連江縣政府係中華民國福建省連江縣最高層級嘅地方行政機關，喺中華民國政府架構中，為縣自治嘅行政機關，同時負責執行中央機關委辦事項，連江縣嘅自治監督機關為行政院各部會（主要為內政部）。