hpprc/llmjp-kaken huggingface dataset:
望ましい日本の内部 労働市場のあり方： 働き方改革と健康経営に着目した実証研究

本研究では、産官学連携で得られた企業や労働者のさまざまなデータを用いて「働き方改革」や「健康経営」の費用対効果などのエビデンスを導出するとともに、それらのエビデンスをもとに、今後の日本の望ましい内部労働市場のあり方を検討し、労働市場政策や企業における人事・労務管理・経営施策への含意を示すことを目指している。初年度の研究実績として、労働者個人のパネルデータを用いて、長時間労働や過労による健康被害が生じてしまうメカニズムを行動経済学的なアプローチで検証した研究のほか、職場での上司の能力やコミュニケーションなどの職場管理の方法などによって労働者のメンタルヘルスがどのように影響を受けるかを検証した研究を進め、2本の論文を査読付き国際学術雑誌へ掲載した。いずれの研究からも、働き方改革や健康経営のあり方の制度設計を検討する上で有用なエビデンスが導出できたといえる。このほか、2019年4月施行の働き方改革関連法による長時間労働是正の効果を既存研究の知見から整理する論文や、女性活躍推進の企業にとっての費用対効果を推計した論文、AIの利活用によって営業職の働き方がどのように変容するかを検証した論文の3本を国内学術雑誌へ掲載した。さらに、働き方改革による長時間労働の是正の副作用として、企業における労働者への人的資本投資が減少する可能性があるのか、また、労働者自身による自己研鑽が代わりに増加しているのか、といった点を検証する研究も進めたほか、働き方と健康の関係に関するこれまでの経済学分野の研究をサーベイする研究、女性活躍推進の状況を開示することが企業業績とどのように関係するかを検証する研究、働き方改革やAIなどの新しい情報技術の活用が企業業績や働き方に与える影響を検証する研究などを進め、合計5本のディスカッションペーパーや報告書として公表した。研究期間の初年度に10本の論文を完成させ、うち2本が査読付学術雑誌に掲載した。また、論文の形にはなっていないが、企業業績と各種健康指標の関係をレセプト・検診データなどを用いて検証することを進めているほか、健康経営・健康施策と企業業績あるいは労働者の健康状態の関係を企業あるいは労働者のデータを用いて検証することに着手するなど、来年度以降の実績につながりうる準備も着実に進んでいる。今後も研究目的に沿った検証を実施するための各種データを収集・作成するために、企業や政府、調査研究機関と連携を強めていく。また、研究論文のクオリティ向上を目指し、内外の専門家への意見聴取を進めていく。今年度にデータ整理等の作業をリサーチアシスタントを雇って実施する予定だったが、その作業が必要なデータの入手が来年度にずれ込んだため、来年度に支出する。
地球本位型社会の実現をめざした生涯学習としての環境教育システムの確立

本年度は、国内外における生涯学習としての環境教育の事例の収集・分析と個別的環境教育の場における環境教育システムの在り方についてのヒヤリング調査を中心に研究をすすめた。1)米国や英国などの欧米における生涯学習としての環境教育の先進事例の収集・分析米国における生涯学習としての環境教育の具体的事例と、それをささえているシステムを探るために、平成5年の7月と9月の2度にわたって、現地調査を行った。7月の第1回調査においては、ヨセミテ国立公園における市民を対象とした環境教育の取組について調査し、9月の第2回現地調査においては、子供の直接体験を重視した環境教育施設である子供博物館(ボストン子供博物館、ブルックリン子供博物館など)を中心にヒヤリングと情報収集を行った。また、全米環境教育法の所轄機関である環境保護庁の環境教育部において、政府の取組についてのヒヤリング調査を行った。これらの調査の結果、国立公園における環境教育は子供から高齢者にいたるすべての人々を対象にしており、それを可能とさせるビジターセンターなどのハードとインタプリター、プログラムなどのソフトの両面が充実していることがわかった。子供博物館を中心とした環境教育施設の調査からは、地域と一体となった環境教育施設の在り方について多くの示唆をえることができた。すなわち施設が体験学習の場であるとともに、環境を生かした地域づくりの拠点として人材養成や情報センターとして機能している。2)国内における生涯学習としての環境教育の実例調査環境教育・学習の振興を明記した環境基本法などの制定を背景とした、学校・行政・市民・企業などにおける生涯学習としての環境教育の先進事例の調査を行った。
Fuzzy集合関数の研究

まず,ファジィ集合の上の関数概念と演算の構成に関する研究を行い次のような結果をえた.ファジィ集合上の関数概念に用いられてきたL.A.Zadehの拡張原理とは,真理値集合を束として,そのsup演算によってファジィ集合間に対応を構成したことに本質があった.そこでsup演算以外の演算を拡張原理の基とすることが,考えられる.それらを基本的な代数的性質からは,もっと良い性質をもつファジィ関数も構成をできた.これを論文Extention of the concept of mappings using fuzzy sets(研究発表の欄を参照)としてまとめた.また,ファジィ集合の特殊概念として定義されていたファジィ数を,拡張して埋め込むことによって,ある種のベクトル空間上の点として定義し直し,自然で使いやすいものとした.これをVSOPファジィ数と呼ぶ.そして,そのVSOPファジィ数の概念の上で,ファジィ順序概念を構成した.これも,これまでのファジィ順序の定義と異なり,公理的な自然な構成を行った.そこでの幾つかの性質を明らかにした.この結果はFirst Asian Fuzzy Systems SymposiumでFuzzy Relations for Comparing Fuzzy Numbersの表題で発表を行った.さらに,ファジィ順序の構成上の問題として「ファジィ順序からファジィ順序を生成できる関数の特徴付け」が考えられたが,これも単純な形にすることができた.これらファジィ数に関連した結果を論文VSOP fuzzyNumbers and its Fuzzy Orderingとしてまとめ,投稿を準備中である.まず,ファジィ集合の上の関数概念と演算の構成に関する研究を行い次のような結果をえた.ファジィ集合上の関数概念に用いられてきたL.A.Zadehの拡張原理とは,真理値集合を束として,そのsup演算によってファジィ集合間に対応を構成したことに本質があった.そこでsup演算以外の演算を拡張原理の基とすることが,考えられる.それらを基本的な代数的性質からは,もっと良い性質をもつファジィ関数も構成をできた.これを論文Extention of the concept of mappings using fuzzy sets(研究発表の欄を参照)としてまとめた.また,ファジィ集合の特殊概念として定義されていたファジィ数を,拡張して埋め込むことによって,ある種のベクトル空間上の点として定義し直し,自然で使いやすいものとした.これをVSOPファジィ数と呼ぶ.そして,そのVSOPファジィ数の概念の上で,ファジィ順序概念を構成した.これも,これまでのファジィ順序の定義と異なり,公理的な自然な構成を行った.そこでの幾つかの性質を明らかにした.この結果はFirst Asian Fuzzy Systems SymposiumでFuzzy Relations for Comparing Fuzzy Numbersの表題で発表を行った.さらに,ファジィ順序の構成上の問題として「ファジィ順序からファジィ順序を生成できる関数の特徴付け」が考えられたが,これも単純な形にすることができた.これらファジィ数に関連した結果を論文VSOP fuzzyNumbers and its Fuzzy Orderingとしてまとめ,投稿を準備中である.
モデル検査技術を活用したソフトウェア設計方法に関する研究

