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ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
フレディは頭の羽根が逆立っていて、片羽にギプスを付けていて体に傷があり、右目が失明している。ジョンソンは姿が隊長に似ているが肥っていて左足がえの短いラバーカップでできていて右目はパットを付けている。
フレッド（リス）/ Fred
声 - 岡林史泰 / フレッド・ステラー
セントラルパークの公園の木に住んでいるリス。目は常に半開き。一人称は「ボク」。性格はかなりマイペースで、スローな喋り方をするのが特徴。コワルスキーの発明品によりマリーンの運命の恋人と勘違いされた（本当は彼の友人で外に住んでいるオスのカワウソだった）。親戚のおじ2人といとこ6人を夜行バスによって轢き殺されている。とてもおばあちゃん思い。ハグが好き。キッカに飲み込まれたことがあるが、無事生還した。
マックス（ネコ） / Max
声 - 荻野晴朗 / ウェイン・ナイト
ペンギンズが月旅行を計画したときに出会った飢えたオッドアイの野良猫。一人称は「オレ」。不時着した場所を月だと思い込んだペンギンズが彼につけた名はムーン・キャット。最初は飛べない鳥だと言って、ペンギンズを食べようとしていたが、ペンギンズの帰り際にリコから魚の缶詰をもらったことに感激し、友好的になった。次の登場時には、局員Xに追われていたところに再会。ペンギンズの協力もあって無事に逃げ切れた。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
シーズン2でも再登場。モート救出のためペンギンズに犬になりきることを勧め、野良犬の心理を教えた。その後ペンギンズを見捨てて逃げようとしたが、Xの時の恩を考え囮になってエルマーをペンギンズから引き離した。その後どうなったかは分からないが、彼がエルマーに自分はキツネザルだと信じ込ませたのか、エルマーと友達になっていた。
たまごちゃん（アヒル） / Eggy
声 - 藤村歩 / タラ・ストロング
マリーンの居住区で拾った卵から孵ったアヒルの子供。オスペンギンであるということからペンギンズが世話を任された。孵化したら即戦力として使用する予定だった。ジュリアンが卵を狙い、空の神が自分に与えたものと思っていた。その時命名した名前は「J.J.（Julian Junior）」。孵化するまでペンギンズに訓練されたため、実力はペンギンズの力を集結させたに等しい。当初は考えていることもペンギンズに似ていたが、後にジュリアンに鞍替えし、性格もジュリアンに似たものとなったが、『メリーキッズマス』、『ベビーシッターはつらいよ』の時は元に戻っている。彼の場合ペンギンズのメンバーに対し“ミスター〜ペンギン”と呼んで敬意を払っている。
キング・ラット（ドブネズミ） / King Rat
声 - シーズン1：斉藤次郎→シーズン2：岡林史泰 / ディートリヒ・バダー
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
下水道に住むドブネズミたちの首領。一人称は「オレ」。他のネズミとは違い背が高く、腹筋が割れている。アイスホッケーが得意で、一時ペンギンズの基地を占領した。倒せるのは隊長のみ。尻尾に赤い輪のあるネズミが現れると簡単に首領の座を降りる。
ロンダ（セイウチ） / Rhonda
声 - タルタエリ / キャシー・キニー
もう一人の敵役。一時的にマリーンのルームメイトとなり、非常識な行動で彼女を辟易させた。後にコワルスキーの発明品を奪うために送り込まれてきた、ドクター・シオフキーのスパイであることが判明した。その後、「ホーボーケン・サプライズ」にて再登場。
アーチャー（アライグマ） / Archie
声 - 坂東尚樹 / ロブ・ポールセン
動物園の外に暮らすアライグマ。公園内の小屋に住んでおり二人称がムッシュであるなどフランス訛りの話し方をする（原語版ではフランス訛りは顕著である）。フレッドの親友。表では可哀想な動物たちにあげるために略奪をしていると言っていたが、裏では略奪したもので生活をしていた。ペンギンズによってその事実が発覚し、今ではペンギンズの指導によって可哀想な動物たちに食べ物を配っている。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
その後帽子や衣装は着なくなり、セントラルパーク内の公園に住み着いたらしく切株等を新人やリコに売りつけようと売り込みをしていた。また、フレッドがドングリの木を当てた時にはジュリアンのダンスの時にDJとして登場もした。
ルル（チンパンジー） / Lulu
声 - タルタエリ / ジェーン・ラバス
一時的にメイソン、フィル達のいるチンパンジー居住区に来たホーボーケン動物園のメスのチンパンジー。空手を覚えている。ホーボーケンから来た動物の中では唯一ペンギンズと敵対しなかった。その後、「ホーボーケン・サプライズ」にて再登場。
スズメバチ / Hornet
声 - 荻野晴朗、石上祐一、岡林史泰 / ジェームズ・パトリック・スチュワート、ダニー・ジェイコブズ
セントラルパーク動物園の時計台に巣を構えたスズメハチたち。子供を刺すのが趣味で、「顔刺したる!」が口癖。巻き舌で話す。モートが巣を破壊したため退散した。
その後は動物園の外に巣を作っていたが、ジュリアン達のパーティーを開いたことで匂いが外の彼らに届いてしまい、果物等を巡って新人とたまごちゃん達を襲った。襲われた新人は考え、結局最後にはペンギンズ基地内に彼らを進入させ、同じ目的で侵入したキング・ラット達と鉢合わせ。お互い倒れるまで戦わせ、最後には新人が彼らを外に追い出していった。
キッカ（ハヤブサ） / Kitka
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
声 - 田中敦子 / カリ・ウォールグレン
セントラルパーク動物園に突然やってきたハヤブサ。ミッドタウンの吸収合併統合ビルの屋上に巣がある。翼の怪我が治るまでに隊長と意気投合した。一時、ジュリアンをさらったとの容疑が掛けられていたが、犯人のオスハヤブサと戦ったことにより、容疑は晴れた。しかし、公園でフレッドを食べていて、それを吐き出したためか隊長から別れを告げられた。
ハンス（ツノメドリ） / Hans
声 - 斎藤志郎 / ジョン・ディマジオ
もう一人の敵役。シーズン1の最終回に登場。一人称は「オレ」。隊長と因縁があるツノメドリ。「コペンハーゲン事件」を起こし隊長がデンマーク国民の敵となるきっかけを作った張本人である。隊長に謝罪をしたいという名目でペンギンズのもとを訪れるが後に彼らを騙し、対決するも敗北。ホーボーケン動物園行きを言い渡される。デニッシュ作りが得意。隊長の妹と思われていた人物の唇を奪ったことがあるらしい。「続・ドクター・シオフキーの逆襲」ではドクター・シオフキーと手を組んだことが、すぐに出番がなくなり、その後は再びホーボーケン動物園に戻った模様。
『ホーボーケン・サプライズ』では一時的にペンギンズと協力した。
その後シーズン3では再びホーボーケンに戻され居住区で一人暮らしをしている。
フランキー / Frankie
声 - 岡林史泰 / ジェフ・ベネット
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
