經過上集的大冒險、回到綠山安頓之後，超音鼠（班舒禾茲　聲演）急於證明自己可以成為真正的英雄，而考驗正正來自他的死對頭──蛋頭博士（佔基利　飾）再度回來作惡，今次還帶同新拍檔納克魯斯，到處搜尋蘊含強大破壞力量的神祕綠寶石。