本研究では以下のことを行い、ソフトウェア設計へのフォーマルアプローチの適用可能性、有用性を調べた.1.時間オートマトンンのCEGARloopの適用アルゴリズムの考案と評価.2. OCL-JML総合変換アルゴリズムの考案と実用性の評価.3.時間オートマトンをライントレースロボットに適用して検証の有効性を示した.4.既存ソフトウェアに対してJML記述をループ構造に対して数学的解析を行うことにより,より精度度良く自動生成する方法論を新たに提案しその有効性を示した.5.JavaのequalsメソッドとhashCodeメソッドの整合性を自動検証する手法を考案し,その有効性を示した.本研究では以下のことを行い、ソフトウェア設計へのフォーマルアプローチの適用可能性、有用性を調べた.1.時間オートマトンンのCEGARloopの適用アルゴリズムの考案と評価.2. OCL-JML総合変換アルゴリズムの考案と実用性の評価.3.時間オートマトンをライントレースロボットに適用して検証の有効性を示した.4.既存ソフトウェアに対してJML記述をループ構造に対して数学的解析を行うことにより,より精度度良く自動生成する方法論を新たに提案しその有効性を示した.5.JavaのequalsメソッドとhashCodeメソッドの整合性を自動検証する手法を考案し,その有効性を示した.本研究では以下のことを行い、ソフトウェア設計へのフォーマルアプローチの適用可能性、有用性を調べる.1.時間オートマトンのCEGARループの抽象化手法を例題に適用し,有用性を示す.2.提案抽象化手法の並列実行アルゴリズムを提案し,有用性を示す.3.既存ソフトウェアに対してJML記述を自動で付加する処理系を提案手法をもとに作成する.4. UML/OCL記述からJML記述を自動導出する方法をもとに3.とあわせてソフトウェア開発支援システムのプロトタイプを作成する.5. UML/OCL記述から時間オートマトンへ変換する方法と組み合わせ,それらをもとに総合的な設計開発法への展開をはかる.本年はおおむね1.および3.,4.の一部を行った.まず,時間オートマトンのCEGARループアルゴリズムを論文にまとめ採録された.引き続き,並列化による効率向上の研究を行っていきたい.また,確率時間オートマトンに対するCEGARループアルゴリズムのプロトタイプを実装し,研究会で報告した.これについては,アルゴリズムの正当性を証明した上で,論文にまとめたい.また,確率オートマトンを用いたネットワーク性能解析検証法に関する手法を国際会議,および研究会にて発表した.3.,4.についてはOCL記述からJML記述への自動変換手法の研究を国内のワークショップで発表し,またそれを整理したものを論文にまとめ採録された.これについては,引き続き,ツールの作成をして,有用性の評価を行っていきたい.本研究では以下のことを行い、ソフトウェア設計へのフォーマルアプローチの適用可能性、有用性を調べる1.時間オートマトンのCEGARループの抽象化手法を例題に適用し,有用性を示す2.提案抽象化手法の並列実行アルゴリズムを提案し,有用性を示す3.既存ソフトウェアに対してJML記述を自動で付加する処理系を提案手法をもとに作成する4. UML/OCL記述からJML記述を自動導出する方法をもとに3.とあわせてソフトウェア開発支援システムのプロトタイプを作成する5. UML/OCL記述から時間オートマトンへ変換する方法と組み合わせ,それらをもとに総合的な設計開発法への展開をはかる本年はおおむね2,,3.,4.を行った.まず,2の時間オートマトンのCEGARループアルゴリズムの並列化による効率向上の研究を行い,並列計算機を用いる方法とボトルネックを見極め1つの計算機でも効率よく発見する方法を考案し,国内研究会で発表した.また,1の発展課題として,確率時間オートマトンに対するモデル検査手法に関するアルゴリズムを考案し評価実験を行った結果を国際会議に発表した.3,,4.についてはOCL記述からJML記述への自動変換手法をeclipseプラグインとして実装し,実用例題を用いて評価した結果等を国内研究会で発表した.また,プログラムからのJMLの自動生成についてこれまでの研究成果をまとめ,論文に採録された本研究では以下のことを行い、ソフトウェア設計へのフォーマルアプローチの適用可能性、有用性を調べる.1.時間オートマトンのCEGARループの抽象化手法を例題に適用し,有用性を示す.2.提案抽象化手法の並列実行アルゴリズムを提案し,有用性を示す.3.既存ソフトウェアに対してJML記述を自動で付加する処理系を提案手法をもとに作成する.4.UML/OCL記述からJMLI記述を自動導出する方法をもとに3.とあわせてソフトウェア開発支援システムのプロトタイプを作成する.5.UML/OCL記述から時間オートマトンへ変換する方法と組み合わせ,それらをもとに総合的な設計開発法への展開をはかる.本年はおおむね2.,3.,4.を行った.まず,2の時間オートマトンのCEGARループアルゴリズムの並列化による効率向上の研究を行い,並列計算機を用いる方法とボトルネックを見極め1つの計算機でも効率よく発見する方法を考案した.また並列化の論文化をし投稿できる状態にしている,また,ソフトウェア品質をモデル検査とテスト結果両面から評価する手法を考案し,国際会議で発表し論文化した.このテーマを発展させ品質メトリクスの提案まで持って行きたい.またOCLJML変換については相互変換をモデルベースで行う手法を提案し,発表した.またモデル検査技法を使い,表明生成のためのテストケ}ス生成に役立てるツールを実装した.ソフトウェアのモデル検査技術の応用として次の研究を行い,発表した.

