1608年陰曆二月，宣祖病勢急迫，突然就駕崩，按照從來嘅慣例，朝廷啲大臣由於呢種政治目的，追究許浚各種各樣對宣祖嘅死嘅責任，結果罷職佢，將佢門外黜送去孔巖，至此佢做咗39年醫官。