hpprc/llmjp-kaken huggingface dataset:
真核生物鞭毛による運搬機構を有する物質内包リポソームの創製

本年度は、物質内包リポソームによるドラッグデリバリーシステムの評価基盤として、灌流可能な血管流路を有した皮膚モデルの構築、評価及び応用可能性の検証を目指した。皮膚モデルは、化粧品や薬剤の試験に使用されている。しかしながら、これまでの皮膚モデルには灌流可能な血管構造が存在せず、外部から培養液や試薬を灌流することが困難だった。報告者は昨年度、灌流可能な血管構造を有した皮膚モデルを構築した。本年度は、構築した皮膚モデルの形態・機能的な評価、及び創薬分野における応用可能性の検証を実施した。まず形態の評価を実施した。本皮膚モデルの表皮は、従来皮膚モデル相当の厚みであり、分化も確認された。さらに血管流路壁面には内皮細胞マーカであるCD31が検出された。機能の観点では、表皮がバリア機能を有することを電気計測により確認し、また血管流路については分子サイズ選択的な透過性及び酸素・栄養供給能があることが確認された。これらの結果から、本皮膚モデルが、皮膚モデル及び血管のモデルとしての基本的な性質を備えていることが示された。本皮膚モデルの表皮に、カフェイン及び二硝酸イソソルビド(ISDN)を塗布し、真皮下の培地及び血管流路内の培地を一定時間ごとにサンプリングした。この結果、両薬剤がいずれのサンプルからも検出され、経時的に累積透過量が増加した。また、ISDN透過量はカフェイン透過量より大きかったが、これはヒト皮膚における両薬剤の透過性の違いと一致した傾向である、さらにVEGFを培地中に添加したところ、血管流路内の培地への透過量が増加した。生体においてもVEGFを添加することで血管の透過性が上昇することが知られており、従って本研究の血管流路が生体に類似した内皮機能を有していることが示唆された。以上の結果から、本研究の皮膚モデルは化粧品・医薬品の開発や皮膚の基礎研究分野に貢献すると期待できる。28年度が最終年度であるため、記入しない。本年度は、物質内包リポソームによるドラッグデリバリーシステムの評価基盤として、灌流流路を有した皮膚組織の曲面構造上での構築を目指した。人工的に作製された皮膚組織は、化粧品や薬剤の試験に使用されている。しかし、薬剤の経皮吸収や、薬剤を血管に注入した後の皮膚への影響の測定のために必要な血管構造は、皮膚組織の培養時に大きな収縮が発生するため、これまで作製できていなかった。また、同様にヒトの身体を模した曲面構造上に皮膚組織を構築することが望ましいが、皮膚組織構築には気液界面における培養が必須であることから、流路無しでの曲面形状上での培養は困難であり、平面上での構築のみに留まっていた。そこで、本研究では皮膚組織培養デバイスに水平方向の収縮を防止する構造を設け、垂直方向にのみ皮膚組織を十分収縮させた後に、皮膚組織内部に通したワイヤを抜去することで流路を作製した。また、当該デバイスをヒトの指を模した構造体に適用した。まず、灌流デバイス内で真皮層を培養し、水平方向の収縮防止に成功した。収縮防止構造が無い場合は、真皮層は収縮し、特にワイヤ抜去時に脱離が発生した。このことから、収縮防止構造の有効性が示された。さらに、培地を灌流することで皮膚組織表面の角化に必要な気液界面を構成し表皮層を構築可能であることが確認できたなお、灌流を実施しない場合は、表皮層の形成が確認できなかった。このことは本デバイスによる灌流培養の有効性を示している。さらに、ヒトの指を模した構造物に、先述のデバイスに取り付けた収縮防止構造付きコネクタを設けた上で、真皮及び表皮層からなる皮膚組織を構築した。これにより、曲面形状上での皮膚組織構築の実現可能性を示した。次年度は、皮膚組織内の流路に血管内皮細胞を播種することで、より実際のヒト皮膚に近づけ、長期培養や薬剤試験に利用可能な皮膚組織の構築について、検証・計画中である。本年度は、物質内包リポソームによるドラッグデリバリーシステムの評価基盤として、灌流可能な血管流路を有した皮膚組織構築を目指した。報告者は昨年度、薬剤の経皮吸収や、薬剤を血管に注入した後の皮膚への影響測定のために必要な血管構造を皮膚組織に組み込むべく、皮膚組織に流路を構築するデバイスを作製した。しかしながら、当該デバイスではヒト皮膚に近い厚み(1 mm)の組織を作製する際に、組織の自重及び収縮により流路が閉塞する問題があった。そこで、本年度は、流路内壁を血管内皮細胞で覆うことで、より分厚い皮膚組織を作製することを目指した。まず、皮膚組織の大きな収縮が起きた状態でも、皮膚組織-培養デバイスの接合が液体の灌流に耐えうるよう、培養デバイスの表面処理を比較検討した。無処理、無処理(排出チューブのみ)、皮膚用接着剤、及びO2プラズマ処理の四種類の培養デバイスに対し、インクを注入したところ、皮膚用接着剤ないしO2プラズマ処理を行ったデバイスにおいて、接合部からの漏れが顕著に少なくなった。この結果より、皮膚用接着剤が組織中に残留することのないO2プラズマ処理を培養デバイスの表面処理として採用することとした。続いて、組織表面に水滴を滴下することで、表面が撥水性になっていることを確認した。このことから、本デバイスで培養した皮膚組織の表皮は正常に角化していると考えられる。

