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ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
また特別に区別して脱保護することが必要な場合には、アリルオキシカルボニル基（Alloc）、(1-(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)-3-eth-yl) 基 (Dde) や 1-(4,4-Dimethyl-2,6-dioxocyclohex-1-ylidene)-3-methylbutyl基 (ivDde) が用いられる。Alloc基はテトラキス(トリフェニルホスフィン)パラジウム(0)で処理するとπ-アリル錯体を形成して脱保護される。Dde基、ivDde基はヒドラジンで処理することで脱保護される。
α-カルボキシ基の保護はC末端のアミノ酸で必要となる。この保護は直鎖のペプチドでは最後に側鎖の保護基と同時に脱保護しても構わないが、環状ペプチドの合成やペプチド鎖同士の結合を行ないたい場合（セグメント縮合）には側鎖の保護基を残したまま脱保護する必要がある。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
メチルエステルあるいはエチルエステルは歴史的にカルボキシ基の保護に用いられていた保護基である。塩酸のアルコール溶液で処理するか、アルコールと塩化チオニルの反応物 (ClS(=O)OR) で処理することで合成できる。しかし脱保護が水酸化ナトリウム水溶液での処理となり、この条件ではエピ化やペプチド結合の加水分解が競合する。そのため、通常は他のエステルが使用される。ベンジルエステル（BzlまたはBn）はベンジルアルコール中で酸触媒あるいは縮合剤を用いてエステル化することで導入できる。またはカルボキシ基をセシウム塩として臭化ベンジルと反応させても導入できる。水素化反応で除去できる。tert-ブチルエステル (t-Bu) はイソブテンと硫酸触媒で反応させることで合成できる。酸に弱い保護基がすでにある場合には、Boc2OとN,N-ジメチル-4-アミノピリジン (DMAP) 触媒で反応させて合成できる。トリフルオロ酢酸で処理することで除去できる。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
またアスパラギン酸の側鎖のカルボキシ基は容易にα-アミノ基と縮合してイミドを形成しやすい。この副反応を防ぐためにシクロヘキシルエステルとすることが多い。またC末端のカルボキシ基を選択的に脱保護したい場合には、フェナシルエステル (Pac) やアリルエステル (All) などを用いる。フェナシルエステルは亜鉛/酢酸還元条件で、アリルエステルはテトラキストリフェニルホスフィンパラジウムにより選択的に脱保護できる。
多くのアミノ酸には側鎖にも官能基があり、これが副反応の原因となるため保護しなくてはならない。これらの保護基は合成終了時に強酸による処理で一度に除去することが多い。
リジン側鎖のアミノ基、グルタミン酸側鎖やアスパラギン酸側鎖のカルボキシ基には上で述べた保護基を適切に選択して用いる。
セリンやトレオニンのアルコール性ヒドロキシ基はベンジル基やtert-ブチル基で保護する。ベンジル基はフッ化水素酸処理や水素化、tert-ブチル基はトリフルオロ酢酸処理で除去できる。一方、チロシンのフェノール性ヒドロキシ基は2-ブロモベンジルオキシカルボニル (Z(2Br)) やtert-ブチル基で保護する。ベンジル基は強酸処理で芳香環上のオルト位に転位しやすいため用いない。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
システインのスルフヒドリル基は4-メチルベンジル基 (Bzl(4Me))、トリチル基 (Trt)、tert-ブチル基、N-(アセチル)アミノメチル基 (Acm) などで保護する。多くの場合、システインのスルフヒドリル基は最終的にジスルフィド結合へと変換する必要がある。ジスルフィド結合させたいスルフヒドリル基のみを脱保護することで選択的に結合形成できる。例えばBzl(4Me)基は強酸で脱保護され、Acm基は強酸で脱保護されないがヨウ素で選択的に脱保護されると同時にジスルフィド結合を形成する。そこでジスルフィド結合をつくりたい2対のシステイン残基がある場合、それぞれの対をBzl(4Me)基とAcm基で保護する。まず最初に強酸でBzl(4Me)基を脱保護した後、ジスルフィド結合の形成を行うと1対目のジスルフィド結合が選択的に形成される。そのあとでヨウ素で処理すれば、もう1対のジスルフィド結合も選択的に形成することができる。
アルギニンのグアニジノ基は求核性が強いため、電子求引基であるスルホニル基を保護基として末端のアミノ窒素と縮合させて反応性を落とす。
p-トルエンスルホニル基(p-Ts)などが使用される。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
ヒスチジンのイミダゾール環は求核性を持ち、また塩基性によりα-炭素のエピ化を促進する。π-窒素をベンジルオキシメチル基(Bom)やtert-ブトキシメチル基 (Bum) で保護したり、τ-窒素を2,4-ジニトロフェニル基 (Dnp)、トリチル基などで保護する。なおこれらの保護基を脱保護した際に生じる副生成物はスルフヒドリル基と強い親和性を持つ。そのため、スルフヒドリル基の脱保護に先立ってまず脱保護を行う必要がある。
ペプチド結合していないアスパラギン、グルタミンのアミド基はDCCなどの縮合剤により一部が脱水されてニトリルとなる。これはフッ化水素酸などの強酸で処理すると元のアミドに戻るので保護は不要であるが、強酸を使わない場合には保護しておく必要がある。ペプチド結合してしまえば脱水は起こらないので、簡単に脱保護できる保護基が使用される。トリチル基やキサンチル基 (Xan) が用いられる。
トリプトファンのインドール環は酸処理による脱保護の際に酸化やカルボカチオンの付加を起こしやすい。そのため、N-ホルミル化を行う。ホルミル基 (For) は塩基やチオールによる処理で脱保護される。酸処理が一度しかない場合にはBoc保護でも良い。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
メチオニンのスルフィド結合には、トリフルオロ酢酸処理やフッ化水素酸処理による脱保護の際にE1脱離で生じるカルボカチオンが転位してくる場合がある。これを防ぐためにスルホキシドに酸化して保護する場合がある。脱保護の際にチオアニオールなどのカルボカチオンスカベンジャーを加えるだけで保護は必要ないことが多い。
すでに述べた通り、ペプチド結合を形成するにはカルボキシ基を活性化して反応性を高める必要がある。現在のペプチド合成では、縮合剤を用いて活性化するのが一般的である。
縮合剤として最も一般的なのはカルボジイミド系の縮合剤である。N,N'-ジシクロヘキシルカルボジイミド (DCC) が古くから用いられてきたが、副生するジシクロヘキシル尿素 (DCU) が溶媒に溶けにくく、これの除去がしばしば問題となっている（さらにアレルゲンでもある）。そのため、副生物の尿素誘導体が有機溶媒に良く溶けるジイソプロピルカルボジイミド (DIPCDI) や酸性の水に溶解する1-エチル-3-(3-ジメチルアミノプロピル)カルボジイミド（EDCあるいはWSC〈Water Soluble Carbodiimideの略〉）が用いられるようになってきている。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
