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ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
手品師のようなトリッキーな戦い方をする。同じくスイクンを追うクリスタルを勝手にライバル扱いする等、少々お騒がせな性格。マツバとは親交がある。クリスタルからは得体が知れないが、いい人で信頼できると評価される。絵はかなり下手。涙もろい。
第9章で再登場。スイクンの情報集めにサファリゾーンでスイクングッズを販売していた。サファリのポケモンとバトルを始めたシルバーに注意していたがラムダに襲われる。戦いの後、シルバーの過去の話を聞いて協力を決め、マツバを紹介する。その後、クリスタルが連れてきたポケモン塾の子供達の引率を引き受ける。事件が終わった後日談ではスイクンを追いかけ回していた。
ミツル
手持ちポケモン：カクレオン、ロゼリア♂、ノクタス、フライゴン♂、チルタリス、ジバコイル、RURU（ラルトス♀→キルリア♀）（ルビー）（一時的）、キモリ♂→ジュプトル♂（エメラルド）（一時的）
病弱だが、ポケモンが大好きな少年。トウカシティでルビーと仲良くなり、RURUを借りて初めてのポケモン・カクレオンを捕獲するが、その時に起こった地震でルビーとはぐれてしまう。その後病気の治療の為、RURU・カクレオンと共にシダケタウンに移り住む。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
そして更に空気の良い土地を求めて移り住んだキナギタウンで、カイオーガによるホウエン地方を真っ二つにするほどの大災害に襲われる。この際、後にエメラルドに渡る図鑑とキモリを保護し、センリと再会する。事件収束の為、空の柱でレックウザを目覚めさせようとするセンリに協力した。事件収束後、RURUをルビーに返し、図鑑はオダマキ博士に返せたが、キモリ(特訓時にはジュプトルに進化)はレックウザを目覚めさせる際に空の柱ではぐれた。
性格は温和で、いつも穏やか。ポケモンとの信頼関係を何よりも重要視している。いとこのミチルが姉妹に間違われるほど似ていると発言しているとおり、女性的な顔立ちをしている。病気は空の柱の修行を期に、次第に克服して来ている様子。
第13章では120番道路にある秘密基地を引き払う時にルビー・レックウザを目撃し、ルビーをサポートする。その後はグランメテオΔ破壊作戦にも参加し、迎撃チームの一員として地上で対応に当たった。
ルビーの母
本名は不明で、センリの妻。5年前のジムリーダー試験の時「この人と一緒ならどこへでも行く」と言っているほどセンリに尽くしている。しかし、何かと心配性で息子のルビーが何か問題を起こしたり、直面している場面を見ると気を失うこともある。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
作中で引越しトラックを運転している為、大型免許を持っている事が分かる。第4章の終盤では、ルビー・サファイアの合同誕生パーティに、ご馳走を作って待っていた。
カラクリ大王
キンセツシティ郊外に住むカラクリ好きの老人で、カラクリを駆使したメカを操る。牛乳瓶の底のような丸眼鏡をかけている。テッセンとは「テッちゃん」「クリちゃん」と呼び合うほど仲がいい。幻の地下都市・ニューキンセツを探していた。最終超決戦ではニューキンセツの放電マシンを飛行用に改造し、サファイアを手助けする。
エメラルドのマジックハンドやブーツを作っており、幼い頃のエメラルドには唯一の理解者だった。出会った時に足のサイズを測った事から、エメラルドからは靴屋と勘違いされっぱなし。
第13章ではホウエン地方が誇る優秀な科学者としてグランメテオΔ破壊作戦に参加した。
マリとダイ
手持ちポケモン：コイル（ダイ）、アブソル（一時的）
ホウエン地方のテレビ局「ホウエンテレビ」のリポーターの女性とカメラマンの男性。ダイがマリに敬語を使っている事から、立場はマリの方が上の様子。英名はマリリンとダイアンである。
ひょんな事からアクア団・マグマ団の暗躍を知り、以後野望阻止のため独自に行動を起こす。ルビー・サファイアに興味を抱く。終盤はアブソルと共に行動する。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
第13章では、ルビーがこぼした「最後」という言葉が気になり、アブソルと情報集めに旅に出る。隕石を調査し、一時テレビ局に戻って仮眠を取っていたが、眼鏡の男によってその情報を流された。
ツワブキ社長（ツワブキ ムクゲ）
ホウエン大企業・デボンコーポレーションの社長であり、ホウエンチャンピオンであるダイゴの父親。かつてはハギ・ゲンジと共に、海の悪童3人組と呼ばれていた。
マグマ団・アクア団の野望を察知し、阻止すべくダイゴと作戦を進める中で潜水艇・かいえん1号の特別起動部品を開発するも、カナズミシティでアクア団に手持ちのポワルン（後にルビーに付いていき、POPOと名付けられる）と自身も襲われ負傷する。有事に備えレジロック・レジアイス・レジスチルを目覚めさせる石板を解析しており、その内容の手紙をサファイアに託した。
第13章では、体調が回復している。ホウエンの図鑑所有者にメガシンカの習得を指示し、吸収盤に生体エネルギーを吸収させ、次元転移装置を起動させようとしている。ゲンシグラードン・ゲンシカイオーガによって海で溺れるが、一命を取り留め流星の里で療養する。その後、重傷を負ったヒガナにかつて｢流星の民｣の意向を無視して行ったレックウザ捕獲作戦を詫びるが、自分達の行いの正しさを疑おうとしない傲慢さが今も変わっていないと厳しく指摘される。最終的にはエメラルドの仲裁で和解し、隕石の破壊に協力する。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ハギ
手持ちポケモン：ピーコちゃん（キャモメ♀→ペリッパー♀）、マーコちゃん（ナマズン）、ハンテール、コイキング、ドジョッチ
トウカシティ周辺に住んでいる長身で屈強な凄腕の船乗りの老人。制服を着ようとせず、漁師時の法被を着用している。ルビーの実力を知るも、「余計な詮索はしない」事をポリシーにしており、相手が話したくなければ深く聞こうとはしない主義である。気性の荒い性格だが、ピーコちゃんにはデレデレで、同い年のカントーナナシマのキワメとは「ハギちゃん」「キワメちゃん」と呼び合う仲で昔からタイミングが合わないらしい。かつてはムクゲ・ゲンジと共に、海の悪童3人組と呼ばれていた。
第4章当初は隠居した元漁師だったが、伝説といわれていた魚ポケモン・ジーランスの情報を聞き捜し求めていた。
第5章・第6章では高速船・タイドリップ号の船長になり、第5章では「さいはてのことう」を探し、キワメが島に行く道を記した「ふるびたかいず」を見つけた時にはすでに見つけて探索した後だった。また、第6章では石化したレッド・グリーン・ブルー・イエロー・シルバーをバトルタワーに運んだ他、さいはてのことうで採取した土が事件解決の鍵となった。
第13章で再登場。星の危機を伝えられ、ゲンジと共にデボンコーポレーションの計画に協力する。ゲンシグラードン・ゲンシカイオーガによって海で溺れるが、一命をとりとめ流星の里で療養する。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ヒデノリ
