hotchpotch/wikipedia-multilingual-ir-pairs huggingface dataset:
X-ファイル 概要
シリーズ終盤は、モルダーがUFOに誘拐され、代わりにドゲット捜査官が登場。かつてのモルダーの立場（超常現象肯定派）をスカリーが、スカリーの立場（超常現象懐疑派）をドゲットが引き継いでいる。これらの展開により、内容の許容範囲が広がった上、ストーリーにめりはりがついたことで長期シリーズを作り上げた。
オープニングと本編の間に通常「THE TRUTH IS OUT THERE（真実はそこにある）」とのキャプションが入るが、いくつかのエピソードでは内容にまつわる重大なキーワードに変わることもあり、ファンの期待感を煽っている。
作中の時間経過は現実にあわせてあり、一話目では90年代前半だったが、ミニシリーズとして復活したシーズン10は2016年の設定になっており、99年から2000年に西暦が変わる話も描かれたことがある。
日本では1994年よりレンタルビデオがリリースされブームとなり、1995年よりテレビ朝日系列各局で第3シーズンまで放送された。日本ではアメリカほどの大ヒットとまではいかなかったが根強い人気を獲得。レギュラー放送終了後、第4シーズン以降のミソロジー系（いわゆる政府の陰謀や異星人・UFO絡み）エピソードのうち幾つかが「Xファイル -特別編-」として『日曜洋画劇場』の枠で放送された。また一部ローカル局では深夜枠などで、同シーズン以降をレギュラー放送していたところもある。
2008年までに202話と劇場版2作が制作され、2016年に新作テレビシリーズとしては13年ぶりとなるシーズン10が放送された。
X-ファイル あらすじ
FBIの捜査官フォックス・モルダーは組織内でもとびきりの「変人」として知られており、自他共に認めるオカルト信者かつ陰謀論者でありながら、数々の難事件を解決してきたキャリアを持つ。彼は事実上一人でX-ファイル課という閑職部門を担当していた。
そんなモルダーのもとにダナ・スカリーという組織内でもとびきりの才媛が送り込まれる。常識的かつ良識的な彼女は優秀な医師でもあり、｢自分の目で見た事象しか信じない」、「噂やヨタ話の類いは一顧だにしない」という現実主義者。スカリーはモルダーが幼少期に起きた「妹の失踪事件」という過去のトラウマを引き摺り続ける幼稚な男として軽蔑と懐疑の視線を向ける。
こうしてちぐはぐなコンビを組むことになった二人は事件捜査の過程で「人智を超えた」としか表現しがたい事象に数多く遭遇する。スカリーは自身のアイデンティティーを揺さぶられ、また随所で発揮するモルダーのプロファイリング能力と優れた洞察力に認識を改める。共に事件に遭遇することで二人は信頼関係を醸成していく。
そんなとき、二人の前に内部告発者（ディープ・スロート）が現れる。彼は米国政府が極秘裏に異星人を捕獲し、殺害した事実を伝えるが、ほどなくしてモルダーを庇い死亡する。彼の死に関わる謎の男キャンサーマンはやがて二人の宿敵として立ち塞がる。それは後に続く様々な出来事のほんの序章に過ぎなかった。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
フォックス・ウィリアム・モルダー（特別捜査官）：デイヴィッド・ドゥカヴニー（全シーズン）
1961年10月13日生まれ 身長183cm 住所はバージニア州アレクサンドリア Hegal Place 2630番地 42号室
オックスフォード大学で心理学を専攻し優秀な成績で卒業。突出したプロファイリングの才能を持つ優秀なFBI捜査官。X-ファイルの事件捜査については一見して事故や超常現象と無関係に見える事件についても、些細な矛盾点を鋭く突いて捜査を開始する。オカルトに関する知識と造詣が深く、UFOやUMAに限らず、民間信仰や魔術、都市伝説といった多岐に渡る広範な知識を持ち、『人智を超えた力の存在』、『国家的陰謀』という切り口から真相に迫る。バッジナンバーはJTT047101111（第2シーズン「幼虫」）。
1973年11月27日、妹のサマンサがエイリアンに誘拐される（第1シーズン「序章」、第2シーズン「リトル・グリーン・マン」ほか）。この一件はモルダーが凶悪犯罪課からX-FILE課に転属したきっかけにもなった（ちなみに、サマンサとは劇中において何度も再会しているように見えるが、それはあくまでも人工的に造られた彼女の単なるクローンである。本当の意味での再会は、第7シーズンで果たされることになる（第7シーズン、「存在と時間」Part.1、2））。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
優秀な捜査官でありながら、超常現象事件を追い続けているため周囲の人間から「変人（スプーキー）」と呼ばれている（第1シーズン「序章」、「スクィーズ」など）。ただし一時期、CSマンの言葉やシンジケートの策略によって、超常現象事件の正体は当局が責任逃れのために捏造した偽物だと思い込んでいたことがある。
第7シーズン最終回にUFOに拉致されて（第7シーズン「レクイエム」）以降、次シーズンはしばらく不在となり、生還したあともスカリー出産後にはさらに深まる危険から身を守るために姿を隠す（第8シーズン「誕生 Part.2」）。第9シーズンでスクリーンに登場するのは最終回のみである（第9シーズン「真実 Part.1」、「真実 Part.2」）。
ヒロインであるスカリーとの個人的関係性（恋愛関係）はシーズン中盤以降は仕事面では阿吽の呼吸で信頼しあう得難いパートナー。私生活面では思春期の少年（モルダー）とうるさ型の母親（スカリー）といった具合でなかなか進展しない。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
普段のファッションは、ジーパンにグレー（第2シーズン「リトル・グリーン・マン」、第4シーズン「ツングースカ Part.1」ほか）、白（第6シーズン「ミラグロ」、第9シーズン「真実Part2」ほか）、紺（第2シーズン「地底」）、黒（第1シーズン「落ちた天使」ほか）の無地のTシャツ（特にグレーが多い）、時に上に革のジャケットを着るという出で立ちである。またOMEGAの時計を着用している（第6シーズン「月曜の朝」、「スイート・ホーム」。複数所持しているか、OMEGAを好んで購入しているようで「月曜の朝」では日にちと曜日表示がある時計が登場するのに対して、「スイート・ホーム」では日にち表示だけの時計を着用している）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
