hpprc/llmjp-kaken huggingface dataset:
腎カリクレイン前駆体の活性化機構とその調節機構に関する研究

1.組織カリクレインmRNAの塩基配列から推定されているプロペプチド(Arg-Asn-Asp-Ala-Ala-Pro-Pro-Val-Gln-Ser-Arg;PS11)を合成し、このペプチドに対するウサギ抗血清を用いて、ラット尿不活性型カリクレインが組織カリクレインの前駆体タンパクであることを証明した。2.ラット尿より腎由来の組織カリクレイン及びその前駆体を精製し、それぞれのN末端側アシノ酸配列を測定した。その結果、尿カリクレイン前駆体は7残基のアシノ酸からなるプロペプチド(Ala-Pro-Pro-Val-Gln-Ser-Arg;PS7)をカリクレインのN末端に有していることが明らかになった。また、PS7のアシノ酸配列は、PS11のC末端側7個のアシノ酸配列と一致することを確認した。さらに、尿カリクレイン前駆体はプロテアーゼの作用によりPS7を遊離し、カリクレインに転換することがわかった。3.ラットの腎皮質より、カリクレイン前駆体の活性化に関与する酵素の一種(ActivatorI)を精製した。本活性化酵素は分子量57,000の糖タンパク性チオールプロテアーゼであることを明らかにした。また、ActivatorIに対するウサギ抗血清を得ることができたので、免疫二重拡散法によりその臓器分布を調べたところ、本活性化酵素が顎下腺にも微量に存在することを認めた。4.腎内活性化酵素を定量的に測定できる方法を考案し、その動態を調べた。その結果、腎臓におけるカリクレイン産生の調節因子として知られているアルドステロンはカリクレイン前駆体の生合成と促進するが、その活性化には影響しないことが明らかになった。一方、合成糖質コルチコイドであるデキサメサゾンの投与は、腎内活性化酵素に対して抑制的に作用した。以上、生化学的及び薬理学的な面から、腎臓におけるカリクレイン前駆体の活性化機構とその調節機構の一端を明らかにした。CM-セルロース,ユンカナバリンA-セファロース,水銀セファロース及びセファデックスG-100を用いた一連の分離操作によって,ラット腎皮質抽出液からカリクレイン前駆体の活性化に関与する酵素を精製した.最終段階のゲル濾過法により, 3種の活性化酵素分画が得られ,溶出順にActivatorI,II及びIIIと命名した.それらのうち最も高分子量の酵素(ActivatorI)はSDS-ポリアクリルアシド電気泳動において分子量57,000の単一なタンパクバンドを示し,糖タンパク染色においても同じ位置に単一なバンドとして認められた.カリクレイン前駆体の活性化におけるActivatorIの至適pHは4.5付近であり, pH7.0以上では,本酵素による活性化反応は認められなかった.また, ActivatorIによるカリクレイン前駆体の活性化はチオールプロテアーゼ阻害剤により抑制されたが,セリン及びメタルプロテーゼ阻害剤によっては影響をうけなかった.以上の結果より, ActivatorIは糖タンパク性のチオールプロテアーゼの一種であることが判明した.一方, ActivatorII及びIIIに関しては,それぞれの均一標品を得ることはできなかったが, ActivatorIと同様にチオールプロテアーゼであることを認めている.次いで,活性化酵素の測定法を考案し,その動態を調べた.

その結果,腎におけるカリクレイン産生の調節因子の1つとして知られているアルドステロンは,カリクレイン前駆体の生合成を促進するが,その活性化には影響しないことを明らかにした.一方,合成糖質コルテコイドであるデキサメサゾンの投与は,腎における活性化酵素に対して抑制的に作用した.以上の知見より,腎カリクレイン前駆体の活性化に関与する酵素の生化学的性質と,その調節機構の一端を明らかにした.1.ラット尿より腎由来の組織カリクレイン及びその前駆体を精製し、逆相系高速液体クロマトグラフィー(RP-HPLC)を行った後、それぞれの分解により分析した。その結果、カリクレイン及びカリクレイン前駆体ともにN末端から25残基のアミノ酸が同定され、カリクレイン前駆体の8残基目からのアミノ酸配列はカリクレインのN末端からのアミノ配列と一致した。したがって、カリクレイン前駆体は7残基のアミノ酸からなるプロペプチドをカリクレインのN末端に有していることが明らかになった。また、カリクレイン前駆体とトリプシンをインキュベートした後、RP-HPLCによる分析を行ったところ、保持時間24分に、215nmの新たな吸収ピークが出現した。このピーク成分のアミノ酸配列は、Ala-Pro-Pro-Val-Gln-Ser-Aroであり、カリクレイン前駆体のN末端側7個のアミノ酸配列と同一であった。以上の結果より、カリクレイン前駆体はプロテアーゼの作用により7残基のアミノ酸から構成させるプロペプチドを遊離し、カリクレインに転換することが判明した。2.カリクレイン前駆体の活性化に関与する腎内酵素の一種(ActivatorI)をすでに精製していたので、本活性化酵素に対するウサギ抗血清を作製し、その臓器分布を調べた。その結果、ActivatorIは腎臓及び顎下腺に存在することを認めた。しかし、膵臓ではカリクレイン含量が多いにもかかわらずActivatorIの存在を確認することはできなかつた。したがって、ActivatorIによるカリクレイン前駆体の活性化反応には、臓器特異性があると推察される。以上、本年度はタンパク化学及び免疫化学的な面からカリクレイン前駆体の活性化機構の一端を明らかにすることができた。
薬剤が歯周ポケット局所環境に与える影響について

