뉴캐슬 유나이티드 FC의 역사 역사
그 이후 블랙번 로버스의 감독이었던 그레엄 수네스가 롭슨을 대신하여 감독으로 취임하였지만, 많은 문제를 일으키며 14위에 머문다. 14위는 그 당시 뉴캐슬 유나이티드가 프리미어리그에서 기록한 가장 낮은 순위였다. 다음 시즌인 2005-06 시즌 알베르 루케를 1,000만 파운드에, 마이클 오언을 클럽 최다 이적료인 1,600백만 파운드에 영입하였다. 마이클 오언과 앨런 시어러는 좋은 호흡력으로 득점을 만들어냈지만, 오언은 다음 2시즌 대부분을 부상으로 보냈고, 루케 또한 부상으로 이렇다한 활약을 보이지 못하였다. 결국 그 해 성적은 강등권에 머물렀고, 수네스는 자신의 무능력함을 여실히 증명하며 2006년 2월 2일 전격 경질되었다.
수네스를 이어 글렌 뢰더가 감독 대행을 맡았다. 뢰더는 2005-06 시즌이 끝날 때쯤 클럽 순위를 15위에서 6위까지 올려놓으며 이를 인정받아 2년 정식 계약을 체결하였고, 앨런 시어러는 이 시즌에 재키 밀번의 최다 득점 기록인 200골을 넘기며 클럽 최고 득점 기록을 경신하였다. 시즌이 끝나고 시어러는 은퇴하였는데, 그때의 골 수는 206골이었다. 2006년 UEFA 인터토토컵을 우승하였지만, 2006-07 시즌 선수들의 잦은 부상 등 악재가 겹쳐 좋은 성적을 보이지 못하자 뢰더는 2007년 5월 6일 상호 협의 아래 감독 자리에서 내려왔다. 5월 15일 볼턴 원더러스의 감독이었던 샘 앨러다이스를 선임하였는데, 이것은 프레디 셰퍼드가 단장으로서 한 마지막 행보였다. 그리고 그 해 6월 7일에 마이클 애슐리에게 그의 마지막 주식을 모두 팔고 크리스 모트에게 단장 자리를 넘겨주었다.
마이클 애슐리는 존 홀 경 시절보다 더욱 강력한 클럽을 만들기를 원했다. 2007-08 시즌 샘 앨러다이스는 자신의 친정팀인 볼턴 원더러스와의 경기에서 3-1로 승리하는 등 출발은 좋았으나, 약체 더비 카운티에게 패하는 등 부진을 거듭하였고, 팬들의 압박 속에 2008년 1월 9일 경질 되었다.
1월 16일, 뉴캐슬 유나이티드는 케빈 키건을 다시 감독직으로 불러들인다는 놀라운 결정을 한다. 키건이 1997년 1월 8일 클럽을 떠난 지 11년 8일만이었다. 이 결정은 팬들에게 큰 희망을 가져다 주었다. 나아가 2008년 1월 데니스 와이즈를 풋볼 디렉터로, 토니 히메네즈를 부단장(선수 영입 담당)으로, 제프 베테레를 기술직으로 영입하는데, 이는 키건을 보조하기 위해 대륙의 축구 운영 방식을 접목시킨다는 계획으로, 감독이 선수 영입을 요청하기 전에 이들에게 초본을 작성한다는 방식이었다. 같은 해 7월 마이클 애슐리의 오랜 파트너였던 데릭 램바이어스가 크리스 모트를 대신하여 단장 자리를 맡았다. 2007-08 시즌의 여름 이적 시장이 막을 내린 후 9월 4일 키건은 클럽 운영진과 3일 간의 회담 끝에 “새로 취임한 운영진의 관리 아래에선 감독을 제대로 맡을 수 없다”며 감독직을 사임한다 이 때 키건을 사임하게 만든 클럽 운영진, 특히 데니스 와이즈와 마이클 애슐리에 대한 비판이 팽배하여 키건이 사임하던날 세인트 제임스 파크 밖에서는 대규모 시위가 열렸고 이것은 다음 홈 경기인 헐 시티와의 경기에서 더 심해졌다. 또한 알렉스 퍼거슨 경과 아르센 벵거 같은 다른 프리미어리그의 감독들도 키건의 사임과 관련하여 클럽 운영진들을 비판하였다. 결국 마이클 애슐리는 계속된 팬들의 압박에 구단을 매각하기로 결정한다.
2008년 9월 26일부터 조 키니어가 임시 감독을 맡게 되었는데, 이 계약은 마이클 애슐리가 구단을 매각할 때까지만 감독을 맡는다는 것이었지만, 10월 한 달 계약 연장을 하였고, 곧 시즌 종료까지 지휘를 맡게 되었다. 그리고 그 해 12월 마이클 애슐리는 적절한 새 구단주를 찾지 못했다는 성명서를 발표하였고 구단을 팔기로 한 결정은 폐기되었다. 애슐리는 성명서를 통해 자신은 아직도 뉴캐슬 유나이티드에 대해 큰 애정을 갖고 있으며 클럽이 더 나은 길을 찾아가기 위해 무엇이든 할 것이라고 밝혔다. 조 키니어와 정식 계약을 체결하려 했지만 2009년 2월 키니어는 자신이 항상 갖고 있던 심장 문제로 심장 수술을 받게 되었고, 요양을 위하여 감독직을 사임한다.
