ペケ×ポン コーナー
5つの項目を、指定された順番通りに並べていく。5兄弟それぞれ担当する順番が決まっており（1番目→たか、2番目→とし、3番目→かなお（柳原）、4番目→しんや、5番目→てっぺい）、自信のある人から1人ずつ挙手をして、自分の順番に該当する項目を1つ選ぶ。
正解すれば、一徹から「その通りだ！」と褒められて、継続。ただし、間違えたら、その時点で終了。一徹から「ばっかもーん!」と告げられ、5人の頭上に愛の金タライが落とされる。5人全員正解ならばパーフェクトとなり、姉からおやつがもらえる。
本田の降板時には、この企画を用いたドッキリを実行。収録途中でセットのテレビから本田の両親との中継映像が映し出され、番組を卒業する本田を労った。
お買い物ママさん
主婦に扮したレギュラーとゲストが、値段当てクイズで対戦。VTRである商品の値段を上1桁または2桁を伏せて発表。ママさん（解答者）は、伏せられた上の桁に当てはまる数字を予想する。
正解との誤差が一番大きかったママさんは、誤差の分だけ解答席にママチャリがマスを前進。スタート位置から数えて11マス以上進んでしまった場合は、「ダメ嫁池」に到達し池から噴射される大量の水を浴びせられる罰ゲームを受け、脱落となる。最後まで残ったママさんが、MVM（Most Valuable Mama）として、今回出題された商品の中から1品が贈られる。
ペケうた合唱団
合唱団員に扮したレギュラーとゲストの5人が、童謡「森のくまさん」の節に乗せた別の歌の歌詞を聴き、その歌詞の曲名を答える（曲名が分からなくても正しいメロディーで歌えれば正解となる）。
ヒントとして、冒頭では曲が発売された年代と売り上げ枚数、1コーラス終わると曲に関するヒントが出される。
正解した人から抜けていき、全員正解で1問クリア、3問連続クリアでご褒美がもらえる。ただし合唱団は5コーラス（問題の部分を5回繰り返して歌う）しか歌わず、1人でも5コーラス歌い終わるまでに正解出来なかったら失敗。連帯責任で全員が後ろから音符型巨大風船をぶつけられるお仕置きを受ける。
ペケポン物産展10
2012年11月9日放送分から登場。選択肢として出された10個の都道府県の中から、ある県民性ランキングのベスト1の都道府県を予想する。なお選択肢として提示されているのは、トップ5（1〜5位）の都道府県とワースト5（43〜47位）の都道府県である。
オバサンパーマにエプロンを着たペケポンメンバーとゲスト3人がくじ引きで決まった順番に解答。ベスト1（1位）を当てると、その都道府県の特産品を獲得。逆にワースト1（47位）を当てると、ベスト1が獲得できる特産品の代金を自腹で支払う。
Who am I?
顔と音声を加工した芸能人「Who am Iさん」が「1人カラオケ」「人間ドックの受診」「占い」「趣味を楽しむ」といった映像を見て、随時出されるヒントと合わせ、誰なのかを当てる。ルールは回によって変わる。
ペケポンメンバー4人とゲスト1人が協力。VTRは前後半に分かれており、解答のチャンスは前半終了後・VTR終了後の2回ある。全員が正解すればお肉券を獲得。1人でも不正解の場合は炭ガスが吹きつけられる。
タカトシチームと有田柳原チームにゲストがそれぞれ1人ずつ加わるチーム戦。前半のVTRで正解すれば1人につき10ポイント、後半のVTRで正解すれば1人つき5ポイントがチームに加算。最終的に獲得ポイントの多いチームが勝利。勝利チームは相手チームとのポイント差に応じて賞品を獲得（5ポイント→なし、10ポイント以上→叙々苑焼肉券1万円分、50ポイント以上→叙々苑焼肉券3万円分）。
上記同様タカトシ・有田柳原にゲスト1人が加わる対抗戦。VTRは通しで流れるが、答えが分かったら解答を書いてからボタンを押してVTRを止める。正解すれば1抜けから順に60ポイント、50ポイント、40ポイント…と10ポイントずつ差をつけてチームに加算される。VTR終了後まだ正解していない人が最終解答を行い、最終解答で正解すれば1人につき10ポイント加算。全問終了時に相手チームに500ポイント以上の差をつけて勝利した場合、ハワイ旅行を獲得。
