2008年北京オリンピックの聖火リレー リレーが行われた各地の様子
2008年4月20日朝、本堂に落書きがあったとして警備担当の僧侶が長野県警へ 通報を行った。善光寺の本堂は1707年に再建された国宝であり、通報した善光寺によれば白いスプレーのようなものでの落書きによる破壊行為は本堂回廊の北側に5ヶ所、西側に2ヶ所あった。新たなスタート地点は長野市の聖火リレー実行委員会によって変更され、県の勤労者福祉センター跡地となった。
2008年4月24日、ウィキペディア日本語版の長野駅のページと北京オリンピックのページに聖火リレー当日の長野駅への爆破予告が書き込まれ、インターネット上のニュース や同年4月25日の読売新聞の夕刊にて報道された。
中国側は当初、各国において聖火を護衛した人民武装警察所属と見られる”青い服の集団”を日本にも同行させる意向を示していたものの、日本政府側は「国家主権」と「法治国家」を名目に拒否する意向を表明し、最終的に少人数の護衛のみを同伴させることに合意した。
4月26日の聖火リレー当日、警備に当たる警察は在日中国人留学生組織「学友会」が約2,000人の留学生を長野市に動員するとの情報を元に警備計画を練っていたが、実際に集まった中国人学生たちの総数は4,000人を超えてリレーが行われる沿道が埋め尽くされるほどだった。これにより「学友会」が用意したTシャツは2,000枚ほど不足した。この動員は、駐日本国中華人民共和国大使館も支援しており、留学生への参加注意とマニュアル、巨大な中国国旗、手持ち用の小旗などが配布され、中国のイメージを崩さない注意や警察官への対応、集団行動に関する方法等も示されていた。
また、中国人ジャーナリストの徐静波が多くの在日中国人を集めるのを主導したとされ、5月に訪日した胡錦濤総書記は徐静波と会見し、「祖国はあなた方の貢献を決して忘れない」とねぎらった。
警察は中国からの独立を目指していたり中国からの侵略の脅威に脅かされている地域や国の支援者による聖火リレーに対する妨害行為を警戒して、沿道の数メートルおきに約3,000人の警官を配置するという厳戒状態をとり、動員された多数の中国人留学生グループもこれに呼応するように沿道を埋め尽くすように待機した。出発式会場の「県勤労者福祉センター跡地」と休憩地の「エムウェーブ」は関係者以外の日本人が立ち入り禁止とされ、到着式を行った「若里公園」も式典エリアへの立ち入りを制限された。しかし聖火リレーを「護衛」する中国人留学生達は入場を認められた。
また当日の長野では中国人留学生の他に中国国旗・オリンピック旗などで埋め尽くされた、またチベットなど中国に反対する勢力の旗も一部に見られた。
19番目の走者となった卓球の福原愛が走行中のときにはチベット国旗を持った台湾籍チベット人の男が「FREE TIBET!」と絶叫しながら乱入したが、すぐに併走していた警官数人によって取り押さえられ逮捕された。また、11時10分頃には生卵を投げつけた日本人の男が威力業務妨害容疑で逮捕された。
韓国の聖火リレーは4月27日にソウル南部にある、オリンピック公園から22kmの区間で2km短縮されて行なわれた。
現地ではチベット支援者と北朝鮮の脱北者強制送還に抗議する市民団体や人権活動家ら約300人が集まった。（以下、こちら側を韓国側と表記する）一方の在韓中国人をはじめとする中国支援側（以下、こちらを中国側と表記する）は6000人〜10000人と数で圧倒し会場周辺や沿道は中国国旗で埋め尽くされた、なお中国側には中国の航空会社に勤める韓国人の客室乗務員もいた。
警察官は厳戒態勢で8000人〜9000人が動員され、約60人〜140人の警察官がランナーの周囲を警備した。また聖火リレー前から韓国側と中国側の間では小競り合いになったりしていた。午後2時（※日本と韓国の間には時差はない）聖火リレーが始まるとスタート地点では脱北者の強制送還に抗議する韓国側に対して、中国側がペットボトルや石・木片・缶・工具・鉄パイプなどを投げつけ、韓国側も応戦する形となり、止めに入った警察官を挟んでの物の投げ合いとなり、韓国市民団体の関係者・警察官・取材中のカメラマンが負傷した。