手持ちポケモン：ぎゃーとん（ギャラドス）、ひーとん（ヒトデマン）
ヒンバスを使った金儲けを企む海パン野郎。ヒンバスの件で偶然ルビーに出会った事から事件に巻き込まれていく。
情に厚く涙脆い一面があり、センリのルビーに対する想いを感じて涙ぐんだ。また、ルビーの為とはいえ、結果的にルビーとMIMI（ヒンバス）の絆を引き裂くような芝居をしたミクリを責めた事もある。
なお、イエローのおじ（前述）と同名だが、関連性は全くない。また、第1章や第2章に登場した海パン野郎とも無関係。
クスノキ
ホウエン地方の海底調査隊の隊長。カイナの造船所や博物館の責任者でもある。やや押しの弱い性格。海底洞窟を調査する新型潜水艦を作る等、才能はかなりのもの。コータスの煙を吸い込み体調を崩すが、事件解決後は体調が回復した。
宝珠守り爺さん・婆さん
手持ちポケモン：チリーン×2
かつて、おくりび山で侵入者の撃退と宝珠の守護をしていた老夫婦。しかし今では引退し、その使命を孫のフウ・ランに託しており、二人と同じ服を着ている。エスパータイプの扱いに長けており、チリーンの力でテレパシー・念視・空中浮遊ができる。ホウエン地方のフロンティアブレーンであるウコンとは古い友人である。
エニシダ
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
第6章から登場。「バトルフロンティア」のオーナー。神出鬼没な情報屋で、サングラスにアロハシャツと怪しげなファッションをしている。UFOのような乗り物に乗って移動する。
「強い者が勝ち、弱い者が負ける」という実力主義者で、フロンティアブレーン達にも試練を課す為に敢えてエメラルドのジラーチ捕獲について黙っていた。
口癖は「それ、○○!」。何かとバトルフロンティアの宣伝をしたがり、エメラルドのバトルフロンティア制覇を宣伝も兼ねて承知した。センリ・オーキド博士と旧知の仲であり、ジラーチの短冊1枚に願う権利と引き換えに頼みを引き受ける。その願い事は「初日から10万人の客がフロンティアに訪れる」事だと発覚。
開会セレモニー時の使用ポケモン
アザミ・ウコンとのマルチバトルでコンピュータによりランダムに決定・指示される。
マルマイン Lv.87
マルノーム Lv.85
技："あくび"・"はかいこうせん"
トオル
第6章に登場。バトルフロンティアを取材に来た記者。飲みきれなかったペットボトルの水を木と間違えてウソッキーにかけて襲われたが、エメラルドに助けられる。ウソッキーを鎮めたエメラルドの力に興味を持ち、彼を追いかけ良き理解者となる。思い込みが激しくやや早とちりな性格で、バトルフロンティアではルールの解説者になる事が多い。後にラティアスと親しくなる。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
バトルフロンティアの事件の後、オーキド博士に写真の腕を見込まれて、ポケモンが息づく島でポケモンの生態記録の作成を依頼される。
『ポケモンスナップ』(NINTENDO64版）のキャラクターをモデルとしており、作中では名乗らなかったがポケSpediaで正式に名前が公開された。
ヒガナ
手持ちポケモン
ボーマンダ♂←→メガボーマンダ♂  Lv.84 特性：いかく←→スカイスキン 性格：なまいき 個性：ちのけがおおい
シガナ（ゴニョニョ♀）Lv.19 特性：ぼうおん 性格：のんき
ヌメルゴン♀ Lv.85 特性：うるおいボディ 性格：うっかりや
オンバーン♂ Lv.86 特性：おみとおし 性格：せっかち
第13章に登場。「流星の民」で「伝承者」を名乗る女性。右足にメガアンクレットを着けている。見た目は少女だが、9年前から容姿が一切変わっておらず実年齢は不明（おそらくルビー達より年上）。実はかつてルビーが関わったレックウザ脱走においても、ボーマンダをけしかけていた張本人である。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
1000年前から伝えられていた危機から星を救う使命の下、活動を行っている。しかし、正当継承者を名乗りながらレックウザと何かを成し遂げた功績を一切持たずあくまで自称に過ぎない。また、使命の達成に対する常軌を逸した執着心から目的の為に手段を一切選ばない上に、「伝承」以外の方法で世界を救う事を断固として認めず、更には私怨を織り交ぜる思考で行動している為、目的達成の過程で生じうる「犠牲」について全く省みようとしていない。この結果、身勝手な行動の数々からも同胞である流星の民達からの反感も買っている為、伝承者とは認められていない。
かつて、流星の民を無視してレックウザの捕獲を強行し、結果的にシガナが落命する原因を作ったデポンコーポレーションには強い不信感を抱く。その為、その復讐も兼ねる形でレックウザの捕獲されていた研究所をボーマンダに襲撃させ、ルビーによって撃破されながらも脱走させている。その後もホウエン地方で起こった数々の事件の裏で暗躍しており、また、第4章の時期にマグマ団・アクア団に潜入して超古代ポケモンの情報を与えていた為、この時の事件の黒幕とも言え、実質的に世界を守る為にホウエン地方を犠牲にしようとした。なお、マグマ団では正体がカガリに露見し脱退している。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
第13章で初登場。かつて多くの命を奪った技術を応用した科学の力で隕石衝突を回避しようとするデボンコーポレーションをかつての遺恨だけでなく、ワープさせた隕石によって平行世界の罪もない人々の命が奪われる可能性を無視して計画を進める傲慢さが以前と変わっていないと嫌悪し、脅迫文を送り妨害工作を行っている。ラティオスと共に空の柱を訪れたルビーを襲撃、彼に情報を与えて立ち去る。その後、新生されたマグマ団やアクア団のメンバー達の事実上のボスとしてデボンコーポレーションを襲撃。ひたすらダイゴやムクゲに不寛容な態度を貫き、次元転移装置を破壊しようとするが、それを持ったサファイアにはフーパのワープ能力によって逃げられる。その後、トクサネ宇宙開発センターを襲撃し、星の危機から救う目的で打ち上げられたロケットだけでなく次元転移装置をも破壊。そしてルビー達から奪ったメガバングルについていた合計五つのキーストーンによってレックウザと絆を結ぼうとするが、上述の独善的な行為に憤りを覚えたレックウザからは完全に拒絶され重傷を負わされる。｢流星の民｣の意向を無視して行ったレックウザ捕獲作戦が原因でシガナを死なせてしまった事を詫びるツワブキ社長に対し、自分達の行いの正しさを疑おうとしない傲慢さが今も変わっていない事を厳しく指摘する形で尚も不寛容な態度を貫くも、あまりにも身勝手な言い分に激怒したエメラルドの仲裁で和解。隕石の破壊に協力するも傷が癒えない状態で動き回ったせいで倒れ、作戦本番になっても回復しきれず自分とシガナのキーストーンをルビー達に託しエメラルドと共に地上で事態の推移を見守り、これまでの悪行か結局は「伝承者」としての使命は果たせずに終わった。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
レンザ&ジンガ&トマトマ
手持ちポケモン：フライゴン×3、ヤミラミ（レンザ）、ヤドラン←→メガヤドラン（ジンガ）、クチート（トマトマ）
