神獄塔 メアリスケルター 登場人物
「ジェノサイド・ピンク」という呼称そのものは、地上の人間が“物語の主人公に擬態して産まれ落ちた少女”に付けたものであり、本来ならば「血式少女」と全く同質の少女たちを指していた。しかし十数年の月日の間に、あるいは同士討ちによって、そしてあるいは処刑台少女の3人に駆逐されてしまい、今ではギロチンたち姉妹を残すのみである。
処刑台少女たちも、元来は他のジェノサイド・ピンク（＝血式少女）と互角の力しか持っていなかったが、彼女らの「パパ」から様々な投薬、科学的人体改造、汚染生物（メルヒェン）・危険汚染生物（ナイトメア）の研究結果からのフィードバック技術による徹底的な肉体強化を受けており、加えて特殊な「ゴアスーツ」を纏うことで常時ジェノサイドモードを維持している。これら絶対的アドバンテージにより、アリスたち血式少女隊を容易く蹂躙する。
火あぶり柱（シラ）
声 - 田村奈央
誕生日：12月23日
『Finale』で新たに登場したキャラクターで、処刑台少女の4人の中で唯一パーティメンバーに加わる。今作の主人公の一人。処刑台少女の末妹で、わがままで生意気かつ強がりで、口が悪く執念深い性格。正式な名前は「火あぶり柱」だが、“シラ”と呼ばれている。人を火あぶりにしたい欲求を抱えている。
しかし、処刑台少女でありながら相手を傷つけることをためらっており、そのため他の処刑台少女（ギロチンら3人の姉）に見下され、咎められている。
通常の姿だと髪色が白と黒のシンメトリーのような感じになっていて、目の色も他の処刑台少女とは少し違う。ジェノサイドモードになると目の色が青になる部分が"血式少女"たちと異なる。ブラッドスケルターモードになると、角の数や長さ、武器も大きく変わり、"血式少女"たちのブラッドスケルター化とはその恐怖感も桁違い。"処刑台少女"としての本来の力を敵味方関係なく振るう。彼女にも職業（ジョブ）が存在し、ジョブカテゴリはつうやメアリーのように専用ジョブ。
ギロチン
声 - 長久友紀（イヤホンズ）
処刑台少女の長女で、リーダー格の少女。丁寧な振る舞いで敬語を使うため、一見すると礼儀正しい性格をしている。だが、その中身は残虐非道で人間を「ゴミ」扱いしていて、一片の慈悲も持っていない。
一度キレると言動が一変し、手が付けられなくなる。
アイアン・メイデン
声 - 高野麻里佳（イヤホンズ）
処刑台少女の次女。美しさにこだわり、同時にその美しさが壊れていくことに快楽を覚える刹那主義者。言動のすべてが刹那的であり、思慮深さは皆無に等しい。その分、突き抜けた残虐性は処刑台少女の中でも群を抜いている。
長女のギロチンと同じで、一度キレると言動が一変し、手が付けられなくなる。
首吊り台
声 - 高橋李依（イヤホンズ）
処刑台少女の三女。他の処刑台少女よりはまともな言動をするが、それとは裏腹に心の中はドス黒く歪んでいる。
表と裏の顔をうまく使い分けて他者を見下し、常にどう弄ぼうかと悪知恵を働かせている。そして他人のものをすぐ欲しがる癖があるが、そうやって手に入れたものもすぐに興味を失い、捨て殺してしまう。
他の2人（火あぶり柱〈シラ〉以外）同様、一度キレると言動が一変し、手が付けられなくなる。
ナイトメアの一部にはゲームのロゴマークをシンボルとして持っているが、これがナイトメアとしての証なのかは不明。
共通して、当初はある程度童話に関する姿を保っているが、外装を破壊すると醜悪な化け物の姿が露見する。
元街道沿いナイトメア
童謡「不思議の国のアリス」を基にしたナイトメア。シンボルは頭部の帽子に飾られている。
1作目では初めて倒されるナイトメアだが2作目では謎のナイトメアによりエリアが破壊されているため序盤ではエリア探索ができなくなっている。
「恋獄塔めありーすけるたー」で端役として立ち絵が使用されている。
元墓所ナイトメア
三姉妹の由来である童話に共通して登場する王子様を基にしたと思われるナイトメア。3人分であるためか、手が4本、脚が6本という姿になっている。シンボルは服の胸元に印刷されている。
「恋獄塔めありーすけるたー」で端役として立ち絵が使用されている。
