hpprc/llmjp-kaken huggingface dataset:
医療データマイニングにおけるユーザインタラクション支援システムの開発

本研究は,医療データマイニングにおける効率的なルール評価作業の支援システムを開発することを目的としている.本年度は,先行研究で得られた髄膜炎および慢性肝炎に関するデータマイニング結果とそれらに対する医師の評価を従来から提案されている客観的指標群を用いてデータを利用し,ルール評価モデルを構築する学習アルゴリズムについてメタ学習アルゴリズムを含めた性能評価を行った.この結果,髄膜炎データマイニング結果とその評価について,再代入評価およびLeave-One-Outによって示した.さらに,ルール評価モデル構築が一般のデータからのルールにも有効であることを示すため,UCI MLリポジトリの共通データからルールを生成し,ルール評価モデルの評価実験を行った.この結果をMDAI2006に投稿し,査読過程において興味深さの推定を客観的指標群によってモデル化する点が特徴的であるとの評価を得て,発表した.会議では,従来から行われてきた正解率や再現率などによる単一の客観的指標を用いたルール選択手法と比較して,本手法が複数の指標の合成関数として主観的な興味深さを推定する手法である点に関心とコメントが寄せられた.UCI MLリポジトリのデータを用いた実験を拡張し,結果をPAKDD2006に投稿し,データマイニングの後処理におけるルール評価支援手法としての評価を得て,本会議において発表するに至った.また,客観的指標群の組み合わせであるルール評価モデルの内容について統計的視点からモデルを構成する指標について評価を行った結果をRSKT2006において発表を行った.この評価について,さらに詳細な検討を加えた結果をRSCTC2006において発表した.さらに,ルール評価モデルを学習するアルゴリズムを選定し,ルール評価支援の精度を高めるために構成的メタ学習機構を導入した評価実験の結果をPAKW2006において発表した.本研究は,医療データマイニングにおける効率的なルール評価作業の支援システムを開発することを目的としている.研究初年度である本年度は,開発用ワークステーションを導入し,先行研究で得られた髄膜炎および慢性肝炎に関するデータマイニング結果とそれらに対する医師の評価を従来から提案されている客観的指標群を用いてデータ化し,ルール評価モデルを構築する学習アルゴリズムの基本的な性能評価を行った.この結果,髄膜炎データマイニング結果とその評価について,ルール評価モデルを構築する学習アルゴリズムがルール評価支援に有効であることを再代入評価およびLeave-One-Outによって示した.この結果をHIS2005に投稿し,査読過程において専門家の主観的評価と客観的な指標による評価を融合する手法であるとの評価を得て,発表した.会議では,従来から行われてきた正解率や再現率などによる単一の客観的指標を用いたルール選択手法と比較して,適応的かつ支援効率の高い手法である点に関心とコメントが寄せられた.さらに,ルール評価モデル構築が一般のデータからのルールにも有効であることを示すため,UCI MLリポジトリの共通データからルールを生成し,同様にルール評価モデルの評価を行った.これらの結果をICDM-2005に投稿し,データマイニングの後処理におけるルール評価支援手法としての評価を得て,本会議において発表するに至った.慢性肝炎に関するデータマイニング結果とその評価のデータについては,複数回にわたって行われた評価作業における医師の興味・関心の推移について,ルール評価モデルの性能および内容の変化から考察し,第72回人工知能学会KBS研究会・電子情報通信学会KBSE研究会合同研究会において発表を行った.本研究は,医療データマイニングにおける効率的なルール評価作業の支援システムを開発することを目的としている.本年度は,先行研究で得られた髄膜炎および慢性肝炎に関するデータマイニング結果とそれらに対する医師の評価を従来から提案されている客観的指標群を用いてデータを利用し,ルール評価モデルを構築する学習アルゴリズムについてメタ学習アルゴリズムを含めた性能評価を行った.この結果,髄膜炎データマイニング結果とその評価について,再代入評価およびLeave-One-Outによって示した.さらに,ルール評価モデル構築が一般のデータからのルールにも有効であることを示すため,UCI MLリポジトリの共通データからルールを生成し,ルール評価モデルの評価実験を行った.この結果をMDAI2006に投稿し,査読過程において興味深さの推定を客観的指標群によってモデル化する点が特徴的であるとの評価を得て,発表した.会議では,従来から行われてきた正解率や再現率などによる単一の客観的指標を用いたルール選択手法と比較して,本手法が複数の指標の合成関数として主観的な興味深さを推定する手法である点に関心とコメントが寄せられた.UCI MLリポジトリのデータを用いた実験を拡張し,結果をPAKDD2006に投稿し,データマイニングの後処理におけるルール評価支援手法としての評価を得て,本会議において発表するに至った.また,客観的指標群の組み合わせであるルール評価モデルの内容について統計的視点からモデルを構成する指標について評価を行った結果をRSKT2006において発表を行った.この評価について,さらに詳細な検討を加えた結果をRSCTC2006において発表した.さらに,ルール評価モデルを学習するアルゴリズムを選定し,ルール評価支援の精度を高めるために構成的メタ学習機構を導入した評価実験の結果をPAKW2006において発表した.
野生ニホンザル集団におけるコンタクトコールの使い分けとその学習に関する発達研究