第13章に登場。流星の民の男性3人組。腕に螺旋状のメガリングをはめている。太めの男性がレンザ、髭面の男性がジンガ、目が前髪で隠れている男性がトマトマ。レンザは冷静沈着、ジンガは怒りっぽい、トマトマは話し方が訛っているのが特徴。ドラゴンポケモンが飛んだ後に残る飛行機雲、「龍雲線」を見抜く事ができ、これが交差したポイントにポケモンを出す事で空が飛べなくても空中に留まらせる。
空の柱から出てきたルビーを足止めしてヒガナの情報を聞き出し、シガナという正統な伝承者がいた事を話した。先発隊的な隕石が降り始め、ルビーに足止めを謝罪して飛び去った。その後、トマトマはおばばと共にルビー達を保護したが、流星の民である自分達が何の役目も得られず忸怩たる思いを抱く。
シガナ
第13章に登場。レンザ・ジンガ・トマトマとルビーとの会話において名前が登場した人物。
流星の民であり、正統な伝承者だった人物。3人組によれば、「特別な能力を持つ天才だった」らしい。かつてレックウザに乗った経験があった事から、「伝承者」としての資格を得るに至っている。しかし、うずもれのとうでデポンが行った「レックウザ捕獲作戦」にメガレックウザと共に抗った結果、命を落としてしまった。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ヒガナのゴニョニョと同じ名前であったため、事情を知らないルビーはゴニョニョの方のシガナが伝承者と勘違いしかけた。
おばば
第13章に登場。流星の民の長を務める老婆。過去に里を訪れたセンリから、グラードン・カイオーガの暴走を止めるためにレックウザの居場所を聞かれ、それを教えている。基本的に冷静に振る舞うが、流星の民の指導者だけあって、自身も一族の手で「伝承」を成し遂げる事を望んでおり、レンザやトマトマが「伝承」の内容をルビーに明かしてしまった際には何度も静かに睨みつけている面を見せている。
かつてヒガナをシガナに代わる伝承者として認めたが、それがシガナを失ったヒガナの数々の暴走やそれによって生じた悲劇を招く事になる。星を救う為に人々が取って行った3つの手段の内、「科学」による手段を取ったデボンの計画はヒガナの妨害行為によって完全に潰え、「伝承」による手段も手詰まりとなり、アオギリ・マツブサのグラードン・カイオーガのゲンシカイキによる「自然」の手段しか取れなくなってしまう。そして、アオギリとマツブサが私情抜きで星を救おうとしていたのを理解した結果、グラードンとカイオーガのゲンシカイキを発動させる為の技の習得の場を提供する形で協力した。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
アオギリ・マツブサに敗れて気絶していたルビー・エメラルド、2人を回収したセンリと共に里に招き入れる。しかし、ヒガナの暴走が原因でヒガナに託していた巻物はルビーに奪われてしまい、更には彼がレックウザの頭上に乗った経験があったという事実から、ルビー・センリに「伝承者」としての役目を託す事を決断。一族の「伝承者」としての役目を果たす悲願を諦める道を選んだ。
セバスチャン
手持ちポケモン：ウツドン、チョンチー×2。これらの他に馬車を引くギャロップ2匹とバルキー3匹が屋敷に就いている。
ベルリッツ家の執事で、主にプラチナの世話係をしている。過保護なほど誰より心配しているプラチナの旅立ちには反対していたが、父親との話し合いの末、ボディーガードを付ける事で承知する。60年以上マサゴで働き町の住人を全て知っている為、プラチナの屋敷に迷い込んだダイヤをよそ者と見て侵入者と間違えて攻撃するが、誤解が解けた後はダイヤとポケモン達を接待する。シンジ湖にダイヤと共に同行し、ハマナ・アヤコ・フワライドと共にシンジ湖に落ちたるー・りーを救出し、パールに託す。
パカ&ウージ
手持ちポケモン：ミノムッチ（パカ）、ブイゼル（ウージ）
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ベルリッツ家に雇われ、本来プラチナのボディーガードとなるはずだった男性2人組。「世界中どこにいても電話に出て依頼者を不安にさせない」という触れ込みで黒い服とサングラスが共通の特徴。唇が厚く緑のマフラーをしている方がパカ、髪が長く赤いマフラーをしている方がウージ。ウージは話し方が子供っぽい。自分達が「プロ」である事を誇りにしているが、マサゴ公園で自転車で暴走したり、尾行中に温泉で休憩する等どこか抜けている。
当初はダイヤ・パールの事を、プラチナを攫おうとしている悪の組織の手先だと勘違いしていた。道中でプラチナに何度か追いついたが、メリッサやギンガ団の妨害により逃げられている。トバリシティにてようやく本来の目的であるプラチナに会い、止むを得ず気絶させながら保護する。その後にギンガ団のSHITAPPAの大群と混戦になり、同じく混戦となっていたダイヤ・パールに出会い互いの誤解を解消した。その後は共闘しながらも修行をつけ何とか軍勢を退けたが、その直後にサターンが使ったギンガ団の「負の産物」と言われる「反物質世界発生装置」によって違う次元に切り離され、消滅する。直前に、ダイヤとパールに対しプロの技術を多少ながら伝授できた事を感謝し、プラチナの護衛任務を託した。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
その後第8章で、「やぶれた世界」内部にて生存が判明する。ギラティナから逃げ続ける習慣のみ繰り返し時間や空間の感覚を失い、生死の判断さえも曖昧になっていた。その後やぶれた世界に現れたプラチナとようやく合流、無事脱出に成功した。尚、サングラスを外した素顔が披露されたのは第8章が初。
モデルは『あぶない刑事』の「タカ（鷹山敏樹）」と「ユージ（大下勇次）」。
ハマナ
手持ちポケモン：ノコッチ
ナナカマド博士の第2助手の女性。ナナカマド博士とベルリッツ氏のいない研究所の留守を守る。ダイヤのりーが盗んだ物で最後まで持ち主の分からなかった「プロテクター」の持ち主。虫と整理整頓が大の苦手。
アヤコ
手持ちポケモン：ニャルマー、ガルーラ♀
ダイヤの母で、フタバタウンに暮らしている。ポケモンコンテストの実力者で、プラチナがコンテストに挑戦した際用いた練習ビデオに、ニャルマーと一緒に出演していた。ダイヤから「Daibaku Show」の副賞旅行に行くと聞かされた時にも電話越しから笑顔で送り出し、真実は何も知らされていなかった。得意料理は「特製きのみグリル」。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ダイヤに新しい服を用意し、シンジ湖まで料理の材料を採りに行くがマーズに捕まる。ダイヤに助け出された後セバスチャンやハマナと共に自宅へ逃げ帰り、新しい服の中に入れていた電話からダイヤの感情を知り、信じて送り出した。ダイヤと「タウリナーΩ」をよく観ており、主題歌も歌える。43巻の第9章から第7章へと繋がる物語にも登場している。
じんりき
手持ちポケモン：ピッピらん・ピッピりん（ピッピ×2）
ハクタイシティ自転車屋の店長。「ンいやァ」が口癖。いつも競技自転車用のヘルメットを着けている。学生時代からマキシマム仮面（マキシ）の大ファン。
ギンガハクタイビルでギンガ団に捕まって尋問される。その後シロナによって救出されるが、当の本人はシロナの姿を見ていなく、"はっぱカッター"の葉についていた米の品種からダイヤ達の事を町で聞き、「自分を助けたのはダイヤ達」と思い込み、翌日3人に礼として折り畳み式自転車3台をプレゼントした。