ポケット内の細菌やポケット内に局所投与した薬剤が、ポケット内の局所環境に影響を与えるとともにポケット内の環境因子からも影響を受けることが想像される。そこで、ポケット内の環境因子としてpHに注目し、初診の患者のポケット内のpHを測定した。その結果、同じ初診時のポケットであってもpHの値は、pH6.23から8.68(平均7.66)と大きなばらつきを示した。また、pHの値はポケットの深さや炎症の程度とは相関が認められなかった。そこで、ポケット内pHと、ポケット内細菌叢を検索した。その結果、pHの低いポケット内からはStreptococcus,Actinomycesが多く分離され、特にA.viscosusの比率が高かった。これに対し、pHの高いポケットからは、P.gingivalis,F.nucleatumが多く検出された。さらにS.milleri,P.gingivalis,A.viscosusの3菌種を用いて培地pHを変え連続嫌気培養を行った。その結果、S.milleriは、P.gingivalis,A.viscosusに対して拮抗的に増殖することが分かった。ラットを用いた組織内培養においては、P.gingivalisは組織液をアルカリへ変動させ、A.viscosusは酸性へ変動させた。一方、薬剤感受性とpHの関係を調べたところ、テトラサイクリンでは培地pHの影響を受けやすいのに対し、ミノサイクリン、ドキシサイクリンでは、テトラサイクリンほど影響を受けなかった。リンコマイシン系についてみると、クリンダマイシンの方がリンコマイシンより歯周病原菌に対して有効であった。患者の歯周ポケット内から得られた細菌叢のうち臨床症状と照らしあわせ,拮抗していると思われる菌を3種類選らんだ。これらの菌を共生させることにより相互にどのような影響を及ぼしあうか。また,環境のpHをどのように変化させ,またその環境の変化によってどのような影響を受けるか検討した。菌の種類として,P.gingibalis,A.seiscosuc,S.millinを選んだ。菌は,いずれも,これまでの実験でえられた患者からの臨床分離株を用いた。まず、ラットの背部にチャンバ-を埋め込み,その中に,P.gingiualisを接種した。当初pHは7.2であったものが,pH8.1へと変化していた。また別の菌でもも,同様の実験をしたところ同じpHをアルカリ側へと変化させていた。in vitaoの系として,連続嫌気培養装置を用いて,P.gingivalis,A.nricoun,S.millenの3菌同時培養を行った。培養開始時のpHを6.0,7.0,8.0の3種とし,40時間培養した。培養は,嫌気ボックス内にて行い,pHは,バッファイズとし培地にてコントロ-ルした。その結果,P.gigualiは、pH6.0では,ほとんど生育せず,pH8.0で他2菌より生育が早かった。また,pH6.0,7.0ではA.siscesis,S.milliuiは、十分な生育を系し,P.gingialiは,生育が弱冠,おさえられる傾向を示した。また,各菌の単独培養においては,P.gihivolisがpH6.2以上において増殖し,6.0では増殖しなかったのに対し,A.vicscous,S.nillcriでは,いずれにおいても増殖はしたが,6.0での増殖の方が,すみやかであった。これまで調べた歯周ポケット内細菌とポケット内pHの関係から、ポケット内pHがアルカリで優位に存在してP.gingivalisと、酸性のポケット内で優位であったA.viscosus、S.milleriの3種を選んで。連続嫌気培養を行った。単独では、P.gingivalisはアルカリ性に、A.visxwsusは、A.viscosus S.milleriは酸性に至適pHがあった。混合連続培養の結果、P.gingivalisは、A.viscosusとの培養で十分な発育をしなかった。

また、同じくS.millerisとの混合培養でも十分な発育をしなかった。ところが、pHが、8.0での培養では、P.gingivalisは十分な成育を示した。これらの結果から、P.gingivalisの多い歯周ポケットでは、ポケット内pHが高くA.viscosusや、S.milleriのような拮抗的役割をする細菌が減らしていることが示唆された。ついで、ラットの皮下にチャンバーを埋入させ、〓出液中での組織内培養を行ったところ、組織液中でもP.gingivalisは環境のpHをアルカリにさせることが判明した。また、A.viscosusはチャンバー内のpHを酸性にさせる作用がみとめられた。以上から、ポケット内の組織液(〓出液)中でも、同様の拮抗作用のある菌か、ポケット内のpHを変化させていることか示唆された。さらに、ポケット内に薬剤を投与する場合、pHの影響をうけるか調べるために、培地のpHをかえた条件下で、薬剤の感受性試験を行った。代表的な歯周病原菌を甲いたところ、pHの高い状態で、テトラサイクリン、ドキシサイタリン、ミノマイシンには、MICか低い細菌が認められた。これまで、ポケット内局所の〓が6.0-8.5と異なることを示した。さらに、こうした〓が、テトラサイクリン系薬剤、クリンダマイシン系薬剤の薬剤感受性に影響を与えることも示した。また、3種の口腔内細菌を連続嫌気培養し、その培養条件の〓を変化させて消長を調べ、至適〓にならない状態での培養には抵抗を示すことを報告した。細菌が生育する条件に影響を及ぼす局所環境の変化を探る目的で騒音被爆による影響をラットを用いて調べた。環境の変化がラットに及ぼす影響は、血糖値によって検索した。12-16週令のラットに対し、各種条件で騒音をきかせることにより環境の変化とした。その結果、3000ヘルツ、95ホンの音を、1日8時間、6日間昼間に、絶食下で連続被爆させたとき、コントロールにくらべ血糖値の有意な上昇が確認された。この血糖値の上昇は、3日目よりおこり、ほぼ6日頃からプラトーに達した。さらに騒音被爆を停止すると3-6日でもとにもどることが確認された。
酵母のシグナル伝達機構を制御するショウジョウバエ遺伝子の分離と解析

動物細胞の増殖・分化を制御するシグナル伝達系において、MAPキナーゼの活性化を介したカスケードが、重要な役割を果たしている。我々は、酵母においてもプロテインキナーゼC(PKC1)を介したシグナル伝達系の下流に、MAPキナーゼの活性化カスケードが存在することを明らかにした。すなわち、PKC1を介したシグナル伝達系は、BCK1、MKK1/MKK2、MPK1のプロテインキナーゼ群により制御され、MKK1/MKK2は動物細胞のMAPキナーゼ・キナーゼと、MPK1はMAPキナーゼと相同性を示す。さらに、XenopusのMAPキナーゼが酵母のMPK1の機能を相補したことから、酵母のMPK1はverte brateのMAPキナーゼと機能的にも相同である。この結果は、酵母におけるPKC1-BCK1-MKK1/MKK2-MPK1のカスケードが、verte brateにおけるMAPキナーゼ活性化カスケードと機能的に類似していることを示唆している。従って、酵母のシグナル伝達系をモデル系として、ショウジョウバエ、動物細胞におけるシグナル伝達系に関与する遺伝子を分離し、それらの機能を解析することが可能である。Schneider細胞から作製されたショウジョウバエのcDNAライブラリーと、ヒト細胞由来のcDNAライブラリーを用いて、酵母のMAPキナーゼの活性化を介したシグナル伝達機構を制御する遺伝子として、ショウジョウバエから2個、ヒトから2個分離し、現在解析中である。
小学校低学年におけるメタ認知的方略測定用具の開発と利用

