魔法禁書目錄角色列表 科學勢力（學園都市）
藉由散布自行研發的，效用等同於賀爾蒙一般的微小粒子來控制對方的精神，同時會使用好幾種不同的化學物質進行複雜的操作，可以讓複數的人們同時看到複雜的幻覺。
《天擇者篇》中，與病理、圓周一同前往巴格吉城，襲擊了「反學園都市科學守衛者」的高層並加以折磨。隨即與搗蛋鬼成員中和自己同樣操控幻覺的烏特迦洛奇對決，兩人陷入無限輪迴的幻覺之中，同歸於盡。亂數所散布的、滯留在決鬥地點的黴菌隨後被圓周回收，並被用來製造更強大的生化武器。
木原圓周（，Kihara Enshuu）
木原一族不「及格」的成員，有著包包狀的的髮型，身上攜帶了三台手機，性格不自然的女孩。專攻的領域是「學習裝置」。
小時候曾經被對木原一族心懷憤恨的人拘禁，試圖以斷絕其資訊來源的方式使其變得不「木原」。在黑暗的小房間中度過了幼年，卻從伸手可及的一切中學得了所需要的一切知識，某一天完美地以不明方式殺死了所有人並逃離了監禁。然而因幼時經歷變得不會分辨善惡，只會按照指令行事的存在。
會把自己的思考模式圖形化，並且借用他人（如其他「木原」成員及上条當麻）的思考模式來行動。對此，加群懷疑其「原本的人格」是否還能保持完整。
《天擇者篇》中，與病理、亂數一同前往巴格吉城，以木原數多的戰鬥模式(以顯微鏡的精準度控制槌子的破壞力)輕鬆壓制雲川鞠亞與近江手裏，在能下殺手前被加群阻擋，為了殺死加群轉而使用木原唯一的戰鬥模式(震撼體內的二氧化碳以爆破血管)，但不敵加群的定向炸彈而逃跑。聽到病理的呼救後協助其重新站起，並預測到對方會偷襲自己而搶先閃避，使用上条當麻的戰鬥模式摧毀了病理的上半身。隨後回收了亂數的黴菌武器，使用紫外光將其變異為殺人武器，等待過程中與前來阻止的雲川鞠亞、近江手裏與莎芙利對決，最終落敗被俘。
回到學園都市後，雖然沒有必要卻號稱「自願」而付錢給監禁能力者的少年院把自己監禁在裡面，實際上則是因自身能夠模擬、重現任何一個「木原」的能力為亞雷斯塔所顧忌而被其刻意誘導自己產生「想要待在裡面」的想法。《上里翔流篇》中，被木原唯一帶出少年院並被要求模擬已經無法行動的腦幹，卻發現腦幹就如同加群一樣是自己無法解析的存在。
木原病理（，Kihara Byouri）
木原一族的研究員，專攻「放棄」的情緒的學者。坐在可變式輪椅上的女性。在一族之中為上位的家族成員。
擅長誘導對方的心理，使對方心生「放棄」的情緒。體內由未元物質改造過，即使心臟被摧毀也能隨即再生的改造人。可利用未元物質將身體進行型態改變，例如手臂改為雪人臂以增加力量，甚至能創造新的大腦以使用學園都市的超能力。
數年前為了使木原加群放棄作為善良教師的身分，創造出隨機殺人魔襲擊雲川鞠亞，使得加群為保護學生而殺死殺人魔後自行離開學園都市。
《天擇者篇》中，與亂數、圓周一同前往巴格吉城，與屠殺學園都市部隊的瑪麗安·史琳格奈亞對決落敗，失去行動能力。被圓周找到後，藉由其幫忙使用「未元物質」重獲行動能力，又為了獨佔未元物質的使用技術而偷襲圓周，被圓周預測並搶先閃避後以上条當麻的戰鬥模式擊敗，上半身被毀。藉助未元物質重構身體後意圖殺死雲川鞠亞等人，與出手阻止的加群展開決戰，分析出對方的術式能夠治癒致命傷後對加群造成大量「不構成致命傷的傷口」試圖令其失血過多而亡，失去對未元物質的控制後被木原加群拚死的最後一擊殺死，但也同時殺死了對方。
其战斗数据作为资料使垣根帝督掌握了重构身体的能力。
木原加群（，Kihara Kagun）
木原唯一（，Kihara Yuiitsu，聲：中原麻衣）