また、通常は縮合剤とともに反応速度の向上とα-炭素のエピ化の抑制のため、1-ヒドロキシベンゾトリアゾール (HOBt) のような添加剤を加える。セグメント縮合の場合にはさらにエピ化が起こりやすいため、それを抑制する効果の高い3,4-ジヒドロ-3-ヒドロキシ-4-オキソ-1,2,3-ベンゾトリアジン (HOOBt) が用いられる。
カルボジイミド系の縮合剤以外にはHOBtにホスフィンなどを結合させて縮合剤としての能力も持つようにした試薬が知られている。このタイプの縮合剤は (1H-ベンゾトリアゾール-1-イルオキシ)トリス(ジメチルアミノ)ホスホニウムヘキサフルオロホスファート (BOP) が最初に開発された。現在良く用いるものとしては1-[ビス(ジメチルアミノ)メチレン]-1H-ベンゾトリアゾリウム-3-オキシドヘキサフルオロホスファート (HBTU) 、HATU、HCTUがあるが、これらはDCC同様に重度のアレルギーを引き起こすことが判明し、処理が問題となっている。
カルボキシ基を脱離能の高いアルコキシ基といったん縮合させたエステルを作り、これにアミノ酸を反応させる方法が活性エステル法である。ニトロフェノールやN-ヒドロキシスクシンイミド（NHS）、ペンタフルオロフェノール等とのエステルが用いられる。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
活性エステル化法は後述する環状ペプチドの形成や繰り返し単位を持つポリペプチドの合成に用いられる。繰り返し単位となるジペプチドやトリペプチドのα-カルボキシ基を活性エステルとした後、α-アミノ基を脱保護すると重合が起こりポリペプチドが形成される。
低温でカルボキシ基にクロロギ酸エステルやカルボン酸クロリドを反応させて混合酸無水物とし、これにアミノ酸を反応させる方法が混合酸無水物法である。非常に反応活性が高いため、かさ高いアミノ酸同士の結合など縮合剤による方法では反応が進行しない場合でも反応が進行することがある。
環状ペプチドの形成は一種のセグメント縮合で、かつ大員環形成反応である。セグメント縮合であるのでエピ化が進行しやすい。
そのため、エピ化が起こりにくい縮合法を用いる。分子内でカルボキシ基とアミノ基を縮合させるために、高度希釈法が用いられる。また縮合剤による方法では、縮合剤の濃度が高まると分子間縮合が起こりやすくなるため、縮合剤の添加は少しずつ長時間かけて行う。
環状ペプチドではどのペプチド結合で環を形成させるかに任意性がある。エピ化の起こらないグリシンのカルボキシ側や起こりにくいプロリンのカルボキシ側が第一の選択肢として選ばれる。しかし環化の成否はペプチドの立体配座に左右されるため、それについても考慮する必要がある。
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
ライゲーションとは結紮を意味するが、ペプチド合成においては特に無保護のペプチド鎖に対して別のペプチド鎖を結合させるプロセスをいう。セグメント縮合が保護されたペプチド鎖同士を縮合させるのに対し、ライゲーションでは無保護のペプチド鎖に再度の保護を施した後、結合を行う。このため、生体内から単離されたペプチドや遺伝子工学的ペプチド合成によって合成されたペプチド鎖などに対しても新たに人工的なアミノ酸配列を付与することが可能である。
ライゲーションさせたいペプチド結合のカルボキシ基はチオエステルとする必要がある。チオエステルを塩化銀とHOOBtとアミンで処理すると、活性エステルであるHOOBtエステルが生成する。これにライゲーションさせたいペプチド結合のアミノ基側のペプチドを加えると縮合が起こる。この方法では側鎖の官能基のうちリジンのアミノ基とシステインのスルフヒドリル基の保護が必要である。
ネイティブケミカルライゲーション
ペプチド合成 有機合成化学的ペプチド合成
チオエステルとシステインからアミド結合を生成するネイティブケミカルライゲーションと呼ばれる方法がある。この方法では側鎖の官能基の保護は必要がないが、ライゲーション部位のN末端アミノ酸はシステインである必要がある。ペプチドのC末端チオエステルに対して、N末端がシステインであるペプチドを加えると、システインのスルフヒドリルがカルボニル基を求核攻撃しチオエステル交換反応が起こる。続いて隣接するアミノ基がカルボニル基を求核攻撃しスルフヒドリル基が脱離してペプチド結合が生成する。
上記のネイティブケミカルライゲーションをシステイン以外のN末端にも適用できるようにした改良法として補助基を用いた方法がある。これはN末端のアミノ基上に補助基としてスルフヒドリル基を持つ置換基を導入する方法である。
以下に歴史的に用いられたペプチド合成法について示す。
1903年にエミール・フィッシャーが開発したペプチドの合成法である。ペプチド結合の形成をアミノ酸エステルとα-ハロカルボン酸クロリドとの間で行なった後、α位のハロゲン原子をアンモニアを用いてアミノ基へと置換する合成法である。α-ハロカルボン酸クロリドとの反応を繰り返すことでペプチド鎖を延長していくことが可能である。この方法を用いてフィッシャーはタンパク質がアミノ酸の重合物であることを示した。しかし、この合成法では新しく導入されるα-アミノ基の立体配置を制御することが困難であるため、現在ではまず用いることがない。
α-アミノ基とα-カルボキシ基以外のヘテロ原子を保護したアミノ酸にホスゲンを反応させるとクロロギ酸アミドが生成し、さらに分子内でカルボン酸無水物を形成してN-カルボキシアミノ酸無水物が生成する。この化合物は少量のアルコールやアミンを添加すると開環重合を起こし、単一のアミノ酸からなるポリペプチドを生成する。この方法で調製されたポリペプチドはタンパク質のモデル化合物としてしばしば用いられた。
また、N-カルボキシアミノ酸無水物に当量のアミノ酸エステルを作用させれば、ジペプチドを得ることができる。酸処理によりN上のカルボキシ基を除去してから、さらに別のN-カルボキシアミノ酸無水物を作用させるプロセスを繰り返せば、ペプチド鎖を延長していくことが可能である。しかし、それぞれのアミノ酸のN-カルボキシアミノ酸無水物を調製するのは、猛毒のホスゲンを用いることもあってかなりの熟練を要する。そのため、現在ではまず用いることがない。
現在の縮合剤による方法が確立するまで、α-炭素のエピ化が少ない方法として用いられていた方法である。特にペプチド鎖同士を結合させるセグメント縮合にこの方法が使用された。
まず、結合させるペプチド鎖のカルボキシ基をカルボン酸ヒドラジドへと変換する。これにはエステル保護されたカルボキシ基に直接ヒドラジンを反応させる方法と、遊離のカルボキシ基にBoc保護したヒドラジンを縮合剤で縮合させた後、Bocを脱保護する方法がある。次に酸ヒドラジドを亜硝酸エステルによって酸化してカルボン酸アジドへ変換する。これをトリエチルアミンの存在下に相手のペプチド鎖のアミノ基と縮合させる。