ハンサムだがいわゆる「格好いい大人の男」的な魅力が希薄な人物であり、ひたむきなオタク少年がそのまま年を経たようなキャラクターが彼の魅力になっている。純粋で情に厚い性格だが少々おっちょこちょい。また、時には感情が高ぶることもあり、机、ゴミ箱等にあたったりもする（第5シーズン「吸血」など）。軽度の色覚異常（第3シーズン「電波」）であり、そのせいもあってか、劇中ネクタイの色のセンスの無さに関して、ローンガンメンほかから指摘を受けている。ヒマワリの種が大好物で、劇中よく口にしている（第1シーズン「スクィーズ」、第2シーズン「リトル・グリーン・マン」ほか）。また本人いわく寿司も好物とのこと（第2シーズン「宿主」）。苦手なものは火（第1シーズン「炎」）と昆虫（第3シーズン「害虫」）。好きなスポーツは野球（第6シーズン「アンナチュラル」ほか）、バスケットボール（第6シーズン「ファイト・ザ・フューチャー Part.1」、「スイートホーム」）。サマンサが誘拐された時にはバスケットボールチームのレプリカユニフォームを着ていた（第2シーズン「リトル・グリーン・マン」）。またX-FILE課の彼のデスクの後ろの棚にはバスケットボールが置いてある。PLAYBOYを毎号購入し、アダルトビデオも購入している。時にはストリップを覗くこともあるなど、性欲と女性への興味関心はある。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
アパートの部屋番号は42（第6シーズン「ドリームランド Part.2」ほか）。間取りは1LDKと思われる。熱帯魚を飼っており、モルダーが失踪もしくは行方不明の際にはスカリーなどが餌をやりに来ている（第2シーズン「リトル・グリーン・マン」、第8シーズン「サーチ・フォー・モルダー Part.1」）。自宅のPCのパスワードは「TRUST NO1」（第2シーズン「リトル・グリーン・マン」）。自宅での睡眠は、8割方がソファーの上である。寝室は、モリス・フレッチャーが掃除、模様替えをするまでほぼ物置同然であった（第6シーズン「ドリームランド Part.2」）が、それ以後、モルダーのアパートでは禁止されているウォーターベッドが置かれることとなる（しかし、後日破裂（第6シーズン「月曜の朝」））。
大学時代、のちにロンドン警視庁の捜査官を務めることとなるフィービー・グリーンという女性と交際。その後捜査の協力をすることとなる（第1シーズン「炎」）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
X-FILE課のオフィスは彼の人柄を表すかのように、天井には鉛筆が突き刺さっており（第5シーズン「ドール」など）、壁中に超常現象がらみの新聞記事や写真、X-FILE課のシンボルと言ってもよい、UFOの写真をバックに「I WANT TO BELIEVE」（私は信じたい）と印刷された特大ポスターなどが貼ってある。このポスターはスカリーがX-FILE課に赴任してきた当時から貼ってあるもので、X-FILE課が火災に遭った際に焼失してしまう（第5シーズン「ジ・エンド」）が、その後、捜査協力者から同じデザインのポスターを譲り受け、再びオフィスに貼られることとなる（第6シーズン「絶滅種」）。
神の存在や奇跡については懐疑的な姿勢をとり続けていたが（第3シーズン「黙示」など）、後年、昏睡状態の容疑者から情報を聞き出すために、幻覚剤を使ってトランス状態に入った際、劇的な神秘体験をする。当該事件の解決後、モルダーは天から鳴り響くラッパの音を耳にしており、神がモルダーに向かって発したメッセージであるかのようなほのめかしがある（第10シーズン「バビロン」）。
当作品と同じくFOXから放送されているザ・シンプソンズの第8シーズン第10話にスカリーと共にクロスオーバー出演したが、身分証の写真がなぜか水着一丁になっている。
ダナ・キャサリン・スカリー（特別捜査官）：ジリアン・アンダーソン（全シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
1964年2月23日生まれ 身長160cm
モルダーの相棒。バッジナンバーは2317-616。元々はモルダーの監視のためにシンジケートがX-FILE課に送り込んだ（第1シーズン「序章」）。しかし、モルダーの真実を探求する姿勢に共感し、彼を信頼して捜査を助けるようになる。医師免許を持つ科学者であり敬虔なクリスチャン。自身が超常現象に巻き込まれ当事者となってもなお、あくまで一科学者としての立場を崩さず、検死解剖や検査といった科学的に立証可能な証拠をもとに捜査を行う。捜査上、モルダーとの方針の違いは信頼関係とは別次元で多くの場合まず衝突する。『あらゆる事象は科学的に立証・説明可能で客観的な事実の積み重ねこそが捜査そのもの』というスタイル。二人が異なる二つの切り口から真相に迫ることがX-FILE課が機能することに繋がっている。
メリーランド州立大学で物理学の学位（卒業論文のタイトルは『アインシュタインの双子のパラドックス』）、スタンフォード大学で医学の博士号を取得。医学部在籍中にFBIに引き抜かれる。医師であり科学者でもあるため、当初は超常現象に否定的だったが、科学では説明できない数々の事件を体験していき、話が進む毎に徐々に超常現象を肯定するようになり、モルダーがいなくなった以降はX-FILE課を引き継ぐ形となった。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
非常に理知的で自他共に厳しい性格。洗練されたセンスで私室もモルダーとは対照的に無駄がなく整頓されている。また近隣住人からの信頼も厚い。（第7シーズン「旅」ほか）劇中、モルダーを男性として意識する場面は多少あり、モルダーの過去の女性関係に嫉妬めいた感情も見せることもあるものの、実態はモルダーの項にある通り。潜入捜査のため二人で偽装夫婦を演じたこともあり、ついに二人は肉体関係を持つに到る。（第7シーズン「宿縁」　後述）
その一方でさみしがり屋なのか、よく実家の母親に電話をする場面が見受けられる（第8シーズン「サーチ・フォー・モルダー」ほか）。また敬虔な カトリック教徒でもある（第2シーズン「昇天 Part.3」、第5シーズン「クリスマス・キャロル」ほか）ため、時折科学と信仰の間で苦悩することもある。
医師であることから、負傷者が出た際「I'm a medical doctor（私は医者よ）」と言って手当てする場面もある（第1シーズン「落ちた天使」ほか）。また、破水した妊婦がいたため赤ちゃんを取り上げることになるが、過去に赤ちゃんを取り上げたことは無い（第6シーズン「アグア・マラ」）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
父が『白鯨』の愛読者であったこともあり、父はスカリーを「スターバック」（第1シーズン「海の彼方に」、第2シーズン「昇天 Part.3」）、スカリーは父を「エイハブ」とそれぞれ呼び合っている。また、飼い犬クイークェグの名も『白鯨』に登場する銛打ち名人の名に由来している。複雑な事情を抱えたモルダー家とは対照的にスカリー家は家族関係が良好でごく普通の家族である。
幼少時代、父が海軍の軍人であったことから世界中を転々としていたことがあり、日本の名古屋にも訪れていたことが劇中の写真からわかる（第5シーズン『クリスマス・キャロル』）。
亡くなった飼い主に代わり、クイークェグと名付けた犬を飼うことになった（第3シーズン「休息」）が、後日捜査に一緒に連れて行った際、湖に棲むUMA（実際はただのワニだった）の餌食になってしまう（第3シーズン「ビッグ・ブルー」）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