さらに、HE染色及び免疫染色により、流路の空洞構造維持、及び血管内皮細胞のマーカータンパク質(CD31)の発現を確認できた。なお、血管内皮細胞を播種しなかった場合、流路は閉塞してしまった。この結果から、血管内皮細胞が、空洞構造の維持に寄与していると考えられる。以上の成果は、化粧品、創薬といった分野で利用可能な血管付き皮膚組織作製において有用であると考える。当初の研究目的である物質内包リポソームの創製に向け、計画修正を行い、より重要度の高い、評価基盤としての皮膚組織構築に注力している。本年度は予定通り、厚みのある皮膚組織において灌流可能な流路を構築することに成功しており、進捗としては順調である。本年度は、物質内包リポソームによるドラッグデリバリーシステムの評価基盤として、灌流可能な血管流路を有した皮膚モデルの構築、評価及び応用可能性の検証を目指した。皮膚モデルは、化粧品や薬剤の試験に使用されている。しかしながら、これまでの皮膚モデルには灌流可能な血管構造が存在せず、外部から培養液や試薬を灌流することが困難だった。報告者は昨年度、灌流可能な血管構造を有した皮膚モデルを構築した。本年度は、構築した皮膚モデルの形態・機能的な評価、及び創薬分野における応用可能性の検証を実施した。まず形態の評価を実施した。本皮膚モデルの表皮は、従来皮膚モデル相当の厚みであり、分化も確認された。さらに血管流路壁面には内皮細胞マーカであるCD31が検出された。機能の観点では、表皮がバリア機能を有することを電気計測により確認し、また血管流路については分子サイズ選択的な透過性及び酸素・栄養供給能があることが確認された。これらの結果から、本皮膚モデルが、皮膚モデル及び血管のモデルとしての基本的な性質を備えていることが示された。本皮膚モデルの表皮に、カフェイン及び二硝酸イソソルビド(ISDN)を塗布し、真皮下の培地及び血管流路内の培地を一定時間ごとにサンプリングした。この結果、両薬剤がいずれのサンプルからも検出され、経時的に累積透過量が増加した。また、ISDN透過量はカフェイン透過量より大きかったが、これはヒト皮膚における両薬剤の透過性の違いと一致した傾向である、さらにVEGFを培地中に添加したところ、血管流路内の培地への透過量が増加した。生体においてもVEGFを添加することで血管の透過性が上昇することが知られており、従って本研究の血管流路が生体に類似した内皮機能を有していることが示唆された。以上の結果から、本研究の皮膚モデルは化粧品・医薬品の開発や皮膚の基礎研究分野に貢献すると期待できる。当初の研究目的である物質内包リポソームの創製に向け、若干の計画修正を行い、その評価基盤としての皮膚組織構築を実施中である。本年度は予定通り、灌流可能な流路を有した皮膚組織を曲面構造上に構築することに成功しており、進捗としては順調である。作製した灌流可能な流路付き皮膚組織の有用性を評価するため、リポソームや薬剤等を塗布し、血管への取り込み等を測定する。また、長期間の培養を行うことで、灌流の効果を実証する。28年度が最終年度であるため、記入しない。皮膚組織内の流路に血管内皮細胞を播種することで、より実際のヒト皮膚に近づけ、長期間の培養及び薬剤試験に利用可能な皮膚組織の構築方式について、検証・計画中である。
過酸化脂質異性体解析から切開く酸化原因特定と健康・食未来社会へ繋げる酸化最適制御

脂質の酸化は、生体においては疾病などの生体機能の攪乱を招き、食品においては品質の低下をもたらすため、生体や食品でどのような酸化反応が惹起されているかの見極めは重要となる。近年、我々は質量分析を駆使し、生体や食品に含まれる過酸化脂質を異性体レベルで解析することで、この見極めを実現しつつある。そこで、本研究では、本法を完成させ、幅広い試料の分析を行う。そして、生体や食品の脂質酸化反応を見極め、従来は困難であったその反応に応じた最適な制御に挑む。本ストラテジーに基づき、機能性食品(抗酸化食品)の創成、食の安全性担保とフードロス削減を目指す。
高温超伝導の発現機構と磁性の関わり-メスバウア分光

本研究の特徴は、YBa_2(Cu_<0.95>Fe_<0.05>)_3O_<7-8>を真空中300°Cで熱処理をすることにより、メスバウアスペクトルがどのように変化するかを調べたことにある。主な成果は以下の通りである。1.この系で第一に問題になるのは、Feの置換位置である。いろいろな測定結果を総合して、最近では、FeはCuを置換していると考えられている。しかし、4種類の四重極タブレットのいずれがCu1またはCu2位置のFeであるのかについては、実験の解釈に曖昧さが残っている。それは、4種類のタブレットが重畳していて、吸収線の位置の同定を正確に行うのが難しいからである。そこで本研究では、吸収線の位置の正確な同定をすることはさけて、真空中300°Cの熱処理前後でメスバウア吸収の絶対値を測定して、両者を比較する方法を選んだ。この熱処理によって、通称D-2と呼ばれるタブレットの強度が減少し、逆にD-1の強度が増加した。この熱処理では(1)Cu1位置のまわりの酸素のみが抜ける(2)Feは置換位置を変えない、ことを考慮すると、我々の実験結果から、D-1、D-2(全吸収の約70%)は共にCu1を、またD-3(2025%)はCu2を置換したFeによるものであることを疑問の余地なく結論づけることができる。プローブとしてのFeの置換位置が確定したことは、重要な成果である。2. Feをドープした試料では、低温で超伝導と磁性が共存する。両者が真の共存であるかどうかは、超伝導の発現機構と深く関わる重要課題である。我々は、上記の熱ょりによって磁気転移温度が変化しないことを見いだした。熱処理によるメスバウアスペクトルの変化から、Cu1のまわりの酸素が相当量減少していると考えられるにも拘らず、磁気転移点が変化しないという事実は、Cu2スピンのゆらぎが磁性に関与していることを示唆している。しかし現段階では、超伝導と磁性に同じCu2が関係しているかどうかは判定できなかった。
イスラーム世界における奴隷エリートの研究-マイノリティー・ネットワークの視座から