2009년 4월 1일 뉴캐슬 유나이티드는 당시 BBC의 《매치 오브 더 데이》 고정 패널을 맡고 있던 앨런 시어러를 클럽을 강등에서 구해내기 위하여 임시 감독으로 임명하였는데, 이는 모두를 깜짝 놀라게 하는 감독 선임이었다. 시어러가 감독직을 맡음과 동시에 논란의 중심에 있었던 데니스 와이즈는 클럽을 떠났고, 클럽 운영진은 풋볼 디렉터라는 직책은 다시 생기지 않을 것이라고 발표하였다. 북동부의 프리미어리그 세 클럽인 뉴캐슬 유나이티드, 선덜랜드, 미들즈브러는 강등권 사투를 벌이고 있었고, 시어러의 임명에도 불구하고 뉴캐슬 유나이티드 리그 마지막 경기에서 애스턴 빌라에 0-1로 지며 그들의 프리미어리그 역사상 첫 강등을 확정짓게 된다. 강등 이후 뉴캐슬 유나이티드는 많은 선수들이 떠났고, 마이클 애슐리 구단주는 클럽을 매각하겠다는 발표를 하였으며, 감독인 시어러의 거취 문제 등으로 인해 조용할 날이 없었다. 거기에 프리시즌 경기에서의 1-6 대패와 보비 롭슨 경의 사망은 분위기를 더욱 악화시켰다.
뉴캐슬 유나이티드는 풋볼 리그 챔피언십에서 2009-10 시즌을 시작한다. 앨런 시어러는 결국 정식 감독이 되지 못하였고, 코치였던 크리스 휴턴이 임시로 지휘봉을 잡는다. 여러 언론들은 뉴캐슬 유나이티드의 전망을 비관적으로 바라봤고, 프리미어리그로의 승격은 힘들어 보였다. 그러나 크리스 휴턴은 뛰어난 지도력으로 리그 초반 뉴캐슬 유나이티드를 1위에 올려 놓았고, 그 공을 인정받아 정식 감독으로 임명되었고, 동시에 마이클 애슐리 구단주는 클럽 매각 계획도 철회한다. 그리고 2009년 4월 5일 시즌 종료 5경기를 남겨두고 승격을 확정 지었으며, 우승을 차지, 1시즌 만에 프리미어리그로 승격에 성공한다.
2010-11 시즌 1라운드 맨체스터 유나이티드와의 경기를 통해 프리미어리그 복귀전을 치른 뉴캐슬 유나이티드는 그 이후 홈에서 애스턴 빌라에 6-0 대승을 거두며 돌풍을 예고했고, 지역 라이벌인 선덜랜드, 강호 아스널 등에 승리를 거두며 한시적으로 5위에 올라서기도 했다. 하지만 이러한 성과에도 불구하고 2010년 11월 6일 웨스트 브로미치 앨비언과의 경기 후 크리스 휴턴 감독은 경험이 많지 않다는 이유로 해고된다. 이후 새 감독으로 앨런 파듀가 선임되었고, 얼마 지나지 않아 겨울 이적 시장에서 공격수 앤디 캐럴을 리버풀에 3,500만 파운드에 팔아버리자 팬들의 분노는 극에 달한다. 이런 안좋은 분위기에 경기력까지 저하된 뉴캐슬 유나이티드의 미래는 상당히 암울해 보였다. 하지만 앨런 파듀 감독은 클럽을 잘 추스렸고, 그 시즌을 12위로 마감하였다. 한편, 이 시즌 최고의 경기로 아스널과 4-4로 비긴 경기가 뽑히기도 하였다.
2011-12 시즌 뉴캐슬 유나이티드는 주장인 케빈 놀런과 호세 엔리케, 조이 바턴 등 전 시즌의 주력 선수들을 내보내고 아템 벤 아르파, 요앙 카바예, 실뱅 마르보, 가브리엘 오베르탕을 영입하여 이른바 ‘프렌치 커넥션’(French Connection)을 형성한다. 또한 전 시즌 웨스트 햄 유나이티드에서 좋은 활약을 펼쳤던 공격수 뎀바 바를 자유 계약으로 영입하였음에도 언론은 주력 선수들이 빠져나간 뉴캐슬 유나이티드의 전망을 밝게 보지 않았다. 그러나 그런 전망을 비웃기라도 하듯, 이적생들의 활약에 힘입어 12 라운드 맨체스터 시티 전에서 패하기까지 11경기 무패를 기록한다. 이후 주력 선수들의 부상으로 잠시 주춤했지만, 숙적이였던 맨체스터 유나이티드를 상대로 11년만에 승리를 거두었고, 겨울 이적 시장에서 SC 프라이부르크의 파피스 시세를 데려오며 공격력을 보강한다. 새로운 9번 파피스 시세는 득점 행진을 이어가며 클럽의 상승세를 이끌었고, 이에 힘입어 뉴캐슬 유나이티드는 시즌 막판까지 아스널, 토트넘 홋스퍼와 UEFA 챔피언스리그 진출권을 따내기 위해 경쟁하였지만, 5위를 기록하여 UEFA 유로파 리그 진출권을 획득하며 2006-07 시즌 이후 오랜만에 유럽 대회에 출전하게 되었다. 2012-13 시즌 9월 뉴캐슬 유나이티드는 앨런 파듀 감독과 8년 계약을 체결하였다.