スカリーのFBI入庁の経緯については妻子あり父親同然の年齢という恩師との不倫関係から逃れるためであり、捜査の過程で偶然にも病魔に冒された恩師と再会。自らの犯した不倫行為が家庭崩壊を招いたことを思い知らされる。近代医学での治療が困難だと確信したスカリーはモルダーの頼みで訪問した女性から東洋医学を紹介され恩師の危機を救う。その過程で仏教に触れ、「運命」や「天啓」を感じたスカリーは恩師との完全な別離と、モルダーと一線を越えた関係を持つに到る。（第7シーズン「宿縁」）
第8シーズンにおいて妊娠・出産するが、父親が誰であるのかは明確にされていない。
第8シーズン最終回以降は出産を機にX-FILE課を離れ、FBIアカデミーの教官としてドゲットとレイエスに協力する。
当作品と同じくFOXから放送されているザ・シンプソンズの第8シーズン第10話にモルダーと共にクロスオーバー出演し、ビールに酔ったホーマーから口説かれた。
ウォルター・スキナー（副長官）：ミッチ・ピレッジ（全シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
モルダーとスカリーの上司。禿げ頭と眼鏡が特徴で鍛え上げられた屈強な肉体を持つ。X-FILE課は彼の管理する部署のひとつであり、モルダーの捜査の行き過ぎ（越権捜査や現場攪乱）と表向き彼を止める目的で送り込まれたスカリーが影響されつつあるように見えることに頭を悩ませ、二人に釘を刺す。あくまで上司と部下の関係で、特に個人的な思い入れや嫌悪の情はなく常識の範疇で警告を発する。一方でモルダー、スカリーのいずれも優秀な捜査官であることは認めており、二人の捜査員としての立場を擁護する姿勢も見せる。基本的に超常現象否定派・懐疑派ではあるが、二人と衝突しつつ時にはX-FILE課に命を賭して協力することもある。そうした姿勢により、シーズンを経ていくことで「煙たい存在の上司」から「二人の心強い理解者」、更に「国家的陰謀に立ち向かう同志」へと徐々に変化していく。だが、そうしたスキナーの姿勢の変化が彼自身を危険へと追いやる。海兵隊出身で、18歳の時ベトナム戦争に従軍。戦闘中負傷し、臨死体験をする（第2シーズン「昇天 Part.3」）また、同戦争中、政府の極秘物資の輸送任務も行っている（第11シーズン「子猫」）。妻とは離婚しており、その後は一人暮らし（第3シーズン『化身』、第4シーズン「ツングースカ Part.1」、第4シーズン「ゼロ・サム」）。第6シーズンからはある事件をきっかけにクライチェックに命を握られることとなる（第6シーズン「S.R819」）。チーム解体後の第6シーズン「トライアングル」において、スカリーの無理な頼みに応じたところ、スカリーから（モルダーよりも先に）キスをされた。終盤、自身の目の前でモルダーがUFOに拉致されたことで超常現象肯定派へと変わり、スカリー達をバックアップする。かつてはシンジケートと近い存在であり、オフィスにCSマンが訪れたり連絡先を控えていた。またスカリーの命を救うために、CSマンに協力し隠蔽工作を行ったことがある（第4シーズン「ゼロ・サム」）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
アルビン・カーシュ（副長官）：ジェームズ・ピケンズ・Jr（第6、8〜9シーズン）
シリーズ中盤、X-FILE課を外されたモルダーとスカリーの新たな上司として登場する。スキナーとは違いX-FILE課には否定的。第8シーズンでは長官代理に出世し、不在となったCSマンのような役割を担う。作中一貫してモルダーと対立していたが、最終章では心境に変化が訪れて囚われていたモルダーを逃がすことに加担する（第9シーズン「真実 Part.2」）。
ジョン・ドゲット（特別捜査官）：ロバート・パトリック（第8〜9シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
第8シーズンからのX-FILE課担当。海兵隊出身で、レバノンでの従軍後シラキュース大学で公共政策を専攻し修士の学位を修める。元ニューヨーク市警。シーズン初回、行方不明となったモルダーの捜索のため赴任してくるが、カーシュにより捜索解決までX-FILE課担当を命ぜられる（第8シーズン「サーチ・フォー・モルダー Part.1」）。優秀な捜査官であり、モルダーとは違うベクトルで真実を追究する。超常現象の知識は皆無に等しく、その存在にも懐疑的。しかし自分自身が目にしたことや体験したことは信じる。アメリカ海兵隊に所属していたこともあり、細身ながら華麗なアクションで戦闘能力が高い。しかし、戦う相手のほとんどが人間以外のものであるため、遅れをとってしまうことも。過去に息子を誘拐され殺されたことがトラウマとなっていて、その事件は未解決である。
洞察力の鋭い他のキャラクターから、ルックスでも学歴でもモルダーにはかなわない事に劣等感を感じている、成功への執着が強い、などと内面を看破されたことがある。
レイエスと違って第9シーズンを最後に登場せず、どうなったのかは明かされていない。
演ずるパトリックはターミネーター2でT-1000を演じていることで有名であり、本作でもこれに基づいたパロディーが多々見られた。
モニカ・レイエス（特別捜査官）：アナベス・ギッシュ（第8〜10シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
第8シーズン中盤、旧知の仲であるドゲット捜査官の要請により、宗教犯罪の専門家としてX-FILE課への協力を始める。第9シーズンでは出産後アカデミー配属となったスカリーと交代する形でX-FILE課に赴任、ドゲットのパートナーとなる。ブラウン大学で民俗学・神話学を専攻し、宗教学の修士号を取得。幼い頃メキシコで育ったため、スペイン語が得意である。霊的な感性を持つ。以前ドゲットの息子が誘拐された事件を担当し、それがきっかけとなって知り合った。また、相棒のドゲットに好意を寄せている。ちなみにこの役名は、クリス・カーターの友人である某美術商から取られている。
第10シーズンの最終話で再登場。スモーキングマンと取引したことが明らかになった。
スコット・ブレヴィンス（課長）：チャールズ・シオフィ（第1、4、5シーズン）
所属セクションは不明だが、組織管理部・人事部長といった役回りであろうか。初回、フォックス・モルダーを監視するために、彼がスカリーにX-FILE課への配属を命令するシーンで物語は幕を開ける。実はFBIに派遣されたシンジケートの手先であり、実際にX-FILEを無き物にしようとする人物の一人である。彼はモルダーによってFBIのミーティングの場でシンジケートのスパイであることを告発され、直後に別の手先によって殺害される。
ブラッド・フォーマー（副長官）：ケイリー・エルウィス（第9シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
第9シーズン、X-FILE課と対抗するポジションとして登場してくる。若くして組織の出世コースに乗ったエリートであり、いささか嫌味なほどの優等生肌。しかしその一方で、以前の恋人レイエスに未だ未練があるため、彼女の所属するX-FILE課と上司カーシュとの間で心理的立ち位置の揺れが度々ある。レイエスとコンビを組むドゲットに対しては非常に高圧的だが、やがて彼の息子の事件解決に一躍かうことになる。
ペンドレル（特別捜査官）：ブレンダン・ベイサー（第3、4シーズン）
第3シーズン、FBIの科学犯罪ラボの職員として、スカリーの首元に埋められた金属製インプラントの分析を行った。
