目前總共有三條直通車路線，喺香港境內都沿東鐵嘅路線行走，分別係每日12班嘅粵港直通車（廣東線）、每兩日一班嘅京九直通車（北京線）同埋滬九直通車（上海線）並由港鐵負責營運。