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复旦大学上海医学院 国家重点学科
医学部分含神经生物学、生物化学与分子生物学、生理学等二级学科。
现由人体解剖和组织胚胎学、病理学和生理病理学、病原生物学、免疫学、放射医学、和法医学及自主设立的蛋白组学、医学信息学等二级学科组成。
含中西医结合基础、中西医结合临床等二级学科。
临床医学
公共卫生与预防医学
公共管理
药学
复旦大学上海医学院 专业设置
上海医学院设有本科专业10个：临床医学（八年制）、临床医学（五年制）、临床医学（六年制，全英语授课）、基础医学、法医学、预防医学、公共事业管理（卫生事业管理方向）、药学、药学（临床药学方向）、护理学，以及高职专业1个：护理。
一级学科博士学位授权点5个（基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学），博士学位授权学科、专业点68个（含自设学科、专业4个），硕士学位授权学科、专业点45个（含自设学科、专业7个），并设有7个博士后科研流动站（生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合、药学、公共管理（医））。
亚门
亞門（英文：动物的亚门为 subphylum，植物和真菌的亚门为 subdivision）是生物分类法中的一个次要分类阶元，一般位于门和纲之间，但有时亚门和纲之间还会增设下门、总纲等次要阶元。
在植物和藻类中，亞門的拉丁學名詞尾為 -phytina，真菌中為 -mycotina，動物的亞門則無固定詞尾。
纲
纲（英文：class，拉丁文：classis）是生物分类法中的一个分类阶元，位于门和目之间。
纲 定义
纲作为具有独特名称的生物分类级别，首先由法国植物学家约瑟夫·德图内福尔（Joseph Pitton de Tournefort）在他的著作《植物元素》（Eléments de botanique，1694年）中出现的植物分类中被引入。
就纲的定义而言，在历史上一般认为是作为包容的分类单位，其中组合了器官的独特程度 - 例如“复杂的程度”，根据它们的器官系统如何分化成不同的区域或亚器官来衡量 - 有构造上的独特的类型，也就是组织系统的一种特定布局。也就是说，每个纲的构成最终取决于生物分类学家的主观判断，通常没有明確的定义，不同的生物分类学家采取不同的立场。描述一个纲没有客观的规则，但对于众所周知的动物，可能会存有共识。
纲 定义
在卡尔·林奈的第一版《自然系統》（Systema Naturae）（1735年）著作中，所有三个自然的界（矿物、植物和动物）都划分到纲。只有在动物界中，林奈的纲是类似于今天使用的纲，而他的植物的纲和目从未打算代表自然群体，而是根据他的《性系统》（Systema Sexuale）提供方便的“人工的键”（a convenient "artificial key"），主要基于植物生殖器官花的排列。
在植物学中，现在纲已经很少被讨论。自1998年的APG系统首次发布以来，该系统提出了开花植物的分类，达到了目的程度，许多来源倾向于将高于目的级别视为非正式演化支。在已经指定正式级别的情况下，分类级别已经精細到非常細的程度，例如陆地植物的木賊綱（Equisitopsida），在这个纲中的主要分支已经分配给亚纲（subclasses）和总目（superorders）。
纲曾经是分类层次结构中的最高级别，直到19世纪初期喬治·居維葉的分支（embranchements），第一次称为门（Phyla），由恩斯特·海克尔引入。
纲 衍生分类
和其他主要阶元一样，纲的上下可建立更高和更低的级别，以下是一些例子：
目 (生物)
目（英文：order，拉丁文：ordo）是生物分类法中的一个分类阶元，位于纲和科之间，可在其上建立级别更高的超目，也可在其下建立级别更低的亚目。
物种属于和不属于每个目是由生物分类学家决定的，和是否应该认可一个特定的目。 通常没有确切的协议，不同的生物分类学家各自采取不同的立场。 在描述或识别目时，生物分类学家不需要遵循严格的规则。 一些分类群几乎普遍被接受，而另一些分类群则很少被认可。
对于某些生物群，使用一致的后缀来表示其级别是一个目。拉丁语后缀 -(i)formes 表示“具有形式”的意思，用于鸟类和鱼类的科学名称，但不用于哺乳动物和无脊椎动物的命名。后缀 -ales 用于植物、真菌和藻类的目的名称。
目 (生物) 级别的层次结构
对于《国际动物命名法规》所涵盖的某些演化支，有时会使用一些其他分类，但并非所有这些分类都得到官方认可。
在他们1997年的哺乳动物分类中，McKenna 和 Bell 在总目和目之间使用了两个额外的级别："大目（grandorder）"和"上目（mirorder）"。 Michael Novacek（1986）将它们插入同一位置。 迈克尔·本顿（Michael Benton，2005）将它们插入"超目(superorder)"和"高目(magnorder)"之间。 这个位置被 Systema Naturae 2000 和其他人采用。
在植物学中，"亚纲"（subclass）和"亚目"（suborder）的级别是预定义为分别在"目"级别之上和之下的次一级的级别。 只要被清晰的定义，就可以使用任何数量的更进一步的级别。
"超目"级别是被常用的，其中 -anae 结尾是由植物学家亚美因·塔赫塔江(Armen Takhtajan)的出版物从1966年开始发起的。
目 (生物) 概念的历史
德国植物学家奥古斯都·奎里努斯·里维努斯（Augustus Quirinus Rivinus）在他的1690年代一系列论文中出现的植物分类中首次引入了作为具有其独特名称的生物分类的独特级别（并且不是仅仅称为更高一级的属（genus summum））的“目”。  卡尔·林奈（Carl Linnaeus）是第一个将其应用于他的《自然系統》(Systema Naturae)（1735年，第1版）中所有三个自然界（矿物，植物和动物）的划分。
对于植物，林奈在《自然系統》和《植物种志》中的目是被严格限制的，被用于将人为的细分为纲到更易于理解的更小的组。 当"ordo"一词首次被用于植物的自然单位时，在19世纪的著作中，例如德堪多的《植物学基本理论》的"德堪多分类系统"(De Candolle system)，和边沁和胡克的《Genera Plantarum》的"边沁－胡克系统"(Bentham and Hooker's system)，它表明了现在所称的「科」被赋予目的分類單元（参见自然目）。
目 (生物) 概念的历史
在法国植物学出版物中，从Michel Adanson的《Familles naturelles des plantes》（1763年）到19世纪末，"科"（famille，复数：familles）一词被用作拉丁语ordo的法语等价物。 这种等同性在阿方斯·比拉姆·德康多爾(Alphonse De Candolle)的《植物命名法则》（Lois de la nomenclature botanique）（1868）中明确说明，这是目前使用的《国际藻类、真菌、植物命名法规》的前身。
