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ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
地面に粘着性の口柄を垂らしてピクミンを捕獲するが、消化することはなく、内容物に唾液や胃液が付着していない様子から捕食が目的ではないよう。死後、体内にあるものは吐き出され、本体は別に降ってくる。稀に果実を取り込んでいるものもいる。
原生生物図鑑によると、クラゲ特有の触手や刺胞を持たず、安全に取り扱うことができるため、運送手段としての活用が期待されている。
浮遊して近づいてきてピクミンを取り込む生態の他、鳴き声もホトクラゲ科に類似しているが、両種の関連性は明らかにされていない。
ルーイメモによると、少し凍らせてシャーベット状にして食べるらしい。
コツリタラシ
【和名：ハンショウシタタラシ 科：オカクラゲ科】
登場作品：Hey!
トロロタラシに類似しており、体内で発生させた暖かい空気で浮遊している。空から長い舌を垂らしてピクミンを捕獲するが、舌を狙ってピクミンを投げつけると地面に落ちる。
ツリタラシ
【和名：ミズイロシタタラシ 科：オカクラゲ科】
登場作品：Hey!
寒くてジメジメした土地に住んでいる浮遊生物。エリア7「大雪原」のボス。ゼリー状の体から舌を伸ばして獲物を狙う点はコツリタラシと同じだが、舌には熱を奪う力があり湖から吸い上げた水を凍らせて落下させたり、時には自身の身体を凍らせて押しつぶそうとしてくる。
ヘビガラス
【和名：オジロヘビガラス 科：ヘビドリ科】
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
登場作品：1、2、3、4
体長：約35cm/350㎜
運搬数：5（『2』）→10（『3』）→15（『4』）
『1』ではステージ「希望の森」で登場。『2』では地下洞窟「白い花園」のボス。地下洞窟「ヘビガラスの穴」、「百戦錬磨の穴」でも中ボスとして登場するほか、地上ステージ「ねむりの谷」「めざめの森」でも登場する。『2』ではもっとも登場頻度の高いボス敵である。『3』では「交わりの渓流」の中ボス。
ヘビとカラスを合わせたような生物。顔は白色でくちばしは黄色、首は長く、青いウロコに覆われている。地中生活の影響で視力は悪いが、後述のアカヘビガラスと同様ピット器官を持ち、熱で獲物の位置を正確に把握する。
地中に潜み近くを通りかかると地面から突然現れ、くちばしでピクミンをついばもうとする。地面のコンディションの影響で地中から現れるときにくちばしがつかえ、飛び出すのに手間取ることがある。『3』では力をためた後、アルフたちを丸呑みにする攻撃が追加されたが、回避に成功するとくちばしが地面に突き刺さって抜けなくなり、しばらくの間無防備となる。
頭部が弱点。高さはそれほどでもないため、黄ピクミンでなくても届く。胴体にも攻撃できるが、ダメージは与えられず食べられる。他の生物に比べて索敵範囲が狭く、後ろに回り込むと攻撃されない。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
姿が酷似する「ヘビガモメ」という生物が存在し（生物図鑑によると生息域に一部重なりがある）、両者は尾羽の斑紋の有無で区別できるというが、ゲーム中では倒しても尾を見ることが出来ないので識別は不可能。図鑑にもヘビガラスしか登録されないが、ピクミンガーデンで後述のヒナガラスの図鑑にて尻の部分の尖った鱗をめくることで判別が可能と明らかになった(白の無地がヘビガラスで、斑紋があるのがヘビカモメ)。
分布の範囲の広さと種が明確に表す地域性により、デメマダラに次いで比較分類される。
『1』では倒すと身体全てが爆発、消滅していたが、『2』以降からは頭だけが残るようになり、『3』では胴体もそのまま残るようになった。 その際アカヘビガラス同様の一本足を確認できる。ただし、尾羽は頭部の羽毛同様に戦闘中に抜けてしまうのか、確認することはできない。
ルーイメモによると、焼き鳥にすると美味らしい。
本編以外では『大乱闘スマッシュブラザーズ SPECIAL』でアシストフィギュアとして登場。地中から出現し、他のファイターに対してくちばしでつついて攻撃する。
ヒナガラス
【和名：オジロヘビガラス ひな鳥 科：ヘビドリ科】
登場作品：4
運搬数：3
活動時間：昼
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
ヘビガラスの子供。親鳥と違って地中に潜らず、エサを多く食べるため食料の豊富な地上で活動し、一本の足で飛び跳ねながらついばんで攻撃してくる。ふ化後一定期間内に見た動くものや声を発するものを親と認識、ついていく刷り込みの生態を持つ。
しかし背が高く、青色をしていて、鳴き声が合わないと親と認識しないため主人公達は容赦なく襲われる。
また、タマゴを破壊すると飛び出てくる個体も存在する。
ルーイメモによると粗挽きのつくねにするらしく、軟骨がコリコリしてて美味しいらしい。
アカヘビガラス
【和名：ヒデリガミガラス 科：ヘビドリ科】
登場作品：2
体長：不明/400㎜
運搬数：5
地下洞窟「ヘビガラスの穴」のボス。地下洞窟「百戦錬磨の穴」でも中ボスとして登場する。
頭が赤、くちばしが黄色、首のウロコが緑色のヘビガラス。1本の足があり、その足で跳ねるようにして移動することができる。
ヘビガラスよりも頭が高い位置にあるため、黄ピクミン以外では攻撃は難しい。足も攻撃できるが、やはりダメージを与えることは出来ず食べられる。耐久力が高く、白ピクミンを食べさせてもほとんどダメージを与えられない。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
ヘビガラスの仲間は土中の生活が長かったため、鳥にしてはあまり目は良くないが、鼻先にヘビ同様ピット器官（熱探知器官）を持ち、正確に獲物を襲うことができる。ヘビガラスと同様くちばしが閊えて、地上に出るときに手間取ることがある。また極稀であるが、紫ピクミンをぶつけると気絶する事がある。
比較的広い場所を縄張りに持っているようで、一部ではヘビガラスとの共生も見られる。
ルーイメモによると、串刺しにしてワイルドに丸焼きにすると美味らしく、生き血を飲むと滋養強壮の効果があるという。
ヨロヒイモムカデ
【和名：ダイオウイモグソク 科：イモグソク科】
登場作品：3
運搬数：20
「再会の花園」にある切り株のうろに生息しているボス。巨大なムカデとトカゲを足したような姿をした多足類で、地面や壁を這いずり回る。食欲旺盛で目にしたものを何でも飲み込んでしまう習性があり、突進によりピクミンもまとめて捕食してしまう。本編では「イカツタツボックリ（ドラゴンフルーツ）」と「いにしえのパケシス（旧式の携帯電話）」も飲み込んでいたりと、意外なものが体内から見つかることもあるよう。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
全身を水晶の鎧状の殻で覆っており、こうした姿から、鎧、具足といった名がついている。ダメージを与えるには水晶を岩ピクミンで破壊して柔らかい本体を攻撃する必要がある。ただし、鎧を破壊するほどに動きが素早くなっていく。また、口元にある顎も水晶であり、これを破壊することでピクミンがまとめて食べられにくくなる。体力が減ってくると、壁を昇って画面に映らないほど上方まで逃げることもある。
ピクミン3のトレーラーやCMなどに登場し、「ピクミン3に出てくるとても巨大な生物」として早々とその存在が知られていた。
原生生物図鑑によると、硬い岩などに身体をぶつけることで自ら殻を割って脱皮を繰り返し、より大きな身体へと成長を重ねていく。