旧寺院ナイトメア
童謡「かぐや姫」を基にしたナイトメア。シンボルは顔の正面に薄っすらと浮き出ている。
月と似たような本体からナメクジのように伸びた緑の目を持つ。
監獄エリアのナイトメアでで唯一巨大化する。
元繁華街ナイトメア
童謡「シンデレラ」を基にしたナイトメア。シンボルは舌先に浮き出ている。
ガラスの靴を履いた1本足と顔と、長い舌の付いた茶色のじゃがいものような本体に、頭部にネズミの集合体を乗せている。
部位破壊をした真の姿は脛辺りから長い舌が生えた一本足。
『2』では外見と中身が大幅に変わっており、茶色で小さめだった本体は大きな赤いかぼちゃに、頭部のネズミが王冠に代わっている。
部位破壊をした真の姿は一本足の上に巨大な頭部を3つ携えておりその内の正面の顔から長い舌が出ているというもの。
3つの顔の内の1つ（本体から見て右後ろ）は他の2つに比べて老けている。
ヘンゼルナイトメア（旧学生街ナイトメア）
童謡「ヘンゼルとグレーテル」を基にしたナイトメア。シンボル箇所は不明。
全身にお菓子を纏っている。
図鑑ではヘンゼルナイトメアになっている。
旧河川・沼ナイトメア
童謡「ラプンツェル」を基にしたナイトメア。シンボルは鎧の胸元に印刷されている。
衛兵のような胴体と塔のような長い両腕を持つが、その内部には人間らしき人形が埋まっている。ナイトメアでは珍しく全体的に無機質。
元駅構内ナイトメア
童謡「赤ずきん」を基にしたナイトメア。シンボルは尻尾に浮き出ている。
頭巾をかぶった狼のような姿をしているが、背中や口には顔が浮かび上がっている。
監獄塔ナイトメア
童謡「ジャックと豆の木」を基にしたナイトメア。蔓のようなものが胴体部に茂り、大きい角を持つ。シンボル箇所は不明。
前半と後半にそれぞれ存在するが、なぜ2体いるかは不明。また、ジャックはその姿を見た際に「鬼だ」と認識しているが、登場人物たちが登場する童話では鬼という存在は描かれていないなど謎が多い。
ナイトメア？（地下洞窟ダンジョンナイトメア）
1作目の本編終了後の余章に登場するナイトメア。シンボル箇所は不明。
その外見は、骨のような外殻で巨大な頭部と手足を形作っているという奇妙な外見をしており、他のナイトメアと比べるとグロテスクな要素がなく幾何学的である。
この外殻を破壊すると、内部の中央と両肩に当たる部分に黒い人型が3体存在しており、中央の人型は笛を吹いている。
その内部の姿故にハーメルンの笛吹き男をモチーフとしているように見えるが、ハーメルン曰く地下洞窟ダンジョンではナイトメアを見たことはなかったという。
『2』およびリメイクにおいて、その正体は「都庁ナイトメア」であることが判明した。
人魚姫のナイトメア（水族館跡ナイトメア）
『2』の新エリアのひとつ、水族館跡エリアで登場したナイトメア。
泡で覆われた本体に、ハイヒールを履いた足・地面まで届く長い手・魚の尾びれが集合した頭部を持ち、体中にナイフが刺さっている。
鶴の恩返しナイトメア（旧芸術通りナイトメア）
『2』の新エリアのひとつ、旧芸術通りエリアで登場したナイトメア。
笠をかぶり、4つの目と2つの口を持つ、年寄りの巨大な顔の横から巨大な腕が生えた外見をしている。
謎のナイトメア
『2』で登場したナイトメア。
崖下から生還したおつうたちが黎明に帰還した時に黎明を襲撃して壊滅させていた。その外見は、手足の生えた臓物とでもいうべきもの。
人間・メルヒェン問わず殺戮と破壊の限りを尽くしているが、血式少女隊と遭遇した時は逃亡するため戦闘に突入しない。
公式サイトにてそのシルエットが公開されているが、その異常な戦闘能力からか名称は「スナーク？」となっている。なお、本編ではほとんどスナークではないかという話にはならない。
しかし、その正体は序盤に行方不明になっていたアリスであることがラスボス戦の直前に明らかになる。アリスは、物語の冒頭にジャックを攻撃してしまった際に「ジャックを殺してしまった…」と思ってしまい、「ジャックのいない世界を滅ぼしてしまいたい…」という想いと「ジャックと一緒にいたい…」という2つの想いをアリスが目覚めた場所の近くにあった核が受け入れた結果、彼女は二つの姿（人間の姿とナイトメアの姿）に分離された。つまりは、元街道沿いエリアでつうたちが再開したアリスは核によって擬態化された姿のアリスということだった。そして彼女は最終的にはジャックを監獄塔・上層ナイトメアから守るために胸を貫かれてしまい命を落とすことになる。