在1905年国际植物学大会的第一个国际植物命名规则中，「科」（familia）一词被分配到法语的“famille”所表示的级别，而目（ordo）一词被保留给了更高的级别，给予19世纪经常被命名为「群」（cohors） （复数群体）的级别 。
一些植物分类的「科」仍保留林奈“自然目”的名称，甚至林奈认可的前林奈时期的自然目的名称，作为其自然分类中的目（例如棕榈科(Palmae)或唇形科(Labiatae)）。 这些名称称为‘描述性的科名字（descriptive family names）’。
目 (生物) 概念的历史
在动物学中，林奈分类中目的使用更加一致。 也就是说，《自然系統》的动物学部分中的目是指自然群体。 他的一些目名称仍在使用中（例如鳞翅目是为蛾和蝴蝶所属的目，或双翅目是为苍蝇，蚊子，摇蚊(midge)和蠓所属的目）。
在病毒学方面，國際病毒分類委員會的生物病毒分类表包括十五个分类群：域(realm)，亚域(subrealm)，界，亚界，门，亚门，类，子类，目，亚目，科，亚科，属，亚属和物种，将被应用 病毒，类病毒和卫星核酸。 有9个病毒目，每个都以后缀 -virales 结尾。
科 (生物)
科（英語：，拉丁語：）是生物分类法中的一级，位于目和属之间，現時生物界約有800个科。真菌、藻类、植物界的拉丁文分类名称的字尾通常是-aceae，动物界则常为-idae。科下也分亚科，而在其上亦有總科（亦稱超科）。
亚科是生物分类法的一级，在科和属之间，有时亚科和屬之間也分族，亞科的拉丁文分類名稱的字尾通常是-oideae或-inae。
属
属（拉丁語：，复数）是生物分类法中的一级，位于种之上、科之下，可用于划分、归纳现存生物、已灭绝生物以及病毒。属名可由拉丁词、希腊词或拉丁化的其他文字构成，首个字母必須大写。在二名法中，属的名称构成该属内每个物种的二名法物种名称的第一部分。
例如： 狮（Panthera leo）和美洲虎（Panthera onca）是豹属（Panthera）属中的两个物种。 豹属是猫科（Felidae）中的一个属。
属的界定和成分由生物分类学者确定，但在方法上并无统一、严格的具体标准，因此不同的资料来源可能会对同一属采取不同的定义，或将同一组生物称作不同的属。然而，在以系统发生学为指导思想的现代系统分类学中，在定义一个属时普遍遵循以下三个原则，这些原则也通用于其它级别的分类阶元：
属 词源
术语“属”来自拉丁语的 genus（“起源，类型，群体，种族”），是与 gignere 同源词的名词形式（“承受；生出”）。  林奈在1753年的著作《植物种志》中推广属这个词的使用，但法国植物学家约瑟夫·德图内福尔（Joseph Pitton de Tournefort）被认为是“属现代概念的创始人”。
属 用法
科学名称（或科学加词）也称为通用名称，首字母為大寫。它在二名法（命名有机体的系统）中发挥着重要作用，並与物种的科学名称相结合：见具体名称（植物学）和具体名称（动物学）。
有关生物科学名称二名法科学名称的规则在命名规则中规定，它允许每个物种有一个唯一的名称，对于“动物”（包括原生生物），“植物”（也包括藻类和真菌）和原核生物（细菌和古菌），是以拉丁文和形式为二名形式；这与普通或俗名名称形成对比，这些普通或俗名名称是非标准化的，可以是非唯一的，并且通常也因国家和使用语言而异。
除病毒外，物种名称的标准格式包括通用名称，表示该物种所属的属，后面是特定的种加词，种加词（在该属内）是该物种独有的。
属 被接受的属的数量
已接受或所有已发表的属名的数量并不准确，尽管后者的数量已由Rees等人，2017年估算，截至2016年底约为510,000，每年增加约2,500。
物种
种（拉丁語：）或稱物种，是生物分类的基本单位。物种位于生物分类法中最底级，在属之下。籠統来讲，同一物种的任意两个性别适当的健康个体，都能够交配繁殖出具生殖能力的後代。满足以上条件的最大群体称为物种。根据演化生物學家恩斯特·麥爾的定义，物种是：「能够相互配育的自然种群的类群，且这些类群与其它的类群在生殖上相互隔离。」昆虫学家陈世骧（1978）对物种所下定义为：「物种是繁殖单元，由又连续又间断的居群所组成；物种是进化单元，是生物系统线上的基本环节，是分类的基本单元。」
在分类学中，一个物种被赋予一个拉丁化的雙名法名称。该名称使用斜体印刷，手写时则加上底線；属名首字母大写，屬名之後紧跟一个唯一的形容词，這個詞稱為種小名或種加詞，其首字母不可大寫。只有完整的双名制名称才称为「种名」，而非仅仅是双名制名称的第二个部分。例如人的种名叫Homo sapiens（智人），而不是sapiens。
物种
物种也是演化和生物多样性的基本单元。
在19世纪，生物学家们意识到物种可以在足够的时间内进化。查尔斯-达尔文于1859年出版的《物种起源》一书中解释了物种如何通过自然选择而产生。这一认识在20世纪通过遗传学和种群生态学得到了极大的扩展。基因变异来自突变和重组，而生物本身是可移动的，由此导致地理隔离和遗传漂变两种不同的选择压力。基因有时可以通过水平基因转移在物种之间交换；新物种则可以通过杂交和多倍体迅速产生；物种也可能因各种原因而灭绝。然而，病毒是一种特殊情况，具有平衡的突变和选择的概率，可以被视为准种。
物种 定义
物种的定义：常是指一类形态和遗传组成相似的生物群体，有生殖能力的个体之间在自然状态下能产生正常后代。以下是其他方式的物种定義：
生物学种（biological species）或隔离种（insular species）概念把物种定义为一组能够或潜在能够相互培育的生物。对于研究现存高等生物，如哺乳类、鱼类和鸟类的科学家来说，这不失为一种简洁的表达方式；但对于不进行有性生殖的生物来说，这个定义是毫无意义的。它把互相配育在理论上的可能性和种群间基因流动的可能性区分开来。例如马和驴杂交是可行的，并且能够产生后代，然而它们仍然属于两个种。这有两个原因：第一，因为在野生状态下，马和驴通常不会杂交。第二，因为它们结合产生的后代很少具有繁殖能力。定义生物学种的关键在于两个种群间没有显著的基因物质交流。值得注意的是：有的物種較早分化，但仍未產生完整的生殖隔離；有的物種較晚分化，但已經產生完整的生殖隔離。
物种 定义
在实际操作中，这些定义通常都相當一致，这些定义的不同点主要是侧重点不同而非相互否定。然而，还没有提出一个物种概念可以在无需具体分析情况下，就能完全应用于所有物種的。事實上，科學界對於物種的定義約有二十多種。物種問題就是指生物學家針對物種定義的爭議。
物种 在生物学分类上的重要性
物种的概念历史悠久。这之所以是最重要的分类阶元之一，有下面的原因：
在使用了几千年后，这个概念依然集中在生物学和相关学科上，也仍然被错误的定义和争论不休。
物种 “指定物种状态”的含义
