深夜アニメ 系列ごとの主な放送の動向
『弱虫ペダル LIMIT BREAK』（第5期）
『ハヤテのごとく!』シリーズ（第2期以降）、『スレイヤーズREVOLUTION』（第4期）、『スクールランブル二学期』（第2期）、『ギャラクシーエンジェル』（第4期）、『銀魂』（2017年以降のシリーズ）、『カードファイト!! ヴァンガード overDress』シリーズ（Season2・『will+Dress』Season1）、『東京ミュウミュウ にゅ〜♡』シリーズ、『BLEACH 千年血戦篇』など
『マリア様がみてる〜春〜』（第2期）、『ネギま!?』（第2期）、『カードファイト!! ヴァンガード will+Dress』（Season2以降）、『キャプテン翼シーズン2 ジュニアユース編』、『ぷにるはかわいいスライム』（第2期）
『アイドルマスター ミリオンライブ!』
『ソウルイーター』、『あにゃまる探偵 キルミンずぅ』、『ケロロ軍曹（7thシーズン）』
『おはスタ』コーナーアニメとしてショート版を深夜でのフル版と連動して放送
『斉木楠雄のΨ難』（第1期）、『古見さんは、コミュ症です。』（第1期）
『夏目友人帳』（第1期）、『神のみぞ知るセカイ』（第1期）、『ケロロ軍曹乙』（『ケロロ軍曹アンコール!』）、『けものフレンズ』（第1期）、『よりぬき銀魂さん ポロリ篇』、『IDOLY PRIDE』、『カードファイト!! ヴァンガード will+Dress』（Season1）、『BLEACH 千年血戦編』、『SPY×FAMILY』（Season1）、『ウマ娘 プリティーダービー』（Season 2、Season 3）
『まりあ†ほりっく あらいぶ』（第2期）、『邪神ちゃんドロップキックX』（第3期）、『異世界はスマートフォンとともに。2』（第2期）、『B-PROJECT〜熱烈＊ラブコール〜』（第3期）
『魔法少女リリカルなのはStrikerS』、『ガールズ&パンツァー』、『IDOLY PRIDE』（前述の様に夕方枠で放送）、『プラオレ!〜PRIDE OF ORANGE〜』、『ウマ娘 プリティーダービー』（Season 2、Season 3）、『戦姫絶唱シンフォギア』（第1期）
『怪 〜ayakashi〜』（『化猫』編のみ）・『モノノ怪』
全国各地でネット系列が異なるパターン
関西圏では毎日放送で放送
『貧乏神が!』、『境界戦機』、『夢見る男子は現実主義者』、『新米オッサン冒険者、最強パーティに死ぬほど鍛えられて無敵になる。』(太字は毎日放送も製作参加)
関西圏ではサンテレビ・KBS京都で放送
『月とライカと吸血姫』
東海地方ではテレビ愛知でネットされず岐阜放送のみで放送
『ワンパンマン』（第1期）
北海道では北海道テレビで放送
『異世界美少女受肉おじさんと』
BSでは地上波と同時期に他のBSデジタル放送局で放送
BS日テレで放送
『月とライカと吸血姫』、『邪神ちゃんドロップキックX』、『アイドルマスター シンデレラガールズ U149』、『夢見る男子は現実主義者』、『SYNDUALITY noir』、『SHY』シリーズ、『B-PROJECT〜熱烈＊ラブコール〜』、『休日のわるものさん』、『転生したら第七王子だったので、気ままに魔術を極めます』シリーズ、『アイドルマスター シャイニーカラーズ』シリーズ、『甘神さんちの縁結び』、『マジック・メイカー 〜異世界魔法の作り方〜』、『ボールパークでつかまえて!』、『#コンパス2.0 戦闘摂理解析システム』、『えぶりでいホスト』
BS朝日で放送
『東京リベンジャーズ』シリーズ、『ちみも』、『完璧すぎて可愛げがないと婚約破棄された聖女は隣国に売られる』
BSフジで放送
『精霊幻想記』シリーズ、『邪神ちゃんドロップキックX』、『聖剣学院の魔剣使い』、『没落予定の貴族だけど、暇だったから魔法を極めてみた』、『暗殺者である俺のステータスが勇者よりも明らかに強いのだが』
BS11で放送
『うらみちお兄さん』、『大正オトメ御伽話』、『境界戦機』シリーズ、『神クズ☆アイドル』、『Do It Yourself!! -どぅー・いっと・ゆあせるふ-』、『クールドジ男子』、『アークナイツ』シリーズ、『アイドルマスター シンデレラガールズ U149』、『アイドルマスター シャイニーカラーズ』シリーズ、『ブルーアーカイブ The Animation』、『転生悪女の黒歴史』
BSよしもとで放送
『ガングリオン』
『境界戦機』シリーズ（BS11で放送）