ヒト以外の霊長類において、多様な個体と関係を築き、保つ必要性は、音声コミュニケーションの能力にどのような影響を与えたのか。ニホンザルは毛づくろいなどの社会交渉を行う際に、敵意を持たないことを相手に伝える音声を用いることがある。集団内でも普段あまり関わらない相手や、ケンカの後といった緊張が高まっている状況においてこの音声を用いると、相手と円滑に社会交渉を行うことができると考えられる。1.ニホンザルは相手の属性や状態に応じて音声の用い方を調整するのか、そして、2.このような効果的な音声の用い方は、発達に伴い習得されるのかを明らかにすることが本研究の目的であった。本年度は嵐山ニホンザル群(京都市)を対象として前年度までに収集した行動・音声データを解析し、主に目的2に関する検討を行った。オトナは普段はあまり関わらない非血縁メスに接近する際には音声を用いることが多いが、年齢の低いメスでは相手との血縁関係によって音声を用いた割合に違いは見られなかった。つまり、効果的な音声の用い方は年齢段階が高くなるとともに、習得されていた。このような音声の用い方は、社会的な経験によって習得されるのかを検討した。その結果、オトナメスと関わる頻度が高かったワカモノメスは、その翌年に音声を用いた割合が高くなっていた。一連の結果から、ニホンザルは相手との関係に応じて音声を用いること、このような音声の用い方は、他個体と関わった経験により修正されることが示唆された。27年度が最終年度であるため、記入しない。ニホンザルは毛づくろいなどの社会交渉を行う際に、親和的な意図を相手に伝達する音声を用いることがある。同じ集団内でも普段あまり交渉を行わない相手や、同じ相手でも不安状態が高まっている場合にこの音声を発すると、相手と円滑に社会交渉を行うことができると考えられる。1.ニホンザルはどれほど相手の属性や状態に応じて音声を用いているか、そして、2.このような効果的な音声の用い方は、発達に伴い習得されるのかを明らかにすることが本研究の目的である。本年度は2014年3月までに90日間の野外観察を嵐山ニホンザル群(京都市)を対象に行い、計260時間の行動データを収集した。得られたデータをコーディングし、目的1に関する分析を行った。その結果、ニホンザルは直前に敵対的交渉を行っていた場合には、敵対的交渉の当事者や敵対的交渉に参加していなかった相手に対して、音声を用いる割合が変化していた。つまり、自分や相手の不安状態が音声の用い方に影響する可能性が示唆された。目的2については、アカンボウからオトナまでのメスを対象にした分析を行った。オトナは普段交渉の少ない非血縁メスに接近する際には音声を用いることが多いが、年齢の低いメスでは相手との血縁関係によって音声を用いた割合に違いは見られなかった。つまり、年齢の低いメスは効果的な音声使用を行っているわけではなかった。これらの結果から、ニホンザルの音声使用には、相手の状態に応じた制御や可塑性が存在することが示唆された。ヒトのコミュニケーションの進化を探る上で、ヒトと系統的に近い生物種の音声コミュニケーション能力を検討することは有用である。本研究ではニホンザルが親和的な交渉を始める際に用いる音声に着目した。この音声が、1.どのような機能を持っているか、相手との関係や状態に応じて音声をどれほど柔軟に用いているのか、そして、2.このような効果的な音声の用い方は、発達に伴い習得されるのかを明らかにすることが本研究の目的である。本年度は嵐山ニホンザル群(京都市)を対象に野外での観察を行い、182時間の行動データを収集した。得られたデータをコーディングし、目的1の音声の機能に関する検討を行った。その結果、この音声を用いた後には敵対的な交渉を行いにくいことから、この音声は発声者に敵意がないことを相手に示す役割があることが示された。次に、相手の状態に応じて音声を用いているのかを検討した。ニホンザルは親和的な交渉を始める際に、相手が直前に敵対的な交渉を行っていた場合や、普段は関わりの少ない相手である場合に、音声を用いる割合が高くなっていた。つまり、相手にとって自身の行動が予測しにくい場合には、音声を頻繁に用いることを示している。これらの結果から、ニホンザルは音声行動を相手の状態に応じて調整する可能性が示唆された。相手との関係や状態に応じてこの音声を用い、敵意がないことを示すことで、社会交渉を円滑に行い、親和的な社会関係を維持していると考えられる。

オトナは普段はあまり関わらない非血縁メスに接近する際には音声を用いることが多いが、年齢の低いメスでは相手との血縁関係によって音声を用いた割合に違いは見られなかった。つまり、効果的な音声の用い方は年齢段階が高くなるとともに、習得されていた。このような音声の用い方は、社会的な経験によって習得されるのかを検討した。その結果、オトナメスと関わる頻度が高かったワカモノメスは、その翌年に音声を用いた割合が高くなっていた。一連の結果から、ニホンザルは相手との関係に応じて音声を用いること、このような音声の用い方は、他個体と関わった経験により修正されることが示唆された。予定していた観察データの収集が完了した。また、音声行動の発達に関する研究論文が受理され、音声コミュニケーションのメカニズムに関する研究に関しても現在投稿中であるため。27年度が最終年度であるため、記入しない。今後も計画通りにデータ入力と分析を行う。目的1に関して、相手の状態に応じた音声使用に関する検討を行う。目的2に関して音声行動の発達に及ぼす要因について検討を行う。当初予定していた観察データのほとんどが収集でき、解析を行うことができたため。また、これまでの成果に関する論文も投稿し、現在改稿が進んでいるため。大阪大学人間科学部比較行動学研究分野HP今後も計画通りに嵐山集団においてデータを収集する。目的1については音響解析を行い、目的2については、音声行動の個体内での経年変化に関する分析を行う。得られた結果は学会等で発表する予定である。
革新的治療法開発を目指した腸内細菌叢とサルコペニアの網羅的解析

本研究の目的は、消化器癌切除・再建術後のmicrobiomeの変化を網羅的に解析し、体重減少に影響を及ぼすmicrobiomeを同定することである。食道癌・胃癌に対して切除・再建術を行う患者50例の手術前及び後の糞便からDNAを抽出し、16S rRNAシークエンスによりmicrobiomeの変化を網羅的に評価する予定であり、現在施設倫理委員会の審査を経て、サンプル収集を開始している。術前、及び術後一年での糞便を検体として使用する予定であり、現在までに約30例の糞便サンプルの収集を行っており、順次16S rRNAシーケンスに提出している。海外共同研究者であるDana-Farber Cancer InsituteのDr. Shuji Oginoとも適宜連絡を取っており、今後の解析の際には協力を得られる体制である。また、栄養状態を評価するために、Prognostic Nutritional Index: PNIのデータベースを構築しており、そのデータベースを用いて、術前の栄養状態と腫瘍免疫の関連を明らかにした。全身栄養状態(PNI)が腫瘍局所免疫に影響を与え、予後にも影響を与えるという結果を、Ann Surg誌に投稿し採択された。本研究では、食道癌・胃癌に対して切除・再建術を行う患者50例の手術前及び後の糞便からDNAを抽出し、16S rRNAシークエンスによりmicrobiomeの変化を網羅的に評価する予定である。現在施設倫理委員会の審査を経て、サンプル収集を開始している。このように、研究はおおむね順調に進捗している。今後は、16S rRNAシーケンスに提出しているデータを随時網羅的に解析していく予定である。海外共同研究者であるDana-Farber Cancer InstituteのDr. Shuji Oginoとも適宜連絡を取っており、今後の解析の際には協力を得られる体制をとっており、順調に解析が進むと考えている。また、栄養状態を評価するために、Prognostic Nutritional Index: PNIなどを含むデータベースを構築しており、そのデータベースを用いて、統合解析を行っていく予定としている。理由:医局内保管の試薬・消耗品を使用することができたため。使用計画:主に実験試薬、消耗品の購入に充てたいと考える。また、研究成果発表および情報収集のための旅費、実験データの管理、資料整理等のため事務補佐員の雇用経費にも充てたいと考える。
HSP47のプロコラーゲンに対するシャペロン機能の分子基盤