对于某个物种的命名应该看作是对于该群生物的进化关系及其独特性的一种假定。更新的资料会证实或推翻这个假设。有时候，尤其是旧时通讯不发达的时候，分居异地的分类学家会为后来定为同一种的生物命两个不同的名字。当两个经过命名的种发现其实是同一个种时，先发表的那个种名通常会保留，后发表的被废弃，这一过程称为synonymization,或lumping。将一个分类阶元分开成多个通常是新的阶元称为splitting。分类学家常被他们的同时戏称为“lumpers”或“splitters”，视乎他们找到了物种间的不同点还是相同点。（参阅統合派與分割派）。
传统上，研究人员依赖于解剖学上的不同，和通过观察不同种群间是否有成功混交来区分物种；解剖结构和生殖行为依然是指定物种状态的重要手段得益于上几个十年里微观生物学研究技术的日新月异，包括DNA分析等，得出了一大批关于物种间相似与区别的知识。许多从前认为是不同物种的类群现在归入了单一的分类阶元，许多过去归在一起的类群被分开了。任何的分类阶元（种，属，科等）都可以合并和分开。对于一个较高的阶元，这样的修订则更显得意义深远。
物种 “指定物种状态”的含义
从分类学的角度看，种下的类群定义为低于种的分类阶元。在动物学中，仅使用亚种概念，而植物学还会使用诸如变种，亚变种，和变型等单位。
物种 更详细的隔离种的概念
总的说来，对于那些大型复杂的有性生殖生物（例如哺乳类和鸟类）, 生物学种或隔离种概念的定义有几种变体。通常，区分两个物种，甚至是亲缘关系很近的两个物种都是很简单的。例如，马（Equus caballus）和驴（Equus asinus）不需要经过专门训练或学习的人就能够把它们分开。然而它们相近得可以进行杂交，并产生不育的骡。它们明显就是不同的种。
但是许多情形则让人难以决定。这就是隔离种和进化种的分歧之处。两个概念都同意一个物种在时间上保持着其血统的独立性，它与其他这样的血统可以被我们区分（否则我们就认不出它们来了），是生殖隔离的（否则一个种群如果一有机会就和另外一个合并起来了），并有有效的种内识别机制（没有这个，该血统不可能延续）。在实际上，两种观点都同意一个种必须有其自身的独立进化历史；否则刚才提到的特征都不适用了。其不同在于：进化种概念不对种群的未来作出预测，而仅仅是记录已知的类群。相反，如果经过研究人员的研究，某两个种群在可能情况下能够再次合并，隔离种概念就不认为这两个种群为两个种。
物种 更详细的隔离种的概念
有两个关键的问题需要解决。第一，初定的这个种是否能持续的、可靠的与其它物种区分;第二，这在未来是否会持续下去。针对第二个问题，下面有几个地理分布上的可能性
初定的两个种地理隔离—它们占有不同的地理区域。很明显，无法直接观察到分隔两地的两个种群之间的生殖隔离情况。通常情况下也不可能通过试验来完成：即使在豢养情况下两个初定的种能配育，这不代表在野外它们也会自由交配，这也不总是可以对杂种后代在进化上的适应性提供多少信息。通过其它一些试验可能会得出更多信息：例如，种群A的个体是否对种群B发出的求偶鸣叫录音有正确的反应呢?有时候，试验能够提供确切的答案。例如，巴拿馬地峽两边居住着七组看上去几乎一样的海虾（Altheus）种群，它们在约3百万年前出现。直到不久前，它们还被认为是相同的7个种。但是当把来自海峡两边的雄性和雌性放在一起时，它们没有交配反而大打出手。甚至如果海峡再次下沉，这些种群在基因上还会保持隔离：所以，它们现在被划分为不同的种。但在更多情况下，观察和试验都无法提供确定的答案，这是就要通过对邻近物种的经验来猜测它们之间的关系了。
物种 更详细的隔离种的概念
初定的两个种地理比邻—它们的繁殖区域比邻但不重叠。这种情况很少有，尤其在温带地区。分界线通常都是栖息地突然改变的地方（群落交错区），比如像森林边缘或者山上的雪线等，但有时却不大起眼。地理上的比邻指出这两个种群占有很相似的生态位导致它们无法在同一个地区共存。又因为它们不进行杂交，可以肯定地说有一种机制（通常是行为上的）来防止种群间的基因交流，因此它们应该属于不同的种。
在两个种群混合区有杂交区域。典型情况下，杂交区域会存在'纯种'种群一方或双方的代表，加上第一代杂交种和反交得到的后代。通过对杂交区域的广度与存在疑问的两个种群典型散布区广度的比较，可以评估两个'纯种'种群之间基因交流阻力的大小。例如橡树的分布距离是鸟或松鼠携带橡子的距离; 袋食蚁兽的散布距离约为15公里，因为这是小袋食蚁兽在离巢后寻找空闲领地时通常会经过的距离。如果杂交区域相对于散布区域越窄，则两个种群间的基因交流就越少，它们之间就更倾向于在进化到路上继续分化。然而，很难去预测未来杂交区域的变化;无论把具有杂交的种群定为两个种还是一个种，都具有潜在的争议性。
物种 更详细的隔离种的概念
种群的变化是渐变式的—在种群地理分布的两极，其典型个体间差异十分明显，但是在它们间的过渡是逐渐进行的。例如，北澳大利亚的树袋熊比南方的亲戚要小而且颜色也较浅，但是它们之间没有绝然的分界线：越向南部，树袋熊的个体就越大而且颜色越深;在中间地带的个体则体型和色泽都是中等。相反，在相同的地理范围内，黑背（北方）和白背（南方）钟鹊不从一种形态向另一种过渡;北方种群黑背，南方种群白背，在杂交区域“纯种”与杂合类型同样常见。树袋熊的变化是渐变式的（从北到南逐渐过渡，在小范围内的种群具有统一的外观），但钟鹊的变化不是渐变的。在这两个例子中，对其分类都存在一些不肯定，但是大多数的看法是两者的南北双方都不足以构成种。由于认为南北的钟鹊基因交流受到了限制，足以称它们为亚种（而非种）;但树袋熊之间存在南北间实质的基因交流，所以专家甚至拒绝认定它们为两个亚种。
物种 分類的歷史
在古時，人只是賦與一群類同的生物一個名詞。希臘哲學家，如亞里士多德，認為生物是可嚴格區分為不同的“物種”，而且物種是永恆不變的。
隨着接觸的生物愈多，人開始嘗試認真把生物分類。最初，人只是以外貌與習性分類，就像中國人把大多數水上生物稱作“魚”。
1686年時英國自然學家约翰·雷是第一次為物種一詞下生物學定義的人。而在十八世紀林奈首次以生殖器官作生物分類。他似乎只是認為這樣的分類有些意義，而並不是以為有近似生殖器官的物種有可聯繫。畢竟，當時的歐洲人相信創造論，即所有物種由神獨立創造，並無任何其他的聯繫。可能由於創造論，林奈對一些差異極微的物種感到困惑。他因而提出一些物種為完美的，樣板的；另一些則是仿造的。
及至十九世紀，多數自然學者開始明白物種在不斷地變异，而地球的古老也足以容纳長時間累積形成的巨變。因而，分類法開始強調物種之間是如何演變。拉马克認為生物可以把需要的特質遺傳給後代，例如長頸鹿就是因為吃愈來愈高的樹葉而長出愈來愈長的頸項。（這只是簡化的描述，拉马克的理論當然遠為深邃）
物种 分類的歷史
拉马克最大的貢獻在於提出不同物種之間可以有連續不斷的系谱。他在1809年的著作《动物学哲学》（Zoological Philosophy）是首個以邏輯理由否定創造論。當達爾文的進化論在1860年代被廣為接受後，卻掩蓋了拉马克的貢獻。及至二十世紀末，拉马克的理論重新獲得重視，成為适应突变的一個基礎。他另一曾被捨棄的目標為本進化論，亦發展成人工选择。
現代的分類學主要以遺傳序列為基礎。
物种 数量
據美国夏威夷大学和加拿大戴尔豪斯大学合作的海洋生物普查科学家推測，地球上约有870万种物种（±130万），其中650万种物种在陆地上，220万种生活在海洋深处。
对于真核生物：
以上统计不包括病毒。
物种 鉴定编码系统
