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宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
同期の土門竜介とは防大時代にある出来事をきっかけに交流するようになり、親友と呼べる間柄となる。しかし、土門の父親が死亡して間がない時にした不用意な発言で関係が悪化し、和解できないまま防大を中退してしまった。
『3199』においてヤマトに配属され、土門達と再会。土門とはわだかまりを抱えたままお互い棘のある態度となっていたが、第9話にて全天球レーダー室を通じた精神感応で本心が伝わり合い、続く第10話で和解する。
杉山宣彦（すぎやま のぶひこ）
声 - 菊本平 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第2話
旧杉山和彦。戦術科士官 / 航空隊員。三等宙尉。
小太りの茶髪男性。冥王星のガミラス基地攻略戦「メ2号作戦」のブリーフィングの際、山本玲が航空隊へ転属してきたことに「やる気が出てきたねぇ」と喜んでいたが、その後、加藤と共に作戦行動中にガミラスの対空射撃で機体を撃墜され、戦死する。
漫画版では第4巻の太陽系赤道祭の際において、戦死した杉山に代わって加藤が杉山の両親に彼の戦死を報告し、息子の代わりにと激励を受けている。また、死後も不可視の霊としてヤマトに留まっており、地球との交信時に存在していたことが百合亜の口から語られている。
根本幹雄（ねもと みきお）
声 - 板取政明 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第2話
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
旧根本明。戦術科士官 / 航空隊員。三等宙尉。小説版『星巡る方舟』によると25歳。
旧作同様に面長、長身の男性。女性クルーに詳しく、桐生のことを篠原たちに語っている。
山本の航空隊へ転属時には、「歓迎するぞ」と迎えていた。メ2号作戦中は篠原と共に行動し、加藤のピンチに駆け付ける。シリーズ後半から登場しなくなったが、第25話冒頭で遺影となる写真が登場して戦死が判明し、後に『星巡る方舟』で戦死シーンが描かれた。
小橋拓哉（こばし たくや）
声 - 吉開清人 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第3話（ヘルメット無しでは第5話）
戦術科士官 / 航空隊員。三等宙尉。19歳。
航空隊のルーキー。顔にそばかすがある。周りには、若干臆病な性格をからかわれている。
メ2号作戦のブリーフィングの際は、杉山に「やる気って何だよ」とツッコミを入れている。七色星団海戦では他の機体に助けられることが多く不甲斐なさを感じる中、敵空母「バルグレイ」を発見して単身突撃するが、対空砲火で撃墜されて戦死する。しかし、撃墜直前に対艦ミサイルを2発発射しており、バルグレイに損傷を与えた。七色星団海戦では、航空隊は小橋・大工原を含めた12名が未帰還となる。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
小説版では航海中の航空隊の損耗により、航空機の運用経験があるということで他の科から転属してきたと設定されており、ルーキー呼ばわりもそれに由来している。そのため、メ2号作戦の時点では登場せず、杉山へのツッコミ役を沢村に代わられている。
大工原剛志（だいくはら つよし）
声 - 菊本平 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第5話
戦術科士官 / 航空隊員。三等宙尉。
茶髪の角刈りで色黒の筋肉質の男性で、小橋たちからは「大工原の旦那」と呼ばれている。甲板部の宮澤と一緒に撮った写真を機体のコックピット内に貼り付けている。
七色星団海戦直前、怯える小橋を励ましていたが、七色星団海戦において小橋を助けた直後にゲットーに機体を撃墜され、戦死する。
田熊猛（たくま たけし）
声 - 木島隆一 / デザイン - 山岡信一 / 初作品 - 『2199』第5話
戦術科士官 / 航空隊員（〜『2202』）→戦闘空母「ヒュウガ」航空隊副隊長（『2205』）。三等宙尉。2175年5月15日生。
もみあげと繋がった顎髭が特徴の温和そうな顔つきの人物。身長はおよそ190センチメートルあり、航空隊所属の登場人物の中で最も長身である。『2199』ではまともなセリフが無かったが、『2202』以降は増えており、『2205』では戦闘空母ヒュウガの航空隊副隊長となっている。
西川淳
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 寸石和弘、吉開清人（『2199』第3話） / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第3話
戦術科士官 / 航空隊員（〜『2202』）→戦闘空母「ヒュウガ」航空隊員（『2205』〜）。三等宙尉。
左右に広がった栗毛の髪が特徴の男性。『2199』第3話での初ワープ時、ダーツをしながら般若心経を唱えている加藤に篠原と2人で小言を言っている。
『星巡る方舟』では、根本以外の航空隊サブキャラで唯一台詞がある。小説版『星巡る方舟』では最終決戦時に100式空偵を駆り、友軍の索敵範囲拡大や敵への電波妨害などの役目を担っている。『2205』では未登場だが、設定上は戦闘空母ヒュウガに転属している。
袴田邦彦
声 - 中西としはる / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第3話（ヘルメットなしでは第5話）
戦術科士官 / 航空隊員（〜『2202』）→戦闘空母「ヒュウガ」航空隊員（『2205』〜）。三等宙尉。
細いタレ目が特徴の男性。『2199』第5話でのメ2号作戦のブリーフィングの際、口笛を吹いて山本を迎えている。『2205』以降は戦闘空母ヒュウガに転属している。
五十嵐徹
声 - 茂木たかまさ / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第5話
戦術科士官 / 航空隊員（〜『2202』）→戦闘空母「ヒュウガ」航空隊員（『2205』〜）。三等宙尉。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
右側に大きく流した前髪と割れ顎が特徴の男性。『2199』第18話ではバラン星偵察任務に志願した篠原を他の航空隊員らとともに激励する。『2205』以降は戦闘空母ヒュウガに転属している。
艦内常装は男女とも濃いオレンジ地に黒のライン（男女とも矢印状）のツナギにベストにキャップ。
榎本勇（えのもと いさみ）
声 - 藤原啓治（〜『星巡る方舟』）→津田健次郎（『2202』） / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第2話
所属 - 戦術科員 / 掌帆長、先任伍長
階級 - 宙曹長
生年月日 - 2163年9月19日生
年齢 - 36歳（『2199』）→40歳（『2202』）→42歳（『2205』）→44歳（『3199』）
出身地 - 青森県
甲板作業・船外作業全般を指揮する男性で、叩き上げのベテラン。古代と島の士官学校時代の訓練教官であり、現在でも彼らからは優秀な教官として慕われている。卒業後は古代や島と階級が逆転しており、特にヤマトで上官になった古代に対しては時々冗談交じりで敬語を使って話すが、一方で彼らの未熟な面をからかい混じりに揶揄することもある。対次元潜航艦戦における古代が指示する前にシーガルの発進準備を整える手回しの良さなど、技量面でも優れているほか、エンケラドゥスでの戦闘時には余裕の表情でヤジを飛ばし、肝の据わりぶりも見せている。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