アジド法はカルボン酸アジドの反応性が低いため、側鎖のアミノ基、スルフヒドリル基以外の官能基は保護せずに行なえるメリットがある。しかし、反応操作に厳密性が要求されること、また毒性のあるアジ化水素が副生し、爆発性を持つアジ化物が残存したりすること、にもかかわらず収率が良くないことから、縮合剤を用いる方法にとって代わられた。
C末端のアミノ酸の保護基をポリマーに担持すれば、固相上でペプチド合成を行うことが可能である。この方法は1962年にロバート・メリフィールドによって開拓された。メリフィールドが用いたのはポリスチレン-ジビニルベンゼン共重合体にメトキシメチルクロリドを用いてヒドロキシメチル基を導入した合成樹脂であった。固相ペプチド合成はルーチン化された手順と反応条件で反応を行う自動合成へと発展した。固相合成法では、α-アミノ基の保護基としてフルオレニルメトキシカルボニル基 (Fmoc) を使用するのが一般的である。
ペプチド合成 遺伝子工学的ペプチド合成
遺伝子工学的ペプチド合成はDNA合成や逆転写酵素、制限酵素の発見などを技術的な基盤として1970年代後半に確立された。1977年に板倉啓壱らによって行なわれた大腸菌を用いたソマトスタチンが最初の例である。
遺伝子工学的ペプチド合成は以下のような手順で行なわれる。
目的のアミノ酸配列をコードしたDNA断片の調製方法には大きく分けて2種類ある。
1つは化学的にDNAを合成する方法である。現在では自動合成装置が市販されており、これを用いて望み通りの塩基配列を持つDNAを合成することが可能である。合成するDNAの塩基配列には目的とするアミノ酸配列をコードする翻訳領域の他に、ベクターと結合させるための制限酵素認識部位が必要である。また、できたペプチド鎖を酵素などで切り出すためのアミノ酸配列に対応する塩基配列を組み込むこともある。自動合成では塩基がうまく結合せず塩基配列の一部が欠損したDNAが生成し、その割合は塩基数が多くなるほど増える。そうすると完全な塩基配列を持つDNAを精製して取り出すのが困難になってくるので、合成できる配列の塩基数には上限がある。
ペプチド合成 遺伝子工学的ペプチド合成
もう1つは目的とするペプチドの翻訳元であるmRNAから調製する方法である。目的とするペプチドを産生している細胞内には、そのペプチドの翻訳元であるmRNAが必ず存在しているはずである。まず、その細胞内に存在するすべてのmRNAを混合物として取り出した後、mRNAの3'末端のポリアデノシン一リン酸配列に結合するオリゴデオキシチミジン一リン酸の5'末端に後でベクターと結合させるために必要な制限酵素認識配列を結合させたDNA断片をプライマーとして加え、逆転写酵素によりcDNA(にプライマーが結合したもの)を調製する。こうして調製したcDNA混合物に対し、目的のcDNAと結合する塩基配列に制限酵素認識配列を結合させたプライマーを添加してPCR法を行う。すると目的とするcDNAのみが増幅されて得られる。得られるcDNAは目的とするアミノ酸配列をコードする塩基配列の前に制限酵素認識部位を、後ろにポリアデノシン一リン酸配列と制限酵素認識配列を結合したものになる。
ペプチド合成 遺伝子工学的ペプチド合成
遺伝子を発現させてペプチドを合成するためのベクターとしては対象とする細胞の種類によりプラスミドやバキュロウイルスなどが用いられる。ベクターにはある種の抗生物質への耐性を持たせる遺伝子と、ペプチド合成を制御するためのプロモーター、オペレーター、リボソーム結合部位、そしてその下流に制限酵素認識部位を集めたマルチクローニングサイトや後述するDNAが導入された細胞の選別のための酵素をコードする遺伝子が組み込まれている。さらに得られたペプチドを精製しやすくするためのポリヒスチジンタグをコードする遺伝子やペプチダーゼで目的のペプチドを切り出すための酵素認識部位をコードする遺伝子を含むこともある。DNA断片はマルチクローニングサイトに導入される。ソマトスタチンの例ではラクトースオペロン内のβ-ガラクトシダーゼをコードするlacZ内に導入された。
DNA断片のベクターへの組み込みは以下のように行なわれる。まず調製したDNA断片の両末端に導入した制限酵素認識配列を制限酵素により切断して付着末端を作る。ベクターの側も制限酵素で切断して付着末端を作る。この2つを混合すると付着末端同士がアニーリングし、ベクターにDNA断片が組み込まれる。これをDNAリガーゼでライゲーションしてDNA断片を結合させる。
ペプチド合成 遺伝子工学的ペプチド合成
DNA断片を組み込んだベクターをターゲットとなる細胞に導入する方法はいくつかある。大腸菌では塩化カルシウムや塩化ルビジウムで処理してコンピテントセルとしてプラスミドを取り込ませる方法、マイクロインジェクションにより直接導入する方法、電気により細胞膜に穴を開けてそこからプラスミドを導入する電気穿孔法などがある。酵母では細胞壁のペプチドグリカンを除去したスフェロプラストにDNAを取り込ませるスフェロプラスト法、酢酸リチウム溶液で処理してDNAを取り込ませる酢酸リチウム法などがある。
ベクターを取り込んでいない細胞や制限酵素による切断がなされなかったことによりDNA断片が取り込まれていないベクターを取り込んでしまった細胞も存在しているため、DNA断片が組み込まれたベクターを取り込んだ細胞だけを選別することが必要となる。これにはベクター上にある遺伝子を利用した2段階選別法が用いられる。
ベクター上にはある種の抗生物質への耐性を与える遺伝子があるため、ベクターを取り込んだ細胞は培地にその抗生物質が含まれていても増殖が可能である。そこで抗生物質を添加した培地でコロニーを形成した細胞はベクターを取り込んでいることが分かる。
ペプチド合成 遺伝子工学的ペプチド合成
またDNA断片がベクターに組み込まれた際に、DNA断片が挿入された位置にあった遺伝子はその機能が失われる。DNA断片はある酵素の遺伝子上に挿入されるため、その酵素の働きが失われることになる。例えばβ-ガラクトシダーゼの働きが失われたことは、X-galを分解して青色の色素を形成する能力が失われたことで知ることができる。このようにしてDNA断片が組み込まれたベクターを取り込んだ細胞だけを選別できる。
組み換えDNAから産生されるペプチドは細胞の機能に影響して増殖を不可能にしてしまうことがある。そのためオペレーターによって遺伝子の発現は抑えられている。インデューサーを添加することによって遺伝子が発現し、ペプチドの産生が開始される。
産生されるペプチドはDNAの導入されたベクターによって欲しいペプチドそのものではないことがある。ソマトスタチンの例ではβ-ガラクトシダーゼの遺伝子の途中にソマトスタチンの遺伝子を挿入したため、ソマトスタチンのN末端側にβ-ガラクトシダーゼのN末端側アミノ酸配列の一部が結合した融合タンパク質として得られてきた。なお、ガラクトシダーゼのC末端側の配列はソマトスタチンの遺伝子の終止コドンによって翻訳が停止するため付加されない。ソマトスタチンの遺伝子の手前にメチオニンのコドンを導入しておき、臭化シアンでこのメチオニンを分解することによってソマトスタチンの切り出しを行なっている。他にペプチダーゼの酵素認識部位をコードする遺伝子を導入しておき、ペプチダーゼで目的のペプチドを切り出す方法なども知られている。
ルーメン (小惑星)
