澳門輕軌 爭議
當日傍晚澳門輕軌股份有限公司發出新聞稿，表示輕軌公司將於4月起直接負責澳門輕軌大部分運營及維修工作，為確保澳門輕軌日常營運不受影響，輕軌公司自2023年起陸續開展招聘人員程序。
此外，輕軌公司亦已要求港鐵（澳門）遵守法律處理人員離職安排，該公司亦為港鐵（澳門）的員工專門舉辦了17場講解會，介紹相關招聘及入職事宜。有關港鐵（澳門）員工就入職輕軌公司的各種查詢，已全數作出回應及跟進。但對於港鐵（澳門）員工轉職至輕軌公司後重新計算年資之事宜隻字不提
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2024年3月22日傍晚，港鐵（澳門）發出新聞稿澄清公司立場，表示該公司一直竭力支持並配合輕軌公司自2021年第三季度起分批接管部分職能及相關的澳門員工的要求；又曾向輕軌公司提出有關轉職員工之公積金計算和工作年資等事宜之建議，另外又提到員工由港鐵（澳門）轉職至輕軌公司均嚴格遵循澳門相關的法律法規。新聞稿最後更指出港鐵（澳門）就澳門輕軌營運所產生的開支不能作出單方批准，暗指港鐵（澳門）的開支審核涉及其他方參與。
2024年3月24日，澳門立法會議員林宇滔就港鐵（澳門）員工轉職輕軌公司之年資及勞動權益等事宜，向立法會提出書面質詢。林宇滔批評相關舉措有損員工利益及嚴重影響公營企業形象，以及批評輕軌公司「完全未有交代」四月一日或之前由港鐵（澳門）轉入輕軌公司的員工年資、職級以及其他福利會否受影響等問題。另外，輕軌公司作為政府全資擁有的公共資本企業，他批評輕軌公司相關做法明顯違反《公共資本企業法律制度》中的「公平公正原則」。他促請政府合法合理處理員工轉職輕軌公司之相關事宜，保障員工權益及穩定員工士氣。
2024年3月26日，自澳門輕軌股份有限公司及港鐵（澳門）分別在3月21日及22日就員工轉職爭議發出新聞稿後，兩間公司再沒有就相關事件再作更多的說明及補充，勞資爭議事件繼續發酵。澳門立法會議員林宇滔亦再就港鐵（澳門）員工轉職澳門輕軌股份有限公司之年資及勞動權益等事宜，向澳門特別行政區行政長官賀一誠致函，要求行政長官賀一誠在輕軌營運交接日(即4月1日)前清晰交代處理方案，確保輕軌員工合法權益不受損害，同時監督輕軌公司的上級及監管部門，包括交通事務局、公共資產監督管理局等亦必須確保相關的員工轉職過程依法進行。隨函附上輕軌員工對是次轉職事件表達的意見及想法。相關信函亦同時抄送至運輸工務司司長羅立文、交通事務局局長林衍新、公共資產監督管理局局長陳海帆、澳門輕軌股份有限公司主席何蔣祺及港鐵軌道營運(澳門)一人有限公司。
2024年3月27日，澳門立法會議員林宇滔表示港鐵（澳門）向轉職輕軌公司的員工發放「特惠金」，「特惠金」按勞動關係法規定之解僱賠償方式計算。但就其他勞資爭議議題例如公積金問題、轉職後職稱被降級、轉職後職級被降級等問題尚未解決，相關解決方案並不盡如人意。除此之外，林宇滔引述輕軌職員表示，輕軌公司管理層的鐵路經驗比基層員工少，有「外行人管內行人」之嫌，而此次事件令人感覺管理層並不重視行業內的專業人才。林宇滔又表示輕軌公司管理層就員工轉職之處理手法差劣，以及此次事件已造成員工士氣嚴重受損及傷透人心，質疑未來輕軌公司如何做好管理及提供可靠的客運服務，以及要求特區政府就此次風波追究相關管理者的責任。
2024年4月1日，輕軌運營及維護工作改由澳門輕軌股份有限公司直接負責。同時，輕軌公司亦持續安排聘用港鐵（澳門）人員，至今已有超過400名原港鐵（澳門）人員於當天入職輕軌公司。而港鐵（澳門）的營運及維護服務合同於同年12月完結。
2024年9月5日至6日，受超強颱風摩羯影響，地球物理氣象局發出該年首個八號風球共16小時，期間輕軌服務於八號風球前1小時即21:00分別由氹仔線兩端總站開出；亦是輕軌跨海段通車後首次在颱風影響下停駛。
2024年9月6日下午2時，氣象局正式改發三號風球，不少市民急於上班返回工作崗位，但輕軌服務未有如公共巴士或電召的士般於八號風球解除後同步恢復，引起社會質疑輕軌未能起到公交疏導作用，最終在風球改發後的兩小時才恢復營運；據澳門輕軌股份有限公司指引，輕軌路軌、電纜等設備硬件大多處於露天位置，路檢人員需於改掛風球後才開展檢查，或需要一定時間，且輕軌只有固定軌道，未能如巴士般若路上有障礙物可行駛其他通道，故在颱風下恢復出發的服務時間亦與巴士有所不同。交通諮詢委員會委員葉偉強表示，留意到網上有不少意見對地球物理氣象局改發三號風球時間尷尬，導致當天下午出現多處道路擠塞情況，他同時建議檢討輕軌從八號改發三號風球後的恢復時間，減輕路面塞車情況及疏導部分人流。傳新澳門協會理事長兼第七屆澳門立法會直選議員林宇滔則呼籲政府檢討輕軌定位和作用，與鄰近地區同樣有露天段的列車，在颱風期間仍能維持服務相比差距明顯，若輕軌能在交通高峰期有效運作，將有助緩解城市交通壓力。