結城による第5稿では「榎本一」、デザイン的に古代たちと同年代のキャラとして描かれたが、「もう少し上にしたい」とのことで変更されている。
岩田新平（いわた しんぺい）
声 - はらさわ晃綺 / デザイン - 結城信輝（原案）、山岡信一（クリンナップ） / 初登場 - 『2199』第3話
戦術科員 / 運用員。三等宙曹。徳島県出身。27歳。
黄色いフレームの眼鏡が特徴の榎本の部下で、艦の甲板作業・艦載機機体運用を担当する。愚痴は多いが仕事はしっかりとこなす。遠山とコンビを組むことが多い。雪のファンだったことを後に暴露している。
オルタが原因の第三格納庫の事故のときは、機械に頼りがちで不測の事態に対処しきれていなかったことを榎本に叱責される。対次元潜航艦戦では、榎本によって古代が独断で行なう対潜哨戒に遠山とともに強引に連れ出されるものの、敵の索敵プローブを発見する活躍を見せる。復路の亜空間ゲート内での白兵戦にて銃撃に被弾し倒れる。その後は不明だった（佐渡の持つ情報端末の戦死者・負傷者リストに名を連ねている）が、『2202』第25話で、戦死した他のメンバーと共に霊体として登場しており、死亡していたことが判明した。
遠山清（とおやま きよし）
声 - 遊佐浩二 / デザイン - 結城信輝（原案）、山岡信一（クリンナップ） / 初登場 - 『2199』第3話
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
戦術科員 / 運用員。宙士長。埼玉県出身。26歳。
小太りで坊主頭が特徴の榎本の部下で、岩田と同じく艦の甲板作業・艦載機機体運用を担当する。「〜なんだな」という独特の話し方をするおっとりした性格の人物。登場するときは基本的に岩田と一緒にいる。
復路の亜空間ゲート内での白兵戦にて銃撃に被弾し倒れる。その後は不明だった（佐渡の持つ情報端末の戦死者・負傷者リストに名を連ねている）が、岩田と同じく『2202』第25話で、戦死した他のメンバーと共に霊体として登場しており、死亡していたことが判明した。
来島秀明
声 - 木島隆一 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第6話
戦術科員 / 運用員。階級は不明。
前髪がギザギザの山形をしている。佐伯とともに新婚の妻を地球に残している。メ2号作戦では水没する第三格納庫の100式空偵のうえに取り残されており、榎本に諦めぬよう叱咤される。太陽系赤道祭の折、甲板員は艦体補修が優先のために地球との交信はお預けだったが、古代と玲が交代してくれたため、佐伯とともに妻と交信できた。
佐伯功二
声 - 板取政明 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第6話
戦術科員 / 運用員。階級は不明。
坊主頭の甲板部員。
土岐鮎斗
声 - 河本啓佑 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第6話
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
戦術科員 / 運用員。階級は不明。
クルーキャップを後ろ向きにかぶった若手男性。七色星団海戦後、イスカンダル人への不信感を抱き、破壊された営倉内部を見ながら伊東の方が正しかったのかもしれないと考えてしまい、榎本に叱責される。また、メルダがツヴァルケを赤く塗装することを強く希望した際は、榎本とともに「女の子は分からない」と困り果てている。『2205』では未登場だが、脚本では補給母艦アスカに乗艦している。
準備稿での仮名は「D.J」。
宮澤ちづる
声 - 本多真梨子 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第7話
戦術科員 / 運用員。第三艦橋要員。宙士。
太陽系赤道際で、猫の着ぐるみを着て他の女性クルーたちと一緒にコスプレをしていた女性。七色星団海戦では真田や榎本とともに第三艦橋で作業しており、波動防壁展開に必要なコンバーターの修理に務めている。ドメルの自爆の際、間一髪で波動防壁の展開が間に合い、九死に一生を得た。最終話冒頭ではデスラーとの戦闘で負傷した主計科の金城を看護している。
香田実
声 - 藤沼建人 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第6話
戦術科員 / 運用員。階級は不明。
細い吊り目が特徴の男性。メ2号作戦では負傷して土岐に担がれていた。『2205』では未登場だが、脚本では補給母艦アスカに乗艦している。
佐藤
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第7話
戦術科員 / 運用員。宙士。
太陽系赤道祭でチアガールのコスプレをしていたぽっちゃり体型の女性。加藤と真琴の結婚式ではベストを脱いで登場している。
艦内常装は男子は白地に緑のライン、女子は黄緑地に黒のライン。
島大介（しま だいすけ）
声 - 鈴村健一（少年期 - 本多真梨子） / デザイン - 結城信輝、結城信輝（少年期・原案）、山岡信一（少年期・クリンナップ） / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 航海科士官 / 航海長→副長兼任（『2205』）
階級 - 三等宙尉（〜『2199』第2話）→一等宙尉（『2199』第2話〜）→三等宙佐（『2205』）
生年月日 - 2178年8月15日生
年齢 - 20歳（『2199』）→24歳（『2202』）→27歳（『2205』）→29歳（『3199』）
出身地 - 沖縄県那覇市
ヤマトの航路計画の責任者で、操舵手も務める男性。父・大吾がガミラスとの初遭遇時に戦死したため、ガミラスに対して人一倍強い敵愾心を持っている。実家は母・沙織と弟・次郎との母子家庭となっている。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
本作では眉毛が細く、モミアゲも短く、古代より少し浅黒い肌色へ変更されている（弟の次郎も同様）。また、古代同様ヤマト乗艦までの経緯も変更されており、航海長候補がガミラスの空爆で戦死したため戦時特進して航海長に就任した。旧作に比べて少し軽い性格となっている。
太田健二郎（おおた けんじろう）
声 - 千葉優輝 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第2話
所属 - 航海科士官 / 気象長（〜『2202』）→戦闘空母「ヒュウガ」航海長（『2205』）
階級 - 三等宙尉（〜『2202』）→一等宙尉（『2205』）
生年月日 - 2178年7月20日
年齢 - 21歳（『2199』）→25歳（『2202』）→27歳（『2205』）→29歳（『3199』）
出身地 - 大阪府
主に気象レーダーを担当し、天体及び自然現象を観測する。島の交代要員でもある。大食漢で、艦内の大食いチャンピオン。
本作では逆立った髪型へ変更されている。女性乗組員に鼻の下を伸ばしたり、真琴を騙してメイド服を着させるなど、旧作よりムードメーカーとしての描写が多くなっている。
林繁（はやし しげる）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 松本忍 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第4話
所属 - 航海科員（〜『2202』）→航海科士官 / 気象長（『2205』〜）
階級 - 二等宙曹（〜『2202』）→三等宙尉（『2205』）→二等宙尉（『3199』）