ルーメン (141 Lumen) は、小惑星帯に位置する比較的大きくて暗い小惑星の一つ。発音によってはリューメンなどにも聞こえる。C型小惑星に分類される。エウノミア族に近い軌道を通るが、S型小惑星で構成されているエウノミア族には含まれない。
1875年1月13日にパリでフランスの天文学者アンリ兄弟により発見され、フランスの天文学者でSF作家でもあるカミーユ・フラマリオンの著書のタイトルから命名された。
2005年1月に本州のかなり広い範囲で掩蔽が観測された。
バキリ・ムルジ
エルソン・バキリ・ムルジ（Elson Bakili Muluzi、1943年3月17日 - ）は、マラウイ共和国の政治家。1994年から2004年まで同国大統領。
バキリ・ムルジ 来歴
1994年5月、マラウイ初の複数政党による大統領選挙でムルジは47.2%の票を獲得し、独立以来の指導者であったヘイスティングズ・カムズ・バンダ破って大統領に当選する。また同時に行われた総選挙でも、ムルジが率いる統一民主戦線（UDF）が勝利を収めた。その後、1999年6月の大統領選挙でも52.4%の票を得てグアンダ・チャクアンバらを退け、再選を果たした。
2期目半ばの2002年、3選禁止を謳っている憲法を修正し自らの3選を可能とする憲法改正を提案するが、これに反発するデモが発生したため提案は通らなかった。2004年5月、2期10年の大統領の任期を終えて退任。後任には同じUDFのビング・ワ・ムタリカが当選した。
ムルジは、バンダが政府を去った後、UDFを率いるとともに民主主義の代弁者となった。しかし、ムルジの大統領としての日々は、論争とスキャンダルに費やされた日々でもあった。特に、国中に飢饉をもたらした旱魃が始まる直前に、他国へトウモロコシの備蓄を売却していたことが問題となった。国際的な圧力にもかかわらず、マラウイの備蓄食料の販売による数百万ドルの利益は戻されなかった。これが結果として外貨となり、ムルジとその支持者の元に入ったと広く疑われることとなった。
バキリ・ムルジ 来歴
それでもなお、ムルジは南部を中心に広く人望を集めた大統領であった。2005年2月に後継大統領であるムタリカがUDFを去り民主進歩党（DPP）を旗揚げした後も、ムルジはUDFの党首として残っている2005年4月、ムルジはムタリカを後継者として指名したこと、国に彼を負わせたことについて国に謝罪した。。
2006年7月27日、ムルジは詐欺と不正告発で逮捕されたが、その日のうちに保釈されている。2007年3月初旬、UDFの有力者たちがこぞって2009年に予定されている大統領選挙に推す動きを見せ、党も3月11日までに立候補の有無を宣言するよう求めた。当日、ムルジは大統領選挙の候補者として党の指名を求める旨を発表した。憲法の規定は再選を2期までとするものであって、一度大統領から退いたものが再び選ばれることを妨げるものではないと判断したからであった。なお、この「連続して」という言葉を憲法から削除する提案もあがっている。
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団
『SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団』（エスディーガンダムがいでん ナイトガンダムものがたりスリー でんせつのきしだん）は、1992年10月23日に日本のバンダイから発売されたファミリーコンピュータ用ロールプレイングゲーム。
カードダス『SDガンダム外伝 円卓の騎士編』（1991年）が題材となっている。シリーズを通しての高いエンカウント率と難易度を受け継いでいる。
2009年9月14日にはバンダイナムコゲームスから携帯電話ゲーム『ナイトガンダム物語 円卓の騎士団』としてリメイク版が配信された。当初はNTTドコモ専用で、章ごとに購入する課金制であったが、後に全シナリオが月額制となった。2014年に配信を終了した。
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 ゲーム内容
総勢12人の円卓の騎士達を、2パーティーに分割して冒険を進める。『騎士団』という考えを生かした、独特の戦闘システムが特徴。前作同様、マップ上でのキャラクターが大きく、移動が快適である。その反面、フィールドやダンジョン内でのエンカウント率が異常に高い。移動画面中セレクトボタンを押すと操作キャラを変えられる。
戦闘
マップ移動中敵モンスターに出会うと、画面は自動的にバトルモードに切りかわる。敵の先制によって仲間が混乱することがあり、混乱した仲間からダメージを受けることもある。敵モンスターを倒すと経験値、G（ゴールド）、名声値がもらえる。また、宝箱がもらえることもある。経験値が一定の値になるとレベルアップ。パーティーリーダーが戦闘不能や「きぜつ」状態などでなければ「たいれつ」コマンドで元に戻せる。時折、フィールド上で旅人一家が襲われている場合があり戦闘に勝てば後述の名声が大幅にUPするが、逃げたり全滅すると逆に大幅に下がってしまう。ステータスの「すばやさ」により、数値が高く相手が低い場合、最大で3回（レッドウォーリアは4回）攻撃ができ、複数攻撃中にもクリティカル攻撃が出るが敵も同様であり、特に通常は防御力やHPに優れているヘヴィガンダムやとうしF90jr.でも注意する必要がある。
技
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 ゲーム内容
MP（メンタルポイント）を消費して必中のクリティカル攻撃を任意に繰り出す。MPが尽きると「きぜつ」状態になってしまう上「きぜつ」する（MPが0になる）状態でも繰り出せるが当然に使用後は気絶してしまう。モンスターも同様にMPがあり、ボスでさえMPが0になると行動不能となる。通常攻撃から及びその戦闘のトドメの時に出された技はMPを消費しない。魔法使いは、最初から覚えているものか、購入した魔法を使用する。魔法は「魔法屋」で売買できる。
命令
パーティーリーダー（クラウンナイト、フォーミュラ）が使用可能。仲間達の操作をオートかマニュアルに切り替える。
「ごめいれいを」
操作をプレイヤーがコマンドで決定する。
「おまかせを」
操作をキャラクター任せにする。キャラクターには行動パターンが設定されており、それに従った行動をとる。パーティーリーダーが戦闘不能状態等だと各自は自動的に行動をとるようになり結果、オート戦闘となる。
キャンプ
移動中に使用可能。ダンジョン内でも使える。一晩過ごすとHP,MPが全回復。使用にはアイテム「キャンプようぐ」が必要。
名声
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 ゲーム内容
騎士達の名の知れ具合。イベントの発生、エンディング後の評価にも影響する。戦闘に勝つ、イベントをクリア、アイテム「紋章」を使用することでアップ。逃走したり全滅したりすると下がっていく。全滅した時の名声が下がらないようにする「保険屋」というのもある。
装備
一部を除いて、装備品は変わらない。町の施設「鍛冶屋」で、アイテム「ガンダリウム」と金貨を払うことでパワーアップ。鍛冶屋にはレベル制限があり、更にクラウンナイトの防具によっても制限がある。
日数、年表
ゲーム再開時に、攻略の進度を年表で表示。日数は朝から夜までの行動か、宿屋で一泊すると1日プラスされる上エンディング後の評価にも影響する。
カードダスバトル
サブゲーム。ストーリー進行には影響しない。2人対戦も可能。