1.データベースのスキームの整合性検査,2.プログラムのループのインバリアント自動導出の精度あげるために数理解析ツールを活用する方法, JavaのequalsメソッドとhashCodeメソッドの整合性をSMTソルバーを用いて自動検証する方法.またJML, OCL相互自動変換ツールとそのオープンソフトウェアへの適用や表明カバレッジメトリクスのアイディアについて国際会議等で発表した.1についてはAlloy Analyzerを用いてフォーマルに検証する技法を用いている.2についてはMathematicaを利用することにより精度向上をめざした.3については限定モデル検査やモジュール検証の技法やZ3のビット演算機能を用いて実用的な部分クラスについて自動検証を可能とした.またプログラムの表明導出,Alloyを用いたプログラム仕様検証,ライントレースロボットの自動検証, JML-OCL自動変換などの論文を掲載した.本研究では以下のことを行い、ソフトウェア設計へのフォーマルアプローチの適用可能性、有用性を調べる.1.時間オートマトンのCEGARループの抽象化手法を例題に適用し,有用性を示す.2.提案抽象化手法の並列実行アルゴリズムを提案し,有用性を示す.3.既存ソフトウェアに対してJML記述を自動で付加する処理系を提案手法をもとに作成する.4.UML/OCL記述からJML記述を自動導出する方法をもとに3.とあわせてソフトウェア開発支援システムのプロトタイプを作成する.5.UML/OCL記述から時間オートマトンへ変換する方法と組み合わせ,それらをもとに総合的な設計開発法への展開をはかる.本年はおおむね4.を行った.OCLJML変換については相互変換をモデルベースで行う手法nituについて効率化を目指した改善をいくつか行い,国際会議等にて発表した.またモデル検査技法を使い,表明生成のためのテストケース生成に役立てるツールについて発表・投稿を行った.時間オートマトンのCEGAR並列化の論文化が予定通りに進まなかったがソフトウェア工学への応用としてのメトリクスの可視化をはじめとしてソフトウェア工学への応用で進展が視られた.25年度が最終年度であるため、記入しない。あとは時間オートマトンを用いた設計総合開発システムへの展開であり概ね1年でできると考える.時間オートマトンのCEGAR並列化の論文化を至急取り組みたい.また,進展のあったテーマについて国際会議での発表をいくつか計画している.25年度が最終年度であるため、記入しない。時間オートマトンのモデル検査の研究を進め,またOCL/JML双方向変換を活用したシステムの有効性評価を進めてきたい.
元刊雑劇における人称代名詞の体系

(1)元刊本に見られる2人称代名詞について、変化の過程を明らかにした。(2)元刊本で用いられる1人称代名詞について、字体、音韻的特徴、文法的機能の諸点から考察し、従来異体字ではあるが同義的とされているものについての異なりおよび版本間での出現には明らかに時代的な偏りが見られることを明らかにした。(3)元曲に見える非漢語の親族呼称についての考察を行った。(1)と(3)はそれぞれ学術論文として公刊済みである。(2)は口頭発表を行った。平成22年度はまず『元刊雑劇三十種』について、ユニコードを用いて省略された字体や誤字についてもできるだけ忠実に反映したコーパスの作成を行った。ユニコードに存在しない字体については、正字体に改めたり外字を作るようなことはせずに、括弧{}を用いて扁旁を分けて表示する、あるいは記号で埋めて別途注により字体を示すなどの工夫をした。抽出された各人称代名詞については、『四聲篇海』『五音集韻』『古今韻会挙要』『中原音韻』「洪武正韻』『四聲通解』『洪武正韻譯訓』『訓蒙字會』『蒙古字韻』等当時の韻書および朝鮮字母、パスパ文字による対音資料によって字義の確定および音価を推定する作業を行った。その結果、今年度は二人称代名詞〈〓〉および〈恁〉について以下のような知見が得られた。金代以前に新たに二人称複数のための[ni〓m](上声)という人称代名詞が出現したがこれを表す字がまだ存在しなかった。そのため、漢字表記として、既存の漢字に音を当てる(当て字)、新たに文字を作る、という二つの方法が平行して取られた可能性がある。当て字のために[ni〓m](平声)という近似した発音を持ち、当時はおそらくほとんど用いられていなかったであろう〈恁〉字を用いたであろうということが考えられる。同時期に〈〓〉という漢字も創られたが俗字としての扱いであった。そのため、当時〈恁〉と〈〓〉の両者が混用された。またこの時代、〈恁〉の指示代名詞としての用法も完全には廃れたわけではないので〈恁〉には指示代名詞と人称代名詞という二つの用法が存在した。押韻および対音資料によって、人称代名詞〈恁(〓)〉の音価は[ni〓m】(上声)であろうと推定される。1、今年度は、元曲元刊本(『元刊雑劇三十種』)に用いられる一人称代名詞および二人称代名詞について、他の元刻資料、韻書、字書、および対音資料等参考にしつつ分析を行った。2、『元刊雑劇三十種』に現れる1人称代名詞に関しては、字体、音韻、文法をはじめとする諸点から考察した。その結果、従来異体字ではあるが同義的とされているものについての差異およびいくつかの傾向が明らかになった。3、『元刊雑劇三十種』に現れる2人称代名詞に関して、従来、元代漢語において異体字の関係にあるとされていたものについてもほぼ混用されることはなく使い分けられていることが明らかになった。特に、人称代名詞と指示詞の区別に関しては厳密に一貫性があることがこのたび明らかになった。4、元曲において多用される非漢語系とされる親族呼称について、従来女真語に由来するとされてきたが同時代の対訳文献には記載がなく、元刊本では関漢卿の作品でのみ使用されること等を明らかにした。5、以上のように、従来、「当て字や略字体を多量に含むはなはだ鄙俗なもの」「不完全なもの」とされてきた元曲元刊本が、実は当時の口語および口語に存在する規則性をかなりの程度まで厳密に記録、反映しており、言語研究にとってはたいへん有用な資料であることを確認できた。
Optical Orthogonal Codeの構成とブロック計画の応用

