斯里兰卡内战 内战爆发
尽管发生了这些事件，双方同意无条件参加10月28日至29日在日内瓦举行的和平谈判。然而，由于在重新开放关键的A9公路问题上存在分歧，和平谈判破裂，A9公路是连接贾夫纳和南部政府控制区的纽带。虽然猛虎组织希望这条在8月激战后关闭的高速公路重新开放，但政府拒绝了，称猛虎组织将利用这条高速公路向经过的人征税，并将利用它对政府军发动进一步进攻。
新年伊始，疑似猛虎组织武装分子在该国南部发动了两起公共汽车爆炸事件，造成21名平民死亡。新闻报道称，这些袭击具有猛虎组织袭击的所有特征。斯里兰卡政府谴责这些袭击，并指责猛虎组织实施了这些袭击，尽管猛虎组织否认与之有任何牵连。
2006年12月，斯里兰卡政府官员宣布计划将猛虎组织赶出斯里兰卡东部省，然后动用全力在该国北部击败猛虎组织。政府表示，猛虎组织正在向东部的平民定居点开火，并使用35000人作为人盾。这些说法后来得到了该地区平民的支持，他们告诉记者，他们被泰米尔猛虎组织用武力控制。2006年11月7日，在相互矛盾的说法中，超过45名泰米尔平民在所谓的瓦哈拉伊爆炸案中丧生。
随后，军队于2006年12月8日在巴蒂科洛阿区开始对猛虎组织发动进攻，目的是夺取猛虎组织在东部的主要据点瓦卡莱；由于该地区有大量平民，加上持续的季风雨，作战行动难以进行，经过一周的战斗，行动暂时中止。在接下来的几周里，估计有20000名平民逃离政府控制的地区，担心即将发生的袭击。军队于1月中旬发动了新的攻势，瓦卡莱于1月19日落入前进的部队手中。在东部攻势持续期间，猛虎组织和其他组织指控政府在1月2日的帕达胡图赖爆炸案中谋杀了15名平民，当时空军轰炸了他们声称是猛虎组织在斯里兰卡北部Illuppaikadavai的海军基地。据预测，瓦卡莱的损失将切断北方猛虎组织向其东部干部的供应路线，从而削弱猛虎组织对东部已经日益削弱的控制。
随着军事进攻的进行，猛虎组织继续在政府控制的领土上对平民发动袭击。2007年4月1日，军方指控猛虎组织在拜蒂克洛东区杀害了6名僧伽罗海啸救援人员。第二天，疑似猛虎组织武装分子在安帕拉的一辆民用巴士上引爆炸弹，造成17人死亡，其中包括3名儿童。
主要由特种部队和突击队组成的小组部队于2月开始了一项新的行动，以清除东部省仅存的猛虎组织战士。作为行动的一部分，政府军于3月28日占领了猛虎组织在Kokkadicholai的关键基地，并于4月12日占领了战略要道A5公路，15年来首次将整条公路置于政府军控制之下。这意味着猛虎组织在东部的活动范围缩小到拜蒂克洛西北部Thoppigala地区140平方公里的丛林地带。在长达三个月的托皮加拉战役之后，政府军于2007年7月11日占领了托皮加拉峰，肃清了猛虎组织在东部省的活动，并结束了东部战区的第四次伊拉姆战争。
北方的零星战斗已经持续了几个月，但2007年9月后冲突的强度有所增加。在前线防线的冲突中，双方进行了猛烈的炮击，随后进行了军事入侵。2007年12月，猛虎组织在Uyilankulama、Parappakandal和Thampanai的防御工事被政府军的前进部队所摧毁。
陆军司令萨拉特·丰塞卡中将在接受《星期日观察家报》采访时表示，陆军占领了猛虎组织的前沿防线，并从四面八方包围了瓦尼猛虎组织基地。他还说，大约还有3000名猛虎组织成员，军方打算在明年前六个月内消灭他们。一天后，陆军、空军和海军指挥官发表了不那么乐观的声明。军队将在瓦尼面对大约5000名猛虎干部。陆军司令打算在2008年8月将前线目前的战斗转入决定性阶段。指挥官们认为，很有可能在2008年击败猛虎组织。
斯里兰卡军方声称，2007年11月26日，斯里兰卡空军对Jayanthinagar的一个掩体进行空袭，猛虎组织领导人Velupillai Prabhakaran受重伤。斯里兰卡空军公开发誓要摧毁猛虎组织的整个领导层。2008年1月5日，猛虎组织军事情报负责人查尔斯上校在一次克莱莫尔地雷伏击中被远程侦察巡逻队（斯里兰卡）击毙。
