東京大学総合図書館 現在の建物
2010年代の改装では、連携研究機構ヒューマニティーズセンター、U－PARL（アジア研究図書館上廣倫理財団寄付研究部門）、そして新たにアジア研究図書館が置かれることとなり、総合図書館開架とは異なる分類によって、本郷キャンパス内に分散配置されていたあらゆるアジア関係資料を集中させて配架されることとされた。5万冊が収容可能で、2020年（令和2年）10月1日の開館時点では2万冊が配架され、今後学内の他図書館・図書室から移管が進められていく方針である。また、この改装において3階大階段上の吹き抜けが復元され、スラブで塞がれていた開口部が再開口された。この吹き抜けの四周には創建当初石造の欄干が設けられていたが、この改装では欄干は復元されず、開口部に面した箇所はガラス張りの壁となった。南側3階旧出納台上の、東西方向に長い吹き抜けは復元されなかったが（3階ホールの開口部跡位置天井には光膜天井が設置されて光源が再現されている）、その上のハイサイドライトは屋上に塔屋を設けて復元されている。
5階建となっているのは本館中心の一部分であり、面積としてはさほど大きくない。開館以来、この空間は倉庫などの事務スペースとして利用されていた。岸本館長下の改修を経て、1965年5月11日からはビュッフェが開業した。ビュッフェの業者選定にあたっては大学当局と出店を目指す東大生協の間で対立が生じていたが、当時東大病院付近で営業していたレストランモナミが営業を担うこととなった。その後、ビュッフェの営業は終了している。裏田館長計画の改修では、この空間は談話や休息に供するための学生ラウンジが計画されていたが、実際には文学部の視聴覚教育センターが移転して入ることとなった。視聴覚教育センターは耐震改修工事に先駆けて2017年に総合図書館から退去することとなり、現在では飲食可能なラウンジとして開放されている。
書庫は本館南側に設けられている。地上は本館の地階（1、2階相当）と主階が硝子床によってそれぞれ3層に分けられていて、地上6層地下1階となっている（本館3階と書庫4層が同一の高さである）。書架は全て鋼鉄製での造り付けで、各層の硝子床と一体となったものである。利用者は3階出納台で出納の手続きを行うと、カウンターからは真空管でカードが書庫内に送られて、書架から取り出された図書は昇降機によって運搬されることとなっていた。書庫は閉架式として運用されていたが、のちに安全開架式として一部の利用者が立ち入ることができる運用に改められている。
書庫には50万冊の図書が収容可能であると見込まれていた。これに加えて、地下には75坪の安全庫（5室）が設置され、特に貴重な資料の保存に充てられることとされていたほか、新聞書庫や雑誌書庫も設置されていた。
岸本館長下の改修工事では、当時仮書庫として使われていた東翼地下の空間を利用して保存書庫としたほか、大学院学生の利用を見込んで書庫内に125席のキャレルが設置された。この工事において、出納を行うカウンターは3階から1階に移設されている。
裏田館長が計画した改修工事では、地下に集密書架が設置されて収容冊数の増加が図られた。
2010年代の改修工事では、1-3層の書庫の北側一部が撤去されて、開架として新着の新聞・雑誌が置かれるようになった。開架と書庫の間は硝子の壁で仕切られ、行き来はできない。書庫の入口は地下1階に設置されている。
本館前の図書館前広場に新たに設けられた、地下4階建の施設である。東京大学キャンパス計画室（野城智也、川添善行）、東京大学施設部が設計監修を行い、設計施工は清水建設が請負っている。
図書館前広場は、南側に総合図書館本館、東西に法学部4号館と文学部3号館、北側には法文2号館と法学部3号館があり、四方を建物に囲まれていた。これらの周囲隣接建物に影響を与えることなく工事を行うために、別館の建設にあたっては清水建設の提案に基づいてニューマチックケーソン工法が採用されている。この工法は、ケーソンの下底に圧縮空気を送り込んで地下水の浸入を防ぐ作業室を設けて掘削や排土を行い、ケーソン上部では構築工事を進めて、徐々にケーソンを沈下させていく工法である。通常は橋脚工事等で用いられる土木工法であり、それを建築物に応用した別館の建設は技術上極めて特異な工事となった。