後にパールと再会。彼に協力するべくリッシ湖に自作のタンデム自転車で同行し、ハクタイシティの銅像の言い伝えをパールに話す。リッシ湖での戦闘や爆破、マキシの稽古にも立ち会っている。また、パールの稽古中に自転車のメンテナンスも行った。
フトマキ
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ポケモンの足跡の採集が大好きで、通称「足跡博士」と呼ばれている人物。マニアとも言えるほど足跡に対する執着心がすさまじく、足跡を取り始めると周りの状況が見えなくなる。足跡からポケモンの感情をはじめ、様々な事を読み取る。ピンチにも全く動じない恐るべき胆力の持ち主で、能天気ともいえる。ギャグが好きで、ダイヤとパールの漫才にも割り込んでくる。
はぐれ研究員を警察署に届け外へ出た瞬間、時空間の乱れによりやりの柱へ飛ばされ、足跡からレジギガスの感情と意思を読み取る。
第8章にも登場。未知の伝説・幻のポケモンの足跡が手に入る事とダイヤにぎーの感情を読み取る事を頼まれ、飛び入り参加で同行を申し出た。その後ナギサシティにて、ギラティナの足跡に「破壊」といった気持ちが見られない事から、事態の完全終結を断言した。
ゲン
手持ちポケモン：ルカリオ♂、リオル
トウガンと知り合いの実力派のトレーナー。スピード不足とされるダイヤの為に、こうてつ島にてポケモンバトルの特訓のコーチをする。その後、やりの柱でSaqueと戦う。第6章ではエピローグにて先駆けて登場し、ホウエン地方の「バトルフロンティア」に訪れている。
第8章ではシンオウバトルフロンティアに訪れ、クロツグに壊れたシャカピーを渡す。修理されたシャカピーの飛行を波導でサポートする為、プラチナに同行した。
ナミキ
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
シンオウ丸の船長。トウガンの知り合いで、妻との結婚の仲人である彼に頭が上がらない。新米船長である為、何かトラブルがある度に慌ててしまい、あまり役に立たない。ナミタロウという一人息子がおり、ダークライによって悪夢に陥っていたが、「みかづきの羽」で目覚めて元気になった。
第3章でもマチスの部下として登場している。
ハンサム
手持ちポケモン：グレッグル
第7章の終盤に初登場した国際警察の捜査官。なお、「ハンサム」というのはコードネームで本名ではない。口癖は、「インターナショナルポリス・アームズNo.○。」
第8章では、ヤナセの連絡により、ギンガ団の捜査にプラチナと協力する。何かとことわざを呟いたり、激しく振舞う癖があり、後者の方が原因でプラチナのポケモン達やコクランのエルレイドに誤解された事もある。
バクを追って向かったハードマウンテンで、プルートに襲われ重傷を負うが、無事回復しプルートを逮捕した。その後長官の指示により「七賢人」の逮捕の為に、前任地のフィオレ地方でポケモンレンジャーの少女から預かったというマナフィのタマゴをダイヤ達に託してイッシュ地方へ向かう。
第10章では「ハンダ サムロウ」と偽名を使って変装し、イッシュ地方のポケモンリーグベスト8に潜入、ブラックと戦った。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
第11章では間の2年はプラズマ団を追って他の地方にまで行っていたが、イッシュ地方に戻る。辞令書類をよく見ず当初はラクツを自らの部下だと思い込んでいたが、その実力を見てからは上司として接する。ラクツが国際警察捜査官を解任されてからも、個人的感情から味方であり続け、事件後はゲーチス達を逮捕・移送していった。
第14章では国際警察となったリラと共にアローラ地方に上陸。UBによる被害を食い止める為に奔走した。
バク
手持ちポケモン：ネンドール
第8章に登場。オーバの弟で、「しょうぶどころ」を取り仕切っている。フロンティアブレーンのコクランとも親しい。
ハンサムの潜入捜査に気付きギンガ団の写真を奪ったり、プラチナからバトルレコーダーを奪うなど、がさつな振る舞いが目立つ。以前からヒードランに憧れており、ギンガ団を阻止すべくハードマウンテンへ関わりが深いと言われている「火山のおき石」を取りに行く。
本人曰く「警察はエラソーでムカツく」らしくハンサムとの相性が悪い。しかし、ハードマウンテンではハンサムと共闘し、プルートに一矢報いるに至った。戦いの末、ハンサム共々意識不明の重体に陥るが、無事に回復しヒードランをハードマウンテンに返しに行った。
マイ
手持ちポケモン：ウインディ、シェイミ
第8章に登場。口数の少ない謎めいたロリータ・ファッション風の少女で、しょうぶどころのポケモントレーナー。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
外見からは分かり難いがポケモンに生かされていると言うほどポケモンを愛しており、ギンガ団の起こしたシンオウの事件で生活・生命を脅かされ人間を憎むようになるポケモンが増える事を心配していた。また、争いがなく人もポケモンも感謝しあえる世の中を望み、同時にそれが叶わない世界に諦めを抱いている。
カントーのオーキド博士に手紙を送り、その返事で感謝から希望が生まれる事とシェイミの存在を教えられ、224番道路で保護する。やぶれた世界ではプラチナから"しぜんのめぐみ"対策を渡されジュピターと戦った。
ミル
手持ちポケモン：フーディン
第8章に登場。ランドセルを背負った少女。しょうぶどころのポケモントレーナーで、彼らとは信頼関係が厚いようで、バクが負傷して入院した際には取り乱すほど心配していた。
やぶれた世界ではサターンと戦った。
モミ
手持ちポケモン：ハピナス♀
第8章に登場。穏やかな女性で、しょうぶどころのポケモントレーナー。バクが負傷して入院した際に取り乱すミルを慰めていた。
やぶれた世界ではマーズと戦った。
チェレン
手持ちポケモン：ツタージャ♂→ジャノビー♂、マメパト♂→ハトーボー♂→ケンホロウ♂、ガントル→ギガイアス
ブラックと幼馴染の少年。眼鏡を掛けている。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ブラック曰く「超真面目」な性格で、礼儀正しく何かと気が回る。ブラックをアララギ博士に推薦した人物でもあり、ベルのツッコミ役でもある。ブラックやベルとは幼稚園の頃からの付き合いで、ブラックの性格もよく把握している。
ブラックにより自分の図鑑が壊れた上、ベルと共に足止めを喰らっていた。図鑑が正常に機能しているのがブラックだけだと伝えにサンヨウシティで合流。サンヨウジムでブラックのジム戦に付き添い、ベルと共にサンヨウトリオとのトリプルバトルに勝利し、バッジを貰う。
ベルと共に旅をしている途中、ヒウンシティではぐれて別行動になり、ホドモエシティでブラックと再び合流する。冷凍コンテナでプラズマ団にポケモンを奪われかけたが、ブラックと共に「わざおしえの家」で身に付けた合体技で撃退。その後はプラズマ団に興味を持ち、七賢人のヴィオに連れられNとゼクロムの対峙を見る。そして、これまで夢中になれるものが無かった自分も実はNのような圧倒的な強さが欲しいと願っていたと実感した。ポケモンリーグでは、ブラックや手持ちのツタージャにさえ冷たい態度を取るなど「冷徹」に振る舞い、テクニックに関してはアイリスを凌駕するほどに成長していたが、ブラックに敗北し準優勝となる。その際、ムシャの夢の煙で、9年前におけるブラックのポケモンリーグの応援を約束していた事を思い出す。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