国防部长Gotabhaya Rajapaksa于2007年12月敦促政府放弃停火协议，2008年1月2日，斯里兰卡政府正式放弃停火协议。2002年2月至2007年5月，斯里兰卡监测团记录了猛虎组织3830次违反停火的行为，而安全部队351次。自2007年5月起，政府军停止就违反停火的行为作出决定。因此，政府表示不再需要停火。几个捐助国对斯里兰卡政府退出停火协议表示失望。猛虎组织正式回应称，由于政府在没有任何理由的情况下单方面退出停火协议，并且他们准备继续履行协议，国际社会应该立即取消对猛虎组织的禁令。
政府军随后试图沿着穆哈马莱前进防线开辟第三条战线。在4月23日的最初挫折之后，政府军迅速推进，于5月9日占领了阿达姆潘镇，于6月30日占领了由岛上最肥沃的稻田组成的Mannar“饭碗”，于7月16日占领了Vidataltivu，于7日占领了Iluppaikkadavai。
2008年7月21日，猛虎组织宣布将于7月28日至8月4日宣布单方面停火，以配合将在科伦坡举行的南盟国家元首第15次首脑会议。然而，斯里兰卡政府认为猛虎组织的提议是不必要和背信弃义的。
2008年8月2日，猛虎组织在Mannar区的最后一个据点Vellankulam镇落入前进的政府军手中，完成了夺回该区的八个月努力。随后，经过数周的激烈军事对抗，陆军于9月2日控制了马拉维。猛虎组织于9月9日对瓦武尼亚空军基地进行了突然袭击，双方都声称取得了胜利。
7月底，政府军从马纳尔进入了猛虎组织的最后一个据点基利诺奇区，意图在年底前占领基利诺奇奇。2008年10月3日，一支联合国援助车队设法在基利诺奇区卸下了所有货物，并称基利诺奇镇几乎被遗弃，但猛虎组织在10月6日的自杀式爆炸中杀死了退役少将Janaka Perera和其他26名受害者。
2008年10月17日，政府军切断了纳奇库达以北的Mannar-Ponaryn A32高速公路，从而有效地包围了该岛西北海岸仅存的主要海虎据点。之后，陆军特遣部队1继续向普内林推进，占领了基兰奇、帕拉维、维拉维尔、瓦莱帕杜和魔鬼角。2008年11月15日，陆军第1特遣部队进入了具有重要战略意义的猛虎组织据点Pooneryn。与此同时，新成立的陆军第3特遣部队进入曼库拉姆地区，目的是将猛虎组织逼入进入贾夫纳-康迪A9公路以东的新战线。政府军于2008年11月17日占领了曼库拉姆及其周边地区。
与此同时，在最近一轮战斗中流离失所的20多万平民的处境正在演变成一场人道主义灾难；然而，由于许多原因，包括对猛虎组织谈判诚意的怀疑，西方政府和印度都没有进行干预，促成新的停火。
政府军于2008年11月23日开始攻击基利诺奇。军队从三个方向攻击叛军的防御。然而，猛虎组织进行了顽强抵抗，旷日持久的袭击导致双方伤亡惨重。
直到2009年1月1日，政府军才占领位于阿-9路线基利诺奇以北的帕兰坦。这隔离了猛虎组织大象山口据点的南部外围，也暴露了猛虎组织在基利诺奇的主要防御工事。这使得攻占基利诺奇变得简单得多，猛虎组织十多年来一直将其作为事实上的行政首都，政府军1月2日完成了这一任务。基利诺奇的损失大大削弱了猛虎组织作为一个有能力、无情的反叛组织的形象，观察人士预测，在多条战线上难以承受的军事压力下，猛虎组织很可能很快就会崩溃。
老虎队很快放弃了在贾夫纳半岛的阵地，在他们最后的主要基地穆莱蒂武丛林中进行了最后的抵抗。到2009年1月14日，整个贾夫纳半岛被政府军占领。然而，他们无法坚持很长时间，1月25日，政府军占领了穆莱蒂武。查莱的最后一个海虎基地将于2月5日沦陷，使猛虎组织控制的领土面积减少到约200平方公里。
战争这一阶段的特点是对平民的暴行加剧，平民伤亡迅速增加。2009年2月19日，人权观察发表了一份报告，指责政府军在不分青红皂白的炮击（包括多次炮击医院）中“屠杀”平民，并呼吁斯里兰卡政府结束其在军方控制的拘留营中“拘留流离失所者”的政策。人权观察还敦促猛虎组织允许被困平民离开战区，并“停止向试图逃离的人开枪”。联合国还对国内流离失所者的状况表示担忧，估计约有20万人被挤在瓦尼海岸一块14平方公里的狭窄土地上，政府已宣布该土地为“禁火区”。