シーズン1から登場しているセントラルパーク動物園外に住んでいる雄の鳩の内の一羽。常に群れで行動しているが、一羽で飛んでいるときもある。
シーズン2ではマクスレイド局長のスピーチを台無しにしようとブルーベリーを丸のみに食べたフンを局長に落とそうとしたが隊長によってそれは阻止された。その後隊長が装備していた防フンチョッキをロケットに飛ばして打ち上げた際に偶然通りかかったフランキー達ハトの群れに当たりフン塗れとなった。
LEM-R（レム・ダッシュR）
人間が作り出したキツネザル型生態コピーロボット。愛称はジュリリン（キング・ジュリアンが命名）。火星への着陸・探検のために作られ、キツネザルの生活を習得させるためにセントラルパーク動物園のジュリアンの居住区に送られてきた。しかし、ジュリアンが教えたのはダンスだけだったため、火星に着陸したときに宇宙イカに捕獲されてしまった。シーズン2で火星から帰還。小さな宇宙イカを連れ帰り惨事となった。なお、モートはLEM-Rを嫌っている。
アカリス / Red Squirrel
声 - 荻野晴朗 / ジェフ・ベネット
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
もう一人の敵役。ナイジェルとバック・ロックガットが追っている伝説の悪党。50年間姿を隠し、自分の望みをかなえるために基地や周りに武器や罠を仕込んでいる。バックロックガットが登場した際にはペンギンズと直接対決することは無かったが、ナイジェルが登場した際には会い見えることとなった。その後、バック・ロックガットを洗脳したが、ペンギンズの活躍によって洗脳が解けて捕獲された。だが、シーズン3に再びセントラルパークの基地へと戻っており、性格上うぬぼれている為シオフキーとは違い部下がいない珍しい彼だったが、フレッドがドングリの木を当てた際は彼とジュリアンを拘束して部下を雇おうとした。
アマリロ・キッド（アルマジロ） / Amarillo Kid
声 - 岡林史泰 / ジェフ・ベネット
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
新人がミスタータックスと名乗っていたときのミニゴルフのライバル。彼曰く新人とのライバル関係の長さと会っていない期間は「チリビーンズ・ボウルの中の蛇より長い」。若いときは新人をも悩ませるプロゴルファーだったらしい。新人に挑戦するためセントラルパーク動物園を訪れ、基地の自爆装置を作動させて動物園を占拠し、卑怯なことをしてでも新人に勝とうとしたが、新人にはかなわず敗北し、どこかへ打ち飛ばされた。その後再び登場したときは、ホリネズミの双子に脅されて新人、及びペンギンズを利用して伝説のパターを盗ませようとしたが、新人を除く全員に飛ばされてしまった。しかし唯一信じてくれた新人の根の優しさに心打たれた結果、パターを手に入れてからは騙そうとしたことを告白。しかしモグラ兄弟は心変わりした場合にも備えて隊長達諸々をはめることに成功。その後彼らとのチェイスでパターを兄弟に盗まれるかと思われたが、キッドは自身のパターで兄弟をヒット。兄弟は無事に捕まり、キッドはその隙にパターを盗もうとしたが、新人に注意されて止められた。
サビオ（ヘビ） / Savio
声 - 岡林史泰 / ネスター・カーボネル
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
シーズン2に登場。もう一人の敵役。キザな喋り方をする。ホーボーケン動物園からセントラルパーク動物園に送られたとき、自らの長い体を利用して檻から抜け出し、ペンギンズや動物園の動物たち（主に哺乳類と、サルの着ぐるみを着た新人）を襲って丸のみにしたが、バートの攻撃に敗れ、ホーボーケン動物園に逆戻りした。その後ペンギンズへの復讐のためにホーボーケン動物園を脱走し、再びセントラルパークへとやってきた。到着前にネズミを送りバートを行動不能にするなど徹底した工作をし、設置した罠をくぐり抜けジュリアン以外の動物を檻に入れたが、ジュリアンのポップコーンバターまみれの体に苦戦。またしても敗北し、ホーボーケン動物園に戻された。
その後、『ホーボーケン・サプライズ』の時はペンギンズに一時的に協力した。
四度目の登場は、動物園に送られてきたベビー・フォッサを退治しようとジュリアンがホーボーケンから送らせてきた。ジュリアンもろともフォッサを食べようとしたが、フォッサの猛反撃によって退散していった。
ちなみにペンギンズは一度も自分たちが勝因になっていないことを気にしている。
ガスの初登場回にもガスのペンギン居住区の水道管の修理を阻もうと隊長の様々な攻めのシーンの中でヘビ攻めで一瞬登場している（台詞なし）。こちらはガスに一瞬で飛ばされた。
宇宙イカ / Space Squids
声 - ジョン・ディマジオ
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場動物
火星に生息する緑色の巨大イカ。ペンギンズはこれを敵視しており、ジュリリンが火星に送られるときに遭遇を心配していた。彼の口から吐き出す液体にあたると動きがフリーズするが話すことはできる。発明万博がセントラルパークで開催された時期に地球へ訪れ、地球の優れた発明品を盗もうとしたが、コワルスキーとマリーンによって阻止され、逃走した。その後「宇宙ペンギン」のラストシーンにて再登場。
クレムゾン（キツネザル） / Clemson
声 - 荻野晴朗 / ラリー・ミラー
どこからかやってきたキツネザル。キング・ジュリアン曰く彼の言葉は心地よくて耳がとろけそうらしい。しかし裏では、キング・ジュリアンをホーボーケン動物園へ送ろうと企んでいた。一時、モーリスに代わってジュリアンの右腕になったが、ジュリアンの地位を奪う前にペンギンズの襲撃にあい、自分がホーボーケン動物園行きの箱につめられるという結末で終わった。しかし、まだ諦めきれず、シーズン3で舞い戻ってきた。ジュリアンがキングではないことを示すと称する書類によって王座を奪おうと策略を立て、ペンギンズをも翻弄しながら遂行しかけしたが、ペンギンズの人格交換マシンの戦略によって再び敗北した。
『ホーボーケン・サプライズ』の時はペンギンズに一時的に協力した。
ナイジェル（ペンギン） / Nigel
声 - 岡林史泰 / ピーター・カパルディ
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
アリス / Alice
声 - タルタエリ / メアリー・シェアー
セントラルパーク動物園の職員。無愛想な性格。ペンギンズが起こす騒動には手をこまねいており、人の目を盗んで活動しているペンギンズに疑惑の目を向けている。魔法の噴水によってペンギンズの基地の存在が暴かれた際には、テレビの取材に対して「胡散臭いペンギンだと思ってました」と答えている。勤務態度はあまり良くないため、動物たちはアリスがクビにならないことを不思議がっている。動物園の閉園時間が大好きで、喜びのあまり客からアイスクリームを奪ったり、売店に並んでいる客を追い払い、強制的に閉店にしたりすることがある。また彼女の履いている長靴は洗われていないらしく、モートが足嫌いになるほどひどい臭い。長年に渡って動物園で勤務しているためか、人並み外れた身体能力を有しており、首や足首は「なんちゃらの巨人並に」頑丈でリコがチョップしても微塵も意に介さず、ガス攻撃も全く効果がない。唯一の弱点は新人のハイパーかわゆさ。