第11章ではシャガの推薦でラクツ達の通うポケモントレーナーズスクールの教師となっており、眼鏡をかけていない。15期生のE組の担任。ホドモエシティ以降の事は思い出したくない様子で、行方不明のブラックを心配している。ポケウッドの社会見学で、ハチクからイッシュ地方のジムを再編しようという動きを聞いて、自身が滞在するヒオウギシティも候補に挙がっていると知る。プラズマフリゲートがイッシュ各地を凍結させた際にはシズイによってマリンチューブに保護されベル達と合流した後はNの城へと駆けつけ、炎上時に「ちかい」の9体合体技で鎮火を行った。プラズマ団の事件解決後はヒオウギシティのジムリーダーにも就任した。
ベル
手持ちポケモン：ミジュマル♂、ヒトモシ→ランプラー
ブラックと幼馴染の少女。
マイペースな性格で、目の前に起きている重大な出来事を「〜そう」と言っては、もう一人の幼馴染のチェレンに突っ込まれている。バトルに関する知識は乏しく、基本的なタイプ相性すら知らなかった。幾つか習い事をしており、ギターやピアノ、フルートを演奏できる。その腕前は本人曰く「どれも中途半端」だが、人やポケモンを惹きつける魅力を持っている。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
旅立ちの当日でも父親から旅の許可を得ておらず、チェレンを巻き添えにしてカノコタウンで足止めを喰らう。その後、サンヨウシティでブラックと再会してジム戦に付き添い、チェレンと共にサンヨウトリオとのトリプルバトルに勝利しバッジを貰う。チェレンと共に旅をしている途中、ヒウンシティではぐれてヒトモシをプラズマ団に奪われたが、ブラック達の活躍によって救われる。
チェレンと別行動してからは父親から逃げる日々でカナワタウンに向かい、そこでフルートを吹いていた時にホワイトと再会する。バトルの腕も上がらず、ブラックやチェレンのように自分に「絶対」と思えるような事が無く悩んでいたが、ヒウンシティでメロエッタと心を通わせポケモンの不思議を研究したいと思うようになり、アララギ博士の助手に志願し、自分よりも適任だとしてホワイトを図鑑所有者に推薦する。アララギ博士からは「意外と何でもそつなくできる」と高く評価されている。
第11章でアララギ博士の正式な助手となり、眼鏡をかけている。ラクツ・ファイツにポケモン図鑑を渡し後を押す、ブラックが行方不明になった事で自分を責めるチェレンを諭すなど、精神的にも余裕ができている。プラズマ団がイッシュ各地を凍結させた際にはチェレンを助けにアララギ博士とマリンチューブ出入り口まで向かい、事件終盤では炎上するNの城へと駆けつけ「ちかい」の9体合体技で鎮火を行った。
ヒュウ
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
手持ちポケモン：ツタージャ、ナックラー♂→ビブラーバ♂、マメパト、シビシラス→（シビビール→）シビルドン
第11章に登場。ヒオウギシティのポケモントレーナーズスクール15期・E組に通う12歳の少年。ゲームでは主人公より少し年上だが、本作では主人公のラクツと同い年（12歳、53巻より）に変更されている。
学年で5位をとるなど成績優秀だが、短気で怒りっぽい性格であり、それが災いしてクラスの女子から嫌われている。一方妹思いな面があり、祖父から貰ったチョロネコを妹にあげている。妹の前では優しい兄であろうと努めている為、その前だけでは粗暴さが鳴りを潜め他の女子に対してもしおらしい態度をとる。
第11章から5年前はやんちゃな少年だったが、プラズマ団に妹のチョロネコを奪われて以来、他人に心を閉ざすようになりプラズマ団を激しく憎んでいる。また、この経緯から妹や家族との関係も悪化してしまったらしく、スクールの男子寮で生活している。ルームメイトはペタシ。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ファイツが偶然落としたメモリーカードを解析し女子クラスメイトの中にプラズマ団の人間がいると知り、これまでの鬱屈を爆発させる形で必ず正体を突き止めると誓う。合唱コンクール優勝の褒賞でヒウンシティに向かった時に再びプラズマ団と遭遇し、怒りを爆発させて潜伏する下水道内へと向かう。その後地上に戻った際にチェレンにプラズマ団が復活し、クラスの女子の中にプラズマ団員がいる事を暴露。メモリーカードを見せ、ファイツが持ち主だと知ると厳しく問い詰める。チョロネコの件にはファイツが関わっていないと説明され、プラズマフリゲートからの攻撃を庇うが、意識を失う。気がついた時はトレーナーズスクールの職員室に七賢人・ロットにより連れ出されており、知ると同時にシビルドンの直接攻撃を与える。その時、プラズマ団が分離・敵対している事や敵対側がイッシュを氷漬けにしている事を告げられ、アクロママシーンを無効化してキュレムの解放には拾ったメモリーカードが必要だと教えられる。それを邪魔しようとするロットの追っ手を「甘い」と自虐しながらも食い止め、寮の部屋に隠したメモリーカードをロットに取りに行かせる。その後、妹のチョロネコはNが大切にしていると知り、プラズマフリゲートに捕らわれたNの所へ向かいファイツと再会。ヒウンシティで責めた事を謝罪し、Nの救出を手伝う。ゲーチスを止めようとするNに付いて行った先でチョロネコを奪った団員を追い詰め、団員が繰り出したツタージャが自ら手持ちになり、チョロネコも取り返した。その後、Nの城の炎上時には「ちかい」の9体合体技で鎮火を行った。ファイツの事は当初は「転校生」と呼んでいたが、和解後の最終話では「ファイツ」と呼ぶようになり夢を応援すると約束する。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ペタシ
手持ちポケモン：モノズ♂→ジヘッド♂
イッシュリーグでベスト8に残ったトレーナーの一人。喋り方は訛りが強い。
チェレンと戦って敗退し、何度も冷たい態度を取られながらも必死でチェレンを応援する、友好的でかつ純情な性格。しかし女の子と話す事が苦手で、顔を見ただけで煙を上げて取り乱す。
第11章ではラクツ達の通うポケモントレーナーズスクールの生徒となっている。また、周囲と人間関係を築けないヒュウとは男子寮のルームメイト同士で、数少ない理解者でもある。ヒュウの妹と地下から聞こえたヒュウの声につられて下水道に入ったと同時にヒウンシティが氷漬けになり、被害には合わなかったがこだいのぬけみちを通り避難した先でチェレンの依頼でヒウンシティに向かおうとしていたカミツレ・フウロと合流し、ラクツが置いて行った手持ちを見つけて飛び出したハンサムと出会う。
容姿はNPCトレーナーの「たんぱんこぞう」に似ているが、服装は同じくNPCトレーナーの「かいじゅうマニア」に類似している。
キダチ
シッポウシティジムリーダー・アロエの夫で、シッポウ博物館の副館長。
副館長としては頼りなく骨格標本が盗まれたことでアロエにはったおされると慌てており、ホワイトからもイライラされていた。
ダークストーンの護衛のためにダークトリニティに他のジムリーダーと共に攫われ行方不明となるが、Nの城で無事が確認された。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ライモンシティ市長
