同時南京由於佢嘅位置優勢，係華北、華東、華中三個地理大區嘅鐵路交接樞紐，而家普通鐵路方面有京滬鐵路（多條鐵路合成，涉及南京有津浦鐵路、滬寧鐵路）、寧銅鐵路（包括寧蕪鐵路）、寧啟鐵路、寧西鐵路經過，高速鐵路方面有滬寧高鐵、京滬高鐵、合寧鐵路、寧安高鐵、寧杭高鐵、滬漢蓉鐵路（多條鐵路合成，涉及南京有滬寧高鐵、合寧鐵路）。