和食のご法度
名店が作った日本料理一品の中に隠された「ご法度（日本料理のしきたりや礼儀作法に反したり、見た目や風味を損なう調理や盛り付け）」を当てる。
ゲスト（複数人出演の場合は1問ごとに代表者が挑戦）と海原雄山に扮したペケポンメンバーによる団体戦。出された料理を見て全員で相談し、最終的にゲストが解答を決定。正解すればご法度を犯していない正しい料理を食べることができるが、不正解の場合は料理は没収され、ハラペコルームにいる大食いタレントに食べられてしまう。
脱出せよ!!ナゾな城
柳原が「ナゾな城の姫・黒雪姫」として司会、榎並が執事として進行を務める。
ナゾな城に囚われたくりぃむ・タカトシにそれぞれゲスト2人がつき、なぞなぞを解いて脱出を目指す。
それぞれのチームに交互になぞなぞを1問出題。相手チームは表情を見て答えられなさそうな人を1人指名。正解すれば20ポイント、不正解の場合はもう1人指名し、2人目で正解した場合は10ポイント、2人目も分からなければ0ポイント。各チーム4問行い獲得ポイントの多いチームの勝利。
絵やイラストで表された暗号が何を意味しているのかを答える。各チームの代表者が重さ35kgの像「でっかなこ」を持ち上げ、解答者は、でっかなこが持ちがっている間だけ解答できる。でっかなこを持ち上げる代表者の前には赤・黄色・緑のランプがあり、でっかなこを持ち上げた高さに応じてランプが点灯、緑が点灯で通常、黄色が点灯で危険となり、赤が点灯で終了となる。各チーム同じ問数を行い、正解数の多いチームが勝利。
両チーム代表者による対決。なぞなぞの答えが分かったら洞窟の中をほふく前進で進み、途中にある早押しボタンを押して解答する。正解すれば前進、不正解やほふく前進したが解答権を得られなかった場合、ベルトコンベヤーの床が動いて元の場所へ戻される。
先に5問正解したチームが優勝。ただし、これまでの成績で優勢のチームは1問分前進してスタートできる。
優勝チームの4人が1人ずつ黒ひげ危機一髪の要領ででっかなこ人形が入る樽に剣を刺していく。8個所ある穴のうち1個所のみある当たりを刺し、人形を飛ばした人に、事前に答えた「今一番欲しい物」が送られる。剣は1人2本あるため確実に誰かは賞品を手に入れることができる。
有田屋デパート 地下一階
デパ地下を舞台に、有田が店長（社長）、柳原が副店長、榎並が新入社員という設定で行う企画。伊勢丹の全面協力で行われる。
上田・タカトシ・ゲスト2人による個人戦で、デパートで売られている人気商品の100g当たり、もしくは1個当たりの値段を予想する。ヒントとして解答者には試食が振る舞われる。
初回は1問ごとに誤差が一番少なかった解答者、第2回は3問の合計誤差が一番少なかった解答者が勝者となり、ご褒美として用意された伊勢丹人気デパ地下惣菜を詰め放題で持ち帰ることができる（初回のみ問題として紹介された商品もOKだった）。第3回以降は人気商品3品の値段があらかじめ発表されており、値段が3品すべて合っていた解答者が勝者となり、ご褒美として人気商品3個の中で最も高いものを好きなだけ堪能できる。
ペケポンお受験
上田が司会を務める企画。ペケポンメンバーとゲストの2世タレントが収録前に小学校のお受験で使われた問題に実際と同じ制限時間で挑戦。その後、スタジオで解答の発表を行い、実際の講師が正誤判定と採点を行う（発想を問うものなどは10点満点で採点を行う。）。
上田祭（上田晋也の課外授業）
普段は進行役としてトシ・タカ・柳原・有田を弄り倒す上田を逆に弄り倒す特別編。3つのコーナーに上田1人で挑戦する。罰ゲームが通常のコーナーよりも過激になっている。
ミチシルベ
2時間スペシャルの後半に実施する特別編。ペケポンメンバーよりも年上のタレントが登場し、実体験に基づく「御教訓」を傾聴し、学んでいく企画。