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全国高等学校野球選手権大会 日程
2019年（第101回）から準決勝と決勝戦との間に休養日が1日追加され（会期は16日に延長）、2022年（第104回）からは、3回戦と準々決勝との間に休養日が1日追加された（会期は17日に延長）。
2024年（第106回）から暑さ対策のため、3日目までを午前の部と夕方の部の2部制（3試合日）とし、4日目から準々決勝までを全て4試合日とした。従来どおり49代表が参加。4試合日が2部制でないのは第4試合の終了時刻が夜遅くなることが見込まれるためである。
なお、夏季オリンピック開催年は、開催期間の重複を可能な限り避けるための日程調整が実施されることがある。
1992年（第74回）と2021年（第103回）は繰り下げて8月10日、2008年（第90回）は逆に繰り上げて8月2日（史上最速）にそれぞれ開幕した。
日本の電力消費は全国高等学校野球選手権大会をピークになっており、電力供給もそれに合わせて調整を行っているという通説がある。電力需給の観点から、電力行政を管轄する通商産業省（現・経済産業省）が開催時期をずらすことについて検討をしたことがある。
全国高等学校野球選手権大会 日程
審判員は、1試合あたり、球審、3人の塁審のほか、予備審判2人と控え審判員1人の計7人が担当する。通常は球審と塁審とで4人で審判を行うが、曇天・雨天時や薄暮、ナイター試合など照明が入った時点で2人の予備審判員が外審/線審として試合に加わる。外審/線審の立ち位置は、プロ野球と同じく塁審と外野ポールとの中間地点（かつフィールド内）。
DH制（指名打者）は2026年選抜高等学校野球大会から採用となる。臨時代走を使用できる。
2011年（第93回）と2012年（第94回）は東日本大震災に伴う節電対策のため、試合開始が一部の日程で繰り上げられる処置が取られた。
2013年（第95回）から2018年（第100回）までは4試合日は8時開始を維持し、2・3試合日は2010年（第92回）以前と同じ時間帯に戻したが、2019年（第101回）から暑さ対策のため、2011年（第93回）・2012年（第94回）と同じく、3・4試合日は開幕日を除き8時開始（開幕日・準決勝・決勝戦は従来どおり）に統一された。
また、2016年（第98回）から準決勝の第1試合開始が11時→10時に繰り上げられ、決勝戦の試合開始が13時→14時に繰り下げられ、2021年（第103回）から準決勝の第1試合開始が10時→9時に繰り上げられた。
全国高等学校野球選手権大会 日程
2023年（第105回）から後述のクーリングタイムの常設に伴い、2試合以上開催する場合「試合時間は2時間5分、その後のグラウンド整備と次の試合の練習に30分」と想定され、新聞社の発表では4試合日の場合「（1）8時、（2）10時35分、（3）13時10分、（4）15時45分」とされているがあくまでも目安であり、原則的には前の試合終了から30分後に次の試合を行う（早く終了した場合は、最大15分繰り上げられることもある）。
2024年（第106回）から暑さ対策のため、3日目まで午前の部と夕方の部の2部制を初めて導入し、開会式が8時30分に繰り上げられた。また、開幕日と決勝戦を除く第1試合開始が8時に統一された（開幕日の第1試合と決勝戦は10時開始）。決勝戦を午前中に実施するのは、2011年（第93回）、2012年（第94回）に次ぎ12年ぶり3度目である。
試合は9回で同点の場合は延長戦を行う。1958年（第40回）から1999年（第81回）は「延長18回」、2000年（第82回）から2017年（第99回）は「延長15回」までに勝敗が決定しなかった場合は引き分けで試合打ち切り。後日再試合が行われた（なお、降雨などにより同点のまま試合打ち切り。後日再試合が行われた例もある。詳しくは「延長引き分け再試合規定」を参照）。
全国高等学校野球選手権大会 日程
2018年（第100回）から延長戦におけるタイブレーク方式を導入。延長10回以降、試合が決着するまで行われる。そのため、1957年（第39回）以来61年ぶりに延長イニング数が無制限となった。
なお、地方大会（決勝戦を除く）で採用されている点差によるコールドゲームは、全国大会では認められていない。
2021年（第103回）までは降雨など止むを得ない事情で試合を中断・打ち切る場合は、試合が7回以降に入った場合は成立（コールドゲーム）とした。7回以前の場合は未成立（ノーゲーム）となり、翌日以降に再試合が行われた。ただし決勝戦は、地方大会・全国大会とも試合が9回終了とならない場合はノーゲームとなった。
2022年（第104回）からは降雨などで試合が中断された場合は、翌日以降に中断された場面から再開し、9回完了あるいは勝敗が決定するまで行うサスペンデッドゲーム（以下＝継続試合）を採用。これにより、全国大会ではコールドゲームやノーゲームが無くなった。
なお、地方大会の継続試合については、上述のとおり各地方の高野連が判断していたが（2022年は35地方大会、2023年は宮城大会を除く48地方大会で適用）、2024年（第106回）からは全地方大会に導入され、地方大会でもコールドゲームやノーゲームが無くなった。
全国高等学校野球選手権大会 日程
2018年（第100回）において、大会本部の判断により、暑さ対策のための休憩時間である「クーリングブレイク（給水タイム）」を設けることが認められ、実際、折尾愛真対日大三の7回裏終了後に10分間の休憩が行われた。
2023年（第105回）から5回裏終了後に原則として「給水タイム」が行われることになった。選手らは一度10分間、ベンチ裏の特設クーリングスペース（スポットクーラーやサーキュレーターといった冷房器具完備）に入り、アイシングマッサージやスポーツドリンクの飲用などでクールダウンをする。ただし、当日の気候によっては省略する場合もある。
2024年（第106回）からは、試合開始が16時以降となった場合は行われない。給水タイム中のセカンドアップは終了3分前に、6回表から新たに登板する投手については終了5分前からOKとなる。
なお、地方大会では必ずしも5回裏終了後とは限らず、大阪府や福岡県のように、3回・7回にも「給水タイム」を設けるものがあった。
2022年（第104回）の大会終了後、日中の気温の高い時間帯を控え、午前中と夕方の薄暮の時間帯に分ける2部制が検討されていたが、2023年（第105回）は応援団などの客の入れ替え時間の確保が難しいという理由で見送られた。
2024年（第106回）から、第3日まで午前の部と夕方の部の2部制を初めて導入することになった。
全国高等学校野球選手権大会 日程
第1日は上述のとおり午前の部として8時30分から開会式、10時から第1試合を行い、夕方の部として16時から第2試合と第3試合をそれぞれ行う。第2日・第3日は午前の部として8時から第1試合と第2試合を行い、夕方の部として17時から第3試合をそれぞれ行う。
なお、第1日の第1試合が13時30分、第2日・第3日の第2試合が14時30分以降も続いた場合は原則として継続試合となる。第1日は第1試合、第2日・第3日は第2試合終了後に観客の入れ替えを行う。