生年月日 - 2179年11月29日
年齢 - 25歳（『2205』）→27歳（『3199』）
旧林。茶髪で顔にそばかすがある男性。島・太田の交代要員。
自動航法室の管理をしていた際、当人曰く「森さんにそっくり」な自動航法室の幽霊を目撃したが、佐渡からは過労と判断される。その際、真琴と漫才のような会話を演じていた。復路では航路作成室でのブリーフィング中、雪のコーヒーを飲んで苦しむ島を笑っていたが、自身は飲んだ途端に噴き出している。
『星巡る方舟』では序盤から中盤まで太田に代わる準主要キャラとして登場。初登場時は予備操縦席に着いており、島が職務についてからは太田の交代要員として航路監視席に着き、天体観測に務めている。
『2205』では戦闘空母ヒュウガに転属した太田の後任として気象長に就任する。
小浜禎
声 - 佐野康之 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第4話
航海科員。宙曹。
四角いフレームの眼鏡を掛けた小太りの男性。
大島夏樹
声 - たかはし智秋 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第11話
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
航海科員。宙曹。『3199』では戦闘空母ヒュウガ航海長。三等宙尉。
航路作成室のオペレーターを務めている女性で、第三艦橋に勤務していることもある。
『星巡る方舟』では、上映前に公開された新作場面カットには映っているシーンがあったが、実際の本編ではカットされた。
艦内常装は男女とも黄色地に黒のライン。
森雪（もり ゆき）
船務科士官 / 船務長（〜『2202』）。
→「森雪 § リメイクアニメ」、および「§ 主役級キャラクター」を参照
相原義一（あいはら よしかず）
声 - 國分和人 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第2話
所属 - 船務科士官 / 通信長（〜『2202』）→戦闘空母「ヒュウガ」船務長（『2205』）
階級 - 三等宙尉（〜『2202』）→一等宙尉（『2205』〜）
生年月日 - 2178年5月17日
年齢 - 22歳（『2199』）→26歳（『2202』）→27歳（『2205』）→29歳（『3199』）
出身地 - 岩手県
通信管制を担う男性。心優しい性格の持ち主であり、部下の面倒見もよい。
本作では眉毛が細く、前髪が短く変更されている。なお、名前の読みは旧作の企画書や『宇宙戦艦ヤマトIII』での「ぎいち」を廃し、第一作での「よしかず」が用いられている。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
旧作同様、両親が地球で待っていたが、帰路において地球との通信が回復した際に、父親の死が伝えられた。
岬百合亜（みさき ゆりあ）→星名百合亜（ほしな ゆりあ）
声 - 内田彩 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第2話
所属 - 船務科士官候補生（『2199』）→波動実験艦「銀河」乗員（『2202』第19話〜）→戦闘空母「ヒュウガ」船務科 主任レーダー手（『2205』）
階級 - 准宙尉（『2199』）→三等宙尉（『2205』）
生年月日 - 2182年1月10日
年齢 - 17歳（『2199』）→21歳（『2202』）→23歳（『2205』）→25歳（『3199』）
出身地 - 山口県
ツインテール、霊感体質が特徴（ツインテールについては『2205』以降は止めている）。雪の交代要員。旧作における雪の役割を分担する者の1人であり、第一艦橋で彼女の交代要員を務める。雪に憧れを抱いている。太陽系赤道祭の折からは艦内ラジオ番組『YRAラジオヤマト』を始める。
霊感体質を自覚しており、艦内で不可思議な体験をたびたびしている。リンケによるヤマト捕獲作戦の際にユリーシャに憑依され、以降彼女の意識が表面に出ているときは自身の記憶が抜け落ちるようになる。なお、普段の髪型はツインテールだが、ユリーシャの意識が表面に出てきているときは髪留めを外して、髪を下ろしセミロングとなる。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
星名とはヤマト乗艦時に知り合って以来の友達だが、周囲から付き合っていると見られるのは嫌な模様で、彼が話しかけてくると軽くあしらっている。しかし、本心では星名が好きであることが、憑依していたユリーシャの口から彼に伝えられている。七色星団海戦の最中、星名が敵兵に撃たれ負傷したのを見て、自身の意識を取り戻し、海戦後に星名と相思相愛となる。
『2202』ではヤマトの決起に参加するが、ヤマトの発進を援護する際にドックにおける操作を行うべく艦を降りた星名についていく形で地球に残留。反乱分子として拘束されるもバレルの手回しにより無罪放免とされ、後に波動実験艦「銀河」のクルーの任務に就く。その間に星名と結婚しており、苗字が変わっている。『2205』では戦闘空母ヒュウガに主任レーダー手として乗艦。『3199』では当初司令部付きオペレーターを務めており、デザリアムの侵攻に際して夫とともに脱出するが、ヤマトには合流できず、地球で潜伏している。
音泉版『YRAラジオヤマト』ドラマパートでは主人公として登場する。
漫画版
第4巻において、生きている人間と見分けが付かないほどはっきり霊が見えることが本人の口から語られている。また、太陽系赤道祭の時点で星名への好意をはっきり示し、彼とキスをする関係になっている。
小説版
霊感体質については語られず、ユリーシャに憑依されるエピソードもオミットされている。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
西条未来（さいじょう みき）
声 - 森谷里美 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第7話
所属 - 船務科員 / 船務士（電探士）→船務科士官 / 船務長（『2205』〜）
階級 - 一等宙曹（〜『2202』）→三等宙尉（『2205』）→二等宙尉（『3199』）
生年月日 - 2178年1月23日
年齢 - 20歳（『2199』）→24歳（『2202』）→27歳（『2205』）→29歳（『3199』）
出身地 - 島根県
雪の交代要員。黒いロングヘアで頭にカチューシャをつけた女性クルー。『3199』では髪をばっさりと切ってショートヘアになっている。同期の北野とは仲がいい。
太陽系赤道祭で初登場した後、古代と共に偵察機で出た雪の交代要員として再登場。作品後半では雪や百合亜が職務につけない状態となることが増えたため出番が多くなっており、七色星団海戦では一貫してレーダー手を務めている。『星巡る方舟』では、序盤から中盤にかけて雪の交代要員としてレーダー手を務めている。『2202』では百合亜が不在かつ雪が半分以上の話数で戦線離脱状態のため、事実上メインのレーダー手として活躍している。
『2205』では雪が補給母艦アスカ艦長に就任したため、後任の船務長に就任。続く『3199』でも船務長を務めるほか、第7話からは全天球レーダー室のオペレーターも担うようになる。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
市川純（いちかわ じゅん）
声 - 藤田咲 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『星巡る方舟』
所属 - 船務科員 / 通信士（〜『2202』）→船務科士官 / 通信長（『2205』〜）。