本研究は、小学校低学年算数科の問題解決場面における児童のメタ認知的方略の様相を捉えることを目的とした。そして、問題解決過程におけるメタ認知的方略の様相を計量的に捉えるために、測定用具を作成した。小学校低学年用のメタ認知的方略測定用具の作成は、先行研究(清水(1996)など)を参考に質問紙を作成し、小学校経験の豊富な教師との検討や因子分析などを行って、対象単元ごとに3因子構成の6つの質問項目からなる測定用具を作成した。また、測定用具の各因子は、それぞれをメタ認知的方略のコントロール、モニタリング、プランニングに対応させた。算数科の授業における実践研究の結果、(1)協同解決型の授業を行うことによってメタ認知的方略量は増加する傾向にある、(2)文章問題における協同解決型の授業は、児童の問題把握(モニタリング)に有効的である、(3)授業における非発言者も、授業を発言者と同じように受けることによってメタ認知的方略量が増える場合がある、(4)九九のように暗記(記憶)に関する学習内容では、時間が経過するとともにコントロールとプランニングは使用されなくなる傾向にあるが、モニタリングは使われ続ける傾向にある、(5)メタ認知的方略量が増加することは問題解決能力を高めることにつながる、などの知見が得られた。そして、これらの結果の学校教育への適用ついても考察をした。授業単元に入る前にメタ認知的方略の測定を行うことによって授業設計を考えることができ、また授業の方法や発言者・非発言者の扱い、そして経時に伴う学習内容の定着度にメタ認知的方略量の測定結果を生かすことができるであろうと考えられた。さらにメタ認知的方略量の測定から、より広い視野から児童の学力を見渡すことができるであろうと考えられた。今後の課題として、対象学年の拡充と測定用具の拡充・精緻化、またメタ認知的方略と児童の数学的理解との関係についての検討などが考えられた。
Ｃｈｉｐ－Ｓｅｑ法による肺腺癌細胞特異的なＴＧＦ－βシグナル伝達制御機構の解析

研究代表者は肺癌細胞において、ChIP-seq、RNA-seq法を用いた網羅的な解析を行い、肺上皮細胞に特異的に発現しているTTF-1という転写因子が、TGF-βシグナルの下流の代表的なシグナル分子であるSmad3とTGF-β非依存的に結合し、クロマチン上で共局在していること、また、Smad3との結合をめぐってSmad4と競合することにより、TGF-βシグナルの一部を特異的に阻害していることを見出した。これにより、TTF-1が肺腺癌の進展に対し促進的にも抑制的にも働くことのメカニズムの一端を解明した。これは将来の肺腺癌の治療薬の開発に貢献するものであると考えられる。申請者は肺腺癌細胞株において、腫瘍の浸潤や転移にかかわるTGF-βシグナルがどのように調節されているのかを、クロマチンの修飾や立体構造の変化のという観点に着目し、ChIP-seq, RNA-seq, Chromatin conformation capture assayなどの手法を用いて、網羅的に解析している。TGF-βシグナルにおける代表的なシグナル伝達分子であるSmad3が、いかに組織特異的な転写制御をおこなっているかに関し、ChIP-seq法を用いてSmad3の協調的に働く共役因子の探索を行った。現在までにTTF-1やFoxA2を同定し、これらがSmad3のシグナル伝達メカニズムをどのように調節しているかをSmad3のbindingpartnerであるSmad4との相互作用などの解析を通じて、TTF-1が今までに知られていないSmad3の働きに関与していることが同定された。また、FoxA2はクロマチンの開閉をコントロールするパイオニア因子として知られており、これらの分子が協調的に働いている箇所ではクロマチンの開閉がTGF-β刺激後の時間経過に沿って変化しており、これによりTGF-b刺激に対する感受性をコントロールしている可能性が示された。現在この可能性に関し、FAIRE-seq法などを用いた網羅的な解析を通じ、さらに解析を重ねているところである。実験代表者は、肺腺癌細胞株において、TGF-βの刺激条件などを変えた複数の培養条件において、Smad3や、Smad3と共役する転写因子であるSmad4,TTF-1,FoxA1/2に特異的な抗体を用いてChIP-seqを行った。このことから、TTF-1はSmad3とクロマチン上で共局在し、Smad4と競合すること、またFoxA2と共局在するSmad3は刺激後しばらくすると、FoxA2とともにクロマチン上から乖離してしまうことを見出した。また、TTF-1やFoxA1/2を過剰発現、またはノックダウンした条件でRNA-seqを行った。これにより得られた遺伝子発現の変化と、ChIP-seqにより得られた結合の変化を比較することにより、TTF-1はTGF-β下流のシグナルのうち、癌の浸潤転移に影響する上皮間葉転換に関係する遺伝子を特異的に抑制し、それはSmad3とSmad4の複合体の結合を抑制しているためであることを見出した。さらに、TTF-1はSmad3とクロマチン上でTGF-β非依存的に共局在することにより、TGF-βの標的遺伝子とは異なる遺伝子の発現を調節しており、これには抗アポトーシス作用があることが示唆された。また、TGF-β標的遺伝子の周囲には複数のSmad3/4結合領域があり、Smad3/4複合体は一つの複合体が複数の領域こ結合しクロマチンの構造を変化させることによって標的遺伝子の発現を促すことが示された。これらの結果はTTF-1が肺癌の進展を抑制するメカニズムを示したものであり、将来の肺腺がんの治療法開発の一助となるものである。これらの結果をまとめ、Cell Ressearch誌に投稿し、現在査読中である。肺腺癌細胞におけるFoxA1/2の働きについても、現在投稿を準備している。現在、TTF-1とFoxA2の二種類の共役因子に関して解析を進めているが、TTF-1に関しては、この分子とSmad3の協調作用により、Smad3の未報告の働きを見出しており、現在論文投稿準備段階に入っている。FoxA2に関しては、この分子は肺腺癌において予後良好因子であるという報告がある一方、同ファミリーで構造や結合部位も非常に類似しているFoxA1は肺腺癌においては腫瘍促進的に働くという報告がある。申請者はこの二つの分子に関してTGF-b刺激後経時的にChIP-seq法を用いてその結合部位を網羅的に解析したところ、この二つの分子の結合部位は非常によくにているものの、刺激後時間がたってからの結合パターンに違いがあり、Smad3のChIP-seqの結果と組み合わせて解析すると、その違いがSmad3の結合パターンへと影響をしている可能性が示唆された。またFAIRE-qPCR法を用いた解析で、この変化にはクロマチンの開閉を伴っていることが明らかになった。