チケットは午前の部、夕方の部でそれぞれ別々となり、入場料は同額となる。多いときで4万人を超える観客入れ替えによる雑踏事故を防ぐため、午前と夕方の間隔を2時間半以上確保した上で、最終試合の終了が夜遅くならないように3試合日のみ行う。なお、悪天候で3試合日が8月10日以降にずれ込んだ場合は2部制は実施しない。
各日の第1試合に出場する選手には、試合前に補食を提供する。早朝の起床で朝食を十分に取れなかった選手が低栄養になって熱中症になるのを防ぐため、医事専門家の提言を受けて実施する。
松井秀喜は、スポーツ報知の寄稿に「地方大会の多くは7月に開幕するが、これを6月から始めるとかできないか」「夏の大会を前半と後半の会期の2部制にすれば体力の負担も軽減されるのではないか。阪神タイガースも一度甲子園に帰ってこられるので死のロードの負担もなくなる。夏休みいっぱいを使って甲子園大会をやってもいいのではないか」とする私見を述べている。
全国高等学校野球選手権大会 始球式
朝日新聞社航空部によって、会場の上空を飛ぶ同社保有のヘリコプターから、開幕試合の始球式で使用するボールが投下される。始球式のボール投下は祝賀飛行と称され、鳴尾球場時代の1923年（第9回）から行われている。当初は飛行機が使用されていていたが、1956年（第38回）からヘリコプターが使用されるようになった。
投下されるボールには朝日新聞社の社旗（西日本版）が取り付けられている。朝日新聞社の社旗には西日本版と東日本版の2種類あるが、大阪朝日新聞社の主催で始まった大会であり、大会会場所在地も朝日新聞大阪本社の管轄区域となるため、西日本版の社旗が使用される。
西日本版の社旗は竿元（旗竿に結ぶ側）が右側となる珍しい旗で、開催期間中はスコアボードにも掲揚されているが、日中は基本的にライトからレフト方向へ浜風が吹いているため、旗が裏返らずに済むという利点もある。
全国高等学校野球選手権大会 開閉会式
1996年（第78回）までは主催者の職員が司会を担当していたが、1997年（第79回）からは兵庫県内の高校の放送部員（おおむね、NHK杯全国高校放送コンテスト兵庫県大会のアナウンス部門・朗読部門で入賞した生徒）が4人（開会式・閉会式に各2名ずつ）が担当するようになった。
開式の前に関西吹奏楽連盟と関西合唱連盟がライトスタンドと一塁側アルプスの間に設けられたゲートから入場。
全国高等学校野球選手権大会 開閉会式
選手入場
ライトスタンドと一塁側アルプスの間に設けられたゲートから入場。曲は「大会行進曲」（作曲・山田耕筰）。春の選抜高校野球と違い、流行歌による入場行進曲の設定はない。
先導者、国旗、大会旗（記念大会は歴代優勝校旗）に続いて、前年度優勝校（連続出場時は出場選手全員、地方大会敗退時は主将のみ）が優勝旗を持って入場し、大会回数の下1桁が奇数の回は北から南、偶数の回は南から北の順に各代表校が続く。
主将を先頭に3列で入場し、レフト寄りから前年度優勝校、続いて入場した学校はセンター、3校目は2校目に入場した学校の手前、4校目は2校目に入場した学校の奥と交互に外野側に整列。最後に入場した学校が揃うとともに選手は一斉にバックネット方向へ前進する。選手は白色の運動靴で入場する。
高野連による代表校順（都道府県高野連順）と北から南の選手入場順は異なる（高野連による代表校順の逆と南から北の選手入場順も異なる）。
加えて、前年度優勝校連続出場時は当該チームが先頭となり、2024年（第106回）からは、開幕試合に登場する2チームは最後に入場することとなった（グラウンドでの長期滞在の熱中症防止及び最初に退場できるため）。
高野連による代表校順（…山梨、千葉、東東京、西東京、神奈川、長野、新潟、…奈良、和歌山、大阪、兵庫、…鳥取、広島…、愛媛、徳島…）
全国高等学校野球選手権大会 開閉会式
北から南の選手入場順（…千葉、東東京、西東京、神奈川、山梨、新潟、長野、…大阪、兵庫、奈良、和歌山、…広島、鳥取、…徳島、愛媛…）
1949年（第31回）から西宮市立西宮高等学校の生徒が国旗、大会旗（記念大会は歴代優勝校旗）、代表校のプラカードを持っている。なお、春の選抜高校野球では各校の生徒がプラカードを持っており、夏の選手権大会と異なる。
なお、2000年（第82回）の開会式から、ライト側で西宮をPRする会による人文字を行っていたが、同会が会員の高齢化などにより活動を終了したため、2018年（第100回）が最後となった。
表彰式に先立ち、共同公開インタビューとして、NHKアナウンサーの司会により優勝監督へ、朝日放送テレビアナウンサーの司会により優勝校の殊勲選手若干名にそれぞれインタビューを行う。
閉会式の準備ができるまでの間、ベンチ周辺でインタビューが行われ、閉会式の準備が終わり次第、閉会式が始まる。
開会式・閉会式の国旗・大会旗の掲揚・降納は、2000年（第82回）までは、開会式は出場校の主将（のちに記録員）が、閉会式は決勝戦を戦った選手全員がバックスクリーンの回転広告板の上（三菱電機の広告看板前）に集まって行っていたが、2001年（第83回）以後は、選手衆はバックスクリーンに移動することなく、所定位置からバックスクリーン方向の掲揚台を向いて見守る形になっている。
全国高等学校野球選手権大会 夏の大会における甲子園の土
3年生部員にとってこの大会の決勝戦以外で負けると高校野球生活が終わるという意味をこめて「夏が終わる」と表現され、大会途中で敗退したチームが試合終了直後に甲子園の土を拾い集める光景はよく報道でも取り上げられている。
なお、優勝校・準優勝校は試合終了直後に土を拾い集められず、また閉会式の途中で中継が終了するため、準決勝までに敗退したチームのみが行うものと誤解されているようであるが、実際には優勝校・準優勝校も閉会式や記念写真撮影、インタビュー終了後、グラウンドから去る寸前に土を拾っている。また1、2年生の中にはもう1度戻ってくるという意味を込めて持ち帰らない者もいる。
全国高等学校野球選手権大会 使用球
2001年（第83回）にアルプス席のブラスバンド部員にファウルボールが当たり、負傷したことから、2002年（第84回）からは打球に注目してもらうため、従来は係員が回収していたファウルボールを選抜も含め、観客にプレゼントするようになった（ただし、ホームランボールは打った選手への記念として渡すために回収される）。
全国高等学校野球選手権大会 育成功労賞・野球殿堂特別表彰授賞式
毎年8月15日の第2試合開始前に育成功労賞の授賞式がある。また野球殿堂の特別表彰授賞式を行うことがある。なお、当日の試合が中止となった場合、育成功労賞は8月15日に大阪市内で授賞式が行われ、野球殿堂の授賞式は翌日以降の第2試合開始前に授賞式がある。
全国高等学校野球選手権大会 大会期間中の黙祷
8月15日は終戦の日であるため、正午前にプレーを中断し、正午に選手、審判員、観客一同で30秒間の黙祷を行う（サイレン鳴響も行う）。この黙祷は1963年（第45回）から行われている。なお、正午が試合間の入れ替えと重なった場合は、次の試合開始前（両チームあいさつの前）に行うことがある。また、当日の試合が中止となった場合は黙祷は行われない。