X-ファイルの捜査に対しても協力的で、謙虚な人間である。生物学の知識とコンピュータを駆使する能力には目を見張るものがある。エイリアンに誘拐され昏睡状態にまで陥ったことがあるスカリーを何かと気遣っている（ただし、ペンドレルはスカリーを誘拐したのがUFOであることを知らない）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
第4シーズン、ペンドレルがバーで飲んでいたところにスカリーがやって来た。偶然にも、その日はスカリーの誕生日であった。ペンドレルはスカリーにバースデードリンクを渡そうとしたが、そこにやって来たシンジケートの殺し屋に銃撃された。殺し屋はスカリーを狙っていたが的を外してしまったのである。応急処置をされる暇もなくペンドレルは亡くなった。スカリーはペンドレルの名前を聞いていなかったことを後悔した（第4シーズン「MAX Part.1」）。
アメリカ政府の裏に存在し、軍部の管理、秘密裏の実験や民衆への情報操作を行う影の政府である。
シガレット・スモーキング・マン（「煙草を吸う男」）：ウィリアム・B・デイヴィス（第1〜7、9シーズン、第10・11シーズン）
CSマンと略される。通称としてキャンサーマンまたは肺ガン男とも。本名はカール・ゲルハルト・ブッシュであるが、偽名の1つとしてC.G.Bスペンダーとも名乗る。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
シンジケートの一員で、X-ファイル全シーズンにおいてモルダーとスカリーにとって最大の脅威かつ最悪の敵にして最も謎めいた存在。彼らの目的のひとつとして、エイリアンの地球への入植に協力し、エイリアンと人類のハイブリッド種を生み出すことで人類の滅亡を回避しようとしている。中でもCSマンは事件の後処理や証拠隠滅、FBIとのコネクションを担当する。一捜査官の立場からグループの陰謀を暴こうと苦闘を続けるモルダーとは敵対するが、彼の能力そのものは非常に高く評価しており、原則として直接的な介入行動（暗殺や拉致）は避けている。また、モルダーは本人に対する圧力・暴力・恫喝には強いため、彼にとってトラウマである妹のサマンサや貴重なパートナーであるスカリーを餌やターゲットにすることで、間接的にモルダーから冷静な判断力を奪い苦しめる。やがては彼が出現してなにかをほのめかす行為そのものがモルダーから理性や正常な判断力を奪うようになる。
一時、シンジケート内部の対立により失脚するが（第5シーズン「帰還 Part.2」）、その能力を必要とされたため再びシンジケートに復帰（第5シーズン「ジ・エンド」）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
モルダーの援助に回るような動きを見せることもあり、彼の実の父親であることを示唆し、結局それが真実であることが判明する。ジェフリー・スペンダーは異母弟にあたる。遺伝子移植手術のため重い病気を患った（第7シーズン「第六の絶滅 Part.2」）後、第7シーズン最終話にてクライチェックとコバルービアスに殺害されたかに見えたが（第7シーズン「レクイエム」）、最終話で再びモルダーとスカリーの前に登場し、エイリアンによる入植の日を告げた後ミサイル攻撃を受けて死亡したかのように思われていた（第9シーズン「真実 Part.2」）。しかし、2016年に生存が判明した（第10シーズン「闘争 Part.1」）。
父親は共産主義者でソ連のNKVDのスパイだったために1917年のスパイ活動法で処刑され、母親は愛煙家で病で亡くしており、孤児院で育った。幼いころから本が好きで、作家になるのが夢だった。彼自身が内的葛藤に苦しむ一人の脆弱な人間であり、ケネディ大統領やキング牧師の暗殺などを実行した自身の半生を「ロール・ブラッドワース」という筆名で小説にし発表したことがあり、作家一本で生活しようとしたのか、辞表まで書いている。しかしながら、出版社の意向であらすじが書き換えられていたことに愕然とし、書いた辞表を破り捨てた（第4シーズン「紫煙」）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
その名の通りの愛煙家で、好きな銘柄は「Morley（架空の銘柄）」である。肺ガン男という通称は本名を明らかにせず、愛煙家の彼を揶揄した表現に過ぎず、疾患を患っているわけではない。演じるデイヴィスは既に禁煙しており、劇中で吸っているのは味のしないエチケット煙草である。
スターウォーズシリーズのダースベイダーに相当する人物であり、息子モルダーとの敵対と確執や愛する人をも犠牲にした彼自身の苦悩と葛藤が本編の隠れたテーマともなっている。
あるイベントで、ファンの1人が「シーズン9最終話でミサイルが直撃したにも拘わらず、シーズン10で生存していたのはおかしい」という疑問をカーターにぶつけた。そのコメントに対して、カーターは「ミサイルが顔に直撃したからといって、必ずしも死ぬわけではない」と応答した。
モルダーとスカリーがザ・シンプソンズにゲスト出演した際にも一瞬ではあるが出演している。
ウェル・マニキュアード・マン：ジョン・ネヴィル（第3〜5シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
シンジケートの一人。ビル・モルダーの葬儀の際に初めてスカリーの前に姿を現す（第3シーズン「祈り」）。年長格でCSマンを抑えることのできる数少ないイギリス紳士。シンジケートの過激なやり方に疑問を抱いているため、時にモルダーとスカリーに警告という形で情報を与える。劇場版第1作ではシンジケートからモルダーの殺害を指示されていたが、ワクチンをモルダーに渡して自分の孫を含む人類の未来をモルダーに託し自爆。
アレックス・クライチェック：ニコラス・リー（第2〜9シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
モルダー監視のためCSマンがFBIに潜入させ、モルダーとコンビを組ませた（第2シーズン「不眠」）。モルダーからは目障りな存在として煙たがられる。FBIから離脱（第2シーズン「昇天 Part.2」）後もシンジケートの命令で暗躍し、モルダーの父ビルを殺害、スカリーの姉メリッサ殺害にかかわり（第2シーズン「アナサジ」）、指示が途絶えた後も独自に活動している。ブラックオイルに感染した過去を持つ（第3シーズン「海底」）。一時期ロシアと組んでシンジケートに反抗していたこともある。ロシアの村人に左腕を切断されて以降は義手を装着している。モルダーやスキナーらには損得で動く男と思われているが、独自の信念を持っているようで、時折モルダーらに情報を提供したり協力を申し出るなどしている。終盤にスキナーに射殺されてしまうが（第8シーズン「誕生 Part.2」）、最終話では幻影でモルダーを手助けするシーンが見られる（第9シーズン「真実 Part.1」）。演じるニコラス・リーは第1シーズン第14話「性を曲げるもの」に別の役で出演している。
ジェフリー・スペンダー：クリス・オーウェンズ（第5〜6、9シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