ルーイメモにやると、生きたまま殻と足を毟ってかぶりつくらしい。また、目玉の裏はコラーゲンがたっぷりとの事。
オオバケカガミ
【和名：オウモンコガクレ 科：オウモンガ科】
登場作品：3
運搬数：15
「迷いの雪原」のボス。蛾とコウモリ、さらにはアンコウを合わせたようななんとも言えない外見の生物。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
体表面の色素胞が弱い光を屈折することで完全に透明化することができ、透明状態のまま飛行して近づいてきて、ピクミンを吸い込んで捕食するときにだけ実体化する。光に弱く、特に光の強い場所では上記の性質から透明化が出来なくなる。登場エリアには黄ピクミンで点灯できる電球がいくつかあるため、これらを利用して攻略していく。攻撃を振り払うと羽や頭部の触覚から弱い毒性の鱗粉を撒き散らすが、ピクミンが混乱するだけで死ぬことはない。
ストーリーでは冒頭にてチャーリーを飲み込んでおり、絶命時には洞窟内の電球に衝突して「ハナシズクノミ（マンゴー）」を落とした。
一般的に暗闇の中で進化を遂げた生物は目が退化し身体が白くなる傾向があるが、この生物にはその兆候が見られない。原生生物図鑑によると、夜間は地上に出て行動するなど好洞穴性の性質があると考えられている。
ルーイメモによると、丸ごと揚げて食べる事が出来、産卵前の雌はプチプチした食感が最高らしい。
コカガミ
【和名：オウモンコガクレ 科：オウモンガ科】
登場作品：3
オオバケカガミの幼体であるが、羽は未発達で飛ぶことはできない。卵を破壊しない限り無限に出現する。成体以上に嫌光性が強く、ヒカリキノコや電球の光を浴び続けると、体力が無くなっていき破裂する。死んだあとに死骸は残らない。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
原生生物図鑑によると、強い光で破裂してしまうのは、成体が透明化するのに使っている色素胞が幼体のうちは過剰な酵素を分泌してしまうことでアポトーシスを起こすためである。一方で、宇宙服の光などに反応しないのは、特定の波長の光に弱いためと考えられる。
ルーイメモによると、闇鍋の材料になるとの事。
コカガミの卵
【和名：オウモンコガクレ（卵嚢） 科：オウモンガ科】
登場作品：3
オオバケカガミが壁や地面に植え付けた卵。1つにつき5匹ほど幼体であるコカガミを産み出し、また、周辺のコカガミの数が20匹以上になると産むのを辞める。原生生物図鑑によると、これはコカガミが分泌する特殊なフェロモンを卵嚢が察知し、濃度が一定以上になった時に産むのを辞める性質のためである。オオバケカガミと同エリアにある卵は、大きい電球以外の電球を2つ点灯すると、コカガミを産むようになる。破壊すると大地のエキスを落とす（1個～3個）。
ルーイメモによると、卵の中身は取り出さずにいただくとの事で、口の中でトロッと溶ける感じが最高らしい。
オオスナフラシ
【和名：ハラジロオオウナゴ 科：オオウナゴ科】
登場作品：3
運搬数：20
「始まりの森」のボス。手足はなく大きな口が特徴的なウナギのような巨大生物。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
砂の中を自由に動き回り、アリジゴクのようにすり鉢状の穴を発生させて底に落ちてくる獲物を砂ごと捕食する。この状態では基本的に攻撃は不可能だがバクダン岩がある場合は食べさせることでダメージを与えると同時に地中から引きずり出すことが出来る。体力が半分を切ると、すり鉢状の穴がエリア全体に及ぶほど大きくなる。前兆は、砂中を円を描くように移動することである。
攻撃はもう一つあり、地中から頭を出して砂玉を吐き出してくる。砂玉攻撃に当たるとピクミンが地面に埋まってしまい、さらに埋まった状態のピクミンもすり鉢状の穴で捕食される為素早く引き抜く必要がある。
登場時には「折れたパケシス（折り畳み式の携帯電話）」を一飲みにした他、「ヒトタマデラマンプク（スイカ）」をまるごと一つ飲み込んでいた。
原生生物図鑑によると、飲み込んだ砂を口から砂玉として吐き出すのは、腸管が袋状で口と肛門が同じであるためだが、細かな絨毛により砂の中の汚れが落とされるため、食べた時より出した時のが清潔である。また、音や衝撃に敏感で、ビックリすると砂の上に飛び出す性質を利用した漁が行われている。
ルーイメモによると、調理する前に一晩水につけて砂を吐かせる。厚切りステーキは口の中でとろける味らしい。
カジオコシ
【和名：アオジタカジオコシ 科：カジオコシ科】
登場作品：3、4
運搬数：3
活動時間：昼夜
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
赤と黒の縞模様を持つナメクジのような陸生の巻貝の仲間。一定の場所をぐるぐる回っている。殻を持たない代わりに体表面が可燃性の粘液で覆われており、着火した炎で外敵から身を守っているため、赤ピクミンでなければ倒す事が出来ない。水の中に入ると火は消えるため、その場合は青ピクミンでも攻撃可能。粘液は常に放出し続けているため、カジオコシの体内まで熱は伝わっておらず熱くはないよう。地面を移動する際にも引火性の粘液を残して炎を撒き散らすが、粘液が尽きると自然に鎮火するため、大規模な火災は発生しないらしい。
自発的な攻撃はしてこないが、目の前に立っていると、大きな舌で捕食される。『4』では近くにいるとカジオコシ側から近づいて捕食してくるようになり、多少攻撃的になった。
ルーイメモによると贅沢に舌をミディアムで食べると美味らしい。
ビリー
【和名：テンジクシビレネズミ 科：シビレネズミ科】
登場作品：3、4
運搬数：7
活動時間：昼夜
白い地に茶色いぶちの模様が入ったネズミのような生物。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
顔の全面は長く垂れた毛におおわれて隠れている。この毛は高い蓄電性があり、擦ることで静電気を集め放電し、捕食しに襲ってくる。捕食自体は電気を受けて痺れていないピクミンにも行うため、黄ピクミンなら安全というわけではない。縄張りに入ってきたものに帯電して突進する様子から一見攻撃的に見えるが、臆病な性格ゆえの過剰な防衛反応と考えられている。
原生生物図鑑によると、この惑星の生物には珍しく子に乳を与える「哺乳」を行うなど、既存の生態系に収まらない新しい種であり、進化分類学上の特異点として期待されているらしい。とはいえ、この惑星には明らかに人間らしき生物の暮らしていた痕跡が多々見られるため、人間を含めたほとんどの哺乳類は死滅してしまったと思われる。
ルーイメモによると、もも肉を油で揚げるらしく、痺れる味が癖になる模様。
ホシオトシ
【和名：アシボソタマモチ：タマモチ科】
登場作品：3
運搬数：12
丸い身体に細い足が一対ある生物。金平糖型の水晶を被っており、水晶を岩ピクミンやバクダン岩で砕かなければ攻撃が通用しない。
イモガエルのようにジャンプでピクミンを潰そうとしてくる。ただし、水晶を全て破壊してしまえば踏まれてもピクミンが地面に埋まるだけで死ぬことはなくなる。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
原生生物図鑑によると、もともとは水中に住む生物であったが、硬い殻のおかげで身体が垂れ広がることなく地上での生活を手に入れたとされている。体表面から水に溶け込んだ養分やミネラルを取り入れているが、捕食に比べて効率が悪く、代謝を抑えるために寝ていることが多い。殻は吸収したケイ素から形成されている。
ルーイメモによると、バター焼きや磯辺焼きにすると美味だが、もちもちしているので喉に詰まりやすいので注意しなければならないらしい。
コンペイトウモドキ
【和名：オボコボシオトシ 科：タマモチ科】
登場作品：Hey!
