hpprc/llmjp-kaken huggingface dataset:
転写因子RFXの転写活性化、及び抑制機序の解明

さらにE4F1はRFX1と相同性の高いRFX3とも結合することが明らかとなった。RFX1による転写調節にE4F1が与える影響を調べるため、レポーターアッセイ系でpreliminaryな検討を行い、HeLa細胞にE4F1を過剰発現させるとRFX1によるMAP1A遺伝子プロモーターへの転写抑制作用を軽減させることが明らかになった。E4F1がRFX1の転写活性化ドメインを含む領域に結合することから推測しても、この分子はRFX1の転写活性化補助因子として作用する可能性が示唆された。以上までの成果は第26会分子生物学会年会で報告した。さらにレポーターアッセイの系によりE4F1がRFX1の転写抑制化ドメインの有無とは無関係に(すなわち転写抑制を阻害する機能に関与しているのではなく)転写活性化に関与しているかどうかの検討を進めている。PCNAとRFX1との関連に関しでは16年度に解析を進める。微小管結合蛋白MAP1Aを始め様々な遺伝子の転写制御に関与する転写因子群RFXのうち、プロトタイプであるRFX1の転写制御機構を明らかにするため、これと相互作用する因子を探索した。本年度は前年度にyeast two hybrid systemでのスクリーニングにより得られた因子のうち、アデノウイルスE4の転写調節を行う細胞性転写因子p120^<E4F>のRFX1活性に及ぼす影響を検討した。HeLa細胞においてRFX1により転写抑制を受けるMAP1A遺伝子プロモーターに対し、p120^<E4F>を過剰発現させるとその転写亢進が認められた。p120^<E4F>はRFX1のDNA結合領域を含む部分に結合することが前年度に判明していたため、この転写亢進作用は転写抑制作用を有するRFX1がDNAに結合するのを阻害する可能性が考えられた。このためクロマチン免疫沈降法とRFX1-GAL4 DNA binding domainキメラ蛋白を用いたレポーターアッセイを行ったところ、p120^<E4F>の過剰発現はRFX1とDNAの結合には影響を及ぼさず、またp120^<E4F>による転写亢進作用にRFX1自身のDNA結合の有無は関係しないことが明らかになった。さらにこの転写亢進がRFX1による転写抑制をうち消すもの(脱抑制)なのか、これとは独立した転写亢進作用なのかを明らかにするために、種々のRFX1部分クローンとGAL4 DNA binding domainとのキメラ蛋白の転写調節機能に対するp120^<E4F>の影響をしらべたところ、p120^<E4F>はRFX1のB、Cドメインが有する転写抑制作用をうち消す(脱抑制する)ことが明らかとなった。またRFX1は細胞増殖核抗原(PCNA)の転写調節に関与することも知られているが、PCNAの転写はアデノウイルスE1Aにより活性化することが知られる。p120^<E4F>はE1Aによりリン酸化修飾を受けることが知られ、PCNAプロモーターに対するE1Aの活性化作用はp120^<E4F>を介したRFX1による転写抑制を脱抑制するという仮説を立て、これを検証するレポーターアッセイを行った。この結果、前記の仮説を支持するデータを得た。
数量データに基づくWeb情報の信頼性検証と高信頼情報の生成

【数量データの収集とその集約に基づいた数量データの意味づけ】数量データを大規模に収集するために,深層強化学習を用いたデータクローラを開発した.教科学習の報酬としてデータの発見の有無を,行動としてどのページへ遷移するかを設定し,長期的な報酬に基づいてリンクを選択的にたどるようなクローラを作成した.平成30年度の段階ではまだ実用には至っていないが,実験においては,これまで提案されていたオンライン学習に基づくクローラよりも高い効率を達成できることを確認している.また,Webから収集された400万件の表データから同一属性や上位下位関係を特定する方法について研究を行った.同一属性の判定には同一実体に対する属性値の一致度を用い,上位下位関係の判定には表の構造と属性値の関係性を用いる.【数量データと情報の対応付けに基づく情報の信頼性評価】Webページに記述されている内容と構造化された知識の対応づけをゼロショット学習の設定下において実現する方法を提案した.この提案手法では,訓練データに出現しないような知識であってもWebページ上の記述と対応づけることが可能であり,この方法によって,より広い範囲の知識とWeb上の記述を対応づけることが可能になった.提案モデルとしては,双方向LSTMによってWeb上の記述を特徴付け,それと知識ベース中のパスをグラフ埋め込みによって表現したものとの類似度を計算し,高い類似度を与えるようなパスがその記述に対応するとしている.また,「古い」や「長い」といったある特定の属性と関係が強い単語から,それが意味する属性値を推定する方法についても研究を行った.この方法では,単語と属性名の類似度に加えて,その単語と属性名が共起するかどうか,また,単語の有無によって属性値の分布が著しく変化するかどうかによって,単語と属性間の対応関係の強さを測った.「(課題3)数量データからの高信頼情報の生成」については大きな進展はなかったものの,「(課題1)数量データの収集とその集約に基づいた数量データの意味づけ」,および,「(課題2)数量データと情報の対応付けに基づく情報の信頼性評価」については想定以上に研究が進んでいる.(課題1)数量データの収集とその集約に基づいた数量データの意味づけ:平成31年度は主に平成30年度に収集した数量データから同一性と包含関係の判定を大規模に行う方法について取り組む.(課題2)数量データと情報の対応付けに基づく情報の信頼性評価:平成31年度は主に平成30年度に収集した数量データから宣言的知識と数量データを対応づけることを目標とする.(課題3)数量データからの高信頼情報の生成:平成31年度は検索行動ログから関係性を発見する方法について取り組む.【数量データの収集とその集約に基づいた数量データの意味づけ】数量データを大規模に収集するために,深層強化学習を用いたデータクローラを開発した.教科学習の報酬としてデータの発見の有無を,行動としてどのページへ遷移するかを設定し,長期的な報酬に基づいてリンクを選択的にたどるようなクローラを作成した.平成30年度の段階ではまだ実用には至っていないが,実験においては,これまで提案されていたオンライン学習に基づくクローラよりも高い効率を達成できることを確認している.また,Webから収集された400万件の表データから同一属性や上位下位関係を特定する方法について研究を行った.同一属性の判定には同一実体に対する属性値の一致度を用い,上位下位関係の判定には表の構造と属性値の関係性を用いる.【数量データと情報の対応付けに基づく情報の信頼性評価】Webページに記述されている内容と構造化された知識の対応づけをゼロショット学習の設定下において実現する方法を提案した.この提案手法では,訓練データに出現しないような知識であってもWebページ上の記述と対応づけることが可能であり,この方法によって,より広い範囲の知識とWeb上の記述を対応づけることが可能になった.提案モデルとしては,双方向LSTMによってWeb上の記述を特徴付け,それと知識ベース中のパスをグラフ埋め込みによって表現したものとの類似度を計算し,高い類似度を与えるようなパスがその記述に対応するとしている.また,「古い」や「長い」といったある特定の属性と関係が強い単語から,それが意味する属性値を推定する方法についても研究を行った.この方法では,単語と属性名の類似度に加えて,その単語と属性名が共起するかどうか,また,単語の有無によって属性値の分布が著しく変化するかどうかによって,単語と属性間の対応関係の強さを測った.「(課題3)数量データからの高信頼情報の生成」については大きな進展はなかったものの,「(課題1)数量データの収集とその集約に基づいた数量データの意味づけ」,および,「(課題2)数量データと情報の対応付けに基づく情報の信頼性評価」については想定以上に研究が進んでいる.(課題1)数量データの収集とその集約に基づいた数量データの意味づけ:平成31年度は主に平成30年度に収集した数量データから同一性と包含関係の判定を大規模に行う方法について取り組む.(課題2)数量データと情報の対応付けに基づく情報の信頼性評価:平成31年度は主に平成30年度に収集した数量データから宣言的知識と数量データを対応づけることを目標とする.(課題3)数量データからの高信頼情報の生成:平成31年度は検索行動ログから関係性を発見する方法について取り組む.
維持期脳卒中片麻痺者における簡便な教示による歩行練習の効果の検証

