艦隊これくしょん -艦これ- メディアミックス
2013年10月から12月まで放送されたテレビアニメ。エンディングロールに「協力」として「艦隊これくしょん -艦これ-」が記載されているほか、『艦これ』のイラストレーターの一部が『アルペジオ』のエンドカード（エンディング後に表示されるイラスト）製作に参加している（奇数回のみ）。ゲームに先行する形で第1話エンドカードにて艦娘「伊401」が公開されている。
2013年12月24日から2014年1月8日まで行なわれた『艦これ』ゲームイベント「迎撃！ 霧の艦隊」では、『アルペジオ』に登場する種族「霧」が敵として登場する。同作のヒロインである「イオナ（声 - 渕上舞）」など、期間限定で仲間（『艦これ』の艦娘と同じ扱い）になる「霧」もいる。味方となるのは、先に述べたイオナと「タカオ（声 - 沼倉愛美）」「ハルナ（声 - 山村響）」の3名で、このうちタカオとハルナは最初は敵として登場する。敵としてのみ登場するのは「キリシマ（声 - 内山夕実）」「マヤ（声 - MAKO）」「コンゴウ（声 - ゆかな）」と、軍艦型で複数現れる「ナガラ級」。このほか、戦闘には参加しないが「ヒュウガ」が味方のサポート要員として登場している。台詞はヒュウガにはついておらず、それ以外の艦の声優はアニメと同じである。
らき☆すた
『コンプティーク』で連載している漫画作品。単行本第10巻のゲーマーズ限定版に、『艦これ』とコラボした特製カバーが付属。同作の登場人物である泉こなたが島風のコスプレをし、柊かがみ・柊つかさ・高良みゆきの顔をした連装砲がカバーに描かれている。
また、上記の島風コスプレのこなたを含むらき☆すたのメインキャラクター4名がセガプライズにてフィギュア化されることが決定。加賀のコスプレをしたかがみ、羽黒改二（中破）のコスプレをしたつかさ、深雪のコスプレをしたみゆきが新たに書き下ろされ、フィギュア化された。
こちら葛飾区亀有公園前派出所
『週刊少年ジャンプ』で連載されていた漫画作品。同誌2014年2月3日号（No.8）の「両津提督の暴走の巻」では、主人公の両津勘吉が『艦これ』を仲間に説明するという形で艦娘が登場し、室内プールを貸し切って艦船のラジコンで対戦をするシーンでは相手の女性チームが艦娘のコスプレで登場した。単行本では第193巻に収録されている。
TYPE-MOON
ゲーム『Fate/stay night』などを発売しているゲームブランド。複数回コラボしている。
Fate/EXTRA
2014年4月1日にエイプリルフールイベントとして、ニコニコ生放送で『Fate/EXTRA』の登場人物である「赤セイバー」と「キャス狐」による『艦これ』の実況プレイ放送（赤セイバーらは架空の人物であり、この放送は「このキャラクターが生で実況している」という設定で作られた動画になっている）が行われた。
コハエースXP
『コンプティーク』で連載している漫画作品。コラボ企画前から作中では『艦これ』の名前が度々出ていたが、2014年10月号にて公式にコラボ企画が行われ、『コハエースXP』のキャラクターと『艦これ』のキャラクターが共演する漫画『58エース』が掲載された。それらの内容は、単行本『コハエースこれくしょん』に収録されている。誌上では、その後も時折登場している。
ヴァイスシュヴァルツ
ブシロードから発売されているトレーディングカードゲームで、2014年から『艦これ』のカードの販売を開始。
スペースインベーダー
タイトーの名作シューティングゲーム。艦娘をドット絵化し、プライズ展開を実施した。
ウォーターラインシリーズ
青島文化教材社から発売されている艦船模型で、2013年10月から『艦これ』とコラボレーションした艦船模型の販売を開始。また、ゲームに登場しない屈曲煙突時代の長門が特別に描き下ろされた。
ファミリーマート
2013年12月3日から12月30日まで実施。特に横須賀汐入店は店外・店内を艦娘で埋め尽くした。
ローソン
2016年2月16日から3月まで、阿賀野型4姉妹描き下ろし私服姿のクリアファイル、ローソンの制服を着用した鹿島のタペストリーをもらうことができた。
2016年8月30日から9月15日まで実施。ローソンの制服を着用した江風のミニタペストリーなどがもらうことができた。
好評だったため、2017年、2018年、2019年にも再び実施された。
このほか、アニメ版「艦これ」とのコラボも実施したことがある。
2025年、リリース12周年記念のコラボ企画が4月22日から実施。対象商品購入で公式クリアファイルが先着・数量限定でもらえる。また、エントリー期間中にPontaカード又はdポイントカードで対象商品を購入・スタンプをためて応募すると公式タペストリーが抽選で当たるキャンペーン。首都圏のローソン12店舗、全国のHMV9店舗合計21店舗では、オリジナルグッズの先行販売も実施。
三越