局員X / Officer X
声 - シーズン1：乃村健次→シーズン2以降：宝亀克寿 / セドリック・ヤーブロー
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
全シーズンをかけて登場する、人間サイドの敵役。乱暴かつ傲慢な性格。シーズン1ではニューヨーク市動物管理（正式にはニューヨーク市動物管理及び、プレッツェルカート取締り）局員だったが、街に出たペンギンズを捕まえようとして公共物を破壊して逮捕され、動物管理局員の職を剥奪される。それ以降は職を転々としながらペンギンズへの復讐及びその功績による動物管理局への復職を試みているがいつも失敗している。
母親からは本名を教えてもらえなかったことから名無しの権兵衛を意味する「X」と名乗る。髪型はスキンヘッド。髭は丸髭で揉み上げと繋がっている。腕力は凄まじく、ジョーイを一発で倒すほど。コワルスキー曰く「マッチョなとんちんかんり局員」。サングラスをかけているが、それ以外では眼鏡もかけている。
シーズン2では「局員Xの転身」から登場。ここでは害虫駆除業者に再就職しており、ゴキブリたちを駆除していたが、そのために害虫駆除業者退治に来たペンギンズと再会。隊長・コワルスキー・リコの捕獲に成功するも、新人とゴキブリたちの反撃で取り逃がす。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
「続・局員Xの転身」では、クルーズへ行ったアリスの代わりに来たセントラルパーク動物園の職員としてペンギンズを見張り、以前にも増して凄腕ぶりを発揮する。新人を狙うも、隊長に敗れる。その後はどこかのアパートで部屋を借り、カップ麺を食べながらクラシック曲を聴く日々を過ごしている。部屋の一角にペンギンズのポスターが張ってあり、そのポスターに向かって割り箸を投げてダーツのように刺している光景があった。
シーズン3では「リトルフット」から登場。コワルスキーの発明したペルソナディバイダーによって作り出されたマリーンの野生の部分であるリトルフットが引き起こした騒動で、その騒動のニュース映像及び彼の元職場の上司のインタビューを見ていち早くペンギンズの関与を察知し、リトルフットを確保。動物管理局本部へ届け、晴れて局員として復職を果たした。しかし、ペンギンズによってリトルフットがマリーンに戻されたことを知らなかったことが仇となり、TV中継で動物管理局が大恥をかいた責任を取らされる形で、再び局員としての職を剥奪された。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
「チームワーク強化週間」では魚を扱う倉庫に鮮魚商として就職したが、そこでニシンの確保を隊長に命じられたコワルスキー、リコ、新人と遭遇する。コワルスキー達を捕まえ配送バンに彼らを乗せた木箱を入れ、動物管理局本部まで連れて行きまた局員に復職を果たそうとした。しかしコワルスキー達に逃げられた上、そのいざこざで配送バンは勢いで停車中のパトカーと衝突、さらには照明塔を壊してしまったことでまた御用になった。
「スノーマゲドン」では菓子店の店員として登場。店に侵入した隊長とマリーンの存在に気づき捕獲。動物管理局に復帰しようとしたが、二人の反撃にまたしても敗北する。この時店の設備も破壊したので、また失業したと思われる。
「ヤツはニュースキャスター」にて、ペンギンズの行動がTVで放送されたときに登場。ペンギンズの仕業を証明するが、ペンギンの人形劇と誤解されたため誰にも信じてもらえなかった。
ガス / Gas
声 - 岡林史泰
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
シーズン2から登場。ペンギン居住区の水道管の破裂を直すために呼ばれた「バブーシュカの水道修理」という店の水道修理業者のガンコ職人。本名はグスタフ・ガス・バブーシュカ。47歳。ロシア・サンクトペテルブルク出身。かつてアジア大会の重量挙げで、銀メダルを獲得した経験を持つ。自らの左右の力こぶを「子分たち」と呼んでいる。故郷のことわざ「仕事のやり方は唯一つ、キッチリやる」がモットーで仕事を最後まできちんとやり遂げようとする。レバーサンドが大好物。その後、レナードの居住区の修理のためや、シェリーの居住区近くに開いた穴を埋めに再登場した。
シーズン3でもペンギンズに鍵を奪われたアリスに呼ばれ再登場。再度キッチリやるハズだったがペンギンズに車を奪われてしまった。
カズー小僧 / Kid Kazoo
声 - 子供時代：佐藤せつじ、大人：花輪英司（シーズン1）→佐藤せつじ（シーズン2）
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
かつてセントラルパーク動物園で「伝説のカズー小僧」と呼ばれていた青年。本名は不明。現在は社会人で株式やり取りで若くして一財築いた実業家。子供時代は、日曜日になると毎週動物園を訪れるほどの常連客であり、いつも持っていたカズーを突然吹いては動物たちを驚かせ、慌てる様子を見て面白がる悪ガキだった。特に巨大な耳を持ち、音に敏感な象のバートは最大の被害者。背景キャラ、及び歩行者としても何度か登場している。シーズン3「チームワーク強化週間」では地下鉄に入ってきたコワルスキーと目があいストーカー呼ばわりされた。
ジム / Jim
声 - 佐藤せつじ
カメラマンで、結婚式や成人式などのセレモニーを専門とする。新人曰く「動物を撮るのもうまい」。一年に1回、動物園に来てパンフレットの表紙になる動物を撮る。かわいいと思ったものしか撮らず、すぐに気が変わる。その後は若干少し偉そうな性格になっていた。それ以降では報道関係やマクスレイド局長の写真撮影時等に背景キャラとして登場した。）
チャック・チャールズ / Chuck Charles
声 - 岡林史泰 / ジェフ・ベネット
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
ニューヨークで放映されている夕方のニュース番組、「五時のあなた」のメインキャスターやモーニングニュース、特集番組などの司会も勤める。かなりアクティブな性格で、パフォーマンスもお手の物であり、忍者の動きを基にしているものも多い。何かがあると必ず取材しに来る。彼曰く、キャスターとしての話し方は普段の話し方とは違うらしく、一度キャスターの話し方になると急には戻せないという。番組のメンバーは、お天気キャスターのギル・フォース（Gil Force）（声 - 岩崎正寛 / アル・ローカー）、スポーツニュースのスクーター・アルバレス（Scooter Alvarez）（声 - 荻野晴朗 / アーマンド・バルデス・ケネディ）、アシスタントのボニー・チャン（Bonnie Chang）（声 - 藤村歩 / ローレン・トム）。「ヤツはニュースキャスター」でメインキャスターをクビになり、セントラルパーク動物園の職員に再就職した。しかしペンギンズのおかげで復職に成功する。
セシルとブリック / Cecil and Brick
声 - 宝亀克寿、荻野晴朗 / フレンチ・スチュワート、ジョン・ディマジオ
シーズン2で登場した泥棒コンビ。ブリックは大柄で巨体で物の扱いが荒く、セシルは細身の男性で頭脳派。最初宝石店内に侵入し盗もうとしたがペンギンズの妨害により失敗。二人揃って警察に捕まった。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