本研究では、維持期脳卒中片麻痺者において特別な機器を要さず簡便に実施可能な歩行練習による歩行機能向上効果を検証した。通所リハビリテーションを利用する地域在住の維持期脳卒中片麻痺者を対象に、用いている杖をできるだけ早く出すようにして歩く杖操作促進歩行練習、非麻痺側または麻痺側の下肢で床上の直線上を踏むようにして歩くラインステップ歩行練習のいずれかを4週間実施した結果、各歩行練習において歩行速度の有意な増加が認められた。本研究で検証した歩行練習は一般的に障害の改善が得られにくいとされる維持期脳卒中者の歩行機能改善を図る効果的・効率的な歩行練習方法の1つになる可能性が示唆された。本研究の目的は、地域在住の維持期脳卒中片麻痺者における簡便な教示による歩行練習の介入効果を具体的に明らかとすることである。平成26年度では、通所施設を利用する地域在住の維持期脳卒中者を対象に、まず、杖操作促進歩行(杖を早く出して歩くように教示して実施する歩行)、麻痺側下肢ラインステップ歩行(歩行路上の直線歩行方向を示したラインを麻痺側下肢で踏むようにして歩くように教示して実施する歩行)、非麻痺側下肢ラインステップ歩行(歩行路上の直線歩行方向を示したラインを非麻痺側下肢で踏むようにして歩くように教示して実施する歩行)を最大歩行速度で実施した。その結果、教示をしない歩行に比べて教示をした歩行では歩行速度が有意に増加し、麻痺側下肢および非麻痺側下肢の平均1歩行周期時間が有意に低い値を示したことから、本研究で用いた教示が維持期脳卒中片麻痺者の歩行パフォーマンスを即時的に向上させる可能性が示唆され、これらの教示を用いた歩行練習を実施することによって歩行パフォーマンスの改善を加速させることが期待される結果となった。そこで、通所施設を利用する地域在住の維持期脳卒中者を対象に、杖操作またはラインステップの教示を用いた歩行練習の効果について、1か月ごとの歩行練習介入期(B)、歩行練習非介入期(A)、歩行練習介入期(B ́)とを設定した3か月間のシングルケースデザイン(BAB ́型デザイン)にて検証した。その結果、一定の対象者において歩行練習介入期での即時的な歩行速度の増加ならびに歩数の減少(歩幅の増加)が認められ、とくに歩行練習介入期(B)では即時的効果と累積効果が良好であった。また、教示による歩行練習後の歩行速度および歩数の変化は、高次脳機能障害が少なく介入前の歩行速度が比較的遅い人においてより明らかとなる傾向があり、本研究で検証している歩行練習の適応に関する基礎資料が得られた。平成27年度では、通所施設を利用する地域在住の維持期脳卒中者を対象に、通所施設を利用する地域在住の維持期脳卒中者を対象に、麻痺側下肢ラインステップ歩行(歩行路上の直線歩行方向を示したラインを麻痺側下肢で踏むようにして歩くように教示して実施する歩行)、非麻痺側下肢ラインステップ歩行(歩行路上の直線歩行方向を示したラインを非麻痺側下肢で踏むようにして歩くように教示して実施する歩行)の教示を用いた歩行練習の効果について、1か月ごとの歩行練習介入期(B)、歩行練習非介入期(A)、歩行練習介入期(B ́)を設定した3か月間のシングルケースデザイン(BAB ́型デザイン)での検証を継続して実施した。とくに非麻痺側ラインステップ歩行では、複数の対象者において歩行練習介入期での即時的な歩行速度の増加ならびに歩数の減少が認められ、とくに歩行練習介入期(B)では即時的効果と累積効果が良好であった。そこで、ラインステップ歩行練習に着眼し、ラインステップ歩行練習の効果を無作為化比較対象試験にて検証した。通所施設を利用する地域在住の維持期脳卒中者を、非麻痺側下肢ラインステップ歩行練習群と麻痺側下肢ラインステップ歩行練習群に無作為に割り付け、通常の通所施設でのリハビリテーション(60分間)とともにそれぞれのラインステップ歩行(10分間)を、週2回、1か月間実施した。その結果、麻痺側下肢ラインステップ歩行練習群と比べて非麻痺側下肢ラインステップ歩行練習群では歩行速度の有意な改善が認められた。本研究で用いた非麻痺側下肢ラインステップ歩行練習は麻痺側下肢ラインステップ歩行練習と比べて、地域在住の維持期脳卒中者における歩行速度を短期的に向上させる有用な歩行練習であると考えられた。平成26年度では、横断研究の結果から、杖操作の促進またはラインステップによる教示によって歩行パフォーマンスが即時的に増加し得ることが示された。この結果は、本研究課題にて検証を進めている歩行練習の効果の説明根拠となる基礎資料になり得ると考えられる。

