チャニング・ウィリアムズ 生涯
遡ること、1872年（明治5年）9月20日から25日にかけて、第一回プロテスタント宣教師会議が横浜にて開催される。日本では当時米国聖公会の宣教師のほかにもイングランド国教会の宣教師がそれぞれの教会の監督の下活動しており、両者が連携して活動すべきであると考えられたからである。この会議により、同一の日本語祈祷書を用いることや神学校を設立することが決定していたことから、ウィリアムズが家塾のかたちで始めた前述の東京三一神学校を母体として、1878年（明治11年）10月に、ウィリアムズを校長に新たな「東京三一神学校」が設立された。米国聖公会からはウィリアムズが校長として、新約学を担当したほか、クレメント T. ブランシェが教会史、W.B. クーパーが組織神学、ジェームズ H. クインビーが旧約学および倫理神学を教え、SPGからはアレクサンダー・クロフト・ショーが証拠論、W.B. ライトが祈祷書を担当した。同年、ビクトリア主教（日本でイングランド国教会の宣教を担当する主教）が不在の間、ウィリアムズ主教は彼の代わりに行動するように要請され、パームサンデーに東京のアレクサンダー・クロフト・ショー牧師の礼拝堂で32人に堅信を授けた。
東京拠点の火災から2年経った1878年（明治11年）11月1日に、大阪から東京へ転任したジェームズ・クインビーが青少年の私塾（通学制）を開設し、立教学校は復興へと踏み出す。1879年（明治12年）9月に開校願いが届け出制に改正される自由「教育令」の内示を受けて、同年6月27日に東京府知事に「私学開業願い」を提出し、立教学校が再び開校された。しかし、クインビーとともに教師を務めた横山錦柵が病気で実働できず、クインビーも病気で帰国するが、入れ替わるようにジェームズ・ガーディナーが1880年（明治13年）10月に来日した。
1880年（明治13年）10月には、立教学校は来日したばかりのジェームズ・ガーディナーを校長に迎え、新校舎の建造を進め、1883年（明治16年）に米国式カレッジである立教大学校を開設する。立教大学校で学んだ岩佐琢蔵（立教大学教授）によると、「ウィリアムズは、学校内の一室に貧しい独身生活をしており、学校の事を直接に何もしていなかったが、その感化は異常なもので、学生全般の精神的生命の源泉であった。そのため、学校内は宗教的気分が実に濃厚であったと考えられる。」と伝えている。
立教大学校の新校舎には、東京三一神学校（のちの聖公会神学院）も移転して大学校と併設されたが、立教大学校と東京三一神学校の学生および築地を中心とする周辺の信徒、求道者が当初は教室で、翌1884年（明治17年）からは講堂で「立教教会」（立教会堂）の名称の集会を開いた。
1886年（明治19年）にウィリアムズは石井筆子（当時、小鹿島筆子）と娘の幸子の洗礼を授け、筆子の教母はクレメント T. ブランシェ、幸子の教母は津田梅子（津田塾大学創設者、聖公会信徒）であった。
1889年（明治22年）12月には、立教大学校（築地居留地37番）に主教館（築地居留地38番）を挟んで隣接する築地居留地39番に聖三一大聖堂が竣工し、立教教会（立教会堂）を始めとする築地の各集会所の会衆と、深川の聖三一教会から2つに分かれた1つの会衆が合併して、新たな聖三一教会（現在の東京聖三一教会）が発足し、従前どおり、立教教会と呼ばれた。深川にとどまった会派は、真光教会（現在は町田市にある）と呼ばれた。