階級 - 二等宙士（『星巡る方舟』）→三等宙尉（『2205』）→二等宙尉（『3199』）
生年月日 - 2179年4月22日
年齢 - 20歳（『星巡る方舟』）→26歳（『2205』）→28歳（『3199』）
出身地 - 兵庫県
相原の交代要員。赤毛の三つ編みおさげにそばかすが特徴の女性。袖を緩めたり裾をブーツから出したりと、艦内服を着崩して着用している。
『星巡る方舟』では序盤で相原と交代し、その後中盤にかけてまで通信席に着いている。『2205』では戦闘空母ヒュウガに転属した相原の後任として通信長に就任する。『3199』では当初補給母艦アスカに乗っていたが、第6話でヤマトに再配属される。
デザインは桐生美影の没稿の流用である。
柏木紗香（かしわぎ さやか）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 杉浦奈保子 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第15話
所属 - 船務科員（〜『2202』）→補給母艦「アスカ」船務科 主任レーダー手（『2205』）→戦闘空母「ヒュウガ」船務科 船務長（『3199』）。
階級 - 宙曹（『星巡る方舟』）→三等宙尉（『2205』）
生年月日 - 2179年6月17日
年齢 - 26歳（『2205』）→28歳（『3199』）
レーダーや無線通信に長けた女性。軽いウェーブのかかった髪をハーフアップにし、リボンで結んでいる（『2199』では赤、『2202』以降は水色）。
『2199』では主に雑談する乗組員の一人として登場。初登場時はドメルが仕組んだ度重なる威力偵察で疲弊しており、イスカンダルの実在を疑問視し始めていた。レーダーや無線通信の扱いに長けるという設定を持つが、実際に従事しているところが描写されたのは『2205』が初である。『3199』では戦闘空母ヒュウガに乗艦。
艦内常装は男子は白地に青のライン、女子は青地に黒のライン。
真田志郎（さなだ しろう）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 大塚芳忠 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 技術科士官 / 技術長兼副長（〜『2202』）→戦闘空母「ヒュウガ」艦長（『2205』）
階級 - 三等宙佐（〜『2202』）→二等宙佐（『2205』）
生年月日 - 2169年2月11日
年齢 - 29歳（『2199』）→33歳（『2202』）→36歳（『2205』）→38歳（『3199』）
出身地 - 長野県
技術部門を統括する男性。技術長としての職務のほか、副長として沖田を補佐し、沖田の不在時は臨時で艦の指揮も執る。性格は冷静沈着かつ無愛想で、古代からは「コンピューター人間」と評されたが、『中原中也詩集』や『帰郷者』などの詩人の書籍を愛読しているほか、「YRAラジオヤマト」のリスナーでもあり、ラジオネーム「シロシンタ」を使用してリクエストなどもしている。
旧作同様、古代守とは宇宙防衛大学時代からの友人であり、新見は後輩である。また、旧作では四肢が義肢であったが、本作では義肢かどうかの描写はない。
新見薫（にいみ かおる）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 久川綾 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第2話
所属 - 技術科士官 / 情報長（〜『2202』）→波動実験艦「銀河」乗員（『2202』第19話〜）→技術科士官 / 技術長（『2205』）
階級 - 一等宙尉
年齢 - 27歳（『2199』）→31歳（『2202』）→33歳（『2205』）→35歳（『3199』）→50歳相当（『3199』）
生年月日 - 2171年11月3日
出身地 - 京都府
髪はミディアム、下ぶち眼鏡、お姉さま的な魅力が特徴の女性。真田のMIT時代からの後輩で彼からの信頼は篤い。真田のことを「先生」と呼ぶことがある。卒業後、軍務局と情報部を経てヤマトに乗る。ヤマトでは情報長としての役職のほか、真田の交代要員も担う。心理学の博士号を所持しており、太陽系を離脱する頃から艦内で乗組員の心理カウンセリングも行っている。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
情報不足と時間的な制約の厳しさから、ヤマト計画は失敗すると考えており、イズモ計画に傾倒している。軍務局長の芹沢からイズモ計画に関する密命を受けており、カウンセリングを通して乗組員を少しずつ懐柔していくなど暗躍する。そして、不満を持つ乗組員と保安部を扇動し、惑星ビーメラ4において伊東と共に反乱を起こす。その動機はあくまでも当人なりに地球人類を救いたいという思いであり、犠牲を厭わない伊東とは反目気味だった。結局反乱は失敗に終わり、営倉に収監されたが、後に七色星団海戦中に波動砲口へ撃ち込まれた特殊削岩弾の除去作業のために暫時拘束を解かれ、戦闘終了後に沖田の配慮で任務に復帰する。
宇宙防衛大学時代からメ号作戦直前まで、古代守と恋人関係であった。弟の進についても面識があり、時々守と進を比較したり重ねたりしている。
『星巡る方舟』でも主要キャラクターの1人として登場しており、ヤマトが捕らわれた謎の惑星（惑星シャンブロウ）の調査隊に参加する。『2202』では、ガトランティス兵の自爆に巻き込まれて負傷し、ヤマトの無断発進には非参加となる。『2205』では戦闘空母ヒュウガに転属した真田の後任として技術長に就任する。『3199』では真田がヤマト技術長に復帰したため、『2199』以来の情報長となる。サーシャの育ての親も担っていたが、それが災いして第6話でアルフォンによってサーシャ諸共拉致されてしまう。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
元々は女性クルーが若い人物ばかりなのはおかしいと考えた結城が、遊び半分で『アルプスの少女ハイジ』のロッテンマイヤー風にデザインしたものである。出渕がおばさんキャラを嫌がったため若くされ、その後新見として正式採用されることになった。また、当初は真田を恋い慕っているという設定であったが、シリーズ途中で守と恋人関係であったという設定に変更された。
漫画版
途中追加された守との恋人設定が反映され、第2巻におけるエンケラドゥスでの戦闘後、守の死に涙を流している描写がある。第6巻でのリンケの精神攻撃のエピソードでは、アニメ第17話の過去エピソードが前倒しで登場し、新見の心情についても描かれている。
小説版
アニメ版同様、イズモ計画派として暗躍しているが、反乱発生までは技術科所属の女性乗組員であること以外は明かされておらず、三人称も「女」としか書かれていないなど、正体は伏せられていた。そのため、伊東と密会しているシーン以外でのイズモ計画派としての描写はほとんど無い。
桐生美影（きりゅう みかげ）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 中村繪里子 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第20話
所属 - 技術科員（『2199』）→波動実験艦「銀河」乗員（『2202』第19話〜）→補給母艦「アスカ」技術科士官（『2205』）→土星修復艦隊　監察官補佐官（『3199』）
階級 - 准宙尉（『2199』）→三等宙尉（『2205』）→二等宙尉（『3199』）
生年月日 - 2180年4月18日
年齢 - 18歳（『2199』）→22歳（『2202』）→25歳（『2205』）→27歳（『3199』）
出身地 - 新潟県
