海賊ギルド 構成員
ダスト星を支配する海賊ギルド幹部。帽子とマスクを身に付けた気障な剣術の達人。村人たちを連行して、自らの支配の要となる空中要塞の建造にこき使っていた。ボーイの使者兼コブラ抹殺の補佐にやって来たアーシュラ中佐と共闘する。しかし、ホークとゴクウを捕えた際、彼らを助けに来るコブラをバカな男と評した結果、「人質をたてに真っ向から戦えぬ腰ヌケよりはマシだろう」とホークに言い返されて憤慨、アーシュラの助成を拒否して向かったコブラとの一騎討ちで死亡する。
シオン
海賊ギルドの幹部にしてロド麻薬製造に携わっている鶏の顔をした人物。コブラが4人目の勇士を探している最中にボーイの野望を探るためコブラに尋問を受ける。ボーイの野望を話したがロド麻薬採掘のロボットたちを襲わせたため、ホークに斬り殺される。
ドクター・ヤマ
海賊ギルドの兵器開発者を務めるマッドサイエンティスト。自身の傑作であるゾラを開発したが、自我を持ったゾラに裏切られて首から下を小型のロボットにされて、ゾラに恨みを持つ。基地内で遭遇したコブラに、ゾラの弱点を教えて協力し、ゾラを追い詰めたがコブラを誘うため連れ去られて殺される。
魔女ゾラ
ドブスン率いる「氷の牙」が不在の間に、彼らの縄張りの海域に出没して航行する船を次々と沈めた魔女。その正体は、ドクター・ヤマが開発したエクトプラズムで出来た生体エネルギー兵器で、「氷の牙」を洗脳してブラックシープの戦力として使用する。ゾラは人から精気を奪って悪魔の形をしたエクトプラズムで出来た生物「光る悪魔」を作り、人間に取り付かせ洗脳する。
殻が無ければ生体維持ができないことが弱点。殻を壊されたことで体が小さくなり生体維持のためにコブラの身体に取り付くも、コブラの捨て身の作戦により身体から逃げ出したところをサイコガンに撃たれて死亡する。
ガバラ少佐
宇宙戦艦「ブラックシープ」内を守る、保安隊の女将校。コブラたちが突入してきた際にボーイの命で迎え撃つも配下の部隊はことごとく壊滅し、遭遇したコブラに自ら挑むも殺される。劇中で確認できる保安隊はキャメル隊、ホエール隊、イーグル隊の3隊。
レーダーマン
ブラックシープ内の管理センター内で各セクションを監視している男。両目とケーブル接続された多数のカメラから得られる情報を基に、各セクションの保安隊に指示や情報を送るが、背後に忍び寄っていたホークに首を切り落とされて死亡。
青龍鬼（せいりゅうき）
エスカープ王国を襲う3人の鬼の1人。鬼たちの中で最も部下を信用せず、失態を犯したり逆らった者は容赦なく呪術で抹殺する。
白虎鬼（びゃっこき）
エスカープ王国を襲う3人の鬼の1人。鬼たちの中で最も強欲で、美を追求する。さらってきた太陽系人の美女に遺伝子操作をして人魚等の姿に変えている。
ゴモル
白虎鬼の作り出した「息子」にして「美の結晶」である存在。さらってきた美女を餌にして捕食し、その体は最終的にはゴモルの顔を構成する一部と化す。また体の方は大型のロボットである。
玄武鬼（げんぶき）
エスカープ王国を襲う3人の鬼の1人。鬼たちの中で最も冷酷非道で、自らに歯向かう者は手段を選ばず容赦なく殺す。また、世界中の武器をコレクションしている。
スカルヘッド
玄武鬼配下の女サイボーグ。その名の通り、骸骨のごとき兜を頭につけている。サイコエネルギーを弾く特殊なエネルギーによる光の輪を手足に纏って、自らを二輪車形態にしての高速移動が可能。
「聖なる騎士伝説」編冒頭において部下を率いて黄金像「黄金の天使」を狙い旅客機を襲うも、そこでコブラに部下を倒され、自らは戦闘を終えたコブラと遭遇し、コブラを旅客機から遥か下の雪原へと落とした。
ムラゴ司教
エスカープ王国の教会幹部で、王位継承権を有する王族の戴冠式を監督する立場にある人物。しかし、彼の正体は海賊ギルド幹部であり、部下のシスターたちも海賊ギルドのエージェントだった。そしてエスカープ王国を襲う3人の鬼たちの黒幕であった。
クリフ・ボールド伯爵（ジプシードック）
声：塩沢兼人（PlayStation用ゲーム）、玄田哲章（コブラ・ザ・アーケード）、咲野俊介（OVA）
「ザ・サイコガン」編で登場。火星の一地域を統治する領主貴族。足の生えた「動く城」で暮らしており、領地を見回っている。武力と権力をもって領民に圧政を強いている上に、海賊ギルドの幹部として麻薬の製造・売買にも関わっている。表向き、海賊ギルドの幹部にして野盗集団のボスであるジプシードックと敵対しているが、実はジプシードックとボールド伯爵は同一人物であり昼は貴族として、夜は野盗として民を搾取している。また、ユートピアの父の仇でもある。
なお、プレイステーションコミック版ではジプシードックからゴールデンドッグという名前に変更されている。
サイバーウルフ
声：東條加那子、永吉ユカ（OVA）