平成16年度には、近年イギリスで発見されたペルシア語史料『歴史の精華』第三巻の分析に取り組み、その史料価値について検討を行った。そして、その成果を「『歴史の精華』第三巻にみるサファヴィー朝の政治文化に関する予備的考察」『アジア・アフリカ言語文化研究』68,2004年,pp193-213として発表した。ここでは、史料の特徴として(1)家族関係に関する記述(2)王族に関する記述(3)行政・外交に関する記述(4)コーカサス情報の4点について得に優れた史料価値があることを明らかとした。さらに、この史料の最大の特徴であるコーカサス情報を利用してサファヴィー朝イランの対コーカサス政策について詳細に検討し、「シャー・アッバース一世の対カフカス政策-「異人」登用の実像」『史学雑誌』113編第9号,2004年,pp.1-37にまとめた。この論考では、「異人」をキーワードとして、サファヴィー朝宮廷における新要素としてのコーカサス系エリートが台頭する過程が、王朝の対コーカサス政策と結びついていたこと、その過程に新エリート自身が深く関与していたことを明らかとした。すなわち、王朝の対コーカサス政策は単なる辺境政策ではなく、中央宮廷内のパワーバランス再編を含んだ帝国権力の支配空間秩序の再編であったのである。この成果により、既存のイスラーム史の枠や国民史観を超えて、相互変容による「奴隷軍人」像の新たな理解を示すことができたと考えている。また、強制移住の問題をはじめ、従来扱われてこなかった領域についても今後の研究の基礎となる成果を得ることができた。このほか、スラブ研究センター冬季シンポジウム、日本スラブ東欧学会やロシア史研究会といったロシア・東欧研究の場で発表・コメントを行うことにより、中東研究の領域だけでなく、広くユーラシア世界全域を意識して研究の発展と成果の還元に努めた。本年度の研究実績の概容は、次のとおりである。イスラーム世界の奴隷エリートに関する研究を進める中で、特にキリスト教社会出身であるコーカサス出身奴隷について考察を進めた。とりわけ、グルジア出身有力4家系の出自についてまとめ、欧文で"On the Ethno-Social Background of Four Gholam Familiesfrom Georgia in Safavid Iran",Studia Iranica,32,Paris,2003,pp.243-278を発表した。また、資料調査もかねてドイツを訪問し、バンベルグ大学で学会発表"Shah's slave or Georgian noble? Unkonwn historyof the Georgian gholams",The 4th International Round-Table on Safavid Studies, University of Bamberg, (Bamberg, Germany)を行った。100名を越える研究者が参加したこの学会では、欧米とイランの多くの研究者と意見交換をする機会に恵まれた。9月にはグルジアを訪れ、現地調査も行った。その成果を踏まえて、10月には「奴隷軍の諸相:サファヴィー朝の場合」の題目で日本オリエント学会第45回年次大会(金沢大学)で研究報告を行った。現在、成果を原稿にまとめて投稿を準備している。この他、奴隷軍人と郷里との関係について研究をすすめ、そのアイデンティティーの問題をグルジア史と併せて論じた「グルジア・ナショナリズムの源流:17世紀叙事詩『テイムラズとルスタヴェリの対話』の意味すること」帯谷知可・林忠行編『スラブ・ユーラシア世界における国家とエスニシティII』JCAS Occasional Paper no.20、2003年11月、国立民族学博物館、pp.37-44を発表した。前近代と現代、歴史と文学、キリスト世界とイスラーム世界といった大きな問題について、今後につながる研究成果を提出できたと考えている。
非小細胞肺癌におけるEGFRを標的としたナノ粒子によるオートファジー誘導療法

本年度は、最も効率良くアポトーシス/オートファジーを誘導し、レセプター介在性に細胞質内に取り込まれるためのナノ粒子を作成するため、様々な素材・サイズのものを用いて検討した。これらの結果、最も効率のよいナノ粒子は、gold粒子を脂質二重膜であるリポソームで包み込み、これらを抗EGFR(epidermal growth factor receptor)抗体で修飾したものであった(直径50-70nm)。(1)アポトーシス/オートファジー誘導効果のスクリーニング上記のナノ粒子およびコントロールナノ粒子(抗EGFR抗体で修飾されていないナノ粒子)をEGFRの発現強度の異なる非小細胞肺癌細胞(HCC827・H1299・H520)に添加し、May-Giemsa染色にて形態学的変化およびanti-PARP抗体、anti-LC3抗体を用いたwestern blotにて、アポトーシス/オートファジー誘導の比率について検討した。EGFRの発現した細胞では細胞質内に空胞形成を認め、主にオートファジーが誘導されている事が確認されたが、EGFRの発現していないH520細胞ではこれらを認めなかった。(2)抗EGFR抗体で修飾したナノ粒子によるオートファジーレセプター介在性エンドサイトーシス誘導効果暗視野顕微鏡を用いて、ナノ粒子の細胞内への取り込みについて検討した所、EGFRの発現した細胞にてナノ粒子が細胞質内に検出されていたが、EGFRの発現していない細胞では、細胞質内にナノ粒子が検出されなかった。これらナノ粒子が細胞質内に取り込まれるのは、レセプター介在性エンドサイトーシスによるものと考えられ、現在、オートファジーとエンドサイトーシスの関連性について更なる検討中を行っている。本研究は、申請者がこれまで米国で行ってきた研究の延長であり、様々な国産ナノ粒子を作成し、非小細胞肺癌の診断・治療を目的とした研究を行ってきた。当初の予定通り研究を施行することが出来ている。24年度が最終年度であるため、記入しない。現在の研究では、120nmサイズのナノ粒子を用いて行っているが、申請者の米国での研究では50nmサイズのナノ粒子が最も効率よく、診断・治療を行えると考えている。その為、可能な限り、50nmサイズのナノ粒子を作成できるようにナノ粒子作成業者と連携を取っていく必要がある。
網膜におけるSモジュリン類似物質の作用

最近われわれは、カルシウム濃度依存的に視細胞の順応を制御している蛋白質S-モジュリンを発見した。ここの研究の途上、カエル網膜にはS-モジュリン類似物質であるs26が存在することに気づいた。本研究では、s26の構造と機能、網膜内局在について研究を行った。その結果、以下の事実が明らかになった。(1)s26のアミノ酸配列カエル網膜より抽出精製したs26から部分的なアミノ酸配列を決定し、PCR法によってs26の全アミノ酸配列を決定した。その結果、s26は同じカエル網膜にありながら、S-モジュリンに対してよりもビジニン(ニワトリの錐体特異的蛋白質)の方に高い相同性を有していることが明らかになった。(2)s26の網膜内での局在(1)で明らかになったs26のアミノ酸配列とS-モジュリンのそれとを比較し、両者で似ていないアミノ酸配列が存在する領域に対するペプチド抗体を作成し、免疫染色によってs26の網膜内での局在を調べた。予備的な実験の結果、s26は視細胞層で発現されていることが示唆されている。(3)s26の機能s26はS-モジュリンやビジニンと高い相同性を持つ。S-モジュリンがロドプシンのリン酸化を高カルシウム濃度で阻害することから、s26にも同様の作用があることが期待される。事実、s26はS-モジュリンと同様にロドプシンのリン酸化を阻害した。(4)他のS-モジュリン用蛋白質の機能の解析S-モジュリン様蛋白質は網膜だけでなく、脳においても発現されている。しかし、これら蛋白質の機能はどれ一つ明らかでない。そこでこれら蛋白質がロドプシンのリン酸化を阻害するか否かを調べたところ、調べた7種の蛋白質すべてがロドプシンのリン酸化を阻害した。その結果、これら蛋白質もそれぞれの組織においてリン酸化をカルシウム濃度依存的に調節して生理機能を果たしていることが強く示唆された。初年度の研究計画によれば、【.encircled1.】s26のアミノ酸配列の決定、【.encircled2.】s26の網膜内での局在、【.encircled3.】リカバリンにおけるS-モジュリン作用の検討、を明らかにすることを計画していた。このうち、【.encircled1.】と【.encircled3.】については研究が完了した。【.encircled2.】については引き続き研究を継続している。今年度明らかになった結果として、【.encircled1.】については、PCR法によって得たcDNAのクローンからs26のアミノ酸一次配列を決定した。s26は同じカエル網膜にありながら、S-モジュリンに対してよりもビジニン(ニワトリの錐体特異的蛋白質)の方に高い相同性を有していることが明らかになった。さらにs26はEFバンド構造を持つカルシウム結合蛋白質であることも結論できた。【.encircled2.】に関しては、現在、s26の部分アミノ酸配列にしたがって合成したペプチドを抗原として抗体を作成中である。残念ながらまだ抗体価が低く、実用に至っていないが免疫を継続しており、近日中に予定した実験を行えるものと考えている。最近の研究によるとビジニンは必ずしも錐体に局在はしておらず、桿体にも存在するといわれている。