シーズン3では南極海へ行って密漁をし、戻って漁港の船積みエリアで荷降ろし中にペンギンズ達と再会。海賊ごっこの相手にされリコとセシル）、ブリックと隊長、新人、コワルスキーが争うが結局のところまた捕まり、再度警察に逮捕された。なお逮捕後のセシルのズボンの後ろにはリコのサービスで生きた魚が入れられた。
その後「ルナコーン・オンアイス」でも一瞬だけ登場。女性の鞄を盗んでいった。
赤ちゃん / Baby
声 - 中嶋アキ
シーズン2で登場。動物園に来ていたパパの赤ちゃん。新人の失態でベビーカーごと動物園から出て行ってしまうが、ペンギンズの手によって無事パパの元に帰された。
シーズン2では、シーズン1で登場したゲストの人間の声は主要な声優陣によって吹き替えられており、ゲスト声優が起用されたのはこの赤ちゃんのみである。
ベスビオ兄弟 / Vesuvius Twin
声 - タルタエリ・藤村歩 / アッティクス・シェーファー
シーズン2から登場する、金持ちの双子。非常に傲慢かつ残忍な性格でペンギンズに物を投げたり、マリーンの尻尾の毛をそったり、ゴリラのタイヤに油を塗ったり、ピンキーを緑色に染めたりと迷惑な行為を行う。動物達からは勿論、アリスからも「お金持ちの悪ガキ」としてマークされているが、彼女はこの2人の実家が動物園に多額の寄付をしていることや兄弟の弁護団の存在もあって中々逆らえない。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
同シーズンではチョイ役としての出番が続いていたが、「恐怖のサーカス」にて遂にメインヴィランを務め、権力にものを言わせて隊長とジュリアンを家に連れてゆき、救出しに来た動物達も捕えて虐待の限りを尽くしたが、最終的に動物達によってその報いを受けることとなった。それもあってかシーズン3では遂に入園を断られたが、財力に物を言わせてお泊りズーのチケットをすべて買い占めることで入園を認めさせた。お泊りズーを二人で独占し、一晩中動物達をからかうことを目論むが、復讐に立ち上がった動物たちから狙われペンギンズによって守られた。しかし、ペンギンズお得意の型破りな作戦の結果、動物達の復讐よりはましだが十分に痛い目にあった。その後、動物園を去る際にコワルスキーがまとめた過去の動物達への悪行が書かれた絵を見たことで改心したが、からかう相手が動物から自分たちよりもお金を持ってない人間に変わっただけであった。
サンタクロース
声 - 宝亀克寿 / ダニー・ジェイコブズ、コンラッド・ヴァーノン
世界中におもちゃを届けるサンタクロース。代理のサンタが募金を集め、おもちゃを届けている。ジュリアン曰く古い友人（メリー・マダガスカル（2009））。魔法使いでもあり、ジュリアンたちによって切り落とされたビッグクリスマスツリーを一気に修復した。
マクスレイド局長 / Pervis McSlade
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 登場人間
声 - 岩崎正寛 / ゲイリー・コール
肩書きは「ニューヨーク市公園局長」。ニューヨークの公園に関する権限を持ち、テープカットなどの行事に必ず出席する。また、出席する際には多くのSPを周りにおく。頭髪が薄く、隊長から「ズラ」呼ばわりされている。動物園規則742「ペンギンに新鮮な魚を条項」を作ったためペンギンズからは好かれているが、公園規則758「鳩追い払い条項」も作ったため、すべての鳩から嫌われている。自分への復讐に来た鳩によって服に糞を落とされそうになるが、隊長に救われる。第3シーズンの話では新聞の裏表紙に出ている。ホーボーケン動物園のフランシスの秘密部屋に肖像画や写真が飾られている。
ユーバンクス主任 / Supervisor Eubanks
声 - 岩崎正寛 / ドット・マリー・ジョーンズ
シーズン3から登場。局員Xの元上司の女性主任。X同様の腕力に優れる剛腕。かつてはXのことを高く評価していたが、ペンギンのせいだと言う彼のことを少し見損なっていた。リトルフット騒動でXがリトルフットを捕まえてきたことで、彼女は彼に局員のバッジを返して局員として復職させた。だが、後にペンギンズの工作によりTV中継で大恥をかき、またXから局員バッジを奪い、彼の局員としての職を剥奪した。
ニューヨーク市民
声 - 荻野晴朗、岩崎正寛、佐藤せつじ、宝亀克寿、岡林史泰、タルタエリ、藤村歩
ニューヨークに住んでいる一般市民。イベントがあるときはかなりの人が集まる。一部の男性市民は、ペンギンズの行動やモートの衝突などによって車が破壊されたときに「俺の車が!」と叫ぶことがよくある（稀に「俺のじゃない車が!」と叫んだこともある）。
デンマーク人署長
声 - 宝亀克寿
アメリカのデンマーク領事館の警備員の長。隊長の冤罪ファイルを警護しており、厳重な警備によってそれを守っていた。「コペンハーゲン事件」における隊長の因縁の相手であるが、領事館に忍び込んだ隊長の前にはあっけなく敗北した。
ピート・ピーターズ / Pete Peters
声 - 荻野晴朗 / ディー・ブラッドリー・ベイカー
チャックの後任の「5時のあなた」のキャスター。チャックが持ってきたペンギンズの行動をTVで放送してしまい、人形劇だと誤解され解雇された。
フランシス・アルベルタ / Frances Alberta
声 - 清水理沙 / メーガン・ヒルティ
「ホーボーケン・サプライズ」に登場。ホーボーケン動物園の若い女性飼育員。ホーボーケンを大幅に改革し、以前は掃きだめのようだった動物園を清潔な場所へと変えた。
その実態は同エピソードのドリームワークス・ヴィラン。自分の功績をニューヨーク市公園局へ行くための糧としており、動物たちをそのDNAから創り出したクローンアンドロイドへと変えて汚らしいものをすべて排除していた。潔癖症のきらいがあり、アリスとは正反対に服は清潔、動物園の通路も、彼女の履いている長靴もピカピカ（日本語版の台詞でも「ピッカピカ」と口癖のように言っている）で、周囲の風景や覗きこむ人物が映り込むくらい綺麗である。話し方がミュージカルのような口調になる時があり、クローンアンドロイドたちに「ハッピー・ホーボーケン」の歌を仕込んでいた。
ペンギンズを「ばっちい鳥」と呼び、本物の動物が嫌い。最後はペンギンズに協力したサビオたちによって悪事が露見、マクスレイドの前で本性を表して彼からクビを言い渡され、大泣きする。
フランク
カズー小僧の上司(声 - 荻野晴朗)のセリフにのみ登場する。会社を辞めたらしい。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 施設・装備・その他
ペンギンズ基地
ペンギンズが生活している基地。本部。動物園のペンギン居住区の地下に作られており、アリスや動物園の従業員には秘密である。中は広く、ワニが入ってもつかえないほど天井が高い。入り口は居住区の餌皿の下や、マリーンの居住区、ロジャーの住んでいる下水道など色々な場所にある。テレビ・武器・レーダー・自爆装置・エネルギー制御システムが装備されており、コワルスキーの研究室や13階分の地下室がある。だが、話によって部屋の構造がたびたび変わっており一定しない。
セントラル・パーク動物園