第92回選抜高等学校野球大会の中止に伴う救済として行われた2020年甲子園高校野球交流試合でも8月15日に試合が行われたため、黙祷が行われた。
広島県・長崎県代表は、それぞれの原子爆弾投下の日時で独自に黙祷を行うことがある。一例として2016年（第98回）の大会3日目第2試合、山梨学院と長崎商の対戦で、試合時間が長崎に原爆が投下された8月9日の11時2分を挟むことから、試合中（応援団は1回表終了後、選手は1回裏終了後）に黙祷を行った例がある。
ただし高校独自で行われるものであり、試合進行が止められることはない。
全国高等学校野球選手権大会 甲子園練習
大会の本番前に、出場校の選手らは「甲子園練習」と称して、実際に試合で着用するユニフォームを着てグラウンド（または屋内練習所）でグラウンドの感触を確かめるための事前練習会があった。
しかし、新型コロナウイルスの影響で、甲子園練習は取りやめられたが、2023年から「甲子園見学会」として、選手がユニフォーム、または制服姿でグラウンドの感触を確認する下見の機会が設けられた。
全国高等学校野球選手権大会 大会歌
これまでに大会歌として新旧2曲、行進曲（正式には「行進歌」）として1曲が作成されている。行進曲は前年のヒット曲などから選定される春の選抜とは異なり、1935年（第21回）から固定の楽曲を使用している。
また、選抜の大会歌は現行の「今ありて」まで歴代3曲とも歌詞に「甲子園」を含むのに対し、夏は新旧2代の大会歌・行進曲（行進歌）とも歌詞に「甲子園」が含まれていない。
栄冠は君に輝く
作詞：加賀大介、作曲：古関裕而
戦後の学制改革を受けて1948年（第30回）から大会名が「全国高等学校野球選手権大会」へ改称されたことに伴い、2代目の大会歌として制定された。
応募総数は5252篇で入選者は石川県の「加賀道子」名義であったが、後に実作者である中村義雄（後に「加賀大介」へ改名）が当時婚約していた夫人（旧姓：高橋）の名前を借りて応募していたことを名乗り出たため、作詞者の名義が変更された。
最初のレコード吹き込みは伊藤久男とコロムビア男声合唱団で、1949年に日本コロムビアから発売された。2021年（第103回）の開会式では、前年に放送された連続テレビ小説『エール』に出演した山崎育三郎がアカペラで独唱した。
これは、同年に開催される予定であった第102回大会が新型コロナウイルス感染症の影響で、中止になったことにより1年後に実現したものである。
全国高等学校野球選手権大会 大会歌
全国中等学校優勝野球大会行進歌（全国中等学校優勝野球大会行進曲）
作詞：富田砕花、作曲：山田耕筰
1935年（第21回）の開会式で初演奏が行われ、戦後も変わらず「（全国中等学校優勝野球）大会行進曲」の別称で行進曲として使用され続けている。
作詞は新旧2代の大会歌のような懸賞公募ではなく、朝日新聞社が詩人の富田砕花に依頼したものであるが、甲子園の本大会では歌唱されたことが無いため、一般には山田耕筰が作曲したインストゥルメンタルのみが知られている。発表時には内本実の歌唱で日本コロムビアがレコードを製造した。
全国中等学校優勝野球大会の歌
作詞：福武周夫、作曲：信時潔
1926年（第12回）開催時に制定。最初の吹き込みはポリドールが製造した陸軍戸山学校合唱団によるもので、これとは別にコロムビアも演歌師の鳥取春陽が歌唱するカバーを作成している。9年後の「行進歌」制定後も大会歌として併用されて来たが、文語体で大時代的な歌詞もあり1947年（第29回）を最後に現行の「栄冠は君に輝く」へ代替わりした。
選抜高等学校野球大会の大会歌は「全国選抜中等学校野球大会の歌」で、夏の旧大会歌と同じ陸軍戸山学校の創唱でポリドールがレコードを製造していたが、合間に手拍子が挿入されるなど歌詞や曲調はまったく異なっていた。
全国高等学校野球選手権大会 問題点
大会参加時の各校野球部の遠征・用具・応援団のバス代などは、近畿圏の学校でない限り数千万円にのぼるという試算がある。夏の甲子園で2試合を戦った徳島県の県立高校では、出費が約4000万円かかったと報じられている。
近年はサッカーやバスケットボールなど高校スポーツの大会でも冠スポンサーが付いたり（SoftBankウィンターカップなど）、チームが独自に練習用ユニホームに地元企業の広告を募って資金を集めるケース（サッカーの青森山田高校、市立船橋高校など）もあるが、日本学生野球憲章は「教育の一環」である野球の商業的利用を禁じている。日本では「スポーツでお金を稼ぐ」ことへのネガティブな意識が社会にあり、その意識の醸成に高校野球は大きく影響していると指摘されている。
高校の野球部が全国高等学校野球選手権大会に出場すると、通常は同校の吹奏楽部・チアリーディング部およびチアダンス部（バトン部がチアリーディングおよびチアダンスを兼任していることも多く、その場合はバトン部が参加。学校によってはバトントワリング部とも称す）が応援に参加する（両方を複合させたバトンチアの場合もある）。
全国高等学校野球選手権大会 問題点
一方、出場校の吹奏楽部が試合当日にコンクールなどで応援に参加できないことがあるほか、学校によっては吹奏楽部自体が存在しない場合もあり、他校の吹奏楽部や卒業生、その他の有志が「友情応援」という形で参加する姿が時に見受けられる。
特に沖縄県の場合、移動の際の交通費や楽器の輸送費が大きく嵩むことから多数で応援に駆けつけることが容易ではないため、例年尼崎市立尼崎高等学校吹奏楽部が沖縄県代表校応援団に加わり「ハイサイおじさん」などを演奏するのが恒例となっている。
学校活動で参加するチアリーダーなどの女性を狙った撮影を目的として、会場に入場する男性の者がおり、野球観戦とは異なる目的での入場として書類送検されるトラブルが起きている。
全国高等学校野球選手権大会 海外遠征
かつては大会終了後、基本的に上位進出校の3年生選手を集め、国際親善を主目的とした海外遠征チームが組まれていた。
行き先はおもにアメリカ（韓国、ブラジルへの遠征実績もあり）で、2006年以降（2008年を除く）はアーバンユース・アカデミー（カリフォルニア州コンプトンにあるMLBの野球振興・選手育成機関）との対戦が組まれていた。
選手およびコーチングスタッフは、帽子マークは「J」、胸文字は「JAPAN」、袖に日章旗という、数十年間変わっていない簡素なデザインのユニフォーム（白およびグレー地）を着用することが多いが、過去には試合により各校のユニフォームの袖に国旗を縫いつけたものも併用したことがある。
また、背番号は1（優勝投手）から投手→捕手→内野手→外野手の順に振り分けられる（つまり投手は背番号がほぼ1桁、野手は背番号が必ず10番台となる）。
全国高等学校野球選手権大会 海外遠征
1998年以降はBFA U-18アジア選手権大会開催年は海外遠征の代わりに原則としてそちらに出場、2012年以降はWBSC U-18ワールドカップの日程が変更されたため、同大会にも出場するようになった（その場合、選手権不出場校の選手や2年生以下の選手が選ばれることがある）。これに伴い、親善目的のチームは2010年を最後に結成されていない。
