除此之外，馬可夫鏈仲可以按好多特性分做進階嘅類別，例如隱馬可夫模型就係一種特殊嘅馬可夫鏈，指條鏈當中有一部份嘅狀態係研究者觀察唔到嘅（隱藏）研究者要齋靠觀察淨低嗰啲－觀察得到嘅－狀態嚟對啲隱藏狀態作出判斷。