2009年2月20日，两架执行自杀任务的猛虎组织飞机对斯里兰卡商业首都科伦坡进行了神风敢死队式的空袭，造成2人死亡，45人受伤，但两架飞机都在摧毁陆军总部和主要空军基地等预定目标之前被斯里兰卡空军击落。到3月底，猛虎组织只控制了禁火区外的一平方公里土地，低于三年前的约15000平方公里。拉贾帕克萨总统面临政治压力，要求他找到冲突的政治解决方案，他呼吁与泰米尔民族联盟举行会议，但他们拒绝了，直到政府解决了被困在战斗中的平民面临的人道主义危机。
4月5日，军事分析家/记者D.B.S.Jeyaraj将Aanandapuram战役描述为30年战争的“决定性时刻”。这场战斗见证了猛虎组织大多数久经沙场的地面指挥官的死亡，其中包括猛虎组织北部前线战斗编队的总指挥官Velayuthapillai Baheeratakumar，别名Theepan。来自5个师的5万多名政府军参加了包围猛虎组织干部的战斗，该战斗位于Paranthan Mullaitivu A35高速公路、Nanthikadal和Chalai泻湖与印度洋之间的一小块沿海地带。猛虎组织伤亡达625人。
政府军将猛虎组织逼进了为平民设立的禁火区。猛虎组织随后在禁火区建造了一个3公里（2英里）长的堤岸，困住了30000多名平民，但被政府军摧毁。
4月21日，政府军对猛虎组织领导人Vellupillai Prabhakaran发动攻击。与此同时，大批泰米尔人正在逃离“禁火区”。第二天，两名猛虎组织高级成员（猛虎组织媒体协调员Velayuthan Thayaniti，化名Daya Master和一名高级翻译Kumar Pancharathnam，化名George）向前进的政府军投降。这对猛虎组织领导层来说是一个“重大的打击”和重大挫折。当被问及为什么投降时，两人都强调，猛虎组织向平民开枪，阻止他们从“禁火区”逃到政府军控制区的安全地带。他们还声称，猛虎组织仍在绑架和征募年仅14岁的儿童，并将向任何试图抵抗的人开火。
到4月25日，猛虎组织控制下的土地面积减少到10平方公里。尽管泰米尔人继续逃离“禁火区”，但联合国估计，在2009年1月至2009年4月期间，可能有约6500名平民死亡，另有14000人受伤。英国广播公司报道称，政府军从猛虎组织手中夺回的土地人口大量减少，完全被毁。
随着战斗的继续，一组独立的联合国专家呼吁人权理事会紧急成立一个国际调查机构，以解决政府军与猛虎组织之间战斗中的“危急”局势。根据联合国人道主义事务协调厅（OCHA）的数据，超过19.6万人逃离了冲突区，这是东北海岸线上一块不断缩小的土地，政府军与猛虎组织之间的冲突仍在继续，而至少5万人仍被困在那里。联合国驻科伦坡发言人Gordon Weiss表示，有100多名儿童在“大规模杀害平民”的事件中死亡，并将斯里兰卡北部的局势描述为“血雨腥风”。联合国秘书长潘基文（Ban Ki-moon）表示，他对上周末数百名斯里兰卡平民在军队与猛虎组织的敌对行动中被杀害感到震惊。他对冲突地区继续使用重型武器深表关切，但也强调，“猛虎组织对平民安全的鲁莽不尊重导致数千人仍被困在该地区”。
5月13日，联合国安理会向新闻界发表声明如下：，“安全理事会成员强烈谴责泰米尔伊拉姆猛虎解放组织（猛虎组织）承认斯里兰卡政府打击恐怖主义的合法权利。安全理事会成员要求猛虎组织放下武器，允许仍在冲突地区的数万平民离开。安全理事会成员对有关在平民高度集中地区继续使用大口径武器的报告深表关切，并期望斯里兰卡政府履行其在这方面的承诺。
2009年5月16日，政府军突破猛虎组织的防御，占领了猛虎组织控制的最后一段海岸线。军方报告称，他们将在几天内“清除”猛虎组织控制的剩余土地。后来，军方声称，据称截获了猛虎组织的通信，猛虎组织在实际上被切断了逃跑路线后，正准备进行大规模自杀。据报道，一些猛虎组织分子引爆了自己身上的炸弹。