過去に存在した長崎屋の店舗 過去に存在した店舗
岐阜店（岐阜市日の出町1-21-23、1975年（昭和50年）4月26日開店-2002年（平成14年）2月11日閉店）
鉄筋コンクリート造り地上9階地下1階建てのビル。店舗面積約4,174.5m2 → 約4,211m2。
閉店後、店舗跡の前にある広場で柳ヶ瀬の活性化を目指した「夜空カフェ」が2012年（平成24年）から毎月第1金曜日に開催され、2015年（平成27年）12月には店舗跡の1階を開放してその会場となった。
約20年間遊休不動産になっていたが、2022年3月1日に岐阜市都市計画審議会で都市計画決定案が承認され、ビルを解体して広場として整備される見通しになった。
熱海店（熱海市清水町6-20、1963年（昭和38年）6月21日開店 - 1992年（平成4年）2月閉店）
店舗面積1,452m2 → 1,815m2。
店舗跡は解体されて熱海市営清水町駐車場となっており、2011年（平成23年）1月28日に熱海市の消防庁舎建設の候補地として地元住民への説明会が行われた が、東日本大震災後に津波に被災しかねないとの問題点が指摘されたため同年6月10日に移転計画を正式に断念することが発表された。
富士宮店（富士宮市中央町5-6、1975年（昭和50年）6月10日開店 - 2002年（平成14年）閉店）
地下1階地上7階建て、店舗面積約11,900m2。
地下1階に「ひのや」と共同出資した「サンドール静岡」が食品スーパーを出店していた。
富士宮駅の北側にあった店舗で店舗跡は解体され、跡地には駅前のペデストリアンデッキと2階で接続して1・2階の一部に富士宮市中央公民館と駅前交流センターが入居する13階建てマンションをセキスイハイム東海が2012年（平成24年）1月に着工した。
豊橋店（豊橋市駅前大通り2-33-1、1972年（昭和47年）11月16日 - 1980年（昭和55年）1月15日閉店）
地元商店街の協業化のために豊橋公民館跡を中心とする敷地面積1,519m2に建設された鉄骨鉄筋コンクリート建て地下1階地上8階建、延べ床面積約15,000m2のサンマートビル(豊橋商業センター)の核店舗として地上1階から3階までの半分と4階以上8階の全フロアを使用し開店した。店舗面積約5,751m2。
店舗面積約3,432m2。
閉店後に建物は総合開発機構に買収され「開発ビル」に改称。一時は「エイデン（当時は栄電社。店舗名は『テクノ豊橋』）」が入居していた時期もあった。現在は商店や飲食店のほかに豊橋市駅前窓口センター、駅前文化ホール、愛知県東三河県民プラザ旅券センターなどの公共施設が入居している。
2013年（平成25年）3月末に「豊橋市駅前文化ホール」が閉鎖された。（長崎屋時代はボウリング場だった同ビル9階以上を改装して使用されていた）代替施設として2013年（平成25年）4月30日に『穂の国とよはし芸術劇場（プラット）』が開設された。
隣地にある名豊ビル・木島ビル・狭間児童公園を含めた1.5haの駅前大通2丁目地区市街地再開発事業計画を地権者などでつくる準備組合と豊橋市で協議中である。
なお長崎屋は、当店閉店から37年後の2017年10月13日に「MEGAドン・キホーテ豊橋店」を出店、豊橋市へ再進出している。
豊田店（豊田市喜多町2-38、1971年（昭和46年）9月18日開店 - 1991年（平成3年） 8月25日閉店）
敷地面積約1,475.06m2、鉄筋コンクリート造一部鉄骨コンクリート造地下1階地上8階建て塔屋1階、延べ床面積約9,652m2、店舗面積約6,237m2（直営店舗面積約4,301m2）。
豊田市駅前の地下1階地上6階(一部7階)建、延べ床面積約9,900m2の『豊田中央開発』の再開発ビルの核店舗として地上1階から地上6階までで出店していた。
地下1階にはヤマナカが入居して食料品売り場を担当し、7階には映画館のアート座があった。
閉店後、跡地には1階においでん横町が開業したが振るわず僅か数年で撤退、その後も建物自体は使われないままそれから25年近く残ったままになっていた。2015年の再開発工事時に周辺の廃墟と共に取り壊され、2017年には跡地にKiTARAが開業した。
四条店→Big-Off四条店（京都市下京区立売東町12-1、1968年（昭和43年）4月24日開店 - 2001年（平成13年）11月30日閉店）
店舗面積約2,310m2。
1987年（昭和62年）5月にディスカウントストアに業態転換した。
