sebelum Islam diperkenalkan, orang-orang di wilayah itu beragama, di antaranya Majusi, Buddha, Surya dan Nana, Yahudi, dan lain-lain. Zunbil dan Kabul Shahi pertama kali ditangkap pada 870 EL oleh Saffariyah Muslim Zaranj. Kemudian, Samaniyah memperluas pengaruh Islamnya ke selatan Hindu Kush. Dilaporkan bahwa Muslim dan non-Muslim masih hidup berdampingan di Kabul sebelum Ghaznawi naik ke tampuk kekuasaan pada abad ke-10.

Afganistan menjadi salah satu pusat utama di Dunia Muslim selama Zaman Kemuliaan Islam. Pada abad ke-11, Mahmud dari Ghazni mengalahkan penguasa Hindu yang tersisa dan secara efektif mengislamkan wilayah yang lebih luas, dengan pengecualian Kafiristan. Dinasti Ghaznawiyah dikalahkan dan dilanjutkan oleh Ghuriyah, yang berkembang dan kerajaan Islam berkuasa. Beberapa berspekulasi bahwa suku Nasher saat ini adalah sisa dari dinasti Ghaznawiyah.

Pada 1219 M, Jenghis Khan dan pasukan Mongol menaklukkan wilayah tersebut. Pasukannya dikatakan telah menghancurkan kota-kota Khurasan yaitu Herat, Balkh dan Bamyan. Kehancuran yang disebabkan pasukan Mongol memaksa penduduk-penduduk lokal untuk kembali ke komunitas pertanian pedesaan. Pemerintahan Mongol dilanjutkan dengan Ilkhanat di barat laut selama Dinasti Khilji yang memerintah daerah suku Afganistan selatan — Hindu Kush hingga penaklukan wilayah Timur, yang mendirikan Dinasti Timuriyah pada 1370. Selama masa Ghaznawiyah, Ghuriyah dan Timuriyah, wilayah ini melahirkan monumen-monumen arsitektur Islam yang bagus serta karya-karya sains dan sastra.

Pada awal abad ke-16, Babur tiba dari Fergana dan merebut Kabul dari Dinasti Arghun.

Penggulingan Safawiyah oleh suku lokal Pashtun Ghilzai

Suku lokal Pashtun Ghilzai berhasil menggulingkan kekuasaan Safawi, dan di bawah dinasti Hotaki, sebentar menguasai semua atau bagian dari Persia itu sendiri 1722-1736. Setelah periode singkat di bawah kekuasaan (1736-1747) dari Turko Nadir Shah penakluk-Iran, salah satu petinggi nya perwira militer, Ahmad Shah Abdali, dirinya seorang anggota suku Pashtun dari klan Abdali, menyerukan loya jirga berikut Nadir Shah pembunuhan (yang banyak melibatkan Abdali) pada tahun 1747. Afghan/Pashtun datang bersama di Kandahar pada tahun 1747, dan memilih Ahmad Shah, yang mengubah nama terakhir untuk Durrani ('mutiara mutiara' yang artinya dalam bahasa Persia), untuk menjadi raja. Afghanistan negara-bangsa seperti yang dikenal saat ini muncul pada tahun 1747 sebagai Kekaisaran Durrani, dan diperluas ke luar dari wilayah Pashtun tradisional untuk memasukkan semua dari apa yang saat ini Afghanistan, sebagian dari Mashad di Iran, dan semua Pakistan, dan Kashmir sebagai baik. Kekaisaran Durrani berlangsung selama hampir satu abad sampai konflik internal yang, dan perang dengan Persia, dan Sikh berkurang kerajaan mereka dengan awal abad ke 19. Namun, saat ini perbatasan Afghanistan tidak akan ditentukan sampai kedatangan Inggris.