ビジニンの機能も明らかになっていないが、s26はカエルにおけるビジニン相同物質であると考えられるので網膜内のどの細胞にも局在し、どのような機能を果たしているのかこれから明らかにしなければならないと考えている。【.encircled3.】に関しては、Stryer等によってS-モジュリンとは機能が異なる蛋白質として報告されたリカバリンが、S-モジュリンと同じようにロドブシンのリン酸化をカルシウム濃度依存的に阻害することを明らかにした。さらに、S-モジュリンとリカバリンとはアミノ酸の一次配列において80%以上の相同性を有することも明らかにした。これらの結果と、リカバリンがウシの桿体に存在するという報告から、リカバリンはウシS-モジュリンそのものであることを結論した。s26はカエル網膜におけるS-モジュリン類似物質である。本年度の研究では、s26の網膜での(1)局在と(2)機能について明らかにすることを目的とした。その結果、(1)s26の網膜内での局在については、既に昨年明らかにしたs26のアミノ酸配列をもとに、S-モジュリンのアミノ酸配列と比較し、両者で似ていない部位のアミノ酸配列を探し、その領域のペプチドを合成し、抗体を作成した。S-モジュリンに対する抗体はうまくできなかったが、s26に対しては反応性を有する抗体が得られた。しかし、抗体価があまり高くないのでアフィニティークロマトで精製し、免疫染色に供した。現在間だ実験を継続中であるが、予備的な実験の結果、s26は視細胞層で発現されていることが示唆されている。(2)s26の機能s26はS-モジュリンやビジニンと高い相同性を持つ。S-モジュリンがロドプシンのリン酸化を高カルシウム濃度で阻害することから、s26にも同様の作用があることが期待される。事実、s26は生理的なカルシウム濃度でS-モジュリンと同様にロドプシンのリン酸化を阻害した。(3)他のS-モジュリン用蛋白質の機能の解析本年度の研究では、さらに研究を進め、s26に加えて他のS-モジュリン様蛋白質の機能についても検討した。S-モジュリン様蛋白質は網膜だけでなく、脳においても発現されている。しかし、これら蛋白質の機能はどれ一つ明らかでない。そこでこれら蛋白質がロドプシンのリン酸化を阻害するか否かを調べたところ、調べた7種の蛋白質すべてがロドプシンのリン酸化を阻害した。その結果、これら蛋白質もそれぞれの組織においてリン酸化をカルシウム濃度依存的に調節して生理機能を果たしていることが強く示唆された。
関数解析学における関数空間と環の構造の研究

研究の主流となった作用素環,リ-環の研究と,微分方程式論および束論への応用についての実績を述べる。1.ヒルベルト空間上の射影作用素の作る束の上に定義された確率測度の線形拡張定理を一般化した,von Neumann環の射影元の作る束の上の確率測度の環全体への線形拡張の問題は,これまで何人かの研究者の論文で略証明出来たように見えていたが,これらの論文には若干の重大な誤りが含まれており,これらを正確かつ完全なものとしてまとめておく必要があったが,今回それに成功して数理物理学の雑誌にレビュ-論文として発表し,さらにこれに関連をもつ量子力学の論理の問題について詳しく検討を行った。2.単独線形偏微分方程式に対するC^∞カテゴリ-での非特性初期値問題を扱い,解の存在のための必要条件について深く考察し,方程式の係数の退化の度合いを用いて条件を表すことに成功した。またさらに問題を進めて,初期面を動かす場合を考察し,適用する方程式の枠も拡大してFuchs型方程式に対する初期値問題のような特性初期値問題にも拡張して結果を改良することが出来た。3.表現論についての研究として,KacーMoody環のユニタリ実形と呼ばれるもの,これは有限次元のLie環でいえばコンパクト実形に相当するものであるが,これには付随する群を,KacーMoody環の表現を利用して構成することに成功し,これについての詳しい解析を行った。4.束論に関する研究では,マトロイド束における劣加法的関数と,それに対応するマトロイドの構造を詳しく調べ,1つのマトロイドを作り出す劣加法的関数の数とマトロイド自身の性質との関係についての考察を行った。既に研究集会で講演発表をし,近く論文にまとめる予定である。
コモン・ロー思想の展開－わが国の判例法学への示唆－