シガレット・スモーキング・マンの息子で、モルダーの異母兄弟にあたる。母が熱烈なUFO信奉者であるためかUFOを含む超常現象に否定的。モルダーに対し敵愾心を持ち度々衝突する。モルダーがX-FILE課から外された際にX-FILE課担当になるが、行方不明となった母の捜索以外何も行わなかった。CSマンが母をエイリアンの実験台に提供したことを知りモルダーと和解（第6シーズン「ファイト・ザ・フューチャー Part.2」）。それは父・CSマンを裏切る行為であり、彼に銃撃されたのち母同様エイリアンの実験台にされた。
演じるクリス・オーウェンズは第4シーズン第7話「紫煙」で若き日のCSマン、第5シーズン第5話「プロメテウス」でムタト役で出演している。
ダイアナ・ファウリー：ミミ・ロジャース（第5〜7シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
モルダーの元恋人。ローン・ガンメンとの親交もある。CSマンによりシンジケートに引き込まれた。第6シーズン、スペンダー捜査官とともにX-FILE課を担当することとなる。第7シーズンにて意識不明のモルダーを救済する手がかりを与えた為に始末される（第7シーズン「第六の絶滅 Part.2」）。元々モルダーと共にX-FILE課を担当していたが、ヨーロッパに赴任する。ヨーロッパ赴任後はヨーロッパ各地とチュニジアを毎週のように往復していることをスカリーとローン・ガンメンの調査によって明らかになる（第6シーズン「ファイト・ザ・フューチャー Part.2」）
ディープ・スロート（「内部告発者」の意）：ジェリー・ハーディン（第1、3、4、7シーズン）
モルダーに怪事件の情報を提供する謎の人物。シンジケートの一人であり、CSマンの同僚である。UFO墜落によって捕獲されたエイリアンを殺害したことがある（第4シーズン『紫煙』）。第1シーズン最終話でモルダーを助けるために死亡（第1シーズン「三角フラスコ」）し、アーリントン墓地に埋葬された（第2シーズン「リトル・グリーン・マン」）。以降、様々な形で再登場する（第3シーズン「祈り」、第4シーズン「紫煙」、第7シーズン「第六の絶滅 Part.2」）。第4シーズン「紫煙」ではCSマンに「ロナルド」と呼ばれている。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
リチャード・マティソン上院議員：レイモンド・J・バリー（第2、第3、第6シーズン）
モルダーがXファイル課に配属された当初から、彼を支援してきた人物。
影ながらの支援ではあるが、彼の支援がなければ、モルダーがここまでX-FILE課を続ける事は出来なかった。
モルダーの数少ない、貴重な味方の一人である。
X：スティーヴン・ウィリアムズ（第2〜5、9シーズン）
ディープ・スロート亡き後の情報提供者。CSマンの手下。第2シーズン「宿主」でモルダーと電話で初めて接触する。高圧的な態度でしばしばモルダーとは対立するが、時には体を張ってモルダーを助けることもある（第2シーズン「昇天 Part.3」、第3シーズン「731」）。モルダーは自宅の窓ガラスにマスキングテープで「X」印を作り、Xを呼び出していた。CSマンにモルダーへの情報漏洩が発覚したため殺害される（第4シーズン「支配者」）。その際、マリタ・コバルービアスに繋がるダイイングメッセージ「SRSG（事務総長特別代表）」をモルダーのアパートの玄関前の床に自らの血で書き残す（第4シーズン「支配者」）。また、ローンガンメンとモルダーの出会いを描いたエピソードでは、シンジゲート側として証拠隠滅を取り仕切るために登場する（第5シーズン「アンユージュアル・サスペクツ」）。最終話では幻影としてモルダーを助ける。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
マリタ・コバルービアス（国際連合事務総長特別代行）：ローリー・ホールデン（第4〜7、9シーズン）
Xの死に際に残したメッセージを頼りに、モルダーが妹のクローンがいたカナダの農場の調査を依頼したことから彼と知り合い、以後情報を提供。金のためにシンジケートに協力していたが、クライチェックと共謀した（第5シーズン『ペイシェントX』）。罰としてマニキュアードマンにより対エイリアン用ワクチン開発の実験台にされた（第6シーズン『ファイト・ザ・フューチャー Part.2』ほか）。最終話にモルダーを弁護する証人として秘密裁判に出廷する。
ノエル・ローラー：アダム・ボールドウィン（第8〜9シーズン）
連邦政府の情報部員。ドゲットの海兵隊時代の仲間で、当たり障りのない情報を提供する。しかし現在のその正体はエイリアンの手先である。最終話でドゲットとモニカを追い詰めるも、彼らの唯一の弱点であるマグネタイトの力により地層に引きずり込まれ消滅した（第9シーズン「真実 Part.2」）。
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
モルダーの10年来の旧友達。自称、政府監視団体。メリーランド州に拠点を構える。彼らの家のドアは鍵がいくつも付けられ、防犯カメラも設置されている。政府の陰謀を暴くべく活動し、機関紙「ローン・ガンマン」を発行している（第1シーズン「E.B.E」ほか）。豊富な知識と優れた能力をもって捜査に協力する。シリーズ終盤ワシントンD.C.を守るために犠牲になり死亡。その亡骸はスキナー副長官の計らいでアーリントン国立墓地に葬られる（第9シーズン「英雄に捧ぐ」）。最終話では幻影としてモルダーに助言をおくる。漫画版のシーズン10において、3人の死は偽装されたもので、実は生存していたことが判明している。しかし、テレビ版シーズン10では生存説は採用されず、幻影として再びモルダーの前に現れた（第10シーズン「バビロン」）。その後、ラングリーのみ再登場。仮想空間に囚われた彼を救う為、モルダーとスカリーが奔走した（第11シーズン「死後」）。描写から考えると、やはり三人は死亡したものと思われる。
メルビン・フロヒキー：トム・ブレイドウッド（全シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
ローン・ガンメンの最年長者。写真撮影、分析担当。雑誌に投稿された小説からCSマンの過去を読み解くほどの分析能力を持つ。スカリーに好意を寄せ、スカリーが昏睡状態で病院に運ばれた際、タキシード姿で花束を持って訪れた（第2シーズン「昇天 Part.3」。吹き替え版では「フロハイキ」と呼ばれている。演じているトム・ブレイドウィッドは初期X-ファイルの助監督。ドアの鍵を開けるのは彼の場合が多い。
ジョン・フィッツジェラルド・バイヤース：ブルース・ハーウッド（全シーズン）
ローン・ガンメンのリーダー格。いつもスーツに身を包み清潔な姿でいる。元連邦職員であり、豊富な軍事知識を持つ。ローン・ガンマン結成のきっかけを作る（第5シーズン「アンユージュアル・サスペクツ」）。モルダーが病院から逃亡するために、モルダーに変装用としてスーツを貸したこともある（劇場版第1作）。ケネディ大統領暗殺の日に生まれたため、ファーストネーム、ミドルネームはケネディ大統領のそれに由来する（第6シーズン「荒野の3人」）。
リチャード・ラングリー：ディーン・ハグランド（全シーズン）
X-ファイル キャスト（準レギュラー含む）