また、シングルケースデザインによる検討結果から、杖操作の促進またはラインステップによる教示を用いた歩行練習によって維持期脳卒中片麻痺者の歩行パフォーマンスが即時的かつ累積的に改善される可能性があることが明らかとなり、杖操作の促進またはラインステップによる教示を用いた歩行練習の効果・適応についての検討を計画に沿って進めることができている。そのため、本研究は順調に進み、おおむね期待された結果が得られてきている。複合領域平成27年度は、現在の進展状況と研究計画に準じて、通所施設を利用する地域在住の維持期脳卒中者を対象に、杖操作またはラインステップの教示を用いた歩行練習が歩行パフォーマンスや生活機能に及ぼす効果について無作為化比較対照試験にて検証する。また、平成26年度の研究成果の一部を第50回日本理学療法学術大会にて発表する予定であり、順次、論文を執筆していく。次年度使用額は、平成26年度に購入を予定していた物品が購入困難となり、購入物品を変更したために生じた。平成27年度は、資料整理などの研究補助者および研究協力者等への人件費、知見の情報収集および成果発表のための旅費、そのほかに必要な用具等について研究費を用いる予定である。
大腸癌に対する門脈血中ras遺伝子の検討(肝転移予測は可能か?)

PCR法を用いて、門脈血中の微量の癌細胞をk-ras遺伝子のpointmutasionを利用して同定し、その量より予後を判定する実際にさいして、その諸条件を決めるべく、以下の予備実験を施行した。2:DNAの抽出方法として、フェノールクロロホルム法と、サンプルのロスが少ないと考えられる加熱によるgenome DNAの抽出(eukaryocuteでは報告はない)とを比較検討した。加熱法ではsw480 2×10^6個を95°Cで10分加熱し、その後RNase,フエノールクロロホルムで処理し、5μgの収量であったのに対し、フェノールクロロホルム法では、6×10^6個で70μgの収量であり、明らかに差があった。しかし、希釈列では、加熱法とPCR法(加熱のあとそのままPCRをかける)で10^2個までは検出可能であり、少量検体での加熱法の有用性が示唆され、今後さらに追及する予定である。3:各細胞において、細胞数10^010^6となるように希釈列を作成し、PCR法を施行した。ゲル電気泳動を施行して、検出限界を調べた。10^2個までは検出可能であった。またPCR法にての正常ヒト白血球細胞との鑑別では(3′末端にmutationがくるよう設定したsense primerを使用するため、条件設定が難しい)、95°C-1分、56°C-30秒、72°C-2分、45サイクルの設定で鑑別が可能であった。希釈列とあわせ、さらに検討する予定である。3で使用した希釈倍列を正常ヒト血液に混入して、同様の方法で検討する。
電子学術コンテンツの形成と学術電子図書館拡大の国際動向に関する調査研究

電子図書館、電子ジャーナルなどに象徴される、学術的情報活動のネットワーク化と学術コンテンツの電子化は、国際的に急速に進展し、これは、学術論文等の学術系コンテンツの形成・利用の方法に多大の変貌をもたらしている。本研究は、こうした状況における学術情報システムの国際的動向に着目し、各国の研究開発・標準化に関する動向調査、学術情報の利用形態、研究評価への応用、学術研究体制の変容等に関する比較調査を行い、わが国の学術情報システムの将来的な方向性を見定め、政策的提言も含めて、その高度化・国際化に資することを目的とするものである。研究は、(1)電子図書館・電子ジャーナルの動向、(2)情報通信技術の動向と学術情報への適用、(3)研究評価情報と学術情報政策の3方向に大別される。(1)では、ITの進展・普及による学術情報環境の変容を分析し、電子図書館システム、電子ジャーナル、書誌ユーティリティの国際的動向を、海外機関への実地訪問調査の結果を踏まえて検討した。(2)では、主として関連国際会議での発表・討論を整理・分類するという方法で動向の分析を行った。すなわち、ゲートウェイ、情報検索システム、人間・計算機インターフェース、XMLによる文書処理・通信技術、モバイル/ユビキタス・ネットワーク技術等の動向分析である。(3)では、学術研究のあり方に関する昨今の社会的要請を念頭に、学術雑誌の発行状況や国際共著論文の動向に基づく、国際的な情報発信の状況分析、1情報学研究の日米比較分析、中国での研究評価体制、研究評価情報と独創性の関連、大学所在の学術情報を事業創出に結実する方策等を論じた。なお、本研究の成果の一部は、国立情報学研究所における各種情報システムの研究開発に適用され、また、科学技術・学術審議会情報科学技術委員会デジタル研究情報基盤WGの議論に反映され、すでに政策的展開が図られつつある。電子図書館、オンラインジャーナル、電子投稿などに代表される、学術的活動のネットワーク化と学術コンテンツの電子化は国際的に急速な進展をみせており、学術コンテンツの形成と利用形態の変貌を引き起こしている。本研究では、電子学術コンテンツの拡大を背景とした学術情報システムの国際的動向に着目し、各国の研究開発・標準化に関する動向調査、学術情報の利用形態、学術研究体制の変容等に関する比較調査を実施する。本研究には、わが国の学術情報システムの国際的な位置付けと将来的な方向性を見いだし、政策的提言も含めて、その高度化ならびに国際化に視することを目的とする。本年度の研究では、わが国の学術情報に対する海外からの需要動向を調査するため、ストックホルム商科大学の欧州日本研究所等、日本関係の研究機関や書誌ユーティリティー、情報センター等を訪問し、また日本情報関連の諸会議に出席して、当方の現況を報告しつつ、わが国の学術情報データベースの海外利用動向や学術情報センターの目録システムに対する需要について調査、意見交換を行った。また、いわゆる電子図書館のみならず、インターネットを通じて多種多様な学術情報が国際的にアクセス可能になっている現状において、それらを効果的、効率的に探索するために、メタデータやサブジェクト・ゲートウェイの整備が海外で進められつつあることに注目し、この関連機関を訪問し、国際会議に出席することにより、インターネットの技術動向を含めて、最新の海外動向の把握と、わが国での実現方式の検討を行った。同時に、これらの問題関心を共有する海外の研究者を招聘して、当方の現況を実地に視察した上で、先方機関と対比しつつ、今後の方策の検討を行った。電子図書館、オンライン・ジャーナル、電子投稿などに代表される、学術的情報活動のネットワーク化と学術コンテンツの電子化は、国際的に急速に進展し、学術論文をはじめとする学術系コンテンツの形成とその利用の方法、様式に多大の変貌が惹起されている。