随着在线数据库的普及，目前已建立多种编码系统用于标识已定义的物种，主要包括以下四种识别码（identification codes）或物种编码（species codes）、物种代码系统：
采用数字形式的“分类学标识符”（taxonomy identifier）—— taxid，作为物种的稳定唯一标识符。例如，智人（Homo sapiens）的 taxid 为 9606。
为有限数量的生物体设计了三字母或四字母代码。例如，智人在该系统中简写为 hsa。
使用不超过五个字符的“生物助记符”（organism mnemonic）。例如，智人对应的助记符为 HUMAN。
通过生命科学标识符（LSID）为每个物种提供唯一编号。例如，智人的LSID为：
urn:lsid:catalogueoflife.org:taxon:4da6736d-d35f-11e6-9d3f-bc764e092680:col20170225。
注：以上编码系统分别服务于不同场景，NCBI和KEGG侧重于基因组与代谢通路研究，UniProt专注于蛋白质数据关联，而ITIS则提供权威分类学信息整合。
生物分類法
生物分类法（英語：），又稱科學分類法，是用生物分类学方法來對生物的物種分组和歸類的辦法。这有助于我们理解和组织生物多样性，以及描述和识别不同生物种类之间的关系，以级别为基础的系统层次结构中使用的一个固定数量的层次，域、界、門、綱、目、科、屬和種。无级别系统使用任意数量的层次。分类的群体被称为分类单元。
現代生物分類法源於林奈的系統，他根據物種共有的生理特徵分類。在林奈之後，根據達爾文關於共同祖先的原則，此系統被逐漸改進。近年來，分子系統對學應用了生物信息學方法分析基因體DNA，正在大幅改動很多原有的分類。
生物分類法屬於系統分類學。
生物分類法 現代發展
儘管林奈當時對生物分類只是爲了方便鑒別，現在人們已經廣泛贊同分類應反映出達爾文關於共同祖先的原則。
隨著1960年代支序分類（cladistics），或稱分支學說（cladism）的出現，一個分類群被定位在演化樹的某個位置。如果一個分類群包括且僅包括某一個共同祖先的所有後代，稱其爲單系群（monophyly）；相對應的，若該分類群包括其共同祖先，但未包括其所有後代，則稱之爲並系群（paraphyly）；若該分類群不包括其最近共同祖先，則稱之爲複系群（polyphyly）。根據分支學說，一個自然分類應該是單系群而非並系群或複系群。
目前正在計劃一種新的命名法，稱做「PhyloCode」，用來處理演化支（clade）而非分類群（拉丁文taxon，複數taxa）。現在仍不清楚，這種新的命名法能否和其它的命名法則並存。
生物分類法 現代發展
傳統的分類受到林奈的兩界說影響甚深。即把生物一律分為動物和植物，又以王國（界）來稱呼這兩大分類，可在二十世紀對於微生物和真菌的研究，便被發現其不適用。第一次突破兩界說是1925年厄多爾德雀頓以「王國（界）之上是帝國（域）」，借用政治和歷史上的概念，創立「域」的最大分類單位，依照所有生物細胞的有無核，將之分為真核生物和原核生物兩界。但本分類標準當時來說太過前衛了所以影響不大。
比較新的分類法中，域或稱總界是最高的單元。三域系統最初被創立於1990年，此後逐漸被學界承認。目前，大多數學者已經接受這個系統，但仍有一些學者遵循五界系統。三域系統的基本特徵是將原本在細菌界（或稱原核生物界(Monera)）中的古細菌和真細菌獨立成細菌域（Bacteria）和古菌域（Archaea）。還有一些學者將古細菌列爲第六個界但不接受三域系統。
生物分類法 早期分類系統
最早已知的對生命形式的分類系統由希臘哲學家亞里士多德所建立。他將動物根據運動方式（空中，陸上或水中）分類。1172年塞維利亞的法官伊本·路世德（ibn Rushd，即阿維羅伊Averroes）將亞里士多德的《論靈魂》（拉丁文de Anima）翻譯成阿拉伯文並刪節。其原始註解已佚，但由斯考特（Michael Scot）翻譯的拉丁文版本仍流傳。
在中國，明代李時珍（約1518–1593）在藥典《本草綱目》中，將生物藥材分爲草部、穀部、菜部、果部、木部、蟲部、鱗部、介部、禽部、獸部和人部。瑞士教授康拉德·格斯纳（Conrad Gesner, 1516–1565）將當時已知的生物進行了分析性的歸納。
新大陸的發現爲歐洲帶來了很多新奇的動物種類的描述和標本。在16世紀晚期和17世紀早期，人們開始對動物進行了詳細描述，先是人們熟悉的種類，隨後逐漸擴展，直到形成了基於解剖學基礎的足夠大的知識體系。這些解剖學知識主要來源於醫學解剖學家，隨後昆蟲學家和最初的顯微鏡學者將分類的範圍進一步擴大。
生物分類法 早期分類系統
卡爾·林奈（Carolus Linnaeus, 1707–1778）的巨著《自然系統》（拉丁文Systema Naturae）在其一生中被改編過12次（1735年第一版）。在此書中，自然界被劃分爲三個界：礦物、植物和動物。林奈用了四個分類等級：綱、目、屬和種。
林奈所建立了用於命名所有物種的學名的方法，並沿用至今。在林奈之前，命名一個物種需要很長的包括許多單詞的名稱，其中包括了對物種的描述，並且這些名稱不固定。林奈將物種名稱統一成兩個单词的拉丁文名稱，即學名，由此分開了命名法和分類法。這種生物命名的方法稱作雙名法，具體命名辦法和書寫規則參見雙名法條目。
目前，命名法由命名法規（Nomenclature Codes）所管理。命名包括了不同等級的分類單元的名稱。
儘管在漢語中，各物種及分類單元有對應的漢語名稱，但在學術上爲了方便交流和避免一物多名或一名多物的問題發生，所有國家仍通用拉丁語的命名法，物種的學名也專指雙名法的名稱。拉丁語的好處在於，它基本已經是一種“死語”，不再用作口語，因此相對穩定。
生物分類法 舉例
常见的五種细胞生物（果蠅、人、豌豆、釀酒酵母和大腸杆菌）的名稱和分類如下：
註：
植物學和微生物學家用系統方法對較高級的分類單元命名，即用拉丁文中模式屬（type genus）屬名的詞幹加上標準的詞尾來命名這個單元（見下表）。例如，薔薇科的“科長”（即模式屬）是薔薇屬(Rosa)，其詞幹爲“Ros-”，則薔薇科的拉丁名即爲“Ros-”加上植物的科的後綴“-aceae”成爲“Rosaceae”。中文的大多數分類單元也是類似用法，但：
中文所用爲高級單元的取名的屬可能和拉丁文不同，如牻牛兒苗科(Geraniaceae)的中文名來源於牻牛兒苗屬(Erodium)，但其拉丁名來源於老鸛草屬(Geranium)。
拉丁名變更後中文名不一定變更。如脣形科拉丁名原根據形態命名爲Labiatae，現根據標準改爲Lamiaceae，取名源自野芝麻屬(Lamium)，中文也不必將脣形科改譯作“野芝麻科”。
生物分類法 分类级别
爲了更細緻的分類，學者們在門、綱、目、科、屬、種之外加了很多附屬級別。最常用的是“亞-”（sub-），在正常級別之下，如“亞綱”、“亞科”等等。在正常級別之上則爲“總-”（super-），如“總目”。比“亞”更小的還有“下-”，或譯作“次-”（infra-）。但下目仍然要比總科大。此外，對於植物，在科和屬之間還有“族”（拉tribus, tribi，英tribe），屬之下還有“”（拉sectio, sectiones，英section，組——大陸用詞、節——台灣用詞，常用於植物學），再往下還能有“系”（拉、英series, series）。比較完整的種之上的分類單元的次序爲（儘管目前大概沒有能把這些等級都用全的分類系統）：