ハッキング、情報収集担当。ハッキングによって政府の極秘情報を書き換えてしまうほどの高い能力を持つ。長髪でヘヴィメタルやパンク・ロックバンドのTシャツを好んで着ており、劇中でパンクバンド「ラモーンズ」のボーカルだった故ジョーイ・ラモーンの生き様を語っている。かなりのTシャツ好きか他の服が相当嫌いか不明だが、スカリーが幻覚で見たモルダーのお別れ会でも黒の喪服・ワイシャツ・黒の蝶ネクタイの絵がプリントされたTシャツを着ていたほどである(シーズン6「トリップ」)。
グレイエイリアン
一般的なイメージそのままのエイリアン。回想や想像の中で登場することが多く、その実態は依然として謎のままである。
カモフラージュエイリアン
墜落したUFOから脱出した光学迷彩をまとった正体不明の生物。敵に対して放射線を浴びせたり、後に出てくるUFOのカモフラージュに手法が似ていることから、やはりシリーズに一貫して登場するエイリアンの一種と思われる。
バウンティハンター：ブライアン・トンプソン
エイリアンが「いた」証拠を消すため、シリーズの要所で登場し暗躍している。正確にはエイリアンの遺伝子を組み込んだハイブリッド人間のクローンの一人で、中でも非常に強力な存在と思われる。顔を変幻自在にモーフィングすることができる。緑色の血を流し、そのガスは有毒なウイルスを含んでいる。首の裏の付け根を攻撃されない限り死ぬことはない。
X-ファイル 劇場版
1998年、『X-ファイル ザ・ムービー』（The X-Files）として映画化された。これはシリーズの一エピソードを大きな規模で描いたもので、時系列では第5シーズンと第6シーズンの間に位置する。テキサス州北部の田舎町で少年が洞窟に落ち、少年と彼を助けようとした消防士らがブラックオイルに感染してしまうところから話は始まる。
2001年9月23日にテレビ朝日系列において放送された際は、アメリカ同時多発テロ事件の影響により、政府関連ビル爆破シーンはカットされた。後にTBSが（『X-ファイル: 真実を求めて』上映に合わせて）放送した際は、爆破シーンもそのまま流している。
『X-ファイル』が5年間にもわたって好評を博したことを受けて、クリス・カーターはより大規模なスケールで『X-ファイル』のストーリーを展開させたいと願うようになった。カーターは『X-ファイル』を映画シリーズとして展開することを目指すようになったのである。カーターは「映画シリーズへ移行する際の問題は、5年間でどんなストーリーが展開されたかを知らない観客にも分かるような作品にする必要があるということだった」と回想している。
X-ファイル 劇場版
1996年12月、カーターとフランク・スポットニッツはハワイで脚本の執筆を進めていた。テレビドラマ版を製作するときと同様に、2人は情報カードにアイデアをまとめながら脚本を執筆していった。クリスマスシーズンが終わる頃には、脚本が仕上がっていた。カーターによると、2人は10日間で124ページの脚本を書き上げたのだという。
カーターは出来上がった脚本のうち90ページをFOXに提示し、それが高く評価されたため、無事に劇場版第1作製作の許可を得た。カーターはダニエル・サックハイムを劇場版第1作のプロデューサーに起用した。サックハイムはシーズン1とシーズン2の製作に携わっていた人物であった。彼にとっては、劇場版第1作が映画製作に関与した初めての作品となった。その後、カーターは監督にロブ・ボウマンを指名した。
X-ファイル 劇場版
製作スタッフは情報の流出を防ぐためにあらゆる手段を講じた。脚本の写真撮影を不可能にするために、出演者とスタッフに配られた脚本は赤い紙に印刷され、マスメディアには故意に偽情報が流された。また、企画の名前も『X-ファイル』を連想させないように、「Project Blackwood」と名付けられた。しかし、ファンの一部が Blackwoodという言葉に隠された意味を発見し、これが『X-ファイル』映画版の企画に違いないと騒ぎ出したため、劇場版第1作が製作されているという事実が明るみに出てしまった。後にスポットニッツは「Blackwoodという企画名は適当につけられたもので、そこに意味なんてなかった」と述べている。つまり、劇場版第1作の製作が事前に周知されてしまったのは全くの偶然だったのである。
X-ファイル 劇場版
製作の初期の段階においては、カーターとボウマンがシーズン5の製作に追われていたため、サックハイムが単独で製作の指揮を執ることとなった。そこで、サックハイムは『ジュラシック・パーク』のプロデューサーを務めたラタ・ライアンを製作総指揮に起用した。機密を厳守する姿勢はここでも貫かれ、テン・サーティーン・プロダクションズのスタッフが同伴しているときにのみ、ライアンは脚本を閲覧することができた。スタッフのほとんどは脚本を読むことすら許されなった。ライアンによると、主要撮影が始まるまで、企画の詳細を知っている人間は外出もままならなかったのだという。
放送終了から5年経った2007年4月、劇場版第2弾（The X-Files: I Want to Believe）に関する噂についてプロデューサーや原案・脚本などを兼任していたフランク・スポトニッツが事実であると認める発言をしたことが話題となる。
北米では2008年7月25日に封切られた。日本では同年11月7日からTOHOシネマズ六本木ヒルズ他、全国TOHOシネマズ系で公開された。日本版の副題は当初オリジナル版の副題をそのまま日本語読みした「アイ・ウォント・トゥ・ビリーブ」が設定されていたが、後にTSUTAYAサイトにて一般公募が行われ「真実を求めて」に決定した。
X-ファイル 劇場版
FBIの女性捜査官モニカ・バナンが失踪した。透視能力を持つという神父のジョーがFBIに協力を申し出たが、彼が雪原で発見したのは切断された男性の片腕だった。FBIの支局長ホイットニーは、ジョー神父の超能力を扱いかねて、退職していたモルダーとスカリーに協力を求めた。
ジョー神父は、少年を襲った罪で聖職をはく奪された男だった。スカリーは神父を嫌い、ペテン師だと決め付けたが、ジョー神父は凍った湖からバラバラ死体を発見した。死体は、行方不明のモニカとは違う複数の遺体の部分だった。
これは臓器の密売事件だと推理するモルダー。容疑者がロシア人であることを突き止めたモルダーは、単独で後を追った。だが、ロシア人の最終目的は健康な全身の『交換』だったのだ。秘密の医療施設でロシア人に捕らわれるモルダー。スカリーはジョー神父のビジョンを頼りにモルダーを追い、彼を救って事件を解決するのだった。
括弧内は日本語吹替声優。
ドラマ版の最終シーズンにおいて2012年12月22日が宇宙人入植の日であるとされたため、それまでに映画版第3作が製作されるのではないかといわれていたが、結局実現しなかった。また、FOXは『X-ファイル』のシーズン9以降の物語を映画という形で展開させようとしていたが、第2作の興行収入が思わしくなかったために頓挫してしまった。
2009年3月に映画版第2作のPRのために来日した際、クリエイターのクリス・カーターは「このシリーズは一生に一回のものだと僕自身理解している。今回の映画の最後を観てもらえればわかると思うが、僕の中では“サヨナラ”なんだ。けれどそれが絶対かどうかはわからないね」と続編製作に対してあいまいな態度を見せていたが、2013年8月には「20世紀FOXの許可さえ下りれば、第3作を作りたい」と述べた。ただし、2013年10月には「宇宙人入植の日がすぎてしまったということは無視できない」とも述べている。