木原一族成员，穿着研究员服装的女性。似乎为现任宗主，指派了病理、亂數與圓周前往巴格吉城。《一端覽祭篇》中引誘未元物質體垣根帝督出戰對抗一方通行，最後審視了所有對未來的利益有用的人物。尊稱腦幹為「老師」，輔助其作為亞雷斯塔左右手的任務。在腦幹被上里翔流打成重傷昏迷後，為了復仇而使用心理掌握的「Five_Over」偽裝成化生院明日香，切下上里的右手，以改造過的「修格斯樣本」和「弱毒性聖日耳曼病毒」強行取得「理想放逐」的力量，險些殺死上条當麻，被取得A.A.A.的美琴阻止。與亞雷斯塔商量後，繼續以獵殺上里為目標，在學園都市中釋放大量的魔法生命體「元素」。在上里本人被放逐至「新天地」後，以右手要脅全體上里勢力獵殺上条當麻。最後在府蘭與琉華成功透過奈芙蒂絲的殘塊將上里召喚回來後，被一眾少女團團包圍，生死不明，而「理想放逐」則被奪回。
木原腦幹（，Kihara Noukan，聲：速水獎）
一條金毛獵犬，木原一族的成員，是木原最初的七位始祖所改造的生命。統括理事長的左右手，也是「對魔法式驅動鎧」的使用者，是負責對付雷蒂麗‧坦格洛德、芙羅蘭‧克洛伊杜尼與代號「Dragon」的安全閥。在蜜蟻愛愉所引發的事件落幕後，殺死了幕後黑手蠢動俊三，完成了所有七十二件因理事長缺席而引起騷亂的人們的擊殺任務。在僧正、娘娘、奈芙蒂絲等一眾「魔神」入侵學園都市時受命將其擊殺。對決上里翔流時，驅動鎧的所有部件都被傳送至「新天地」，但因為自己非常滿足於「現在的世界」而無法被傳送。出於敬意，上里用手杖將其打成重傷，最後被唯一放入冷凍睡眠裝置，等待科技更加先進之時才能救治。《克倫佐篇》時，被冥土追魂救醒並跟隨他一同前往米娜‧馬瑟斯與莉莉絲的所在地。
木原相似（，Kihara Souji，聲：田丸篤志）
於外傳「科學未元物質」中登場，木原一族的青年。本職為人工肢體、器官等醫療設備的開發及技術研究。
九月初，由於一方通行的大腦受損，將「DA」中更為激進的一批人「DA‧覺醒」洗腦，進行對杠林檎的捕捉作業。對她進行調整後得以在她身上重現一方通行的能力，並強迫杠林檎與垣根帝督戰鬥，試圖透過超能力者之間的戰鬥獲取數據。
計畫最後被常識所不適用的「未元物質」給粉碎，相似本人則被未元物質的一刀給逐漸沙化，最終變成一盤散沙死亡。死前還興奮地看著自己被沙化的下半身，想著要分析研究這一現象。
冥土追魂（，Hevun Kyanseraa（英語：），聲：仲野裕）
本名不明。看起來像青蛙的學園都市醫生（美琴稱他為「真人版蛙太」）。能靠部份麻醉進行心臟手術（小說第五集），技巧高超到号称「不死就能救活」的地步，所以得此外号（能从鬼门关追回病人灵魂）。以「不管發生什麼都不能拋棄患者」為信念，行動時連眉頭都不會皺一下。曾做出能夠克服人類壽命的機器。
在都市建立前於英國救下了重伤的亞雷斯塔，幫助亞雷斯塔來到日本並告知學園都市理念，之后的都市建立中也是重要人物，但因自身意愿，未担任理事。
原本擁有亞雷斯塔的生命維持裝置的遠程控制器，有能力立即終止其運作以終止亞雷斯塔的生命，但因不抛弃病人的原则放弃。
芳川桔梗（，Yoshikawa Kikyou，聲：冬馬由美）
在學園都市中研究所上班的女性研究員。在小說第五集中得知年齡已經超過二十五歲了。負責管理「絕對能力進化（Level 6 Shift）計劃」實驗的中樞。實驗凍結後一個人留在研究所中，企圖阻止受到天井入侵的最終之作失控。自知性格天真卻不溫柔，曾想當老師而後來放棄了。為了阻止天井曾胸部中彈。小說第十二集中和一方通行與最終之作一起出院。
黄泉川的挚友。在0930事件中發現了因為中了「天譴術式」而昏過去的黃泉川，並得知一方通行獵殺獵犬部隊一事。
天井亞雄（，Amai Ao，聲：鈴木達央）