本研究課題では、司法制度改革を受け、判例法の伝統を持つ英米の法思想から裁判官の役割について示唆を得ることができないか検討した。また、判例法に批判的なベンサムの法思想も検討している。英米の法思想の単著を2013年度に刊行し、2014年度にはベンサムに関する共編著を刊行した。論文は、立法の思想の分析、裁判をめぐる現代の英米の議論の検討、ベンサムの法思想を検討したものなど、計7本、執筆した。同様のテーマで、国際学会4回を含む、計8回の学会報告を行った。なお、コモン・ロー思想、ベンサムの法思想の第一人者のロバーン教授、ポステマ教授などを招聘し、2014年度と2015年度に同志社大でセミナーを開催した。平成25年度においては、論文1本、書評1本を公刊した。論文「英米の法思想とダイバーシティ」、瀬川晃他著『ダイバーシティ時代における法・政治システムの再検証』(成文堂)においては、平成25年に公刊した単著『近代英米法思想の展開ーホッブズ=クック論争からリアリズム法学までー』(ミネルヴァ書房)で検討した英米の法思想、コモン・ロー思想の研究を基礎としながら、当該論文が収録された共著のテーマである「ダイバーシティ」の観点から、イギリス、アメリカの法思想、コモン・ロー思想の特徴の比較を行った。英米の法思想、コモン・ロー思想の比較については、これまで、サマーズ・アティアの共著、ホーウィッツ、ポズナーなど、英米の著名な法学者、歴史家によっても検討されてきたが、それらの研究の問題点、さらには不十分な点を指摘しつつ、イギリス=法実証主義的、アメリカ=社会応答的という図式によってこそ、両者の比較が可能になるという枠組みの提示を試みた。書評「ジョン・フォーテスキュー著、直江眞一訳『自然法論』」(イギリス哲学研究37号)では、15世紀のイギリスの法律家で、イングランドのコモン・ロー思想、特にその政体論、国会主権論に影響を与えたジョン・フォーテスキューの『自然法論』の直江眞一教授の翻訳の書評を行った。フォーテスキューのその著書自体は、王位継承権に関わるものであったが、より広いイギリス法思想、コモン・ロー思想におけるその位置づけについても、若干の考察を行った。平成24年度においては、単著1冊、論文3本を公刊するとともに、国際学会と国内の学会で1回づつ報告した。単著『近代英米法思想の展開』(ミネルヴァ書房)では、進展が顕著である近年の英米の研究を参考に、17世紀のイギリスから20世紀前半のアメリカの法思想を包括的に検討するとともに、現代英米の法理論をコモン・ローのコンテクストにおいて捉え、「判例法」、あるいは「法」についての英米の考え方の違いを明らかにした。論文1「イングランドにおける法の支配に関する『法思想史的』考察」(イギリス哲学研究35号)では、わが国でも議論が盛んな「法の支配」に関して、イギリスの法思想の変遷を考察し、その法実証主義的な「法の支配」概念の特徴を明らかにした。平成23年に開催された国際功利主義学会でのペーパーを基にした、イタリアパレルモ大学の紀要に掲載された論文2`Bentham's Legal Theory and the Common Law Tradition' (Storia e Poltica, Vol.4-2)では、ベンサムとコモン・ロー伝統の連続性とともに、その間の違いについても検討した。論文3「コモン・ローのコンテクストとハート、ドゥオーキン」(同志社法学64巻3号)では、英米の判例法実務の違いも、現代英米法理論の性格の違いの背景の一つであることを論じている。学会報告に関しては、平成23年度に引き続き、国際功利主義学会(ニューヨーク大学)に参加し、ベンサムの法典化論についての報告をした。また、比較法学会(京都大学)においては、上記の単著のエッセンスを報告した。平成26年度においては、編著書一冊、その編著書に収録された論文二本を執筆した。また、日本法社会学会と、国際功利主義学会、日本法哲学会で、学会報告をし、書評も一本書いている。横浜国立大学の深貝保則氏と共編で、『ジェレミー・ベンサムの挑戦』というタイトルの著書を、研究成果公開促進費をいただき、2015年2月にナカニシヤ出版から公刊した。そのなかで、二本の論文を執筆している。「グローバリゼーションとベンサム」では、ベンサムの法典化論のグローバルな射程が持つ意義について検討した。また、「コモン・ロー的伝統とベンサムの法理論ー「裁判官の慣習」と「一般的慣習」の峻別によるコモン・ロー批判」では、コモン・ローを一般的慣習に基づくとしたコモン・ロイヤーたちの議論に対するベンサムの批判を検討することで、判例法主義一般の正統化論についても検討している。2014年5月には、法社会学会のミニシンポジウムで、「タマナハ教授の近代アメリカ法思想史研究とBalanced Realism」というテーマで報告し、タマナハ教授の近代アメリカ法思想史の研究について検討した。2014年8月には、横浜国立大学の国際功利主義学会にて、「Bentham's Pannomion and the Anglo-American Legal History」というタイトルで報告し、ベンサムの法典化論がコモン・ローの伝統からいくつかの影響を受けていたことと、その限界について考察した。

2014年11月には、法哲学会のワークショップで、「立法をめぐる近代イギリスの法思想ー19世紀を中心に」というタイトルで報告し、19世紀のアメリカも含め、立法とコモン・ローの関係を考察している。なお、『法制史研究64』に、小畑俊太郎『ベンサムとイングランド国制ー国家・教会・世論』の書評も執筆した。最終年度である平成27度には論文一本、分担執筆を一本、書評を二本、学会展望を一本執筆し、研究会の報告を二回、学会報告と学会での通訳をした。また、三月にはポステマ教授を招聘し、セミナーを開催した。『法の理論』34号には、「創る法と成る法」という特集の下、「立法をめぐる近代イギリスの法思想ー19世紀イギリスにおける『創る法』と『成る法』という論文を執筆し、イギリス法における判例法と制定法の関係、法をめぐる様々な思想を検討した。また、森村進編『法思想の水脈』(法律文化社)で、「『法』と法の支配ークックからダイシーまで」という章を担当し、近代イギリス法における法の支配の思想史を概観した。さらに、ツァイ教授の共編著、Bentham's Theory of Law and Public Opinion(Cambridge, 2014)と岡嵜修『レッセ・フェールとプラグマティズム法学』(成文堂、2013年)の書評を執筆するとともに、イギリス哲学会の機関誌『イギリス哲学研究』で、イギリス法思想史の学界展望を執筆した。学会報告等としては、国際法哲学社会哲学学会連合(IVR)の研究大会にて、イギリス法理学とコモン・ロー思想との関係を分析する報告をした。さらに、横浜国大の有江大介教授が主催する科研費補助金研究集会で、ベンサムに関する共編著について報告するとともに、ロンドン大学ベンサム・プロジェクトのベンサム・セミナーでも、ベンサムの法典化論の日本での受容という観点から報告した。この他に、関西学院大学の深尾祐造教授が、法制史学会にロバーン教授を招聘した際、マグナ・カルタについての報告原稿の翻訳やディスカッションの通訳などをしている。3月には、当初の予定通り、ノース・カロライナ大学のポステマ教授、コメンテーターとして、マカオ大学のツァイ教授を招聘し、ベンサムと法の支配に関するセミナーを開催した。本研究課題では、司法制度改革を受け、判例法の伝統を持つ英米の法思想から裁判官の役割について示唆を得ることができないか検討した。また、判例法に批判的なベンサムの法思想も検討している。英米の法思想の単著を2013年度に刊行し、2014年度にはベンサムに関する共編著を刊行した。論文は、立法の思想の分析、裁判をめぐる現代の英米の議論の検討、ベンサムの法思想を検討したものなど、計7本、執筆した。同様のテーマで、国際学会4回を含む、計8回の学会報告を行った。なお、コモン・ロー思想、ベンサムの法思想の第一人者のロバーン教授、ポステマ教授などを招聘し、2014年度と2015年度に同志社大でセミナーを開催した。本研究は、わが国における判例法の役割の増大の状況を念頭に置き、イギリスやアメリカの判例法主義の国において、判例法、コモン・ローの正統性がどのように論じられてきたか、その批判者であったベンサムも含めて考察するものである。さらに、わが国の判例法学への示唆についても検討することを試みている。
内耳性難聴に対する細胞移植と人工内耳の併用治療に関する基礎的研究