また、デイヴィッド・ドゥカヴニーとジリアン・アンダーソンの両名も、2013年10月のインタビューにおいて映画版第3作に出演したいとの意向を明かしている。しかし、2014年1月のインタビューにおいて、アンダーソンは自身の多忙のために、第3作の製作があるとすれば、2016年以降になるだろうとの見解を示した。また、「人々が第3作への関心を持っているのかどうか分からない。」「2012年のエイリアン入植の日を描くにはもう遅いのではないかと感じている」と述べた。
X-ファイル コミック
映画版第2作の後のモルダーとスカリーを描いたコミック『The X-Files Season 10』が2013年6月から月間の漫画雑誌に掲載され始めた。映画第2作の後のモルダーとスカリーを描いた作品で、ストーリーはクリス・カーター（第5話まで）とジョー・ハリスが担当した。シーズン10はドラマで展開されたミソロジーを受け継ぐストーリーとして、「より狂気に満ちたアメリカ同時多発テロやウィキリークスによる一連の告発以降の現代社会におけるエイリアンの陰謀を描き出す」ことを目指したものとなっている。
「Believers」（第1話 - 第5話）
シナリオ：ジョー・ハリス、クリス・カーター 絵：マイケル・ウォルシュ
X-ファイル コミック
映画版第2作『真実を求めて』から5年後の世界。モルダーとスカリーはバージニア州スポットシルバニア郡で暮らしていた。2人はそれぞれアンソニー・ブレイク、ダナ・ブレイクと名乗っていた。そんなある日、FBI長官代理を務めるウォルター・スキナーが2人を訪ねてきた。2人はスキナーから何者かがFBIのデータファイルをハッキングしてX-ファイルに関する情報を得たことを知る。その後、スキナーは宿泊しているホテルで殺されかけ、スカリーは勤務先の病院で何者かに誘拐されてしまう。スカリーを襲った一団には、スカリーが診察していた幼い女の子、エミリー・ヴァン・デ・カンプがいた。エミリーは何かに憑依されたかのようだった。
ジョン・ドゲット捜査官は石油パイプラインで起きた原因不明の爆発の調査を開始した。
モルダーはスカリーを助けるべく、ローン・ガンメンの3人を訪ねる（この場面で、読者はシーズン9での3人の死がFBIによって偽装されたものであったことを知る。なお、偽装死以降の3人は政府の雑務をしていた。）一方、スカリーは部屋の中で意識を取り戻し、自身がカトリックの司祭風の男たちに取り囲まれていると気が付く。ところが、そこにやってきた不気味な助祭によって救出される。
X-ファイル コミック
モニカ・レイエス捜査官はモルダーとスカリーの息子、ウィリアムの養父母を訪ねるが、2人はウィリアムの部屋で死んでいた。レイエスは謎の存在がウィリアムの養父母に成りすましていたことに気が付く。その頃、スカリーはドゲットが調査していたパイプラインがマグネタイトを運搬していたことを知る。一方、モルダーは死んだはずのシガレット・スモーキング・マンと遭遇する。スモーキング・マンは奇矯な振る舞いをするのだった。スキナーがエミリーを調べたところ、エイリアン特有の酸性で緑色をした血液が検出された。
モルダーはマグネタイトが運搬されているというパイプラインを突き止め、スカリーがその周辺の森の中に捕らわれていると推測する。しかし、実際には、スカリーは助祭によって商店に連れ込まれていた。そこで、警察官がスカリーを発見した。しかし、その警察官は司祭風の男が姿を変えたものだった。司祭風の男が突然、モルダーに姿を変えたため、スカリーは事故を起こす。そして、森の中で本物のモルダーを撃ってしまった。モルダーを変身した助祭と勘違いしたのである。
スカリーに撃たれたモルダーは司祭風の男たちによって治療されたが、その一団にスカリーがいると思い込まされてしまった。その頃、スカリーは自らを騙した一団を殲滅しようとして辿り着いたイエローストーン国立公園で予想もしなかったものを目撃する。
「Hosts」（第6話 - 第7話）
X-ファイル コミック
シナリオ：ジョー・ハリス 絵：エレナ・カサグランデ、シルヴィア・カリファノ
FBIの地下にあったX-ファイル課のオフィスを整理する前に、モルダーとスカリーの2人は呼び出しを受ける。そこで、2人は新しい上司となるアンナ・モラレスFBI副長官と初めて会う。モラレスは再開されたX-ファイル課の業務を効率化を図ろうとしていた。モラレスはフルークマンと似た事件（シーズン2第2話「宿主」を参照）を解決するべく、スカリーをバージニア州クアンティコへ、モルダーをマサチューセッツ州マーサズ・ヴィニヤードへ派遣する。
モルダーはマーサズ・ヴィニヤードの下水道で巨大なフルークマンに襲撃されるも、スカリーが応急処置を施してくれたため、死なずに済んだ。ところが、モルダーとフルークマンの間に精神的なつながりが生じたことが判明する。
「Being for the Benefit of Mr. X」（第8話）
シナリオ：ジョー・ハリス 絵：マイケル・ウォルシュ
モルダーがかつて住んでいたアパートの住所から謎のボイスメールが送られてきたため、モルダーとスカリーは職場復帰のための訓練を中断することになった。ボイスメールから得た情報によって、2人は敵の正体と「純潔種支配（Purity Control）」計画の存在を突き止める。
なお、このエピソードではミスター・Xがなぜモルダーに協力しようとしたのかが明かされた。
X-ファイル コミック
「Chitter」（第9話）
シナリオ：ジョー・ハリス 絵：グレッグ・スコット
モルダーとスカリーは失踪事件の捜査をするためにペンシルベニア州ミラーズバーグへ向かう。その事件の容疑者と目されている人物は犠牲者の絶望を増幅させる「さえずりの神」のコントロール下にある可能性があった。
「More Musings of a Cigarette Smoking Man」（第10話）
シナリオ：ジョー・ハリス 絵：トニー・モイ、メントン3
シガレット・スモーキング・マンは記憶の一部を失ったことに気が付いていた。記憶を取り戻そうとする中で、自分が一度死んでいたことを知る。
「Pilgrims」（第11話 - 第15話）
シナリオ：ジョー・ハリス 絵：マシュー・ドー・スミス
モルダーとスカリー、モラレス副長官の3人はサウジアラビアの油田で起きたテロを捜査するために現地へ赴く。スカリーは現地の病院で治療中の負傷者に話を聞こうとしていた頃、モルダーは自爆テロの様子を収めたテレビの映像を見ていた。ローン・ガンメンの協力を得たモルダーは映像におかしな点があることに気が付く。そこに映っていた謎の人物について調査をしようとした矢先、モルダーは何者かに襲撃される。足を怪我したモルダーの前に現われたのは死んだはずの（シーズン8最終話「誕生」参照）アレックス・クライチェックだった。
X-ファイル コミック
襲撃者から逃げているうちに、モルダーとクライチェックの2人はカピトリウムがある通りに入り込んだ。そこで2人は空から強烈な光で照らされた。その瞬間、時間消失現象が起きた（UFOに遭遇した人間は時間を失う）。その頃、スカリーは負傷者の治療に当たっていたクラウス医師のオフィスに侵入していた。スカリーがオフィスで書類を調べていると、重傷を負った女性がスカリーに情報を提供した後、自殺してしまった。命からがらアメリカ大使館に戻ったモルダーは、スカリーに砂漠へ行って時間消失現象が起こるかどうか確かめないかと提案する。2人が砂漠へ行くと、確かに時間消失現象が起きた。ところが、時間と一緒にスカリーの姿も消えてしまうのだった。