デジタル携帯電話の通信方式CDMA (Code Division Multiple Access)として利用されているスペクトラム拡散通信には,直接拡散方式と周波数ホッピング方式の2種類がある.直接拡散方式では,多数の利用者が同じ周波数帯を共有し,時間軸でも重なっている状態で混信のない通信を行うため,送信された信号が誤って解釈される誤りをできるだけ最小にするように,Optical OrthogonalCode (OOC)と呼ばれるコードが用いられる.ただし,y, zの添え字はvで剰余をとるものとする.またλ_a=λ_c=λのとき(v, k,λ)-OOCと書き,できるだけ多くの符合語をもつOOCを最適であるとする.本研究では,λ=2,3のOOCを有限射影空間上の曲線を用いて構成を行った.以下にその主な結果を示す.補題1 Pを射影平面PG(2,q^2)の点であってPG(2,q)の点ではないものとする.Cを射影平面上のconicであって,かつ点Pを通る有限体GF(q)上のすべてのconicの集合とする.このときCの任意の2つのconicはPG(2,q)上において高々2点で交わり,その曲線の個数はq^3-q^2である.また,qが偶数のときには,補題1の各conicにそのnucleusを追加した点集合を考えC'とするとき,計算機実験により次の結果が予想される.予想C'の任意の2つのconicはPG(2,q)上において高々3点で交わり,その曲線の個数はq^3-q^2である.予想符号語数がq^3-q^2であるような(q^3+q^2+q+1,q+2,2,3)-OOCが構成できる.デジタル携帯電話の通信方式CDMA(Code Division Multiple Access)として利用されているスペクトラム拡散通信には,直接拡散方式と周波数ホッピング方式の2種類がある.直接拡散方式では,多数の利用者が同じ周波数帯を共有し,時間軸でも重なっている状態で混信のない通信を行うため,送信された信号が誤って解釈される誤りをできるだけ最小にするように,Optical OrthogonalCode(OOC)と呼ばれるコードが用いられる.ただし,y,zの添え字はvで剰余をとるものとする.またλ_a=λ_c=λのとき(v,k,λ)-OOCと書き,できるだけ多くの符合語をもつOOCを最適であるとする.本研究では,λ=2のOOCを有限射影空間上の曲線を用いて構成を行った.以下にその詳細な結果を示す.(1)Cをどの2つも高々2点でしか交わらないような射影平面PG(2,q)上のconicの集合とする.このとき(q^3+q^2+q+1,q+1,2)-OOCが存在し,その符号語数は#C+[(q^3-1)/(q^2-1)]となる.ここで#CはCの曲線の個数を表わし、[a]はaを超えない最大の整数であるとする.(2)Pを射影平面PG(2,q^2)の点であってPG(2,q)の点ではないものとする.Cを射影平面上のconicであって,かつ点Pを通る有限体GF(q)上のすべてのconicの集合とする.このときCの任意の2つのconicはPG(2,q)上において高々2点で交わり,その曲線の個数はq^3-q^2である.(3)(1),(2)の結果より符号語数がq^3-q^2+[(q^3-1)/(q^2-1)]であるような(q^3+q^2+q+1,q+1,2)-OOCが構成できる.デジタル携帯電話の通信方式CDMA (Code Division Multiple Access)として利用されているスペクトラム拡散通信には,直接拡散方式と周波数ホッピング方式の2種類がある.直接拡散方式では,多数の利用者が同じ周波数帯を共有し,時間軸でも重なっている状態で混信のない通信を行うため,送信された信号が誤って解釈される誤りをできるだけ最小にするように,Optical OrthogonalCode (OOC)と呼ばれるコードが用いられる.ただし,y, zの添え字はvで剰余をとるものとする.またλ_a=λ_c=λのとき(v, k,λ)-OOCと書き,できるだけ多くの符合語をもつOOCを最適であるとする.本研究では,λ=2,3のOOCを有限射影空間上の曲線を用いて構成を行った.以下にその主な結果を示す.補題1 Pを射影平面PG(2,q^2)の点であってPG(2,q)の点ではないものとする.Cを射影平面上のconicであって,かつ点Pを通る有限体GF(q)上のすべてのconicの集合とする.このときCの任意の2つのconicはPG(2,q)上において高々2点で交わり,その曲線の個数はq^3-q^2である.また,qが偶数のときには,補題1の各conicにそのnucleusを追加した点集合を考えC'とするとき,計算機実験により次の結果が予想される.予想C'の任意の2つのconicはPG(2,q)上において高々3点で交わり,その曲線の個数はq^3-q^2である.予想符号語数がq^3-q^2であるような(q^3+q^2+q+1,q+2,2,3)-OOCが構成できる.
膵癌の微小環境におけるケモカインシグナルのインパクトとその作用機序の検討

我々の樹立した膵発癌マウス(膵臓特異的変異型Kras発現+TGF-betaII型受容体(Tgfbr2)ノックアウト)は、間質の増生・線維化といった臨床の膵癌の組織像を良く再現し、これまでの検討から、膵癌の微小環境における腫瘍間質相互作用が膵癌の進展に寄与していることが分かり、中でもケモカインシグナルの重要性が示唆された。そこで本研究の目的は、この臨床像に近い膵発癌マウスモデルにおいて、ケモカイン受容体CXCR2, CCR2シグナルのノックアウトによる膵癌の発育進展に与えるインパクトと癌の非小環境におけるその作用機序を明らかにし、膵癌の微小環境の病態理解に基づいた、より効果的な膵癌の治療法を開発することである。本膵発癌マウスにおいてCxcr2のヘテロノックアウトを行うと、もとの膵発癌マウスに比べて生存期間が有意に延長することがわかった。Cxcr2ヘテロノックアウトの組織像はH&E染色では著明な相違はないように思われたが、免疫組織学的に詳細な解析を行った結果、Cxcr2ヘテロノックアウトでは腫瘍血管新生が抑制されており、癌細胞の血管への微小浸潤も抑制されていた。また、Cxcr2ヘテロノックアウトでは、腫瘍内に浸潤している好中球、骨髄由来抑制性細胞(myeloid-derived suppressor cells, MDSC)が減少しており、apoptosisに陥っている癌細胞が増加していた。これまでの研究で、膵癌細胞と癌関連線維芽細胞とが同じ種類のCXCケモカインを産生して、お互いの浸潤・遊走能を高めていることも示されており、膵癌の微小環境においてCXCR2シグナルの阻害が、膵癌と線維芽細胞の協働による膵癌の浸潤を抑制し、腫瘍内の免疫・炎症細胞のプロファイルを変化させ、生命予後にも寄与する有望な分子標的治療となり得ることが示唆された。また、本膵発癌マウスにおいてCcr2のノックアウトも行うべく交配を進めている。本膵発癌マウスにおいてCxcr2ヘテロノックアウトとCxcr2野生型の個体が十分な数(各n=25以上)得られ、その生存期間の比較ができた。ヘテロノックアウトであったが、生存期間に有意差が得られ、このシグナルのインパクトが示された。またその組織像の解析のために週齢を揃えて膵腫瘍組織を確保し、詳細な免疫組織学的解析を行うことが出来た。本膵癌マウスにおいてCcr2をノックアウトするプロジェクトについては、Ccr2ノックアウトアレルとTgfbr2 floxedアレルの一方がホモ接合体となると他方が野生型となってしまう傾向があり、両アレルのホモ接合体が得られにくい状況ではあるが、徐々に交配が進んでいる。Cxcr2ヘテロノックアウトのインパクトについては、癌関連線維芽細胞と膵癌細胞とのCXCケモカイン-CXCR2 axisを介した膵癌進展機序を含めて論文化し現在投稿中。また、Ccr2阻害剤の存在により、膵癌細胞、癌関連線維芽細胞、マクロファージ系の細胞の増殖や浸潤・遊走能に影響があるかどうかをin vitroの系にて確認するのに加え、それぞれの細胞の共培養とCcr2阻害剤の有無が、増殖・浸潤・遊走に与える影響についても検討する。膵癌は年々増加傾向にあり、その予後は依然として最難治癌であり、その病態の理解および、より有効な治療法の開発が急務である。我々の樹立した膵発癌マウス(膵臓特異的変異型Kras発現+TGF-b 2型受容体ノックアウト,PKT)は、間質の増生・線維化といったヒト膵癌の組織像をよく再現し、これまでの検討から、膵癌の微小環境における腫瘍間質相互作用が膵癌の進展に寄与していることがわかり、中でもケモカインシグナルの重要性が示唆された。そこで本研究の目的は、この臨床像に近い膵発癌マウスモデルPKTにおいて、ケモカイン受容体CXCR2、CCR2シグナルのノックアウト・ノックダウンによる膵癌の発育進展に与えるインパクトと癌の微小環境におけるその作用機序を明らかにし、膵癌の微小環境の病態理解に基づいた、より効果的な膵癌の治療法を開発することである。これまで、PKTにおけるCxcr2のヘテロノックアウト(PKT CXhet)は交配が進んでおり、PKTとの生存期間の直接比較を行うと共に、その膵腫瘍の組織学的比較検討を進めている。PKT CXhetは、PKTと比べ、有意に生存期間が延長する結果が得られている。その生体内での機序を、膵腫瘍組織を用いて検討中であり、腫瘍の微小環境に関わる種々の因子について免疫染色を行い比較している。また、PKTマウスの膵腫瘍から得た癌関連線維芽細胞(CAF)と正常膵から得た線維芽細胞との遺伝子発現プロファイルの相違をマイクロアレイにて解析中である。さらに、膵癌微小環境に豊富にみられるCCR2リガンドの意義を検討するため、Ccr2のノックアウトマウスを導入し、これをPKTと交配するための手順を開始したところである。PKTとCxcr2のヘテロノックアウトとの交配により、PKT CXhet(Cxcr2のヘテロノックアウト)とPKTとの生存期間の比較の結果が得られてきており、Cxcr2のヘテロノックアウトにより生存期間は有意に生存延長効果が示されている。また、その生体内での機序を明らかにするための膵腫瘍の組織学的解析を進めている。癌関連膵線維芽細胞と正常膵線維芽細胞との遺伝子発現プロファイルの相違の検討も進めている。