創立100年あまりのニューヨーク・マンハッタンのセントラルパークにある動物園。屋外の動物の居住区には柵しかないが、爬虫類館などにはガラスが張ってある。周りは公園であるため木々がたくさん生えている。そのうちの一つはリスのフレッドの住処。敷地内には、ちびっ子動物園、ふれあい動物園、爬虫類館、お土産ショップ、動物病院などの施設がある。毎年クリスマスシーズンになると24日から26日まで休園になり、その間、動物たちによって「キッズマス」が開催される。創立100周年時にタイムカプセルが埋められ、その中にあった宝が騒動を起こした。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 施設・装備・その他
キング・ジュリアンの王国
ジュリアン、モーリス、モートが生活している居住区でジュリアンが勝手に王国と称している。王国内には、トランポリン遊具の通称「ボヨンボヨンハウス」や、キングが座る王様チェアなど椅子2脚・小屋・バーなどがある。
ふれあい動物園
セントラルパーク動物園の敷地内にある、ウサギやランディが住む動物園。人に触られるのでランディはひどく嫌っている。ペンギンズによってジュリアンが移されたときジュリアンは「ふれあいん王国」という名の王国を作り、ウサギを家来にしていた。
爬虫類館
セントラルパーク動物園の敷地内にある爬虫類専用の施設。中にはバリー・カメレオンたちがいて、一時サビオがいた。
下水道
昔、ロジャーが住んでいた下水道。ドブネズミたちの住む区域となっている。マリーンの居住区の地下にも古い下水道がある。一部の水流は魚が骨だけになるほどの強烈な流れである。
リコの腹部武器庫
文字通り、リコの腹の中。主に出てくるのは、火炎放射器・手榴弾・バズーカ・ダイナマイト。腹の中は迷路のようになっているらしい。モート位の大きさの動物しか中に入れない。
ラジコンカー
ペンギンズの長距離・高速移動のための車。一度、コワルスキーの発明品が原因でモンスターのようになり、リコを攻撃した。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 施設・装備・その他
ラジコン飛行機
基地内の倉庫にある飛行機。公園でこれを操縦していた青年から奪い、以降空中偵察や、卵の監視などに利用している。
ホーボーケン動物園
ペンギンズが最も恐れ、行きたがらない動物園。隊長曰く雑菌がうようよいる、いわゆる掃き溜めで、世界各国の刑務所・収容所・囚人作業所よりもいやな場所らしい。動物園を襲った動物（ハンス、サビオ、クレムゾン、ロンダのみ水族館）が送られている動物園。だがフランシスの改革によって清潔感あふれる施設へと変貌していた。
博物館
セントラルパーク近辺にある博物館。正式名は自然史博物館。中には、象の剥製、アート作品、美術品、歴史的作品などが展示されている。
ルナコーンズ
プリンセスビューティフルハート（声 - タルタエリ）を主人公とする子供向けテレビ番組。新人・ロイ・ラーがファン。また、レナードも睡眠時に療法としてペンギンズに見せられて睡眠時のみファンとなった。登場人物は純真無垢なセリフを言う。ルナコーン人形は不人気だが、アイスショーにはかなりの人数が集まった。登場するキャラクターにはプリンスグッドボーイ(声 - 岡林史泰)、クイーン・グッドマナー未登場のキンググッドエチケットがいる。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 施設・装備・その他
おマヌケ動物チャンネル
頭にダンボール箱を被った動物が、物にぶつかったりするコメディ番組で、24時間放送している。この番組のせいで動物園に客が来なくなった。
宇宙衛星が爆発したことにより、番組が見られなくなり、また動物園に客が来るようになった。
オクーと動物の森
モートが落とし物の箱から手に入れたゲーム。主人公はオクーと言うピンク色のキャラクター。ゲーム内容には、オクーが星やサンドウィッチを食べる、オクーが雲の上を渡る、おサル叩きなどがある。
コワルスキーに回路を奪われてゲームが壊れ、モートは大泣き。回路を取り付けたサイコトロンは壊れてしまい、ペンギンズが玩具屋から新しいオクーと動物の森を買ってきたが、あまりにも大泣きしていた為、モーリスが新しいおもちゃとして、携帯電話をあげた。
ウォンバットを倒せ
架空のトランプゲーム。詳しい遊び方は不明。タスマニアでは、このゲームでイカサマをすると死刑になるらしい。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
知能増強付き孵化装置
登場「赤ちゃんはペンギンがお好き」
アヒルの子供の「たまごちゃん」の知能を増強させて孵化させるために作った発明品。強力な電気ショックによるもので、これを受けた新人は三平方の定理を説明した。
ジェット・パック
登場「ペンギンたちの三角旗」「ドクター・シオフキーの逆襲」「動物園スキャンダル」「ボディーガード」「かわゆい肉食獣」「ヤツはニュースキャスター」
コーラを振った勢いで飛び、両手につけた主翼でバランスと方向転換をする飛行用スーツ。最初は旗取りゲームでジュリアンチーム対策として製造。その後はドクター・シオフキーのアジトへの潜入、マクスレイド局長への糞対策、記憶消去スプレーの散布など広い分野に使用されている。飛距離はセントラルパークからブルックリンを横断してコニーアイランドに到着できるほど。
スーパー光線
登場「超人モート」
魚に当てるとスーパーフィッシュになるというレーザー光線。その魚を食べると、筋肉量が増し、骨が丈夫になり、驚くほど羽がつやぴかになるらしい。生きているものに当てると身長が高くなりムキムキになり、怒りのコントロールが不安定になる。専用の薬を飲むと元の姿に戻る。
ビームカッター
登場「ルームメイト」
コワルスキーが極秘に作り上げた発明品。触るとかなり弾かれ、ロープなどを近づけると切れる。ロンダに奪われた。
人格交換マシン
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
登場「クロコダイル シンガー」「ムービーデー」「キング争奪戦」
人格を取り変えることのできるマシン。リコとロジャーの中身を変えるために使用。ミキサーを使い、すべての機能を順番に使うと人格を交換できる。元に戻せる可能性は2.7%。その後、毛の生え代わりの時期が来てハイパーかわゆさを出せなくなった新人をモートの体に入れるために再使用したが、モートが動いたために失敗、キング・ジュリアンの人格がモーリスの頭に、モーリスの人格がキング・ジュリアンの尻に入ってしまった。その後、クレムゾンの再襲来の際にジュリアンとペンギンズそれぞれの人格、最後はクレムゾン自身の人格を交換して追い返した。
冷却装置
登場「クールアンドヒート」
ボイラーの圧力を下げるために取り付けるはずだった装置。エアコンにつけると部屋を水浸しにしない限り連鎖反応が起こり、街の半分が吹っ飛ぶ。装置の中には赤、朱色、ワインレッド、臙脂、茜、紅、バラ色のつまみがあり、臙脂色だけを回さないと動物園は爆発する。
無痛ヘルメット／核融合焼却炉／脳エネルギー感知ゴーグル／おとぼけオーラ
登場「ハチとの遭遇」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