こうした状況に鑑み、本研究では、電子的学術コンテンツの拡大・普及を背景とした学術情報システムの国際的動向に着目し、各国の研究開発・標準化に関する動向調査、学術情報の利用形態、学術研究体制の変容等に関する比較調査を実施している。本研究は、わが国の学術情報システムの国際的な位置付けと将来的な方向性を見いだし、政策的提言も含めて、その高度化・国際化に資することを目的とする。本年度の研究では、わが国の学術情報に対する海外からの需要動向に関し、英国におけるNACSIS-CAT利用大学図書館関係者の会合を設定し、同システムの現況と今後の機能拡充計画を説明し、先方各機関での要望等を聴取し、当研究所の電子図書館、データベース・サービス等の利用をも含めて、意見交換を行った。また、当研究所における電子ジャーナル編集・提供システムの開発に関して、CrossRefシステムの適用可能性を調査、検討するべく、米英の関係機関について訪問調査を実施し、現況の実態的把握を行った。この他、学術情報の利用調査に有効な引用索引データベース関連の機関への訪問調査、海外の大学図書館における電子図書館的サービスの展開状況の実地調査を行った。さらに、インターネットを通じて、マルチメディア型の多様な学術情報が国際的にアクセス可能になっており、それらを効率的に探索するための電子図書館、メタデータ等の整備が海外で進められているので、関連する通信技術の動向を含めて、この関連の国際会議等に出席、意見交換を行い、最新の海外動向の把握し、わが国での実現方式の検討に資するものとした。電子図書館、オンライン・ジャーナルなどに象徴される、学術的情報活動のネットワーク化と学術コンテンツの電子化は、国際的に急速に進展し、学術論文等の学術系コンテンツの形成・利用の方法に多大の変貌をもたらしている。本研究は、こうした状況における学術情報システムの国際的動向に着目し、各国の研究開発・標準化に関する動向調査、学術情報の利用形態、研究評価への応用、学術研究体制の変容等に関する比較調査を行い、わが国の学術情報システムの将来的な方向性を見定め、政策的提言も含めて、その高度化・国際化に資することを目的とする。研究計画最終年にあたる本年度では、電子図書館等の国際的動向を鳥瞰するべく、IFLA(国際図書館連盟)情報技術常設委員会において、各国の代表と意見交換し、現況の把握を行った。当研究所における電子ジャーナル提供システムの開発に関しては、米国OhioLink方式の適用可能性に注目し、同システム運用機関を訪問調査し、その実態的把握を行った。また、メタデータ関連の動向に関して、DublinCore規格の推進者を招聘し、意見交換を行った。わが国の学術情報に対する海外の需要動向に関し、ドイツにおけるNACSIS-CAT利用大学図書館関係者の会合を設定し、利用促進に関する意見交換を行った。学術情報の相互利用と研究評価に有効な引用索引データベースの形成方式に関して、米国NEC Research Instituteの自動作成システムの開発者を訪問し、今後の協力可能性を含めて意見交換を行った。
流域の流出物理特性推定のための水質情報の利用

本研究では、流域の流出物理特性推定に水質情報を利用できるか、さまざまな対象について検討した。1.流域全体の流出物理特性と水質情報との関係を検討した。検討結果をまとめると、以下の通りである。(1)水質を利用した流出成分分離法により、流出特性の原因となる物理機構が推定できた。検討した対象流域では斜面流出特性の影響が大きいと分かった。(2)濃度低下率という水質情報と流出寄与域特性とを関係ずけることができた。(3)簡単な流出システムのパラメータ推定に水質情報が利用できることを示した。また、そのためにはシステム構造の想定が前提となることを示した。2.流域流出機構を構成する素過程のうち、水みち流れに関するもについてその特性を水質情報により解析した。(4)構造的水みち流れについて、マトリックス部粒径、トレーサー種、トレーサー濃度等、がトレーサー移動に与える影響を明らかにした。(5)非構造的水みち流れについて、トレーサー移動が水の存在するところで均一に起こっているのではないことを明らかにした。(6)二層斜面からの流出について、トレーサー移動経路を説明するためには二層の境界を横切る流れを扱うための特別なモデルが必要なことを示した。河川流出水質には流域の流出物理特性が直接反映していると考えられる.この視点から本研究では,現実の物理的流出機構と対応し水質変化をも説明できる流出モデルを考究し,水質情報を用いてそのパラメーターを決定することをめざす.本年度は,物理的流出機構のうち水量・水質の両面で重要な機構は何かを現場観測により検討し,さらに室内実験によりその機構を支配する特性値と水質との関係を検討した.研究成果は以下の通りである.(1)現場観測による水質に影響を与える流出物理機構の抽出山梨大学北の相川流域(約9Km^2)を対象とし,降雨時並びに降雨前後の流量と水質(主に陰イオン濃度)の対応を検討した.さらに,流域内の各植生,地形代表点から採取した土壌について,種々の水質成分の供給・浸透過程を調べた.以上の検討により,イオン種により濃度変化が異なること,また土壌層により各イオンの供給特性が異なることを明らかにした.これより,種々の土壌層からの流出が全流出を決定し,各土壌層の影響の程度が水質に反映していると考え,多層構造斜面モデル化による検討対象とした.(2)実験による流出物理機構についての特性値と水質との関係の検討水質をも決定する流出物理機構についての特性値として,斜面の層構造,傾きを取り上げ,水の動きとどのように関連するかを,種々の降雨強度で検討した.これにより,粒径,傾斜,降雨強度により各層からの流出量の比率がどのようにかわるかを明らかにした.また,それぞれの流れについてトレーサーの動きを観測することで,水質応答の基礎的検討を行なった.以上の本年度の検討では,この点を水質応答解析という視点で検討する.さらに,流域の水質応答によりモデルの物理特性パラメータをいかに推定するかを検討する予定である.本研究では、流域の流出物理特性推定に水質情報を利用できるか、さまざまな対象について検討した。本年度は特に、水みち流れに代表される不均一な流れの流出物理特性を水質情報により解析した。1.構造的水みち流れについて水みち部の両側にガラス・ビーズ層、土壌層のマトリックス部がある装置でトレーサー移動実験を行い、マトリックス部粒径、トレーサー種、トレーサー濃度がトレーサー移動に与える影響を明らかにした。これにより、マトリックス部構造が水質情報で推定できることを明らかにした。2.非構造的水みち流れについて不飽和ガラス・ビーズ層でトレーサー移動実験を行い、トレーサー移動は水の存在するところで均一に起こっているのではないことを示した。これにより、水みち流れ部の構造が水質情報で推定できることを明らかにした。3.二層斜面からの流出について不飽和二層ガラス・ビーズ斜面でトレーサー移動実験を行い、トレーサー移動経路を説明するためには二層の境界を横切る流れを扱うための特別なモデルが必要なことを示した。これにより、境界付近の薄い層の構造が流量を決定していることを明らかにした。
印刷された神々への信仰-現代インドのポスター宗教画からみる宗教文化の変容