PKTとCcr2ノックアウトとの交配については、Ccr2ヘテロノックアウトが自施設に導入され、これをTgfbr2 floxed/floxedと交配開始したところである。我々の樹立した膵発癌マウス(膵臓特異的変異型Kras発現+TGF-betaII型受容体(Tgfbr2)ノックアウト)は、間質の増生・線維化といった臨床の膵癌の組織像を良く再現し、これまでの検討から、膵癌の微小環境における腫瘍間質相互作用が膵癌の進展に寄与していることが分かり、中でもケモカインシグナルの重要性が示唆された。そこで本研究の目的は、この臨床像に近い膵発癌マウスモデルにおいて、ケモカイン受容体CXCR2, CCR2シグナルのノックアウトによる膵癌の発育進展に与えるインパクトと癌の非小環境におけるその作用機序を明らかにし、膵癌の微小環境の病態理解に基づいた、より効果的な膵癌の治療法を開発することである。本膵発癌マウスにおいてCxcr2のヘテロノックアウトを行うと、もとの膵発癌マウスに比べて生存期間が有意に延長することがわかった。Cxcr2ヘテロノックアウトの組織像はH&E染色では著明な相違はないように思われたが、免疫組織学的に詳細な解析を行った結果、Cxcr2ヘテロノックアウトでは腫瘍血管新生が抑制されており、癌細胞の血管への微小浸潤も抑制されていた。また、Cxcr2ヘテロノックアウトでは、腫瘍内に浸潤している好中球、骨髄由来抑制性細胞(myeloid-derived suppressor cells, MDSC)が減少しており、apoptosisに陥っている癌細胞が増加していた。これまでの研究で、膵癌細胞と癌関連線維芽細胞とが同じ種類のCXCケモカインを産生して、お互いの浸潤・遊走能を高めていることも示されており、膵癌の微小環境においてCXCR2シグナルの阻害が、膵癌と線維芽細胞の協働による膵癌の浸潤を抑制し、腫瘍内の免疫・炎症細胞のプロファイルを変化させ、生命予後にも寄与する有望な分子標的治療となり得ることが示唆された。また、本膵発癌マウスにおいてCcr2のノックアウトも行うべく交配を進めている。本膵発癌マウスにおいてCxcr2ヘテロノックアウトとCxcr2野生型の個体が十分な数(各n=25以上)得られ、その生存期間の比較ができた。ヘテロノックアウトであったが、生存期間に有意差が得られ、このシグナルのインパクトが示された。またその組織像の解析のために週齢を揃えて膵腫瘍組織を確保し、詳細な免疫組織学的解析を行うことが出来た。本膵癌マウスにおいてCcr2をノックアウトするプロジェクトについては、Ccr2ノックアウトアレルとTgfbr2 floxedアレルの一方がホモ接合体となると他方が野生型となってしまう傾向があり、両アレルのホモ接合体が得られにくい状況ではあるが、徐々に交配が進んでいる。PKT CXhetとPKTとの生存期間の相違のデータを確定すると共に、その生体内での機序を膵腫瘍の組織学的検討から明らかにする。微小環境における各種因子の免疫染色をベースに解析を進める。膵癌微小環境における癌関連線維芽細胞(CAF)の働きについては、正常膵線維芽細胞との遺伝子発現プロファイルとの相違から、CAFが特徴的に産生している因子の機能的意義を癌細胞と線維芽細胞との共培養などの系にて検討する。PKTにおけるCcr2のノックアウトについては、マウスの交配を進め、PKT Ccr2ノックアウトとPKTとの表現型の相違を検討していく。
次世代高性能硬Ｘ線非球面望遠鏡の超平滑面創成