無痛ヘルメットはスズメバチの攻撃対策として作り上げた発明品。しかし、テストで手に碇を落としたときは泣き喚くほど痛かった。核融合焼却炉は、モートが触ったときはかなりの電気が流れていた。脳エネルギー感知ゴーグルは、モートがおとぼけオーラに包まれていることを発覚させた。おとぼけオーラによる電気ショックを受けると、頭が空っぽになり、痛みを感じなくなる。また、性格自体もモートと同じになるため、これを使われた者はジュリアンの足に異常な興味を示すようになる。吸い取られた頭脳データは段ボールに保管される。
自白剤／催眠ガス／記憶消去スプレー
登場「動物園スキャンダル」「ヤツはニュースキャスター」
チリソースには自白剤、グレープジャムには催眠ガス、ケチャップには記憶消去スプレーが入っている。自白剤は新人が誤って飲んでしまったことで、隊長のアンコウ料理の腕におべっかをつかっていたことと、動物が襲ってきたときのためひみつをデータにする「コッソリのぞき見」作戦でペンギンズのつかんだ動物達の恥ずかしい情報を暴露してしまった。
ラブハンター3000
登場「運命の恋人」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
防衛策に応用するために製造。運命の恋人を探し出すことができる装置。実験としてマリーンの運命の恋人を探し出したが、装置が示した先に現れたのはフレッドだった。しかし実際は、フレッドの近くにいたスパニッシュギターが得意なカワウソのアントニオ（声 - 花輪英司）を示していた。
DNA検査機
登場「ミス・ペンギン」
メスが一羽いるというアリスの発言から使用された発明品。痰からでも検査可能。大量の電気を食うためヒューズが切れやすい。そのため隊長がメスと勘違いされるという事態を起こした。
生命体・プルプル／圧縮光線→ミニミニ光線
登場「コワルスキーの奇妙な発明」「帰ってきたプルプル」「秘密のトンネル」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
スランプだったコワルスキーの作り出した立方体のスライム生命体。緑に近い黄緑色で透明。跳ねたり擦り進んだりして動く。果物を吸収し、驚異的な速さで巨大化する。嫌いな食べ物は生魚。コワルスキーの発明した圧縮光線で小さくされ、今もひっそりと飼育されている。後にプルプルのみが再登場。果物を吸収しなくなった代わりにホイップクリームを吸収するようになった。巨大化しなくなったが殴る・踏み潰す・爆破するなどの衝撃を加えると増殖し、動物園中をパニックに陥れた。圧縮光線は「秘密のトンネル」で、ミニミニ光線に名称が変更された。バートがネズミに驚き、トンネルを詰まらせた際にコワルスキーが使用するも、バートを小さくするつもりが、コワルスキーが小さくなってしまう。バートに元の大きさにするよう頼むも、大きすぎたり、小さすぎたり、体に水玉模様ができたりしたせいで、元に戻れず、動物達が元の居住区に戻った際も、小さいままだった。
衛星リモートコントロール装置
登場「テレビがライバル」
動物園が閉園の危機に陥ったときに作られた発明品。望遠鏡、携帯電話、パラボラアンテナ、タイマー、懐中電灯、ラバーカップ、ランニングマシーンで完成する。半径72km全てのテレビに動画を送ることが出来るが、ランニングマシーンを一定以上で走ると、負荷が掛かりあっという間に壊れる。
潜水艦
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
登場「水中に舵を取れ」「ビックフィッシュストーリー」「コードネーム 南極作戦」「私を愛したペンギン」
1回目は、アヒルに頼まれたライギョ退治のために建造。ジュリアンが勝手に命名した名前は「キングジュリアン・アイアイ（アイアイは二世の意）」。隊長が艦長、新人がレーダー、コワルスキーが航路、リコが見張りという分担であり、ライギョへの体当たりのため崩壊。2回目は、ニューヨーク湾の海底、ノルウェー王国のニシン運搬船「フィスケンルクト号」のニシン引き上げのために再建、使用されたが、そのニシンのせいでリコを除いたペンギンズは魚中毒に。3回目は、ヒョウアザラシのハンターと共に南極へ飛ばされてしまった新人を助けるために使われた。4回目は、ドリスの兄であるフランシスを、シーヴィルわくわくアクアパークから助け出すために使われた。
サイコトロン
登場「ともだちは箱の中」
相手の考えていることが分かる機械。チープな回路を使うとすぐに発火する。モートのゲーム機の回路を取り付けるも、あまり持たなかった。
脳改造マシン
登場「知りすぎた少年」
スパイの親玉であるという誤解から、校外学習の引率をしていた先生に対し記憶改ざんの目的で使用された。
ザ・ヘルメット
登場「ザ・ヘルメット」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
名称は仮。コワルスキー曰く「良い名前があったら受け付けます」。思ったことを実現できる装置。物を浮かせて移動させたり、取り寄せたりすることが可能。強度を最大10まで調整できるが、コワルスキー並みの頭脳でも1から5程度が限界であるらしい。キング・ジュリアンがコワルスキーから盗み、強度を最大にしてしまった結果、装置を暴走させてしまう。
神経無効化装置／ハイパーレーザー標的システム／磁力解除装置
登場「リコVSモンスターカー」
これらの発明品には、文字の読めないコワルスキーがカンで作成したネームプレートがつけられていた。ハイパーレーザー標的システムは、リコがうっかり壊したラジコンカーに誤って取り付けられた。
赤外線ニシントースター／透メーカー
登場「限りなく透明に近いマシン」
赤外線ニシントースターは爆発を起こし、コワルスキーが隊長に発明や実験、怪しい活動の禁止を言いわたされるきっかけとなった。それにより、コワルスキーは隊長を見返すべく物を透明にする光線を発射できる車である透メーカーを発明したが、ジュリアンのせいで大パニックに。正式名は透明物質製造機。
予期せぬことを探知する装置
登場「予期せぬできごと」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
マッチ棒の触れ具合によって予期せぬことを探知できる。男の子のアイスクリームが落ちることを探知できたが、新人の投げた魚がリコに当たり、リコの口から出た物（ラバーカップ）が鳩に当たり、それが落ちて作業員に当たり、倒れた梯子がカートに当たって進み、その中身から飛び出た金物を誤ってバートが吸い込み、勢いよく吐き出されたそれらがゴリとラーの居住区に吊り下がっていたタイヤを切り外し、そのタイヤが転がってベビーカーにあたり、ベビーカーごと赤ちゃんが動物園から出てしまうということは予期できなかった。また、恐ろしいことが起きるとなると爆発する。
ドリンククーラー／高エネルギーベーグルトースター／陽電子舌クリーナー／素粒子爪切り／耳垢リサイクラー／ハイパーチャージした脳
登場「脳内レボリューション」
コワルスキーの研究していたもの。ドリンククーラーと耳垢リサイクラーは大爆発を起こしている。また、コワルスキーは自らの脳をハイパーチャージし、この世で一番賢いペンギンと称したが、原因不明の脳の縮小が起こり、知能が減退した。
クランクカラカラ背骨矯正機
登場「一日一善」「眠りにおちたシェイクスピア」
メイソンにバケツが当たったときに登場した。中世の拷問装置をモデルにしている。引っ張られると背が伸びる。新人への尋問のときに再登場したが使用されなかった。
かわゆさアナライザー
登場「かわゆさオーバーロード」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