再建3年計画の一環として土地と建物を1994年（平成6年）7月に勧業不動産へ売却したが、その後も賃借に切替えて営業を継続した。
賃料引き下げ交渉を行って損益改善を目指したが所有者との協議が決裂したため閉店となった。売場面積約2,000m2の小型店だった。
寝屋川店→Big-Off寝屋川店（寝屋川市桜木町663、1971年（昭和46年）3月6日開店 - 1999年（平成11年）3月22日閉店）
平田ビル、敷地面積約1,254m2、地下1階地上7階建て、延べ床面積約8,910m2、売場面積5.610m2 → 約4,485m2。
建物は解体済み。閉店後に1階にジャンボカラオケ広場、2階にブックオフが出店したが2018年（平成30年）1月末で閉店し、3階に出店した100円ショップシルクが2012年（平成24年）12月末で閉店した。
岸里店（大阪市西成区千本北1-11-32、1968年（昭和43年）8月20日開店 - ）
敷地面積約3,150m2、鉄筋コンクリート造地上3階建て一部4階、延べ床面積約5,579m2、店舗面積約3,143m2（当社店舗面積約1,963m2）。
鉄筋コンクリート造地上3階建て。敷地面積3,150m2、延べ床面積5,578.928m2、店舗面積約3,376.833m2（長崎屋店舗面積約1,963.053m2）。
岸の里デパート(現・ビック岸の里)2階。長崎屋閉店後岸の里デパートは、ビック岸の里に店名変更。(ビック岸の里は、2018年10月末で閉店予定。)
堺東店（堺市堺区中瓦町2-88、1970年（昭和45年）11月18日開店 - 1990年（平成2年）閉店）
地下1階地上8階建て、延べ床面積9,821m2、売場面積約6,284m2（直営売場面積約5,692m2）
南海高野堺東駅西口の南西側に出店していたが、近隣にイズミヤやニチイ、ダイエー(これらは全て撤退)のほか高島屋があってオーバーストアとなっていた。その後はテナントビル(現在の名称はテクノ大徳ビル)としてつかわれている。
北野田店（堺市東区北野田15-1、1970年（昭和45年）10月10日開店 - 1995年（平成7年）4月閉店）
敷地面積約5,000m2、鉄筋コンクリート造地下2階地上2階建て、延べ床面積約10,032m2、店舗面積約6,262m2 → 約8,625m2（直営売場面積約5,516m2）。
食料品部門をライフ北野田店に譲渡後も営業したが閉店。地上1階と地下1階の売場面積約3,203m2に拡張して1995年（平成7年）7月6日にライフ北野田店として開業した。）
堺小阪店 → 泉北店（堺市小阪270（現・南区）、1984年（昭和59年）6月24日開店 - 2002年（平成14年）閉店）
敷地面積約8,420m2、鉄筋コンクリート造地下1階地上2階建て塔屋3階、延べ床面積約20,630m2、店舗面積約16,890m2（当社店舗面積約9,104m2）、駐車台数約900台。
泉北高速鉄道深井駅に近い「泉北紡績」工場跡地に同社が開発したショッピングセンターの核テナントとしての出店。
店舗跡には2002年（平成14年）11月15日にイズミヤ泉北店を核店舗としてほかに29のテナントが入店するショッピングセンターのアンディが開店。
御影店（神戸市東灘区御影本町4-653、1970年（昭和45年）11月27日開店 - 2009年（平成21年）5月31日閉店）
阪神電気鉄道御影駅前にあった
地下1階地上8階建てのビルに出店していた店舗で、地下1階から地上6階まで7層の売場という多層階型の総合スーパーだった。
開業時には売場面積約4,950m2で、専門店6店を併設していた。
阪神・淡路大震災で被災して休業し、修復を終えて1995年（平成21年）11月9日に営業を再開した。
2008年（平成20年）9月に赤字経営ではないが富裕層の多い御影地区に合わせた営業形態を模索したとして2009年（平成21年）1月末で閉店する 方針をいったん固めたものの近隣住民の要望などを受け撤回した が、2009年（平成21年）5月に同月末での閉店することになった。
建物は2021年まで、1階と2階のみ使用され、1階にローソンとライフォートが、2階にゲオが入居していたが、2021年(令和3年)1月に解体され、2022年(令和4年)4月にJR西日本不動産開発によりVIERRA御影として薬局(ココカラファイン)とフィットネスクラブが先行開業し、同年5月にコンビニエンスストア(ローソン)が開業し、クリニック等は遅れて開業することになった。