これらのことから、Smad3との協調作用という観点において、FoxA2がFoxA1とは異なる働きをしており、それが肺腺癌の進展に関与している可能性が示されている。25年度が最終年度であるため、記入しない。本研究の2年目は、当初の計画通り、前年度の研究結果を踏まえ、共役因子のGain of function, Loss of Function条件でのTGF-βシグナルに対する応答を確認する。すなわち、ノックダウン(あるいは過剰発現)条件下でSmad3特異的な抗体を用いたChIP-seq、ならびに発現マイクロアレイ(もしくはRNA-seq)のデータを取得し、その解析を行う。本課題で解析対象の転写共役因子は、Smad3と結合するという報告があり、クロマチン上で共存していると考えられる。また、クロマチンの構造にも影響するという報告があるため、Smad3の結合に大きな変化を認める場合は、付近のクロマチン構造に変化を伴っていることが考えられる。そこで、この変化をクロマチンコンフォメーションキャプチャーアッセイ(3C)法により検出する。さらに、今回対象とする転写共役因子は、いずれも肺癌を含む複数の癌患者において、癌の進展や予後にかかわることが報告されている。そのため、今回の解析の結果得られた主な標的遺伝子発現変動につき、実際の肺腺癌患者のすでに公開されている臨床検体のデータを参照し、解析を行う。また、今回の共役因子の発現の高低による患者の予後への影響が、TGF-βシグナルによるものであるかどうかに関しても、解析を行う。
繰り返し測定データに対するノンパラメトリック推測法の開発と応用

医学研究においては、関心のある評価項目が経時的に繰り返し測定され、評価されることがしばしば行われる。このような繰り返し測定データの解析に対し、最近生存時間の手法が効果的に導入されたが、本研究ではその方法の適切性を評価するための方法を開発した。理論的あるいは計算機シミュレーションにより、提案法は実際の医学研究に有意義な方法であることが見出された。本年度は繰り返し測定データに対する時変係数を有する一般化線形モデルの推測法の開発を行った。局所多項式近似に基づく推定法を開発し、その理論的性質を明らかにした。このモデルに対して、他の推定法の提案が最近なされ、我々の接近の意義をより明確化する必要があり検討中である。また、Cheng et al(2000 Biometrika)により提案されたセミパラメトリックモデルのモデル診断についての研究を併せて実施した。この方法は本プロジェクトが対象としている計数過程による繰り返し測定データの解析手法に属する方法であり、これまでこの方法に対するモデル診断の方法は議論されてこなかった。繰り返し測定データに対しては、一般化推定方程式GEEに対する累積残差によるモデル診断がLin et al(2002 Biometrics)により議論されてきた。本研究が対象とするモデルでは残差が平滑化に依存してしまうが、工夫を加えることで平滑化に依存しない形で累積残差によるモデル診断法を開発し、その理論的性質を調べた。この方法ではモデルを構成する2つの部分を診断する2つの統計量によるため、多重性の問題が生ずる。ある種のリサンプリング法により、多重性を考慮したオムニバス検定を構成した。現在はその数値的な性質を調べている。この研究は当初の研究計画とは異なるものであるが、本研究が意図していた時変係数を有するモデルへの拡張が期待されるものである。以上の研究結果は未発表であるが、平成19年度に行われる2007Taipei International Statistical Symposiumにおいて発表する予定である。本年度は、繰り返し測定データに対する計数過程に基づくセミパラメトリック推測に関する累積残差による回帰診断法に関する研究を実施した。手法の構成と理論的な考察はすでに昨年度に中心的な部分は完了していたが、本年度は理論の細部を詰めるとともに、計算を実施するプログラムコードを作成し、計算機シミュレーションにより提案法の有効性を検討した。提案法は100例程度の実際の臨床試験に現れる程度の大きさのデータに対しても有効であることが確認できた。またC型肝炎症例に対する無作為化臨床試験データに適用し、試験期間を通じて治療効果が一定と仮定して設定した統計モデルが不適切であることを見出した。論文を作成し、現在投稿である。また、脱落を伴う繰り返し測定データに対して頻繁に用いられるIPCW法に対する局所影響度分析手法の開発を行った。近似的に影響度を評価する方法を導出し、計算用のプログラムードを作成した。IPCW法は、関心のある回帰係数を得るために、複数の回帰モデルを当てはめるが、したがって、関心ある回帰計数の推定は、これらの複数の回帰モデルの特定に依存することになる。我々の方法は、各症例の関心ある回帰係数への影響を、各回帰モデルに起因する部分に分解する式を与えており、推定に要する一連の回帰モデルのどの部分を改善すべきかのヒントを与える。この性質から、効率的にIPCW法に必要な回帰モデルの改良を行うことが期待できる。現在は、提案法の有効性を確認するべく、実際のAIDS症例に対する臨床試験データへの適用を行っている。本年度は、昨年度までに開発した繰り返し測定データに対ずる計数過程に基づくセミパラメトリック推測に対する累積残差による回帰診断法を報告した論文の改訂作業を行い研究成果を出版した。また、脱落を伴う繰り返し測定データに対して頻繁に用いられるIPCW法に対する局所影響度分析手法の開発を昨年までに行ったが、本年度はいくつかの数値実験を行いその現実問題への有用性を調べた。成果を、国際計量生物学会、IASC2008および統計関連連合大会にて発表した。論文を投稿し、現在最終的な改訂作業を行っている。この方法は独立作業相関の場合に限定されており、一般の作業相関を用いる場合の方法を開発することを本年度の目標としていた。直接的な拡張を試みたが、それは困難であると考えられ、何らかの近似的な方法を開発することが重要であると考えられる。one-step推定の考え方を導入することで、独立作業相関の場合の我々の公式に帰着する近似法が適用できることを見出した。現在のところ手法の構成に成果は限定されており、現在は現実問題での有用性を確認するべく、プログラムコードを作成している。我々の方法は、関心のあるパラメータへの各症例の影響度を、IPCW法が要求する各時点での脱落への複数のモデル由来の成分に分解した形式をとる点に特色がある。分解した項を別々に見ることで、脱落へのモデルが不安定であることが示唆される場合には、パラメータを共有したコンパクトなモデルを当てはめるなど、モデルの改善に対する示唆を得ることができることが期待される。このことを実データへの適用あるいは計算機シミュレーションなどにより具体的に調べるべく、プログラムコードの作成を進めている。
文章解析・生成のための日本語構造の記述に関する基礎的研究