欧米の協力の下に日本が2015年度に打上げる硬X線望遠鏡と軟X線望遠鏡を搭載したX線天文衛星ASTRO-Hの開発は終了し、現在は打ち上げ前の種々のテストを行っている。高性能な硬X線望遠鏡を開発するには現状の円錐近似の反射鏡ではなく、正確な回転放物面と回転双曲面からなる反射鏡が必須であり、軽量化のためには超精密な非球面金型からレプリカ法で非球面反射鏡基板を製作する方法がベストである。従来は前加工のし易さからアルミニウム合金を超精密ダイヤモンド切削し、それに無電解ニッケルを成膜し、ダイヤモンド切削と研磨で非球面金型を製作する方法と合成石英を研削・研磨して非球面金型を製作する方法を研究開発して来た。しかし、日米欧の経済状態から次世代の硬X線望遠鏡にはより安価に非球面金型を製作する技術の開発が急務となった。特に、合成石英の非球面研磨では所用の形状を創成するのに年単位の時間が必要であった。そこで、本年度は、前加工が極めて容易なグラファイトを金型材料として採用し、非球面切削後に炭化珪素を化学気相成長させ、その表面をこの研究で開発したShape Adaptive Grinding (SAG)工具で研削する方法を見出した。この工具は研究室内で極めて容易に製作でき、工具寿命も10時間以上あり、表面粗さ0.4nm Ra以下の面を従来法に比べ12桁高能率な10100mm3/minの除去速度で加工できることを見出した。液晶用ガラスをX線反射鏡基板として使う場合に使用できる非球面金型をこのSAG研削のみで製作できることが判明し、次世代の高性能硬X線非球面望遠鏡の新しい製作法として注目を浴びている。この研究により研究分担者は国際生産工学アカデミー(CIRP)より2015年8月にTaylor Medalを受賞することになった。26年度が最終年度であるため、記入しない。日本が主導し、欧米が国際協力することにより2015年の打上げを目指し、ASTRO-H衛星の開発が進んでいるが、それ以降の硬X線望遠鏡開発計画が世界的に皆無であり、X線天文学の発展のためには、次世代の高性能硬X線望遠鏡の開発計画を早急に作成する必要がある。次世代のX線望遠鏡としては円錐近似でなく、正確な回転放物面と回転双曲面からなる軽量・安価な反射鏡製作技術の確立が急務である。軽量化のためには、金型から反射鏡基板を成形するレプリカ反射鏡を製作する方法が有利である。本研究は、そこで使用する回転放物面ならびに回転双曲面からなる超精密非球面金型を製作する超平滑面創成技術を開発することにある。NASAが開発した液晶用ガラス基板を合成石英製円筒金型の上に載せ、加熱・成形してX線望遠鏡基板とする方法の非球面化を図るため、210mm角、60mm厚の合成石英材料を半径200mmの円錐形に研削し、それをボネット研磨とパナソニック社の超高精度三次元測定器UA3P-500Hによる形状計測を繰り返すことにより、回転放物面からの形状誤差36.7μmP-Vを100nmP-Vに仕上げることができた。フロート・ポリシングおよび流体ジェット研磨に共通する砥粒の高速流れと加工表面との相互作用をCOMSOL社のソフトウエア(Multiphysics Subscription)で解析するため、数値シミュレーションモデルの構築を行った。平成26年度に3編の学術論文が発刊される予定であるなど、研究成果が顕著であるため。

超精密研磨の物理学的シミュレーションを行うと共に、合成石英製非球面金型を完成させ、NASA/GSFCに送り、硬X線望遠鏡用金型として適しているかどうか調査研究する。また、この合成石英製非球面金型を研磨した経験から前加工としての研削が極めて重要であることを認識したため、超精密研磨の研究と共に、ダイヤモンドシートを貼り付けた新しい研削工具による超精密研削も手掛ける。X線望遠鏡用の金型材料として、前加工の容易なグラファイトに炭化珪素を化学的気相成長させたものを上記の新工具による研削と超精密研磨で仕上げる方法も開発する計画である。
選択理論心理学を活用した心の健康教育教材の開発とその効果の検証

生徒の人間関係力を向上するねらいで,選択理論心理学を用いた教材を開発活用し,あらゆる機会を通じ,コミュニケーションスキルを向上させる支援を行い,その効果を検証した。2年生に実施した薬物乱用防止講座の中で,タバコを吸うか吸わないかは自己の欲求からの選択であるというプレゼンテーションを行った後,グループでタバコを吸わない宣言のキャッチコピーを作るワークを行った。この感想の内容をまとめてみたところ,これからの選択への責任,決意,達成感などが多く見られた。このことから,自分たちが作り出した喫煙防止キャッチコピーを自分たち自身のこれからの選択への宣言として取り入れるという効果がみられたと考察する。3年生に実施した思春期講座では,オリジナル教材として「人間関係を『ぴと』で考えると」を開発した。これは人間関係をより良くしていくための教材であり,友人関係や異性関係に役立つようにと考えたものである。人間関係の距離感を「ぴと」という単位で概念化した。いずれの距離においても役立つ人間関係の持ち方としてレクチャーした。この講座への生徒の評価は,おおむね良好なものであった。また,「Happy Cakeをつくろう!」というコミュニケーションワークを開発し,全校生徒の中から希望者に行った。このワークをすることで,相互の関係の距離感が縮まったり,自己の内的統制感が高まったりする効果も期待できるということが調査から若干みることができた。「心の授業」として過年度から実施していた2年生対象の選択理論心理学をレクチャーする授業では,高野和子氏とともにTTで行った。内容は,心の宝石箱「上質世界」を公開し共有するワーク,「基本的欲求」との関連づけ,そしてその中から自分自身の目標への「全行動」のプランニングのワークで構成した。これについての生徒の評価および内的統制感との関連は現在分析中であり,選択理論心理学研究に論文として投稿予定である。
生理心理反応を考慮した衣服シミュレータの開発