本研究では、プロコラーゲン特異的分子シャペロンHSP47の分子機能を明らかにする目的で、コラーゲンモデルペプチドとHSP47との相互作用をin vitroで解析した。1.HSP47のオリゴマー構造についてリコンビナントHSP47を基質となるコラーゲンモデルペプチドの存在下および非存在下においてグルタルアルデヒド処理することにより、そのオリゴマー形成を検討した。しかし、これまでにHSP47が多量体を形成していることを積極的に支持するデータは得られていない。2.ホモおよびヘテロ3量体型コラーゲンモデルペプチドの合成とそのHSP47結合性HSP47結合配列であるPro-Arg-Glyをトリプルヘリックス当たり03個含む4種の3量体型コラーゲンモデルペプチドを合成した。3量体化には位置選択的ジスルフィド結合形成反応を利用した。合成したホモおよびヘテロ3本鎖とHSP47との結合実験の結果から、トリプルヘリックス上の1つのアルギニン残基がHSP47との特異的な結合に十分な構造情報を有していることが明らかになった。3.HSP47上のコラーゲン結合部位の同定光反応性活性基をもつ4-benzoylphenylalanineを導入したコラーゲンモデルペプチドを用いて、HSP47との光架橋を行った。これまでに、最適架橋条件が決定され、また、架橋体の精製にも成功している。精製した架橋体の酵素による断片化および断片の配列解析によるHSP47の基質結合部位の同定は今後の課題である。
運動制御・運動記憶における大脳ー小脳動的連関の解明とその操作

・大脳ー小脳間の機能的結合の同定前年度に引き続き、光遺伝学を用いた大脳ー小脳間の機能的結合の解析を行った。小脳皮質の様々な部位のプルキンエ細胞からスパイク記録を行いながら、大脳皮質をレーザーで刺激し、大脳と小脳の間の機能的結合マップを作成した。大脳からの入力は、小脳小葉ごとに、主に感覚野、運動野、連合野などから特異的な入力を受け取っている一方で、一部の小葉では、広い範囲から様々な情報を受け取っていることが明らかとなった。また、大部分の小葉で対側の大脳皮質から入力を受けていたものの、一部の小葉では両側性に入力があることが明らかとなった。特に、小脳半球の第二脚では両側の高次運動野から一次運動野にかけてほぼ同程度の入力を受けていた。その詳細を細胞ごとに解析したところ、主に対側から入力を受ける細胞と同側から入力を受ける細胞に分かれることがわかった。すなわち、各細胞が両側から均一に同じような入力を受け取っているわけではなく、細胞ごとに同側・対側特異的に入力を受けていた。さらに、同側からの入力によるスパイクは、対側入力によるスパイクに比べて潜時が短いことが明らかとなったことから、異なる経路を介して入力していることが予想された。・課題実行中のマウス小脳における情報表現前年度までに、音弁別課題を実行中のマウス小脳において運動および認知機能に関わる小脳モジュールを同定していたが、今年度は特に運動課題に絞って解析を行った。レバー引き運動課題を実行中の小脳皮質登上線維応答を2光子イメージングにより解析したところ、レバー引き直前の登上線維応答の増加と、レバー引き直後の登上線維応答の抑制が観察された。この結果を小脳の制御モデルに当てはめると、レバー引き前の登上線維入力はフィードバック運動指令を、レバー引き後の登上線維抑制は、報酬獲得中または随意運動中の感覚入力の抑制に対応していると考えられる。28年度が最終年度であるため、記入しない。1.大脳ー小脳間の機能的結合の同定大脳皮質と小脳皮質の間の機能的な結合を網羅的に解析するために、大脳皮質の出力ニューロンである第5層錐体細胞にチャネルロドプシンを発現するThy1-ChR2マウスを用いた光機能マッピングを行った。麻酔下のThy1-ChR2マウスの大脳皮質をレーザーを用いて経頭蓋的に光刺激し、小脳皮質の様々な部位でプルキンエ細胞から活動電位を記録した。小脳皮質の記録部位に応じて特異的な入力マップを得ることに成功している。さらに、入力元の大脳領域に応じて異なる潜時でプルキンエ細胞の発火(単純スパイク、複雑スパイク)が起こることが明らかとなった。2.課題実行中のマウス小脳における情報表現認知運動課題の実行にかかわる大脳ー小脳連関機構を明らかにするため、課題実行中のマウスにおいて2光子イメージングを行う。今年度は小脳皮質における認知運動課題にかかわる神経メカニズムの解析を行った。音弁別go/no-go課題を実行中のマウス小脳において2光子カルシウムイメージングを行い、運動学習および認知学習にかかわる小脳モジュールを同定した。異なる学習プロセスにかかわるシグナルが小脳の異なる領域に与えられていることから、それぞれの機能に関する大脳ー小脳ループにおいて平行して学習が起こっていることが示唆される。また、レバー引き運動課題を遂行中の小脳活動イメージングにも成功しており現在データ解析中である。3.大脳ー小脳間の動的連関による運動表出メカニズム解明大脳ー小脳間の相互作用を明らかにするため、両者の活動を同時に観察できる顕微鏡システムの開発に着手した。まず今年度は、大脳光刺激ー小脳活動イメージングを可能にするシステムを構築した。それぞれの実験項目について、当初予定した計画どおり進行している。

レバー引き運動課題を実行中の小脳皮質登上線維応答を2光子イメージングにより解析したところ、レバー引き直前の登上線維応答の増加と、レバー引き直後の登上線維応答の抑制が観察された。この結果を小脳の制御モデルに当てはめると、レバー引き前の登上線維入力はフィードバック運動指令を、レバー引き後の登上線維抑制は、報酬獲得中または随意運動中の感覚入力の抑制に対応していると考えられる。1.大脳ー小脳間の機能的結合の同定については、大脳から小脳への機能的結合マップは得られており成果を論文として発表する。同時に、小脳から大脳への機能的結合マップの解析に着手する。2.大脳運動関連領野および小脳における運動情報表現については、現在進めているgo/no-go課題について、成果を論文として発表する。レバー引き課題についての実験および解析を進める。3.大脳ー小脳間の動的連関による運動表出メカニズム解明については、大脳と小脳の活動を同時に観察する顕微鏡システムを完成させる。その上で、課題実行中の両者の活動の相関解析を開始する。28年度が最終年度であるため、記入しない。
ATP感受性Kチャネル開口剤の新しい作用機序の分類と臓器作用検定法の開発

