清华大学 历史
1998年5月，江泽民总书记提出建设若干所具有世界先进水平的一流大学目标，国家开始实施“985工程”。8月，清华最终制定《清华大学创建世界一流大学规划（1999-2001）》，即“985”计划，并于2003年通过一期验收。
為了邁向世界一流大學，清華進行部分院系調整。1993年12月恢复人文社会科学学院建制；1994年整合建立信息学院；1996年整合建立机械工程学院；1999年恢复法学院；1999年并入原中央工艺美术学院为美术学院；2000年整合建立土木水利学院建制，同年建立公共管理学院；2001年6月8日，清华大学深圳研究生院挂牌成立，成为清华第一個异地办学实体；2001年建立医学院，同年工业工程专业从精密仪器系分离出来建立工业工程系；2002年建立新闻与传播学院。
科研方面，1999年9月18日，中共中央、国务院、中央军委召开表彰为研制“两弹一星”作出突出贡献的科技专家大会，授予为“两弹一星”事业作出突出贡献的23名科技专家“两弹一星功勋奖章”，其中14位专家曾在清华学习或工作过。
2001年4月29日是清华大学90周年校庆日，海峡两岸的北京清华和新竹清华首次合办校庆。4月22日，北京清华校长王大中率团访问台湾，26日，新竹清华校长刘炯朗率团访问北京。此外，两校之间还举行学生排球友谊赛等诸多庆祝活动。清華的九十周年建校大会在新建成的综合体育馆举行，中共中央总书记、国家主席江泽民、国务院总理朱镕基、中央书记处书记胡锦涛等党和国家领导人出席，海内外及兄弟院校领导、有紧密联系的国内外企业代表、输送优秀生源的中学校长，以及最早为1931年毕业的各级校友出席。江泽民发表讲话，激励青年学子创造时代业绩，建设世界一流大学是中国综合国力的重要体现。
2003年初，清华明确“三个九年，分三步走”总体战略，即1994年至2002年，调整结构，初步向综合性研究型大学过渡；2003年至2011年，重点突破，跻身世界一流大学行列；2012年至2020年，整体推进，在总体上达到世界一流大学水平。最终到2050年中国基本实现现代化，争取达到或接近世界著名一流大学的水平。
2003年以来，為了邁向世界一流大學，清華继续進行部分院系調整。2004年在工程力学系、宇航技术研究中心等基础上建立航天航空学院；2006年，与中国协和医科大学紧密合作办学，成立北京協和醫學院—清華大學醫學部；2008年恢复心理学系，同年成立马克思主义学院，邢贲思任院长；2009年成立教育研究院和生命科学学院，同年复建清华国学研究院，由著名哲学家陈来任院长。2011年，成立环境学院。
科技方面，清华开展科研攻关，例如在2003年的非典期间，清华实行封校措施，取消校庆活动，严密控制出校、返校人员，保证师生教学科研安全。同时全校科研机构开展紧急非典科研攻关，生物系饶子和教授领导实验室研究“非典”冠状病毒全基因组蛋白质及相关多肽的大规模表达，环境系、清华同方、深圳清华大学研究院等开展医院垃圾无害化处理和红外线快速体温检测仪器研制生产，并大规模投入使用。清华同方还为附中、附小建设网络教育平台，并对外免费开放远程教育。
然而清華在建設一流大學的同時，也遇到一些困境。學科建設方面，人文學科規模不大，醫學部分一直無法與協和合併；青年教師住房問題長期無法妥善解決；2005年的水木清華BBS事件讓學生與校方嚴重對立，最終學生在校外创办水木社区（“新水”，与校方“旧水”对应）。
根据清华明确的“三个九年，分三步走”总体战略，2012年至2020年是清华大学建设世界一流大学的第三个九年，战略提出清华大学应整体推进，在总体上达到世界一流大学水平。最终到2050年中国基本实现现代化，争取达到或接近世界著名一流大学的水平。