アイテムは同一の物なら3つで一つの枠となり、1キャラで6枠、最大18個持てる。
薬草
HPを30回復。
傷薬
HPを80回復。
特効薬
HPを全回復。
気つけ薬
MPを10回復。混乱状態も治す。
ぶどう酒
MPを30回復。混乱状態も治す。
メガウォーター
MPを完全回復。混乱状態も治す。
毒消し
毒状態を治す。
奇跡の薬
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 ゲーム内容
戦闘不能状態を治す。1つ3,000Gと異常に高額な上に限られた場所でしか販売していない。
キャンプ用具
HPとMPを全回復し、状態異常も治す。
魔法のハシゴ
ダンジョンから脱出できる。
兵法の書
前作までと違いレベルが1上がる効果となっている。
名馬のたてがみ
馬を呼び出し乗って移動できる。移動スピードは通常時と変わらず森などの通過も出来ないが、奇襲を受けない特徴がある。
チキンホイッスル
チャッピーを呼び出し乗って移動できる。上記の名馬のたてがみと同様の効果があり、両方とも使用中はBGMが変わる。
天の裁き
使用することでザコ敵を一掃する事ができる。
悪魔のつぶやき
味方全体のMPが減少する、マイナスアイテム。
銀の紋章
使用すると名声が20ポイントアップする。
金の紋章
使用すると名声が100ポイントアップする。
闇の紋章
使用すると名声が100ポイントダウンする、マイナスアイテム。
ひすいの指輪
魔法の消費MPが1減る。ゲーム全体を通して2個手に入るが効果は重複しない。
ガンダリウム
武器・鎧のレベルを鍛冶屋で鍛えることで1段階上げる。終盤鉱山から無限に取る事が出来る。
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 登場キャラクター
ゲームソフトの都合上、オリジナル設定が多数追加されている。詳しい対比についてはこちらを参照。
皇騎士ガンダム（ゲーム内ではクラウンナイト、以下同じ）→キングガンダムII世（キングガンダムII）
ブリティス王国再興を目指す皇子。終始リーダーであるため、マニュアルで操作する。物語終盤で王位を譲り受け、キングガンダムII世を名乗る。
必殺技：ヴァトラス・アタック→キング・フィニッシュ
装備：ヴァトラスソード→キングキャリバー、ノーマルスーツ→ジーアーマー→フルアーマー、キングシールド
勇剣士プラス（プラス）
血気盛んな若者。素早さが高く、攻撃重視で殆ど回復をしない。
必殺技：スパット斬り
装備：サイドワインダー、ハイブリッドメイル
鎧騎士ガンダムF90（フォーミュラ）
旧円卓の騎士の一人。クラウンナイトを優先して守る。後に第二パーティーのリーダーを務める。歴戦の戦士だが年齢を考慮してかステータスが低めに設定されている。F90jr.3兄弟の父親。
必殺技：烈火流星斬
装備：ブリティスソード、ブリティスメイル
白金卿（プラチナロード）
旧円卓の騎士の一人。記憶喪失になっていたが、愛剣を取り戻し参戦。慎重派で、仲間の回復を怠らない。フォーミュラ同様、ステータスが低めに設定されている。
必殺技：スプラッシュ・ゴールド
装備：プラチナソード、プラチナクロス
重戦士ヘビィガンダム（ヘビィガンダム）
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 登場キャラクター
アイリッシュ村を守っている戦士。攻撃力・守備力に優れ、暴れまわる。
必殺技：プレッシャー・バースト
装備：アックスブレード、ヘビィメイル
風騎士ガンダムマークII（ガンダムマークII）
旧円卓の騎士団、嵐騎士ガンマガンダムの息子。風のアジトを拠点にレジスタンス活動を行っている。クラウンナイト達の活躍如何で協力してくれる。回復優先タイプで、冷気攻撃に耐性がある。
必殺技：トルネード・ストリーム
装備：ウインドスラッシャー、ハリケーンメイル、ディフェンサー
麗騎士レッドウォーリア（レッドウォーリア）
旧円卓の騎士団、薔薇騎士ロゼッタガンダムと同じ出身地であるとされる。キザでナルシスト。自身のファンクラブもある。二刀流で攻撃回数が多いが、一発の攻撃力が低く設定されている。
必殺技：ダンシング・ローズ
装備：スカーレットスワロー、ローズソーン、スカーレットメイル
僧正ガンダンクR（ガンタンクR）
旧円卓の騎士の一人でソドンの町で隠居している。ゼダンの要塞攻略時に参戦。
必殺技：購入した魔法を使用（メガショックを使用するとアニメーションが出る）
装備：プラスロッド、マイナスロッド、スピリットガード
剣士F90ジュニア（けんしF90jr.）
鎧騎士ガンダムF90の息子。梟の館に捕まっている。プラス同様スピードに優れる切込隊長。
必殺技：真・烈火流星斬
装備：サポートソード、フォーミュラアーマー
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 登場キャラクター
闘士F90ジュニア（とうしF90jr.）
鎧騎士ガンダムF90の息子。ヘビィガンダムに次ぐ力の持ち主。やはり攻撃重視。
スコットの村で仲間に加わる。アプリ版ではザビロニアに臆病風を吹かした彼の目を覚ますため、ヘビィガンダムと同様に戦闘を行って加入する形となる。
必殺技：爆走猛牛殺
装備：デストロイドアックス、フォーミュラアーマー
僧侶F90ジュニア（そうりょF90jr.）
鎧騎士ガンダムF90の息子。先走って行動した二人の兄弟を心配している。
必殺技：購入した魔法を使用（メガショックを使用するとアニメーションが出る）
装備：アサルトロッド、フォーミュラアーマー
灼騎士ガンダムF91（ガンダムF91）
不死鳥の館を構えるレジスタンス。メンバー随一の守備力を誇り、炎攻撃に強いが氷攻撃に弱い。回復優先タイプ。
必殺技：バーニング・ノヴァ
装備：クロスファイアー、バーニングメイル、ブリンクシールド
闇騎士ガンダムマークII（ダークナイト）
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 登場キャラクター
旧円卓の騎士団、嵐騎士ガンマガンダムの息子。風騎士ガンダムマークIIの兄にあたる。幼少期の記憶を無くしており、グレートデギンの側近となっていたが、風騎士ガンダムマークIIの説得によって記憶を戻した（アプリ版ではガンマガンダムの武器「闘士ダブルゼータのダブルハンマー」に振れたことで記憶を取り戻した）。最終決戦時、グレートデギンから聖杯を奪い、命を落としたかに見えたが、聖杯によって救われ以後13番目の円卓の騎士団となる。アプリ版では援軍として仲間に加わる。ちなみに愛馬の名前はタイタン。
必殺技：ダークネスストリーム
戦士ハイザック
各地でいろいろと悪さをしている。主に雑魚としてランダムエンカウントするが固定敵としても出現する。しかし能力は変わらない。
邪騎士ザクエス
オープニングで突然の皇騎士の登場に、錯乱して敗走したが、ガルマの館の地下道内で再戦する。
魔剣士ザクロード
ガルマの館の中で待ち受けるボス。ガルマを陰で操っていた。一度倒すと、館から出る時に追いついてきてザクトパスへと変化する。
モンスターザクトパス
魔剣士ザクロードの正体。倒しても不死身なので生きているが、龍の首飾りの力により消滅した。ザクトパスに引き続き出口直前で襲い掛かる為得意の水中戦には持ち込めなかった。
呪術士ダーティギャン
ノース砦を預かるザビロニア帝国の呪術士。オリジナルとは異なり、ガルマの館陥落後に戦うことになる。メガマインドが脅威となる。アプリ版では援軍として仲間に加わる。ジーアーマーを隠し持つ。
