とある魔術の禁書目録の登場人物 科学サイド（学園都市）
「暗部」に属する15、6歳の少女。根丘の尖兵。上記の名前は上条に名乗った偽名で、本名は不明。学校では「何でもできる委員長」的な立ち位置にいる。「暗部」一掃に抵抗し、根丘の指示で新統括理事長の弱みである打ち止めの拉致を目論む。
能力は「念動能力（テレキネシス）」。上述の最適化を受けた結果、純粋に「物を動かす力」の一点だけなら美琴でも綱引きにならないほどの圧倒的な出力を発揮する。
碧海 華麗（あおうみ かれい）
「ペットブリーダー」の通称で呼ばれる「暗部」の女性。年齢は大学生くらいで派手な露出の黒光りするボンデージを着ている。秘密裏に訓練された害虫や害獣のような危険なペットをけしかけ、事故に見せかけて狙った人物を攻撃する専門職。単純な脅迫から著名人のリタイア、暗殺まで傷の大きさや感染症の度合いは多岐に渡るという。
花露姉妹
「暗部」でも嫌普性に分類される双子の研究者。どちらも白衣とガスマスクを装備した10歳くらいの長い黒髪の少女で、年齢や背丈の割に胸が大きい。無能力者（レベル0）。有害物質や微生物を昆虫や小動物に載せて指定の通りに拡散させ、狙った個人やエリアを正確に攻撃するエキスパート。高位能力者ではないが、動物を操作するための人工フェロモンや合成蜜と、動物に載せて使う毒性の高い化学薬品や微生物が揃えば、手に負えない脅威となる。
花露 過愛（はなつゆ かあい）
花露姉妹の片割れで、「分解者」の通称で呼ばれる、食物連鎖のピラミッドを循環させるために不可欠な存在である、ハエ、ゴキブリ、ネズミ、ダニなど都市の残飯喰らいの研究者。命と命のやりとりに遊びや気紛れを挟んでパフォーマンスを繰り返す。一方的な吸い上げによって先細りと硬化を招く世界の秩序を嫌い、大きな街の汚れをかき集めて体の中で浄化したいと思っている。その一環で自分の全裸を衆目に晒そうとする悪癖があり、妖宴からはやめるよう何度も文句を言われているが、一向に気に留めていない。その関係で、上条のような熱血で潔癖な正義の押し売りをする男性原理の権化を最も嫌う。また本心では、1人で何でもできることから妖宴の存在を窮屈に感じており、双子の絆も自分自身も「何もかも分解したい」という独立心を抱えている。
花露 妖宴（はなつゆ ようえん）
花露姉妹の片割れで、「媒介者」の通称で呼ばれる研究者で、あらゆる病原菌を効果的に運搬するために小動物を使う。容姿が酷似しているだけに、過愛の特殊性癖に巻き込まれて自分まで恥をかく経験を幾度もしており、何度言っても態度を改めない彼女には手を焼いている。一方で防犯ブザーを過愛の腹部に縫って埋め込むなど、彼女とは対照的に縛り付けてでも永遠にべったりしたいという考えを持つ。双子の片方と向き合ってタイムアタックをひたすら極める事以外に興味が薄いため、明白な目的がない限りは機能と効率を重視する。ぐいぐい推しの一手で来られるとつい流されてしまう性格。
レディバード
木原端数が作ったアンドロイド。外から見れば人間と全く見分けがつかないクオリティで、外見年齢は13、4歳くらい、鮮やかな真紅のロングヘアに、オレンジと黒の競泳水着に似た装束を纏っている。対人関係が皆無で世界が狭く、精神的に未熟である。
「暗部」のゲテモノを素材とした骨格や筋肉は、その気になればV12エンジンの最高回転数とでも張り合えるとされ、40kgはあるだろう女性を片手で振り回す怪力を発揮する。
フリルサンド#G
ドレンチャー＝木原＝レパトリによって科学的に作られた人造ゴースト。外見はツインテールにした長い金髪に薄い青のふわふわしたシルエット、ボディラインのくっきりしたドレスの上に薄布を重ねた、洋風の人形のようなグラマラスな20歳くらいの女性。名前のGはゴーストを意味する。「まずは身近な子供を守る子育て幽霊であって、そのためならば外敵と戦う事も辞さない」恐るべき善性の幽霊である。
ヴィヴァーナ＝オニグマ
「暗部」の和風拷問マニア。長くてクセの強い銀髪に袴姿の女子学生で、滝壺には劣るが巨乳。「暗部」としては良心的で、好普性に分類されている。自分で線を引いて真摯に科学と向き合う専門家で、悪人に対しても非殺傷を選択し、見知らぬ子供を救済するために自分の命を投げ出せるという、無駄を楽しむ浪漫の心を持っている人物。
ベニゾメ＝ゼリーフィッシュ
「暗部」狙いのパパラッチをしている女性。20代前半くらいのグラマラスな美女で、黒髪おかっぱ、クラゲの飾りを付けたド派手なテンガロンハット、真っ赤なチャイナドレスという和洋中揃い踏みの奇抜な格好をしている。特別なスクープを撮るためなら撮影対象を銃撃して混乱を見舞わせるくらいは当たり前、目的のためには殺人すらも厭わない、というモラルハザードを起こした報道人で、その性質から自分から罪を犯す事はないが、すでにある犯罪行為を引っ掻き回して被害を倍加させていく。