平成18年度には平成17年度に引き続いて、モルモットを用いて骨髄間葉系幹細胞を含む細胞群を培養し、ドナー細胞とした。これを移植した際にレシピエント組織と識別するために、前もって骨髄間葉系細胞群の細胞質に緑色蛍光蛋白質GFP、赤色蛍光蛋白mRFP1、mYFPを発現させた。次に、経中耳的に蝸牛開窓術を行い、内耳に蛍光蛋白で標識した自己の骨髄間葉系幹細胞を移植した。細胞移植後、蝸牛開窓部はモルモット自家軟骨を用いて閉鎖し、14日後にモルモットを断頭し内耳の組織標本を作製した。組織標本は蛍光顕微強鏡下に観察を行った。今回の実験系において蝸牛基底回転における鼓室階にmYFPを発現させる細胞が確認された。その他の部位には移植細胞を認めなかった。蛍光蛋白による新規の標識法として、GFPとほぼ同じ色として細胞に発現して、その後に、紫外線に数秒間曝すだけで赤色蛍光蛋白に変わる性質を持っている蛍光蛋白Eosを導入する方法がある。Eosを発現する細胞を移植した後に、ねらった場所に紫外線を局所的にあてられれば、その時期にその場所にある細胞だけを認識でき、細胞の動態を知ることが可能となる。実験動物の聴力障害の程度を評価する方法として、聴性脳幹反応(ABR)を安定して正確に記録するシステムを構築した。電磁波などの影響の少ない環境とするために、電磁シールドされた防音室において、動物、アイソレーター準備し測定した。音刺激(刺激音は20000Hzのtone burst)を与え、ABRを測定した。刺激音の周波数は20000Hzで刺激音圧は76.5dBSPLから36.5dBSPLまで変化させ、ABRを測定した。音圧の低下とともに1からIII波の波形が小さくなり、36.5dBSPLの刺激音圧ではIからIII消失していた。実験動物の取り扱いに関しては福島県立医科大学動物実験ガイドラインに沿って、愛護的に行った。本年度の研究はモルモットを用いて骨髄間葉系幹細胞を含む細胞群を内耳に移植する実験を行った。モルモットの骨髄を採取しシャーレで付着系細胞を選択的に培養することで骨髄間葉系幹細胞を含む細胞群を得た。これらの細胞群をドナー細胞として移植した際にレシピエント組織と識別するために、遺伝子導入の方法を用いて蛍光蛋白を発現できる細胞群を作製した。これらの細胞群は、骨髄間葉系幹細胞を含む細胞群の細胞質にクラゲ及びディスクコーラル由来蛍光蛋白質であるGFP遺伝子ファミリー、mRFP1、mHcRed遺伝子を組み換えレトロウイルスベクター用プラスミドDNAをレトロウイルスパッケージング細胞Pheonix-Amphoに導入し、非増殖型組み換えレトロウイルスを作製した。さらに組み替えレンチウイルスベクター用プラスミドをウイルス粒子パッケージングベクターpCMV-VSV-G-RSV-Revとともに293T細胞に導入し、非増殖型組み換え体レンチウイルスを作製した。作製されたウイルスを感染させることにより遺伝子導入を行い、蛍光蛋白mRFP1、mYFPを発現させる骨髄間葉系肝細胞を含む細胞群とした。モルモットを用いて経外耳道経由で鼓膜切開を行い、蝸牛を開窓し、開窓部から蛍光蛋白で標識した自己の骨髄間葉系幹細胞を移植した。細胞移植後、蝸牛開窓部はモルモット自家軟骨を用いて閉鎖し、細胞移植後14日後にモルモットを断頭し内耳の組織標本を作製した。組織標本は蛍光顕微鏡下に観察を行った。
関節リウマチ滑膜線維芽細胞における炎症メディエーター産生エピゲノム機構の解明

本研究は、関節リウマチ(RA)滑膜線維芽細胞のエピゲノム修飾を詳細に解明し、特異的な治療法の基盤を構築することを目的とする。これまでに得られた各刺激条件のトランスクリプトーム、オープンクロマチン情報、遺伝子多型を組み合わせ基礎検討解析を行った。まず、刺激滑膜線維芽細胞で主要な炎症メディエーター遺伝子領域のオープンクロマチン配列間に結合する転写因子をHOMERなどのアルゴリズムで同定し、複数の炎症メディエーター遺伝子領域で共通する転写因子に絞り込み、転写因子複合体を推測した。その結果、RUNX1および上皮間葉転換の転写因子SNAI1, SNAI2、さらに転写因子Xを同定した。またRA感受性多型と、末梢血リンパ球と刺激滑膜線維芽細胞のオープンクロマチンとの一致のマップを作成し、RUNX1、CD40、および転写因子X近傍のRA感受性多型が刺激滑膜線維芽細胞上で一致することを見出し、これらの多型の滑膜線維芽細胞における機能がRAにおいて重要であることが示唆された。RUNX1、CD40、および転写因子X近傍の感受性多型はそれぞれ、RUNX1, CD40,転写因子Xの遺伝子発現量に対する有意な量的形質遺伝子座(eQTL)効果を示した。IFN-gammaとCD40Lで刺激した滑膜線維芽細胞は大量のIL-6を発現し、滑膜炎症へのCD40の寄与が強く推測された。サイトカイン刺激滑膜線維芽細胞に、RUNX1,転写因子X, SNAI1, SNAI2のsiRNA投与を行うと、IL-6などのサイトカインやケモカインの発現量が有意に低下し、RUNX1,転写因子X, SNAI1, SNAI2が炎症メディエーター産生に関わる転写因子複合体を形成することが強く示唆された。本研究により、RAの遺伝的素因と関連する炎症メディエーター産生に関わる転写因子複合体のコンポーネントを明らかにすることができた。遺伝子領域のオープンクロマチン配列間に結合する転写因子をHOMERなどのアルゴリズムで同定し、複数の炎症メディエーター遺伝子領域で共通する転写因子に絞り込み、転写因子複合体を推測した。推測した転写因子に複数の、RA感受性多型によるeQTL効果を受けるものが含まれ、試験管内の実験で炎症メディエーター発現への関与を証明することができた。またRA感受性多型と、末梢血リンパ球と刺激滑膜線維芽細胞のオープンクロマチンとの一致のマップを作成したことも、大きな成果といえる。研究1年目にRAの遺伝的素因と関連する、炎症メディエーター産生に関わる転写因子複合体のコンポーネントを明らかにすることができたことは順調な進捗といえる。またCD40近傍のRA感受性多型がCD40にeQTL効果を発揮し、IFN-gammaとCD40Lで刺激した滑膜線維芽細胞が大量のIL-6を発現したという知見は、滑膜炎症へのCD40の深い関与を示すものである。従来滑膜線維芽細胞のIL-6産生はTNF-alphaによる刺激が主体と考えられていたが、T細胞からのIFN-gammaとCD40LもIL-6産生を誘導し、この経路がRAにおいて遺伝的に重要であることが明らかとなったことは進捗といえる。RUNX1および上皮間葉転換の転写因子SNAI1, SNAI2、さらに転写因子Xの機能について、ChIP-seq,ウェスタンブロット、ノックアウトマウスによって検証する。特に転写因子Xについては、滑膜線維芽細胞株にビオチン化遺伝子をノックインすることにより、ストレプトアビジンで高効率に転写因子X領域の配列を回収し、結合蛋白を質量分析で同定する実験を行う。またアメリカのAccelerating Medicine Partnership(AMP)コンソーシアムから、滑膜線維芽細胞のシングルセルRNAシークエンスのデータが公開されており(https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2018/06/20/351130.full.pdf )、このデータも用いてこれらの転写因子の機能を解析する。AMPコンソーシアムのデータと我々のデータを統合して解析すると、IL-6産生能の高い滑膜線維芽細胞はTNF-alphaとIFN-gammaの影響を強く受けていると考えられ、特にこれらの刺激に注目して解析を行う。TNF-alphaとIFN-gammaを組み合わせた場合に、滑膜線維芽細胞のオープンクロマチンにどのような修飾が加わるのかを、ATAC-seqにより解析する。これらの解析により、RAの病態解明が大きく進み、新規治療法開発の基盤となることが期待される。またRA感受性多型と、末梢血リンパ球と刺激滑膜線維芽細胞のオープンクロマチンとの一致のマップを作成し、RUNX1、CD40、および転写因子X近傍のRA感受性多型が刺激滑膜線維芽細胞上で一致することを見出し、これらの多型の滑膜線維芽