（2代目）尼崎店→Big-Off尼崎店（尼崎市神田北通4丁目、1970年（昭和45年）4月26日開店 - 1990年（平成2年）3月18日に火災が発生→翌年解体）
移転し開店。
1987年（昭和62年）11月にディスカウントストアに業態転換した。
尼崎中央商店街四番街内にあり、阪神電気鉄道尼崎駅から出屋敷駅にかけて広がる「尼崎中央・三和・出屋敷商店街」の集客の核施設だったが、1990年（平成2年）3月18日に発生した長崎屋火災で死者15人を出したため、建物が解体されてその後約12年間更地となっていた。
商店街の中心部に更地のため商店街を分断する存在となっていたが、2002年（平成14年）8月に1階と2階が店舗の15階建て分譲マンション が建設された。
伊丹店→シャル伊丹店（伊丹市若松町411-5、1970年（昭和45年）11月20日開店 - 1990年（平成2年）頃閉店）
阪急伊丹駅東側に出店していた が、尼崎店火災のあおりを受け、閉店後解体。なお、この店舗には当初、映画館 や長崎屋ボウル（ボウリング場）も併設されていた。店舗跡地は2003年（平成15年）時点で駐車場となっていた。
店舗面積約3,250m2 → 約4,534m2。
奈良店（奈良市大森町47-3、1985年（昭和60年）9月27日開店 - 2002年（平成14年）閉店）
鉄筋コンクリート造地下1階・地上2階建て。敷地面積7,786.47m2、延べ床面積10,935.895m2、売場面積約5,490m2（当社店舗面積約3,220m2）、駐車台数約350台。
大東ビルディングに出店していた
店舗跡に2002年（平成14年）5月24日にヤマダ電機が開店し、2002年（平成14年）6月16日にスーパーの丸進が開店した が、ヤマダ電機が移転後はセリアとなったが、2011年10月より寝具リースを手掛ける小山の本社として使用。
和歌山店（和歌山市元寺町5-2、1970年（昭和45年）12月5日開店 - 2002年（平成14年）11月17日閉店）
敷地面積約3,305m2、鉄筋コンクリート造地下1階地上4階建て、延べ床面積約28,111m2、店舗面積約13,137m2。
跡地は複合商業施設「CITY!WAKAYAMA」である。
同社初の郊外型ショッピングセンターで、開業時点で、地下1階地上4階建て延べ床面積約8,000坪に47店の専門店のほか銀行や診療所、ボウリング場（4階）、200台収容の地下駐車場を備えていた。
最盛期の1990年（平成2年）に売上高約66.82億円を上げたが2001年（平成13年）に売上高約29.86億円へ落ち込むなど数年間赤字が続いていたため閉店となった。
黒崎店（北九州市八幡西区黒崎3-2-1、1974年（昭和49年）10月31日開店 - 2002年（平成14年）2月11日閉店）
店舗面積約6,402m2。
井筒屋の黒崎店(旧店舗)に隣接して開店し、最盛期の1992年（平成4年）2月期に売上高約56億円を上げていたが、2000年（平成12年）2月期に売上高約18.83億円で当期損失約1.22億円の赤字に転落したため閉店となり、九州から全面撤退となった。その後、2019年（令和元年）6月27日にイオン福重店跡地にMEGAドン・キホーテ福岡福重店を出店し、17年ぶりに九州再進出となった。
大分店（大分市中央町2-1-30、1971年（昭和46年）4月28日開店 - 1988年（昭和63年）2月閉店）
敷地面積約1,914m2、鉄筋コンクリート造地下1階地上8階建て、延べ床面積約15,345m2、店舗面積約10,230m2。
中央町商店街の一角に出店していた。
1983年（昭和58年）3月10日に大分シャルに転換。閉店後に解体され、跡地はパチンコ店とゲームセンター。
熊本店（熊本市中央区手取本町5-1、1971年（昭和46年）10月16日開店 - 1984年（昭和59年）2月29日閉店）
敷地面積約1,584m2、鉄筋コンクリート造地下2階地上9階建て、延べ床面積約14,850m2、店舗面積約8,580m2（直営店舗面積約4,950m2）。
新世界グリルを経営していた地場資本の三陽が熊本市手取本町に建設した新世界会館の核店舗として地上1階から7階までで出店していた。
地階の食堂街や2階1部の新世界グリルなどの飲食店は三陽が自から営業していた。
1986年（昭和61年）5月1日に熊本パルコが新世界会館の建物に開店している。
店舗面積1,023m2
店舗面積2,000m2
店舗面積1,310m2