特徴的な髪型をした中年男性。娯楽の殿堂と呼ばれるライモンシティの発展に試行錯誤しており、ここ数年来場者が横ばいな状態が続いている事を懸念している。
企画会議でホワイトが提案したポケモンミュージカルを採用した。また、ミュージカルと合わせ、バトルサブウェイを企画し、チャンピオン・アデクにバトルシステムの監修を依頼した。
マジシャン
手持ちポケモン：ヘイガニ
怪しげな容姿をした男性。バーの奥の部屋でラクツからメディカルチェックや道具の改造を頼まれている。「〜である（よ）」が口癖。技術力は優れており、本来「3日掛かる」と言う作業を4時間で終わらせる。
本来は裏社会の人間で、ラクツの情報屋・Sとして非合法な手段を使い様々なサポートをする報酬として、現金と国際警察のコンピュータに自由に出入りできる裏口を教えられていた。"テクノバスター"用のカセットの製作も依頼されており、ようやくできた不完全な「ブレイズカセット」を奪い取るようにラクツが持って行ったその日の夕方、ラクツの体調管理モニターが急にダウンしたことを不審に思い情報を集める。そして翌日にはラクツの行動が国際警察内部で問題となり解雇された事や自身のラボが上層部に特定された事が重なり、ハンサムに最新の情報を伝えて行方をくらました。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
実は、「黒の壱号」と呼ばれる国際警察の正規の捜査官である。国際警察の長官とも面識があり、ラクツが解任後も捜査官として職責を全うできるか、教育により獲得したモラルを逸脱しないかといった実験を行っており、事件後はアローラ地方からアクロマに依頼のあった件の準備を進めた。
ユウコ&マユ&ユキ
手持ちポケモン：ヒマナッツ（ユウコ）、ミツハニー♂（マユ）、プリン（マユ）、キャモメ→ペリッパー（ユキ）
第11章に登場。ヒオウギシティのポケモントレーナーズスクール・E組に通う女子3人組。双葉のような髪型で、活発で好奇心旺盛な性格の女子がユウコ、ショートヘアでおっとりとした性格の細目の女子がマユ、リーダー的存在で、サンバイザーを付けている活発な性格の女子がユキ。ユキの容姿はNPCトレーナーの「テニスプレーヤー」をモデルとしている。
ラクツのファンであり、いつもラクツを贔屓していて、ファイツとも仲良くなっている。その一方で、怒りっぽく乱暴なヒュウとは仲が悪く、他の女子達と一緒になって妹の事を棚に上げて対立している。特にユキはヒュウとは犬猿の仲。
合唱コンクールではチーム・プリン。プラズマ団の事件解決後はヒュウの活躍を知り謝罪、和解して共にトレーナーズスクールを卒業した。
トロバ
手持ちポケモン：フラベベ♀→フラエッテ♀→フラージェス♀（あおいはな）
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
第12章の狂言回し的な存在。エックス・ワイの幼馴染で、小柄な少年。ティエルノからは「トロバっち」と呼ばれている。
学者になることが夢で、プラターヌ博士からポケモン図鑑3台と、ハリマロン・ケロマツ・フォッコの3匹を預かっていたが、ゼルネアス・イベルタルの争いによってフォッコと図鑑1台が行方不明になってしまう。ゼルネアス・イベルタルの争いの状況を博士に説明する為、アサメタウンからエックス達と共に旅立つ。
独力でメガシンカに関する考察を行うなど非常に聡明で、フラダリ・コレアからもその能力を高く評価されている。控えめな性格ではあるが内に強い思いを秘めており、相手が強大な力を持っていようとも正面から非道を糾弾する勇気もある。フレア団が最終兵器を作動させようとした時には勇気を振り絞り、不意打ちでフラダリを退けギリギリで装置のカギを引き抜き兵器の完全起動を阻止した。
フレア団との最終決戦ではバラと交戦。ワイのけろけろと協力して勝利した。その後はシトロンからプラタ－ヌ博士に渡されたフォッコの最終進化系のマフォクシーを返された。またその後、アローラ地方へと向かったジーナ・デクシオに代わり博士の助手として働いている。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
メガシンカのルーツを調査しに、ホウエン地方に行ったプラターヌ博士の留守の間、研究所をコンコンブルの弟子達と守りながらメガシンカの研究をしている中、イクスパンションスーツがミアレ美術館を襲った事でマチエールが疑われ、クロケアと調査した状態から、フェアリーとはがねタイプの技と見てワイから預かった図鑑で、数日前にすれ違ったマギアナを知る。また戻る可能性から張り込み、取り押さえようとしたがマギアナの様子から庇った事で連れ出される。直後、警備員に化けていたエクスパンションスーツがマギアナが攻撃を止めた肖像画を持って現れ、撃退したが中身は空だった。クセロシキの取り調べでは、AIだけで動かそうと最初に作ったがいらなくなった「0号スーツ」が、独自学習により伝説のポケモンを全て捕獲するよう目的を更新したかもしれないとの事だった。その後、ファイツと面談してマフォクシーを預け、シャラシティに呼ばれたエックス・ワイに連絡し、ホウエンから始まった「グラン・メテオ」による星を襲った絶望を思い出す。
サナ
手持ちポケモン：ネコP（エネコ♀）、トリP（トリミアン）、ルカリオ♂（コルニ）（一時的）
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
エックス・ワイの幼馴染で、褐色肌の少女。トリミアントリマーになるのが夢で、人間のスタイリングの心得もある。エックスを「エッP」、ワイを「ワイP」、ティエルノを「ティエるん」と呼んでいる。ゲーム版と異なり最初の3匹は所持しておらず、トリミアンを所持している。
物事をはっきりいうタイプで5人組のツッコミ役。冷めた性格で、ワイとは対照的にエックスを外へ出す事には消極的だったが、本心ではエックスが外へ出てくれる事を願っていた。
「5つの誓い」を立てられたにも関わらず大人（ビオラ）と行動を共にしようとするワイ達に反発し、トリミアンとはぐれた寂しさやフレア団に対する不安をフレア団のコレアに突かれ操られたが、エックスやジムリーダー達の活躍で正気に戻り、ワイ達と和解した。ヒャッコクシティではワイのメガリングを一時的に預かり、日時計に呼応して輝きだしたメガストーンを回収した。
フレア団との最終決戦では因縁あるコレアと交戦。昏睡状態のコルニから預かったルカリオと協力し勝利した。その後はミアレシティに移り住み、新進気鋭のトリミアントリマーとして活躍している。
ティエルノ
手持ちポケモン：ヘイガニ♂→シザリガー♂
エックス・ワイの幼馴染で、ふくよかな少年。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ダンサーになるのが夢で、大柄な体格とは裏腹に身のこなしは軽い。ローラースケートの扱いも巧みで、コルニから渡されて間もないうちからアクロバティックなトリックを使いこなしている。おおらかな性格で諍いを好まないが、怒ると別人のように豹変し、激昂する。ネガティブな発言を繰り返すエックスを根気強く諭す事もある。ワイ同様、大人を信用していない。