2016年11月23日から11月29日まで実施。ビジュアルとして、私服姿の北上と大井が描き下ろされた。さらに、Polaの三越modeが実装された。好評だったため、2017年3月と8月、2018年2月と6月、2019年、2020年にも再び実施された。
コスパ
正規品のコスプレ衣装やアパレルグッズを販売している。艦娘のコスプレ衣装のほか、ゲーム内ではプレイヤーとして扱われる、提督をイメージしたコスチュームも販売する。
しまむら
「アベイル」ブランドで2017年3月10日に情報が解禁され、3月18日に第1弾の衣類が発売されたが、大多数の店舗で即日完売したため、数度の再発売が行われている。
グッドスマイルカンパニー・鉄人化計画
「グッ鉄カフェ」にて『艦これ』を扱う（2013年10月17日 - 2013年12月15日、2014年2月11日 - 3月30日）。
ufotable
アニメ『劇場版 空の境界』『Fate/stay night』などを制作しているアニメ制作会社。ufotableが運営している「ufotable Cafe TOKYO」と「ufotable Cafe TOKUSHIMA」、「ufotable DINING」にて、コラボカフェ＆ダイニングを実施した。期間は2014年1月28日から同年2月23日までの約1ヶ月間。店内にはufotableのスタッフ達による描き下ろしイラストが多数展示されており、キャラクターをイメージした料理やドリンク、ufotableオリジナル『艦これ』グッズが販売された。
グッドスマイルカンパニー・アニメイト
「甘味処 間宮」として期間限定の店舗を運営（2014年11月29日 - 2015年2月22日）。
秋葉原GiGO（セガのゲームセンター）・バンプレスト
一番カフェ「艦これ」秋葉原泊地として、期間限定でドリンクとグッズを販売（2015年10月30日 - 10月31日完売、12月11日 - 12月31日販売終了）
ゼンショー
すき家とのコラボレーションで、一部の店舗で500円ごとの飲食・持ち帰りで3Dカードがもらえるキャンペーンを実施。レシート情報を入力、抽選でポスターやどんぶりがもらえるキャンペーンを実施した。キャンペーン初日には3Dカードを求めようと、各地で大行列ができた。2016年9月28日から10月30日にかけてなか卯の一部の店舗でも実施した。
ナムコ・バンプレスト
横須賀市にて「甘味処 伊良湖」・「酒保 伊良湖」を運営（2016年7月28日 - ）11時から16時が「甘味処 伊良湖」、17時から23時が「酒保 伊良湖」としての展開となっている。期間限定ではなく常設店舗としての展開となる。2017年4月にメニュー開発などを行うため7月31日にいったん閉店した。
イートアンド
大阪王将とのコラボレーションで、2017年4月22日の読売新聞朝刊にて、本ゲームの4周年を記念し、赤城を起用した全面広告を展開。5月12日 - 2017年5月21日には限定店舗で対象メニューを注文した客に、前述の読売新聞広告面を配布するイベントが行われた。
Peach Aviation
2017年5月26日から飛龍、蒼龍、吹雪がラッピングされたエアバスA320が運航した。
渋谷の109MEN'Sともコラボし、艦これジェットに関連したグッズが発売。福岡、札幌、大阪でも展開した。
海上自衛隊
『護衛艦カレーナンバーワングランプリ』にて、「いせ」のアピールタイムの際、艦娘「伊勢」のパネルが掲示された。なお、このパネルには「C2プレパラート寄贈」と記載されており、「艦これ」運営からも公認を受けている。この他にも新規デザインのイラストを含む多数の艦娘を描いたパネルが海上自衛隊へ度々寄贈されており、各護衛艦の裁量において艦艇一般公開の際に展示している。
また前述の通り、2019年には横須賀市や呉市・佐世保市と海上自衛隊、ならびに艦これを運営するC2機関が大々的にコラボレーションし、旧日本海軍の鎮守府設立記念として大規模なイベントが行われた。海上自衛隊とは令和元年度自衛隊観艦式において、フリートウィークの10月5日から6日に行われた横須賀基地のイベントで自衛官姿の霧島のコスプレをした「艦娘遊撃隊」や、声優・内田秀が描いたオリジナルキャラクター「ボクカワウソ」の登場、新規オリジナルグッズの販売などのコラボレーションを行った。
東山奈央 1st LIVE “Rainbow”
2018年2月3日に日本武道館で行われた東山奈央のライブに、運営も協力しコニシが描いた、金剛に扮した東山奈央の描き下ろしイラストが発表された。
内田秀
本作が声優デビュー作品となった内田秀とのコラボレーションにより、彼女が描いたカワウソ型のキャラクター「ボクカワウソ」がグッズ化されている。また、下記「洋菓子のヒロタ」の項でも述べられているが、名前の「しゅう」とシュークリームの「シュー」をかけて、内田秀をイメージさせる「Uchida」イメージのシュークリームが発売された。
洋菓子のヒロタ
2019年4月、由良/日進/Got/Uchida イメージのオリジナルフレーバーのシューアイス4種類を発売（数量限定）。