域(總界) - 界 - 門 - 亞門 - 總綱 - 綱 - 亞綱 - 下綱 - 總目 - 目 - 亞目 - 下目 - 總科 - 科 - 亞科 - 族 - 亞族 - 屬 - 亞屬 -  - 亞 - 系 - 亞系 - 種
生物分類法 分类级别
在種之下，動植物還能分成“亞種”（subspecies，簡寫subsp.）和“變種”（拉varietas, varietates，英variety，簡寫var.），植物還能加上栽培品種名。比如現代智人的學名爲Homo sapiens subsp. sapiens，或者也可以直接省掉亞種簡寫直接寫成Homo sapiens sapiens。一種豌豆的變種的栽培品種可寫成Pisum sativum var. macrocarpon 'Snowbird'。對於細菌和古菌，在種之下則用“株”（英strain），如一株可以引起食物中毒的大腸杆菌菌株Escherichia coli O157:H7。注意只有屬之下的單位（包括亞種、變種）名用斜體，而屬級之上的單位、級別縮寫用正體。
生物分類法 分类级别
宏目 Gigaorder
高目 Magnorder or Megaorder
大目 Grandorder or Capaxorder
上目 Mirorder or Hyperorder
总目 Superorder（一些分类学者将总目置于高目及大目之间）
系 Series（常用于鱼类）
目 Order
从目 Nanorder
次目 Hypoorder
若目 Minorder
亚目 Suborder
下目 Infraorder
小目 Parvorder or Microorder
以下的分类级别可用于纲之下、目之下、或科之下。此種分類常見於分類階層尚不夠明確的生物，例如恐龙。這些分類級別也常被直接以「演化支」（clade）通稱，以描述其確切分類位置的未定性。
生物分類法 屬以上級別學名之後綴
在屬以上級別的分類單元的學名通常由模式屬的詞幹加上一個標準的後綴所構成。後綴的選擇取決於分類單元傳統上所在的大類別，如下表所示：
注意：
渤海国
渤海（：／；俄語：，698年－926年）是于公元698年到926年、以粟末部為主的靺鞨族君主制、多民族王国，建国者为大祚荣。渤海国的前身为现今中国东北部、朝鲜半岛北部、俄罗斯东南部地区各时期的“高句丽”、“肃慎”、“挹娄”、“沃沮”、“勿吉”、“靺鞨”等多个地方民族部落或政权。
渤海国在建国后受唐册封，唐王朝在黑水靺鞨居住地牡丹江流域置忽汗州，设忽汗都督府，亦称“渤海都督府”，册其首领为都督，封“渤海郡王”，史称“渤海王国”；其国人自称“靺鞨”、“靺鞨国”或“渤海国”。中国史籍《新唐書》称之为“海东盛国”。
渤海国所统治的领土在极盛期时，曾包括今嫩江至松花江河道一线以南的黑龙江省部分地区、吉林省大部、辽宁省、滨海边疆区的南半部以及朝鲜半岛北部。
渤海国
渤海國有五個首都，包括上京龙泉府、東京龙原府、中京顯德府、南京南海府和西京鴨綠府；當中最大的龍泉府為五京之首，仿照唐朝都城长安形制营建，其遺址位于今中国黑龙江省宁安市渤海镇。自渤海国三世文王大钦茂时期起，龍泉曾两度成为渤海国都，先后长达160余年，也是当时中国东北地区最大城市及政治、经济、文化、军事及外交中心。
10世纪，渤海国被契丹辽太祖阿保机所灭，故地建附庸东丹国，但渤海人不断逃亡，最终在金朝兴起后融入同样为靺鞨后裔的女真统治集团。
渤海国 国名
渤海国初名“振”（震），为大祚荣袭其父的大唐封爵“震国公”。而关于“震”的含义说法不一，比较通行的看法是认为取自周易震卦卦名，有人分析粟末靺鞨自隋朝就受到儒家文化影响很深，大祚荣更是熟知汉文经史，因此以地处东方而以震为国号。朝鲜学者朴时亨所著渤海史则认为“震”是威震四方之意，但武则天封“震国公”用威震四方之意几乎不可能。也有学者指出应该与乞四比羽被唐朝封为许国公一起考虑，并认为从音韵学上来说，“许”“震”可能为“靺鞨”的别称“肃慎”的谐音。“渤海国”名则来自于唐朝的“渤海郡王”封号。渤海國的疆域並未濱臨渤海，以“渤海”为封号，有人认为“渤海”是“靺鞨”的音近变音。
渤海国 历史
最早记载勿吉粟末部的史书是《魏书》卷100《勿吉传》。当时的靺鞨刚从北方迁移至粟末江流域，与当时的南扶余人的君主制国家—高句丽（前37—668年）因争夺土地逐渐产生冲突，至晚在公元471年－476年以前，粟末部已与高句丽连年征战。至隋朝初年，粟末靺鞨在与高句丽的战争中逐渐处于劣势，因此粟末靺鞨人大多臣服于高句丽。不愿臣服于高句丽的8个粟末部落，在首领突地稽的率领下逃往辽河以西，被当时的隋文帝安置于辽西柳城与幽州昌平一带。
在隋与高句丽的战争中粟末靺鞨人也参加了对高句丽的征战。
公元666年，唐高宗乾封元年，唐高宗派李勣和薛仁贵伐高句丽，臣属于高句丽的白山靺鞨部与粟末靺鞨部跟随高句丽对唐军进行了抵抗。
渤海国 历史
公元668年，唐高宗总章元年，高句丽灭亡。唐朝政府为了防止高句丽政权复辟，并有效控制高句丽遗民与临近靺鞨、契丹、奚、等部民，强行将“粟末靺鞨附高丽者”徙居辽西营州，高句丽治下的一部分粟末靺鞨人、白山靺鞨人被与高句丽遗民一同強行遷至营州（今辽宁朝阳）一带。而渤海高王大祚荣的父亲乞乞仲象（当时即为部落酋长）就在这部分粟末靺鞨人当中。乞乞仲象一家自668年被迁到营州到公元698年大祚荣率部众重新迁回“粟末故地”期间在营州生活了近30年，乞乞仲象之子大祚荣正是在这一时期出生并长大成人。
公元696年，武则天万岁通天元年，松漠都督府都督契丹人李尽忠以及其内兄孙万荣起义，反抗唐的统治。白水靺鞨酋长乞四比羽、粟末靺鞨酋长乞乞仲象也参与了此次反叛。
公元698年，武则天为安定东北边疆局势，在对契丹实行武力围剿的同时，对参加反唐的粟末靺鞨采用招抚政策，封白水靺鞨首领乞四比羽为许国公、粟末靺鞨首领乞乞仲象为震国公，赦免其反唐之罪。但是乞四比羽拒绝受封，被唐军追击杀死；乞乞仲象率部向东逃亡中病故。
渤海国 历史
公元698年（武则天聖歷元年），乞乞仲象之子大祚荣代父率所部继续逃亡至东牟山，降周的契丹大将李楷固追击其至天门岭，被大祚荣击败，是為天门岭之战。大祚荣借此在粟末靺鞨与高句丽故地的忽汗州敖东城建国称王，以唐朝廷封其父为震国公之震国作国号，自称震王（亦作“振”），都旧国（今吉林省敦化市敖东城），史称“震国”或“靺鞨国”。
大祚荣多次遣使向长安称臣，公元713年（唐玄宗先天二年）唐赐封大祚荣为“左骁卫大将军”、“渤海郡王”，令其统治所居之忽汗州，加封其为“忽汗州都督”。大祚荣自此将国名由“靺鞨”更改为“渤海”，以忽汗州（号上京龙泉府，今黑龙江省宁安市西南东京城）为上京，史称“渤海国”。
762年，君主开始獲唐朝册封为“渤海国王”。