ホシオトシに似た生物。硬い水晶で身が守られている時は凶暴だが、水晶を壊されると逃走しようとする。
マッキー
【和名：キウイマルキドリ 科：キウイモドキ科】
登場作品：Hey!
黄色い鳥のような頭部に二本の脚を生やした生物。大きな嘴は飛行生物だった頃の名残で、目と羽は退化してしまっている。普段は寝ていたり鳴きながら歩き回っているが、ピクミンやオリマーを見つけると捕食しようと襲いかかってくる。挙動は過去作のチャッピーに似ており、後ろからの奇襲に弱い、オリマーとピクミンが大きく離れたら追跡を止める等、共通点は多いが、泳ぐことはできないため、水中に落とすと溺死する。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
『Hey!ピクミン』ではキービジュアルに登場したりパッケージを飾るなど、歴代シリーズのチャッピーさながら作品を代表する原生生物となっている（チャッピーはボスとして登場している）。
トサカマッキー
【和名：トサカマルアオドリ 科：キウイモドキ科】
登場作品：Hey!
頭部にピンク色のトサカを生やし、紫の羽毛に覆われたマッキー。動きはマッキーと同じだが、マッキーよりも体力が多い。
アシナガオトシ
【和名：アシナガキウイマルサクラドリ 科：キウイモドキ科】
登場作品：Hey!
高所のエサを取るために脚が長く進化した、ピンク色の羽毛に覆われたマッキーの亜種。ピクミンを捕食することはないが、足元にいると踏み潰されてしまう。足に生えた羽毛を攻撃するとバランスを崩して転倒し、体にピクミンを投げ当てられるようになる。
ニセシャコモドキ
【和名：オカデメゴウナ 科：デメヤドカリ科】
登場作品：Hey!
硬い貝殻を背負ったヤドカリのような生物。背後に接近しようとする者を貝殻で押し出そうとする。本体に直接ピクミンを投げ当てるかバクダン岩で貝殻ごと破壊することで倒せる。
アカゴデメシズク
【和名：スキダマアカゴデメシズク 科：シズク科】
登場作品：Hey!
天井の水を吸って成長し、雫のように滴り落ちる生物。生まれたてで触るだけで死んでしまう。
クサヤドリアメヒドラ
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
【和名：クサヤドリアメヒドラ 科：アメヒドラ科】
登場作品：Hey!
緑色のスライム状の身体を持ち、植物に寄生して生きるための栄養をもらう寄生生物。寄生された植物はエサを求めて彷徨う。
「最後の大地」にラスボスとして君臨する姿は、三つの頭に巨大な身体を持つまるで龍のような姿の植物の怪物。寄生元の植物は綺麗な花を咲かせる無害な種だったが、ドルフィン2号機が墜落した際にショックで外れたパーツ「キラキラエネルギー変換装置」が昼寝をしていたクサヤドリアメヒドラに突き刺さり、周囲のエネルギーを流入させた結果寄生能力が暴走、他の植物を吸収しこのような怪物になってしまった。
対峙した時は、地中から3本の頭だけを突き出した状態で、毒を吐き出したりピクミンを捕食しようとしてくる。
一定のダメージを与えると地中から身体を引きずり出し、足のような根っこでオリマーたちを踏み潰そうとしてくる。足の裏にピンク色の弱点があり、そこにピクミンを投げつけると転倒させることができる。
さらにダメージを与えると、背中から葉っぱを生やして空を飛ぶようになる。毒吐きや捕食行動の他、画面の奥に移動してビーム状の毒を吹き付ける攻撃も行うようになる。
植物の身体が倒されると、背中を割って本体が出現。身体に刺さったキラキラエネルギー変換装置を落として逃げていった。
ザコサンショウ
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
【和名：ニセガネオカアンコウ 幼体 科：オカアンコウ科】
登場作品：4
運搬数：5
活動時間：昼
タカラサンショウの幼体。提灯の発達も未熟でピクミンをおびき出すことはできない一方、背中にはすでに鉱物を背負っておりそちらはセンサーやピクミンを狂わせる。襲われない様に隠れている事が多い。
生まれてすぐはまだオタマジャクシのような姿で足も無いが、1週間ほどで足が生えて1か月もすると背中の鉱物が出来て陸にあがる。
ルーイメモによると背中に背負ったキラキラ（鉱物）を煮詰めるとカラメルになるらしく、それを使い丸ごと甘露煮にするらしい。
タカラサンショウ
【和名：ニセガネオカアンコウ 科：オカアンコウ科】
登場作品：4
運搬数：20
活動時間：昼
背負っている鉱物のようなものは、体液が凝固したものでキラキラエネルギーと似た成分を含みセンサーを狂わせる他、ピクミンを惹きつけ攻撃を誘発する。
大きな口を開けて舐める様にピクミンを捕食する。背中を攻撃すると鉱物がはがれて生身があらわになるが、すぐに舌で放り投げて元に戻してしまう。
大きな提灯から発せられる電磁波はピクミンやオニヨンに影響を与え、リーダーと誤認させて勝手にオニヨンから出てしまったりあちこちへ自由に移動したりしてしまうが、完全に味方にする事は出来ず引き出したピクミンが隠れてしまい捕食には役立っていない。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
ルーイメモによると身からほのかに山椒の臭いがしており、クセがなくすっきり上品な味らしい。提灯は黒焼きにすると滋養強壮の効果があるとの事。
スイトリー
【和名：ハシブトヒサゴドリ 科：ヒサゴドリ科】
登場作品：4
運搬数：7
活動時間：昼
細長い口を持ち、呼吸筋が非常に発達していて強力な吸引で何でも吸い込んで食べてしまう。
天敵となる大型生物がおらず、エサを取られる競合相手も少ない環境が確保されているため翼は小さく、所謂飛べない鳥である。ピクミンが生息圏を拡大している影響で競争に勝てず徐々に数を減らしている。
ルーイメモによると胸肉、腿肉、手羽、鶏ガラといった部位を余すことなくいただけるらしい。
ヤキオオバン
【和名：セキタンオオバンガイ 科：オオバンガイ科】
登場作品：4
運搬数：7
活動時間：昼
二枚貝の仲間で、体内の油分を貝殻で火打石のように着火させることで片面に常に火がついている。
外敵に対してはひっくり返って押しつぶすことで大地のエキスに還元しつつ、自身の炎で焼き畑農業のように土壌を改良してエサとなるコケや微生物の生育を促している。
ルーイメモによると中身をほじくり出して火が付いたままの殻に乗せて焼くとの事で、香ばしさと旨味が共演しているらしい。
シビレオオバン
【和名：シビレオオバンガイ 科：オオバンガイ科】
登場作品：4
運搬数：7
活動時間：昼
ピクミンシリーズの原生生物一覧 その他生物