エックスが引きこもりになっている間、ガル・コガルを世話していた。ゼルネアス・イベルタルの争いで通っていたダンススクールが崩壊し、アサメタウンから旅立つ。ヒャッコクシティではエックスのメガリングを一時的に預かり、日時計に呼応して輝きだしたメガストーンを回収した。
フレア団との最終決戦ではモミジと交戦。ヘルガーの"れんごく"で右足を負傷するが、進化したシザリガーの猛攻で勝利した。その後はミアレシティでストリートダンサーとして活動を始め、一緒に踊るメンバーも増えてきている様子。
ジーナ&デクシオ
手持ちポケモン：エーフィ（ジーナ）、グレイシア（デクシオ）
プラターヌ博士の助手。ジーナが女性でデクシオが男性。ゼルネアスとイベルタルの争いの映像のコピーをプラターヌ博士に依頼される。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
プラターヌ博士の指示でミアレシティのカフェの店員になりすましていたフレア団と交戦し、フラダリの居場所を知らせた。フレア団との最終決戦後は、ジガルデ細胞に酷似した物体の目撃が確認されたアローラ地方への派遣をプラターヌ博士から指示を受ける。
第14章ではサンにジガルデ・コアの収集を依頼する。5か月間で60%のジガルデ・セルを回収しており、運び屋であるサンに残りの40セルを集めるようにと、1セルにつき10万円の報酬を約束して依頼し、回収用のジガルデ・キューブを託す。また、ジガルデがカロスで捕獲・利用された反省から、力を集中分散させるリボーンマシーンの開発にも成功し、ナリヤの協力を得て16番道路で組み立てを完了させる。半年後、ウルトラスペースから帰還したサンとラナキラマウンテンの山頂で再会し、ウツロイドの毒で昏倒したルザミーネを麓まで連れて行く役目を引き受け、ザオボーに差し向けられたプルメリの攻撃から守り続けた。
サキ
手持ちポケモン：クレッフィ（一時的）
ワイの母親で、サイホーンレーサー。引きこもりになったエックスの食事を作っていた。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
サイホーンレースの遠征から帰った際、伝説のポケモンの襲撃に遭ってしまう。その後、街の住人とフレア団に捕まり、牢屋に閉じ込められているが脱走を繰り返している。その後ギルガルドに洗脳され、大樹の運搬をさせられていたが、エックス達の活躍で解放され、クノエ総合病院に搬送された。
フレア団との最終決戦後は意識を取り戻し、アサメタウンで娘のワイと再会した。
パンジー
手持ちポケモン：エリちゃん（エリキテル）
ハクダンジムリーダー兼カメラマンであるビオラの姉で、ジャーナリストをしている。ビオラと共にスカイトレーナーのワイの取材でアサメタウンに訪れていたが、ゼルネアスとイベルタルの争いを取材する。
ミアレシティでプラターヌ博士に取材した上でアサメタウンの事件の真相の特集を組もうと考えていたが、プリズムタワーでミアレ出版の編集長に取材を邪魔され、更に原稿や資料を燃やされ、襲われたがエックスに救われる。編集長がフレア団の手先である事と、アサメの事件は「起こされたもの」でテレビや雑誌は事実を掴んでいながら報道せずに隠していると気付き、3年前に担当した雑誌の記事の切り抜きをワイに託してビオラの元に向かった。最終決戦においてはシトロン達と10番道路に向かった。
マチエール
手持ちポケモン：もこお（ニャスパー）
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
褐色肌が特徴の謎の少女。両親の虐待を恐れて家を飛び出し、ミアレシティで「ミアレギャング」として生活していたが、クロケア達に匿われている。クロケアのことを非常に慕っており、役に立つためにアルバイトとしてフレア団が行う実験に参加している。
実はフレア団の実験台であるエスプリの正体。実験中は催眠状態にあったが行っていた事の記憶は残っており、クロケアへの恩義と周囲への恐怖からフレア団に従い続けていた。しかしエックスの説得を受けてスーツの支配に抵抗、駆けつけたクロケアがスーツの制御装置を破壊して反抗できるようになる。フラダリへ攻撃の指示を出そうとした瞬間にメガギャラドスの攻撃で重傷を負うが、辛うじて一命は取り留めた。
コンコンブル
手持ちポケモン：ヘラクロス♂←→メガヘラクロス♂、ゲンガー♂（一時的）、メガボスゴドラ、メガプテラ、メガデンリュウ（弟子）
メガシンカの秘密を知る老人であり、コルニの祖父。サナから「コンP」と呼ばれている。グリーン・カルネ・ダイゴなど17名の弟子にメガシンカを教授した。第13章の描写によると、カロス地方に移り住んだ流星の民の末裔である可能性が高い。
数年前、性悪な報道記者に絡まれていたエックスを助け、メガリングを渡した。フレア団の野望に巻き込まれ、襲撃された代々守ってきたマスタータワーを捨てる決意をしてコルニやカルネと共に旅立ち、エックスと再会する。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
エスプリのオーロットに足を傷つけられ、幹部・アカマロとの戦いで受けた毒に蝕まれ戦線を離脱、その代わりにアサメタウンの5人組にバトルの特訓をつける。自分のメガグローブのキーストーンを別のメガリングに埋め込み、それを自ら見込んだワイに託した。
エックスの継承式の後、プラターヌ博士とホウエン地方に向かう。
AZ（エーゼット）
手持ちポケモン：ゴルーグ
フラダリに監禁されていた大男。正体は、3千年前に醜い戦争を嘆きカロスを浄化しようとした王その人である。トロバ・サナ・ティエルノに助けられ、大昔カロスで起きた戦争の話をする。復活したゼルネアスと協力して子供達を脱出させ、自身はクセロシキ達によって再び捕縛されかけたが一瞬の隙を突き監視者Zの存在を告げて姿を消した。
最終決戦を終えカロスを救ったにもかかわらず侮蔑の視線を向けるミアレシティの人々に対して憤りを抱くワイ達の前に再び姿を表し、最終兵器を起動させるべきかの決断を迫り戦いを挑む。戦闘の中で彼らの覚悟を汲み取ると自らマリソの技を受け持っていた起動キーを破壊、その直後にかつて去っていたフラエッテと再会した。
ハウ
手持ちポケモン：アシマリ→オシャマリ→アシレーヌ、ピチュー♂→ピカチュウ♂、ネッコアラ
マラサダが大好物の少年。メレメレ島のしまキング・ハラの孫。マイペースでのんびりした性格で、ポケモンとバトルが好き。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
「ゼンリョクバトル」の一回戦でグラジオと戦うが敗北、信念や背負うものが無いと散々酷評され、苦手意識を抱く。その後、ククイ博士からアシマリを貰った。イリマと共にウラウラ島の「ポータウン」でスイレン達と合流し、スカル団と話し合う目的でアジト「いかがわしきやしき」に乗り込むも、ボスのグズマが召還したUBに襲われ、交戦する。
アローラの危機を思い、立ち向かう為に半年間アローラを一人で巡り、手に入れた「かがやくいし」をライチにZリング（アシレーヌZも付与されていた）にして貰った。そして祖父からも成長を認められ、カプ・レヒレを援護してポニ島を襲ったマッシブーンと戦った。
事件後はグズマと共にマラサダとエネココアの店を開店し、マオに店のレシピの相談をしている。
アシマリを貰ってからはパートナー兼主力とし、優先してバトルに出したり連れ歩いている。
原作と異なり、リーリエとの関わりは無い。
リーリエ
手持ちポケモン：アブリー、コスモッグ→コスモウム→ルナアーラ（一時同行）