吊り目でポニーテールが特徴の女性。真田の交代要員。専門分野は言語学であり、ガミラス以外の異星種族との接触の可能性を考慮した新見にスカウトされてヤマトへ乗艦する。ヤマト艦内では新見直属の部下という立場だが、イズモ計画派の反乱には加担していない。旧世代洋上艦艇マニアで、また、北欧神話とアンリ・ルソーの絵画を嗜むなど多趣味。
『2199』では七色星団海戦において初登場し、真田の交代要員として第一艦橋に入る。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
『星巡る方舟』ではキーキャラクターとして登場。ガミラスから寄与された翻訳機から異星言語の解析作業を行う日々を送っていたが、ヤマトが謎の惑星（惑星シャンブロウ）に降り立った際に、惑星の調査隊に参加する。沢村とは、物語冒頭で急いでいる時に暇そうな彼とぶつかったのがきっかけで不仲な関係であったが、最終的にお互いに恋する関係になっている。
『2202』ではヤマトの決起に参加するが、ヤマト発進の援護のため山崎、星名の3人でドック操作を行うべくヤマトから降り、地球に残留する。反乱分子として拘束されるもバレルの手回しにより無罪放免とされ、後に波動実験艦「銀河」のクルーの任務に就く。
家族には父・悟郎のほか、文化人類学者の母親がおり、美影もフィールドワークに連れて行ってもらったことがある。また、父親の部下で、家族ぐるみで私的な付き合いがあった斉藤始とは兄妹のように親しい。ネレディアの妹にして、バーガーの恋人だったメリアと容姿が似ている。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
新作映画（後の『星巡る方舟』）における語り部として用意されたキャラであり、出渕が映画で唐突に登場することを嫌ったため、『2199』で先行して登場させられた。『2199』登場の時点では、映画の内容すらほとんど決まっていなかったこともあり、美影も設定らしい設定はなく、設定画も結城によるラフ画しかなかった。その後、制作が進むに伴い様々な設定が付加されていき、設定画も正式な決定稿が描かれた。なお、主要キャラクターとして登場することが前提だったことから中村がキャスティングされたが、『2199』の時点では準レギュラー以下の出番しかなかったため、事情を知らない視聴者の間で若干の話題を呼んだ。初期設定名は「桐生・グレース」。
板東平次（ばんどう へいじ）
声 - 羽多野渉 / 初登場 - 『2205』第1話
旧板東平次。技術科員。准宙尉→三等宙尉（『3199』）。2186年11月1日生。18歳（『2205』）→20歳（『3199』）
宇宙防衛大学第38期生。額のホクロが特徴。
『3199』では当初土門とともに補給母艦アスカに乗艦していたが、第6話でヤマトに転属する。
佐野史彦（さの ふみひこ）
声 - 吉開清人 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第7話
技術科員。宙士長（〜『2202』）。
短髪に小さな眼鏡を掛けた男性。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
太陽系を目前にして、美影とともに波動砲制御室でコスモリバースシステムの調整に務めていたが、コスモリバースシステムが勝手に起動したことに動揺する。
『星巡る方舟』では、相原と協力して超空間ネットワークの構築を試みるというシーンが脚本段階において存在したが、本編ではカットされ、設定として残るのみとなっている。
俳優の佐野史郎をモデルにデザインされている。キャストに吉開清人が起用されたところ、吉開自身が佐野史郎に似ていると言われていることを告白し、間接的に佐野史彦が吉開にも似ていることとなった。また、『2199』第22話に登場した際の容貌から、「某家庭教師に似ている」という指摘を視聴者から受けた。
岸田優
声 - 烏田裕志 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第24話
技術科員。宙曹。
七三分けとしゃくれ顎が特徴の男性。科学解析や情報分析を担う。下の名前は『2202』でつけられた。
松井里水（まつい さとみ）
デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第24話
技術科員。宙士。『3199』では戦闘空母ヒュウガ技術長。三等宙尉。2179年4月16日生。28歳（『3199』）。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
長い前髪を左右に分け、後ろ髪をポニーテールにした女性。『2202』第16話では、真田の交代要員として技術長の席に座っている。『3199』では戦闘空母ヒュウガに乗艦。下の名前は『3199』でつけられた。
板野
デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第24話（第22話でも沖田の演説シーンにおいて技術科の面々の中に彼女と同じ髪型の人物が極小さく登場）
技術科員。宙士。
長い前髪を七三分けにした女性。
東田舜（ひがしだ しゅん）
声 - 手塚ヒロミチ（『2205』）→水越健（『3199』） / 初登場 - 『2205』第1話
宇宙防衛大学第38期生。配属先通達後、ヤマト配属となった徳川太助に対して大門と一緒に「父親がヤマト機関長だからヤマト配属になった」「お茶の間の皆さんはこういうお涙頂戴ネタが大好き」と嫌味を言った。『3199』で明かされた設定によると、『2205』時の配属先はヤマトの僚艦となる補給母艦アスカ。『3199』では小惑星イカルスでヤマト改装に携わっており、ヤマトクルーとなる。
『2205』では上記のワンシーン以外での出番が無く、名前も設定されていなかった（キャストクレジットは「ヤマト新人クルーB」）。苗字の由来は『永遠に』での新ヤマトクルーである東田。
艦内常装は白地にオレンジのライン。スーツ・タイプと、ボトムスイン・タイプ（旧作仕様）の2種がある。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
徳川彦左衛門（とくがわ ひこざえもん）
声 - 麦人 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 機関科士官 / 機関長（〜『2202』）
階級 - 三等宙佐 →一等宙佐（『2202』第26話、戦死により二階級特進）
生年月日 - 2136年2月29日
年齢 - 62歳（『2199』）→66歳（『2202』）
出身地 - 愛知県
機関部門を仕切るベテラン機関士。沖田とは旧知の仲であり、メ号作戦では沖田の座乗するキリシマの機関長として参加した。2か月後に退役を控えている身だったが、信頼する沖田の依頼を請けて長男夫婦の反対を振り切り、ヤマトへ乗艦する。
本作では地球に残っている家族が、長男の彦七、次男の太助、彦七の嫁の菊子、孫のアイ子と設定されており、『宇宙戦艦ヤマト 新たなる旅立ち』で生じた矛盾は解消されている。
山崎奨（やまざき すすむ）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 土田大 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第2話
所属 - 機関科士官 / 応急長（『2199』）→波動実験艦「銀河」乗員（『2202』第19話〜）→機関科士官 / 機関長（『2205』）
階級 - 二等宙尉（〜『2202』）→一等宙尉（『2205』）
生年月日 - 2153年9月9日
年齢 - 45歳（『2199』）→49歳（『2202』）→52歳（『2205』）→54歳（『3199』）
出身地 - 熊本県
