日本人3,554人分の全ゲノムリファレンスパネルを... | プレスリリース・研究成果 | 東北大学 -TOHOKU UNIVERSITY-

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東北大学東北メディカル・メガバンク機構（ToMMo）と岩手医科大学いわて東北メディカル・メガバンク機構（IMM）は、3,554人の全ゲノムリファレンスパネル（3.5KJPN）を作成し、約3,710万個の一塩基変異（SNVs）を収載することに成功しました。同SNVsの72%以上にあたる約2,690万個が、世界各地のSNVsを登録する国際データベースには存在しません。集団（民族集団など）が保有するSNVsの多くは集団ごとに特徴的なことが知られていることから、3.5KJPNには日本人に特徴的なSNVsが多数収載されていることが明らかになりました。今後、3.5KJPNは日本人を対象とするゲノム医療に大きく貢献することが期待されます。
3.5KJPNの約32%は宮城県と岩手県以外の検体から構成されています。詳細に検討すると、日本列島内の地域集団の微細な違いは確認されるものの、他のアジア集団のゲノム情報とは、大きく、かつ明確に異なる日本列島出身者としてのまとまりが検出されました。これらのことから、これまでToMMoが開発してきたリファレンスパネル（1KJPN、2KJPN）が日本人の特徴を幅広く反映するものであることが実証されました。合わせて、3.5KJPNは日本全国の地域集団の特徴を更に詳細に反映していることも明らかになりました。
3.5KJPNは、日本人の持つ0.03%以上のSNVsをカバーするものと考えられます。ToMMoとIMMは本パネルに含まれるすべてのSNVsの位置情報、アレル頻度情報及びアレル数情報を近日中に公開します。これらの情報により、現在日本医療研究開発機構（AMED）が実施中の、未診断疾患イニシアチブ（IRUD）事業における疾患候補遺伝子の絞り込み性能のさらなる向上が見込まれます。また、疾患への罹患リスク推定などの目的で利用されるマイクロアレイ解析での全ゲノム復元性能を向上させることも可能になります。このように3.5KJPN全ゲノムリファレンスパネルは本邦におけるゲノム医療の研究基盤として大いに活用されるものと期待されます。

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Eメール：nagasaki*megabank.tohoku.ac.jp（*を@に置き換えてください）

東北大学東北メディカル・メガバンク機構
シークエンス解析室　室長
准教授　勝岡 史城（かつおか ふみき）
電話番号：022-273-6214
Eメール：kfumiki*megabank.tohoku.ac.jp（*を@に置き換えてください）

（報道に関すること）
東北大学東北メディカル・メガバンク機構
広報戦略室　室長
長神 風二 （ながみ ふうじ）
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ファクス：022-717-7923
Eメール：f-nagami*med.tohoku.ac.jp（*を@に置き換えてください）