謎の多い少女。一人称は原作では「わたし」だが、本作では「わたくし」に変更されている。3か月ほど前に行き倒れていたがバーネット博士に助けられ、彼女の元で保護されている。
ポケモンが傷つくのが苦手でバトルもできないが、成り行きで「ゼンリョク祭り」の参加選手になり困っていたがムーンに助けられ、代わりにバトルトーナメントに出場して貰う。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
実は「エーテル財団」代表のルザミーネの娘であり、グラジオの妹。エーテルパラダイスで虐待されているコスモッグを居た堪れず、「たいようのふえ」と共に持ち出し逃走していた。
バーネットに連れられてハギギシリの襲撃で海に転落し、助けに入ったサンと一緒にウラウラ島に漂着、アセロラに保護されてサンの島めぐりに同行する。ジガルデ・セルの捜索とスカル団の拠点があるポータウンの調査に向かったサンと別れ、バーネット博士と合流するも、UBの映像に兄の姿を認めて現地のホクラニだけに向かい、兄弟で久々の再会を果たす。
それから半年は兄やビッケとポニ島に侵入する方法を探りつつ、サンやムーンの帰還を待っていた。キャプテン達と合流すると、マツリカから父が記憶を失っているがどこかで生きている事を知らされる。そしてウルトラホールがラナキラマウンテンに開くという情報を得て現地へ向かい、サンやルザミーネと再会すると、恐れていた母親に意を決して父の生存を伝えてウツロイドの寄生から解放した。そしてルザミーネを狙うプルメリに応戦する為、自分でもポケモンを扱えるとは想像もしていなかったが不意を突く事に成功し、グズマが帰還していると知らせる。
事件後は昏睡状態が続く母親の治療に、ポケモンと融合した経験を持つマサキの意見を聞きにバーネット博士と共にカントー地方へ向かう。
ダルス
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
「ウルトラ調査隊」の男性隊員。UBの研究を専門にしていて捕獲とコントロールする状況を抑えようとしていた。
ルナアーラによるウルトラワープライドの最中にウルトラディープシーに迷い込み、同じくアローラからウルトラスペースに迷い込んでいたサン・ムーンと出会う。ムーンがルナアーラと絆を結んでいると見て彼らに協力を決め、ルナアーラの定員の関係でウルトラディープシーに残ったが、所持していた「ウルトラネクロZ」ごとアローラ地方に引き寄せられる。
アマモ
手持ちポケモン：ベベノム
「ウルトラ調査隊」の隊員の少女。UBと心を通じるのに長ける。かなり無邪気で、モンスターボールが作れない世界にいた為に入れられるだけで歓喜する。サンにルナアーラのウルトラワープライドを教え、ウルトラメガロポリスへ案内した。
サンの指示を受けたジガルデ・ソルガレオ・ルナアーラの攻撃で弱ったネクロズマを「ウルトラボール」に収めた。
ミリン
「ウルトラ調査隊」の女性隊員。冷静かつ慎重な性格でエーテル財団やルザミーネを信用していなかった。
ポケモンと人間の信頼関係を見てサンやムーンを信用し、ルザミーネにネクロズマを捕獲させるのは危険だと判断して二人に協力する。
シオニラ
手持ちポケモン：アーゴヨン
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
「ウルトラ調査隊」の隊長である男性。ルザミーネにネクロズマの捕獲と救済を頼んだが、ルザミーネには欲望しかなくその後にはかつて、祖先のある者がネクロズマを傷つけて光が奪われたウルトラメガロポリスのように、サン達の世界から全ての光が奪われかねない危機となる。
ソニア
手持ちポケモン：ワンパチ→パルスワン
マグノリア博士の孫娘で若き研究者。ごくたまに祖母の助手をしている。元ジムチャレンジャーで、現ガラル地方ポケモンリーグのチャンピオンであるダンデとは幼馴染だが、現在は避けている。ジムチャレンジで知り合ったルリナとは今でも親友。何らかの事情により、いまだにチャンピオンカップもジム戦も観戦できずにいる。
かつてガラル地方で起きたと伝えられる「ブラックナイト」を調べている。若輩故に中々調査の許可が降りずに苦労していたが、創人やシルドミリアとの出会いを機に調査活動が進展しはじめる。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ナックルシティの宝物庫で英雄伝説を現す4枚のタペストリーを見た後、ビートの事件で崩れたラテラルタウンの壁画から現れた彫像を創人達に教え、隠された意図と思われる物証としてキルクスタウンにあった以前の4枚に繋がる5枚目のタペストリーを見てシルドミリアが思い出した2人組の手がかりを掴み、かつてジムチャレンジの推薦人のローズがまどろみの森の事件に関わっていると動揺し合流先に向かっていたそらをとぶタクシーをギギギアルに襲われ墜落寸前に呼び出していたダンデに救われる。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ナックルシティで治療を受け、ダンデに逃げ回っていた訳を話す。チャンピオンになる前のダンデには負けた事がない優秀なポケモントレーナーだったが、ローズに推薦されたのはマグノリア博士の孫としての利害関係ではないかと疑われ、勝ち続けて不正や八百長ではない強さを証明しようとするも、最初のターフスタジアムで苦戦して初めてバトルを苦痛に感じ、一方でダンデは弱音も吐かず、試合は巨大なプレッシャーをも楽しみ、試合で輝く姿に敵わないと思う。アラベスクスタジアムのジムトレーナーに敗北した時には安堵が強く、トレーナーを引退してバトルから遠ざかることを決意。試合後、誹謗中傷が敗因ではないかと心配したジムリーダーに慰められ、その時同じように苦労していたカブから聞いたホウエン地方の伝説のポケモンの話からガラルの伝説に興味を持ち、地方の伝説を勉強する為に大学に入り地元のブラッシータウンを離れた。
ローズ
手持ちポケモン：ゾウドウ、ダイオウドウ（キョダイマックス）、ナットレイ
ガラルポケモンリーグのスポンサー企業「マクロコスモス社」の代表である中年男性。ガラル地方のポケモンリーグ委員長を務め、自身もチャンピオンカップ準優勝の経験がある。かつてのダンデやソニアとビートのジムチャレンジの推薦者でもある。
ポケットモンスターSPECIALの登場人物 サブキャラクター
ガラル地方を支える大企業のトップなので、いち民間企業のトップでありながら公営施設を自由に動かせる権限まで持っている。「やるべきことはすぐやらないと」が信条の人物で、現代にあるもの全てを引っくるめて1000年先の未来までガラルを守るという強い意志で行動している。ガラルへの愛と、地方の為に考え実行していると耳ざわりのいい言葉で熱く語り、口先だけではなく実は伴っているのだが、悪く言えば自分の気の済む事だけやっている独善的な側面がある。
ガラル地方の電力のもととなるガラル粒子が1000年後には枯渇して、その結果文明が崩壊する可能性に気づき、1000年に一度、7日間だけ目覚めるポケモン等の為にも、未来でポケモンが生きていける世界を維持する行動を起こす。ダイマックス、パワースポット、ガラル粒子の関係を解き明かすヒントが歴史の中にあると考えており、ガラルの伝承を研究するソニアにもナックルシティの宝物庫を見れるよう便宜を図っている。また、ダンデがジムチャレンジに推薦した創人にも目をかけている。