英雄傳說 軌跡系列用語列表 重要歷史事件&劇情概述
主角等人收到破戒賀伍德的邀請函來島內度假，實則是破戒準備了一道試煉給眾人，度假第二天清晨，破戒安排島內毒氣裝置要主角眾人巡迴島內接受各方勢力挑戰，至島上廢棄研究所時，才發現島原來是D∴G教團 樂園的根據地，也是蕾恩過去的陰影所在地，透過破戒利用島內裝置喚醒卡特爾天使之力，眾人來到地下大空洞，也是D∴G教團研究的核心之所，原來教團終極目標是要打開異界之門來讓惡魔入侵現世，在眾人一番戰鬥後，雖成功阻止異界之門開啟，但在斯溫的突然背叛下第八創世完全復原，八個創世中的七個被庭園主人所奪走（剩下一個即亞妮艾絲最初持有的創世被魔裝鬼化的范恩及時奪回），也得知原來破戒這一切的安排是讓蕾恩與過去陰影可以做一個了斷。
首都動亂
涅梅斯島數天後，娜迪雅因斯溫的背叛傷心欲絕而離開眾人獨自行動，范恩等人開始著手調查庭園主人下落，才發現庭園主人利用第八創世來修改友方的記憶來與主角為敵，在經過與亞仙、星杯騎士塞莉絲等其他曾經的熟人的追殺，一次次的死亡回歸，最後甚至是庭園主人利用陣與霧香策劃綁架總統的計畫，在瓦解計畫後，才發現原來已經為時以晚，第八創世啟動最後的侵蝕將首都的時空撕碎。眾人再次回到調查的第一天，成功利用娜迪雅在最後的侵蝕給予的第七創世，來到庭園主人的空間虛白焉庭，在一度成功的風險賭注以及奪還回緋之阿爾緹菈後，眾人揭開庭園主人的真面目，其真身是太激進而被自己同伴處決的共和國開國元老之一——奧古斯特·阿爾丹，被殺的時候其靈魂輾轉被D∴G教團持有的古代遺物吸收並附身在庭園管理人梅魯奇歐以ACE的資料為原形製作的特殊擬體身上，並利用第八創世之力偷走拉碧絲的AI並篡改記憶成為「緋之阿爾緹菈」，並造出緋紅魔裝鬼佐爾格。在被范恩等人擊敗之後消失於現世。
八重維度決戰
學園祭的下午，范恩收到之前一直自稱第三代C的邀請來到塔前，發現原來創世失去作用是因為其本體存在於八重維度，女演員妮娜自爆其是七曜教會的終焉聖女並打開了八重維度之門，之後在八重維度深處才知道原來C的真實身分是死去的丁格，其人格被第八創世所吸收，而第八創世是用來觀測人們的罪，並紀錄一切曾經發生過的平行時空間的事件，如眾人被擊敗後所有不好的壞結局都將重現，成功擊敗丁格變成的緋紅魔裝鬼佐爾格後，瑪麗艾爾來到現場與丁格告別，從此八創世全都回歸。結局在學園祭第一天夜晚晚會，與收音機宣布第二天將發表宇宙軍基地的消息而結束。
序章
【序幕「邂逅〜交錯的意志〜」】
范恩等地下萬事屋成員們在馬爾鐸克公司的訓練設施中遇見同樣受邀前來的黎恩等托爾茲軍官學院相關人士、守護騎士凱文和盧法斯。在總統府發表了震撼各界的《摘星者計畫》後，眼看擡面上下的各方勢力紛紛開始展開行動,眾人則聚集在此進行了聯合訓練和聯歡會，而摘星者計畫的第二階段也在這段期間內執行完畢。在這樣的局勢下，黎恩、凱文和范恩等人各自懷著不同的目的與動機再次展開行動。
《太空計畫》：第一階段，發射通訊衛星，第二階段，測試載人機體升空，第三階段，實現載人宇宙飛行。
范恩線
【第I部】
范恩一行人在因摘星者計畫而熱鬧非凡的首都中再次開始處理4spg。透過與協會交換情報和合作,雖然意外發現檯面下社會並沒有太大的動靜,但同時也得知了「詭異的魔獸」的存在，對此有著不祥的預感。之後,他們造訪了亞妮艾絲位於雷弗地區的家，面見了格蘭哈特總統。在進行了一段互相刺探彼此虛實的對話後，范恩再次開始思考亞妮艾絲手中創世的謎團。