チャッピー
アイリッシュ村の少年が拾った卵から孵ったチキンゾックで同様のポジションである名馬と違い名前が与えられた。アイテムを使って呼び出し乗り物として利用できる。
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 他機種版
携帯アプリ版の変更点
ガンダリウム、魔法の種類が増えた。ガンダリウムには赤、青、黄、黒と色があり、I、II、III（バージョンアップ以前はα、β、γ）のランクがある。それぞれ、青は素早さが、黄色は気合の一撃の出やすさが、黒にはその両方の特性があり、レベルによって上昇しなかった素早さと気合の一撃の出やすさを上昇できるようになった。また、魔法にはギガ、テラフレアなど、メガの上位魔法がある。
SDガンダム外伝 ナイトガンダム物語3 伝説の騎士団 評価
ゲーム誌『ファミコン通信』の「クロスレビュー」では、7・6・6・4の合計23点（満40点）、『ファミリーコンピュータMagazine』の読者投票による「ゲーム通信簿」での評価は以下の通りとなっており、21.2点（満30点）となっている。
ポラナ (小惑星)
ポラナ (142 Polana) は、小惑星帯に位置するとても暗い小惑星の一つ。主に炭素でできており、C型小惑星のサブグループのF型小惑星、またニサ族のサブグループであるポラナ族に分類される。1875年1月28日にオーストリアの天文学者、ヨハン・パリサがポーラ（現クロアチア領プーラ）で発見し、発見場所に因んで名付けられた。
秋月 (駆逐艦)
秋月（あきづき）は、大日本帝国海軍の駆逐艦。秋月型一等駆逐艦の1番艦である。艦名は秋の月から。対空能力に優れた防空型駆逐艦として開発され、太平洋戦争（大東亜戦争）後半の艦隊防空を担当した。ソロモン諸島を巡る戦いでは、水雷戦隊旗艦として行動する事も多かった。
艦名は戦後、海上自衛隊の護衛艦（あきづき（初代）、あきづき（2代））に受け継がれた。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
1939年（昭和14年）度の④計画による乙型一等駆逐艦の第104号艦として建造がはじまる。舞鶴工廠にて1940年（昭和15年）7月30日に起工。5月15日、正式に「秋月」と命名、一等秋月型として登録される。7月2日に進水し、同日附で佐世保鎮守府籍。
9月12日に内示された『昭和17年度海軍戦時編制』によれば、秋月型3隻（秋月、照月、初月）で第25駆逐隊の編制が予定され、同駆逐隊は空母「鳳翔」および特設航空母艦2隻と「第七航空戦隊」を編制予定であった。だが、この編制を実現する前に太平洋戦争が勃発したため、秋月型3隻が「鳳翔」と実戦に参加する事はなかった。
1942年（昭和17年）3月20日、日本海軍は駆逐艦「三日月」「東雲」「親潮」艦長等を歴任した金岡国三中佐を「秋月」の艤装員長に任命する。
5月20日、金岡艤装員長は転任し、代わって駆逐艦「山雲」艦長だった古賀彌周次中佐が「秋月」初代駆逐艦長に任命された。
「秋月」の竣工は5月25日を予定していたが、公試で主砲塔に不具合が判明し、6月中旬に延期された。
6月5日 - 6日のミッドウェー海戦で日本海軍は主力空母4隻（赤城、加賀、蒼龍、飛龍）と重巡「三隈」を喪失。「秋月」は砲塔の不具合を解消しないまま急遽作戦に投入されることになり、完成予定日を繰り上げて6月11日に竣工し、同日附で警備駆逐艦となる。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
「秋月」は竣工後ただちに実戦配備され、駆逐艦「朧」と共に第五航空戦隊の空母「瑞鶴」護衛を命じられた。これはミッドウェー海戦で南雲機動部隊が壊滅したのち、アリューシャン列島方面でもアメリカ軍機動部隊出現の徴候があったため、北方部隊（第五艦隊基幹）を増強する必要があったからである。連合艦隊は珊瑚海海戦以降内地で待機していた「瑞鶴」とミッドウェー海戦から戻った駆逐艦「浦風」に対し、北方部隊第二機動部隊（龍驤、隼鷹、瑞鳳）編入を下令。「朧」と「秋月」に対しては、北方へ向かう「瑞鶴」と「浦風」の往路護衛を指示した。舞鶴を出港した「秋月」は横須賀へ向かう予定を変更して、そのまま呉へ移動。
6月15日に「瑞鶴」「朧」「浦風」「秋月」は内地を出発し、途中キスカ島上空での敵重爆迎撃作戦発令と撤回などがあり時間をとられ、6月24日に大湊へ到着した。同日附で「秋月」と「朧」は「瑞鶴」と「浦風」の護衛任務を解かれ東京湾方面部隊に編入。2隻は横須賀に戻った。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
6月29日、「秋月」は横須賀を出港して「鎌倉丸」をマカッサルまで護衛し、7月18日に横須賀へ帰投。8月13日に「鳴門丸」を護衛して横須賀を発し、8月20日にニューアイルランド島カビエンに着いた。翌8月21日にラバウルへ入港し機動部隊主隊に編入された。
8月24日、日米機動部隊による戦闘が行われ、日本海軍は空母「龍驤」等を撃沈されて敗北した（第二次ソロモン海戦）。「秋月」が機動部隊に合流したのは戦闘終了後の8月25日であったという。トラック泊地着後の9月8日、第十戦隊に編入。9月26日、「秋月」および第9駆逐隊の駆逐艦（朝雲、夏雲、峯雲）は外南洋部隊に編入される。ショートランド泊地へ移動後の9月29日、来襲したB-17爆撃機3機のうち、1機を撃墜した（#秋月に関する通説参照）。10月3日以降、ガダルカナル島への輸送作戦（鼠輸送）に従事する。
10月7日附で「秋月」と同型艦「照月」で第61駆逐隊（駆逐隊司令則満宰次大佐）が編成され、あらためて第十戦隊に編入された。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
10月3日、水上機母艦「日進」、駆逐艦2隻（野分、舞風）によるガダルカナル島輸送作戦が実施された。輸送隊はアメリカ軍機の断続的な空襲を受けたため、急遽「秋月」に出撃命令が出される。「秋月」は10月4日黎明にガ島から引き揚げてくる「日進」「野分」「舞風」と合流。零戦や水上機部隊の掩護をうけつつ、ショートランドに帰投した。また零式水上観測機1機がB-17重爆に特攻して撃墜、脱出した零観搭乗員2名は「秋月」に救助されている。
10月7日、増援部隊指揮官橋本信太郎第三水雷戦隊司令官（旗艦「川内」）より命令を受けた「日進」と「秋月」は、駆逐艦5隻（時雨、綾波、白雪、吹雪、叢雲）と共に輸送作戦を実施することになった。だが第11航空艦隊より、天候不良のため直衛の戦闘機派遣不能との連絡が入る。「日進」と「秋月」はショートランド泊地へと避退、「時雨」以下駆逐艦部隊のみでの輸送作戦となった。
10月8日、「日進」による第2回ガダルカナル島輸送作戦が実施された。「秋月」は駆逐艦4隻（夕立、春雨、朝雲、夏雲）と共に「日進」を護衛し、アメリカ軍機から守った。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
10月11日朝に水上機母艦「日進」「千歳」と駆逐艦6隻（秋月、綾波、白雪、叢雲、朝雲、夏雲）はショートランド泊地を出撃し、ガダルカナル島への輸送・揚陸作戦に従事する。輸送隊は零戦隊の掩護を受けつつ、順調に進撃。夜になってガダルカナル島へ到着、物資揚陸に成功する。