体内に筋肉でできた発電器官を持つオオバンガイで、その電気で獲物を感電させて押しつぶし、土壌を改良していく。
ルーイメモによると身をバターで軽くソテーしたらペースト状にした緑色の肝ソースをかけるとの事で、ちょっぴり苦いオトナの味らしい。
ゲーム内で登場箇所が1か所のみ（まっくらトンネルに1匹のみで、ダンドリバトルやダンドリチャレンジ、葉っぱ仙人の洞窟にもいない）の希少な原生生物である。
ヒエオオバン
【和名：カマクラオオバンガイ 科：オオバンガイ科】
登場作品：4
運搬数：7
活動時間：昼
低温の冷気を片方の貝殻から放出して、近づいてきた獲物を凍らせてつぶす。
ルーイメモによると冷える側の殻の下の身はしまっていて、もう片方の身は、脂身たっぷりで一匹で二度美味しいらしい。
ハリアラシ
【和名：ドドメイガグリヒコウ 科：クリヒコウ科】
登場作品：4
運搬数：12
活動時間：昼
臆病な性格で、危険を感じると針を射出させる。この針の再生には多くのエネルギーを消費するため、ゴミを漁って何でも食べてしまう。
体から生えている針は4回飛ばすことができ、針を全て飛ばすと無防備になり攻撃が通る。しかし針はすぐに再生してしまう。
ルーイメモによると肉は綺麗に4枚におろせるらしく、卵とパン粉にくぐらせて弱火で揚げるとの事。
ナゲクライ
【和名：タカアシガマグチガニ 科：ガマグチガニ科】
登場作品：4
運搬数：12
活動時間：昼
二足歩行を獲得した特異的な姿をしたカニの仲間。長い大きなハサミで動きの遅さを補い、獲物を捕らえると頭頂部に大きく開いた口へ放り込んで捕食する。ただ捕食まで時間がかかり、攻撃されるとバランスを崩して転んでしまうため集団のピクミンの前にあっけなく倒されてしまう事が多い。
未成熟なうちはこの口は閉じており、目の下にある小さな口でエサを食べて成長に伴い頭頂部の口が開くと、そこから大量の捕食が出来るようになる。
やわらかな殻の頭部を直射日光から守るため薄暗い沼地や地下にいることが多い。
ルーイメモによるとむしった唇は塩とレモンで前菜にでき、脚と腕と味噌がたっぷりつまった甲羅でフルコースができるらしい。『4』のルーイの日誌でも、倒したこの生物は唇のマリネ、爪のクリームコロッケ、足と味噌の甲羅焼き、目玉の醬油漬けにして食べた事が記されている。
シリアゲヨロヒ
【和名：ケブカシリアゲヨロヒガタ 科：ヨロヒガタ科】
登場作品：4
運搬数：20
活動時間：昼
サソリのような姿の原生生物。全身が硬い甲殻で覆われ、非常に獰猛な性格で鋭いキバのついた顎を広げながら突進して獲物をとらえる。
尻尾を引っ張られると怯んでしまい、弱点の尻尾の先端を狙えるようになる。
ルーイメモによるとしっぽの先は果物のように甘酸っぱいらしい。
コバナタタキ
【和名：クロスジマキバナウリ 幼体 科：ハナタタキ科】
登場作品：4
運搬数：20
活動時間：昼
緑色の象のような生物で生後すぐに皮膚の硬質化が始まり、ほどなく成体と同じ針すら通さない硬さとなる。ピクミン達の攻撃をものともせず、紫ピクミンの落下にすら耐える頑丈さを誇り長い鼻を振り回して追い払おうとする。
この長い鼻に対して体幹があまり強くなく、バランスを崩しやすいせいでトッシンされるとひっくり返ってしまい、柔らかいおなかがあらわになってしまう。
ルーイメモによると身がウリのような青臭さと苦味があるらしい。
オオハナタタキ
【和名：クロスジマキバナウリ 科：ハナタタキ科】
登場作品：4
運搬数：20
活動時間：昼
コバナタタキの成体。長い鼻には骨や関節がなく、全て筋肉でできていて大きく振り回したり、叩きつけたりして攻撃してくる。
その巨体ゆえ簡単にはひっくり返らず、トッシンにも耐える。しかしもう一度トッシンすると横たわり腹が露わになる。
ルーイメモによると大きくなると苦みは消え、甘く芳醇な香りになり、鼻元は煮込み、鼻中は焼き肉、鼻先は燻製と、いろんな食べ方が楽しめるらしい。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
ピクミンには正体不明な原生生物も登場する。主に「?科」と表記された原生生物を記載する。
ピキマキ
【和名：ピキマキミツムシ 科：ミツムシ科】
登場作品：1、2、4
体長：約2.5cm/25㎜
活動時間：昼
風に漂う浮遊生物。普段は透明だが、オリマー達が近づくと興奮して内臓が発色し透けて見える。
『1』では大地のエキスを、『2』『4』では卵を、巣にいる幼虫のために運んでいる。ピクミンを投擲して命中させるとぶらさげた物を落として猛スピードで逃げていく。
『2』では卵を持つという仕様から、タマゴムシを落としていくことがある。
死ぬと体組織が崩れてしまう事と、すばしこく捕まえにくい（ただし、ぶら下げた物を落として逃げていく際を除けば、ゲーム中での移動速度はさほど速い訳ではない）事から、いまだに標本が存在していない生物である。そのためオリマーは「生きたまま持ち帰れば少しは研究が進みそうなものだが」と語っている。
ルーイメモによると、卵をストローで吸えばたくさんの栄養を手軽に取れるバランスフードになるらしい。英語版では携帯食料にとどまらず、スクランブルエッグで素朴な田舎風味のまろやかさと、卵ならではの手軽な高栄養価食品として注目を浴びている模様。ピリッとした辛味もあるらしい。
ミウリン
【和名：ミウリン 科：?科】
登場作品：1、2、4
体長：約6cm/60㎜
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
運搬数：8（『1』）→7（『2』）→10（『4』）
体の左半分が異常に発達した、左右非対称の体を持つ珍しい生物。
高度に発達した知能を持つらしく、捕食による生存を捨て、自ら植物を栽培・培養することによって食料を得ているようだが、実際に栽培した植物を捕食する様子は確認できない。保存のために種子を埋める生物は他にもいるが、定期的に「畑」にやってきて剪定や実を太らせるため余分な枝を落とす等の手入れをするのは今のところミウリンだけである。ピクミンやオリマーを発見すると、植物と勘違いして地中に埋めようとする。
ミウリンを倒す前にピクミンを引き抜こうとすると襲いかかってくる。埋められたピクミンは、オニヨンからはき出されて地中に埋まったものと同様に引き抜く必要があるが、埋められるとすぐに花が咲く。
『1』『4』ではこちらから攻撃を加えなければ何もしてこず、こちらに合わせて動いて見つめるだけであるが、『2』ではピクミンたちが近づいただけで動きだし、埋めようとしてくる。
本来植物を食べる生物だが、お宝を飲み込んでいることもあり、ボス以外では唯一探検キットとなるお宝を所持している。