地下萬事屋一行人在與艾蕾因會合後,得知了反移民團體的不自然活動,以及在黑芒街有人無故失蹤的案例等情報。之後,他們循著線索來到地下暗渠區域,並遇到了可以用「無形之鬼」來形容的神祕存在。這時,莉婕特也出現明顯的不適。儘管心中充滿疑問，一行人還是來到了謝爾丹地區的劇場,並在那裡見到了個個都大有來頭的人們。
在與洛克史密斯前總統和妮娜等人共進晚餐時，范恩等人進一步了解了格蘭哈特的為人。之後，范恩在夜間巡邏時接到了約爾妲的委託，希望他能幫忙找回她的兄長，於是兩人一起展開行動。然而，在過程中他們著手調查傑佛瑞的奇怪行為，並遇見了自稱A:D的詭異團體。而那個手拿神祕白色裝置在暗中活動的人，居然是伊克斯。
【第II部】
「愚者們的拍賣會」
一行人與靜名和蕾恩會合後,透過來自黑月等的情報確信伊克斯手中的裝置與創世相似。就在此時,范恩收到了一封以《C.C.》名義發出的簡訊,一行人因而決定前往拍賣會。在拍賣會上拍賣的,是模仿創世的白色裝置。然而,神秘的冒牌幻夜之貓卻突然現身將裝置奪走。范恩一行人循線追蹤過去,卻遇到了在那裡等著他們到來的坎佩尼拉等《結社》的執行者們。
「另一個黎明」
范恩等人透過《黑色庭園》大致掌握各方面的狀況後，再次開始調查白色複製品和名為《另一個黎明》的集團。就在此時，黑芒街爆發了原因不明的混戰――暴動者們紛紛朝迪爾克紀念公園聚集而去，范恩等人也和警察、協會和黑月一同追趕他們的腳步。最終，他們得知了在一連申的騷動幕後,存在著一個自稱《殘渣》的神秘集團
「心意的形式」
在約爾妲果斷行動下，范恩等人掌握了残渣们的去向，並決定當晚各自分頭行動後，於次日前往那裡。是夜，亞妮艾絲要求范恩讓她陪同進行夜間巡邏。范恩隱約猜到她的用意，但還是帶著她走了一趟宛如約會般的夜間巡邏行程。當兩人結束巡邏回到舊市街時，亞妮艾絲向范恩告白，說出了她的心意。
「安卡維爾〜殘渣的行蹤」
范恩等人前往安卡維爾市，並以茱迪締的老家《黑貓之夜亭》作為據點展開行動。然而,他們卻發現有人刻意散布不實傳聞扭曲4spg的形象，於是一行人循線追查來到中央醫院。這時醫院內的人們突然開始暴動，而他們在深入調查後發現地下有一座非法的禁藥工廠。一行人深入工廠在那裡等著的殘渣和處刑者對峙。就在此時，那位傳說中的《劍仙》雲·卡法伊出手幫助了范恩等人⋯⋯
「緋紅之夜〜赫然悪意」
在醫院發生的事件後,范恩等人與雲師父一同推導出關於殘渣和處刑者的假設。他們推測一切與「生物奈米機械」和「時空跳躍」等現代科學無法解釋的技術有關。之後,雲師父剛離開不久，安卡維爾就遭到紅色霧氣和魔獸襲擊，於是一行人立刻趕往引發事件的殘渣藏匿的物流倉庫。經過一番激戰，范恩等人發現殘渣之中竟包括照理說已不在人世的人。
「遺留的『謊言』,以及――」
亞妮艾絲在總統的要求下突然被召回首都，蕾恩和多明尼克也選擇與她同行。與此同時，一行人與艾蕾因和的爾妲會合，並開始調查殘渣潜伏地點。這時，“破戒”賀伍德卻試圖與他們接觸。他們從賀伍德那裡得到了與當前狀況和《結社》立場相關的片段情報，但這時整座城市突然被籠罩在「白色泛魔化」之中。一行人在這異常情況下再次發現了殘渣，並揭露了戴面具的使徒的真實身分。
黎恩線
「巴澤爾招聘〜AF實戰測試」
以黎恩和克洛為首的托爾茲相關人土之所以會來到巴澤爾，是因為他們身為前璐神的操縱者而受道參加聯合演習。兩人駕駛最精銳的機甲兵提爾鋒擊敗了艾米莉亞少校的新型AF「王者之劍」。然而,作為摘星者計畫的關鍵，王者之劍明顯擁有過剩戰鬥力，讓人更加懷疑必須用上這種機體的摘星者計畫究竟有何真正目的。
「天穹彼方之物」