徳川の交代要員。徳川の片腕である古参の機関士で、艦の損傷時にはダメージコントロールも指揮している。沖田のことを信頼しており、「沖田のオヤジ」と呼んでいる。実は島の父親である島大吾の元部下で、大吾が指揮していた巡洋艦ムラサメの唯一の生存者。ガミラスとのファーストコンタクトの真相を知っており、後に島に打ち明けた。『2202』ではヤマトの決起に参加するが、ヤマトの発進を援護しようと地球に残留し、後に波動実験艦「銀河」のクルーの任務に就く。
名前の読みは『新たなる旅立ち』から『宇宙戦艦ヤマト 完結編』までに混在していた「やまざき しょう」を廃し、「やまざき すすむ」が用いられている。
薮助治（やぶ すけじ）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 -  チョー / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 機関科員 / 機関士（〜『2199』第21話）→ガミラス軍次元潜航艦UX-01機関士（『2199』第25話〜）→ガミラス軍技術交流官（『2205』）→ガルマン・ガミラス軍次元潜航艦ゼランダル機関科副長（『3199』）
階級 - 一等宙曹（『2199』）→ガミラス軍一等機関兵曹（『2205』）→ガルマン・ガミラス軍機関兵曹長（『3199』）
生年月日 - 2165年2月22日
年齢 - 33歳（『2199』）→36歳（『2202』）→40歳（『2205』）→42歳（『3199』）
出身地 - 三重県
徳川の愛弟子の機関士。家族はおらず天涯孤独。優秀な機関士だが小心者であり、その能力はヤマト艦内ではなく、後述のUX-01で発揮される。
旧作同様ヤマトの航海には懐疑的で、後に反乱に加担するが、旧作と異なり首謀者ではなくなっている。また、旧作ではイスカンダルで反乱を起こして死亡するが、本作では生き残る。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
名前の読みは旧作での「やぶ すけはる」から、「やぶ すけじ」へ変更されている。
ヤーブ・スケルジ
フラーケンに拾われ、次元潜航艦UX-01の新入り乗組員となった機関士。他のUX-01乗組員からはザルツ人と思われているが、その正体は反乱失敗後に成り行きで惑星レプタボーダに残留した薮である。ヤマトに乗艦していた当時より表情が明るく、精悍な雰囲気になっている。
『2202』では物語終盤に登場。『2205』では3人の子持ちのザルツ人女性と結婚しており、ガミラス本星に家族を残した状態で、ガミラス軍技術交流官（ガミラス軍一等機関兵曹）としてヤマトへ派遣される。
徳川太助（とくがわ たすけ）
声 - 岡本信彦 / デザイン - 山岡信一（『2199』） / 初登場 - 『2199』第2話
機関科員（『2205』）。准宙尉（『2205』）→三等宙尉（『3199』）。2187年2月22日生。18歳（『2205』）→20歳（『3199』）。
徳川彦左衛門の次男。
『2199』では民間人として登場。姪のアイ子と仲がよく、よく抱いている。太陽系赤道祭の折にも、アイ子と一緒に彦左衛門と交信した。彦左衛門によると父と同じ船乗り（軍人）を目指している模様。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
『2205』では軍人となり、宇宙防衛大学第38期生の一人としてヤマトに乗艦する。『3199』では当初島大介らとともに空軍に出向しており、無人艦隊コマンド艦グラディエーターに乗艦していたが、デザリアム侵攻時に乗艦が損傷して脱出。その後、古代達と合流し、地球を脱出して再びヤマトに乗艦する。
早乙女友治（さおとめ ゆうじ）
声 - 菊本平 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第2話
機関科員。宙曹。
肥満体型にちょび髭が特徴。『2199』第16話において、崎山や薮と共にイズモ計画派に同調し、ビーメラに立ち寄った際の反乱に加担する。その後の描写は無く、不明。
崎山克典（きやま かつのり）
声 - 茂木たかまさ / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第15話
機関科員。宙曹。
肥満体型に茶髪で、顎が割れている。早乙女や薮と共にイズモ計画派に同調し、反乱に加担する。早乙女同様その後の描写は無く、不明。
吉田充
声 - 河西健吾 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第6話
機関科員。宙曹。
前髪の一部が跳ねた青い髪が特徴。メ2号作戦中、薮がイスカンダルまで行けるかどうか疑問視した際には早乙女と目を合わせている。
嘉茂君彦
声 - 寸石和弘 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第2話
機関科員。宙曹。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
四角い眼鏡を掛けており、2本のアホ毛がある。序盤から登場しつつも当初モブ以上の出番はなかったが、薮・早乙女・崎山がMIAとなった関係で後半から出番が多くなっている。
栗哲夫（くり てつお）
声 - 前田弘喜 / 初登場 - 『2205』第2話
機関科員。准宙尉→三等宙尉（『3199』）。2187年2月8日生。18歳（『2205』）→20歳（『3199』）。
宇宙防衛大学第38期生。『2205』では新人として太助とともにヤマト機関科に配属。出航時に現在の船速を度忘れし、太助に確認したが彼も間違えていたため、エンストを起こしてしまう。
『3199』では小惑星イカルスでヤマト改装に携わっており、出航後は再び機関科として務める。
若狭祥司（わかさ しょうじ）
声 - 手塚ヒロミチ / 初登場 - 『2205』第2話
機関科員。宙曹長。2167年9月5日生。38歳（『2205』）→40歳（『3199』）。
ガトランティス戦役で初戦を戦ったエンケラドゥス守備隊の生存者で、『2205』でヤマトの新乗組員となる。太助や栗を指導している。
『3199』では小惑星イカルスでヤマト改装に携わっており、出航後は再び機関科として務める。
艦内常装は男女ともオレンジ地に黒のライン。
平田一（ひらた はじめ）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 伊勢文秀 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 主計科士官 / 主計長
階級 - 一等宙尉
生年月日 - 2176年1月29日
年齢 - 23歳（『2199』）→27歳（『2202』）→29歳（『2205』）→31歳（『3199』）
出身地 - 長崎県
食糧を始めとする物資管理を統括する男性。
本作では『宇宙戦艦ヤマトIII』での設定が反映されており、『III』同様に古代や島の同期である。部下の玲が航空科に転属するにあたり、「嫌になったら帰ってこい」などと気遣うなど、『III』同様の懐の広さを持つ。また、極度の虫嫌いやメカフェチという設定も付加されている。
土門竜介（どもん りゅうすけ）
『2205』において戦術科から主計科に転属。
→「§ 土門竜介」を参照
金城和夫
声 - 菊本平 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第16話
主計科員。宙士。
ビーメラ4調査隊に同行した無精髭の男性。準備稿での仮名は「ボビー」。
復路でのガミロイド兵との白兵戦で右肩を負傷した。
木村英義
声 - 茂木たかまさ / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第16話
主計科員。宙士。
ビーメラ4調査隊に同行した茶髪で小柄な男性。