昨年度までの調査では、主に現代インドで広汎に流通する印刷物宗教画(以下ポスター宗教画)の大量生産物というモノとしての性質や、近年新たに製作されるようになった図像が現代インドの社会変容といかに関わっているかを論じてきた。本年度は諸個人の宗教実践に関して引き続きデリーにてフィールドワークを行っている。その際、これまで調査の主対象であったポスター宗教画等を介してなされるヒンドゥー教徒の家庭内のプージャー(礼拝供養)のみならず、寺院参拝や巡礼を含む人々の宗教実践の全般に関しても調査を行ってきた。そのなかで特に、寺院参拝は盛んであってもポスター宗教画に描かれない神、家庭内では祀られない神を取り上げ検証している。ポスター宗教画では寺院で祀られている全ての神が図像として描かれ流通しているわけではない。なかには図像を製作することや、家庭で祀ることをよしとしない神々がある。それらは厳格な荒ぶる神であったり、非常にローカルな村落神であったりする。それら大量生産物となることを拒む神々の性質と、人々の家庭と寺院におけるプージャーに対する認識・実践の差異を検討することにより、神格と土地(トポス)との関わりや、礼拝対象物の性質、そして現代インドにおける家庭内儀礼の位置づけを再考した。それにより、大量生産物であるポスター宗教画が宗教実践に与えた影響をより包括的に明らかにすることに努めた。これらの研究成果の一部は叢書「フェティシズム研究」第2巻「越境するモノー呪物・商品・蒐集品」(京都大学学術出版会)において出版予定である。本研究では、現代インドにおいて広汎に受容されている印刷物の宗教画をポスター宗教画と呼ぶ。ポスター宗教画は、民衆レベルの宗教実践を形成するモノとして宗教文化に多大な影響を与えていると指摘されながら、これまでその制作やそれを対象とする礼拝儀礼の実態に関しては明らかにされてこなかった。本年度は夏期に現地調査を行い、ポスター宗教画の制作・流通・受容の一連の流れを把握すると共に、特に制作現場に着目し、1990年代から顕著にみられる印刷業のデジタル化に伴うポスター宗教画の制作過程の変容と流通する図像の現代的展開について検討した。この調査結果は博士予備論文として在籍機関へ提出している。本博士予備論文では、まず現在インドで地域やカースト間差異を超えて流通するポスター宗教画の性質を理解するために、印刷紙としての素材性に注目することも重要であると指摘し、従来の礼拝対象物に用いられていた自然素材(石や木等)と印刷紙という素材の差異が、それまで神像制作において重視されていた様々な儀礼的・カースト的規制からポスター宗教画を自由にしている点を論じた。また制作現場調査と一次資料の分析から、消費者の多様化により求められる図像が多様化している現状に関して、その特徴として以下の二点を挙げた。一点目は現代インドにおいて地方性やカースト帰属に基づいたアイデンティティが再度重要になってきていることであり、これは現代インドで高揚しているアイデンティティ・ポリティクスと連動した動きと捉えられる。二点目は「脱神話的・脱物語的」図像が増加している点である。それら神話の意味世界に依拠した神学的・図像的正統性が求められないポスター宗教画には、人々が現世利益を求めようとしていることを論じた。この図像の現代的特徴に関しては、京都大学人文科学研究科における共同研究班「フェティシズムの文化・社会的文脈」研究会においても発表を行った。本研究では現代インドにおいて広汎に流通している印刷物の宗教画をポスター宗教画と称している。これまでポスター宗教画は、「ヒンドゥー教においてはあらゆるモノに神が顕現できる」という前提のもとに、その神性が所与のものとみなされ、神性化の過程は等閑視されてきた。しかし寺院やバラモン司祭の家庭の神像においては緻密な儀礼を経て神が招来されるのに対して、ポスター宗教画にはそのような体系だった儀礼は整備されていない。本年度は昨年に引き続いてフィールド調査を行い、ボスター宗教画をめぐる、製作者、流通者、販売者、購買者、礼拝者、メディア、神格などの多元的エージェント間の複合的相互交渉に注目し、一つの「商品」であったポスター宗教画がどのように人々にとって固有の意味や重要性を持つようになっていくのか、その過程を調査した。この研究成果は叢書『フェティシズム-人とモノの関係を探求する』(2008年出版予定)に掲載予定である。また、ポスター宗教画が全インドに広まったとされる19世紀末から現代までの図像の変遷に関しても引き続き調査分析を行った。この際、蒐集したポスター宗教画の図像や製作現場での調査をもとに、近年登場した新しい図像と現代インドの社会変容との関連について考察している。これらの研究内容は日本南アジア学会において発表を行うと共に、論文にして投稿した(京都大学人文科学研究所発行「人文学報第95号」に採録決定)。また奈良大学におけるポスター宗教画をめぐる展示会において、資料に特別寄稿を寄せる等、これまでの研究内容を積極的に報告することに努めた。