在聯合演習之後,黎恩等托爾茲成員重新思考了摘星者計畫的真正目的，決定不能再袖手旁觀。於是,一行人前往天文台觀星,然而只有黎恩和克洛看到的並非满天星空，而是無盡的虛空。之後，一行人在與守護騎士塞莉絲和里翁一起調查隱藏在天文台地下的占星術工房遺址時,發現望遠鏡捕捉到的影像乃是人為偽造的真相，漢彌爾頓博士利用阿瑪塔核心，在各地的天文塔創造望遠鏡所觀察到的滿天星空的虛擬景象以蒙蔽世人。
「在回天之地的盡頭」
黎恩一行人自巴澤爾逃離追捕後抵達了龍來。為了與雲師父對峙，黎恩決定前往師父所說的《回天之地》,並設法查明太空計畫的真相。在得到了陣、瓦爾特、霧香和黑月的協助後，他們突破了斑鳩的防線，朝著雲等待之地前進。後來,黎恩在得知雲師父的真正用意後與其交鋒，試圖抵達師父的境界。
凱文線
「不適合野餐的大熱天」
盧法斯和拉碧絲與凱文同行協助他執行「工作」薩爾巴德與斯溫、娜狄雅會合。然而，凱文以這次的任務是「制裁異端」――也就是殺害目標為由,拒絕讓斯溫和娜狄雅同行，兩人卻堅持要參與並展現了他們的覺悟,決定「陪到中途」。為了判斷制裁目標的罪行，凱文開始回顧這片土地過去發生的事件。
「被揭露的『原罪』」
凱文所追捕的《異端》嫌疑人竟然是漢彌爾頓博士。在調查過程中，一行人發現二十年前漢彌爾頓博士爾巴德進行的水利工程幕後的真相。深入調查後，他們來到了當年水利工程的「現場」遺跡塔。最後，他們終於查明漢彌爾頓博士曾在此地進行過，預支未來水源的違反世界法則的實驗。
「母親傳授之歌」
凱文等人追踪漢彌爾頓博士的足跡，乘坐梅爾卡巴I來到克雷優村的遺址。當他們在被反應兵器摧毀之地克雷優找到漢彌爾頓博士時，塞莉絲、里翁、歇里德和娜潔已經在她身邊了。博士坦然認罪並說出了部分真相，於是凱文決定正式將她視為《異端》，並對她舉起武器。然而，歇里德和塞莉絲等人不同意奪去博士的性命，使雙方陷入了對立的局面。
終焉亦為創始
亞妮艾絲在總統的要求下突然被召回首都，蕾恩和多明尼克也選擇與她同行。范恩等人回到首都後，決定入侵總統府地下以來釐清太空計畫計畫的真相，與營救蕾恩與亞妮艾絲，進入地下第三層深處後，發現亞妮艾絲與多明尼克消失，並在總統等人的邀請下前往觀測指揮廳決戰，原來摘星者計畫(雷瓦汀計畫) 的真相是：發動王者之劍來企圖銷毀束縛著塞姆利亞大陸，每1200年就會發動大重置回歸時空的時之至寶。艾米莉亞少校駕駛新型宇宙用AF「王者之劍AX」成功升空，在宇宙空間護衛從從地表共和國軍基地發射加強一千倍威力的24枚反應導彈，企圖利用反應導彈消滅時之至寶。緃使共和國軍第一輪8枚反應導彈攻勢成功炸毀至寶，但是至寶的強大時間回朔能力使得能瞬間自我修復，同時因應人類的科技水平已突破大氣層及對至寶攻擊行為，上調人類SiN值評估，把原定1080小時後才發動「大重罝」，提前於作戰開始後45分鐘發動。最後召喚神秘騎神擊落艾米莉亞少校的王者之劍，瓦解共和國軍所有攻勢，「雷瓦汀計畫」宣告失敗，漢彌爾頓博士的後備方案馬上執行。盧尼趁機調換牆上的真正八創世，並表明部分真正目的後變身金髮魔裝鬼「沙代」，以一人之力利用時空轉移力量拖延范恩一行人後結束戰鬥。在至寶的第20000期「大重置」快要降下時，受漢彌爾頓博士安排下，較早前多明尼克陪同亞妮艾絲利用時空跳躍瞬移到特里昂塔，儘管笵恩一行人在通信中極力勸阻亞妮艾絲的決定及全速前往特里昂塔，但為機已晚。最後在漢彌爾頓博士、多明尼克、盧尼、教會和結社的代表見證下，利用八創世改寫其術式內容，干涉至寶的大重置，讓時空不會回歸到七耀曆0年而改為部分時空回溯，但代價是犧牲亞妮艾絲的存在。