2024年9月9日，輕軌公司在官網回應指，由於設施絕大部分暴露於戶外空曠環境，在受颱風等惡劣天氣情況時，容易受外來物件損壞。故此，在發出八號或以上風球時，基於乘客安全為前提，公司必須安排輕軌列車全線服務暫停，所有車站也會關閉；另基於工作人員安全考慮，只有當八號正式下調為三號時，才安排工程車輛沿線進行檢查，根據以往經驗全線檢查至於亦需兩小時，同時優化停運復運信息發佈安排
2025年6月25日，輕軌公司調整八號或以上風球發出前尾班車開出和風球解除後首班車復運的安排。
2024年9月29日，在慶祝中華人民共和國國慶75周年免費乘車日首日，氹仔線於下午1時半起出現故障，導致乘客滯留車站超過半小時，在故障後40分鐘才公佈列車延誤，隨後在下午近3時才宣佈除媽閣站至海洋站一段外，其他站點全線暫停，到下午約4時左右才全線恢復營運。故障事件引起坊間及訪澳旅客批評，包括輕軌公司未有及時進行消息發佈，並未有安排免費接駁巴士往來氹仔線沿線站點，更有社會人士要求輕軌公司檢討應變機制如何及時發佈、處理、調查事故原因，以及要求輕軌公司就故障事件應在24小時內向交通事務局提交初步調查報告，除此之外，八號風球下停運及復運安排、票務系統過時爭議及員工轉職事件等影響輕軌公司的形象及員工整體士氣，加上相關部門並未有按照《公共資本企業法律制度》對輕軌公司依法進行營運績效評核監督及整頓，導致輕軌公司長期經營不善。
2024年10月15日，澳門輕軌股份有限公司表示，就不足一個月內兩度發生列車故障，已與列車系統供應商三菱重工召開緊急會議，要求供應商必須查明和釐清故障原因，並提出改善措施建議，以防再次出現同樣問題。輕軌公司另於2024年11月中旬回覆澳門立法會直選議員顏奕恆關於優化輕軌配套服務的書面質詢時透露指除了持續優化輕軌電子支付方式，在遇有突發情況時，輕軌公司已有既定的機制和程序，讓乘客在安全和有序情況下離開列車和車站，並向當局通報輕軌運營事件、事故及意外，亦會按照法律法規的相關要求作跟進。對於故障事件影響系統運作和服務，已要求列車系統供應商必須查明和釐清故障原因，並提出改善措施建議，以防再次出現同樣問題。會檢視及優化信息發佈，讓公眾掌握復運安排。輕軌公司亦有既定機制，視乎情況酌情處理有關票務事宜。
2025年1月18日，運輸工務司司長譚偉文與多個組織座談會，其間表示相關部門會致力解決，包括列車故障、極端天氣後復運需時較長等問題，亦會與各範疇加強跨部門合作，做好整體規劃，優化監督機制，進一步完善城市建設及基建項目。
2025年4月20日，在復活節假期第三天，氹仔線於當天上午10時半左右出現供電故障，導致一輛開往媽閣站方向即將駛入馬會站的列車中途停頓，約有30名乘客被困車廂，其中一名五旬本地男子不適但拒絕送院。期間氹仔線媽閣站至協和醫院站列車服務一度暫停近三小時，澳門輕軌股份有限公司作致歉指將進一步檢查系統及完善事故通報、現場指示等安排。有乘客指輕軌公司沒有加強指示、公佈或提示輕軌出現服務故障，影響輕軌服務的印象。有本地社會團體直指輕軌系統運營穩定性不足的根本性問題、信息發布透明度不足，建議在事故發生後應增加臨時接駁巴士的頻率，建立“15分鐘應急通報機制”，確保公眾在突發事件中能即時獲取信息，及時調整行程，減少對出行造成的影響。澳門立法會議員施家倫促請當局交代在利用數據化分析故障和潛在問題的應用情況，建議加大投入合適的智慧化系統，提升輕軌服務品質和安全性，應對未來不斷增長的客流量及運營壓力。另一議員李良汪表示輕軌故障期間僅於通知形式在網站公佈，影響居民和旅客使用服務，呼籲當局及輕軌公司檢討通報機制，促請政府加強信息透明與管理水平，又提到高架車站候車區採用非密封式設計，每逢遇上暴雨，雨水便從上蓋滲入候車區，嚴重影響候車環境。交通咨詢委員會委員張淑玲表示，頻繁故障不僅影響居民日常出行，更損害澳門旅遊城市的形象，她督促檢討並查明故障成因，完善事後通報機制以降低對乘客的影響。