同其他鱷魚一樣，菲律賓鱷都係一種得人驚嘅捕獵者，捉啲好似羚羊咁大隻嘅獵物，但又會畀鱷魚鳥去清理佢棚牙，細隻嗰陣就食魚、蝦、老鼠同水蝸牛。