子囊菌門

子囊菌門係真菌界入面種類最多嘅一個門。

亞門同綱 
 外囊菌亞門 (Taphrinomycotina)
 粒毛盤菌綱 Neolectomycetes
 肺孢子菌綱 Pneumocystidomycetes
 裂殖酵母綱 Schizosaccharomycetes
 外囊菌綱 Taphrinomycetes
 酵母亞門 (Saccharomycotina)
 酵母綱 Saccharomycetes
 盤菌亞門 (Pezizomycotina)
 星裂菌綱 Arthoniomycetes
 座囊菌綱 Dothideomycetes
 散囊菌綱 Eurotiomycetes
 蟲囊菌綱 Laboulbeniomycetes
 茶漬綱 Lecanoromycetes
 錘舌菌綱 Leotiomycetes
 李基那地衣綱 Lichinomycetes
 圓盤菌綱 Orbiliomycetes
 盤菌綱 Pezizomycetes
 糞殼菌綱 Sordariomycetes
 刺盾炱綱 Chaetothyriomycetes

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真核生物