ATP感受性カリウムチャネル(K_<ATP>)に対するカリウムチャネルオープナ-(KCO)の効果はこのチャネルのサブタイプによって異なっている。この分子機構を解明し、KCOの開発の理論的な基礎を構築するため、脳cDNAライブラリーからサブユニットであるBIRとuK_<ATP>をクローン化した。また、心臓からスルフォニル尿素受容体SUR2A,SUR2B cDNAを新たにクローン化した。SUR2Bはdifferential splicingによってSUR2Aと同じ遺伝子から作られると考えられ、C末端の42個のアミノ酸配列はSUR1に似ていた。SUR2A、SUR2B共に培養細胞(HEK)においてBIRもしくはuK_<ATP>とともに共発現させることによってK_<ATP>が出現した。SUR2Bの発現は広く分布しており、uK_<ATP>と共に培養細胞HEKに発現させたところ、ATPの阻害効果はMg-ATP complexの阻害効果よりも強いことや、ピナシジルやジアゾキサイドが共によく効く等、血管平滑筋に存在するATP感受性カリウムチャネルに非常に似た性質のチャネルを発現することがわかった。これははじめての血管平滑筋型ATP感受性カリウムチャネルのクローニングである。一方、SUR2AとBIRを構成サブユニットとするK_<ATP>は心臓のK_<ATP>チャネルの性質と非常に似ていた。即ち、ATPの阻害効果はMg-ATP complexの阻害効果とほぼ同等であり、一方、KCOの効果ではジアゾキサイドに反応しにくく、ピナシジルはよく効くことなど心筋K_<ATP>に非常によく似ていた。SUR2AとBIRによるK_<ATP>はSUR2BとBIRのチャネルに比べニコランジルの効果が約1/10と効きにくいことが判明した。また、BIRとuK_<ATP>のキメラによる解析から2つの膜貫通領域とそれにはさまれた領域がコンダクタンスの大きさを決定することがわかった。以上のように、K_<ATP>のクローンを培養細胞に発現させてパッチクランプ法で測定することによりKCOのK_<ATP>サブタイプ別の効果を客観的に評価する系を確立することができた。モルモット単一心室筋細胞標本のパッチクランプ法による解析では,inside-out patchの実験でATP感受性K(K_<ATP>)チャネルは1)rundown以前のチャネル2)rundown後のチャネル3)rundown後にヌクレオチド二リン酸(NDP)を加えた状態のチャネルに区別することができる。我々は細胞内NDPによる(1)KATPチャネルの作用が二次元的であることを明らかにした。すなわちrundown以前のチャネルではNDPは細胞内ATPによる阻害を拮抗する。rundown後にNDPを加えた状態のチャネルでは,NDPはチャネルを開口させるが,細胞内ATPと拮抗しない。これらrundown後のNDPによるチャネル回復の程度が細胞内Mg-ATP依存性の過程により調節されていることを見い出した。さらなる調節機構として,G蛋白質によるK_<ATP>チャネルの活性化を明らかにした。ATP存在下では,GTP(+アセチルコリン),GTP_γSや,AlF_4はチャネルを活性化したが,ATP非存在下では影響を与えなかった。また活性化型G蛋白(Gαi-1,Gαi-2,Gαo)は細胞内ATPにより閉じたK_<ATP>チャネルのみを活性化した。

以上よりG蛋白は細胞内ATP依存性阻害機構を拮抗することにより心筋細胞K_<ATP>チャネルを活性化することを見い出した。1.我々が単離した膜2回貫通型カリウムチャネルの1つGIRK2BcDNA(Isomoto et.al.,Biochem.Bophys.Res.Commun.218,286,1966)をプローブとしてマウス脳cDNAライブラリーよりやはり膜貫通領域を2箇所持つuKATP-1クローンを単離した。このuKATP1は清野らがクローン化し報告しているuKATP-1(J Biol.Chem.270,5691,1995)と同一のクローンであった。さらに、uKATP-1をプローブとして脳cDNAライブラリーよりBIRcDNAを単離した。このBIRcDNAは清野らによってクローン化され特に膵臓ランゲルハンス島β細胞に強く発現しKATPチャネルであることが証明されたチャネル(Science 270,1166,1996)と同一であった。このKATPチャネルは血糖降下薬のスルフォニルウレアを結合するスルフォニルウレアレセプター(SU receptor)と共発現させるとスルフォニルウレアによってその開口が抑制されることが報告されており、今後Bryan(Baylor College,USA)より供与を受けたSU receptor cDNAと共発現させてその電気生理学的性質と各種カリウムチャネルオープナ-(KCO)の作用を検討していく。2.スルフォニルウレア薬の反応性には臓器特異性がありSU receptorにはいろいろのサブタイプが存在していると考えられている。分子レベルの臓器特異的なKCOの効果を検討するためにSU receptor cDNAをプローブとして心臓cDNAライブラリーをスクリーニングし新たに2つのサブタイプと考えられるcDNAクローンを単離した。この2つのクローンとSU receptor cDNAとのホモロジーはいずれも約70%であり心筋に発現しているサブタイプの可能性が非常に高いと考えられた。これらのクローンはその5′側が欠損しているため現在全長領域のクローン化をおこなっている。ATP感受性カリウムチャネル(K_<ATP>)に対するカリウムチャネルオープナ-(KCO)の効果はこのチャネルのサブタイプによって異なっている。この分子機構を解明し、KCOの開発の論理的な基礎を構築するため、脳cDNAライブラリーからサブユニットであるBIRとuK_<ATP>をクローン化した。また、心臓からスルフオニル尿素受容体SUR2A,SUR2BcDNAを新たにクローン化した。SUR2BはdifferentialsplicingによってSUR2Aと同じ遺伝子から作られると考えられ、C末端の42個のアミノ酸配列はSUR1に似ていた。SUR2A,SUR2B共に培養細胞(HEK)においてBIRもしくはuK_<ATP>とともに共発現させることによってK_<ATP>が出現した。
バイオインフォマティックスに基づくイネの胚乳細胞壁多糖の機能解析とその応用