1.テキストの入力・話しことばの文字化試料のデータベース化(雑誌『言語生活』(筑摩書房)「録音器」欄、約50万レコード)および検索プログラムの開発(権利処理後、公開の予定)・福沢諭吉『文明論之概略』(作業中、完成後用語索引として出版の予定)2.用例の入力・データベース化・国立国語研究所『現代語の助詞助動詞』・国立国語研究所『動詞の意味・用法の記述的研究』・国立国語研究所『形容詞の意味・用法の記述的研究』・言語学研究会編『日本語文法・連語論(資料編)』(以上、権利処理後、研究用として公開の予定)3.明治大正の小説の機械処理・日本語形態素解析プログラムJUMANによる処理精度の分析(下記報告書に記載)4.『分類語彙表』の機械辞書化・「分類語彙表形式による語彙分類表(増補版)本表と索引(約8万7千語、フロッピ-2枚に収録、モニター用として公開)5.日本語の語彙・文字の調査プログラム集MCLの開発と公開下記のホームページにて公開。6.研究会の開催「国語学・日本語学と日本語情報処理とのかかわりあいについて」1995年1月19日「コーパス言語学の現状と課題」1996年2月18日「日本語学と日本語情報処理-日本語研究の方法論-」1997年2月14日7.報告書の刊行「日本語学と日本語情報処理」(1997年3月刊)1.テキストの入力・話しことばの文字化試料のデータベース化(雑誌『言語生活』(筑摩書房)「録音器」欄、約50万レコード)および検索プログラムの開発(権利処理後、公開の予定)・福沢諭吉『文明論之概略』(作業中、完成後用語索引として出版の予定)2.用例の入力・データベース化・国立国語研究所『現代語の助詞助動詞』・国立国語研究所『動詞の意味・用法の記述的研究』・国立国語研究所『形容詞の意味・用法の記述的研究』・言語学研究会編『日本語文法・連語論(資料編)』(以上、権利処理後、研究用として公開の予定)3.明治大正の小説の機械処理・日本語形態素解析プログラムJUMANによる処理精度の分析(下記報告書に記載)4.『分類語彙表』の機械辞書化・「分類語彙表形式による語彙分類表(増補版)本表と索引(約8万7千語、フロッピ-2枚に収録、モニター用として公開)5.日本語の語彙・文字の調査プログラム集MCLの開発と公開下記のホームページにて公開。6.研究会の開催「国語学・日本語学と日本語情報処理とのかかわりあいについて」1995年1月19日「コーパス言語学の現状と課題」1996年2月18日「日本語学と日本語情報処理-日本語研究の方法論-」1997年2月14日7.報告書の刊行「日本語学と日本語情報処理」(1997年3月刊)平成6年度は、以下のことをおこなった。研究計画の予定どおりの進捗状況で、研究のための準備的な段階をほぼ終えた。1.言語調査データおよびテキストデータのデータベース化(1)国語研究所がおこなった語彙調査のテキスト、および、科研費でおこなわれた話しことばのKWICについてデータベース化のための情報をつけた。(2)『日本語文法・連語論』『現代語の助詞助動詞』をコンピュータに入力、用例文をデータベース化するための準備をとして、付加情報をつけはじめた。2.機械辞書の作成大野晋・浜西正人『類語国語辞典』(角川書店)をもとにして、約6万語について位相情報・語種情報・意味分類情報などの一次入力を終了した。3.ワークステーションを使用した言語処理京都大学で開発された日本語処理プログラムを移植し、おもに科学技術文献を対象としていたそのシステムを明治期の小説などの、文体的に異なった種類のテキストへ応用することを試みた。また、パソコン上で動いている各種言語処理プログラムをワークステーション上に移植した。4.アンケートの実施日本語情報処理にかかわる研究者には、大きくわけて国語学の研究者と工学系の研究者がいるが、両者の間の研究目的・方法論などの違いについて研究者自身を対象にアンケートを行った。結果はとりまとめ中であるが、データに対する考え方の違いが、使いやすいデータベースの作成や言語処理ツールの効果的活用をさぐるための参考になるのではないかと思われる。5.研究会の開催平成7年1月19日に下記のテーマで研究会を行った。・テキストデータベースの構築について・日本語情報処理に対する異なったアプローチの仕方(国語学と工学)について6.電磁媒体による日本語テキストデータの収集CD-ROMや電子ブックなど機械で読む日本語テキストが次第に出版点数をましてきている。これを調査し、一部収集を始めた。平成7年度は以下のことを行った。また、本データベースを利用するためのプログラムを作成している。(2)『日本語文法・連語論』『現代語の助詞助動詞』をコンピュータに入力、用例文をデータベース化するための準備をとして、付加情報をつけた。(3)『動詞の意味・用法の記述的研究』『形容詞の意味・用法の記述的研究』をコンピュータに入力、用例文をデータベース化を始めた。2.機械辞書の作成「増補版分類語彙表」を言語処理用機械辞書に変換するために、昨年度作成した位相情報・語種情報・意味分類情報の付加作業をはじめた。

語数は9万語になる予定。3.ワークステーションを使用した言語処理京都大学で開発された日本語処理プログラムを移植し、おもに科学技術文献を対象としたそのシステムを明治期の小説などの、文体的に異なった種類のテキストへ応用することを試みた。また、パソコン上で動いている各種言語処理プログラムをワークステーション上に移植した。4.研究会の開催平成8年2月に下記のテーマで研究会を行った。「コーパス言語学の現状と課題」1.大規模テキストデータベースの作成テキストデータベースは、用法記述になくてはならない基礎資料である。8年度は、文学作品データ(約71万語)のデータベース化、およびそのデータベースの検索プログラムの試作の2つを行った。2.用例テ-タベースの作成『現代語の助詞・助動詞』『日本語文法・連語論』『動詞の意味・用法の記述的研究』『形容詞の意味・用法の記述的研究』の用例を統合し、データベース化を完了した。3.日本語処理プログラムの作成移植した単語分割・漢字解読・品詞認定・語種認定のプログラムの上に、構文解析プログラムをのせて、処理実験をおこなった。4.公開プログラムと辞書の移植、改良移植した形態素解析プログラムを国定読本や明治・大正の小説処理用に改良し、その機能を評価した。5.研究発表会の開催平成9年2月14日に研究会「日本語学と日本語情報処理」を行った。国語学・情報処理関係研究者による研究会を開き、研究の評価、成果の普及をはかった。6.報告書の刊行研究成果として報告書『日本語学と日本語情報処理』を刊行した。
フィールドワークを軸とするベトナム特産薬用資源の生産研究

