ＤＮＡブック®のデータベース・検索閲覧システムを公開　－出版されたＤＮＡブック®の６万５３１２のＤＮＡ情報などをデータベース化－　－インターネットを通じＤＮＡブック®の内容が全て検索閲覧可能に－


平成１７年６月２日
独立行政法人理化学研究所
独立行政法人科学技術振興機構

# ＤＮＡブック®のデータベース・検索閲覧システムを公開

## －出版されたＤＮＡブック®の６万５３１２のＤＮＡ情報などをデータベース化－
－インターネットを通じＤＮＡブック®の内容が全て検索閲覧可能に－

独立行政法人理化学研研究所（野依良治理事長）は、独立行政法人科学技術振興機構（ＪＳＴ，沖村憲樹理事長）プレベンチャー事業ＤＮＡブックチーム（林﨑良英リーダー）の協力を得て、ＤＮＡブック®※１に関する様々な情報をデータベース化し、更にインターネットから内容の検索や閲覧ができるシステムを開発しました。これはゲノム科学総合研究センター（榊佳之センター長）遺伝子構造・機能研究グループ（林﨑良英プロジェクトディレクター）の研究成果です。
活用する情報は、マウスＤＮＡブック®、シロイヌナズナＤＮＡブック®など既に出版された"ＤＮＡブック®"に関する情報やページの情報、収録している６万５３１２種のＤＮＡの情報をデータベース化しました。さらにシステムでは、検索閲覧機能を作成し、ＤＮＡブックに関する様々な情報や図を閲覧することや、ＤＮＡデータを名前や機能から検索して研究対象のＤＮＡがＤＮＡブックにあるかを調べることを可能にしました。主な特徴は次の通りです。
１）ＤＮＡブックに関する各種情報のデータベース化
２）内容の閲覧機能（画面）の作成
３）対象ＤＮＡの検索機能の作成
開発したシステムはホームページhttp://gerg03.gsc.riken.jp/DNABook_DB/　（図１）で６月３日から公開し、インターネットを通じて、潜在的ユーザーである一般研究者に遺伝子クローンがあるＤＮＡブックの有無やクローン情報などが提供されます。ＤＮＡブックとそのデータベースがそろうことにより、さまざまな場面においてゲノム研究が推進されることが期待できます。尚、理研が最初に出版したマウスＤＮＡブック®は理研ベンチャー・株式会社ダナフォームが販売中です。プレベンチャーではＤＮＡブックの本格的な事業化（生産、販売）を目指した技術開発・市場調査を行なっており、潜在的ユーザーの反応を参考にします。
※ＤＮＡブック®は（株）ダナフォームの登録商標です。

### １．システムの概要

ＤＮＡサンプルを紙の上に貼り付け、書籍として移送、流通させることを可能にしたＤＮＡブック®は、生物種ごとや遺伝子の分類ごとなどに作成されており、今後とも出版されていく予定です。それに伴い、それぞれのＤＮＡブック®に収録されているＤＮＡサンプルの生物学的情報や、ＤＮＡサンプルを実験で使用する場合の条件などの情報を取り出し、さらには利用者が興味あるＤＮＡサンプルがどのＤＮＡブック®に収録されているかを簡単に知ることが必要になります。
ＤＮＡブック®データベース閲覧検索システムは、ＤＮＡブック®の様々な情報をデータベース化し、ＤＮＡブック®利用者が容易に使用できる検索インターフェースを提供するものです。実際のＤＮＡブック®における各ページと対応する情報・図を閲覧可能にし、さらに必要な情報を調査する際には、外部のデータベースなどに移動することができるシステム（図２）です。

### ２．ＤＮＡブック®情報のデータベース化

### ＤＮＡブック®に関する様々な情報のデータベース化を実施しています。データベースには、実際のＤＮＡブック®に関する情報（目次や、各ページの内容）をはじめ、収録されているＤＮＡサンプルに関して各プロジェクト機関のデータベースから取得した情報が格納されています。現在の収録情報は、ＤＮＡブック®の種類が４冊、収録したＤＮＡ数が６５,３１２個です。
■データベース化されたＤＮＡブック®の情報一覧
・ ＤＮＡブック®の情報(出版日、ページ数、各項目の内容、イメージ図など）
・ シートページの情報(ページ説明、ＤＮＡサンプル数、イメージ図、ＤＮＡ配置情報など）
・ ＤＮＡサンプルの情報（利用情報、品質情報、IDや名称・機能・配列情報など）
・ 各種画像データや、ＰＤＦデータ、外部データベースへのリンク情報

### ３．インターネットを通じた検索閲覧機能の作成

### ＤＮＡブック®利用者が、ＷＥＢブラウザを通して世界中からシステムを利用できるＷＥＢシステムを作成しました。これにより、データベースに収録されている様々な情報を必要に応じて閲覧することができるほか、ＤＮＡサンプルの名前や機能情報等から検索することが可能です。更に、単なる情報閲覧にとどまらず、研究レベルでも活用できるように、実験利用情報や配列情報などを提供しており、マウスＦＡＮＴＯＭデータベース等の外部データベースへもアクセスすることができます。
■ ＤＮＡブック®の内容検索
・ 検索機能（ＢＯＯＫ名、ＤＮＡサンプルのＩＤや名称、機能情報など）
・ ＤＮＡに関連する各種情報閲覧機能（図３）

用語説明
■図１　ＤＮＡブック®データベース・検索閲覧システムトップページ
■図２　ＤＮＡブック®データベース・検索閲覧システムの役割
■図３　閲覧検索機能マップ

（問い合わせ先）
独立行政法人理化学研究所
横浜研究所 ゲノム科学総合研究センター
遺伝子構造・機能研究グループ
プロジェクトディレクター
（独立行政法人科学技術振興機構、プレベンチャー事業、DNAブックチームリーダー兼務）
林﨑　 良英
プロジェクト副ディレクター 河合　　 純
TEL: 045-503-9222 FAX: 045-503-9216
研究推進部 星野　美和子
TEL：045-503-9117 FAX：045-503-9113
独立行政法人科学技術振興機構
プレベンチャー事業　DNAブックチームサブリーダー
渡邉　幸彦
TEL: 045-508-7464 FAX：045-508-7467
独立行政法人科学技術振興機構
産学連携事業本部　技術展開部　新規事業創出課
米谷　雅之、粂田　真宏
TEL: 03-5214-0016 FAX: 03-5214-0017
（報道担当）
独立行政法人理化学研究所
広報室 駒井　秀宏
TEL: 048-467-9272 FAX: 048-462-4715
独立行政法人科学技術振興機構
総務部広報室 阿部　学
TEL: 03-5214-8404 FAX: 03-5214-8432