公元738年（开元二十六年，大兴元年），渤海派遣使团入唐，前往长安，求写《大唐开元礼》，得到唐玄宗的允许，从此汉制唐礼正式传入渤海，此事件对渤海社会尤其是政治制度的影响巨大。在输入《大唐开元礼》之后，渤海贵族以唐礼为准绳，进一步建立起了以封建贵族等级制度为基础的社会秩序、以儒家思想为基础的道德规范，以及依据唐制建立的国家政治体制。
渤海国 历史
公元755年左右（天宝末年），文王大钦茂仿效唐的五京与都城制度，将渤海国都从“旧国”（今吉林省敦化市敖东城），迁徙到了上京龙泉府（今黑龙江省宁安县渤海镇），三十余年后，又将国都陆续迁至东京龙原府（今吉林省珲春八连城遗址），其间曾以中京显德府（今吉林省和龙西古城）作为国都。
渤海第五代成王大华玙，在公元794年至795年，将渤海国都从东京龙原府迁回上京龙泉府，直至渤海灭国。
大祚榮時期以粟末靺鞨、白山靺鞨為核心，力圖團結伯咄、安車骨等各部靺鞨。大武藝時期，渤海施行北進政策，尤其對黑水靺鞨的進攻，儘管一度受到挫折，但渤海的政權得到了鞏固，疆域擴大。
大武藝時期，由於渤海國受到唐朝，新羅和黑水靺鞨的包圍，大武藝採取遠交近攻的策略發生了唐與渤海國的戰爭，除了派使臣到突厥、契丹、新羅、日本，732年大武藝派張文休將軍攻打遼東城與玄菟城，將遼河西岸完全納入渤海的領土，接著跨海攻擊登州（山東半島北邊）
渤海国 历史
大欽茂時期，渤海終於實現了對拂涅靺鞨、鐵利靺鞨、越喜靺鞨、虞婁靺鞨的內部兼併。雖然沒有直接的文字記載，但史學界根據《冊府元龜》等記錄拂涅、鐵利、越喜、虞婁、黑水等靺鞨部落向唐王朝入貢的變化情況，做出了大致判斷。
渤海国末期上层穷奢极欲，王权争斗不断，内部矛盾不断。根据现存的考古遗址，渤海国在大彝震在位期间大兴土木，仿造唐代长安城兴建了恢弘庞大的上京龙泉府，军队规模也从数万增长至数十万，显然超出了国力所能负担的范围。大彝震后期政治动荡加剧，之后的3位君主都缺乏史料记载，906年大諲譔即位后内斗不降反升，渤海大将申德、礼部侍卿大和钧、大钧老、司政大元均、工部卿大福漠、左右卫将军大审理、左首卫小将冒豆干、检校开国男朴渔等等国内重臣都逃亡高丽。922年前后，长白山火山爆发导致天池周边500公里内遭遇毁灭，火山灰笼盖了渤海国东部地区，其国内的农业生态环境急剧恶化。黑水、越喜、铁利、拂捏等部不堪压迫，见渤海国国力衰微，都发动了反抗渤海国统治的起义。:222-225
渤海国 历史
907年唐朝灭亡，渤海国因承平已久，将本国国防寄希望于后梁、后唐，对契丹扩张无所作为，甚至连首都上京城都没有什么防备。:223-2249世纪末，阿保机领导下的耶律氏迅速崛起并在契丹确立了汗位，意图南下中原的契丹人迫切需要解决渤海国这个后顾之忧，因此不断向渤海国方向扩张。908年，契丹已经“筑长城于镇东海口”，将势力扩展到辽东沿海，阿保机更是于次年“幸辽东”。911年契丹灭了与渤海国唇齿相依的库莫奚后，更是915年“钓鱼于鸭禄江”、918年“幸辽阳故城”，至此契丹已经完全控制了原本属于渤海国羁縻的辽东半岛地区。919年，契丹修复辽阳城，并以汉人、渤海人充实当地人口，以辽阳作为入侵渤海国的前线基地，又在921年迁移徙檀、顺二州汉人填充今天的辽沈地区。924年，渤海国主动进攻契丹的辽州并杀死其刺史、掠夺其人口，阿保机在同年夏回击渤海却无功而返。925年冬，阿保机以“渤海世仇未雪,岂宜安驻”为由再度入侵渤海，围下扶余府、东进龙泉府。渤海国末代君主大諲譔在围城第4日主动向契丹投降，然而渤海民众在契丹入城时突然起义，在阿保机亲自指挥下契丹攻破龙泉府，渤海国安边、鄭颌、南海、定理等府纷纷降服，渤海国正式灭亡。:564-569
渤海国 政治
渤海国官制仿唐而建，同唐一样实行“一准乎礼”的方针，“可毒夫”（又称圣王、基下）为国家元首，下设宣詔、中台、政堂三省以及忠、仁、义、智、礼、信六部。
渤海國分为5京、15府、62州。
地方層級為府－州－縣，州以刺史為長官，縣則設丞。
渤海以國中五要邑為「五京」，分別是：
其它府名有：
渤海国 外交
成书于808年（唐德宗贞元十七年）的中国史籍《通典》卷一八六《勿吉》中记载“大唐盛化远被靺鞨国频使贡献。”
大祚榮接受了唐的冊封，成為了唐的一個羈縻州兼地方行政機構，同是又是地方的民族政權。和唐王朝即是中央與地方的關係，又是藩屬關係。渤海王室大氏集團為了加強和穩固渤海貴族集團的統治，加強自身實力，積極向唐學習，與中原交流，并輸入了唐的儒家經典、政治制度、典章制度以及經濟制度，輸入漢字，推動了渤海社會的發展。
渤海與唐也發生過武裝衝突，但時間短暫，規模不大。渤海国有向唐朝进贡的义务，史载渤海向唐朝进贡凡140余次。
渤海国与中原在文化、文字、行政上制度一致，可视为“车书本一家”。唐朝著名诗人温庭筠再送渤海国王子回国时曾赠诗：《送渤海王子归国》：“疆里虽重海，车书本一家。盛勋归旧国，佳句在中华。”
公元705年，唐派遣侍御史張行岌前往旧国，招慰大祚榮，并考察震国国情。大祚荣对唐示好，并隨即派兒子大門藝随張行岌入唐抵达长安，唐朝廷留大門藝为宿衛。
渤海国 外交
公元713年（唐玄宗開元元年，高王十六年），唐玄宗谴使鸿胪寺卿崔忻，敕持节“宣劳靺鞨使”的名义，[2]从唐都长安出发到登州（今山东蓬莱）出海，由今旅顺口登陆，溯鸭渌江北上，到达渤海国旧国（今吉林省敦化市敖东城），册拜靺鞨首领大祚荣为“渤海郡王”（从一品）、“左骁卫员外大将军”（正三品）、，并以大祚荣统辖地区为忽汗州，加授其为忽汗州都督（正三品），从此，去渤海国“靺鞨”之号，专称“渤海”。[3]大祚荣亦再次派子前往長安，請求唐“就市交易”，“入寺禮拜”，得到了唐玄宗的允許。
公元714年（唐玄宗開元二年），大祚榮再次“令生徒六人”，入唐學習。鸿胪寺卿、宣劳靺鞨使崔忻册封使命完成后返回长安，路经辽东半岛南端都里镇(今中国辽宁旅顺)，为纪念册封渤海之行，崔忻于黄金山下凿井两口（史称“鸿胪井”），并刻石一块并題詞。刻石文字共二十九字，分三行自上而下自右向左书写：“敕持节宣劳靺鞨使鸿胪卿崔忻 井两口 永为记验 开元二年五月十八日。”史称“唐鸿胪井刻石”。
公元719年（唐玄宗七年三月，高王二十二年）大祚荣去世，唐玄宗于八月谴使册封大武艺为“左骁卫大将军”、“渤海郡王”、“忽汗州都督”。
渤海国 外交
渤海国第二任君主大武艺（在位时间：719-737年）虽然对内采用自己的年号，但与唐朝交往时仍然奉唐朝为宗主国。由于渤海国受到唐朝、新罗和黑水靺鞨的包围，大武艺采取远交近攻的策略。
公元726年（开元十四年，仁安七年），大武艺在突厥的支持下，派其弟大门艺以及任雅发兵攻打黑水靺鞨。曾在唐廷留侍宿卫的大门艺认为会惹怒唐朝廷，在阵前写信表示反对，大武艺改派大壹夏代替大门艺出征，并准备召回大门艺并将之杀害，大门艺得知命令后便逃亡唐朝，唐玄宗授予大门艺左骁卫将军。大武艺派遣马文軌、葱勿雅前往长安，向唐玄宗上表，表中历数大门艺罪状，请求唐玄宗诛杀大门艺，唐玄宗留下渤海使臣，派鸿胪少卿李道邃、李源复到渤海，告知唐不会杀大门艺，但已将其流亡岭南。但大门艺并未被流放的消息泄露，大武艺派人至长安指责唐廷：“大国示人以信，岂有欺诳之理，今门艺不向岭南，请仍诛之。”
唐玄宗处分了不能督察僚属以至于消息泄露的李道邃、李源复二人，又派崔寻挹至渤海，携国书对大武艺进行训谕。
公元732年（仁安十三年）九月，大武艺派将军张文休率领水军跨渤海湾进攻唐朝登州（山东蓬莱），杀死登州刺史韦俊。唐玄宗命令左领将军葛福顺发兵进讨。
