フライハイトクラウディア メインキャラクター
進化の神レブ・マデュラ(4)
十神の一人。「神々を蹂躙する人間達を愛する必要などあるのか」とダーナは疑問を感じていたが、レブは側に寄り添って「私を愛しているのなら、貴方は人間も愛しているはず」と彼の恋人として支えていた。しかし、彼女自身も人間の手にかかり死んでしまった。それがログ・ダーナの暴走のきっかけとなってしまった。
自分のせいでログ・ダーナが堕神となったことに責任を感じ、死んでからもログとしてログ・ダーナの傍にいた。しかし、堕神となって正気を失った恋人は、レブの存在に気づくことはなかった。レブ自身もログとして変異したため、正気を失っていたがルナの心に触れたことで元に戻り、全ての力をルナに託す。
ディリウス(4)
4年前まではセントミラに仕える「三賢者」の一員として、国の発展に努めていた。彼らは新たな力としてログ・ダーナの存在に目を付け、封印の一部を解いてしまった。ダーナの力を利用するつもりだったが、逆に殺されて魂を奪われてしまう。現在は、ログとしてダーナの駒となり、イスファル、グラッフル、ゼクスの霊魂にそれぞれ同化させられている。なお、ルナの神法によってイスファルたちのログ化は阻止されている。しかし、ルナが神法を最大にまで引き上げることにより三賢者たちの姿を引き出すことが可能（三賢者が死ぬと同化された魂も運命を共にする。故に、イスファルたちと会話するためには先に三賢者を引きずり出して倒す必要がある）。
ディリウスは、イスファルに寄生しており、彼の思考を狂わせてログ・ダーナの配下とし、ルナへと刃を向けさせた。ハントを軽々と降し、レイナスとロナードのふたりがかりでもものともしなかった。カイゼルシュルトにてライを人質に取り、ルナの身柄をレイナスに要求する。だが、その直後ハントの銃撃によって妨害されてしまった。
イスファルを完全に支配した後は、レイナスたちを皆殺しにするべく、セイントローズへと乗り込んでくる。
ライと一戦を交え、彼女を瀕死状態にしたその後、駆けつけたレイナスたちと交戦し、ルナの神法によってログとしての醜い姿を引きずり出された。
ログ形態時は、阿修羅や金剛力士を模した複数の腕を持つ鬼のような姿となる。
マルカダ(4)
グラッフルに寄生しており、少しずつ彼の自我を奪っていった。彼を支配した後は、セイントローズに乗船していた部下たちを皆殺しにし、ログで溢れかえらせた。
ブリッジにてハントたちと交戦し、ルナによってログとしての姿を引きずり出される。
ログ形態時は、巨大な四足獣に騎乗した人型の怪物となる。三賢者の中で最初に戦うこととなる相手である。
リリー(4)
ゼクスに寄生しており、巨大な魔力を操って攻撃を仕掛けてくる。ログ・セルシウスにて交戦。究極の氷魔法ログゼクスによってレイナスたちを圧倒する。だが、仲間を傷つけられたことで激怒し、潜在能力を引き出したヴァイスとの一騎討ちに敗北。ルナの神法によって、ログの姿を引きずり出された。
最後に戦う三賢者だけであって、今まで戦った賢者とは比べ物にならない力を持っている。最強の雷魔法バルザライザーと氷の最強魔法ログゼクスを連発する。しかし、それでも、ゼクスの最強魔法エスクラディアまでは使用することができなかった。
ログ形態時は、巨大な怪鳥の首を女性の上半身に変えた、いわゆるハーピーのような姿となる。
クラウディアに住む10人の神々たち。彼らはどこまでも人間を愛し、守ろうと見守っていた。だが、人間達が取った行動は神々を兵器の原動力として扱うという冷酷なものであった。神々は次々と人間達の手にかかり、力尽き死んでいった。それでも神々の統率者ラグデュエルは「人間を愛し続ける」というのをやめようとはせず、仲間の神々もそれに従っていた。
今では大半の神々が消滅してしまい、『4』が始まった時点で現存しているのはマルキュロディン、ルナ、ログ・ダーナ、レブ・マデュラのみである。ラグデュエルも精神体として存在はしているが、肉体は失ってしまっている状態にある。