UDP-グルクロン酸からUDP-キシローズを生成するUDP-グルクロン酸デカルボキシラーゼと推定される遺伝子について、二種類クローニングすることに成功し、これらの配列をGenbankに登録した。これらの遺伝子についてタンパク質の発現および機能解析を行った。その結果、一方の遺伝子に関して大腸菌で大量に発現することに成功し、クローニングした遺伝子がUDP-グルクロン酸デカルボキシラーゼであることを同定した。この結果は単子葉植物(イネ科)において初めて明らかにしたものであり、Journal of Experimental Botanyにおいて公表された。もう一つは、様々な発達段階のタケ節間組織におけるヘミセルロースおよびペクチンの分布を組織レベルおよび微細構造レベルで示した報告についてである。節間の発達段階を三種類に分類し、phase I :一次壁、phaseII :未木化二次壁、phase III :木化二次壁とした。(1→3,1→4)-β-グルカンは節間が活発に伸張する時期に、ほとんど全ての組織に分布していた。しかし、微細構造レベルでのβ-グルカンの分布は一次壁や細胞間層および師部の未木化二次壁に制限された。高分岐したキシランはphase I初期におけるほとんど全ての組織において局在していたが、木化直前に全ての組織において消失した。これと対照的に、低分岐のキシランはphase Iでは原生木部にのみ存在していたが、phase IIになると木化直前の全ての組織で観察された。さらにphase IIIでは木化細胞壁において特に多量に局在していることがわかった。メチルエステル化されたペクチンはphase I初期の全ての組織に存在していた。また、木化直前からはメチル化に関わらずにペクチンは師部と原生木部にしか局在しなかった。キシログルカンは主に師部と木化組織に分布していた。これらの結果は単子葉植物(イネ科)の一次および二次壁形成に伴って初めて明らかにしたものであり、HistochemicalJournalにおいて公表された。昨年度UDP-グルクロン酸からUDP-キシロースを生成するUDP-グルクロン酸デカルボキシラーゼと推定される遺伝子について、2種類クローニングすることに成功し、これらの配列をGENBANKに登録した。今年度はこれらの遺伝子についてタンパク質の発現および機能解析を行った。その結果、一方の遺伝子に関して大腸菌で大量に発現することに成功し、我々が得た遺伝子クローンがグルクロン酸デカルボキシラーゼであることが明らかになった。この結果は単子葉植物においてはじめてのものであり、現在海外の雑誌にこの遺伝子およびタンパク質の性質についての論文を投稿中である。また、本年度はアラビノキシラン合成に関する遺伝子であるUDP-xylose 4-epimeraseと推定される遺伝子について、3種類クローニングすることに成功した。次年度に発現解析を行う予定である。それと平行に、UDP-グルクロン酸デカルボキシラーゼとUDP-xylose 4-epimeraseなどのアラビノキシランの生合成に深く関与している遺伝子の発現プロファイリングについてもデータの解析を進行中である。さらに本年度はHawaii大学のPaull博士との共同研究により、ハワイ大学において種子成熟過程におけるキシランの関与についての研究を行った。その結果、種子の成熟過程においてキシランが関与している興味深い結果を免疫染色法によって得ることに成功した。
口腔内抗菌性蛋白質の歯質への接着機構の解明と臨床応用への検討

平成9年度の実験よりリゾチームの正電荷(アミド基)とハイドロキシアパタイトの負電荷(リン酸基)が吸着に関与し、リゾチームはハイドロキシアパタイトへの吸着サイトが抗菌活性部位の反対側であることから吸着状態で抗菌性を保持している可能性を示唆した。この吸着状態での抗菌性に着目し、平成10年度は抗菌性の実験を行い、臨床応用について検討した。まずヒト母乳からリゾチームの精製を行った。6人の母乳からの精製量は1Lから平均で約15mgであったが、これは過去の文献の量と比較するとかなり少ない量であった。ヒトリゾチームをニワトリリゾチームと比較したところ、未吸着状態での活性値は低かったが、吸着状態はNMRの結果よりニワトリリゾチームと同様に活性部位の反対側で吸着しており、吸着状態で抗菌活性を有している可能性が高いことが分かった。次にリゾチームの抗菌性を臨床的に検討した。一般的に臨床に用いられているグラスアイオノマー系のセメントにリゾチームを添加し、その性状を調べた。最大5%のリゾチームを添加したセメントはその物理的性質を変化させることはなかった。しかしある種の細菌に対し、抗菌性を示した。M.Luteusに対しては非常に強い抗菌性を示した。また齲蝕原因菌の一種といわれるS.Mutansに対してもその抗菌性を確認した。しかし義歯性口内炎の原因菌といわれるC.Albicansに対して抗菌性を確認することができなかった。今回用いた抗菌性を調べる実験法は培地を利用したディスク法、吸光光度計を用いる方法であるが、詳細を調べるために今後はATPアナライザーを用いて生菌数を調べる方法を追加しなければならないと考えている。またセメントに直接リゾチームを添加する方法では永久的なものとは考えられない。そこでセメントにリゾチームの抗体を添加し、口腔内のリゾチームをセメントに集中することで二次齲蝕を予防できる材料の開発に着手した。蛋白質の分離精製に広く用いられるハイドロキシアパタイトは歯質の硬組織の主成分である。しかし蛋白質との相互作用部位などについてはこれまで明らかにされていなかった。今年度、蛋白質に唾液中にも含まれ抗菌性を有するリゾチームを選択し、ハイドロキシアパタイトとの吸着平衡実験でラングミュア吸着等温式より吸着親和力と吸着基数を求め、その結果とハイドロキシアパタイト表面をリン酸リッチにしたサンプルの結果を比較すると吸着基数は変わらなかったが、吸着親和力は約3倍となった。このことはリゾチームの正電荷(アミド基)とハイドロキシアパタイトの負電荷(リン酸基)が吸着に関与していることを示している。またハイドロキシアパタイトに吸着したリゾチームは活性部位をフリーの状態にしており、抗菌性を保った状態で吸着していることも解った。一方、リゾチームなど塩基性蛋白質の分離精製に用いられるイオン交換樹脂を吸着剤に選択した吸着平衡実験および吸着状態での水素-重水素交換と核磁気共鳴装置ではリゾチームの吸着様式がハイドロキシアパタイトの場合とはまったく違かった。その吸着力は非常に強かったが、吸着部位は特定できなかった。つまり表面全体でのマルチサイト吸着であったといえる。今回実験に使用したイオン交換樹脂は塩基性蛋白質用であり、そのカルボキシル基を利用しリゾチームのアミド基に吸着していることは解っている。本年度の実験で効率よく吸着するためにリゾチーム表面に存在するどのアミド基にでも吸着できることが解った。
生成音楽の体系的理解に向けた音を生み出す構造の分析