その際、これまで調査の主対象であったポスター宗教画等を介してなされるヒンドゥー教徒の家庭内のプージャー(礼拝供養)のみならず、寺院参拝や巡礼を含む人々の宗教実践の全般に関しても調査を行ってきた。そのなかで特に、寺院参拝は盛んであってもポスター宗教画に描かれない神、家庭内では祀られない神を取り上げ検証している。ポスター宗教画では寺院で祀られている全ての神が図像として描かれ流通しているわけではない。なかには図像を製作することや、家庭で祀ることをよしとしない神々がある。それらは厳格な荒ぶる神であったり、非常にローカルな村落神であったりする。それら大量生産物となることを拒む神々の性質と、人々の家庭と寺院におけるプージャーに対する認識・実践の差異を検討することにより、神格と土地(トポス)との関わりや、礼拝対象物の性質、そして現代インドにおける家庭内儀礼の位置づけを再考した。それにより、大量生産物であるポスター宗教画が宗教実践に与えた影響をより包括的に明らかにすることに努めた。これらの研究成果の一部は叢書「フェティシズム研究」第2巻「越境するモノー呪物・商品・蒐集品」(京都大学学術出版会)において出版予定である。
有限単純群と符号・格子・頂点作用素代数

研究課題に関して,本研究では以下のような研究成果を得た。これらについては,いずれも論文として発表,または,その準備中である。1.48次元の符号および格子にっいて,特に,singly even codesとoddlatticeのextremal neighborに持つ場合と持たない場合の構成について考察した。その過程で,新しい長さ48のextremalなZ/Z4上の符号を発見した。2.72次元の(存在が知られていない)extremal binary codeと,5-designの関係について調べ,5-(72,16,78)デザインが存在するならば,そのブロックをwordとして生成したものが問題のextremal binary codeを生成することを証明した。3.Hall-Janko群が作用する長さ100の自己双対符号を新たに構成した。次に,与えられた可移置換群の作用により不変な自己直交符号が,位数2の元の固定点全体によって生成される符号の双対符号に含まれることを証明した。その応用として,いくつかの散在型単純群に対する実例(Golay符号や,前述のHall-Jankoに対する符号を含む)を計算した。その結果,散在型単純群が作用する新しい自己双対符号を構成することができた。4.extremal singly even[64,32,12]codeで知られていなかったweight enumeratorを持つ符号を構成し,そのneighborを考えることにより,被覆半径が12であるようなextremal doubly even codeを初めて構成した。5.ランク3のグラフの最大の部分空グラフ(coclique)とデザインについて研究を進めた。結果として,Hall-Janko graphを10次のWitt system,および,4元体上のhexacodeの言葉を用いた再構成を与えた。次に,散在型鈴木グラフの66点の部分空グラフを構成し,16元体上の3次元ユニタリ群が作用する新しい3-(66,16,21)デザインを具体的に構成した。その3デザインからの散在型鈴木グラフの新しい構成法を与えた。研究課題に関して,今年度は以下のような研究成果を得た。1.宗政,原田(分担者)との共同研究として,Boris Venkov氏の研究協力を得て進めていた,48次元のextremalな符号および格子についての研究を継続した。特に,singly even codesとodd latticeについて,extremalなものをneighborに持つ場合と持たない場合の構成について,論文としてまとめた。また,副産物として新しい長さ48のZ_4-codeを発見した。2.同じく宗政,原田とは,72次元の(存在が知られていない)extremal codeと,5-designの関係について調べ,デザインをwordとして生成したものが,code自身に一致するという結果を得た。論文として,投稿中である。3.原田との共同研究として,中空大幸(岡山大学大学院)の研究協力を得て,(non)self-orthogonalなデザインの構成と特徴付けについて,研究を進めた。符号理論的な観点も合わせて,部分的な結果を得ており,来年度に向けて進行中の研究である。4.宮本,山田(分担者),Lam(海外共同研究者)とは,モンスターの元に対応する,√<2>E_8型latticeのLeechlatticeへの埋め込みについて考察を始めた。山田・Lam達のMcKayobservationに関する結果を踏まえての研究であるが,現時点で進行中であり来年度以降の課題である。

(1)宗政,原田(分担者)らと進めていた,48次元extremal code, extremal latticeについての研究,および,72次元の(存在が知られていない)extremal codeと5-designの関係についての研究について,研究成果をまとめて,論文として発表(出版済み)した。また,大井剛史(元,千葉大学大学院生)の研究協力の下で行った,長さ8のZ/4Z上の符号の分類について,研究成果を論文として発表した。(2)原田とは,千吉良直紀氏(室蘭工業大学)の研究協力を得て,Hall-Jankoの群が作用する長さ100のself-dual codeの構成を行った。これまでに知られていなかった2つの符号を構成することが出来た。論文として投稿中である。また,この構成を一般的な視点から考えることにより,可移置換群が作用する符号について,ある種の上限を与える定理を示した。これについては論文を作成中である。(3)上記の研究と関連して,中空大幸氏(千葉大学特別研究学生)の研究協力を得て,Hall-Jankoの群に対する強正則グラフの再構成について検討し,Wittの3デザインから始めるという再構成を得た。これについては,論文を準備中であるが,より一般的な議論の展開や,デザインの理論との関連を調べており,今後の進展に期待している。(4)宮本(分担者)によって定義された,Reed-Muller codeから構成される頂点作用素代数の自己同型群の決定問題について検討した。現時点では最終的な結果を得ておらず,次年度以降への課題である。研究課題に関して,今年度は以下のような研究成果を得た。1.可移置換群の作用により不変な自己直交符号について,一般的な探索・構成の原理を与えた。その応用として,いくつかの散在型単純群に対する実例を計算した。ここには,昨年度に発見されたHall-Janko群が作用する自己双対符号を含んでいると共に,22次のMathieu群が作用する長さ330の自己双対符号が新たに発見された。これについては,原田・千吉良との共著論文として投稿済みである。2.affine polar graphから得られる長さ64の自己双対符号から始めて,次々とneighborを取るという方法により,いくつかの新しいパラメータの符号を構成した。この件は,現在進行中の考察であるが,すでにいくつかの観点で興味深いものが得られており,原田・千吉良との共著論文として発表の準備中である。また,別の長さの場合への応用などを模索中であり,次年度への課題の一つであると考えている。
乳腺組織リモデリングにおける細胞運動性の統合的制御機構の解明