硬俵 総太（こうたわら そうた）
「工場否定（パーフェクトフィルム）」の通称で呼ばれる、完璧な身分証を作る技術を持つ腕のいい偽造職人。見た目は岩石のような頑固オヤジ。
警策 看取（こうざく みとり）
声 - 富田美憂
食蜂操祈の協力者でドリーのお目付け役。→詳細は「とある科学の超電磁砲 § 警策看取」を参照
木原 数多（きはら あまた）
→詳細は「§ 木原数多」を参照
木原 幻生（きはら げんせい）
→詳細は「とある科学の超電磁砲 § 木原幻生」を参照
テレスティーナ＝木原＝ライフライン（Therestina=Kihara=Lifeline）
→詳細は「とある科学の超電磁砲 (アニメ) § テレスティーナ」を参照
木原 那由他（きはら なゆた）
→詳細は「とある科学の超電磁砲 § 木原那由他」を参照
木原 乱数（きはら らんすう）
バゲージシティ制圧のために投入された木原一族の一人。茶髪の若い男性。「木原」としてはスタンダードな人物で、軽薄な口調と残虐非道な性格の持ち主。作者曰く一族内のランキングは中の下。「体験」を司る化学物質の研究者で、専攻は世界平和。世界的なスポーツの国際大会など、共通する条件の下で興奮や快楽に包まれている間は、民族・思想・国境といった問題から解き放たれて一体感に包まれる事に着目し、それを人工的に作り出す研究を行っている。
木原 円周（きはら えんしゅう）
バゲージシティ制圧のために投入された木原一族の一人。年齢は中学生ぐらい、左右にお団子を結った黒髪に、統一感のないセーターやスカートといった服装で、オドオドとした雰囲気の大人しい小柄な少女。紐で首から提げたスマートフォンや小型ワンセグテレビなど複数の携帯端末機器で、半自動的にハッキングを行っている。仲間意識を口にしたり他人の身を案じるなど木原一族らしからぬ言動が目立ち、「木原」が足りないと評されるが、頭の良さだけならトップグループに属する。
木原 病理（きはら びょうり）
バゲージシティ制圧のために投入された木原一族の一人。「諦め」を司る研究者。一族の中でも上位に位置する。車椅子に乗っている女性で、眼窩が暗い影に覆われたように描かれることもある。相手を諦めさせることに意義を見出している。
木原 加群（きはら かぐん）
→詳細は「§ 木原加群」を参照
木原 唯一（きはら ゆいいつ）
声 - 中原麻衣
木原一族の一人である若い女性。既製品のリクルートスーツと白衣を着用。一国の指導者程度では閲覧できない情報を得る権限を有している。本来はかなり荒っぽく話すようだが、普段は丁寧な口調で会話する。同じ木原である脳幹のことを「先生」と呼び、尊敬している。脳幹が依頼を受けた際にはサポート役として動いている。非常に優秀な科学者で「滞空回線」を起爆する「横紙破り」などを開発している。また身体能力も高く、「打点を複数設けることで体内に伝播する衝撃同士をかち合わせ、血管内を移動する血液に気泡を与えて死を招く」という数多の体術の元になった技術を使う。
木原 脳幹（きはら のうかん）
声 - 速水奨
木原一族に数えられる犬。ゴールデンレトリーバーに演算機を取り付けただけのものだが、人語を介し言葉を話すことが可能で、推定で80年以上の寿命を持つ。本質的には血族には縛られないという木原一族の一端を表している。犬であるにもかかわらず、各部へのコネクションの影響力が強い。現存する木原一族の中では最古に当たり、今はもう亡き木原一族の始祖である7人によってただの犬から知性を持つ存在となった。
愛煙家でロマンチスト。木原一族ではあるが、それなりに倫理観を持っており、導き出された「木原」の答えを確かめ、7人の始祖が始めたタスクを閉じる事を使命とする。同じ木原である唯一から「先生」と呼ばれ、慕われている。
木原 相似（きはら そうじ）
外伝『とある科学の未元物質』に登場する「木原」の青年。本来の専門は傷んだ肉体を代替するサイボーグ技術で、医療用の人工臓器の研究者であるが、「心を代替させる」事で自分の命令を信条だと思い込ませる洗脳技術を持つ。
木原 端数（きはら はすう）
マッチ棒のように痩せ細った「木原」の老人男性で、アンドロイド・レディバードの開発者。青いつなぎの上に白衣を羽織っている。様々な「暗部」のネタを追ってきたベニゾメをして「ちょっと大物過ぎる」というほどの有力者。レディバードにはアンドロイドの研究が進めば人体実験は必要なくなると語っていたが、「置き去り」を実験台にしようとするなど、本性は「木原」らしく非情かつ悪趣味。
ドレンチャー＝木原＝レパトリ（ドレンチャー＝きはら＝レパトリ）