ルーイメモによるとアシが速い（腐りやすい）らしく、捕まえたらその場で茹でることを推奨している。英語版では「食べられない。鶏肉みたいな味」と矛盾したことが書かれている。
ミズモチ
【和名：オオフグリミズモチ 科：設定なし】
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
登場作品：1
リキッド状の粘性の大きい物体が青色と黄色の2つの核を内包している。黄色の核が感覚器官であり、外敵を発見するとこちらの核を向けて近づいていく。青い核はミズモチの本体とも呼べるものである。
ピクミンが攻撃対象とするのは青い核だが、かなり堅いのか耐久力が高く体力ゲージがなくなるまでに時間が掛かる。黄色い核にピクミンをぶつけると炸裂を起こし、青い核を攻撃している最中のピクミン達は吹き飛ばされるが、黄色い核の方が与えられるダメージは大きい。リキッド状の物体は青ピクミン以外が触れるとリキッド状の物体にまとわり付かれて溺れた状態になってしまい、死亡する（その前に笛で呼び戻せば、助けられる）。オリマーが触れると弾き飛ばされ、ダメージを受ける。
雌雄別体の種だが、ゲーム中に登場するのは産卵前の融合形態である。このことからミズモチは卵生であるといえる。
ミツモチ
【和名：オナガホシミツモチ 科：ミズモチ科】
登場作品：4
運搬数：5
活動時間：昼
先端にヒレがついた尾を持った星型の核とゲル状の体を持った、単一の細胞で構成される原始的な生物。普段は大地のエキスに擬態し、近づいてきた獲物を取り込み消化する。尻尾のある核の部分を引っ張られると弾けて身体が飛び散ってしまうが、核が無事な限り寄り集まって元に戻る。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
ルーイメモによるとゼリー部分をグズグズに崩し、甘味とフルーツを加えあんみつにするらしい。
メダマモチ
【和名：キミノホヤモチ 科：ホヤモチ科】
登場作品：4
運搬数：1
活動時間：昼
原索動物と呼ばれる原始的な生物の一種。見た目は半熟の目玉焼きにそっくりである。
他の生物の卵に住み着き、幼体は脊索とヒレを持っていて魚のように泳ぎ回りながら成長し、成体になると卵の外で活動する。
白身のように見える部分は移動にも利用できる程大きく発達し外に出た胃袋で、背伸びした後広がって獲物を捕食する。
ルーイメモによると、食用は一応可能らしく、ルーイは塩コショウ派らしい。
ドドロ
【和名：オオドロアメフラシ 科：?科】
登場作品：1、4
運搬数：3（『1』）→不明（『4』）
活動時間：夜（『4』）
下半身の大部分が気化している生物。「大水源」にある巨大な卵にオリマーパンチかピクミンで攻撃すると卵から現れる（攻撃しなくとも、一定時間以上卵を眺めているとドドロが現れる）。ただし遭難15日目を過ぎると卵は現れず、卵を攻撃した場合もドドロが現れる前に破壊すれば戦わずに済む（ただし戦利品の玉が手に入らなくなる）。
『1』では戦闘が任意の上に倒してもストーリーの進行に影響がないため、事実上の隠しボスとなっている。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
体の下半身部分にあたる、気化によって生まれたガスはピクミンにとっては強い毒性があり、ピクミンが接触すると即死する。衝撃波を出し、地に埋まっているピクミンを引き抜いた上で、ガスによってピクミンを死に至らしめる。さらにオニヨンの真下に立ってピクミンを呼び出すことを妨害することがある。フリーピクミンは下半身のガス部分に自ら攻撃を仕掛けてしまうので一刻も早く隊列に復帰させる必要がある。弱点は顔だが、絶えず動き回る上に、見た目に反して素早いので投げ当てるのは難しい。耐久力も異様に高いので、一度出現してしまうと手がつけられなくなってしまうこともある。
倒した後に出現する金色の球は『1』で最も栄養価が高い。ただし、宇宙船のパーツは持っていないため、必ずしも倒す必要はない。
なお、ドドロはミウリンの卵であり、孵化に失敗したミウリンだとの説がある。
『4』では洞窟のボスとして登場。薄汚れた卵から出現し、口から「ヤミ」と呼ばれる通常の毒耐性に関係無くピクミンを即死させる猛毒を吐きだして攻撃する。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
腐敗したように常に体組織が崩壊しており、標本も残せないため正体不明とされていたがドドロの生まれる卵はミウリンのものである事が特定されており、ドドロは孵化に失敗したミウリン説を後押ししている。孵化に失敗した理由についてオリマーは、何らかの原因で夜間に地上に取り残されたミウリンが強力な分解酵素を持つヒカリのミツを摂取した結果卵黄の栄養素に影響を与え、胚の生育不良や酵素による分解が起きた可能性を指摘している。
ルーイメモによると卵を燻製にすると美味らしく、食べるとお腹と頭がポカポカするらしい。
タマコキン
【和名：テッポウコキン 科：?科】
登場作品：2
体長：未記載/118㎜
運搬数：10
魚類の究極進化形の一種。体表が魚類の鱗状の模様となっており、体の一部が機械化されている。ステージ内のほぼ全域を珍妙な音を立てて歩き回り、オリマーやピクミン達を発見すると、デウススパイラルチャンバー加速器を用いて加速収束したBB弾（バイオバレット弾）を3つ同時に打ち出す。発射されたBB弾の方向にはばらつきがあり、何かに接触すると同時に炸裂する。口吻は専らBB弾の発射を目的として使われ、捕食を行うことはない。前面には防御板があり、ピクミンからの直接攻撃を防いでいるため、横から攻撃する必要がある。また、高台に居座って砲撃してくる個体もいるため、かなり厄介である。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
生命活動に必要なエネルギーをゼンマイネジに頼っている。物理的に体力が無くなるまで攻撃しても、自動的にゼンマイがまかれ始め、一定時間経過で体力を回復して復活してしまう。石化させてから倒しても魂が出ない。
BB弾は直撃を受けない限りピクミンたちは死ぬことはないが、爆風によって吹き飛ばされ花が散らされることはある。BB弾には他の敵にも攻撃判定があるのでタマコキンをうまく誘導すれば、BB弾で他の敵を倒すことができる。基本的に地下洞窟に出現するが、のぞみの大地では地上にも生息している。
尾びれを固定すると攻撃できなくなるというレポートがあるが、未確認情報である。
ルーイメモによると、刺身、または昆布で締めるらしい。
ヤキダマコキン
【和名：ヨウガンコキン 科：?科】
登場作品：Hey!