私共は、これまでに、低分子量G蛋白質Arf6が乳癌細胞の浸潤活性に根幹的役割を果たしていること、Arf6のエフェクターがAMAP1であること、EGFレセプター経路介した乳癌の浸潤形質獲得においてArf6を活性化因子がGEP100であることを明らかにした。さらに、GEP100-Arf6-AMAP1経路(以下Arf6経路)が、VEGFR2の活性化に伴う血管新生に関与することなど多様な細胞浸潤性誘導に関与することを見出した。当該研究期間において、AMAP1のエフェクター機能を解析する過程の中で、AMAP1がPRKD2を介してインテグリンと結合することを見出した。EGF刺激に伴ってArf6経路がRab5cと協調してインテグリンのリサイクルエンドソームから細胞膜への輸送に関与することを見出した。さらに、AMAP1がEMT誘導に伴って発現が誘導されるEPB41L5と特異的に結合することを見出し、Arf6経路の活性化に伴うinvadopodia形成あるいはE-cadherinを介した細胞-細胞間接着の消失が誘導される分子機序を見出した。また、AMAP1及びEPB41L5の発現が癌抑制遺伝子p53を介して抑制されることを明らかにした。p53欠損と、幹細胞様形質の誘導、あるいは、EMT誘導との関連が明らかとなっている。さらに、basal-likeに分類される乳癌の約80%において癌抑制遺伝子p53の遺伝子変異が見られ、その他の遺伝子変異がほとんど見られないことが報告されている。私共がこれまで高浸潤性乳癌細胞として用いていたすべての細胞が、basal-like乳癌と同じ遺伝子発現プロファイルを示すこと、さらに、p53に変異があることが明らかになっている。ことなどから、GEP100-Arf6- AMAP1経路が、乳腺組織幹細胞における細胞運動性・浸潤性の制御に関与している可能性が示唆された。24年度が最終年度であるため、記入しない。これまでに、低分子量G蛋白質Arf6を中心としたGEP100-Arf6-AMAP1経路が乳癌細胞の浸潤・転移形質獲得に根幹的役割を果たしていることを明らかにしてきた。その際、Arf6GEFであるGEP100がそのPHドメインを介して多様な運動性・浸潤性の誘導に関与する可能性が示唆された。当該研究期間において、血管新生における集団的細胞運動の誘導と管腔形成に着目し、GEP100-Arf6-AMAP1経路が、VEGFレセプターシグナル伝達により活性化され、血管内皮細胞のin vitro2D培養wound-healing、3D培養における管腔形成及び、マウス個体を用いたin vivoの血管新生に必須であることを論文発表した。さらに、マウスの正常乳腺組織において、妊娠に伴って、GEP100-Arf6-AMAP1経路を構成する分子群の蛋白質発現量が増加し、授乳期まで継続し、退縮期に入るとそれらの発現が減弱することを見出した。これらの知見は、GEP100-Arf6-AMAP1経路が乳腺を含む様々な正常組織形成における細胞運動性の制御に関与すると仮定した我々の作業仮説を指示するものである。当該研究期間において、作製を終了した乳腺特異的GEP100遺伝子欠損マウス(Wap-Cre/GEP100-KO)を用いた乳腺組織形成におけるGEP100の機能解析を進めている。さらに、上皮由来細胞を3D培養することによって見られる極性を持った管腔形成、acina formation(腺房形成)を指標としたin vitro乳腺リモデリング系や、マウスの乳腺組織から分離した細胞群を、乳腺除去したマウスに移植し、妊娠誘導によって乳腺組織の再構築が惹起される乳腺幹細胞移植実験系を用いたGEP100-Arf6-AMAP1経路の関与の検討も順次進めている。

さらに、basal-likeに分類される乳癌の約80%において癌抑制遺伝子p53の遺伝子変異が見られ、その他の遺伝子変異がほとんど見られないことが報告されている。私共がこれまで高浸潤性乳癌細胞として用いていたすべての細胞が、basal-like乳癌と同じ遺伝子発現プロファイルを示すこと、さらに、p53に変異があることが明らかになっている。ことなどから、GEP100-Arf6- AMAP1経路が、乳腺組織幹細胞における細胞運動性・浸潤性の制御に関与している可能性が示唆された。24年度が最終年度であるため、記入しない。妊娠に伴う乳腺組織リモデリングのプロセスにGEP100-Arf6-AMAP1経路が関与することを強く支持する結果に次いで、研究実施計画に沿った機能解析に関する結果は順次得られているが、organoidsや乳腺幹細胞移植系を用いた乳腺リモデリング過程のライブイメージングに必要な実験系の構築が遅れている。今後は、乳腺特異的GEP100遺伝子欠損マウスを用いたin vivoでの解析を重点的に進め、乳腺リモデリングにGEP100が関与すること、引き続いて、GEP100-Arf6-AMAP1経路が関与することを確定し、乳癌モデルマウスと比較することによって、in vitroの実験から構築した乳腺リモデリングにおけるGEP100-Arf6-AMAP1経路の活性化・不活性化の制御機構のモデルの妥当性を検証し、どのような異常によって癌の浸潤・転移形質獲得へと繋がるのかその分子機序を解明することを優先する。organoidsや乳腺幹細胞移植系を用いた乳腺リモデリング過程のライブイメージングは優先順位を下げて、当該領域内の専門家とdiscussionしながら確実に進めて行く。
生体分子の修飾・制御システムの異常による発がん機構