生成音楽とは,音楽家の手を離れて自動的に奏でられる音楽である.本研究では生成音楽の体系的理解を目指し,研究計画に上げた以下の項目:1.生成音楽の歴史的調査,2.古典的作品の再現, 3.シンポジウム・ワークショップの実施,4.音を生み出す構造の分析,5.実制作による検証,に沿って研究をおこなった.その成果は,最終年度に研究報告として発表するとともに,展覧会形式「生成音楽ワークショップの展覧会」で広く一般に公開した.以上の本研究の概要は,展覧会場で配布した冊子「生成音楽ワークショップの展覧会」にまとめられており,今後Webサイトで公開する予定である.以下,平成25年度の研究実績の概要を研究計画に記述した項目に沿って述べる.1.生成音楽の歴史的調査前年度のSTEIMを中心とした実地調査の結果を踏まえ,本年度は特に文献や音源を中心に生成音楽の歴史的背景を調査した.2.古典的作品の再現前年度に引き続き,小杉武久「catch wave」などを参考に,特にラジオに関わる生成音楽のあり方を検討した.3.シンポジウム・ワークショップの実施先述のラジオに関わる生成音楽のあり方を,横浜国立大学音響空間スタジオの主催するワークショップにて検討した(2013年3月).また後述の実制作を通じた検証に関わるものとして,(予め吹き込むべき音響のない)紙のレコードに関わるワークショップを韓国samsung art and design institute[sadi](2013年7月),情報科学芸術大学院大学[IAMAS](2013年10月),および横浜国立大学音響空間スタジオ(2013年12月)で主に学生向けに実施した他,情報科学芸術大学院大学[IAMAS]オープンハウスでは,音楽と録楽の未来と題したシンポジウムを開催した.この模様は[城,三輪,松井,2014]に掲載されている.4.音を生み出す構造の分析前述の実践を踏まえ,生成音楽の要素の洗い出しと,その体系化を図りつつある.この結果は最終年度に論文として取りまとめる予定である.5.実制作による検証前年度に引き続き,レコードを題材として新たな生成音楽のあり方に関する検討を行い,その結果を国内外の論文誌[Jo, 2014],国際会議[Jo, Ando, 2013][Jo, 2013],研究会[城,2013],パフォーマンス[Jo(jojporg), 2013]などで発表した他,その製作手法はインターネットで公開している.生成音楽とは,音楽家の手を離れて自動的に奏でられる音楽である.本研究では生成音楽の体系的理解を目指し,研究計画に上げた以下の項目:1.生成音楽の歴史的調査,2.古典的作品の再現, 3.シンポジウム・ワークショップの実施,4.音を生み出す構造の分析,5.実制作による検証,に沿って研究をおこなった.その成果は,最終年度に研究報告として発表するとともに,展覧会形式「生成音楽ワークショップの展覧会」で広く一般に公開した.以上の本研究の概要は,展覧会場で配布した冊子「生成音楽ワークショップの展覧会」にまとめられており,今後Webサイトで公開する予定である.以下、計画に記述した研究項目にそって平成24年度の主な活動の概要を述べる。1.生成音楽の歴史的調査として、電子音楽の研究組織であるSTEIMの他、生成音楽に関わる展示の調査をDocumenta13、ICA、ZKMで行い、施設訪問や実作品の鑑賞の他、関連人物へのインタビュー、文献、視聴覚資料の収集を行った(2012年9月)。2.古典的作品の再現として、ジョン・ケージ「失われた沈黙を求めて(プリペアド・トレイン)」の再演(2012年8月)、「虫の音楽」(2012年12月)、「鳴釜神事楽」の再現(2013年2月)を行った。3.シンポジウム・ワークショップとして、エオリアン・ハープ製作ワークショップを当該の楽器の研究者である杉山紘一郎氏を招いて、約10名の参加者を集めて実施した。4.音を生み出す構造の分析として、前述の調査、再現、ワークショップの中でも、特にケージの作品を中心に再演の過程を分析し、その構造的な特徴をまとめた他[金子、城、2013]、公開シンポジウムの場で、研究の趣旨および成果を一般に公開した[金子、2012]。平成25年度には、国際会議での成果発表に際した外国旅費を中心に、研究内容の議論のための国内旅費、研究者・作家の招聘費、その他資料・消耗品の購入費の支出を予定している。その他、装置やルールに関わる当事者へのインタビューを通じて、主観的な視点からの考察を行った[城、金子、2013]。5.独自の生成音楽作品につながる試みとして、パーソナル・ファブリケーションの手法を取り入れ、代表的な音響メディアの一つであるアナログ・レコードの新たな製作手法を検証し、実演[城、2012]、展示[城、2012, 2013]を行った。本研究では,生成音楽の体系的理解を目指し,生成音楽一般の音を生み出す構造の分析を中心に調査,再現,議論,制作をおこなった.研究期間を通じ,研究計画に上げた以下の項目:1.生成音楽の歴史的調査,2.古典的作品の再現, 3.シンホジウム・ワークショップの実施,4.音を生み出す構造の分析,5.実制作による検証,に沿って研究をおこなった.最終年度には,その成果を研究報告「音を発する装置の構造生成音楽ワークショップのまとめとして」