営業スマイルが飽きられたことにより新たなかわゆさを求めて使用された機械。測定結果はリコがマイナスで怖いか危ない。新人は何もしなくても48%という結果が出た。また、測定結果が100%を超えると、自前のかわゆさで相手の脳をオーバーロードさせる「ハイパーかわゆさ」を発揮できるとされる。
音速素粒子加速器
登場「キング・ジュリアンの一日隊長」
ジュリアンが一日隊長として基地を散策していたとき、地下13階の極秘エリアにて見つけた発明品。マリーンの綿あめを取ってきて欲しいという要望を叶えるために使用。
おやすみファイティング・モビール 宿敵バージョン
登場「なんちゃってヒーローズ」
隊長を起こさないようにするために使用された物。絵が下げられており、ドクター・シオフキー、ハンス、老人（ヒッピー）の絵が付いている。これをつけている間は宿敵を倒す夢を見ているため簡単には起きない。
ビーム銃／ラット・キャノン
登場「ゆりかごの中の隊長」
腐った魚を若返らせてフレッシュにするための発明品。隊長に向かって誤射され、隊長が子供になってしまった。下水道に落ちてドブネズミに奪われた時はフレッシュライザー・ネーターと呼ばれ重宝されていた。ラット・キャノンは、対ネズミ用に開発されたミサイル。
スーパーコチョコチョ
登場「色白は七難を隠す?」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
アリーン（塩素で白くなったマリーン）が自分はマリーンであると名乗ったとき、調べるためにコワルスキーが出したもの。先にピンクの毛のようなものがたくさんくっついており、新人がスーパーコチョコチョをうけ大笑いしていた。
クロノトロン／スノーコーンマシン
登場「タイムマシンにお願い」
過去に行けるいわゆるタイムマシン。名が味気ないのでこの名が付いた。未来の人物がこれを使って現在の同一人物と対面すると時空の連続性が狂い、地獄と化し混乱する。コワルスキーが唯一使用し、過去から来た者、過去から来てもう一度過去に行った者、現在いる者と3人が一斉に出てきてしまい、混乱を引き起こした。最終的にリコによって時空の狭間に投げ込まれたことで解決した。その後スノーコーンマシンが開発されたが、その結果アメリカ中がスノーコーンアイスに埋め尽くされた所で物語は終わる。
ナノマシン
声 - 荻野晴朗
登場「ナノマシンにおまかせ」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
顕微鏡でないと見られないくらい小さい発明品。これを機械にかけるとグレードアップする。ペンギンズに危害を与えないように防御プロトコルをプログラムした。しかし、「バリーが猛毒を持っているから危険」という言葉に反応して防御プロトコルがエスカレートし、ちょっとしたことでもペンギンを守ろうと発展しさらにナノマシンの機械が合体してロボットのようになったが最終的にコワルスキーに危害を与えたため自分のプログラムの犠牲になり自爆、コワルスキーは隊長にこっぴどく叱られることになった。
ザ・ネクスト・クールビズン
登場「はじめての宿敵」
次世代ペンギン型ロボットスーツ。コワルスキーが何回もテストしたがすべて失敗した上、デールとのトラブルの元になってしまう。
S.T.A.N.K.（スタンク）
登場「しょっぱい関係」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル コワルスキーの発明品
トイレの形をした匂い爆弾で匂い爆弾の親玉。「プロジェクト：スーパー とっても アロマティック 二度と結構 カブーンブーン（Project：Super Toxic Aromatically Noctious Kaboom-boom）」の略語。便座に座らせたターゲットをロックし爆弾のコアを刺激して爆発する。新人がペンギンズに入る前に完成していて元々ドクター・シオフキーに使用する予定だったがイルカはトイレを使わないため断念し封印したが諸事情により姿を現した。今でも動く。ロックを解除するには塩分（塩や涙など）が必要。
クロノカービュレーター/超次元歯ブラシ
登場「ストップウォッチ」
ストップウォッチの形をした時間を止める装置だが発音しづらいため隊長に「ストップウォッチ」と改名された。ペンギンズはこれでアリスにイタズラしたり、かき氷売りのワゴンのかき氷をワゴンごと強奪しかき氷を食したりするが、ジュリアンにストップウォッチが奪われたあげく、ストップウォッチが壊れた。これによりジュリアンとコワルスキーを残して時間が止まり、コワルスキーが試行錯誤に直そうとするが治らないので、2人で時間が止まっている間にやりたい放題やった（その間コワルスキーはたくさん発明を行っており、超次元歯ブラシは7009個目の発明である）。その後ストップウォッチの中にジュリアンが噛んだガムが入っていたことがわかり、それを取り除いたことによりストップウォッチは直った。
ペルソナディバイダー
登場「リトルフット」
性格の一部を取り出すことが出来る機械。すでに完成されていたが、コワルスキーの哲学的配慮から使用されなかった。マリーンの野生の部分を取り除くために使用されたが、その影響でマリーンは極端に怖がりになった上に野生の部分がリトルフットとして具体化、街に出て暴れまわった。しかし再び光線を当てて合成、マリーンの野生の部分のコントロールにも成功した。
チュロスティ・フィッシュ・ナタイザー
登場「夢のフィロス」
ペンギンズの好物であるチュロスと魚を合体させた「フィロス」を量産するマシン。隊長曰くこの世の旨いものを凝縮した味がするらしい。有害物質を宇宙空間に垂れ流すのが欠点で、ペンギンズがフィロスを食べまくったため有害物質のバブルが宇宙に発生。動物園近辺に局地的な異常気象を巻き起こした。ジュリアン達からするとフィロスはまずいと感じるらしい。
内蔵式バイオ顔文字センサー／くっつき装置
登場「ずっ敵」
バイオ顔文字センサーによって敵か友かを判断する機械。だがセンサーを逆に取り付けていたため、友を敵と判断してアラームを鳴らし続けた。そのため、しびれを切らした隊長が破壊しようと叩いた際、体に電流が流れ、機械の中身が隊長に流れ込み、彼がハンスと手を組むに至った（ジュリアンも本心では敵と思っていたので友人として接した）。くっつき装置は隊長を元に戻す際に使用された。
フリーズ光線
登場「お泊りズー」
ベスビオ兄弟を救うために使用された銃。フリーズと解除を使い分けることが出来る。だが人間に対しては一定時間が経つと解除されてしまう。
セクタービクターブラボー
初登場「マダガスカルからの物体X」
場所を探知するイワシ缶でできた機械。初登場以来、ほとんどの話に登場している。ラブハンター3000に接続することができる。
ターボシューズ/お尻ペンペナー
登場「腹はなんでも知っている」
パワーセル
登場「続・ドクター・シオフキーの逆襲」
核融合イワシ缶詰
登場「プリンセス・パーキーちゃん」
発明したものの制御が不可能であった。半径8kmを壊滅させる威力とされていたが、実際の爆発は規模の小さいものであった。
スキスキレーザー
登場「スキスキレーザー」
アイス光線
登場「コワルスキー司令官」
物を凍らせることができる。マリーンの居住区が水浸しになった際に利用され、その後、メンドリに奪われた。
反重力ソックス
登場「私を愛したペンギン」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル ドクター・シオフキーの装備、戦力