赤いタマコキンで、画面の奥から大きな炎の弾を発射してくる。弾は少しすると上空から降ってくる。炎の弾は赤ピクミンでも当たると死んでしまう。体温が高いのか、体の前面にあるシールドは溶けたかのように歪んでしまっている。
アメボウズ
【和名：ヤマトアメビト 科：?科】
登場作品：2、4
運搬数：不明
活動時間：昼
地下洞窟『2』の「水中の城」『4』の「深海の城」のボス。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
巨人のような姿をした生物。体は水飴のような見た目だが、常に原型を保ち、また透明度は高い。そしてその実体は実次元に存在せず、この状態ではピクミンの攻撃やオリマー達のパンチが全く通用しない。加えて紫ピクミンがいなければ、ゲキニガスプレーでの石化以外に全く対抗できる手立てがないため、出現した際は逃げることしかできない。
地底にて数件の目撃例が報告されているだけで、詳しい生態については明らかになっていない。いずれの供述にも共通しているのは「飴のように透明の粘体の巨人」という点と、「報告者が極度の恐怖に襲われ心神喪失状態に近かったため、曖昧な記述が多い」ということ。そのため、「心霊現象にすぎない」「報告者が単なる自然現象を疲れと恐怖によって生物と錯覚しただけ」との指摘もあるが、いずれも証明がされていないため、真相は不明である。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
「水中の城」の1 - 4層目のフロアにて5分間経過すると、2つの石のローラーとともに上方から落下し、敵を含むありとあらゆる生物と障害物を乗り越えて踏みつぶしつつステージ内を走り回る。ローラーの下敷きになると、オリマー・ルーイ・社長以外のいかなる生物も即死し、間欠炎などの障害物（土の壁を除く）も一瞬で破壊される。5層目（最終層）のアメボウズは円形の広場の中央に行くと経過時間に関係なく降ってくる。1 - 4層目のアメボウズは登場時の専用BGMがあるが、5層目のアメボウズはボスとして立ちはだかるため、他のボスと共通のBGMが使用されている。
紫ピクミンを投擲すると実体化し、他のピクミンでも攻撃が通るようになる。さらに、この間は身体を丸めて動かなくなる。これについて、本体は別の次元にあり、紫ピクミンが落下した衝撃で生じる衝撃波をぶつけることで初めて本体を別次元から呼び戻すことができるとされている。実体化した際の本体は紫色をしている。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
HPをゼロにするとローラーが壊れて攻撃手段を失い、素早く逃げ回るだけしかできなくなる。こちらからしばらく追いかけると、疲れて動けなくなる。透明時は紫以外のピクミンは弾き飛ばされてしまうために攻撃出来ないが、紫色に実体化した場合は包囲攻撃が可能となる。ただし、ピクミンを振り払う速度が非常に速く、包囲攻撃では有効なダメージを与えにくい。また、アーチ型の壁がある通路（アメボウズが通行困難な場所）ではそこを無理矢理通ってしまい、出られなくなってしまうこともある。
作中でも特に謎が多い生物であり、遭遇したオリマーも｢何とも不思議な現象｣とした上、｢今でもあれが現実だったのか白昼夢だったのか自信がない｣とまで語っている。しかし、劇中ではローラーが現実に存在し、ピクミンや他の原生生物が下敷きにされるのは事実である。また、探険キットになるお宝を所持していたのも明らかであり、オリマーも「それだけは確かだ」と確信している。
ルーイメモでも「未だに料理されたという話を聞いたことがない。本当に実在するのか？」と言及しているのみである。一方で英語版での説明によると、確かに実在はしているが、筋肉の硬直や心臓麻痺を引き起こす麻痺毒を肉に含んでいるので食用にはならないようである。
アメニュウドウ（謎の生命体）
【和名：セイヨウコガネアメビト：?科】
登場作品：3
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
｢哀しき獣の塔｣のボスであり『3』のラストボス。液状の身体に立方体の核を持ち、様々な形状や材質に変化する他、アメーバ状になったり人型になったりもする謎の生命体。理由は不明（様々な説がある）だがオリマーに執着しており（オリマー自身は探索メモで「気に入られた」と語っている）、シロアリの巣のような塔の中に彼を軟禁。オリマー自身が逃走を図ったり、第三者が彼を救出をしようとしても、執拗に追いかけて彼を捕まえようとする。なお、エリア名にもある「哀しき獣」というのはアメニュウドウのことを指すと思われる。体は金色で、オリマ―は「お宝のよう」と例えている。アメニュウドウは以下の2つの形態が存在する。
第1形態（謎の生命体）
まず始めは塔の頂上でオリマ―に何かしようとしており、アルフ達に気が付くとオリマーを取り込むが、普通に攻撃をすると倒せる。
その後、塔の中に入ると、『1』に登場したミズモチに酷似したアメーバ状の姿となり現れる。Wii U版ではこの時点で注目しても｢謎の生命体｣と称され、オリマーを取り戻そうと背後からゆっくり迫ってくる。移動速度はそれほど速くはないが、多少の段差は乗り越えてくるため注意。その為、謎の生命体から逃れながらオリマーを運搬し、塔から脱出する事が目的となる。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
オリマーめがけて進んでくる間は半透明な状態で、ピクミンでダメージを与えることができず身体の中に取り込まれてしまうが、ピクミンが死ぬ事はなく、笛で呼び戻せば救出できる。しかし、オリマーを捕らえると金色になり攻撃が可能になる。金色になった瞬間にオリマーを運搬していたピクミンや、既に摂取されていたピクミンは即死する。オリマーを捕らえた後は来た道を戻っていくが、ある程度攻撃すると身体がバラバラになり、オリマーを救出できるようになる。ただし、一定時間経過すると復活し、再び迫ってくる。また、この際にアメニュウドウがスタート地点まで戻ると強制的に日没となる。
オリマーを捕まえて逃げる際に、後述のコニュウドウを展開して、ピクミンのまとわりつきを防御することがある。
第2形態
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
塔の天辺に辿り着いた際と、塔を脱出した後にオリマーを取り込んだ際に変化した形態で、人型に近い姿をするようになる。高速で触手をピクミンに突き刺し捕食するほか、火、水、電気、水晶といった属性のある攻撃を持つコニュウドウを繰り出したり、飛行するなど『2』に登場したヘラクレスオオヨロヒグモのように『3』における5種類のピクミンのもつそれぞれの耐性に対応した様々な攻撃手段を持っている。ただし、ヘラクレスオオヨロヒグモとは違い、それぞれ異なる属性攻撃を持つコニュウドウを2 - 3個一度に出してくる。更に突き攻撃も行ってくるので、非常に危険である。攻撃されたり、コニュウドウを展開する時に体の一部を撒き散らしてしまい、これらを破壊することでどんどん体が小さくなっていく。
倒しても死ぬことはなく、オリマーを排出して逃走していく。エンディング時点ではなんと復活しており、飛び立つロケットに塔の上から手を振っているような動作をしている。最初の塔の頂上にいるうえに、オリマーメモにも塔の頂上にいたと書いてあるので、基本的には塔の頂上を住処としていると考えられる。
哀しき獣の塔の中には多くの原生生物の姿が確認できるが、それらは倒した瞬間に溶けるように消滅してしまい、アメニュウドウの細胞によって作られたものと考えられる。また、アメニュウドウがそれらの生物に接触すると、その生物は吸収されて死亡する。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 謎の生物
