原計劃嘅北環綫，會由嘅錦上路站出發，喺中途嘅凹頭、牛潭尾同埋新田設三個預留車站，取消咗原本喺《鐵路發展策略2000》建議新田同埋古洞之間連接九廣西鐵同埋九廣東鐵嘅直通路綫，然後喺新起嘅洲頭站接駁落馬洲支線，最後連接支綫既有嘅落馬洲站，兩鐵合併後，港鐵仍然沿用呢個方案。