その頃、ガダルカナル島沖では日本の第六戦隊などがアメリカ艦隊と交戦して敗退（サボ島沖海戦）。日進輸送隊はラッセル諸島西側を通過して戦闘海域を離脱。この時、第六戦隊救援と掩護のため駆逐艦4隻（朝雲、夏雲、白雪、叢雲）が分派されたが、空襲により「夏雲」と「叢雲」が沈没した。
10月12日午前7時、輸送隊は橋本少将が率いる軽巡洋艦「川内」「由良」、駆逐艦「時雨」「白露」「浦波」「磯波」「天霧」等と合流。日進隊は「由良」「天霧」「白露」「時雨」の護衛を受けてショートランドへ到着した。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
10月12日夕刻、第四水雷戦隊司令官高間完少将は秋月型の対空能力を期待して軽巡洋艦「由良」から「「秋月」に移乗し、第四水雷戦隊旗艦とした。秋月型の旗艦能力も、短時間の任務ならば概ね支障ないとの評価を得ていた。
10月14日、増援部隊指揮官・橋本少将指揮のもと、軽巡3隻（川内、由良、龍田）と駆逐艦4隻（朝雲、白雪、暁、雷）は、それぞれガダルカナル島への揚陸に成功。翌日、四水戦（秋月、村雨、五月雨、夕立、春雨、時雨、白露、有明）等の護衛による輸送船団6隻は、アメリカ軍機の空襲で輸送船3隻（笹子丸、九州丸、吾妻山丸）が座礁するもかろうじて輸送任務に成功した。だが日中の米軍艦砲射撃や空襲により、揚陸地点に集積されていた物資は大部分を焼き払われてしまった。
10月16日、連合艦隊は水上機母艦（日進、千歳、千代田）による輸送をやめ、軽巡洋艦及び駆逐艦での輸送を下令する。「秋月」は水雷戦隊旗艦として輸送隊を指揮する事になった。10月17日午前2時以降ショートランド泊地を出撃した輸送隊は、同日午後10時にガダルカナル島へ到着。白露型2隻（時雨、村雨）が警戒及び陸上砲撃を行う中、各艦・各部隊は陸軍兵2,159名、大砲18門、軍需物資の揚陸に成功した。「由良」に米潜水艦「グランパス (USS Grampus, SS-207) 」から発射された魚雷1本が命中したが、不発のため損害は軽微だった。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
10月24 - 25日、南太平洋海戦および陸軍のガダルカナル第二次総攻撃の際、「秋月」は、軽巡洋艦「由良」および第2駆逐隊（村雨、春雨、五月雨、夕立)と共にガダルカナル島ルンガ泊地へ突入すべく行動を開始した。先行して泊地に突入した突撃隊（指揮官山田勇助大佐/兼第6駆逐隊司令　第6駆逐隊《暁、雷》、第27駆逐隊《白露》）に続航してツラギ北方（インディスパンサブル海峡）を通過中、米軍機による攻撃を受ける。
10月25日午前10時55分、SBD爆撃機の急降下爆撃により「由良」が命中弾を受け速力低下、「秋月」も至近弾を受けた。「秋月」は最大発揮速力23ノットに低下、第二攻撃隊は北方への退避を開始する。続く艦爆の攻撃は撃退したが、午後3時10分、B-17爆撃機の攻撃により「秋月」に爆弾1発が命中する。戦死11名、戦傷22名を出した。一連の空襲をうけて「由良」は復旧の見込みがなくなり、「春雨」「夕立」により処分されて午後7時に沈没した。「秋月」は各艦が救助した「由良」の乗組員を収容すると、四水戦旗艦を「村雨」に移譲して撤退を開始した。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
損傷した「秋月」は10月27日にラバウルに到着した。10月31日、ラバウルを出港してトラック泊地へ移動。ここでは第4駆逐隊（嵐、舞風、野分）、第17駆逐隊（浦風、谷風、浜風、磯風）、第10駆逐隊（秋雲）と共に、南太平洋海戦の損傷艦（翔鶴、瑞鳳、熊野、筑摩）の内地回航を護衛した。また回航に際し、「秋月」は外南洋部隊（第八艦隊）より除かれ機動部隊に復帰した。11月6日、横須賀着。同地にて修理を行い、12月18日付の訓令により機銃増備工事が追加されたため、当初予定より工事期間を延長し12月28日まで行った。このとき煙突左右に機銃台を新設して25ミリ機銃3連装を1基ずつ搭載した。竣工時の25ミリ機銃連装2基と合わせ全体で25ミリ機銃10門となった。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
1943年（昭和18年）1月4日、駆逐艦3隻（秋月、第16駆逐隊《初風、時津風》）は空母「瑞鶴」（陸軍九九式双軽爆撃機輸送任務）を護衛してトラックに進出する。「瑞鶴」は戦艦「陸奥」等と共に内地へ帰投し、「秋月」「初風」「時津風」は前進部隊に編入された。ガダルカナル島増援任務に投入されていた第二水雷戦隊（長波、陽炎、親潮、涼風）等の疲労と消耗がはなはだしく、健在艦と交代させる必要があったからである。「秋月」には第十戦隊司令官木村進少将が座乗、十戦隊旗艦となる。1月10日、「秋月」に先行してガ島輸送作戦に参加した「初風」はアメリカ軍魚雷艇の襲撃により大破し、「嵐」「江風」「時津風」に護衛されてショートランドへ帰投することができた。
1月15日、「秋月」（第十戦隊旗艦）は陽炎型駆逐艦8隻（黒潮、時津風、浦風、磯風、浜風、谷風、嵐、舞風）を指揮し、ガダルカナル島へのドラム缶輸送に従事する。警戒隊（秋月、黒潮、時津風、嵐）、輸送隊（谷風、浦風、浜風、磯風、舞風）という区分である。重巡部隊（鳥海、羽黒、熊野）、水上偵察機の掩護によりアメリカ軍魚雷艇部隊は撃退されたものの、B-17やSBDの襲撃により「嵐」「谷風」「浦風」「浜風」が損傷した。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
1月19日に陸軍輸送中の船団がブーゲンビル島北東でアメリカ潜水艦「ソードフィッシュ (USS Swordfish, SS-193) 」の攻撃を受けて「妙法丸」が被雷し、のち沈没する。ショートランドから「秋月」と敷設艦「初鷹」が現場へ向かったが、1月19日21時37分ごろに「秋月」はアメリカ潜水艦「ノーチラス (USS Nautilus, SS-168) 」の雷撃を受けて魚雷1本が命中し、一罐室浸水。戦死者14名、重軽傷者63名を出し、木村少将も負傷した。雷撃に遭う直前、見張り員が4,000 mの距離に敵潜水艦を発見しており、射撃用意が完了後艦長が「打ち方始め」の号令を出そうとしていた。しかし砲術参謀が「味方潜水艦かもしれないので照射してはどうか」と遮って具申を行った。艦長は反対したものの、木村司令官が具申を採り上げた、もしくは木村司令官が砲術参謀に任せたことにより照射が行われた。しかし、探照灯管制機の不調で補足できない間に敵潜水艦が潜行、爆雷戦用意を行いながら海面に向かっていた所を被雷したという。ショートランドへ向かう途中、「秋月」は再度雷撃されたが、命中しなかった。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
1月20日、「秋月」はショートランドに入港して応急修理を行う。翌日、第十戦隊旗艦は駆逐艦「風雲」に変更された。
将旗を徹した後の「秋月」は1月30日ショートランド泊地発。2月2日、トラック着と同時に工作艦「明石」に横付けして修理を受けた。
2月3日、第61駆逐隊司令は則満大佐から大江覧治大佐（前職第19駆逐隊司令）に交代した。