[金子,城,2015]として発表した他,これまでに取り上げた複数の作品を横浜国立大学人間文化課程音響空間スタジオの協力の下,展覧会形式「生成音楽ワークショップの展覧会」で広く一般に公開する(さくらWORKS〈関内2015年3月14日(土)ー2015年3月18日(水))と共に,展覧会の会期中には,「エオリアン・ハープ制作ワークショップ」,トーク・セッション「生成音楽の実践を考える」,「パフォーマンス」を実施した.この内トーク・セッションでは,NTTインターコミュニケーション・センター[ICC]主任学芸員の畠中実氏をゲストに迎え,これまでの研究の成果や関連研究の現在の動向を議論を通じ,生成音楽の文化的・現代における意義を考察した.以上の実践を含む本研究の概要は,展覧会場で配布した冊子「生成音楽ワークショップの展覧会」にまとめられており,今後Webサイトで電子版を公開する予定である.音響学,インタラクション・デザイン,メディア表現前年度の成果を踏まえ,研究の目的を順当に達成している.特筆すべき点としては,国内外で多様な形での発表を行っている実制作による検証がある.前述の研究実績が示すよう、本研究では平成24年度に1.生成音楽の歴史的調査、2.古典的作品の再現、3.シンポジウム・ワークショップの実施、4.音を生み出す構造の分析、5.実制作による検証、の5項目各々において、実践を行っている。その成果も既に一部は論文として掲載されている他、実演や展示、といった形で広く一般に対しても公開されている。これは当初の計画を上回る進捗状況であり、平成25年度以降さらなる発展が期待される。初年度,次年度の内容を踏まえ,最終年度は特に生成音楽における音を生み出す構造の分析に積極的に取り組むとともに,その結果を論文としてだけでなく国内外の研究者・アーティストとともにシンポジウム形式で考察する予定である.また,実制作による検証も引き続き,展覧会やパフォーマンスという形で実践的にとりおこなう予定である.平成25年度には、引き続き前述の各研究項目に沿った実践を行う。初年度の成果をまとめ、国際会議などで発表する他、関連の研究者・作家を招聘したシンポジウムを実施し、分野における現在の動向を議論すると共にその文化的な意義を考察する。あわせて、実製作による検証を進め、展示や実演などの実践を通じて研究成果の一般への訴求を図る。本年度の研究においては,実施費用先方負担でのワークショップの開催など,経費をかけずに成果を出すことが出来たため,次年度使用額が生じた.最終年度は,研究内容議論のための国内旅費,国際会議での発表旅費の他,研究成果シンポジウムの実施に際して,海外から研究者/作家の招聘費,研究資料の購入費,などの支出を予定している.平成25年度には、国際会議での成果発表に際した外国旅費を中心に、研究内容の議論のための国内旅費、研究者・作家の招聘費、その他資料・消耗品の購入費の支出を予定している。
日中寺院における蔵経建築の比較研究

本年度では、博士学位論文の執筆を主とし、寺院蔵経建築における一つの特殊な形式である輪蔵を中心に、資料集成、現地調査及び基礎研究を実施した。研究内容は4つの部分に分けられた。1.日中輪蔵の型式分類:日本・中国の輪蔵遺構及び建築技術における輪蔵規定を網羅し、型式分類、時代変遷、地域差という面から、輪蔵に対する考察を行った。2.建築技術書に見る輪蔵の設計技術:規定内容、寸法計画の側面から、『営造法式』と日本の木割書を対象とし、日中建築技術書に見られる輪蔵の設計技術について考察した。3.遺構から見る輪蔵の設計手法と建造技法:遺構より抽出された規模、細部寸法に対し、整数尺、比例関係、基準寸法を中心に分析を行った。輪蔵心柱にある回転機構、台座部・蔵身部の骨組、蔵書設備などの建造技法に関して整理を行った。さらに、輪蔵の構造特徴及び設計手法をめぐり、書物から書架へ、書架から建物への順次的な設計技術にも注目した。4.日中寺院における伽藍構成と建築形式の変遷に見る輪蔵の特質:遺構、古文献、遺跡、絵図資料を用い、中国・日本寺院における経蔵の配置法、建築形式の変遷を解明し、その上で輪蔵の特質を抽出した。研究結論として、輪蔵の変遷史に見る日中建築の交流関係は、広汎な日中建築交流史の枠組に納入できると認識され、従来の日中建築交流関係の説を固め、裏付ける意義が存在していることを明らかにした。計画書通りに初年度目は、基礎資料の収集から分析、博士論文の執筆、対外的発表に移行しており、順調に進展している。博士学位論文に基づいき、日本と中国寺院の蔵経建築に関わる書物の保存状態、信仰的活動などの問題をめぐって研究を展開する。なお、蔵経建築と寺院における他種別の建築との様式的・技術的比較、神仏習合の背景のもとに神社における蔵経建築への考察を実施する計画である。前期には遺構と文献資料の現地調査を行い、最終報告に必要な資料を補完する。後期は審査付き論文への投稿および最終報告書の作成に力を入れていく。
受動車輪付きドローンの壁面接触を考慮した制御系の構築と実験検証

本研究課題では,2つの受動車輪を取り付けたドローンの,壁面付近における安定な動作を保証した制御系を構築する.車輪は横滑りしづらいため,車輪を壁面に押し付けることで風によるドローンの動作への影響を軽減することが可能となる.まず,壁面への接触は制御における拘束条件として解釈することが可能であるため,拘束を考慮した代表的な制御手法であるリファレンスガバナを導入した自律制御系を設計する.また,人間によるドローンの操作に加え,リファレンスガバナを組み合わせた制御系設計を目指す.さらに,実機実験行いドローンを用いた保守点検の有効性を示す.本研究課題では,2つの受動車輪を取り付けたドローンの,壁面付近における安定な動作を保証した制御系を構築する.車輪は横滑りしづらいため,車輪を壁面に押し付けることで風によるドローンの動作への影響を軽減することが可能となる.まず,壁面への接触は制御における拘束条件として解釈することが可能であるため,拘束を考慮した代表的な制御手法であるリファレンスガバナを導入した自律制御系を設計する.また,人間によるドローンの操作に加え,リファレンスガバナを組み合わせた制御系設計を目指す.さらに,実機実験行いドローンを用いた保守点検の有効性を示す.
シロイヌナズナサイクリンD4の機能解析