細胞における機能がRAにおいて重要であることが示唆された。RUNX1、CD40、および転写因子X近傍の感受性多型はそれぞれ、RUNX1, CD40,転写因子Xの遺伝子発現量に対する有意な量的形質遺伝子座(eQTL)効果を示した。IFN-gammaとCD40Lで刺激した滑膜線維芽細胞は大量のIL-6を発現し、滑膜炎症へのCD40の寄与が強く推測された。サイトカイン刺激滑膜線維芽細胞に、RUNX1,転写因子X, SNAI1, SNAI2のsiRNA投与を行うと、IL-6などのサイトカインやケモカインの発現量が有意に低下し、RUNX1,転写因子X, SNAI1, SNAI2が炎症メディエーター産生に関わる転写因子複合体を形成することが強く示唆された。本研究により、RAの遺伝的素因と関連する炎症メディエーター産生に関わる転写因子複合体のコンポーネントを明らかにすることができた。遺伝子領域のオープンクロマチン配列間に結合する転写因子をHOMERなどのアルゴリズムで同定し、複数の炎症メディエーター遺伝子領域で共通する転写因子に絞り込み、転写因子複合体を推測した。推測した転写因子に複数の、RA感受性多型によるeQTL効果を受けるものが含まれ、試験管内の実験で炎症メディエーター発現への関与を証明することができた。またRA感受性多型と、末梢血リンパ球と刺激滑膜線維芽細胞のオープンクロマチンとの一致のマップを作成したことも、大きな成果といえる。研究1年目にRAの遺伝的素因と関連する、炎症メディエーター産生に関わる転写因子複合体のコンポーネントを明らかにすることができたことは順調な進捗といえる。またCD40近傍のRA感受性多型がCD40にeQTL効果を発揮し、IFN-gammaとCD40Lで刺激した滑膜線維芽細胞が大量のIL-6を発現したという知見は、滑膜炎症へのCD40の深い関与を示すものである。従来滑膜線維芽細胞のIL-6産生はTNF-alphaによる刺激が主体と考えられていたが、T細胞からのIFN-gammaとCD40LもIL-6産生を誘導し、この経路がRAにおいて遺伝的に重要であることが明らかとなったことは進捗といえる。RUNX1および上皮間葉転換の転写因子SNAI1, SNAI2、さらに転写因子Xの機能について、ChIP-seq,ウェスタンブロット、ノックアウトマウスによって検証する。特に転写因子Xについては、滑膜線維芽細胞株にビオチン化遺伝子をノックインすることにより、ストレプトアビジンで高効率に転写因子X領域の配列を回収し、結合蛋白を質量分析で同定する実験を行う。またアメリカのAccelerating Medicine Partnership(AMP)コンソーシアムから、滑膜線維
多様な無脊椎動物の比較解析基盤としての比較ゲノムデータベース構築