続編「フライハイトフロンティア」には十神の名を冠した武器が存在し、異世界「フロンティア」の謎を解く鍵となっている。
記憶の神マルキュロディン(4)
十神の一人。神々の仲間からはロディンとも呼ばれる。性格は傲岸不遜で、同士であるルナに対しても見下したような態度を見せていた。
十神の中で中立を貫き、ログ・ダーナが闇に堕ちて人類を滅ぼそうとした時も一切関わらなかった。今回もルナの説得にもかかわらず力を貸そうとはしなかったが、レイナスたちの協力を受けて立ち向かったルナに倒され力を託す。
ルナから「力を貸して欲しい」と懇願された際に、ロディンは「ログ･ダーナの暴走は人間が招いた禍。なぜ我が力を貸さねばならぬ」と拒否している。ルナとの戦いに敗れ、彼女に力を託す時にダーナに起こった悲劇を見せた。
創造の神ラグデュエル(4)
十神の一人で、その中でもリーダー的な存在だった。闇に堕ちたログ・ダーナを自分の命と引き換えに神の棺ログ・セルシウスに封印した。命を引き換えにとはいっても、人間の世界から神の世界に帰ったともいえるようで、その力を受けるイベントがある。
イスファル（正確にはディリウス）に殺されたライを復活させ、離れ離れとなったふたりを少しの間だけ引き合わせてくれた。
カイゼルシュルト王(1～4)
軍事大国カイゼルシュルト帝国を治める王。『1』でザマによって操られ自国や他国に甚大な被害を与えた事に苦悩するが、国民のために王位を続投することを決めた。バーデルゼンを滅ぼしてしまった罪滅ぼしに、レイナスを指揮官に任命し、バーデルゼンの復興を行わせた。しかし、『3』で復興が終わったと共にエルディア軍の新兵器「アルネウスの光」によって再び崩壊してしまう。その間隙をつかれ、カイゼルシュルトもエルディア軍により深い傷跡を残された。
しかし、それでもめげずに各国と手を取り合い、エルディア軍に対抗するため行動する。
セントミラ王(1、3、4)
魔法王国セントミラを治める王。ヴァイスには特別信頼を寄せていた。フロンティアでは死亡しており、彼の息子が王位を継いだとのこと。
ガルボア(1、4)
『1』では、バーデルゼン司令塔を守る司令官として登場し、最初のボスとしてレイナスと戦った。直前に発した「カイゼルシュルトの豚野郎」が強烈な印象を残す。レイナスに敗れたとき、散り際に彼の強さを認める。
『4』ではグラフィディル闘技場で復活を果たした。
ヨーロ(2)
バミューナの街に事務所を構えるクラウディア指折りの情報屋。相手の足元を見た交渉をするなど手段はよろしくないが、商売人としての実力は高く、街中のごろつきから尊敬されている。
アベル(1～4)
フライハイトクラウディア名物のエアクレスト収集家。集めたエアクレストの数によってアイテムをくれる。
ラルフ(1、4)
セントミラにいる音楽家。彼に話しかけると世界中に散らばっている音符を集められるようになり、エアベルンの専用ルームに行けばいつでも音楽が聞けるようになる。
ロイス(3)
セントミラの街で歌っている少年。音楽家ラルフの弟で、エアシップに乗せると魔獣のパーツと音符とを交換してくれるようになる。
ミルン(3、4)
セントミラ城で働いている新人のメイド。掃除は苦手だが料理は得意で、『4』ではセイントローズの商業エリアにドリンク屋を開いてくれる。
シーザ（1、2、4）
山賊の首魁として君臨する男性。隠しボスとして登場するが、『3』には未登場。
偽ハント（1、4）
ハントに物凄くそっくりな男性。服の色と髪が真紅なのが特徴。『1』でプテリュクス在住の女性の下着を盗んだため、ハントに下着泥棒疑惑がかけられてしまう。隠しボスとして登場し、倒すと女王の下着を入手できる。期間限定のボスのため、ロナードが加入すると戦うことが出来なくなってしまう。
『4』では闘技場のボスとして復活を果たした。BGMはディリウスやマルキュロディン戦と同じ「神戦」となっている。