これまでの研究により、シロイヌナズナのD4型サイクリン(CYCD4)が胚軸の気孔を形成する過程の細胞分裂に特異的に機能し、その機能には気孔形成過程で順次機能することが知られる3つのbHLH型転写因子のうち、最初期に機能することが報告されているSPEECHLESS(SPCH)の機能が必要であることを明らかにしてきた。SPCHについては、最近になって気孔形成を抑制するMAPKカスケードによりリン酸化され、機能抑制を受けることが報告された。CYCD4/CDKA複合体とMAPKのリン酸化カスケードの関係が示唆され、興味深い結果といえる。さらに、SPCHの発現レベルはCYCD4過剰発現体で野生型よりも高く、CYCD4ノックアウト系統で野生型よりも低かった。今後は翻訳後修飾および転写調節の両方を考慮しCYCD4とSPCHの関係を検討する必要がある。また、CYCD4と最も近縁なCYCD2の過剰発現体においても、胚軸で顕著な細胞分裂の亢進が見られることが明らかになった。しかしながら、CYCD2の過剰発現による細胞分裂の亢進にはCYCD4の場合のような細胞列特異性は観察されず、気孔形成だけでなく胚軸表皮細胞一般で分裂が亢進されていることが示唆された。さらに、CYCD2にT-DNA挿入がある変異体では気孔形成に異常は見られなかった。これらの結果から、気孔形成系譜の細胞で細胞分裂を促進するという分子機能は、CYCD4に限定されたものである可能性が示唆された。我々は、これまでの研究でシロイヌナズナのD4型サイクリン(CYCD4)が胚軸の気孔を形成する過程の細胞分裂に特異的に機能する事を明らかにしてきた。そこで本研究は、CYCD4がどのような上流因子による制御を受け、どのような下流因子を介して細胞分裂を促進しているか明らかにする事を目的としている。本年度は研究の目的のうち、気孔形成過程で機能することが知られている遺伝子群とCYCD4との遺伝学的な関係を明らかにする、という遺伝学的解析を中心に実施した。SPEECHLESS(SPCH)遺伝子は、シロイヌナズナの葉の気孔形成において初期段階の細胞分裂に必要であることが報告されている。そこでまず、spch変異の胚軸における気孔形成への影響を確認したところ、葉の場合と同様に、気孔形成に必要な細胞分裂が全く起こらなくなっていることがわかった。しかしながら、spch変異体でCYCD4を過剰発現した場合は、野生型でCYCD4を過剰発現した場合と比較して著しく細胞分裂の亢進効果が抑制されていた。つまり、CYCD4の気孔形成過程で細胞分裂を促進する機能には、SPCHが必要であることが示唆される。SPCH以外に、シロイヌナズナの葉の気孔形成において初期段階の細胞分裂に必要であることが報告されている因子として、ERECTA(ER)が挙げられる。er変異体についても、胚軸で葉と同様に気孔に隣接して過剰な細胞が見られる表現型を確認した。er変異体とCYCD4過剰発現植物を交配すると、両方の表現型が合成されたような異所的な細胞分裂が観察された。また、er変異体とcycd4変異体を交配すると、er変異体と同様の表現型が見られ、cycd4変異による細胞分裂の抑制は観察されなかった。これらの結果から、CYCD4とERは互いに独立した経路で気孔形成段階の細胞分裂を制御することが示唆された。
長期未発症HIV感染者における 細胞内抗HIV蛋白の発現および機能の検討

1、長期未発症HIV感染者の調査国立病院機構大阪医療センターおよび国立国際医療センターにおいて、受診した合計2100人あまりの中で、6年以上CD4+Tリンパ球が継続して500/μl以上を維持している患者数を調査した。その結果、合計15人が該当した。抗APOBEC3G抗体に関しては、米国NIHより供与を受け、これを用いた細胞内APOBEC3Gタンパクの蛍光染色を行ったところ、in situでの高発現を確認できた。しかし、その一方で、実際に末梢血単核球(PBMC)でのAPOBEC3G発現レベルは、大きなばらつきがみられる為、AOBEC3G発現量の高低を測定する際の、発現量の基準となるAPOBEC3Gを恒常的に発現している安定した細胞株の樹立を試みた。一般的にHIV感染の研究にはリンパ球由来の浮遊系細胞が用いられるが、浮遊系細胞からはクローン細胞の作成は困難であることが多く、作成されたクローン細胞でのタンパク発現も安定であることが多い。そこで、単層系非浮遊系細胞の293T細胞株を基礎としたAPOBEC3G発現細胞を構築した。作成したAOPBEC3G発現クローン細胞のうち、A3G-C1およびA3G-C4はvif欠損HIVの感染が認められず、発現したAPOBEC3Gが機能していることが確認された。また、これらの細胞はin situでの高発現も認められ、今後、臨床検体由来HIV感染者PBMCでのAOPBEC3G発現測定の半定量化が可能になり、長期未発症者およびそれに準ずるSlow progressor,進行HIV感染者(ただし抗HIV療法導入前)ならびに健常者において測定が可能となった。APOBEC3Gが国立病院機構大阪医療センターおよび国立国際医療センターにおいて、長期未発症者およびそれに準ずるSlow progressor,進行HIV感染者(ただし抗HIV療法導入前)ならびに健常者において採血を行ない、全血より末梢血単核球を分離し、確保・保存している。その中より、mRNAを抽出し、これを鋳型にAPBEC3G遺伝子をPCR法にて発現ベクターに組み込む作業を準備している。現在、同方法ならびにウエスタンブロット法によるAPOBEC3Gタンパク発現量の多少を、長期未発症者およびそれに準ずるSlow progressor,進行HIV感染者ならびに健常者においての、相互比較検討を開始している。長期未発症者においてリンパ球の実数ならびに低下が見られる場合はその低下速度とAOPBEC3Gの発現量の多少について検討を行う。加えて、各々の長期未発症者のAPBEC3G遺伝子とvif欠損HIVとによる感染実験にてAPBEC3Gとvifタンパクの相互分解実験を準備している。

しかし、その一方で、実際に末梢血単核球(PBMC)でのAPOBEC3G発現レベルは、大きなばらつきがみられる為、AOBEC3G発現量の高低を測定する際の、発現量の基準となるAPOBEC3Gを恒常的に発現している安定した細胞株の樹立を試みた。一般的にHIV感染の研究にはリンパ球由来の浮遊系細胞が用いられるが、浮遊系細胞からはクローン細胞の作成は困難であることが多く、作成されたクローン細胞でのタンパク発現も安定であることが多い。そこで、単層系非浮遊系細胞の293T細胞株を基礎としたAPOBEC3G発現細胞を構築した。作成したAOPBEC3G発現クローン細胞のうち、A3G-C1およびA3G-C4はvif欠損HIVの感染が認められず、発現したAPOBEC3Gが機能していることが確認された。また、これらの細胞はin situでの高発現も認められ、今後、臨床検体由来HIV感染者PBMCでのAOPBEC3G発現測定の半定量化が可能になり、長期未発症者およびそれに準ずるSlow progressor,進行HIV感染者(ただし抗HIV療法導入前)ならびに健常者において測定が可能となった。
新規Zn finger転写調節因子EOSの神経発生における役割

通常の発現解析に用いられるnorthern解析とin situ hybridization法で解析した。ゼブラフィッシュ発生の各段階でのゼブラフィッシュEos(z-Eos) mRNAの発現を,魚類を使っての研究の利点である発生の極初期の胞胚期から初期神経系形成期までを重点的にWhole mount in situ hybridization及び通常の切片でのin situ hybridization法で解析した。その結果、さきに、マウス胚において認められた神経胚より初期の段階、嚢胚期にz-Eosの発現が認められた。受精後24時間を過ぎた頃から、発現部位が頭部中枢神経系に限定された。in situ hybridization法での結果をnorthern解析により確認を試みたが、今のところ確認されていない。northern解析より感度よく発現を感知できるRT-PCRによる解析を採用して現在発現解析を試みている。