研究費が交付された平成11年11月から研究終了の平成13年3月までの期間に3回のフィールドワークを行なった。調査対象は主に桂皮と沈香、および民間で用いられる薬用植物類で、調査地は、第1回がベトナム南部、第2回が同北部、第3回が同中南部である。これらの現地調査で得られた情報と入手資料を用いた各種実験から、以下のようなことが明らかとなった。まず、桂皮については、ベトナム桂皮には大きく分けて北部系のYBと南部系のMNがあり、各種の分析結果から両者の特徴が大きく異なることが判明した。現地での情報と核酸分析により、この違いは植物種の違いによるという結果が得られた。沈香については、中南部にて野生および栽培の様子を調査した。その際に人為的に沈香を生成させる方法について情報を得た。一方、京都大学薬学研究科に設置の環境制御装置付きガラス温室内ではシナジンコウおよびベトナムより導入したジンコウジュを栽培し、このものの新鮮葉を用いた核酸分析と、無菌試験のためのカルス誘導を行なった。誘導したカルスからは大量増殖用の液内培養系を確立した。さらに、幹部に傷害を与えて樹脂を生成させることを試み、少量であるが香気成分を含む樹脂が生成することを確認した。また、台湾より入手したシナジンコウの風倒木の成分研究を行ない、新規クロモン類の構造を決定した。ベトナムで使用される伝統薬について、エキスの抗トリパノソーマ活性試験行ない、特に活性の強かったAlpinia galanga, Sophora suffruticosaについては、活性成分の単離、同定を行なった。フィールドワークとして、2000年1月7日より1月28日の期間、南ベトナムを中心に特産薬用資源、特に沈香と桂皮についての調査を行なった。目的は、これらの栽培状況の現状調査、栽培生産に適した将来性のある樹種の選定、及び生産研究に用いる種子・苗の入手である。ホーチミン市内の生薬の現状調査では、扱われる生薬類の大半が中国からの輸入漢薬類で占められていた。従来よりベトナム特産の生薬として評価の高いものに桂皮と沈香(伽羅)があるが、我が国の薫香料メーカーでは、ベトナムからの薫香料原料に適した品質の良い沈香が年々入手しにくくなっており、供給面での将来性が非常に危ぶまれている。実際、沈香は市場においても粗悪な品質のものが少量扱われているのみで、近年は産出量が激減しているということであった。この沈香の基原木(おそらくAquilaria agalocha)の植栽状況をホーチミン市内、ニャチャン郊外、ならびにラム・ドン県にて調査した。現在、沈香に関しては別途に入手し、発芽・育成させたAquilaria sinensisについて、カルス誘導を行うと共に香気成分産生に関する実験を行っている。ダナン市では市環境森林保護局の案内で桂皮の採種用林の調査と桂皮加工場の見学を行なった。採種用林の木は総て原因不明の寄生病に侵されており、症状が進んで枯死している個体もあり、保護局長からこの寄生病の同定と防除手段の検討を要請された。桂皮加工場では、これまで我が国には輸入実績のないMN桂皮と称される高品質の桂皮についての各種情報と分析用サンプルの収集を行なった。本サンプルについては、中国産、北ベトナム産など他の産地のサンプルを入手し、比較分析を行なう予定である。また、MN桂皮の基原木(おそらくCinnamomum cassia)の種子を入手し、帰国後すぐに播種したが、現在までのところ順調に発芽、生育している。第2回のフィールド調査として、2001年10月13日より10月21日の期間、北ベトナムを中心に特に桂皮についての調査を行なった。北ベトナム地域における昔から名の通った桂皮産地である、Yen Bai、Than Hoa、Quan Ninhの3産地に赴き、桂皮の栽培、流通の現状を調査した。それぞれの地域に特色があり、これらのいずれの地域にも、昨年のMN地区で観察されたような寄生病は観察されなかった。これまでに収集された各産地の桂皮サンプルについて、精油含量、灰分、油層の割合について分析を行なった。精油含量は1.065.55%と高く、いずれも局方適(≧0.5%)であった。精油含量と油層の割合については正の相関が示され、油層が厚いものほど高品質であることが確かめられた。しかし、高精油含量のMN桂皮では、灰分が過剰で局方不適と判断されるサンプルが多いものの、いずれのサンプルも中国産桂皮よりも格段に良質と判断された。今後は、これらの品質の差異が、起源植物によるのものなのか、生育条件によるのか、などを考察する。昨年度導入したAquilaria sinensisおよびCinnamomum cassiaは、環境複合制御装置付きガラス温室内で順調に生育しており、これらの新鮮葉を用いた核酸分析等の実験も進行中である。さらに本年は、現地でA.agalochaと称される幼苗25本を導入することができ、現在、鉢植えにて育成中である。また、A.sinensisの葉より、各種ホルモン条件下、カルス誘導を行ない、大量培養を目標とする液内細胞培養系の確立をした。