幽霊という分野にまでメスを入れた「木原」の青年研究者。地味な色のサファリジャケットを着た探検家のような出立ちで、アウトドア用のwebカメラを頭に固定している。「人工的に幽霊を作る」という研究でフリルサンド#Gを開発した。
木原 平均（きはら へいきん）
木原の研究者。心理学的アプローチの一環として尾行技術を習得していたが、完全に公私を混同させる悪癖からストーキングの常習犯でもあった。
冥土帰し（ヘヴンキャンセラー）
声 - 仲野裕
学園都市第七学区にある病院に勤める医師。本名不明。その容姿から「カエル顔の医者」 とも表記・描写される初老の男性。基本的に作中で負傷した人物は、ほぼ全員が彼の治療を受けることとなり、特に上条が最終的に彼の治療を受けて終わるパターンが多い。
医師としての腕はズバ抜けており、どんな病気や怪我も治すということから、「冥土帰し」の異名を持つ。また「何があっても患者を見捨てない」という信念の下、「必要とあらばどんなものでも用意する」と豪語し、医師として眉をひそめるような技術でも躊躇せず治療に利用する。また、治療後や退院後の患者についても気にかけており、声だけで患者を特定できるほど覚えている。
妹達（シスターズ）
声 - ささきのぞみ、日高里菜（打ち止め）、加隈亜衣（番外個体）、小原好美（ドリー）
御坂美琴のDNAマップを用いて作られた体細胞クローン。
ミサカ○○号と呼ばれる（10032号は御坂妹とも）御坂美琴と瓜二つの20,000体に加え、制御用個体の20001号・打ち止め（ラストオーダー）、第3次製造計画で生み出された番外個体（ミサカワースト）、量産型能力者計画以前に製造されたドリーが登場している。
→詳細は「妹達」を参照
芳川 桔梗（よしかわ ききょう）
声 - 冬馬由美
「絶対能力進化実験」の研究員で実験管理の中枢を担っていた女性。実験の凍結後も自分だけ研究所に残り、天井が打ち止めに仕込んだウィルスコードを除去するため、コード解析やワクチンの作成を進めていた。性格は甘いだけで優しくないと自覚しており、かつて、希望であった学校の先生になることを断念した経験がある。
天井 亜雄（あまい あお）
声 - 鈴木達央
「絶対能力進化実験」の研究員で実験管理の中枢を担っていた男性。「学習装置」を用いた人格データの作成が専門で、その前は「量産型能力者計画」に携わっていた。
杉谷（すぎたに）
声 - 松田健一郎
統括理事潮岸の側近を務める男。潮岸の警備組織の半分「杉谷班」を任されている。年齢は30歳ほど。短く刈り上げた頭で、スーツとサングラスを着用している。自らを甲賀の末裔と名乗り、優れた体術と忍者のような相手の裏を突く戦法を使う。
坂島 道端（さかしま みちばた）
学園都市で美容院を営む男性。ややいい加減そうな性格をしているがその腕は確かで、その美容院は常盤台中学から学校指定美容院に指定されている。学園都市では珍しくオカルトも信じており、逆に学園都市の存在意義について疑問を抱く一面もある。
丈澤 道彦（じょうさわ みちひこ）
学園都市で働く整備員の中年男性。自分が製作した駆動鎧「HsSSV-01 ドラゴンライダー」が、第三次世界大戦の早期終結によって倉庫行きが決定したことには安堵と喪失感を募らせていた。
不願 竜造（ふがん りゅうぞう）
学園都市で働く設計士の男性。顧客から求められた設計書を作成してそれを提供するというビジネスを行っている。完成するものがいかに危険なものであっても、それを作るのも使用するのも自分ではないため、法の隙間を潜り抜けて報酬を得ていた。
松定（まつさだ）
学園都市の研究機関に所属する博士。男性。流体力学の権威と呼ばれる著名な学者。
山岳 揚子（さんがく ようこ）
衛星誘導車の運転手を務める女性。
→詳細は「とある科学の超電磁砲 § 山岳揚子」を参照
祭場（まつりば）
学園都市の若い新入り運転士。鉄オタでもないフラットな状態で運転士という職に就いた変わり種。「オペレーションネーム・ハンドカフス」で逮捕された「暗部」を護送する「オーバーハンディング」の運転を担当する。
楽丘 のどか（らくおか のどか）
楽丘豊富の妹。栗色の長い髪を簡素なヘアゴムで縛った、女子大生より歳上くらいに見える、おどおどした若奥様。
ストーカーの木原平均を殺害した張本人で、100均ショップやディスカウントストアを軍の武器庫にも勝る殺傷力の山と化す、死のクラフトスキルこそが本質。必要に迫られればいくらでも破壊力を調達できる閃きで満ちており、不足を感じた瞬間に機転を利かせて創意工夫を思いつき、その場にあるものだけで形を作り、きちんと結果まで残す悪運の強さを持っている。
富良科 凛鈴（ふらしな りりん）
→詳細は「電脳戦機バーチャロンシリーズの登場キャラクター § とある魔術の電脳戦機の登場人物」を参照