本研究では人体が衣服を着用した場合の心理生理反応のシミュレーションによる予測を最終目標とし,アンダーウェア(特にブラジャー)を着用した場合の人体の変形と衣服圧,さらにそれに伴う心理生理変化をシミュレート可能なモデルを構築することが目的である.最終年度はブラジャーから受ける衣服圧による心理反応の計測と,それらのデータを基にしたシミュレーションにおける心理反応の予測を試みた.シミュレーションで心理反応を予測するためには,ブラジャーによる衣服圧や人体の変形が,心理反応(たとえば,フィット感等)にどのように影響しているのかを定量的に求める必要がある.そこで計測では,衣服圧を段階的に調整可能なブラジャーを作製し,それらを用いて着用実験を行ない,そのときの衣服圧と皮膚変形,そして着用者の官能量を計測した.計測の結果,脇部分の衣服圧とブラジャーのフィット感の間に有意に相関が確認された.皮膚変形とフィット感の間においても,有意な相関関係が確認されたが,これはそもそもブラジャーからの衣服圧によって皮膚が変形していることから,衣服圧と皮膚変形の間の相関が大きいためと推測される.計測ではフィット感以外にも,快適感や肌触り等の他の官能量についても衣服圧や皮膚変形との関係を検証したが,有意な相関は確認できなかった.よって以上の結果を基に,シミュレーションで予測された脇部の衣服圧からブラジャーのフィット感を予測するシミュレーションを行なった.その結果,大まかな快・不快については予測できるものの,着用者が実際に感じている微妙な感覚を予測することはできなかった.これはシミュレーションにおける衣服圧予測の精度の問題と,衣服圧とフィット感の間を結びつける関係式の精度の問題が考えられる.したがって今後は両者の精度を向上が課題である.本研究では衣服が人体に与える圧力すなわち衣服圧に着目し、衣服圧が人体に加わった場合の生理的変化をシミュレート可能なモデルを構築することが目的である。本年度に行なった研究によって以下の知見を得た。1.パーティクルシステムによる圧力分布の推定衣服圧の人体への影響をシミュレートする場合、衣服圧の推定は必須である。そこで本研究ではパーティクルシステムを用いて動的な衣服圧推定のアルゴリズムを考案した。ただし、本年度の研究では人体を剛体としている。つまり、マネキン等に衣服を着せた場合の衣服圧ということになる。アルゴリズムでは、まず衣服をパーティクルにより離散近似し、人体を三角形ポリゴンで近似した。そして各パーティクルの運動方程式を解き、人体を表わす三角形ポリゴンに加わる力を計算することで人体に掛かる衣服圧の推定を行なった。シミュレーションの検証を行なうためにシミュレーション結果と実際の実験結果を比較した結果、ほぼ同様の分布をしておりシミュレーションの妥当性が示唆された。2.弾性人体モデルの構築上記1でも述べたが本年度の研究では、人体を剛体として衣服圧推定を行なった。しかし実用化を考慮した場合、人体は剛体ではなく弾性体である必要がある。そこで、本年度は人体の中で特に衣服圧の影響が大きいと考えられる成人女性の胸部に着目し、弾性体モデルを構築した。モデルの構築ではまずVisible Humanプロジェクトの女性断面画像から皮膚、皮下脂肪、筋肉・骨領域を推定し、それを元に皮膚部、皮下脂肪部、筋・骨格部の3層構造の弾性胸部モデルを作成した。各部のヤング率やポアソン比などの材料特性は硬度計を用いて測定した。今後は構築された弾性胸部モデルをさまざまな条件下でシミュレートし、実際の形状や挙動と比較検討することで、モデルの妥当性を検証する予定である。本研究では衣服が人体に与える圧力すなわち衣服圧に着目し,衣服圧が人体に加わった場合の生理心理的変化をシミュレート可能なモデルを構築することが目的である.本年度は昨年度に引き続き人体のモデリングを中心に研究を行なった.昨年度の研究では3次元計測により人体表面形状を取得し,生理学的知見に基づき経験的に脂肪・筋肉等の皮下組織をモデル化した.しかし,検証の結果,この手法で作成されたモデルには誤差が含まれることが判明した.そこで今年度は実際の皮下組織の構造に忠実な人体モデルを作成するために,人体MRI画像から皮下組織を推定し人体モデルを構築することを試みた.さらに皮下組織の材料特性は,実際の胸部形状に一致するような物性を同定した.構築されたモデルの妥当性を検証するために変形シミュレーションを行なった.シミュレーションでは立位時とファンデーション着用時の変形形状,接触圧を推定した.接触圧を推定する際には,構築した人体モデルとファンデーションモデルとの間で接触問題を解くことで求めた.シミュレーション結果を3次元計測装置とエアパック式圧力測定装置を用いて得られた結果と比較することで検証を行なった.その結果,立位時の人体形状はほぼ実際の形状に変形することが確認された.一方ファンデーションを着用した場合のシミュレーション結果は,ファンデーションを接触させることで形状が変形することが確認されたが,接触処理をする際に含まれる誤差等から実際の形状との間に大きな差異が生じた.また,接触に関しても実際の値に比べて高い圧力値が推定された.このことから,今後は人体モデルと接触物体との間の接触アルゴリズムを検討することが必要であることが考えられる.本研究では人体が衣服を着用した場合の心理生理反応のシミュレーションによる予測を最終目標とし,アンダーウェア(特にブラジャー)を着用した場合の人体の変形と衣服圧,さらにそれに伴う心理生理変化をシミュレート可能なモデルを構築することが目的である.最終年度はブラジャーから受ける衣服圧による心理反応の計測と,それらのデータを基にしたシミュレーションにおける心理反応の予測を試みた.シミュレーションで心理反応を予測するためには,ブラジャーによる衣服圧や人体の変形が,心理反応(たとえば,フィット感等)にどのように影響しているのかを定量的に求める必要がある.

そこで計測では,衣服圧を段階的に調整可能なブラジャーを作製し,それらを用いて着用実験を行ない,そのときの衣服圧と皮膚変形,そして着用者の官能量を計測した.計測の結果,脇部分の衣服圧とブラジャーのフィット感の間に有意に相関が確認された.皮膚変形とフィット感の間においても,有意な相関関係が確認されたが,これはそもそもブラジャーからの衣服圧によって皮膚が変形していることから,衣服圧と皮膚変形の間の相関が大きいためと推測される.計測ではフィット感以外にも,快適感や肌触り等の他の官能量についても衣服圧や皮膚変形との関係を検証したが,有意な相関は確認できなかった.よって以上の結果を基に,シミュレーションで予測された脇部の衣服圧からブラジャーのフィット感を予測するシミュレーションを行なった.その結果,大まかな快・不快については予測できるものの,着用者が実際に感じている微妙な感覚を予測することはできなかった.これはシミュレーションにおける衣服圧予測の精度の問題と,衣服圧とフィット感の間を結びつける関係式の精度の問題が考えられる.したがって今後は両者の精度を向上が課題である.
脳疾患パーソナルゲノム多様性を分析する情報学の創成