名前はアニメのクレジット表記およびアーケード版より。ジプシードックが操る2体の女性型サイボーグで、鬣（たてがみ）のような赤い髪を持つ。外見は美女だが中身は野獣そのもので、獣のごとく四つん這いで走り、吠え掛かってくる。武装は両肩のキャノン砲。
レッドボーン
声：浦山迅（OVA）
ギルド太陽系方面司令官の肩書きを持つソラリス人。大艦隊を直卒しており、ボールドに対して、古代火星人の残した「宇宙創造の秘密」を入手するよう、頭ごなしに命じる。
メガ・カーン
ギルドの精鋭である突撃兵こと「ブラックダーツ」隊長。あらゆる機械を生物に変えてしまうマハドーマ星の魔力にてこずっていたギルドの司令官の命を受け、マハドーマ星に派遣された。魔力の源である「マーラの源」を、そして源を探すコブラを狙う。
勘が鋭くドラキュラの城にレジスタンスが居ることを察知する。
魔法陣を出現させ、架空の生物を召喚することが可能。この魔法陣は小さくすることで盾や凶器にすることもできる。また、魔法陣の中では魔力は無効化される。
「魔法の源泉」を止めたが、コブラに殺される。
彼とその部下は機械のついた三度笠にマントという、時代劇に出てくる渡世人のような格好をしている。サイボーグで、脚部は鋏のような形をした口となっている。その脚部の口にはサメのような牙が無数についており、これで相手の首を噛みちぎることも可能で、空を飛ぶためのブースターともなる。
魔力の影響を受けた際に竜人になった。
カーンが召喚した生物
ミノタウロス
カーンが召喚した生物。コブラを鎖で捕らえたが、コブラに右手を折られて、ラナと拷問道具たちに押さえられる。
メドゥーサ
カーンが召喚した生物。パルチザンのメンバーを石化させた。意思を持ったザナドゥに首を切られてザナドゥとコブラがドラキュラ城を脱出するためメドゥーサの顔を使用される。
射手座
カーンが召喚した生物。毒矢でコブラの動きを止めた。
アラバスター
メガ・カーンの腹心。彼女もカーンと同じような格好をしている。右の頬にあるサソリのタトゥーがワンポイントとなっているほか、体全体にタトゥーをしている。
その正体はドラキュラIII世の恋人。カーンによって洗脳されてドラキュラIII世を利用するための駒として使われていた。
「ブラックダーツ」とパルチザンの戦いの折り、光線兵器の通用しないドラキュラIII世を実体化させるため、カーンの命で高所から飛び降りる。墜落死する前に実体化したドラキュラIII世によって受け止められるも、傭兵たちのビーム兵器にドラキュラIII世ごと撃たれて死亡する。
ブラッディハウンド
「ブラックダーツ」のサイボーグで、全員が三度笠とマントを身に着けている。マントを纏うことで四足歩行型ロボットに変形し、時速100キロで走る。肩にあるミサイルを武器としている。コブラとの戦いで全滅した。
マシャド
マハドーマ星の奴隷島で奴隷売買を行っている商人。「マーラ」の巻物を保管していたがコブラに盗まれたことでカーンに粛清される。
バルガス
ギルド艦隊の艦長。
過去にバルガスはロック、ビル、テッドという3人の仲間を売り、ロックは警察との銃撃で死亡、ビルとテッドは刑務所に送られ、さらにバルガスが刑務所内に送り込んだ殺し屋によって殺害された。この裏切り行為はただの噂とされていたが、コブラはバルガスの仕業と確信しており、仲間を売った行動を許さなかったコブラによりバルガスは殺される。
スチームパワード
マシャドのボディーガードで、性別は女。力が強くコブラを捕まえることができる。また、手のひらでエネルギーを吸収して打ち返すことができる。
コブラが「マーラ」の巻物を盗んだことで追いかけたが、ザナドゥの斧で左腕が切断されて滝に落ちて撤退した。
メガ・カーンが「魔法の源泉」を止めるためコブラと戦っていたが、横槍に入ったザナドゥとの戦いで敗北する。
バルゲラ
ギルドの幹部。渓谷へと姿を変えたマンハッタンにてボスとして君臨していた。カメレオン型の宇宙人であり、不可視化する体と長い舌が武器。しかしコブラに葉巻を咥えさせられ、その煙によって居場所がばれて倒された。コブラ曰く「身体はでかいが脳ミソは便所のスリッパ並」。
沼の主
マンハッタンを渓谷に変えた張本人。一見すると人間の女性だが、その正体は下半身が無数の触手で構成された軟体動物。血も他の軟体動物や甲殻類のように銅を含んでおり、青い。何人もの人間を溶かして内臓を吸い取っていた。血が青いことからコブラに正体を気付かれ、マンハッタンを元に戻すからと命乞いをしたものの、それでは殺された人々が浮かばれないとして容赦なく倒された。
ビガロ
声：曽我部和恭
原作の三姉妹編を基にしたシナリオで展開するPCエンジン用ゲーム『コブラII 伝説の男』に登場。ギルド最高評議会幹部の一人。最終兵器を手に入れ、コブラの抹殺を図る。
クイーン
声：野口絵美
『コブラII 伝説の男』に登場。ギルド最高評議会幹部の一人。ビガロと共に行動しているが、最終兵器を手に入れたビガロの裏切りにあう。