2010年，清华在校庆日上宣布启动“百年校庆年”，发布校庆标识，公布校内道路命名方案，开始举办各类学术活动、社会服务、校友互动等。同年7月，北京清华大学和新竹清华大学组成“两岸联合登山队”共同攀登唐古拉山脉中段的各拉丹东雪山。2011年4月24日上午，“庆祝清华大学建校100周年大会”于人民大会堂召开，胡锦涛（1965届水利系校友）、吴邦国（1967届无线电电子学系校友）、温家宝、贾庆林、习近平（1979届工程化学系校友）、李克强等党和国家领导人，北京大学校长周其凤等国内大学代表，耶鲁大学校长莱文等国外大学代表，国内外知名学者代表，台湾新竹清华大学代表团，清华校友代表和师生代表，共8000多人出席大会。校庆前后，胡锦涛、朱镕基（1951届校友、经管学院首任院长）先后回校考察访谈，深圳大运会圣火采集仪式在清华举行，全球130余所大学校长齐聚清华参加“2011大学校长全球峰会暨环太平洋大学联盟第15届校长年会”，世界知名经济学者齐聚清华参加“国际经济学会第16届全球大会”，清华校友、社会人士成立清华新百年发展基金支持清华发展。
百年校庆上，中共中央总书记胡锦涛提出新的建設一流大學計畫，稱為2011计划，與985工程、211工程不同，此計畫取消終身制。百年校庆后，清华又接连入选一系列建设名单，2015年，習近平推出雙一流建設。2016年，985工程、211工程相繼取消。2017年9月21日，教育部公布雙一流建設名單，清華入選為一流大學建設A類高校，並同時有34個學科入選一流學科。2017年12月28日，清华正式发布《“双一流”建设方案》。
百年校慶之後，清華在辦學上也同样有所突破，2012年，中国人民银行研究生部并入成为清华大学五道口金融学院，成立人文学院、社会科学学院、材料学院。2013年4月，美国黑石集团董事长苏世民宣布向清华大学个人捐赠1亿美元，并筹集2亿美元创建“清华大学苏世民学者项目”，2015年6月18日，清华大学與美国华盛顿大学和微软公司合作创建全球创新学院，这是中国大學第一次到美国办学，建立第一个实体校区和教育科研平台，同年，成立药学院。2016年成立專門培養未來的世界領導者的蘇世民書院，並招收第一屆學生。2018年，成立人工智能研究院；与香港大学签约合办本科双学位课程，2019年，成立天文系、车辆与运载学院；与香港中文大学签约合办本科双学位课程，2020年，成立清华大学万科公共卫生与健康学院、清华大学人工智能国际治理研究院、清华大学智能产业研究院。2021年，成立清华大学求真书院；成立清华大学集成电路学院；建立通用人工智能实验班；成立清华大学北京市中医药交叉研究所；成立清华大学健康中国研究院；成立清华大学碳中和研究院；成立清华大学-中国长江三峡集团有限公司气候变化治理机制与绿色低碳转型战略联合研究中心；入选国家智能社会治理实验基地教育特色基地。成立清华大学-中国电子数据治理工程联合研究院。2022年，组建清华大学闻泰科技工业与车规半导体芯片联合研究中心；成立为先书院。
百年校慶之後，清華在教學上進行一些改革。2014年12月，清华大学成立本科生课程咨询委员会（简称课咨委），成为中国大陆第一个学生参与学校教学管理的学生组织。2015年7月8日正式成立的清华大学教学委员会，就在委员会章程中规定，对于涉及本科生的决议，应该通过课咨委征求学生意见。2015年，進行学分绩改革，此年入學的本科生和研究生新生開始，學期成績從百分制改為等級制，在選課制度上，执行“候选队列”方案，取消退课费，並延長退課時間，讓選課更有彈性，降低學生壓力。2017年開始，清華實施大類招生與大類培養，將原本的本科專業分為16個大類，目的是打破學科界限，培養交叉復合型人才。2018年起，本科生中开设“写作与沟通”必修课程，以提升学生的写作能力、沟通能力、逻辑思维和批判性思维能力。成立语言教学中心，以提升学生用非母语交流的能力，並從2019年開始，第二外语成为本科生的必修课。