10の動物門に含まれる314種の動物ゲノムについて、遺伝子機能のスペクトル(ゲノムスペクトル)を、門、綱、目、科、属の各系統分類において調べ、共通遺伝子を整理することでプロテオームデータと統計量の整備を進めた。全生物系統に共通して存在する遺伝子は1,908で、ほぼ全てが基本生命維持機能のコア遺伝子群でり、系統固有の遺伝子も系統分類ごとに同定した。また、動物系統のみに共通して存在する1,299の遺伝子群を特定した。その多くはミトコンドリアに関係する遺伝子であり動物固有の機構の存在を示唆した。ほかに脊椎動物系統のみ不在の遺伝子など、生物進化過程を解明する重要な手掛かりが得られた。多種生物にまたがる比較ゲノム・オミックス統合データベースの開発をめざし、過去にバイオインフォマティクス推進事業の支援を得て構築したホヤ統合プロテインデータベースCIPROのデータ解析スキームを飛躍的に発展させるため、基礎となる解析対象生物種の選定に着手した。特に、沖縄科学技術大学院大学の佐藤矩行教授との連携のために研究打ち合わせを行い、今後、彼らの研究グループが目指す、すべての動物門から1種ずつ以上のゲノム配列決定およびその公開にあわせ、生物種間の比較系統解析、および解析の先行するモデル生物の実験情報・アノテーション情報の連携化を行うため、配列比較解析に着手した。具体的には、これまでゲノム解析のモデル生物として使われてきた生物種群から大幅に離れた生物種のサンゴAcropora digitifera、真珠貝Pinctada fucataのゲノム配列の比較解析を行った。脊索動物との分岐は、6億年前のカンブリア爆発の頃よりも前と想定されるこれらの生物との比較解析に際しては、低い配列類似性のみならず、ゲノム中に含まれる遺伝子の大幅な重複や欠失が見られるために、相同遺伝子の定義自体に多くの課題があることが明らかとなった。加えて遺伝子予測の精度にも大きな課題が残っており、解読ゲノム配列の信頼性の指標も存在しないため、生物間比較において共通性と種特異性を明確に定義することができないことが明らかになった。そこで繰り返しの比較・予測・アノテーション処理によって漸近的に真の姿に近づくことをめざすこととした。多種生物にまたがる比較オミックス統合データベースの開発を目指し、過去にバイオインフォマティクス推進事業の支援を得て構築したホヤ統合プロテインデータベースCIPROのデータ解析スキームを飛躍的に発展させるため、公共データバンクにて公開されている314種の動物ゲノムデータをベースとして系統準備を行い、全動物門を横断する形にプロテオームデータの整備を進めた。また、入手したゲノムデータのいくつかについて機能モチーフ探索および遺伝子オントロジーに基づいてカテゴリ分類および標準化を行い、生物種毎の遺伝子スペクトル作成を行った。この結果、生物種固有の遺伝子群の偏りを見ることができたものの個別事例の例示にとどまることが懸念される。そこで、生物系統の進化に結びつくような一般則を見いだすことを目指して、方向転換を図り、全てのゲノムデータを再処理し,遺伝子機能スペクトルの作成を目指すこととした。まず、314種から得られた全9,114,517タンパク質配列を精査したところ、1,608,556が重複配列であることが判明したため、これらがどのように機能アノテーションされているかを確認した。その結果、ゲノム解読プロジェクト毎に命名方法や質に大きな差があり、同一配列の遺伝子であっても多様な名前を持つことが明らかになった。一般には、配列類似性に基づいて機能推定することが多く、本課題でもその方向を目指していたが、基盤となる機能アノテーション辞書の品質に課題があるため、収拾がつかなくなることが判明した。そこで期間内に目標に到達できるようにするため、辞書の整備を優先することにした。なお、同一配列の遺伝子辞書は下記に公開した。http://phylomix.ibio.jp/web/spectra/level/identical_seqゲノム・プロテオームデータはNCBI,EBI,UCSCの3カ所に蓄積されているが、配列データとしてはNCBIが大半をカバーし、EBIがアノテーションの多くをカバーしているものの、動物門レベルの生物系統の整備はなされておらず比較解析を難しくしていたため、この点の整備を中心に順調に進めた。これと独立に純粋に計算量を要求する遺伝子スペクトルデータ取得について、セマフォの導入による計算資源効率化活用方法を確立し、膨大なゲノムデータを従来の1/3程度の時間で処理できるようにすることができた。多種生物にまたがる比較オミックス統合データベースの開発を目指し、過去にバイオインフォマティクス推進事業の支援を得て構築したホヤ統合プロテインデータベースCIPROのデータ解析スキームを飛躍的に発展させるため、公共データバンクにて公開されている314種の動物ゲノムデータを中心に系統を行い、全動物門を横断する形にプロテオームデータの整備を進めた。前年まではアノテーション名の比較に基づいた遺伝子分類を行ってきたが、アノテーションに問題があることが判明したため、参照データベースとして最もアノテーション信頼性が高いとされるSwissProtを対象とする相同性再解析を行い、全対象生物ゲノムについて遺伝子スペクトラムの構築を進めた。各生物の持つ遺伝子は1万6千4万程度であるが、すべてを網羅する遺伝子数は8万程度となった。入手したゲノムデータのいくつかについて機能モチーフ探索および遺伝子オントロジーに基づいてカテゴリ分類および標準化を行い、生物種毎の遺伝子スペクトル作成を行った。系統固有の遺伝子は期待したよりは少なく、同一系統内の異種間での差異が大きい傾向が見られた。

この膨大な結果をデータベースとして公開するほか、より全体像を俯瞰できる形に集約を進め、生物のもつ遺伝子スペクトラムの系統間共通性と特異性をより明確に浮き彫りにすることを目指し、引き続き、遺伝子スペクトラムに基づいて生物特性を表現する新しい方法を確立することを目指したいと考えている。ゲノム・プロテオームデータはNCBI,EBI,UCSCの3カ所に蓄積されているが、配列データとしてはNCBIが大半をカバーし、EBIがアノテーションの多くをカバーしているものの、動物門レベルの生物系統の整備はなされておらず比較解析を難しくしている。またアノテーションの精度にはゲノムプロジェクトごとにばらつきがある。このため、いったん既存アノテーションに頼ることをやめ、独自の基準でアノテーション作成と種をまたがる遺伝子分類を進めた。今年度、学内のサーバセキュリティ対策要請が大幅に強化され、強制的に短期間対応を求められたため、当初の計画が一時中断してしまい、予定よりやや遅れることになった。10の動物門に含まれる314種の動物ゲノムについて、遺伝子機能のスペクトル(ゲノムスペクトル)を、門、綱、目、科、属の各系統分類において調べ、共通遺伝子を整理することでプロテオームデータと統計量の整備を進めた。全生物系統に共通して存在する遺伝子は1,908で、ほぼ全てが基本生命維持機能のコア遺伝子群でり、系統固有の遺伝子も系統分類ごとに同定した。また、動物系統のみに共通して存在する1,299の遺伝子群を特定した。その多くはミトコンドリアに関係する遺伝子であり動物固有の機構の存在を示唆した。ほかに脊椎動物系統のみ不在の遺伝子など、生物進化過程を解明する重要な手掛かりが得られた。多種生物にまたがる比較オミックス統合データベースの開発を目指し、過去にバイオインフォマティクス推進事業の支援を得て構築したホヤ統合プロテインデータベースCIPROのデータ解析スキームを飛躍的に発展させるため、公共データバンクにて公開されている314種の動物ゲノムデータをベースとして系統準備を行い、ゲノム決定された種を含む全動物門を横断する形にプロテオームデータの整備を進めた。生物ゲノムに含まれる遺伝子セットをゲノムスペクトルとし、真核生物について門、綱、目、科、属の各系統分類において、共通に存在する遺伝子群を整理した(http://phylomix.ibio.jp/web/)。これに先立ち、生物種名から系統・一般名(英語・日本語)・形態を把握できるようにするための辞書を整備、それぞれが持つ遺伝子統計量を一覧化した(http://phylomix.ibio.jp/web/genome_master/tab/2)。また、同一配列を持つ遺伝子群のリストを整備した(http://phylomix.ibio.jp/web/spectra/level/identical_seq)。全生物系統に共通して存在する遺伝子は1,908で、ほぼ全てが基本生命維持機能のコア遺伝子群であった。系統固有の遺伝子は系統分類群ごとに同定された。また、植物には見られず、動物系統のみに共通して存在する1,299の遺伝子群を特定した。