第一回プロテスタント宣教師会議以来協力関係にあった英国聖公会と米国聖公会が合同で日本聖公会を設立する。組織設立には米国聖公会のウィリアムズと英国聖公会のエドワード・ビカステスが主導的な役割を果たし、1887年2月11日に最初の総会を開催した。ウィリアムズは旧約聖書の日本語翻訳にも取り組み、1888年2月3日にプロテスタント各派の宣教師たちにより開催された明治元訳聖書の旧約聖書翻訳完成祝賀会では、米国長老派教会のジェームズ・ヘボンが司会を務める中、会の冒頭でウィリアムズは詩篇19篇の朗読を行った。会ではヘボンとフルベッキにより翻訳の沿革が語られた。1889年にはウィリアムズが日本伝道主教を辞任し、ジョン・マキムが主教を後任した。1890年11月1日には、ウィリアムズの要請により医師で聖公会信徒の長田重雄が京橋区船松町13番地に「愛恵病院」（英語名：Tokyo Dispensary）を設立する。この病院は「築地病院」（英語名：St. Luke＇s Hospital）と改称されたのち、ルドルフ・トイスラーが1901年2月21日に設立する「聖路加病院」となった。ウィリアムズは1893年12月にアメリカへ帰国した。
1889年（明治22年）3月11日に、大日本帝国憲法発布（1889年2月11日公布）の祝賀夜会が、渋沢栄一らが発起人となり、鹿鳴館において開催され、閣僚、皇族、華族、外国人280名を合わせた内外名士ら約1200名が参集したが、ウィリアムズもプロテスタントの長として招待された。ジェームズ・ガーディナー夫妻も招待されている。
1895年（明治28年）に再び来日したウィリアムズは、京都に住まいを得、京都聖ヨハネ教会など3つの教会を管理した。京都では、後に岸和田聖保羅教会で牧師を務めた菅寅吉の一家と一時期生活を共にし、寅吉の3人の子供たちは、洗礼名として長男の菅円吉（後の立教大学文学部長、キリスト教学科創設者）から順にウィリアムズ、チャニング、ムーアとそれぞれウィリアムズの名前が名づけられ、ウィリアムズも子供たちを可愛がり、その後も一家と深く親交した。また京都ではウィリアムズには、友（tomo）という名前のコック（調理人）がおり、ウィリアムズが岸和田へ鉄道を利用して訪問するときなど、友さんのつくった弁当やサンドイッチを持参し、菅円吉は、ウィリアムズからサンドイッチの半分を分けてもらったことがあるという。
1895年（明治28年）に大阪市川口居留地の照暗女学校を京都市に移転して、校名を「平安女学院」に変更し開校する。その頃になると、目が見えなくなったり、また自分の行こうとしていた場所を失念したりするなど、老衰が顕著にみられるようになってきた。
1896年（明治29年）9月、ウイリアムズは新井和臣伝道師を福井に派遣し、日本聖公会における福井での伝道が開始される。同年、福井市宝永中町に講義所（現・福井聖三一教会）が設置される。
その後、ウィリアムズはジェームズ・ガーディナーに依頼してアメリカへ帰国する手続きをしてもらい、1908年4月30日に、横浜出帆の「サイベリア号」に乗船して米国へ向けて出航した。この時、リッチモンドまでガーディナーに付き添われながら帰国した。
1909年にはウィリアムズの病状が悪化したため入院する。入院中は日本語を話して看護婦を困らせたとされる。1910年12月2日、ウィリアムズは逝去した。
以下の墓碑に記されている「道を伝えて己を伝えず」という言葉の通り、ウィリアムズは自分について知られることを嫌っていて、日本から帰国する際に自分に関する資料を燃やしてしまったほどだという。
バージニア州リッチモンドのハリウッド墓地（Hollywood Cemetery）にある彼の墓碑には、次の文字が刻まれている。
「IN LOVING MEMORY OF THE RIGHT REVEREND CHANNING MOORE WILLIAMS, D.D. WHO CONSECRATED HIS LIFE TO JAPANESE PEOPLE AS MISSIONARY AND BISHOP FROM JULY 1859 TO APRIL 1908. THIS TABLET IS ERECTED BY JAPANESE CHRISTIANS. 
創業ノ難󠄀ヲ拜シ堅忍󠄁能ク日本聖󠄁公󠄁會ノ基ヲ奠ム嗚呼我ガ老監督ウイリアムス美哉日本在任五十年道󠄁ヲ傳ヘテ己ヲ傳ヘズ一朝󠄁飄然トシテ去リ老骨ヲ故山ニ埋ム溫容彷髴追󠄁憶日ニ新ナルモノアリ茲ニ碑ヲ老師就眠ノ地ニ建󠄁テ日夕愛慕ノ意󠄁ヲ表ス 大正二年七月󠄁 日本聖󠄁公󠄁會 有志者󠄁」