渤海国 外交
公元733年（开元二十一年）正月，唐玄宗派大武艺之弟大门艺前往幽州征兵，从西路进兵讨伐大武艺。又派新罗王之侍子金思兰回国，动员新罗王金兴光发兵进攻渤海南部。唐玄宗敕谕新罗王的国书记载：“渤海靺鞨，外称藩翰，内怀狡狯。今欲出兵问罪，卿亦发兵，相为犄角。闻有旧将金庾信孙允中在，须差此人为将。”
新罗王金兴光遂命金允中、金允文等四位将军进伐渤海南境，正巧天寒雪大，山路险滑，士卒死伤过半，只好退兵。同时，葛福顺、大门艺所率的范阳兵进军西线也无进展。
后大武艺率兵进至马都山（山海关附近），唐平卢先锋乌承玼率领本营兵马，用石块堵塞道路，绵亘四百里，黑水靺鞨与室韦靺鞨派来五千靺鞨兵归其指挥，由此乌承玼击退了大武艺的进攻，渤海与唐的战争宣告结束。
但大武艺战后仍心怀怨恨，于同年派刺客在洛阳天津桥南行刺大门艺，大门艺与刺客搏斗，得以不死，刺客被唐廷捕杀。
公元733年，突厥毗伽可汗去世，突厥内乱，势力迅速衰落，大武艺迫于形势，改与唐朝修好，向唐廷谴使上表谢罪，唐玄宗赐书招抚：“失道未远，迷复能徙，何其智也。……。既尽诚节，永固东藩，子孙百代，复何忧也。”
渤海国 外交
后突厥谴使渤海，约同攻打奚与契丹，大武艺为向唐示好，与突厥决裂，擒缚突厥使臣，并派大诚庆赴长安请命，唐玄宗不许，并回书对大武艺进行训谕。
之后的大武藝在位時期，渤海王廷派遣朝唐使二十三次，史載其“常習華風”。
公元738年（唐開元二十六年，大興元年）渤海“譴使求寫《唐禮》（即《大唐開元禮》）及《三國志》、《晉書》、《三十六國春秋》（應為《三十國春秋》或《十六國春秋》，原文如此），许之。”即得到了唐的允許，并谴使内侍段守简前往旧国，册封大钦茂为渤海郡王、左骁卫大将军、忽汗州都督。《册府元龟》中保存了唐玄宗册封大钦茂的全文，要求其“长保忠信”。
公元762年（唐宝应元年，大兴二十五年），唐代宗册封大钦茂为“渤海国王”，加授检校太尉，后又加拜司空兼太尉。唐朝正式将渤海国由羁縻州府（忽汗州都督府，渤海郡王）升为属国。
文王大欽茂在位五十六年中，形成了向唐學習的高潮，唐先後四次冊封大欽茂，五次遣使渤海宣谕，大欽茂也派遣朝唐使四十九次。
渤海的康王大嵩璘、定王大元瑜、宣王大仁秀都被唐皇帝封为渤海国王。
渤海国 外交
渤海国与日本外交关系亲密，文化、贸易交流频繁，日本为了联合力量对抗新罗，一度视渤海国为日本藩国，过从甚密。日本史料有时将渤海客称作“唐客”，将渤海大使称作“唐客”、“大唐使”或“唐客大使”，渤海在發給日本的國書中曾稱，他們恢復了高句麗的故土，具有扶餘的傳統，自稱“高麗國王”或“天孫”。
公元727年（日本神龟四年），渤海国为对抗唐朝和新罗，首次向日本派出使团，要求建立邦交关系。日本《扶桑略记》第六卷记载为“大唐使首领齐德入京”。日本朝廷官方的记录为“渤海郡王使首领高齐德等八人，来著出羽国”，“渤海郡王使”这个称谓应是渤海使节对出羽的地方官的自我介绍。日本出于牵制新罗的战略也希望与其和好，遂於728年派出首次遣渤海使，此後双方正式使节往来不断。
752年，發生日本遣唐使大伴古麻呂與新羅使者爭奪席次的事件。同年日本遣新羅使到達新羅後，被認為傲慢無禮，未得見新羅景德王而歸。759年日本太政大臣藤原仲麻呂計畫聯合渤海國，準備了軍船394艘和四萬零七百人的軍隊，準備遠征新羅，但此計畫因其與實際掌權的孝謙天皇不和及渤海方面情況有變等原因而流產。
渤海国 外交
8世纪中期以后，渤海国与唐朝的关系好转，因而渤海国对日关系开始转向以贸易为主，其关系一直持续到926年渤海国被辽国所灭为止。
公元771年（大兴四十一年），文王大钦茂派遣史都蒙从南海府吐号浦出发经对马岛访问日本。
公元873年（日本清和天皇贞观十五年）五月，出使大唐的渤海使团因遇风浪，漂流至日本萨摩国甑岛郡，渤海大使崔宗佐、大陈润陈书当地官员用汉字书写自陈书表明身份，但被当地官员怀疑为伪装成渤海人的新罗斥候。
公元883年，渤海使裴颋入日本国都，《扶桑略记》第二十卷时而记录为“渤海大使”、“唐客大使”；
公元908年，渤海大使裴璆一行入日本国都，《扶桑略记》第二十三卷记录为“渤海入觐大使”或“唐客大使”；
公元919年，渤海使裴璆第二次人日本国都，《扶桑略记》第二十四卷记录为“渤海客”、“唐客”。
公元929～930年，此时渤海为契丹所灭、改称东丹国，裴璆作为东丹国使出使日本，《扶桑略记》第二十四对此事亦有记载，称“唐客称东丹国使”。
靺鞨国一直与日本维持着很好的外交和商贸关系。靺鞨国曾34次派使团到日本。日本也曾13次派使团到靺鞨。
渤海国 外交
渤海国立国前，靺鞨七部之一、分布于长白山及南脉盖马大山东西一带的白山靺鞨，曾长期臣服于高句丽。《旧唐书·靺鞨传》记载：“白山部素附于高丽（高句丽）”。朝鲜史书的《高丽史》则将“白山部”记录为“靺鞨”，高麗時代李承休的《帝王韻紀•東國郡王開國年代》中將渤海記述為韓國史。
朝鲜史书《三国史记》中也记载了在高句丽与新罗的战争、高句丽与百济以及高句丽与中原王朝的作战中，高丽曾调遣白山靺鞨参与作战，并将白山部统记为“靺鞨”。如：
公元668年，唐高宗总章元年，唐灭高句丽，并将“粟末靺鞨附高丽者”徙居辽西营州，高句丽治下的一部分粟末靺鞨人、白山靺鞨人被与高句丽遗民一同移居安置在营州（今辽宁朝阳）一带。
公元732年（仁安十三年）九月，大武艺派张文休跨渤海海峡进攻唐朝登州（山东蓬莱），733年，唐玄宗命新罗王之侍子金思兰返回新罗，动员新罗王金兴光发兵进攻渤海南部。唐玄宗向金兴光表示：“奇功若有所成，重赏更何所爱。”新罗王金兴光遂命金允中、金允文等四将率兵进击渤海南境，由于大雪，士卒死者过半，无功而还。
渤海国 外交
战争结束后，唐玄宗为了犒赏新罗出兵援唐伐渤海，将浿江（大同江）以南之地划给了新罗，新罗从此积极向北推进。
公元748年（新罗景德王七年大兴十一年）新罗设置大谷城等十四郡县，与渤海南境接壤，构成了对渤海边境的威胁。此举得到了唐的支持，在唐玄宗的《敕新罗都护金兴光书》中，唐玄宗明确表明：“近又得（金）思兰表，称知卿欲于浿江置戍，既当渤海冲要，又与禄山相望，仍有远图，固是长策。……，警寇安边，有何不可，处置讫，因使以闻。”
渤海国第三代君主大欽茂（在位时间737-793年）大大扩展了渤海的疆土北到松花江，西到辽东半岛。在他在位期间，渤海与新罗建立起了稳固的贸易关系。755年，大欽茂定都位于牡丹江镜泊湖附近的上京龙泉府，以加强对靺鞨国诸靺鞨人民的管理。大欽茂还仿效唐的国子监建立了胄子监。
渤海国第十代君主大仁秀（在位时间818-839年），在位期间，渤海国的领土已包括朝鲜半岛北部，以及今天嫩江—松花江一线以南的中国东北部和俄罗斯滨海边疆区南部。其间，新罗国势衰微，靺鞨国的壮大迫使新罗在与渤海的边境上开始修建“浿江长城”三百里，并增加驻兵防备渤海。
渤海国 外交
公元699年（圣历二年），大祚荣刚刚立足忽汗河（牡丹江）一带，慑于西面东突厥势力的强大，向与唐为敌的突厥谴使修好，建立了外交关系。
公元711年，东突厥默缀可汗请唐和亲，向唐称臣，受唐册封，此时武则天已经去世，唐朝廷遣使招慰大祚荣。大祚荣一面与东突厥维持友好关系，一面接受唐的招慰。