七色星団海戦後の宇宙葬では、平田とともに納棺を行った。
篠田琴
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 原由実 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第7話
主計科員。宙曹。
太陽系赤道祭でチャイナドレスのコスプレをしていた女性。左目に泣きボクロがあるのが特徴。下の名前は『2202』でつけられた。
梅田
デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第7話
主計科員。宙曹。
太陽系赤道祭で妖精のコスプレをしていた女性。
峯岸
デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第7話
主計科員。宙士。
太陽系赤道祭で婦警のコスプレをしていた女性。補給や食料の管理を担当。
岩佐
デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第24話
主計科員。宙士。
タナカ
声 - 吉開清人 / 初登場 - 『2199』第7話
主計科員。宙曹。
YRAラジオヤマトのミキサーを担当している男性。面長で真ん中分けの髪型が特徴。
YRA初期からミキサーを務めており、復路でも継続して務めている。
第8話EDクレジットでの表記は「YRAラジオヤマトミキサー」。「タナカ」という名前は準備稿に書かれていたものをそのまま使用したものである（タナカの他には「ショタオ」や「テツコ」と書かれた人物のものも存在する）。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
艦内常装は男性は水色地に黒のライン（矢印ではなく、服そのものの形状も他の科とは大きく異なっている）、女性はベージュピンク地に黒のライン（他の科と同じ服の上にワンピース状の上着を着用している。真琴のユニフォームも他の女性クルーと同じ仕様であるが、ジッパーを外してセパレートにすることでオリジナリティーを出している）、共に胸にMEDICマーク。
佐渡酒造（さど さけぞう）
声 - 千葉繁 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 衛生長・医官
階級 - 二佐相当官（軍属）
生年月日 - 2144年10月1日
年齢 - 54歳（『2199』）→58歳（『2202』）→61歳（『2205』）→63歳（『3199』）
出身地 - 新潟県
艦内の衛生管理やクルーの体調管理を担う医者で、内科的処方から外科的処置までこなすオールラウンダーの名医。大酒飲みで、特別純米清酒「美伊」という酒を愛飲している。
本作では目の瞳や鼻の穴を明確に描かれた顔立ちへ変更されている。旧作では本職が獣医であり召集されてヤマトに乗り込む設定だったが、本作では最初から沖田の主治医を務めており、土方の依頼を受諾してヤマトへ乗艦する。冒頭に愛猫のミーくんも登場するが、旧作と同様に地球に残され、佐渡のアパートの大家に預けられている。
原田真琴（はらだ まこと）→加藤真琴（かとう まこと）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
声 - 佐藤利奈 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 衛生士（『2199』）→民間人（『2202』〜）
階級 - 宙曹（二等宙曹）相当士（軍属）（『2199』）
生年月日 - 2177年6月30日
年齢 - 21歳（『2199』）→25歳（『2202』）→28歳（『2205』）→30歳（『3199』）
出身地 - 秋田県
ボブカット、アホ毛、巨乳、おっちょこちょいが特徴。旧作における雪の役割を分担する者の1人であり、佐渡と共にヤマトへ乗艦する。衛生士としての使命感が強く、エンケラドゥスでの戦闘時は敵の治療も行おうとしていたり、イスカンダル寄港時には乗組員のガス抜きのため、イスカンダルの海での遊泳を進言したりしている。
当初は自分の手を自分で負傷させて医務室を訪れる加藤を呆れながら治療していたが、エンケラドゥスでの戦闘において航空隊に救われたことをきっかけに、慕うようになる。当初は敬語で話していたが、徐々に親しくなって口調もフランクになっていき、惑星レプタポーダを出発した頃には「サブちゃん」と呼ぶ仲になっており、イスカンダルからの帰路に妊娠を機にヤマト艦内で加藤と結婚式を挙げる。
艦内服は股の部分でセパレートされており、太股が露出しているが、こうなっている理由は不明。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 ヤマト乗組員
『2202』では、1人息子の翼が遊星爆弾症候群に侵され、看護のために月のサナトリウムにいる。ヤマト決起に際し、自身は残留するが、悩む夫の背中を押し、ヤマトへ向かわせる。その後、夫はガトランティスとの最終決戦で戦死し、未亡人となる。『2205』では出航するヤマトを息子と共に見送っている。
京塚みやこ（きょうづか みやこ）
声 - 村中知 / 初登場 - 『2205』第1話
旧京塚ミヤコ。衛生士。准宙尉→三等宙尉（『3199』）。2187年3月3日生。18歳（『2205』）→20歳（『3199』）。
宇宙防衛大学第38期生。同期のかすがい役。
小宮聡
声 - 松本忍 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第6話
衛生士。宙曹相当士（軍属）。
後述の笠原と共に佐渡の補佐を担当する男性。
笠原真希
声 - 本多真梨子 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第6話
衛生士。宙曹相当士（軍属）。
癖っ毛の頭にカチューシャをつけている女性。
最終話では真琴のウエディングドレスの試着の着付けを手伝っている。
艦内常装は男女ともライトグレー地に黒のライン。
伊東真也（いとう しんや）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 地球
『2199』では行政組織の「国連宇宙局」、軍事組織の「国連統合軍」が国際連合の傘下に存在する。統合軍の傘下に「国連宇宙軍」のほか、「軍務局」や「情報部」などが存在する。『2202』では国連が解体されて「地球連邦」となり、統合軍も「地球連邦防衛軍」として再編されている。
藤堂平九郎（とうどう へいくろう）
声 - 小川真司（〜『星巡る方舟』）→小島敏彦（『2202』） / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
国連宇宙局・極東管区行政長官（『2199』）→地球連邦防衛軍統括司令長官（『2202』）。ヤマト計画本部長（『2199』）。高知県出身。 2139年9月25日生。59歳（『2199』）→63歳（『2202』）→66歳（『2205』）→68歳（『3199』）。
温厚かつ冷静な人格者で、ヤマト計画に強い期待を寄せている。イズモ計画派の妨害を予期しており、星名に密命を与えていた。『2202』では軍のトップになっており、政府方針に対して従ってはいるものの不信を抱いている。古代の提言するテレザート探索を却下するが、ヤマトクルーの「反逆」にいきり立つ芹沢を抑えて対話による説得を試みるなど、ヤマトクルー自体に対しては好意的。
『2199』では軍人ではなく、文官と設定されている。
芹沢虎鉄（せりざわ こてつ）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 地球
声 - 玄田哲章 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