原本是量產型能力者計畫的研究員，專長是使用學習裝置製作人格資料。在「絕對能力進化（Level 6 Shift）計劃」時間中負責實驗管理。實驗凍結後於最終之作腦中放入病毒，企圖加入反學園都市的外部組織，但被一方通行阻止。其開的車似乎是黃色的凌志LFA。
後來趁著一方通行對最後之作的程式進行重組的過程中，槍擊他的眉間，也讓一方通行之後失去演算能力。
最後與芳川桔梗以槍近身對峙，但最後還是被她槍殺而死。死前對芳川說「溫柔這個詞果然不適用於妳，妳現在是堅強了」。
木山春生（，Kiyama Harumi，聲：田中敦子）
松定博士（，Matsusada）
流體力學界的權威，著作是「黏性、濃度與次世代演算裝置的未來」。由於研究成果成為了「人力資源計畫」的基礎，因而害怕得想要逃出學園都市，被黃泉川與史蒂芬妮阻止，卻在被捕前一刻吞下藏在臼齒中的冬眠劑「CP-191」，讓自己陷入長達三個月且無法被中途喚醒的睡眠。
蠢動俊三（，Shundou Toshizou）
“才人工房”第三研究室“内部进化（Ideal）”的研究员，在“内部进化（Ideal）”实验意外，以为仗着受统括理事会支持可以继续获得实验预算，结果被食蜂和统括理事会交涉后中断了“才人工房”的资金。
向武裝集團「Deadlock」提供「篡奪之槍」，試圖透過其來搶奪「心理掌握」的研究者之一。因違背都市高層的意志而全員被抹殺，然而蠢動卻透過將自己大腦中「人之所以為人」的部分接上殺人鯨的大腦而轉生逃過一劫，躲藏在巨型水族館「天體水球」。暗中協助了蜜蟻愛愉的行動，事件結束後被亞雷斯塔派遣的木原腦幹擊殺。
妹妹們（Sisters）
小郭（，Kuruwa，聲：和泉風花）
半藏的家臣，忍者。想復興忍者，並找來「原石」名單企圖將他們拉入夥。
外型是迷你浴衣，左手是無袖型，會露出肩膀，不知為何帶是透明的，浴衣更配合這點，露出了肚臍，在帶子上外加兩條皮帶，更裝飾著一條長鎖鏈。
雖然是忍者，但是會用手枪戰鬥，本人自稱忍者是會因時代不同而不斷進步的。
其必勝忍法就是脫衣。
人才派遣（，Management，聲：野上翔）
學園都市的黑市商人，負責替人手不足的犯罪計畫補充人力的仲介。替「區塊」的計畫介紹了大量傭兵，又幫「學校」的計畫介紹了新任狙擊手砂皿緻密。在五大暗部的混戰中被土御門元春槍擊並回收，由下層組織運送時遭到「學校」的譽望萬化攔截滅口。
百貨公司（，Depart，聲：本橋大輔）
學園都市的黑市商人，年紀約莫大學生左右的男子。以幫人尋找「藏身處」起家，主要販售逃跑或隱藏行蹤時所需的物品。有著毆打人肉沙包的低級興趣。
在三次大戰前夕的暗部動亂中，被一方通行受命暗殺。
坂島道端（，Sakashima Michibata）
常盤台中學指定美容院的店長。喜歡打電動與和顧客閒聊。曾經提議將白井黑子的髮型改成爆炸頭，更曾經不自禁地把帆風潤子的髮型整個大改造。
丈澤道彦（，Jousawa Michihiko）
「新生」的下級成員，負責「龍騎士」驅動鎧的保養與維修。出於「希望可以讓它為人類帶來貢獻」的理由，而將龍騎士借給突然出現的濱面仕上。
不願竜造（，Fugan Ryuuzou）
學園都市的「黑暗」中的軍火設計師，從網路接單後將設計圖上傳以換取酬勞。由於不信任網路銀行的防火牆，於是將所有酬勞換成黃金存放在自己的移動據點，大型油罐車之中。《人力資源計畫篇》中，被追查人力資源計畫的土御門元春襲擊，隨後所在位置與大量黃金的情報被公開，幾分鐘內便被「土狼」們掠奪一空。
山揚子（，Sangaku Youko）
「衛星引導車失控事件」中，該引導車的駕駛。原本在絕望之下決定犧牲自己，最後在及時趕到的初春飾利的捨身協助之下成功將車給勉強停下。