ヒトゲノム全域にわたって多様性情報を収集し分類することは人類遺伝学の大きな目標であるが、その情報量の大きさゆえに効率的に観測・分類を行うことは困難であった。本研究では、短いが高精度なDNA解読リードおよび精度は若干劣るが1万塩基対を超える長いDNA解読リードという互いに補完的な特徴を持つ情報を組合せ、1塩基置換(SNP)/短い挿入削除等のミクロな多様性だけでなく、大規模な挿入削除領域/重複領域/染色体内逆位/染色体の融合転座等のマクロな多様性を検出するアルゴリズムを研究開発した。これらを利用して脳疾患に特徴的な構造多型を個人ゲノムデータから解読することを可能にした。構造多型の検出アルゴリズムの研究開発:SNPの検出アルゴリズムの研究に取り組み成果を収めた。また、長い挿入削除、逆位、染色体融合等の構造多型を精度よく検出する方法論についても目途が付き改善中である。本命題はたとえば1000人ゲノムプロジェクトでも研究されてきたが、多数の人が共有する頻度の高い典型的な構造多型の検出に重きが置かれ、稀な変異の検出には向かなかった。本研究では1個体からでも稀な変異を検出するアルゴリズムの構築が目標である。家系データからのinheritance stateの推定:父母のゲノムデータが揃った家系データから子の2つのアレルのinheritance stateを推定することは難しい問題ではない。ところが現実のデータでは、どちらか1人の親のゲノムデータしかない場合が多く、その場合inheritance stateを推定することは非常に難しい問題になることが知られている。我々はこの問題を解くためのアルゴリズムを設計し、高い精度を確認することに成功した。日本人レファレンスゲノムの作成:現在標準的に使われているヒトゲノムは約200人の集団から無作為に選択された人のゲノムである。日本人の標準ゲノムとは大きく違うと考えられている。実際、2008年に中国人、2009年に韓国人のゲノムが解読され、欧米人と東洋人のゲノムとの間には数多くの差異が見つかってきている。家系データを使い、日本人の標準的なゲノムを複数決めることができた。今後は、日本人内ゲノム多様性のプロファイリングを進める。多様性と疾患の関連解析:minor allele frequencyのSNPを検出する技術を使って、疾患関連遺伝子座のSNPプロファイリングを行い、複数の疾患に関連する変異を同定することに成功した。ヒトゲノムの多様性には大きく分けて、1塩基置換(SNP)/短い挿入削除等のミクロな多様性、大規模な脆弱領域/染色体内逆位/染色体の融合転座等のマクロな多様性がある。超高速DNA解読装置の登場は、疾患関連遺伝子座の状態を、1塩基対レベルで観測することを可能にした。この結果、稀な変異が多様に起こり発症すると考える仮説の検証を可能にしつつある。本研究では、これまでの研究でゲノムと疾患の相関について先駆的研究が展開されてきた脳疾患を対象に、個人ゲノム情報を収集し、疾患と相関の高い多様性モチーフを探し出し、モチーフが生まれる機序を推定する新しい情報学を創成することを目指している。平成23年度は挿入削除、逆位、染色体融合等の構造多型を精度よく検出することに取り組んだ。これらの変異が起こっているゲノム上の位置を精度良く推定するために、split alignmentアルゴリズムを作成した。また、挿入欠失部位の周辺ではアラインメントの誤りに起因する擬陽性の多型が検出される例が多いことが分かっているが、この問題に対処をするために生リードを直接アラインメントするのではなく軽くアセンブリを行いリードを擬似的に伸ばした後にアラインメントを行うことで擬陽性を大きく減らすアルゴリズムを開発した。また、PacBio RSが導入され、長いリードが収集可能になった。PacBioリードには塩基レベルで10%を超える挿入削除エラーが含まれる。この補正のため、Illuminaリードとのマッチングを取る高精度かつ高速なアルゴリズムを研究開発した。一方で、個人固有のde novo insertionのカタログ化を進めている。また、400 alleleの情報を基に、日本人の標準的なゲノムを決定した。これにより日本人内ゲノム多様性のプロファイリングは格段に進歩すると期待できる。PacBioは一分子計測でDNA配列を解読するため15%程度の短い挿入削除が入る。この問題の解決のために2つのアプローチを試した。1つ目はPacBioリード間でエラーを補正するというアプローチである。PacBioリードをゲノムの40倍から100倍の被覆度で収集する必要があるため、バクテリア等の数百万塩基の小さなゲノムサイズを持つ生物種に対して有効であることが知られている。そこで平成25度は、線虫(ゲノムサイズ120Mb)、およびメダカ(ゲノムサイズ800Mb)程度まで本アプローチの有効範囲を拡大した。

線虫においてはcontig N50長で約2Mb、メダカにつては約200 kbの精度の高い配列が得られた。最終年度の平成26度は論文としてまとめ上げる。しかし高い被覆度でデータを収集することがコスト面で困難な生物種、たとえばヒトや脊椎動物においては、PacBioリードを高々30倍の被覆度で収集することが現実的である。このような大規模ゲノムを扱う場合に2つ目のアプローチとして、廉価にデータ収集が可能な長さが100塩基程度の短いIlluminaリードを使ってエラーを補正することに取り組んできた。平成25度はヒトを対象にした研究を展開し被覆度30倍のデータを収集し解析をすすめた。平成26度はこれらの結果から構造多型を抽出し、論文としてまとめる。PacBio RS IIは一分子計測で平均長1万塩基の長い断片を解読できる装置である。この技術を活用して、本研究では長い挿入削除、逆位、染色体融合等の構造多型を精度よく検出する研究課題に取り組んだ。技術的課題はDNA配列を解読するため15%程度の短い挿入削除が入ることである。この問題の解決のために2つのアプローチを試した。1つ目はPacBioリード間でエラーを補正するというアプローチである。PacBioリードをゲノムの40倍から100倍の被覆度で収集する必要があるため、バクテリア等の数百万塩基の小さなゲノムサイズを持つ生物種に対して有効であることが知られている。そこで平成26年度は、線虫(ゲノムサイズ120Mb)、およびメダカ(ゲノムサイズ800Mb)程度まで本アプローチの有効範囲を拡大した。線虫においてはcontig N50長で約2Mb、メダカにつては約1Mbの精度の高い配列が得られた。大規模ゲノムを扱う場合に2つ目のアプローチとして、廉価にデータ収集が可能な長さが100塩基程度の短いIlluminaリードを使ってエラーを補正することに取り組んできた。平成26年度はこれらの結果から構造多型を抽出するアルゴリズムを研究開発した。ゲノム医科学、シーケンシング、情報科学の分野で国際的に活躍する研究者(森下真一、笠原雅弘)が密に連携し、日本人標準ゲノムの作成、minor allele frequency SNPの検出など、これまでは困難と考えられてきた研究課題で成果をあげ、現在1本を投稿中、3本を投稿準備中である。本研究では、これまでの研究でゲノムと疾患の相関について先駆的研究が展開されてきた脳疾患を対象に、個人ゲノム情報を収集し、疾患と相関の高い多様性モチーフを探し出し、モチーフが生まれる機序を推定する新しい情報学を創成することを目指している。