国際大会出場の場合、2011年アジア選手権・2012年世界選手権は社会人他アマ代表と同一の、2013年世界選手権以降はプロ・社会人・学生各年代・女子を含めてデザインを統一した『侍ジャパン』のユニフォームを着用している。
全国高等学校野球選手権大会 歴史
1958年（第40回）：初の記念大会として、沖縄県を含む全国各都道府県の代表47校で開催。沖縄県は初めての本大会出場。沖縄は当時アメリカ施政下にあったため、沖縄県代表は琉球列島米国民政府発行の渡航証明書（パスポートに相当）を各自所持して参加。阪急西宮球場と2会場に分かれて開催。また、準々決勝の徳島商対魚津戦が春夏を通じて初の規定による延長18回引き分け再試合となった。
2015年（第97回）：本大会開催100周年を記念して、初めて大会のシンボルマークが佐藤卓のデザインにより制定。また、第1回大会出場校のユニフォームを再現し、入場行進。始球式は早稲田実OBでプロ野球・読売ジャイアンツで活躍し、福岡ダイエーホークス・ソフトバンクホークスの監督・会長を務める王貞治が務めた。プロ野球OBが高校野球の始球式を務めたのは、春夏を通じて史上初。
全国高等学校野球選手権大会 歴史
2018年（第100回）：中央特別自由席（バックネット裏）を全て指定席化、外野席を有料化し、前売り販売を開始。また、2日目第4試合の旭川大対佐久長聖戦で、春夏を通じて初めてタイブレークが適用された（当時は延長13回から）。このほか、入場者数が前年までの最多であった1990年（第72回）の92万9000人を超える101万5000人となり、初めて100万人を超えた。この年は前々年度の地方大会参加校数が多かった上位7府県（埼玉、千葉、神奈川、愛知、大阪、兵庫、福岡）を2分割して史上最多となる56代表校で実施。大阪桐蔭が史上初の2度目の春夏連覇を達成（延べ8校目）。
2022年（第104回）：3回戦と準々決勝との間に休養日が1日追加。また、雨天などで試合が中断された場合、翌日以降に中断された場面から再開し、9回完了または勝敗が決定するまで行うように改定された。暑さの問題や新型コロナウイルス感染症などの対策に対応するため、入場料を値上げした。宮城県の仙台育英が山口県の下関国際との初優勝を懸けた試合を制した。「白河の関越え」とも言われる東北勢の優勝で、八地方全てに優勝経験校が出た。
2023年（第105回）：ベンチ入りが18人→20人に増員｡熱中症対策の一環として、各試合の5回裏終了時に『#クーリング（給水）タイム』（サッカーなどで言う『ハーフタイム』に準ずる）が10分間設けられた（その日の気候によっては、大会本部の判断で取りやめることが可能）。神奈川県の慶応が前年優勝校の仙台育英を下し、1916年（第2回。当時は東京府の慶応普通部）以来107年ぶり。大会史上歴代最長のブランクを乗り越えての優勝。
全国高等学校野球選手権大会 歴代記録と大会結果
優勝校に優勝旗と優勝盾、準優勝校に準優勝盾が贈られる。
2025年（第107回）終了時点で、次の29都道府県が優勝を経験している。
2025年（第107回）終了時点で、次の18県が1度も優勝したことがない。
旧外地では、満洲と台湾は準優勝、朝鮮はベスト8が最高である。一方、南樺太からは地方大会への参加そのものがなかった。
2024年（第106回）までの地方大会に1915年（第1回）から連続して参加している高校（皆勤校）は、次の15校である。
2024年（第106回）現在、春夏通算で全都道府県との対戦を終えているのは、北海道、東京都、愛知県、大阪府、兵庫県の5都道府県である。以上は2代表選出時に代表同士との対戦もあり、47都道府県と対戦している。
優勝旗の色は深紅（「深紅の大優勝旗」）。現在の優勝旗は3代目。いずれも西陣の職人による制作。
なお、毎日新聞社主催の選抜高等学校野球大会の場合、優勝旗の色は紫紺であり、準優勝旗もある点が異なる。
全国高等学校野球選手権大会 エピソード
1978年（第60回）以降は出場が49校のため、最初の組み合わせ抽選の時点では、1校だけ初戦の対戦校が決定しない。
その1校は初戦で開幕試合の勝者と対戦することになるが、初戦の対戦校が決定しない高校の対戦成績は、出場が49校に定着した第60回大会（1978年）以降、1998年（第80回）・2008年（第90回）を含め、11勝32敗1分・勝率0.256である。
また、勝利した11校のうち2勝以上あげたのは2006年（第88回）の鹿児島工のみであり、ほかの10校は勝利しても次の3回戦で敗退している。鹿児島工はこのジンクスを破ってベスト4入りしたが、中迫監督は「試合を見に行かせた」「対戦相手の試合を見られることもいいこと」などと振り返っている。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
1953年（第35回）からNHKがテレビ中継を開始。1965年（第47回）からカラー中継を開始した。1974年（第56回）までは、原則として総合テレビのみで18時まで中継するスタイルであったが、同大会準々決勝（8月17日）の東海大相模対鹿児島実戦がテレビ中継の放送予定時刻を大幅に超え、試合途中の18時54分で中継を打ち切った。その直後からNHKに対して視聴者から中継打ち切りに対する抗議が殺到したため、天気予報と『7時のニュース』終了後に中継を再開した。
これを受けて、翌1975年（第57回）から総合テレビと教育テレビ（Eテレ）とのリレー方式で完全生中継を行うようになった。地上デジタル放送開始以降はイベントリレー機能を利用し、リレー時の案内を実施している。
1999年（第81回）以降は、アナウンサーと解説者1名で実況しているが、1980年代（遅くとも1984年）から1998年は、初戦のみ両校関係者をゲストとして招き、4人体制で中継を行っていた。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
当初、ゲストは試合をする両チームの野球部員から代表として選ばれた生徒1人（両校合わせて2名）が出演していたが、ある年の試合中に解説担当として出演した生徒が相手チームを愚弄する発言をしたことから生徒同士が口論となり、カメラが回っているのも忘れて放送中に喧嘩を始めるという放送事故が起きてしまい、これがきっかけで生徒をゲストに呼ぶことが廃止され、それ以降は、各校の野球部関係者（コーチやOBなどの成人者）が出演していた。
初戦では学校紹介のVTRが放送され、おもに学校所在地の市区町村を中心に紹介している。BGMは「栄冠は君に輝く」のマリンバテイストによるインストゥルメンタルが流れる。その後、主将と選手陣のコメントVTRが流される。
試合間には歴史や過去の名勝負、記憶に残る高校や選手・プレーなどを振り返るVTR「白球の記憶」が放送される。
高校野球関係者が入った年に行われる野球殿堂入り表彰式は、民放とは異なり映像を映さず、実況でもどのような表彰かは明言しなかったが、2019年（第101回）では、脇村春夫の表彰式が行われた際にその映像が映され、野球殿堂入りの旨も説明された。
1988年（第70回）から走者の位置をベースに見立てた図で走者のいる塁を赤色で表示している。このレイアウトが現在の日本における野球中継の標準になった。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