他にも少数の韓国側を中国側が大勢で囲んだり、チベット支援者をホテルまで追いかけ暴行し、止めに入った機動隊員を傘などで殴り負傷させたりした。2時55分頃、地下鉄の駅長を務めるランナーが走り出した際に市民団体所属で脱北者の男1人が飛び出し、警察官に取り押さえられ逮捕された。3時35分頃、北朝鮮の脱北者強制送還に抗議する人権団体の男2人がシンナーを撒いてコース上に火をつけようとして警察に逮捕された（焼身自殺を図ったとする報道もある）。最終的に逮捕者は5人となった。
後に中国人が韓国人を暴行したと報道され、一部の在韓中国人が暴行で逮捕されたり韓国政府が中国の在韓大使を呼びつけ抗議するまでに至った。その後の韓国国内では反中感情が噴出し、オリンピックのボイコットも論じられた。一方の中国の新聞社では「韓国メディアが中国人の過激行為をオーバーに報道した」と反論が掲載された。
ベトナムの聖火リレーは中国本土以外では最後の聖火リレーで、ホーチミンで10kmの距離で4月29日の夜間に行なわれた。トップランナーはグエン・ティ・トウ・ハ（ホーチミン市副市長）・ラストランナーは胡乾文（駐越中国大使）が行なった。ランナーの周りを警察車両などが取り囲む厳戒態勢の中での開催となったが、目立った妨害行為などもなく、数千人の観衆に見守られながら終了した。
香港の聖火リレーは中国領内最初の聖火リレーで5月2日に行なわれた。聖火リレー前には中国国旗がサッカーワールドカップ以上の大量購入がなされた。スポーツ選手や人気タレントなど120人（ランナーの1人は飛行機の遅延により欠席）が走り、
リレーの出発地点近辺には、五輪開催を支持する中国人学生などが大勢集まり中国国旗と香港の旗により、周辺は真っ赤に染まった。また中国の人権問題改善を訴える抗議者もいたが、声は中国人学生らの国歌などで打ち消され、チベット支援者の男性が見物人たちに小突かれた上「裏切り者」などと愚弄されたりした。他にも中国政府のチベット政策を批判する活動家8人の身柄を一時拘束するなど混乱が続いた。
5月3日に行われたマカオでの聖火リレー。オリンピック聖火は初めてマカオにやってきた。開会式はマカオ・フィッシャーマンズ・ワーフで開催された。その後、聖火はマカオのいくつかの名所（媽閣廟、マカオ・タワー、嘉楽庇総督大橋、西湾大橋、マカオ・カルチャーセンター、マカオ・スタジアム）を回り、フィッシャーマンズ・ワーフに戻り閉会式を行った。聖ポール天主堂跡、タイパ島周囲では、サポータが殺到して通りが狭くなったためコースが短縮された。聖火リレーには、ギャンブルの帝王スタンレー・ホーを含む120人が参加した。Leong Hong Manが最初のランナーでLeong Heng Tengが最後のランナーだった。澳門日報は、聖火ランナーのリストはマカオ人を完全に網羅できておらず、聖火ランナーにはアスリートではない者が含まれすぎていると批判した（幾人かは、他のスポーツイベントで既に聖火ランナーを務めたことがあった）。
四川大地震の影響で一部計画が変更され、震災最大の被災地の綿陽市では本来は外で聖火リレーをするはずが避難場所になった体育館内部でのみの聖火リレーとなった。
聖火リレーの一環としてエベレスト登頂が計画され、中国側からアタック、成功を収めた。
ピークハント（頂上制覇）を行う最終メンバーには対内外を考慮してチベット族を含むチームが選ばれた。
これに先立ってエベレストへの中国側からの登頂の禁止が通達、その後アタック日が近づくにつれ警備は厳重を増し最終的には山中に銃を携帯した兵士や武装ヘリが駐屯した。入山していた各国の登山隊に対し、BCより上部の尾根への入山禁止・撮影禁止という前代未聞の事態となった。