《新唐書》卷二一九《黑水靺鞨傳》記載，在渤海國興盛后，拂涅靺鞨、鐵利靺鞨、越喜靺鞨、黑水靺鞨等靺鞨其餘各部“皆役屬之”，不再向唐朝貢。对照《冊府元龜》《唐會要》等唐官方資料的記載：拂涅靺鞨、铁利靺鞨、越喜靺鞨、黑水靺鞨从开元二年（公元714年，高王十七年）起曾多次，或独立或联合地，向唐王朝入贡，有时和渤海国使同年同月抵达长安。这些资料表明，在渤海国初期，拂涅、铁利、越喜、黑水等靺鞨部落仍是独立的部落力量，但某些方面可能受到渤海的控制，因此才会出现与渤海国同年同月入唐朝贡的情况。
公元741年（开元二十九年）突厥被回纥瓦解，渤海国向北扩张的障碍减小，大钦茂开始积极兼并靺鞨各部。
渤海国 外交
公元726年（开元十四年）唐在黑水靺鞨部落地区设立黑水都督府，同年，大武艺在突厥的支持下进攻黑水靺鞨，兵进登州，抵马都山，影响了靺鞨各部对唐的朝贡。
其后黑水靺鞨一直处于渤海国的控制之下，直到公元912年（后梁乾化二年、諲譔六年）渤海势力衰微，黑水靺鞨部才再度向中原王朝入贡。
根据《冊府元龜》记载，拂涅靺鞨最后一次入唐朝贡时间为公元741年（开元二十九年）。自此后，史料中不再有拂涅靺鞨入唐朝贡的记载，说明公元741年之后大钦茂吞并了拂涅靺鞨。
渤海统一拂涅靺鞨后，在其部落地区设置东平府进行管辖。
根据《冊府元龜》记载，铁利靺鞨最后一次入唐朝贡时间为开元二十八年（公元740年），自此后，史料中不再有铁利靺鞨入唐朝贡的记载。
日本史料《续日本纪》卷十八记载：公元746年（天平八年，天宝五年，大兴九年），“渤海人及鐵利，惣一千一百餘，慕化來朝，安置出羽國，給衣糧放還。”根据以上史料，可以判断出公元746年时，铁利靺鞨部已被渤海吞并，因此才会出现人数众多的出走逃徙。
渤海统一铁利靺鞨后，在其部落地区设置铁利府进行管辖。
越喜靺鞨最后两次入唐朝贡时间分别为公元741年（开元二十九年）与公元802年（唐德宗贞元十八年，康王正历八年），自此后，史料中不再有越喜靺鞨入唐朝贡的记载。根据以上史料分析，宣王大仁秀时期吞并了越喜靺鞨，于越喜靺鞨地设置怀远府与安边府进行管辖。
约公元741年至公元745年之间，大钦茂吞并了虞娄靺鞨，将虞娄靺鞨地划至定理府、安远府管辖。
渤海国 經濟
渤海的社會經濟發展是不平衡的，發達地區已是封建經濟，但在邊遠地區，仍處於原始社會末期或向奴隸社會過度的階段。
渤海国的中部為農業和漁獵區。大體包括上京、中京、東京、南京一帶，畜牧業發達。西部与南部主要为农业区。东部的核心地带为农业与渔猎畜牧相结合的地区。北部居民主要从事渔猎与畜牧业，农业在部分地区有一定的发展。
从大祚荣建国，到大钦茂执政，由于铁器的普遍应用，社会生产力开始提高，加之政局稳定，对外交流加强，所以渤海国的社会经济在这段期间内得到了迅速的恢复与发展，经济逐漸繁荣，并在九世纪达到了最高峰。
渤海国的农业主要分布在西部松嫩平原、松花江流域的扶余府、鄚颉府、长岭府、涑州，西南部的鸭渌府和上京、中京、东京以及率宾府，南部的南海府。
渤海的农作物见于记载的有粟、麦、穄、豆、稻等，豆类作物在渤海的农业中，占据相当位置，栅城（珲春）以大豆做豉（豆的酿造物），远近驰名。渤海国水源充足、土地肥沃的平原与山间谷地会被种植水稻，卢城（和龙一带）是当时主要的水稻产区，直到今天依然如此。此外，葵菜的种植、丸都（集安）的李以及乐游的梨也都有史籍记载。
渤海国 經濟
渤海国因为气候寒冷，地产麻、毛和柞蚕丝，因此主要生产麻织品以及柞蚕丝织品。
渤海国种植苧麻，用以织布。苧麻的种植与纺织在靺鞨人、高丽人社会有着悠久的传统，渤海人在此基础上又有了发展，使麻布有了粗麻与细麻之分。渤海国曾派裴璆贡细布于后唐，亦以细白布与契丹交易。
随着大规模修筑京、府、州、县城池，以及人口增长伴随着的建房的需求，在原有的基础上，在吸收了唐的陶瓷生产技术后，渤海国的制陶业日益扩大，技术提高，产品质量发展很快。
渤海国的矿冶生产，据目前所知有铁、铜、金、银等。
在渤海国境内的遗址与墓葬中出土了相当数量的铁器。渤海国的产铁地点文献记载并不多，已知的有中京显德府铁州辖属的位城（今朝鲜咸镜北道茂山一带）。铁利府也以产铁闻名。史载辽灭渤海后，渤海国的冶铁匠人，被大量迁往契丹境内，宋王曾目睹渤海人在柳河馆冶铁：“柳河馆，河在馆旁，西北有冶铁，多渤海人所居，就河漉沙石，炼得成铁。”
渤海国 經濟
渤海人的祖先挹娄人善于航海，渤海人继承了这个传统。
渤海在立国的二百二十九年中，先后向唐、后梁、后唐入贡143次，每次使者数十人，最多时120人。从朝贡道，出鸭绿江口，扬帆出海，渡过渤海海峡，取道登州，前往洛阳、长安。渤海曾聘问日本34次，主要从盐州（今俄罗斯克拉斯基诺）出发，乘船渡过日本海，在日本越前、能登、加贺等地登陆，每次使团100人以上，有时达359人，最多时多达一千余人。这样大规模的远航，反映了渤海国具有发达的造船实力。
渤海大量饲养猪、马、牛、羊。其中猪生产于渤海全国，以扶余故地鄚颉府的产猪最为盛名。马在渤海饲养的家畜中，地位最为重要，遍及渤海全国。武力扩张与经济发展也推动了养马业的兴盛，出现了率宾府这样的著名养马区。《渤海国志长编》中《食货考》记载，公元730年（开元十八年，仁安十一年），渤海入唐，贡马匹三十匹，后再献马三十匹。
渤海国 交通
渤海的主要交通干线有五条，分别是：鸭渌~朝贡道、长岭~营州道、扶余~契丹道、龙原~日本道、南海~新罗道。
是从渤海旧国（吉林敦化）、上京龙泉府（吉林宁安渤海镇）、中京显德府、东京龙原府经鸭渌江，渡海抵登州，前往唐都长安的朝贡道。
这是一条前段陆路、后段以水路为主、联结渤海与唐的主要交通干线。
路线一：上京龙泉府——旧国——大蒲柴河——抚松——西京鸭渌府神州（临江镇）——乘船；
路线二：上京龙泉府——汪清嘎呀河——延吉——龙井——中京显德府——安图——大蒲柴河——西京鸭渌府神州——乘船；
路线三：东京龙原府——沿图们江——翻南岗山脉——沿布尔哈通河——延吉——龙井——中京显德府——安图——大蒲柴河——抚松——西京鸭渌府神州——乘船；
西京鸭渌府神州——桓州——泊汋口——东行过乌骨江（今鸭绿江支流爱河）——石人汪——杏花浦——桃花浦——青泥浦——都里镇——横渡乌湖海（渤海海峡）——乌湖岛——末岛——歆岛——龟岛——大谢岛（今山东庙岛列岛诸岛）——登州（山东蓬莱）登岸前往长安。
渤海国 交通
唐摄鸿胪卿、宣劳靺鞨使崔忻册封大祚荣后于开元二年（公元714年）从旧国返回长安途中，经过辽东半岛南端的旅顺黄金山麓，凿井两口题记留念，成为了这条朝贡道的历史物证。
营州（今辽宁朝阳），唐平卢节度使驻地，代表唐朝廷管理渤海。渤海使者，由上京龙泉府（宁安渤海镇），经旧国（敦化），取道长岭府，经过现在的桦甸、辉南、海龙、抵达盖牟、新城（今辽宁抚顺），然后经过现在的沈阳——黑山——北镇——义县（燕郡城），到达营州，再由营州越过古北口前往唐都长安。这是一条直通唐都长安的陆路交通干道，但在契丹、突厥以及安史之乱的多次遮断时，渤海与唐的使臣只好转而选择“鸭渌——朝贡道”了。
由渤海出发前往西面的契丹，必须经过渤海西部的扶余府。扶余府治为今天的农安。渤海的契丹道，大体从上京龙泉府出发，西越张广才岭至扶余府，再经现在的长岭、通辽、开鲁、天山，抵达契丹的都城临潢。