生命情報はDNA→RNA→タンパク質に変換されることで機能発現しており、生体分子は様々な修飾・制御を受けている。ゲノムDNAや制御タンパク質の分子修飾の異常が多くの癌細胞に共通した病態のひとつであり、細胞の不死化・癌化や悪性化に関わる可能性が強く示唆されている。本研究では、[1]DNAメチル化とクロマチンによる転写調節、[2]細胞内タンパク質の翻訳後修飾と分解、という2つのシステムの生理機能と発癌関連性を理解することを目的とした。メチル化DNA結合タンパク質MBD1は、癌抑制遺伝子や組織特異的な遺伝子のDNAメチル化依存的な転写抑制、ゲノム安定性などに関わっている。その転写抑制とクロマチン形成機構として、1)新しいエピジェネティクス制御因子MCAF1とヒストンメチル化酵素SETDB1の複合体を介して遺伝子発現を阻害すること、2)ピストンのメチル化酵素Suv39・脱アセチル化酵素HDAC1/2、ヘテロクロマチンタンパク質HP-1との協働で転写抑制することを明らかにした。メチル化DNA領域でMBD1がH3-K9メチル化酵素をリクルートすることで、DNAメチル化からヒストンメチル化への経路があることを証明した。また、DNAメチル化とゲノム損傷修復の関連は不明な点が多いが、MBD1が塩基除去修復酵素(メチル化プリンDNAグリコシラーゼ)と協働してDNA修復反応を促すことを見出した。さらに、タンパク質の修飾・分解について、1)HECT型ユビキチンリガーゼhHYDがDNA損傷・修復に関わるトポイソメラーゼ結合タンパク質TopBP1をポリユビキチン化すること、2)血清反応を司る転写因子SRFがヒストンアセチル化酵素CBP等と共にPML核内ボディに局在してc-fos遺伝子の転写調節を行うこと、3)SRFがユビキチン様SUMO修飾で機i能制御されていること、4)ベンツピレンなどの化学発癌や低酸素応答・血管形成に働く共通の転写因子ARNTがSUMO修飾で機能制御されていることを報告した。生体内の遺伝子やタンパク質の機能は選択的に活性化または不活性化されており、広くはエピジェネティクスの概念で捉えられる。とりわけ、DNAメチル化とクロマチンによる転写調節、細胞内タンパク質の翻訳後修飾と分解による機能分子の代謝的安定性、それらの制御異常が発がん機構として重要であることが明確になってきた。本研究を通して、[1]DNAメチル化とクロマチンについて、メチル化CpG結合タンパク質MBD1の転写抑制ドメィンはヒストン脱アセチル化酵素に依存せず、新規メディエーターMCAFを介して転写開始複合体を直接阻害することが判明した。これは他のメチル化CpG結合タンパク質がヒストン脱アセチル化酵素と共役することと対比される。癌細胞でメチル化されたp16遺伝子の転写抑制に関与しており、発がん関連性が示唆された。また、NMR構造解析によって、メチル化CpGとMBD1のメチル化DNA結合ドメインの複合体構造を解明した。[2]細胞内タンパク質の翻訳後修飾と分解について、新しいHect型ユビキチンリガーゼhHYDがDNA損傷・修復に関わる新しいユビキチン化経路で働いており、トポイソメラーゼ関連タンパク質TopBP1が基質のひとつであった。また、血清による細胞増殖と分化を司る転写因子SRFがPML核内ボディでヒストンアセチル化酵素と相互作用してc-fos遺伝子などを転写活性化すること、SRFのDNA結合ドメイン内のSUMO-1化で負に調節されることを明らかにした。生体分子は様々な修飾を受けることで、標的分子との相互作用を変化させている。DNA分子中の5'-CpG-

3'のシトシンのメチル基修飾、タンパク質のユビキチンおよびユビキチン様SUMOによる翻訳後修飾に焦点を当てた。ともにDNA配列以降の調節機構として、広義のエピジェネティクスに含まれている。しかも、これらの制御異常は多くの癌細胞で見出されており、腫瘍の発生機構を理解する上で極めて重要な意義を持っている。[1]メチル化DNA結合タンパク質MBD1の転写抑制機構として、1)新規のポジティブメディエーターMCAFを阻害することで転写開始を直接抑制すること、2)ヒストンのメチル化酵素・脱アセチル化酵素との協働で転写抑制すること、3)塩基除去修復酵素と相互作用することでゲノム安定性に関わることを見出した。p16などの癌抑制遺伝子のプロモーター領域のメチル化による不活性化、ゲノムのDNA損傷に対する修復に関連することが新たに判明した。[2]タンパク質の修飾について、1)新しいHECT型ユビキチンリガーゼhHYDがDNA損傷・修復に関わるトポイソメラーゼ結合タンパク質を基質とすること、2)血清反応を司る転写因子SRFがPML核内ボデイで機能制御されること、3)ベンツピレンなどの化学発癌や低酸素応答・血管形成に働く共通の転写因子ARNTがSUMO修飾で機能制御されていることを報告した。これらの分子はゲノム安定性、細胞の増殖分化と環境応答に関わることから、発癌に密接に関連すると考えられる。生体内の分子は様々な修飾で調節されており、細胞機能と恒常性の維持に重要な役割を果たしている。DNAメチル化とクロマチン、細胞増殖分化に関わる制御タンパク質の翻訳後修飾の観点から、発癌の分子機構を解析した。修飾システムの異常は多くの癌細胞に共通した病態であり、広義のエピジェネティクスの異常と捉えられる。メチル化DNA結合タンパク質MBD1は、癌抑制遺伝子のメチル化依存的な抑制、細胞の発生分化、染色体ゲノムの安定性に関わっている。その転写抑制とクロマチン形成機構として、1)新しい転写メディエーターMCAFとヒストンメチル化酵素SETDB1/ESETの複合体を介して遺伝子発現を阻害すること、2)ヒストンのメチル化酵素Suv39・脱アセチル化酵素HDAC1/2、ヘテロクロマチンタンパク質HP-1との協働で転写抑制することを明らかにした。DNAメチル化とゲノム損傷修復の関連は不明な点が多いが、MBD1が塩基除去修復酵素(メチル化プリンDNAグリコシラーゼ)と協働してDNA修復反応を促すことを見出した。クロマチンとゲノム安定性が密接に関係することを示した。さらに、タンパク質の修飾について、1)血清反応を調節する転写因子SRFがヒストンアセチル化酵素CBP等とPML核内ボディで共在してc-fos遺伝子の転写調節を行うこと、2)SRFがSUMO修飾で機能制御されていることを明らかにした。細胞増殖分化を司る転写因子がPML核内ボディとSUMO修飾で調節される機構を示した。生体分子は細胞状況に応じて修飾・制御されている。ゲノムDNAや制御タンパク質の分子修飾の異常が多くの癌細胞に共通した病態のひとつである。