3月11日に「東京丸」に護衛されてトラックを離れ、サイパンを経て佐世保へ向かったが、サイパンの北西40浬で艦橋下キールが切断、「勝泳丸」に曳航されてサイパンに戻り艦橋を撤去した。艦橋は「松安丸」に移載された。さらに強度が落ち折れ曲がった船体前部を切断。6月24日に「神光丸」に曳航され駆逐艦「漣」の護衛でサイパンを出港し、7月5日に長崎に着いた。
航海中の6月30日、第61駆逐隊から除籍され、第二予備艦に指定される。
7月27日、古賀彌駆逐艦長は重巡洋艦「妙高」副長へ転任。「秋月」は駆逐艦長不在となった。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
1943年（昭和18年）10月31日まで、修理期間短縮のため既に出来上がっていた建造中の同型艦「霜月」（4月7日進水）の艦首を接合する工事を三菱長崎造船所で行う。一部残工事を佐世保海軍工廠に場所を変え11月6日まで行った。竣工時より装備の25ミリ連装機銃2基を三連装2基に増強するとともに、空所であった後部高射装置予定部を機銃台に改装し25ミリ三連装機銃1基を装備し、25ミリ機銃は合計15門となった。艦橋上及び左右に13ミリ単装機銃4挺、九三式水中聴音機、21号電探、逆探を装備している。また爆雷投下台6基は撤去され爆雷投下軌条2本が装備された。
修理完成直前の10月8日、二代目駆逐艦長として軽巡洋艦「木曾」副長・緒方友兄中佐（駆逐艦「霰」沈没時艦長）が補職される。「秋月」は工事完成とともに10月31日附で第三艦隊・第十戦隊・第61駆逐隊（初月、涼月、若月）に再編入された。
11月26日、岩国を出港し、駆逐艦4隻（秋月、島風、谷風、玉波）で空母2隻（翔鶴、千歳）をトラックまで護衛した。12月1日、トラック泊地に到着。同地で第61駆逐隊僚艦と初めて対面したという。だが12月7日、61駆（初月、涼月）は空母「瑞鶴」重巡「筑摩」を護衛してトラックを出港し、第61駆逐隊は再び分散した。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
当時、日本海軍はマーシャル沖航空戦で「中型空母1隻撃沈、大型空母1隻撃破、巡洋艦1隻撃沈」と認識し、また七五三航空隊も空母1隻、巡洋艦3隻を撃沈と報じ、12月6日の大本営発表で華々しく発表した。実際の戦果は、空母「レキシントン (USS Lexington, CV-16) 」が魚雷1本命中で中破、巡洋艦1隻、駆逐艦1隻損傷だった。このような状況下、連合艦隊はマーシャル群島の航空隊整備を企図した。12月9日、クェゼリン環礁に第一航空戦隊・第二十二航空戦隊の基地物件を輸送。12月14日にトラック泊地に戻った。
その後、「秋月」は戦艦「武蔵」の標的船曳航作業を行った。
この間の12月12日、第61駆逐隊司令は大江大佐から泊満義大佐に交代した（大江大佐は12月26日附で重巡洋艦「摩耶」艦長）。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
12月25日、「秋月」は戊三号輸送部隊第二部隊に編入された。戊三号輸送部隊第二部隊は軽巡洋艦「能代」（第二水雷戦隊旗艦）、「大淀」、駆逐艦2隻（秋月、山雲）という戦力で、12月31日にトラックを出撃し、1944年（昭和19年）1月1日カビエンで陸軍兵と物資を揚陸した。作業終了後、アメリカ軍機の空襲を受けた。対空戦闘開始時、4隻は旗艦「能代」を中心にして、「能代」の右舷4 kmに「秋月」、左舷3 kmに「山雲」、「能代」の後方8 kmに「大淀」という陣形をとっていた。カビエンからは零戦約50機（第二航空戦隊《龍鳳、飛鷹》所属機30含む）が発進し、艦隊を掩護した。一方「能代」は「大淀」の直衛に「秋月」を派遣したため、戊三号輸送部隊は「能代」「山雲」と「大淀」「秋月」という二群に分離する。零戦隊を突破した米軍機は二手にわかれると、大型の「能代」「大淀」を主として狙った。「大淀」「能代」「山雲」が至近弾、小型爆弾の直撃、不発弾、機銃掃射等の被害を受けたものの、深刻なダメージを負った艦はなかった。「秋月」に大きな被害はなかった。零戦隊は撃墜24（不確実14）を報じ、6機（二航戦所属4機）を喪失している。1月4日、トラックに戻る。1月25日、「秋月」は再びラバウルへ進出したが2月上旬にはトラック泊地へ呼び戻された。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
1944年（昭和19年）1月上旬、軽巡洋艦「阿賀野」（第十戦隊旗艦）の損傷に伴い同戦隊司令官木村進少将が座乗して「秋月」は再び旗艦となった。このころ、連合艦隊司令部はトラック島が戦場になることを懸念し、在泊連合艦隊艦艇をリンガ泊地（東南アジア）に移すことを決定する。「秋月」は敷島部隊（戦艦《長門、扶桑》、重巡《熊野、鈴谷、利根》、第17駆逐隊《浦風、磯風、浜風》）に加わり2月1日（1月30日とも）、トラック泊地を出港した。2月4日、パラオのコロール港に到着する。
2月16日、パラオを出港し2月21日にスマトラ島とシンガポールに挟まれたリンガ泊地に到着した。リンガ泊地には既に空母「瑞鶴」、第十戦隊各艦（風雲、初月、若月）が到着しており、第61駆逐隊が再び合同すると同時に第十戦隊旗艦は軽巡洋艦「矢矧」に変更となった。
秋月はリンガ泊地滞在中、赤道直下の無風帯での酷暑や蒸し暑さの中、居住区が簡易な構造であったため、兵員は船舶内において折畳椅子を持ち出して床板で休息することが多かった。また、「丁事件」においては、現地収容された参謀長以下職員らが不運にも死傷したとされる出来事が記録されており、「乙事件」に関しても、指揮官の戦死に次ぐ大きな衝撃であったとされる。この記述は、気象条件による兵員の生活状況や、指揮系統に関する重大事件（「丁事件」「乙事件」）についての貴重な一次資料的記録である。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
3月1日、第一機動部隊が新編成される。3月4日には中部太平洋方面艦隊（司令部サイパン島）の編成にともなって前第一艦隊長官南雲忠一中将が親補、「秋月」は戦艦「長門」を退艦してシンガポール飛行場に赴く南雲を送迎した。
3月20日、1月16日の「涼月」被雷時に戦死した泊大佐の後任として、天野重隆大佐（前職第10駆逐隊司令）が第61駆逐隊司令に任命される。
4月5日、新鋭空母「大鳳」が到着。5月1日には戦艦「大和」、重巡洋艦「摩耶」、駆逐艦「島風」が合流。「秋月」は主に訓練に従事した。
5月15日、タウイタウイ泊地に進出する。5月16日、第二航空戦隊（隼鷹、飛鷹、龍鳳）・第三航空戦隊（千歳、千代田、瑞鳳）が合流。5月20日、豊田副武連合艦隊長官は連合艦隊旗艦「大淀」より「あ号作戦用意」を発令し、10時34分発電で「今次作戦は実に皇国興廃の繁る所にして決戦部隊、就中航空部隊、潜水部隊は身を挺し必勝邁進し、各方面部隊は要地を固めて之が支援鉄壁を形成し、各員其の任務に応じ誓って本作戦の必成に向ひ善戦敢闘を望む」と伝えた。6月2日、「秋月」は護衛任務を中断してタウイタウイ泊地に帰投。
秋月 (駆逐艦) 艦歴
6月15日、「秋月」は機動部隊の一艦としてギマラスを出撃、サンベルナルジノ海峡を通過して太平洋に進出した。6月16日、渾作戦のためハルマヘラ島に派遣されていた第一戦隊司令官宇垣纏中将指揮下の別働隊（大和、武蔵、妙高、羽黒、能代、島風、沖波）が合流する。この頃、アメリカ軍機動部隊の攻撃により太平洋の島々に配備された日本軍基地航空隊が壊滅している。