原生生物図鑑によると、アメボウズの目撃例との類似点もあり、こちらも集団幻覚との見方もある。ただし、アメニュウドウは捕獲された際の詳細な記録が残っており、何かがいた事実だけは認められている。第2形態での身体の穴は心の傷によって空いたものだと言われており、その原因が分かれば、この惑星の生命の進化と歴史を解明する糸口になると期待されている。
ルーイメモによると、危険な味と香りがした為に飲むのを断念したとの事。
コニュウドウ
【和名：不明：?科】
登場作品：3
アメニュウドウが自分の体から吐き出す分身。アメニュウドウと同じく立方体の核を持っており、そこを中心に円形あるいは立方体の形に変化する。
アメニュウドウの身体から分離した後は、炎・水・電撃・水晶など様々な姿に変化して、アメニュウドウを襲うピクミンたちを妨害する。
核を攻撃するには、彼らが展開する属性に強いそれぞれのピクミンで戦う他ないが、代わりに耐久性がそれほど高くない。核を破壊されると原型であるアメニュウドウの体の一部に戻り、一気に破壊するチャンスになる。
モス
【和名：イチヨウイエイヌ 科：?科】
登場作品：4
運搬数：不明
活動時間：昼
全身緑色でところどころ濃い緑の模様があり、しっぽの先端が葉っぱになっている犬。『ピクミン4』にてオリマーがピクミンの次に出会った友好的な生物。非常に知能が高く、主の言う事を理解して様々なお願いをこなす事ができる。
「一番星の隠れ家」ではオリマーが救助されるまでの間、エリア内を徘徊し、ピクミンを見つけると自身の元へ呼び集めてしまう。倒しても一定時間後に復活する上、運ぶこともできない。
呼び集められたピクミンで攻撃してくる事は無いが、運搬作業の邪魔になる上にそのまま日没を迎えると死亡してしまうため、取り返す必要がある。
オリマーが救助された後はルーイの後をついて行くようになる。
しかし、2度のダンドリバトルの敗北後、ルーイはその場から逃げ出してヤタノワスレイヌの元に行ってしまい、モスはルーイに利用されるのを防ぐべくレスキュー隊に保護され、以降は再びオリマーに懐く。
最終的に生まれながらの葉っぱ犬で有るため、オッチンに対して使用した治療薬は効果が無く、PNF-404からは出られないことから、ピクミン達の新たなリーダーとしてPNF-404に残る事となった。
ルーイメモによると食料を調達しに行くのに便利でコンパクトで小回りが利くらしい。
ヤタノワスレイヌ
【和名：イヌガミノツカハシメ 科：?科】
登場作品：4
運搬数：不明
活動時間：夜
地下洞窟「王の穴」のボスであり『4』のラストボス。オッチンやモスを数倍以上大きくしたような見た目をしている。
巨体を生かした突進攻撃のほか、体力が減る毎に氷・電気・炎・ヤミを使った攻撃を繰り出してくる。尻尾にピクミンを数匹取りつかせると追い払おうとした反動でひっくり返り、弱点であるお腹が露出する。
倒すとそのまま一目散に逃走し、装着していた首輪であるお宝「キズナの首飾り」を落とし、この首輪に付着した毛の間葉系幹細胞から葉っぱ化したオッチンの治療薬が作られる。その後、エンディングで主人公達がPNF-404から去った後、モスとピクミン達の元へやって来た。
原生生物図鑑によると、この犬とオッチンは遺伝子的に99.9%類似していると考えられている。この事からかつてこの犬の子孫がPNF-404の知的生命体によって宇宙に進出し、オッチンへと繋がったのではないかとも言われている。
ルーイメモによると極上の毛触りと乗り心地で連れて帰りたいらしい。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
ピクミンシリーズには、植物と動物の性質を併せ持った半動半植物と呼ばれる生物が登場し、ピクミンもその一種である。半動半植物にはピクミンを攻撃してくる生物も存在する。厳密には植物ではないが、キノコであるボケナメコもここに分類する。
ポンガシグサ
体長：未記載/65㎜
茎が短く、地面から直接咲いているような形状を持つ花。花弁は鮮やかな色で、ピクミンの色に対応する8色の種類があり、投げ入れられたピクミンをそのポンガシグサと同じ色にして吐き出す。『1』や『3』ではこれを利用しなければ取れないパーツ、果実があり、『2』においての紫・白ピクミンはポンガシグサ以外に増殖方法がないため、シリーズを通して非常に重要な役割を果たす存在である。
生物図鑑によると半動半植物らしいが、移動は一切しない。神経のようなものはあるのか、花弁にピクミンやプレイヤーキャラクターが触れると揺れる性質がある。『2』以前と『3』以降で大きく見た目が異なる。
『2』のオリマーの解説では「この科の植物の葉は肉厚で柔らかく……」と書かれているが、全体に5枚の花弁とその下に4つのがくがあるのみで、葉に当たる部分が見当たらない。
『4』の図鑑で、花に見えるのは捕虫葉と呼ばれる葉が発達した器官で、近づいてきた虫を捕らえる性質を持つことが明らかになった。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
捕らえた生物は捕食せず、DNAを取り込むことで進化を図ろうとするも、細胞が自己死滅してしまい花と同じ色のピクミンのタネを吐き出すだけにとどまっているらしい。ピクミン・オニヨンとともに生物界の常識から大きく外れており、いずれも密接な関係にある為、ピクミンの亜種、または進化系、もしくは未成熟のオニヨンとされる。
『1』では1度に10匹までピクミンを入れることができ、50匹入れると枯れて消滅するが、翌日には復活する。
『2』では地下洞窟にしか存在せず、そのポンガシグサの色以外のピクミンを5匹入れると枯れ、消えてなくなるが、その地下洞窟から一旦出て、改めて入り直すと復活している（一部の地下洞窟は必ずしも復活をしていないものもある）。前作と比べると、色替え出来る数が大幅に減少している｡『3』や『4』でも5匹しか色替えが出来ない。また、このポンガシグサにも『3』には本編未登場の物が存在。外見は前作に酷似したグラフィックのシロポンガシグサに、五本の花弁の先端に黒い棘が付いている。そこにピクミンを投げ込むと即死する。
オリマーは、ポンガシグサ科の植物を栽培できれば、薬用、香料、観賞用など、用途が多そうだと語っている。
ルリ・ベニ・キイロの『1』における通称・和名はすべて「ポンガシグサ」であり、色名が付記されているのは『2』のみ。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
ルーイメモによればどの色もサラダ(生食)には向かないらしい。
ルリポンガシグサ
【和名：ルリポンガシグサ 科：ポンガシグサ科】
登場作品：1、2、3、4
ルーイ曰く、青臭く、生食には向かない。海外版では、花自体が頑丈すぎるが華やかな飾りにはなるとのこと。
ベニポンガシグサ
【和名：ベニポンガシグサ 科：ポンガシグサ科】
登場作品：1、2、3、4
ルーイ曰く、辛すぎて、生食には向かない。海外版では舌に乗せると燃え上がるとのこと。
キイロポンガシグサ
【和名：キイロポンガシグサ 科：ポンガシグサ科】
登場作品：1、2、3、4
ルーイ曰く、酸味が強く、生食には向かない。海外版ではフライパンが溶ける程の強酸性との事。
ムラサキポンガシグサ
【和名：ムラサキポンガシグサ 科：ポンガシグサ科】
登場作品：2、3、4
ルーイ曰く、脂質が多く、生食には向かない。「森のバター」の異称を持つ（ルーイメモより。アボカドも森のバターの異称を持つ果実だが無関係）。英語版では、そのままでも濃厚なのでドレッシング抜きでサクサク食べられるナイスなベジタブルと評価されている。
シロポンガシグサ
【和名：シロポンガシグサ 科：ポンガシグサ科】
登場作品：2、3、4
ルーイ曰く、アシが速く腐りやすい。英語版では摘み取ってわずか数秒で腐るとの事。
灰色のポンガシグサ（正式名称不明）
【和名：不明 科：ポンガシグサ科】
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
登場作品：3、4
ピンク色のポンガシグサ（正式名称不明）
登場作品：3、4
【和名：不明 科：ポンガシグサ科】
水色のポンガシグサ（正式名称不明）
登場作品：4
【和名：不明 科：ポンガシグサ科】
ポポガシグサ