1994年（第76回）からは、平日は9時から1時間おきに、土曜日・日曜日は10時と15時に、イニング終了後、ニュースを伝えるために3分間中継を中断するようになった。
2010年（第92回）まではBS2でも開会式・準々決勝・準決勝・決勝戦と閉会式のみ中継された。また、小笠原諸島、沖縄県大東島地方の地上波テレビの衛星再送信中継局ができるまでは、東東京・西東京・沖縄のそれぞれの代表出場校の試合も中継された。
2011年（第93回）からは東日本大震災に伴う節電・省エネおよび暑さ対策のため、第1試合の開始時刻は3試合以上の場合（開幕日を除く。2013年 - 2018年は4試合日のみ。2011年および2024年は2試合日も含む）は、1994年（第76回）以来17年ぶりに8時開始に戻された（#第1試合の基本的な開始時刻を参照）。
海外向けのNHKワールド・プレミアムでも準決勝、決勝戦と閉会式を中継している。録画での時差放送（ディレード）となる場合と生中継となる場合とがあるが、最近は編成の都合上、時差放送で行われることが少なくない。
2015年（第97回）から全試合でリアルタイム字幕放送、5.1サラウンドを実施。2017年（第99回）からは投手の投球数と球速が交互に表示されるようになった。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
2018年（第100回）から中継テーマソングとして福山雅治の「甲子園」が使われている。2021年（第103回）から2023年（第105回）は、エンディングのみの使用となったが、2024年（第106回）では再び中継で使われた。
2021年（第103回）は東京パラリンピック中継のため、8月25日 - 28日は全てEテレで中継された。
2024年（第106回）は前述した2部制の導入に加え、パリオリンピックの録画中継に伴い、8月7日 - 11日は11時54分以降の試合（総合テレビからのリレー中継および7日 - 9日の「夕方の部」）を全てEテレで中継。また、18時45分 - 19時30分は総合テレビで各放送局からのニュースと『NHKニュース7』を放送するため、オリンピックをEテレメインチャンネルで中継し、高校野球はサブチャンネルで中継された。
ラジオ中継の歴史は古く、1927年（第13回）から、当時の大阪中央放送局が中継を開始した（これがスポーツ中継の始まりでもあった）。
ラジオ第1で全試合を中継。中継時間は、原則として8時 - 18時50分。2024年（第106回）の第1試合開始は開幕日と決勝戦を除き8時であるが、2021年（第103回）までは、第1試合の最初の5分間はニュースのため中継できなかった。2022年（第104回）から、1回表の攻撃終了後にニュースを挟む形に変更された。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
なお、4試合日の第1試合開始が現在と同じ8時であった1980年代は、試合開始5分前の7時55分から中継していた。
2012年（第94回）からIPサイマル配信「NHKネットラジオ らじる★らじる」で、2018年（第100回）からは民放ラジオポータルサイト「radiko」でも同時配信を行っている（2018年はNHKラジオ第二次実験配信。ただし、アーカイブ機能の利用は「らじる★らじる」のみ利用可）。
2021年（第103回）は、勝利監督インタビューが終わって次の試合に入るまでの穴埋めBGMに「栄冠は君に輝く」のフェンダー・ローズテイストによるインストゥルメンタルが流れた。もとの変ロ長調ではなく、半音下げたイ長調のものが使用された。BGMがフェイドアウトすると次の試合が始まる。
テレビとは異なり、11時50分 - 12時20分の間は、試合展開にかかわらず中継が中断するほか、毎正時ごろのニュース挿入と、一部の地域は道路交通法の規定による日本道路交通情報センターからの交通情報による中断もある（ニュースの場合は、毎正時になった後の攻守交代時。ただし、第1試合と決勝戦は1回表終了後。交通情報の場合は毎時28分前後の攻守交代時。また、初戦は2回表・裏に校歌が流れるため、2回裏終了後にニュースまたは交通情報を放送）。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
また、8月9日は長崎平和祈念式典中継のため10時55分 - 11時30分、8月15日は全国戦没者追悼式中継のため11時50分 - 12時20分の間は、試合展開にかかわらず中継が中断する。
このほか、18時50分からニュース終了（平日＝19時30分、土曜日・日曜日・祝日＝19時25分）までは、試合展開にかかわらず中継が中断する。ニュース終了後も試合が続いている場合はFM放送にて中継を再開する（中断中に試合が終了した場合はニュースの中で結果のみ放送する）。中継再開後は2024年までは原則として最大で22時までとなっていたが、2025年から撤廃されている。
FM放送ではラジオ第1の中断時（正午のニュースなど）にリレー中継は行わないが、夏季オリンピックと日程が重複したり（1984年ロサンゼルスオリンピック、2008年北京オリンピック、2012年ロンドンオリンピック、2016年リオデジャネイロオリンピック）、国会中継を行う場合は中継する。
1960年代前半まではラジオ第2で中継された。その後も、ラジオ第1で中継できない場合に中継されたが、ラジオ第2の周波数があまり知られていない、カーラジオに設定されていない、語学講座、気象通報、株式市況が定時に放送できないという理由からFM放送に移行した。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
1970年代前半までは、11時55分 - 13時5分は当時のテレビと同様、レギュラー編成のため中継できなかった。
大会期間中は、中継枠の時間調整のため、穴埋め番組『話題と音楽』が随所に編成される。
朝日放送テレビ（ABCテレビ）、朝日放送ラジオ（ABCラジオ）では、ラジオが開局翌年の1952年（第34回）、テレビは前身の「大阪テレビ放送」であった1957年（第39回）から、1回戦から決勝戦まで生中継を実施している。
サンテレビジョンと提携した1985年（第67回）からは土曜日と準々決勝以降を除き、昼の時間帯は近畿圏の独立局とのリレーネットも実施している（CMも通常の全画面ではなく画面下側3分の1に表示され、球場の風景も放送）。夜の時間帯（19時頃以降、ゴールデンタイム）はリレーを行わず、試合の途中で地上波の放送終了となることがある。
1995年（第77回）から2000年（第82回）の間、BSアナログハイビジョン試験放送（BS-9ch・JO248-BS-HDTV）において中継を行っていた。この名残からか、2001年（第83回）からは、BS朝日でも朝日放送との同時放送を行っている（ハイビジョン中継、連動データ放送あり。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