調査対象は主に桂皮と沈香、および民間で用いられる薬用植物類で、調査地は、第1回がベトナム南部、第2回が同北部、第3回が同中南部である。これらの現地調査で得られた情報と入手資料を用いた各種実験から、以下のようなことが明らかとなった。まず、桂皮については、ベトナム桂皮には大きく分けて北部系のYBと南部系のMNがあり、各種の分析結果から両者の特徴が大きく異なることが判明した。現地での情報と核酸分析により、この違いは植物種の違いによるという結果が得られた。沈香については、中南部にて野生および栽培の様子を調査した。その際に人為的に沈香を生成させる方法について情報を得た。一方、京都大学薬学研究科に設置の環境制御装置付きガラス温室内ではシナジンコウおよびベトナムより導入したジンコウジュを栽培し、このものの新鮮葉を用いた核酸分析と、無菌試験のためのカルス誘導を行なった。誘導したカルスからは大量増殖用の液内培養系を確立した。さらに、幹部に傷害を与えて樹脂を生成させることを試み、少量であるが香気成分を含む樹脂が生成することを確認した。また、台湾より入手したシナジンコウの風倒木の成分研究を行ない、新規クロモン類の構造を決定した。ベトナムで使用される伝統薬について、エキスの抗トリパノソーマ活性試験行ない、特に活性の強かったAlpinia galanga, Sophora suffruticosaについては、活性成分の単離、同定を行なった。第3回のフィールド調査として、平成13年12月7日平成13年12月17日の期間、ベトナム共和国中南部を中心とする地域にて、主に桂皮と沈香に関する調査を行なった。(本多、伊藤、嶋田)まず、Quang Nam県Tam Ky市Tra My村を中心にMN桂皮に関する情報収集と各種サンプルの入手を行なった。MN桂皮の基原植物には2型あり、品質、特に精油含量や製品にした時の価格も異なること、また、形態学的な両型の区別点等も明かとなった。さらに、9年生の各々の型の生原木1本ずつを伐採し、樹皮を剥ぎ、各種データを得た。沈香についての調査はTam Ky市Tien Phuouc村にて行なった。この周辺地域ではジンコウ樹を栽培しており、栽培ジンコウ樹に人工的に処理を施し、沈香を生成させていた。すでに京都大学薬学研究科に導入のジンコウ樹およびベトナムケイは順調に生長しており、シナジンコウジュは開花結実し、多数の苗を育成した。また傷害法による樹脂生成に成功した。さらにこれらの新鮮葉を用い、核酸分析を利用した分類学的識別を指向した分析をも行なった。また、ジンコウ樹新鮮葉より誘導した培養細胞についても成分分析を行なった。一昨年来、逐次入手してきた桂皮、沈香のサンプルについては、京都大学薬学研究科に設置のHITACHI製GC-MS装置(平成12年度導入)やその他の既存の分析器機を用いて、また三星製薬株式会社分析室において、精油定量、灰分定量、精油成分分析等の分析を行なった。得られたデータ類は現在投稿中ならびに投稿準備中であり、日本薬学第122年会にて発表の予定である。
インドネシアの天然薬物調査研究(第5次)

インドネシアは、東南アジア島嶼無の大部分を占め、地理的に赤道を挟んで南北に、またウォーレスラインの東西に長く延び、スマトラ・カリマンタン・イリアンジャヤなど大陸にも匹敵する大きな島からサンゴ礁に至る無数の島々から成っている。気象的には、概ね熱帯雨林気候もしくは熱帯モンスーン気候であるが、地理的変化に富んでいるためその植物資源は極めて豊富である。しかしながら、インドネシアの植物資源に対する植物生態学、植物分類学、及び天然物化学をはじめとする薬学的的見地からの分析は殆ど行われていないのが現状である。一方、インドネシア社会の医療形態を見ると、都市部では近代医学による病院、開業医、薬局などがあるが、郡部ではドゥクンと呼ばれる世襲性の民間医が、近隣の山野に自生する熱帯薬用植物を用いて、マラリアなどの熱帯病をはじめとする種々の疾病の治療を行っている。本学術調査は、第一次調査(昭和6061年度)及び第2次調査(昭和62平成元年度)では、ジャワ島及びバリ島における伝統的薬物ジャムゥ生薬の市場調査、ならびにヌサ・テンガラ・チム-ル州(チモール島、フローレス島、スンバ島)における民間薬、民間医療及び薬用植物調査を行った。第3次(平成23年度)では、調査地域を、熱帯雨林気候でウォーレスラインの西側に位置するスマトラ島に移し、ベンクル州及びリアウ州の天然薬物調査を行った。また第4次調査(平成45年度)は、香料諸島として有名なモルッカ州アンボン島、及びほぼウォーレスラインに位置し地形的変化に富む中部スラウェシ州において調査した。そして、今回の第4次調査は、平成6年度にボルネオ島の西カリマンタン州を調査地とし、主としてサンバス県においてダヤック・イバン族の集落を訪ねた。また平成7年度は、同じくボルネオ島の東カリマンタン州においてダヤック・ベヌアック族の集落で調査を行った。両年度とも、現地の国立大学のスッタフや地元森林局職員の協力を得、極めて円滑に調査を遂行することができ、当初の計画をほぼ遂行した。各集落においては、年輩者を訪問し、その集落で民間薬として用いられている薬草(薬用植物)について、用法・用途を含めて情報を収集した。また、民間医(ドゥクン)から、彼らの民間医療としての治療法を詳細に聞き取り調査を行った。さらに、民間薬調査及び民間医療調査で得られた情報を基に、薬用植物調査も平行して行い、両州合わせて計80種の薬用植物資料を収集することができた。収集した情報・資料については、本学術調査研究のインドネシア側共同研究機関であるジャワ島ボゴール市にあるインドネシア科学院附属の国立生物学研究所において、分析及び植物分類学的な同定を行った。ダヤック族とは、古来からボルネオ島に住む民族の総称である。西カリマンタン州のダヤック・イバン族(平成6年度)と西カリマンタン州のダッヤク・イバン族(平成7年度)では、彼らの民間薬・民間医療ともに大きく異なるものであった。その理由・背景については、現在インドネシア側の民族植物学者と協力して研究を進めているところである。この様に、南米のアマゾン流域と並んで世界有数の植物資源国であるインドネシアの天然薬物調査は、新規な医薬品開発に資する化学的及び生物学的研究に寄与するに留まらず、人類にとって今や貴重な財産となったインドネシアの有用植物資源リストの作成に貢献するものである。さらに、国際共同研究体制で進める本学術調査は、日本・インドネシア両国の学術交流に大きく寄与するものである。「インドネシアの天然薬物調査研究」を完遂するため、平成8年度以降も、本学術調査の継続を計画している。