【和名：ポポガシグサ 科：ポンガシグサ科】
登場作品：2
ルーイ曰く、生食すると、お腹を下す。英語版ではその胃腸へのダメージはお腹下すどころか窒息するほどの消化不良を起こす威力らしい。
まだら模様のポンガシグサで、白色の地に赤 → 黄 → 青と色を変える斑点がある。
ほかのポンガシグサと違いピクミンを1匹しか入れられないが、ピクミンを投げ入れたときの斑点の色のピクミンに変化させて9匹（ただし、投げ入れる直前にいるピクミンが93匹以上、つまりポポガシグサからピクミンが9匹出るとピクミンの数が101匹以上になってしまう場合は、100匹を超えない最大数のピクミン）に増やして放出し枯れる。ピクミンを増やせない地下洞窟においてピクミンを補充できる数少ない手段の一つ。一方的にピクミンが得をしている。
ペレット草
【和名：アメノツユクサ 科：アメアオイ科】
登場作品：1、2、3、4
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
茎部分が半動半植物。花の部分に大地のエキスを結晶化してできたペレットがついていて、それにピクミンをぶつけるとすぐにペレットを落とせる。茎を数回攻撃してもペレットを落とすことができ、ペレット部分を攻撃した場合と異なり鳴き声を発する。
大地のエキスを結晶化出来るのはペレット草だけで、そのペレットにピクミンを始め多くの原生生物が依存しているにも拘わらず生態系が維持できるのはペレット草の成長の早さ故である。
『1』では1ペレットをつけたもののみ登場したが、『2』以降では5・10・20ペレットをつけた巨大変種が登場する。巨大変種もペレットの落とし方は同じ。なお、茎の耐久力は『2』の方が高い（耐久力はペレットの大きさに依存しない）。
ペレットの色は固定のものと変化するものがあり、後者は倒したときの色のペレットが落ちる。『4』では引き出しているピクミンの色と同じ色となる性質を持ち、1色のみ出していれば変化せず、2色以上出しているとそれらの色に変化するようになった。
ペレットはピクミンの栄養であり、同じ色のオニヨンに運ぶとより多くのピクミンが生まれる。1ペレットとはピクミン1匹で運べるペレット。5・10・20ペレットも同じ。
『Hey!』ではペレットのみが登場する。ボーナスステージ内に無造作に置かれており、どれも重さは8。回収するとその色に対応したピクミンが8匹増える。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
ルーイメモによると、スープの味をまろやかにする効果がある事から、料理の隠し味として使えると考えられる。
ボケナメコ
【和名：アカボケオオナメコ 科：ボケナメコ科】
登場作品：1、4
運搬数：10(『1』)→12(『4』)
軸の下に菌糸が発達した小さい足が生えており、歩けるようになったキノコで歩く植物である歩根類に対し歩菌類と呼ばれる。笠の天辺には、目が生えるように出ている。歩く時や走る時には独特の足音をたてる。
オリマーやピクミンが近づくと逃げるように動き回る。足を掬われるとひっくり返る。
弱点は軸の辺りであり、笠の部分は弾力性が強く、ピクミンを弾き返してしまう。
直接、攻撃はしてこないが実際のキノコのように胞子を出すことができ、暫くひっくり返った後に起き上がり、必ず胞子を蒔く。それを浴びたピクミンをキノコピクミンにして洗脳し、それを利用して間接的に攻撃する模様。『4』では、キノコピクミンにして洗脳するのではなく混乱状態にさせる。
食用のキノコで、美味である（公式ガイドブックの原生生物の欄でも、「食べるととても美味しいらしい」と書かれている）というところから、ボケナメコ自体に毒性はない。
ルーイメモによると笠を下にして炭火でじっくりと炙り、しっとり汗をかいてきたら食べ頃らしい。
ドクナメコ
【和名：ボケナメコモドキ 科：ボケナメコ科】
登場作品：4
運搬数：12
活動時間：昼
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
ボケナメコ同様にキノコでも動物でもなく半動半菌類の歩菌類である。
胞子をまき散らしてドクフキコマダラを生やしたり、原生生物の死骸に菌糸を植え付けて動かしたりしてくるが直接の攻撃は毒になる胞子の放出のみである。
他の原生生物に菌糸を寄生させ、身体を乗っ取りゾンビ化させて繁殖するがピクミンが寄生される事はなく胞子を浴びても毒になるだけである。
ルーイメモによると土に40日くらい埋めておくと毒が抜け、むせるほど香りが強くチョコのような味となるらしい。
ボケエリンギ
【和名：アカボケキノコ 科：ボケナメコ科】
登場作品：Hey!
巣穴の中からモグラ叩きのように出ては引っ込むエリンギ。これといった攻撃はしてこない。エネルギー反応の高い物体を溜め込む習性を持つ。
カビコチャッピー
【和名：ボケナメコモドキとその宿主 科：ボケナメコ科】
登場作品：4
運搬数：3
活動時間：昼夜
菌糸に体を乗っ取られたデメマダラの幼体。その名の通り背中にはカビの塊がくっついていて、ピクミンをぶつけると胞子がまき散らされて白ピクミン以外は毒になってしまう。
コチャッピーに意思はなく、ひたすら捕食活動を行い胞子の栄養のためにエサを食べ続けてやがて活動を停止すると、その身体全体を培地として菌糸が成長しドクナメコの幼体が生まれる。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
基本的には倒せば死亡するが、ドクナメコと一緒にいる場合のみ倒してもドクナメコの胞子を浴びると何度でも蘇ってしまう。
ルーイメモによると腐る直前の肉が一番美味しいとの事で、カビをしっかり切り落としたら、熟成肉のような濃い味わいが楽しめるらしい。
カビフラシ
【和名：ボケナメコモドキとその宿主 科：ボケナメコ科】
登場作品：4
運搬数：3
活動時間：昼夜
神経系だけでなく、粘液を出す生理器官も菌糸に侵されてしまったカジオコシ。胞子をまき散らしながら移動して他生物のゾンビ化を促し、菌糸の繁殖に手を貸した後は動かなくなるが体液が抜けて小さくなってしまうため培地にもされず、そのまま放置される。
カビコチャッピーと同様にドクナメコと一緒にいる場合のみ倒してもドクナメコの胞子を浴びると何度でも蘇ってしまう。
ルーイメモによると毒抜きする時の茹で汁が香ばしく旨味が強いが、飲み過ぎるとお腹を壊すらしい。
びっくり菊
【和名：キクヅモリ 科：キクヅモリ科】
登場作品：2、4
体長：約13.5cm/135㎜
運搬数：10
活動時間：昼
根を足のように使って歩けるようになった半動半植物。ヤドリピクミンと同じ寄生性の歩根類で、植物部分が他の生物に寄生している。
ピクミンシリーズの原生生物一覧 半動半植物
普段は地中に体を埋めており、その姿はマーガレットそっくりに擬態（ただし元々植物なので「擬態」という表現は当てはまらない）しているが、よく見ると『2』でのびっくり菊は花の中心部に目があり、葉がない。
『2』では捕食により養分を得る完全な捕食者となったため、光合成を行わなくなり、結果として葉が退化してなくなった。
ピクミンたちが近くを通ると姿を現し、ピクミンを食べようとするが、失敗すると胴体に口が当たり転んでしまう。
「のぞみの大地」では花を枯らすはずのアオケダタラと同じ生息域にいるが、特にお互いを攻撃するようなことはない。
『4』では「寄生する生物が違う」という設定でデザインが大幅に変更されて、頭頂部に目の付いた花を生やした二足歩行の両生類のような姿になった。捕食方法も変更されており、口から粘着質の長い舌を伸ばしてピクミンを捕食する。『2』では葉をつけなくなっていたが、こちらでは葉も本物の花同様につけており一応は光合成も可能。ただし、注意深く探さないと不意打ちを喰らいやすい(ただし、レーダーの原生生物を示すマークにはちゃんと表示されている)。
ルーイメモによると花や脚を捥いで球根状の部分をスライスにしてサラダにすると良いらしい。
おったまダケ
【和名：キノコヅモリ 科：キクヅモリ科】
登場作品：4
運搬数：10
活動時間：昼