斗六大圳便以上述各溪為主要水源，於境內設有二十八條小型埤圳，但斗六除清水溪外，其餘溪流之溪谷，且因陡急之故，一旦降雨，溪流立刻氾濫成災，而雨停後，各溪流流量即銳減。