フジテレビは1998年4月期から1999年10月期にかけて『頭文字D』などを放送し、2001年4・7月期の『パチスロ貴族 銀』をきっかけに深夜アニメの放送に本格参入した。しかし、2003年12月1日の地上デジタル放送のチャンネル開局に伴う放送設備のメンテナンスによる深夜帯の放送休止が頻発したことなどが災いし、番組編成の混乱が多発した。
2004年10月から半年間の休止を経て、2005年4月期には『ノイタミナ』枠を設立して再度参入。これ以降はフジテレビ自身も製作委員会の幹事役として積極的に関与するようになった。当初は深夜アニメ枠としては珍しく、少女漫画や女性向け漫画を原作とする作品を中心に放送した。2018年10月期からは、BSフジも製作に参加する『+Ultra』枠が、2023年10月期からはbilibiliと連携して中国製アニメの日本語吹替版を中心に放送する『B8station』枠が新設された。
2016年4月期から2018年10月期まで、『ノイタミナ』枠の番組はAmazon Prime Videoで有料の独占配信を実施した（本放送から1クール程度経過すると、FOD経由で他の配信サイトでも配信される）。『+Ultra』枠も同様に2021年1月期まではNetflixが独占配信を行なったが、第1話の放送後に全話分の先行配信を実施していた（一部例外あり）。
長らく『鬼滅の刃』専用枠を除き全国ネットの深夜アニメ枠を有していなかったが、2024年10月期から金曜23:40 - 翌0:10に全国ネットの深夜アニメ枠を新設。2025年4月改編で同枠を10分繰り上げ新『ノイタミナ』枠とするほか、『ONE PIECE』を『鬼滅の刃』専用枠であった日曜23:15 - 23:45にそれぞれ移動する。一方、『+Ultra』枠については北海道文化放送、テレビ西日本、BSフジがレギュラーネット局から外された。
関西テレビ
関西テレビ（カンテレ）は2003年10月・2004年1月期に自社製作深夜アニメ第1号として『ギルガメッシュ』を放送したが、「30分の深夜アニメとしてはテレビ東京系列以外で初めて全系列局での放送」を果たした作品である（後にBSフジでも放送）。
2014年10月・2015年1月期の『四月は君の嘘』から2017年4月期の『冴えない彼女の育てかた♭』までの『ノイタミナ』枠の番組や2025年4月期の『最強の王様、二度目の人生は何をする?』以降の『+Ultra』枠の番組、『暗殺教室』シリーズの製作委員会にフジテレビと共に参加。2017年4月期からは『ウマ娘 プリティーダービー』などの独立局系の番組の製作にも参加しており、不関与の番組も一定数放送している。
2010年4月期から2011年7月期まで、深夜アニメの番組枠名称として『アニメわ〜く!』を制定していた。
2026年1月期よりフジテレビ系列フルネットの『火アニバル!!』枠を火曜2300枠に新設。
その他の系列局
独立局系深夜アニメの続編をキー局系列深夜アニメとして放送
『鬼滅の刃』シリーズ（第2期以降）
第1期『鬼滅の刃』の本放送は一部FNS系列局でネットの他、関東圏ではTOKYO MX・群馬テレビ・とちぎテレビで放送。BS11もネット局となっており、これらの4局とFNS全局で第2期以降を引き続き放送。
『時光代理人 -LINK CLICK- II』
第1期は2023年10月期に『B8station』にて実質再放送された。
BSフジが製作参加し、地上波では他系列で放送
『バトルアスリーテス大運動会 ReSTART!』（テレビ朝日系列全国ネット枠『NUMAnimation』で放送、テレビ朝日と共同制作）、『ポーション頼みで生き延びます!』（ABCテレビ・テレビ朝日系列全国ネット枠『ANiMAZiNG!!!』で放送）、『精霊幻想記』シリーズ・『聖剣学院の魔剣使い』（関東圏はテレビ東京で放送）
1998年に放送された『LEGEND OF BASARA』を皮切りに独立局各局でも深夜アニメが多数放送されている。
2025年現在ではTOKYO MXが積極的に製作委員会に参加している他、その他の独立局も時折製作に参加するケースがある。TOKYO MX・サンテレビ・KBS京都のほか、毎日放送を中心とする在阪広域局やテレビ愛知でも番組数が多い。後述するように、BS11・BSフジ・BS日テレ・BS朝日などのBS放送局でも多数放送されているほか、AT-Xなどのアニメ専門チャンネルやABEMAなどのインターネット配信を活用すれば、地域を問わずほとんどの番組を視聴できる。