地下に設けられることから、浸水や土圧への対策の必要があり、躯体は柱と一体となった幅1,900-2,300mmの躯体壁が設けられ、その外周はさらに6mmの止水鋼板で覆われ、各鋼板の境目は溶接によって処理されている。これらの構造は、地下水の中で建築物全体が浮上するのを、重量によって防ぐという役割も果たしている。
別館の建築は、以下の賞を受賞している。
この空間は、学生や教職員の誰もが利用できる全学的なアクティブ・ラーニングの場として計画されたものである。議論を伴うグループワークや、トークセッションなどの利用が想定されている。
空間はおおよそ円形の平面となっていて、東西の両側に出入口が設けられている。これらの入口は、法学部4号館と文学部3号館の地下にある図書室に面して設けられたサンクンガーデンに接している。室内中央の上部は、ガラスの張られたトップライトとなっているが、この直上に噴水がある。この噴水は、水が出る機能を廃してモニュメントとして相輪塔のみを残すことも検討されたが、関東大震災で焼失した図書館の復興において防火水槽としての役割も与えられて造られたものであるため、その経緯の歴史性を尊重して、浅く水を張って噴水としての機能を存続することとされた。このため、ライブラリープラザには水面を通してゆらぎのある自然光が差し込むようになっている。トップライトはアクリルパネルと網入りガラスの二重構造とすることで、止水性を確保している。またロールスクリーンが設置されていて、必要に応じて開閉される。このトップライトの周囲の天井には、岐阜県東白川村の天然杉を利用したルーバーが同心円状に配置されている。この木製ルーバーは、照明の器具を隠して光が直接目に入るのを防ぎ、ルーバーに反射して均一な明るさを確保するとともに、天井に設置される吸音材とともに反響を防止する機能もある。
ライブラリープラザは2017年（平成27年）7月に、耐震改修工事を行う本館の閲覧席の代替スペースとして仮オープンした。このときは本館の閲覧室で使われていた閲覧席を再利用していた。2018年10月には本来のアクティブラーニングの場としてリニューアルオープンを果たし、これに伴って設置されていた閲覧机や椅子を一新し、可動性があって柔軟に利用できるものに取り換えた。以降、能動的な学習空間として運用されている。
約300万冊の書籍を収容可能な自動書庫として設計された空間である。各階は、それぞれ約10メートルほどの高さがある。
書庫という機能を地下に実現することから、止水の面では万全の対策が施され、先述した躯体壁や止水鋼板に加えて、躯体碧の内側には1,200mm幅のバッファゾーンが設けられて、万が一躯体壁の内側への浸水が起こった場合でもバッファゾーンまでで浸水を食い止めて、地下から排水を行う計画となっている。
これらの空間には、日本ファイリング株式会社の自動書庫（「自動化書庫」は同社による呼称）が設置され、資料を入れたコンテナがラックに収容されている（コンテナ数はA5サイズ25,184個、B5サイズ25,032個、A4サイズ9,516個、フリーサイズ（A4以上）3,000個）。ラックからコンテナを取り出すスタッカークレーンは13機、地下から本館までコンテナを搬送する垂直搬送機は3機備えられている。利用者が本館内OPAC端末から資料の出庫を請求すると、コンテナが1階の出納ステーションに運ばれ、このコンテナから図書館員が資料を取り出してカウンターで利用者に提供する。。
2017年時点の配架計画では、総合図書館所蔵の製本雑誌、利用頻度が少ない開架図書、状態の良い書庫の図書、学位論文に加え、人文社会系部局から移管される製本雑誌，アジア研究図書館の各種資料を収めることとされた。300万冊という収容冊数の計画は、人文社会系資料の今後30年間の増加に対応したものとなっている。