朝日放送テレビでは2009年（第91回）からリアルタイム字幕放送を行っている。BS朝日では決勝戦のみ実施していたが、2020年を最後に廃止された。CMは通常放送と同じく16:9のハイビジョン形式画像（一部CMは4:3の標準形式画像）で全画面放送し、提供クレジットはCM終了後の後クレジットのみ表示となり、1本のCMを放送するたびにそのCMを放送したスポンサーのみ表示を行う）。
なお、2022年（第104回）からはBSでは4Kのみで放送され、2Kでは放送されないことになった。
朝日放送系列のCS放送局、スカイAでも当日の夕方から録画放送している。また、全国大会の開幕前から、順次地方大会決勝戦ノーカット放送を行ってきたが、2012年度は一部地区がダイジェスト放送となり、2013年度以降は地方大会の全試合完全放送を見送ることになった。
これは、民放でテレビ中継を行う地方大会が減少傾向にあるため、一部の地区で独自中継してきたが、それも難しくなったためである。代替措置として『速報!甲子園への道』の全放送日一挙放送や、開幕直前の生放送番組で地方大会をまとめて流すようにした。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
テレビ朝日系列では開会式の一部と決勝戦（2014年まで）については全国中継される。年度によってはそれ以外の試合でも出場校の地元局がネットすることがある（年度や局によっては深夜に録画放送される）が、北海道テレビ放送（HTB）では2019年（第101回）を最後に取りやめた。
テレビ朝日は長らく続けていた準決勝の一部中継（14、15時台のみ）を2005年（第87回）を最後に取り止めた。2015年（第97回）は、決勝戦の放送枠がネットワークセールスからローカルセールスへと変更されたことから、テレビ朝日系列局のうちテレビ朝日のみ決勝戦の中継を行わず、2016年（第98回）はネット局がさらに減少し、2021年（第103回）は関西ローカルのみでの放送となっている。
ネット外の地方局ではテレビ山梨（UTY・JNN）、富山テレビ（BBT・FNN）、山陰放送（BSS・JNN）が2014年（第96回）までネットしていた。それ以降決勝戦も含め、全編ローカルセールスに変更されたことからネット局は縮小傾向にある（2021年はテレビ朝日がゴルフ中継を行い、大部分のテレビ朝日系列がテレビ朝日を優先したため、高校野球の決勝戦は朝日放送テレビ以外では生中継されなかった）。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
2018年（第100回）まで関西地方以外の地域で地元代表校出場試合が放送される場合（決勝戦は除く）、映像は朝日放送テレビからのネットワークを受けるが、一部の放送局では実況は地元の放送局が派遣したアナウンサーによる「地元校応援実況」を行っていた。
ただし、中継予定時間になっても地元校出場試合が始まっていない場合は、朝日放送テレビアナウンサーの実況をそのまま放送する（回線の都合上、前の試合のどちらかの地元局の応援実況が放送されることもある）。2009年（第91回）のみ全局が朝日放送（当時）の実況となった。最終的に愛媛朝日テレビのみ実施されていたが2018年（第100回）で終了した。
また、テレビ朝日系列各局と、朝日新聞資本がある一部のテレビ朝日系列以外の放送局および朝日放送ラジオでは、7月中旬ごろ（朝日放送ラジオは7月1日）から朝日新聞の大会CMが放送される（台詞の違いによる地方大会版と本大会版とが存在）。
バックのBGM「栄冠は君に輝く」は、当初は学生の混声合唱であったが、21世紀になってからはハウンドドッグ、サーカス、森山良子、夏川りみ、小椋佳らイメージアーティストが歌うようになった（2021年に山崎育三郎で復活）。
全国高等学校野球選手権大会 テレビ・ラジオ中継・映像記録
2011年（第93回）以降は日本各地の高校生による合唱・演奏に変更された。テレビ版の映像は前年度の本大会（年度により地方大会も）の模様をフィルム撮影したものを使っている。ナレーションは、2014年（第96回）まで小林清志が務めていた（テレビ・ラジオ共に）。
2015年（第97回）はテレビCMの新たな趣向として、同志社香里高校ダンス部員（女子）らの出演、Dream5の「栄冠は君に輝く」歌唱による「ダンス編」が制作された（本大会開催期間中は従来の作りのテレビCMもあわせて放送）。2016年（第98回）は「ダンス編」の第2弾を放送（従来の作りのテレビCMはなし）。
ラジオ中継は、朝日放送ラジオで先述の通り1952年（第34回）から中継し全試合完全中継を行っていたが2009年（第91回）からは試合展開や地元の近畿勢が出場する試合に関係なく17時50分で中継を打ち切っている。
ラジオ中継でも地元の大会出場校が出場する試合については当該地区の局で中継する場合がある。
2014年（第96回）からニコニコ生放送が新規参入。第86回選抜から引き続き、NHKでの放送を見ながら実況する「テレビ実況生放送」として配信。2015年（第97回）は森永製菓、2017年（第99回）は面白法人カヤックが後援。
2017年（第99回）は、愛甲猛のメイン番組とは別に、元プロ野球選手による同様の企画が配信された。
2014年（第96回）までは朝日放送サイト内で全国選手権大会を配信していたが、2015年（第97回）からは、朝日放送・朝日新聞社の共同事業による「バーチャル高校野球」内で地方大会と全国選手権大会のライブ中継を配信する。2018年からは「SPORTS BULL（スポーツブル）」内で「バーチャル高校野球」の配信を行う。
2020年、新型コロナウイルスの感染拡大防止のため中止となった第92回選抜高等学校野球大会の代替大会2020年甲子園高校野球交流試合では、毎日新聞社、毎日放送が運営する「センバツLIVE」と「バーチャル高校野球」がライブ配信で競作した。
2022年からは「SPORTS BULL（スポーツブル）」だけではなく、スポーツナビ（ヤフー）でもバーチャル高校野球を扱うようになったため、スポーツナビからでも中継映像を見ることができるようになった。
2023年（第105回）はサイバーエージェントとテレビ朝日の合弁インターネット放送局であるABEMAでも「バーチャル高校野球」を同時配信。
2024年（第106回）からは「オーディオ高校野球」として、朝日放送ラジオ制作の高校野球中継をradikoにて、エリアによる制限無し並びに完全中継で無料配信している。
ジェフユナイテッド市原・千葉
ジェフユナイテッド市原・千葉（ジェフユナイテッドいちはら・ちば、JEF United Ichihara Chiba）は、日本の千葉県市原市および千葉市にホームを置く、日本プロサッカーリーグ（Jリーグ）に加盟するプロサッカークラブ。略称は「ジェフユナイテッド千葉」、または「ジェフ千葉」、「千葉」である。旧呼称は、「ジェフユナイテッド市原」または「ジェフ市原」。
ジェフユナイテッド市原・千葉 概要
