16旅童軍係聖類斯中學唯一嘅制服青少年團體，目前有一個小童軍團（聖類斯小學小一至小二）幼童軍團（聖類斯小學小三至小六）一個童軍團（中一至中三/四）同埋一個深資童軍團（中四/五至二十一歲）。