両年度とも、現地の国立大学のスッタフや地元森林局職員の協力を得、極めて円滑に調査を遂行することができ、当初の計画をほぼ遂行した。各集落においては、年輩者を訪問し、その集落で民間薬として用いられている薬草(薬用植物)について、用法・用途を含めて情報を収集した。また、民間医(ドゥクン)から、彼らの民間医療としての治療法を詳細に聞き取り調査を行った。さらに、民間薬調査及び民間医療調査で得られた情報を基に、薬用植物調査も平行して行い、両州合わせて計80種の薬用植物資料を収集することができた。収集した情報・資料については、本学術調査研究のインドネシア側共同研究機関であるジャワ島ボゴール市にあるインドネシア科学院附属の国立生物学研究所において、分析及び植物分類学的な同定を行った。ダヤック族とは、古来からボルネオ島に住む民族の総称である。西カリマンタン州のダヤック・イバン族(平成6年度)と西カリマンタン州のダッヤク・イバン族(平成7年度)では、彼らの民間薬・民間医療ともに大きく異なるものであった。その理由・背景については、現在インドネシア側の民族植物学者と協力して研究を進めているところである。この様に、南米のアマゾン流域と並んで世界有数の植物資源国であるインドネシアの天然薬物調査は、新規な医薬品開発に資する化学的及び生物学的研究に寄与するに留まらず、人類にとって今や貴重な財産となったインドネシアの有用植物資源リストの作成に貢献するものである。さらに、国際共同研究体制で進める本学術調査は、日本・インドネシア両国の学術交流に大きく寄与するものである。「インドネシアの天然薬物調査研究」を完遂するため、平成8年度以降も、本学術調査の継続を計画している。インドネシアは、東南アジア島嶼部の大部分を占め、スマトラ、カリマンタン、イリアンジャヤなど大陸にも匹敵する大きな島から珊瑚礁に至る無数の島々から成っている。気象的には、殆どの地域が熱帯雨林もしくは熱帯モンスーン気候であるが、地理的変化に富むためその植物資源は極めて豊富である。しかし、その植物資源に関する科学的なメスはこれまで殆ど入れられていないのが現状である。この様な背景から、本学術調査では、インドネシア科学院・国立生物学研究所との共同研究体制で、調査地域を順次移動しインドネシア各地の民間薬、民間医療、及び薬用植物調査を行っている。平成6年度は、ボロネオ島の西カリマンタン州において調査を行った。とくに、同州のサンバス県に住むダヤック・イバン族の集落を訪問し、その民族特有の薬用植物の利用法について詳細に情報を収集し、さらに、得られた情報をもとにして、薬用植物採集を行った。ダヤック・イバン族はボルネオ島に古来から生活し焼畑農業を生活の糧にしている民族であるが、彼らの民間薬や民間医療には中国やマレー分化の影響も認められた。また、彼らの多くは熱帯原生株(ジャングル)に自生する薬用植物植物を採集して利用しているが、集落によっては集落の周りに薬用植物の栽培を始めている。本調査によって、西カリマンタン州における薬用植物に関する情報とともに計31種の薬用植物を化学的研究用に収集することが出来た。全資料は、インドネシア国立生物学研究所附属のゴボール植物標本館において同定を行った。
光合成初期過程の動態解明に向けたカロテノイドの時間分解顕微ラマン分光測定

本研究では光合成初期過程におけるカロテノイドの振電相互作用と緩和過程のダイナミクスを解明することを目的としている。植物が独自に発達させた光捕集アンテナ系に含まれるカロテノイドは太陽光エネルギーを余すことなく享受するための色調を与える主要因となっている。このカロテノイドのダイナミクスを解明すれば光合成において非常に高効率でエネルギー伝達を行う植物の光捕集から光反応中心への伝達の仕組みを明らかにすることができる。その方法としては時間分解顕微ラマン分光測定を用いる。この研究を実施するために既に使用していた共焦点顕微ラマン分光測定装置を改良して時間分解ラマン分光測定ができるようにする。本研究では、異なる細菌から単離してきた光捕集アンテナを再構成し、人工的に制御された光合成膜を測定する。再構成した光合成膜はバッファー中、およびポリマー中に固定したものを、共焦点顕微鏡を用いて分光測定し、平均と局所的なデータの二種類を得る。光合成細菌の光合成膜の検出を顕微で行うことによって膜内におけるカロテノイドの位置(構造)と機能の関係を、振動分光学を用いて明らかにする。膜内のカロテノイドがどのような構造をしているのかに関する知見を得ることができれば、光合成においてどのような構造をしていることが高効率なエネルギー移動をすることに重要なのかということがわかり、人工光合成の実現に貢献することができる。またこの測定と同時にカロテノイドの吸収スペクトルのシミュレーションを行った。このシミュレーションはラマンスペクトルのデータを用いて行うので、構造の情報をもとに電子構造をシミュレーションしている。吸収スペクトルのシミュレーションから求まった物理量を複数のカロテノイドについて比較することによってカロテノイドの構造において周辺環境と相互作用を受けやすいのはどの部分なのか、ということを定量的に検討することができる。26年度が最終年度であるため、記入しない。時間分解ラマン分光法は短寿命分子種のラマンスペクトルを測定する実験手法である。ラマンスペクトルは分子構造に関する豊富な情報を含むので、時間分解ラマンスペクトルは光化学反応の反応機構を研究する強力な実験法となっている。手法としては分子の短寿命種を測定するのに有効なポンプープローブ分光法を用いる。レーザー技術の進歩によって、近年ではサブピコ秒領域までの波長領域まで波長可変パルス光を得ることが容易になっており、時間分解ラマン分光測定においても共鳴ラマン効果を得ることができる。本研究ではまず、培養した光合成細菌を用い、顕微測定の強みである微小領域を測定することによる位置と機能の関連付けを行ってダイナミクスを追う。続いて、異なる細菌から単離してきた光捕集アンテナを再構成し、人工的に制御された光合成膜を測定する。これらの試料を測定することによって人工光合成システムの開発に大きく貢献することができる。まずはカロテノイドから溶液を作成し、その後光合成膜の測定に進めていく。

時間分解顕微ラマン分光測定装置の構築が完了していないため。研究奨励費のおかげで必要な物品の購入は行うことができたが、時間分解測定装置の構築は想定していたよりも困難で完了にはまだ時間を要する。時間分解顕微ラマン分光測定装置の構築を完了させることを当面の目標とするが、申請者個人の力では知識面、技術面から困難な点が多く、経験者の助言、指導を必要であると考えられる。装置の構築にまだ時間を要するため、当初予定していた研究計画を達成できない可能性は考慮に入れる必要がある。申請者が行おうとしている光合成膜の測定を行うところまではできたとしても、励起光の強度が生物サンプルに対して強すぎる可能性があるので、その部分でもまた時間がかかることが予想される。これらの問題への対応策として、既に顕微ではないが生体試料の時間分解測定を行っている先行研究の論文を参考にすることはもちろん、本人と直接連絡を取って議論、研究室の見学に行くことも考えている。また、別の対応策として、シミュレーションと実験の統合も考えている。吸収スペクトルとラマン散乱は密接に関係しているので、ラマンスペクトルのから吸収スペクトルをシミュレーションすることにより、カロテノイドの周辺環境を考察することができる。このシミュレーションについては現在既に進行中で、ある程度の結果も得られている。