1993年の開幕時からJリーグに参加。ホームタウンは千葉県市原市、2003年シーズンから千葉市が加わった。ホームスタジアムはリーグ開幕時から2005年シーズン途中まで市原臨海競技場、2005年シーズンの途中からフクダ電子アリーナに代わった。練習場は2000年から市原市の姉崎公園サッカー場（フットパーク・あねさき）を使用していたが、2009年10月よりフクダ電子アリーナに隣接するユナイテッドパークに移動した。また、クラブハウスも同地に新築している。
クラブの運営会社はジェフユナイテッド株式会社（株式会社 東日本ジェイアール古河サッカークラブより2009年10月1日改名）。東日本旅客鉄道（JR東日本）と古河電気工業（古河電工）が50%ずつ出資（資本金：4.9億円）。なお、2008年までは1億円であったが、2009年秋に完成予定のクラブハウス建設費調達などの関係から、2009年に増額された。
ジェフユナイテッド市原・千葉 概要
クラブ名の「ジェフユナイテッド」（JEF UNITED、ユナイテッド＝結束した）はクラブとホームタウンの結びつき、チームの協調・連帯感を表現しており、1991年に公募で決定された。また、JEFは、クラブの母体となったJR-East（=JR東日本）・Furukawa（=古河）の略称にも由来する、UNITED（ユナイテッド＝結束した）はクラブとホームタウンの結びつき、結束力を示し、2005年から千葉市を含めた地域との結びつきも含むようになった。1991年に公募により決定される。
マスコットは秋田犬の兄弟。背番号2を付けているのがジェフィ（兄）、背番号9を付けているのがユニティ（弟）である。ちなみに両マスコットの背番号は足すと11で、1つのチームを示すものである。チームスローガンは2001年以来「WIN BY ALL!」。ほとんどの他クラブが1年ごとにチームスローガンを設定しなおす中、千葉はこのスローガンを9年にわたって使用し続けており、千葉を象徴するフレーズとして浸透している。
ジェフユナイテッド市原・千葉 概要
スクール及びジュニアユースチームは市原市の辰巳台地区と習志野市の茜浜地区にある。千葉県外ではこの他に、栃木県宇都宮市、青森県八戸市にサッカースクールを所有している。また、宮城県名取市の東北電力名取スポーツパーク（NASPA）と提携してNASPAスクールの運営も行っている。これはジェフがJリーグ発足当初、市原市を中心とし、JR東日本沿線の東北、関東、甲信越の各地域を広域的にネットワークする構想を持っていたことの名残りである。実際、秋田、仙台、山形、新潟と、古河電工の事業所がある福井でホームゲームを開催した実績がある。また、スクールのデリバリー版として「サッカーおとどけ隊」が主に市原市、千葉市内の保育園・幼稚園・小学校・中学校くらいまでを範囲として訪問している。さらに千葉大学と提携して指導者向けの講習も行っている。
ジェフユナイテッド市原・千葉 概要
ジェフに特有の下部・関連組織としてアマチュアチームとなる「ジェフユナイテッド市原・千葉リザーブズ」がある。このアマチュアチームは市原市民が1995年に立ち上げ、元々人材交流のあったアマチュアクラブチームの「市原スポーツ・クラブ」を2000年よりジェフユナイテッド市原の普及部付けとして改組したもので、2003年からはクラブの名称を冠して「ジェフユナイテッド市原アマチュア」（当時）を名乗っている。こうした下部チームの形態はヨーロッパでは珍しくはない。アマチュアチームの立ち上げ以降日本フットボールリーグへの参加を目指し、2005年に関東サッカーリーグ1部で準優勝、さらに全国地域リーグ決勝大会では準優勝を果たし、日本フットボールリーグへの昇格を果たした。
女子チームとしてジェフユナイテッド市原・千葉レディースがある。レディースチームは当初（1992年）からジェフの下部組織として運営されている。廃部される例が少なくない日本の女子サッカーチームとしては、かなり息の長い存在となっている。
クラブ発足当初は古河色を色濃く残しており、監督に古河OBの永井良和を、コーチにこれも古河OBの岡田武史を充てていた。ただし、外国人選手にヨーロッパ出身者を当てる伝統は既にこの頃から始まっており、元ドイツ代表ピエール・リトバルスキー、チェコ出身のパベル・ジェハークを迎え彼ら中心のチーム編成を行っていた。
Jリーグ開幕からこれまでにヨーロッパを中心に、20カ国以上にも及ぶ国籍の選手が在籍しており、これはJリーグ加盟チームで最多である。ヨーロッパだけでなく南米やアジア・アフリカ・オセアニア出身の選手も所属していたことがある。
その後も監督には清雲栄純、奥寺康彦と続けて古河OBを監督に充てていたが、ゼネラルマネージャーに祖母井秀隆が就任した1997年シーズンのヤン・フェルシュライエンから2009年シーズン中のアレックス・ミラーまで、12年にわたってヨーロッパ出身の監督を起用していた。
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
前身は1946年に設立された古河電気工業サッカー部。1965年の日本サッカーリーグにスタート時から参加。。日本リーグ、Jリーグを通じて一度も下部（日本リーグ2部、旧JFL、J2）リーグに降格したことのない唯一のクラブチームである日本リーグ時代は三菱重工（現：浦和レッズ）や日立（現：柏レイソル）とともに丸の内御三家と言われていた。日本サッカーリーグ2回、天皇杯全日本サッカー選手権大会4回、JSLカップ3回優勝の名門。また、1986年/1987年にはアジアクラブ選手権で日本のクラブとしては初めてとなるアジアタイトルを獲得した。
プロリーグ発足に関しては、古河電工単独でのプロクラブ化は難しかったため、1991年に古河電工と取引関係にあったJR東日本と合弁でクラブチームに移行し「東日本JR古河FC」となった。
プロクラブ化に関しての曲折は古河電気工業サッカー部、また、ジェフユナイテッドの誕生に尽力した小倉純二の項目も参照のこと。
当初は当時、古河電工サッカー部が活動本拠地としていた横浜市をホームタウンとすることを企画していたが、早々に横浜フリューゲルス及び横浜マリノス（当時）が横浜市をホームタウンとすることを決定したため、新たなホームスタジアム探しが始まった。
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
まず千葉市にかけあったが断られたため、JR東日本の関係から仙台市に話を持っていったが、ここでも断られた。そして、習志野市を本拠地にすることを計画し、ホームスタジアムは秋津公園サッカー場を予定していた。そのためホームタウンが決定する以前の1991年からクラブ事務所と練習場は、距離的にも習志野市に近く、古河電工の事業所が置かれていた浦安市舞浜地区に置いていた。ところが秋津サッカー場周辺の住民が騒音の問題などを危惧してホームタウンとすることに反対したため、習志野市議会の同意を得る事が不可能となり、ホームスタジアム探しは振り出しに戻ってしまった。
千葉県下において次の候補地となったのが同じく古河電工の事業所が設置されており、古河電工の社宅など関連施設が多く存在していた市原市である。市原市議会からの賛同を得て、正式にホームタウンとしてJリーグに登録できたのは締め切り直前の1992年5月だった。ホームスタジアムはそれまで市営の陸上競技場としてこじんまりと使用されていた市原臨海競技場を突貫工事で改修して使用することになった。