国連統合軍・極東管区軍務局長（『2199』）→地球連邦防衛軍統括司令副長（『2202』）。宙将。茨城県出身。2144年6月5日生。55歳（『2199』）→59歳（『2202』）→61歳（『2205』）→63歳（『3199』）。
独善的な性格で、派閥としては、保守派の中の過激派の代表格ともいえる。地球脱出計画（イズモ計画）推進派という立場からヤマト計画を良く思っておらず、新見に密命を与えている。一方で政治的野心も強く、英雄として人々の尊敬を受ける沖田を疎ましく思っている。
2191年のガミラスとの遭遇時には、地球側の呼びかけに応答しなかったガミラス艦隊に対し、中央司令部の決定を受けて先制攻撃を指示したうえ、それを拒否した沖田を解任し、ムラサメの島大吾艦長に先制攻撃を命令している。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 地球
『2202』では、軍の副司令として「波動砲艦隊計画」を推進する立場にある。独断で動くヤマトクルーを苦々しく思い、ヤマト発進を阻止すべく実働部隊を差し向ける。ヤマトを危機に陥れた加藤三郎の行為を知り「戦って死ね」と命じた。ただし、最終回で時間断層と引き換えに古代と雪を救出するか否かの国民投票の際の演説で立ち去り際に真田に対し「君たちが羨ましい」と言い残したり、古代と雪を乗せてヤマトが帰還した際に涙ぐむなど、決して非情な人物ではなく、情の深い側面を垣間見せた。
『2205』では平和使節団の地球全権大使としてヤマトに乗艦する。ガミラス星崩壊時には、難民たちの救助に向かおうとする古代たちの意見を尊重しつつも、「地球に危機を呼び込みかねない判断を下すことはできない」と却下する。反乱を起こした土門たちの意を汲んだ古代の判断により、山南・バレルと共に強制的に退艦させられてしまうも、救助に向かうヤマトを穏やかな表情で見送る。
『3199』では将来的なデザリアムの地球侵攻を予期し、藤堂とともに対デザリアム作戦「オペレーションDAD」の準備を密かに進めていた。
大統領
声 - 幹本雄之 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2202』第2話
地球連邦大統領。60歳（『2202』）。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 地球
理想を持ちつつも現実との妥協点を最優先する優秀な政治家とされる。『2202』ではガミラス大使であるローレン・バレルからの交渉におり、テレザート星への航海に無断で発進したヤマトを追認する。
『3199』でも現職だが、地球の置かれた状況が芳しくないため、あまり支持されていない。地球を侵略したデザリアムに対しては、バレル大使とも連携しながら、面従腹背の姿勢を取っている。
藤堂信乃（とうどう しの）
声 - 塩田朋子 / 初登場 - 『3199』第2話
地球連邦防衛軍 情報局 情報局長→地球連邦防衛軍 第二代統括司令長官（『3199』第11話〜）。宙将。2148年12月28日生。58歳。
藤堂平九郎の実妹で、防衛軍情報部のトップ。地球人類を生き延びさせることに最大の価値を見出している。地球へ「帰還」しようとするデザリアムに与し、南部康造を始めとする政財界の要人と連携してクーデターを起こす。
藤堂家は軍人家系であり、彼女も一族の期待に応えるかのように「軍務ひとすじ」を貫き、家庭も持たなかった。場合によっては彼女が防衛軍長官の地位についていたかもしれないと言われている。平九郎は自分が軍人の道を進まなかったことで信乃から人生の選択肢を奪ってしまったと考えており、彼女に対して思うところがある。
古代守（こだい まもる）
声 - 宮本充 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 地球
宇宙海軍・連合宇宙艦隊・第一艦隊所属駆逐艦「ユキカゼ」艦長。三等宙佐。古代進の兄。神奈川県三浦市出身。28歳。
メ号作戦で先遣艦を務めていたためガミラス艦隊との直接戦闘を一時回避する。艦隊に合流後、旗艦キリシマの撤退援護のため敵艦隊に突撃。消息を絶って戦死扱いとなる。部下からは慕われている。
旧作と異なり、ヤマトのイスカンダル到着時点ですでに死亡しているが、イスカンダルの科学力によってその記憶は保存され、コスモリバースを起動させる核となる。
土方竜（ひじかた りゅう）
声 - 石塚運昇（〜『2202』第19話）、楠見尚己（『2202』第21話〜） / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
空間防衛総隊司令長官（『2199』）→外洋防衛師団司令官（『2202』）。宙将。東京都出身。2142年5月5日生。56歳（『2199』）→60歳（『2202』）。
『さらば宇宙戦艦ヤマト 愛の戦士たち』や『宇宙戦艦ヤマト2』が反映され、古代や島の恩師となっている。また、沖田の同期かつ親友と明確に設定され、旧シリーズではなかった共演シーンが存在する。その他、雪の保護者という設定も追加されている。
山南修（やまなみ おさむ）
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 地球
声 - 江原正士 / デザイン - 結城信輝 / 初登場 - 『2199』第1話
所属 - 宇宙海軍・連合宇宙艦隊・第一艦隊旗艦「キリシマ」艦長（『2199』）→地球連邦航宙艦隊総旗艦「アンドロメダ」艦長（『2202』）→第65護衛隊隊司令（『2205』）→長官直轄特別任務隊司令（『3199』）
階級 - 一等宙佐（『2199』-『2205』）→宙将（『3199』）
生年月日 - 2150年4月4日
年齢 - 48歳（『2199』）→52歳（『2202』）→55歳（『2205』）→57歳（『3199』）。
出身地 - 兵庫県。
楽観主義者だが実力は確かな人物で、沖田の信頼は厚い。
目の形や肌の色、頬髯や顎鬚など、『ヤマトよ永遠に』とは大きく異なる顔立ちへ変更された。また、『ヤマトよ永遠に』では姓のみ設定されていたが、本シリーズではフルネームが設定された。
島大吾（しま だいご）
声 - 宝亀克寿 / デザイン - 結城信輝（原案）、山岡信一（クリンナップ） / 初登場 - 『2199』第4話
宇宙海軍・巡洋艦「ムラサメ」艦長。一等宙佐。大介・次郎の父。沖縄県出身。故人、2191年没、享年52。
宇宙戦艦ヤマト2199の登場人物 地球
2191年のガミラスとの初遭遇時の戦闘で戦死している。ガミラスとの戦闘はガミラス側の先制攻撃と報道されたが、実際は芹沢の命令を受けた大吾のムラサメが先制攻撃を仕掛けた。どのような命令でも粛々と遂行する生真面目な軍人だが、本来は異星人とも友好関係を築けると考える温和な人格者であり、ガミラスと戦端を開いてしまったことを悔やんでいた。死の間際、大介に異星人とも共存できるという希望を持つよう願った。
軍人であると同時に船乗りとしての信念を抱いており、かつて大介に「どんな時も仲間を見捨てないのが本当の船乗り」と語っている。その信念は、成長した大介にも受け継がれている。
石津英二
声 - 原田晃 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第1話
宇宙海軍・連合宇宙艦隊・第一艦隊所属駆逐艦「ユキカゼ」副長。宙雷士。一等宙尉。
メ号作戦で、殿（しんがり）を務める意志を持った古代守に対して軽口を叩き、他の乗組員とともに「銀河航路」を歌い始め、最期まで守と共にする覚悟を示した。その後、ガミラスの捕虜となるが、捕虜護送船がイスカンダルへ墜落し、その際に死亡する。守や他の乗組員とともにイスカンダルに墓標が立っている。
山本明生（やまもと あきお）
声 - 小上裕通 / デザイン - 山岡信一 / 初登場 - 『2199』第2話（遺影）