X-ファイル コミック
アーリントン墓地で、ローン・ガンメンはスカリーを連れたクライチェックを目撃し仰天する。3人はクライチェックを自分たちの隠れ家に連れ込んで話を聞くが、クライチェック自身にもなぜ自分が蘇ったのかはわからなかった。スカリーはクライチェックの身の安全を確保するために、彼をスキナーの下へ連れていく。その頃、モルダーはサウジアラビアの砂漠を彷徨っていたが、そこで正体不明の女性と遭遇する。モルダーは女性が「ブラックオイル」に感染していると見抜き、彼女に銃を突きつけた。もみ合っているうちに、2人が乗るトラックは崖から転落してしまう。モルダーは何とか生還するが、「ブラックオイル」に感染してしまった。
「ブラックオイル」はモルダーを操ってアメリカにやって来た。スカリーはモルダーに銃を向ける。「ブラックオイル」は宇宙人が7200万年前になぜ地球にやって来たのかを語り始める。話を終えた「ブラックオイル」はシェルテムと名乗り、スカリーに自分を助けてくれないかと頼み込んだ。その頃、ニューヨークではシガレット・スモーキング・マンがスカリーとシェルテムが出会ったことを何者かに報告していた。
「Immaculate」（第16話 - 第17話）
シナリオ：ジョー・ハリス 絵：コリン・ロリマー
「Monica & John」（第18話）
シナリオ：ジョー・ハリス 絵：マシュー・ドー・スミス
「G-23」（第19話 - 第20話）
シナリオ:ジョー・ハリス 絵:トム・マンドレイク
「Elders」（第21話 - 第25話）
シナリオ:ジョー・スミス 絵:マシュー・ドー・スミス
『The X-Files Season 11』は2015年8月より連載が開始された。シナリオはジョー・ハリスが、絵はマシュー・ドー・スミスらが担当している。
「Cantus」（第1話）
シナリオ:ジョー・ハリス 絵:マシュー・ドー・スミス、メントン3
「Home Again」（第2話 - 第4話）
シナリオ:ジョー・ハリス 絵:マシュー・ドー・スミス、メントン3
追手から身を隠しながらも、モルダーはX-ファイルの捜査を続けていた。そんなある日、モルダーは偶然立ち寄った農場でピーコック一家に遭遇する（シーズン4第2話「ホーム」参照）。
「My Name is Gibson」（第5話）
シナリオ:ジョー・ハリス 絵:マシュー・ドー・スミス
徳間書店より少年キャプテンコミックススペシャルとして発行
XーFILES vol.1
「序章」作画：かきざき和美「氷」作画：板橋しゅうほう(1995/11/1 ISBN 978-4198301125)
XーFILES vol.2
「スクィーズ」作画：井上宣「海の彼方に」作画：坂田靖子(1996/2/1 ISBN 978-4198301156)
XーFILES vol.3
「炎」「影」作画：望月三起也(1996/4/1 ISBN 978-4198301347)
X-ファイル テレビ版シーズン10
もともとFOXはこのシーズンを「ミニシリーズ」と位置付けていたが、Amazon.comをはじめとする動画配信サービスび多くの批評家から「シーズン10」と表記しており。FOXも第1話放送後に「シーズン10」の表記を使用するようになった。
日本では『X-ファイル 2016』としてで2016年6月1日からデジタル配信がスタートし、7月2日にDVD及びブルーレイBOXが発売された。また、漫画『金田一少年の事件簿R』とのタイアップが行われた。
X-ファイル テレビ版シーズン11
シガレット・スモーキング・マンとスキナー副長官の過去を掘り下げるエピソードが存在すること、第3話がドッペルゲンガーを扱ったエピソードであることが明かされている。また、最終話がクリフハンガーで終了することも判明している。
一方、2018年1月1日にはスカリー役のジリアン・アンダーソンがシーズン11を最後にこの役を引退する意向であると報じられた。クリス・カーターは「アンダーソン抜きで『X-ファイル』を続行することは考えられません」と述べているが、シリーズを続行するためのアイデアがあることは認めている。また、デヴィッド・ドゥカヴニーも同様の反応を示している。
X-ファイル 日本語吹替
テレビ朝日放映版とソフト版で異なったキャスティングの吹き替えが製作された。ソフト版はVHSテープへのパッケージングを前提に2話ずつ収録されたためか、非レギュラー声優の2話連続出演例が多数ある。新シリーズのX-ファイル 2016及び2018のソフト版には、モルダーとスカリーのみ両バージョン（小杉・相沢版、風間・戸田版）の吹き替えが収録されている。
X-ファイル 放送局
シーズン4以降は一部のエピソード2～3話分を編集して『日曜洋画劇場』枠で放送された。
X-ファイル 小説版
『X-ファイル』の小説シリーズも出版されており、日本では角川文庫から刊行されている。
『X-ファイル - 未来と闘え』と『X-ファイル - 真実を求めて』は、映画作品のノベライズで、それ以外の作品はオリジナルエピソードとなっている。執筆はケヴィン・J・アンダーソンやベン・メズリックらの手によるものであり、いずれの作品も南山宏が翻訳を手がけている。
登場人物の設定はほとんどテレビドラマに準拠しており、いずれの主人公もフォックス・モルダーとダナ・スカリーの両名である。
X-ファイル スピンオフ
2001年にスピンオフ作品として、モルダー捜査官を助ける3人組が主人公のテレビドラマ『ローン・ガンメン（The Lone Gunmen）』が1シーズン13話のみ製作され、X-ファイルのシーズン8と並行する形で放送された。その最終回はX-ファイルシーズン9のエピソードにつながる。日本ではセルビデオが3話だけ発売されたのみ。CS放送のFOXチャンネルにて全13話がビデオシリーズの吹き替えキャストで数回放送された。
X-ファイル リリース
シーズン1
X-ファイル シーズン・ファースト DVDコレクターズ・ボックス - 2001年3月6日発売
X-ファイル シーズン・ファースト DVD-BOX - 2007年7月27日発売
X-ファイル シーズン1 <SEASONSコンパクト・ボックス> - 2010年5月29日発売
シーズン2
X-ファイル シーズン・セカンド DVDコレクターズ・ボックス - 2001年6月18日発売
X-ファイル シーズン・セカンド DVD-BOX - 2007年7月27日発売
X-ファイル シーズン2 <SEASONSコンパクト・ボックス> - 2010年11月5日発売
シーズン3
X-ファイル シーズン・サード DVDコレクターズ・ボックス - 2002年2月8日発売
X-ファイル シーズン・サード DVD-BOX - 2007年7月27日発売
X-ファイル シーズン3 <SEASONSコンパクト・ボックス> - 2010年11月5日発売
シーズン4
X-ファイル シーズン・フォー DVDコレクターズ・ボックス - 2002年6月19日発売
X-ファイル シーズン・フォー DVD-BOX - 2007年8月25日発売
X-ファイル シーズン4 <SEASONSコンパクト・ボックス> - 2010年11月5日発売
シーズン5