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
Jリーグが開幕した1993年から1995年の3年間は営業面においてクラブの絶頂期だった。特に1993年は観客動員においてヴェルディ川崎（当時）に続く2位。1994年はヴェルディとガンバ大阪に続く3位だった。また、この2年間は平均観客動員が2万人を超えていたが、これは国立霞ヶ丘競技場で主催試合を多く取ったためで、地元・市原臨海競技場でのホームゲーム開催数は少なかった。
成績面では、1997年までリーグ順位は中位から下位、カップ戦もグループリーグ敗退、初戦敗退と振るわなかった。特に天皇杯では、1993年から4年連続で初戦敗退を喫した。さらに1995年はブランメル仙台（現：ベガルタ仙台）、1996年は富士通川崎（現：川崎フロンターレ）と2年連続でJFL勢に敗れる様であり、プロ移行後の天皇杯初勝利は、1997年の対コンサドーレ札幌戦であった。
しかし、選手の個人成績では1994年の得点王・フランク・オルデネビッツ（オッツェ）や、城彰二、中西永輔など活躍をみせた。また、市原ユースから多くのJリーグ選手を輩出しており、スカウティングや育成面では良好だった。
1996年から観客動員の減少が始まり、1997年には総観客動員、平均観客動員がJリーグで最下位になった。以降この位置が常態化し、1997年以降2005年に至るまでの9年のあいだ、年間観客動員がJ1リーグ最下位を記録していた。
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
この期間、クラブと市原市も少しずつではあるが、地域に密着して行こうとする努力を始めた。当時クラブ事務所と練習場は、ホームタウンを市原市に変更して以降も浦安市に置かれていたが、地理的にかなりの距離がある事から、クラブの中枢機能とホームタウンである市原市の連絡体制が不十分だった。また、練習場と試合会場が離れていたため、選手・スタッフの多くが浦安市周辺に住んでおり、試合をするためだけに「市原市に来ていた」状態が続いていた。この状態を改善するため、2000年からはホームタウンである市原市にある「フットパーク・あねさき（姉崎公園サッカー場）」にクラブ中枢機能及び練習場を移し、名実ともに市原市のクラブとしての機能を高めるようになった。
1998年
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
同年にワールドカップが開催される影響から過密日程の中、1stステージを全18チーム中11位で終える。続く2ndステージでは、1stで勝ち点21を積み上げたのに対し2ndでは勝ち点はわずか4の最下位。このため、年間16位となり、翌年からJリーグが2部制導入に伴って、残留争いを繰り広げることとなった。翌年からのJ1に参加するため、迎えた相手はリーグ最下位ながらもJFLの川崎フロンターレを退けたアビスパ福岡だった。第1戦はアウェイながらも2-0と勝利を収め、続く第2戦も2-1と競り勝ち、2戦2勝合計スコア4-1で残留を決める（J1参入決定戦）。なお、アビスパ福岡とは2000年まで3年間、ともに残留争いを繰り広げることとなる。
1999年
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
1stステージを降格圏の15位で終え、前年に続き残留争いをすることに。しかし、2ndステージで追い上げをみせ、負ければその場で降格という中、最終節に残留の可能性を残した。それでも、勝っても他のクラブの結果次第（残留の条件：90分以内で勝利し、福岡が負けるか、浦和が90分以内で勝たないこと）という状況下、アウェイでガンバ大阪を相手に1-0と90分以内で競り勝ち、他会場の結果を待つ。他会場では残留争いのライバル、アビスパ福岡が敗戦、浦和レッドダイヤモンズは延長戦で勝利を挙げる。この結果、ジェフを含め3チームが同じ勝ち点で並んだが得失点差でジェフは他チームを上回ったため、最終節で降格圏を脱出、年間13位で降格を回避した（1999年J1最終節）。
2000年
1stステージを11位終えたが、2ndステージで敗戦を重ねて一転最下位に転落し、3年連続で残留争いを繰り広げることに。しかし、1stステージでのアドバンテージが功を奏して、1勝（勝ち点3）差で、15位の京都パープルサンガを上回り、年間14位で残留した。
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
しかし、3年連続で降格の危機に面したことに対して、サポーターがクラブの姿勢を激しく糾弾。2000年シーズン終了直前の12月7日には、サポーターが市原臨海競技場を占拠して、当時監督のズデンコ・ベルデニックとチーム統括部長の祖母井秀隆の辞任を求める騒ぎとなった。クラブは成績向上を模索してサポーターと話し合いの場を設ける事に同意し、後日姉崎公園サッカー場のクラブハウス前で執り行われたサポーターミーティングが行われる事になった。これが後のサポーター・コミュニケーション・デーの元となった。
2001年
シーズン開幕前には、当時韓国代表 FW崔龍洙が加入。1stステージで2位となり、下馬評を大きく覆して見せ、この年から始まったtotoと共に注目を集めた。しかしそれでも観客動員は大きな回復を見せず、これが翌年から始まる抜本的な改革の契機となった。
2002年
この年は、調子を落としたものの、1stステージは8位、2ndステージは11位で終え、「万年降格争い」と言われた時代を脱却した。また、Jリーグ開幕以来苦手としていた天皇杯において、初の準決勝進出を果たし、2025年現在での過去最高の成績（ベスト4）を記録している。
2003年
ジェフユナイテッド市原・千葉 歴史
チーム力のさらなる引き上げを目指し、祖母井チーム統括部長は1990年のイタリア・ワールドカップでユーゴスラビア代表監督を務めたイビチャ・オシムを監督に招聘。「賢く走る」、「危険を冒すサッカー」をキーワードにチーム強化を図っていった。また同時に、ユース出身で当時21歳の阿部勇樹をキャプテンに指名。改革はチームの意識変化にまで及んだ。
オシムの監督就任1年目の2003年は1stステージ3位、2ndステージ2位、年間総合3位という結果を残し、優勝争いに加わるチームに成長させた。特に、2003年の2ndステージはステージ優勝を逃したものの、優勝した横浜F・マリノスとは同じ勝ち点で並んでの2位だった。
2004年
1stステージでは勝ちきれず引き分けを重ね、中位に後退。2ndステージでは、首位を独走する浦和レッドダイヤモンズを猛追するも優勝までは届かず、前年に続き2ndステージ2位。
なお、この頃からオフシーズンに主力選手の引き抜きにあうことになる。2003年オフには中西永輔や崔龍洙、2004年オフには茶野隆行や村井慎二というチームのレギュラーが次々退団していったものの、順位を落とすことなく上位争いに加わったが、主力選手の流出は2008年オフまで続くことになる。
2005年