ナイトメア・ラブ
ある2体のナイトメアの強い思いを受けた核が2体を取り込んで生み出された花のような姿の怪物で、『神獄塔 メアリスケルター2』の最終ボス。
エネルギー供給源である核と一体化したことで絶大な力を持つ一方、不死性が失われている。
都庁ナイトメア（旧）
リメイク版で登場したナイトメア。
かつて存在した、都庁ジェイルを管轄するナイトメア。
ところが、ナイトメアとしては不完全らしく、人間に近い姿を持ち、性格もおとなしい。戦闘能力も低く、メルヒェンにすらバカにされるという非常に例外的な個体。
結果、都庁ジェイルから逃げ出し、地下洞窟ダンジョンを彷徨った果てに水族館跡エリアへと流れつき、そこにいた少女とお互い姿を見せずに交流をして支え合いながら暮らしていた。
しかし、急に少女との交流が途絶え、諦めて都庁へ帰ろうとするも時間が経っていたことで元々複雑な地下洞窟はさらに変貌。都庁へと帰ることができず彷徨い続けた結果、いつしか上記の骨のような外殻を持つ姿へと変容していった。
そして血式少女隊が地下洞窟に突入した際に遭遇、自身のコピーをけしかけて逃げ回りながらなんとか都庁へと辿り着く。しかし、都庁に突入してきた彼女たちに自分がまだ生きていることがばれてしまい、都庁内でも追いかけられていたところ、彼女たちの会話を盗み聞きして人魚姫が死亡していたことを知る。絶望するもここが都庁ジェイルであることを思い出し、ウィッチクラフト（後述）の力を利用するため、自分の血をまき散らしてジェイルを成長させつつ頂上を目指していった。
都庁ナイトメア（新）
リメイク版で登場したナイトメア。モチーフは織姫と彦星。
最初にジャックたちが訪れた際には存在が確認されず、「やり直し」の後に訪れた時点で出現するようになったナイトメア。その姿は明確な怪物であり、短冊のついた笹に覆われた目玉の化け物。
なぜか自ら核を破壊するなど他のナイトメアがとることのない異常な行動をとる。
スナーク
ナイトメアに関連すると思われる、白い姿の怪人。十島博士曰く、恐ろしい力で調査隊を壊滅に追い込んだとのこと。
血式少女隊がジェイルの核を潰すのを静観する一方、自身の正体を語ろうとしたナイトメアを容赦なく処断するなど行動には不明な点が多い。
実は、調査隊壊滅の際に擬態によって黎明の人間に成りすましており、ジャックたちの動向を監視しつつ目的を果たすために動いている。
その正体は、ジェイルの「種」を持ち込んだ異星人。何らかの理由で母星が滅んでしまい、そこから持ち出した種の持つ擬態能力によって母星を再生することが目的である。
最終計画の発動には空高く伸びた監獄塔を「卵」に接触させる必要があり、核の破壊を見過ごしていたのもジェイルの横への成長を妨げ縦への成長を促す「剪定」のため。監獄塔を伸ばしての脱出計画も、このための方便である。事前に用意しておいた大量の「生贄」を監獄塔で殺すことで一気に成長させて卵に到達させるという計画だった。
しかし、童話という観念的なものまで擬態とできると知ったことでハルの知る考えとはずれ、神を創り出す計画にシフト。自身が神になるのではなく、創り出すことが目的で、そのために教団の信者たちを生贄に捧げ、盲信と憎悪による神を生み出そうとした。その計画が失敗すると、信者の代わりにメルヒェンを生贄として、願いの中核に自身を使うことで目的を果たそうとする。
監獄塔の頂点付近スナークの正体を見破って証拠を突き付けられるかによってエンディングが分岐するようになっており、失敗すると生贄の虐殺が実行されてしまい、おそらくはそれに巻き込まれる形で最後の救援が登場することができなくなった結果、監獄塔が崩れ落ちて脱出する道を完全に失う、という結末になる。
『2』においては、襲撃してきた謎のナイトメアにより、なすすべもなく殺された。