リング・オブ・ファイヤー（Ring of Fire）
「ドクター・シオフキーの逆襲」に登場
北極の氷を溶かして地球を海で覆い尽くし、人間達に火の輪くぐりをさせる為につくられたマシン。北極点を丸く囲む8つのタワーにより構成される。タワーはドリル型で、地球の中心から熱を取り出し、傘の骨のように開く10本のバーから熱を発散する。チャック・チャールズ曰く「熱の輪っか」（Hoop of Heat）。ドクター・シオフキーのアジトにある遠隔操作盤には丸い4つの押ボタンがあり、「赤」で起動、「青」は熱出力を「笑っちゃうレベル」（ludicrous level）に、「緑」は出力を「メガトン級」(beyond all reason）に増加させる。停止は「紫」である。
メタルクロー（Chrome Claw）
「ドクター・シオフキーの逆襲」に登場
ドクター・シオフキーによって凶悪・巨大化し、右のハサミが金属と化した1匹のロブスターで、15匹ぐらいのパワーを持つ。武器はハサミ（爆弾を一鋏で粉砕した）と尾（コワルスキー、リコ、新人を一発で跳ね飛ばした）。元々は海と陸を支配する為に作ったが、隊長を倒すために送った。隊長をハサミで追い詰めとどめをさそうとしたが、リコ、新人のダイナマイトで真上の橋を落とされ、下敷きとなった。
マインドジャッカー（Mind Jacker）
ザ・ペンギンズ from マダガスカル ドクター・シオフキーの装備、戦力
「続・ドクター・シオフキーの逆襲」「私を愛したペンギン」に登場
スクーターの中に装備したピエロの頭部をしたマシン。口から発射される光線は、相手（隊長、コワルスキー、リコ、新人、ロブスター、シオフキー本人）の記憶を抜き取ることが出来るが、再度打ち戻せば、抜き取った記憶を元の持ち主に戻すことが可能である。
ディアボロジャイザー（Diabologizer）
「続・ドクター・シオフキーの逆襲」に登場
あらゆる物を凶悪する、巨大なレーザー砲。放たれる光線は、色々な物を巨大な怪物に変化させることができる。1匹のウサギで実験し、その後コワルスキー、リコ、新人をモンスターにしようとしたが、モートと共にエレベーターから戻ってきたジュアリンのMP3プレーヤーに命中してしまったが、パワーセルの働きで、意味を持つ怪物と化した。
MP3プレーヤーモンスター
「ディアボロジャイザー」に当たったMP3プレーヤー。サイバー的な風景とギザギザ線の画面とイヤホンが両目になってるのが特徴で、パワーセルの働きで意志を持ち、宙を泳ぐように移動し、目から光線を発射する他、そこに入った物の声が歌声（アレックスには影響を受けない）となる緑色の空間に作り出すことが出来るが、相手の歌声（シオフキー、ジュリアン、隊長）には反応する。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 各話リスト
日話数は日本の話数。米話数はアメリカの話数。Sは日本でのシリーズ話数。D話数は日本のディズニー・チャンネルおよびディズニーXDでの話数。米話数で斜体の話数は本来は別シーズンの話数。E放送日はNHK Eテレでの放送日、X放送日はディズニーXDでの放送日、D放送日はディズニー・チャンネルでの放送日。絵コンテで無表記は不明。
日本語版サブタイトルはリコ役の岩崎正寛が読み上げ、その後にサブタイトルに関したネタを言う。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 放送局
ここでは日本での放送を表記する。放送地域は全国放送。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル 備考
本作は、アメリカと放送順が異なり、さらにはEテレのシーズン2からシーズン3の放送順も異なるため話に辻褄が合わない時がある。
シーズン2までは次回予告が存在していたが、シーズン3から次回予告がカットされ、声の出演のメインキャラ以外の声を担当する人物についてもクレジットされなくなった（メインキャラも登場がない回はクレジットされない）。また、スタッフクレジットもシーズン2までは1つずつ表示していたが、シーズン3からはまとめて表示するようになった。なお、本作が土曜に移動した後も年末年始の特番に限り日曜に放送されることがある。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル ペンギンズ FROM マダガスカル ザ・ムービー
ペンギンズを主人公にした映画。本テレビシリーズの劇場版ではなく『マダガスカル3』の続編として制作されており、キャスティングもそちらに基づいている。ただし日本語吹き替え版では、テレビシリーズにおける主要キャストの多くが別役として出演している。
詳細は『ペンギンズ FROM マダガスカル ザ・ムービー』を参照。
ザ・ペンギンズ from マダガスカル DVD
当初は2011年3月11日リリース予定だったが東日本大震災により長期間延期されていた。しかし2012年7月13日に再びリリースすることがニコロデオンサイトで発表された。
『ザ・ペンギンズ from マダガスカル ペンギンズ、DVDデビュー』
「ペンギンズ、月へ行く?」「マダガスカルからの物体X」「ハラハラ時計爆弾」「ゴーフィッシュ!」「小脱走」「ルームメイト」「人気者で行こう!」「クロコダイル シンガー」「ワイルド・マリーン」「局員Xの追跡」
『ザ・ペンギンズ from マダガスカル ハッピー・キング・ジュリアン・デー』
「キング・ジュリアン・デー」「バッテリーズ」「王様の私」「モートとぬいぐるみ工場」「愛と王冠はドブの中に」「ペンギンズ・オブ・サンダー」「いつも心に太陽を」「マイ, ロボット」
ザ・ペンギンズ from マダガスカル DVD
『ザ・ペンギンズ from マダガスカル メリー・キッズマス』
「メリー・キッズマス」「ゴールデン スクイレル 〜失われたお宝〜」「ボディガード」「ミラクル・オン・アイス」「ザ・ヘルメット」「噴水に願いを」「アカリス大捜索」
『ザ・ペンギンズ from マダガスカル ミッションはインポッシブル? ポッシブル!?』
「局員Xリターンズ」「ジャングルの掟」「超人モート」「ハチとの遭遇」「おみくじクッキー」「クール＆ヒート」「ゾウは決して忘れない」「運命の恋人」
『ザ・ペンギンズ from マダガスカル パトロール隊、始動!』
「ドクター・シオフキーの逆襲」「隊長はニュースキャスター」「動物園スキャンダル」「空のギャング」「失われたブギ」「さびしんぼうキング」「触れられざる者」
グラゼライト人
グラゼライト人 (Grazerite) は、アメリカのSFテレビドラマ『スタートレック』シリーズに登場する異星人。
草食動物から進化したヒューマノイド。硬質で黄褐色の皮膚を持ち、眉はなく両目の上から頭部へ続く隆起が特徴。非常に温厚で、争いや暴力を嫌う。
グラゼライト人 代表的なグラゼライト人
ジャレシュ・インヨー
地球暦2370年代はじめごろの惑星連邦大統領。もとはグラゼライト選出の惑星連邦議会議員で特に政治的野心を持っていたわけではなかったが、周囲に頼まれて大統領選挙に出馬したところ当選し、期せずして惑星連邦の長となる。在任中にはドミニオンの侵攻やレイトン宇宙艦隊中将のクーデターが起こるなど、困難な時期の惑星連邦を統治する。なお地球暦2372年の時点で政治家歴が約70年に及ぶ大ベテランである。