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代謝 異化
異化作用は、大きな分子を分解する一連の代謝過程である。これらの過程には、食物分子の分解と酸化が含まれる。異化反応の主な目的は、分子を構築する同化反応に必要なエネルギーと成分を供給することである。具体的な異化反応は生物によって異なり、生物はそのエネルギー、水素、および炭素（主要栄養群）の供給源によって下表のように分類することができる。有機栄養生物は、水素原子や電子の供給源として有機分子を利用し、無機栄養生物は無機基質を利用する。光栄養生物は太陽光を化学エネルギーに変換し、化学栄養生物は有機分子、水素、硫化水素、鉄イオン (en:英語版) などの還元型供与体分子から酸素、硝酸塩、硫酸塩に電子を移動させる酸化還元反応に依存する。動物では、この反応によって複雑な有機分子が分解され、二酸化炭素や水などの単純な分子になる。植物やシアノバクテリアなどの光合成生物も、同様の電子移動反応によって、太陽光から吸収したエネルギーを蓄積している。
代謝 異化
動物でもっとも多く見られる一連の異化反応は、大きく3つの段階に分けることができる。第一段階では、タンパク質、多糖、脂質などの大きな有機分子を細胞外で消化し、より小さな成分に分解する。次に、これらの小分子は細胞に取り込まれ、さらに小さな分子、典型的にはアセチル補酵素A（アセチルCoA）に変換され、若干のエネルギーを放出する。最終段階では、アセチルCoA上のアセチル基がクエン酸回路と電子伝達系で水と二酸化炭素に酸化され、補酵素のニコチンアミドアデニンジヌクレオチド（NAD+）をNADHに還元しながら、より多くのエネルギーを放出する。
細胞は高分子を直接処理することができないため、タンパク質や多糖などの高分子は、細胞の代謝に利用される前に、より小さな単位に分解されなければならない。高分子の消化には、さまざまな種類の酵素が使用される。これらの消化酵素には、タンパク質をアミノ酸に分解するプロテアーゼや、多糖を単糖に分解するグリコシドヒドラーゼ（糖質加水分解酵素）がある。
微生物は単純に消化酵素を周囲に分泌するのに対し、動物は胃や膵臓などの消化管や唾液腺にある特殊な細胞から消化酵素を分泌する。これらの細胞外酵素は、タンパク質をアミノ酸に、多糖を単糖に分解し、能動輸送タンパク質によって細胞内に輸送される。
代謝 異化
炭水化物は、炭水化物異化作用と呼ばれる過程を経て、より小さな単位に分解される。炭水化物は通常、単糖に消化された後、細胞内に取り込まれる。細胞内では、主に解糖という分解経路で分解され、グルコースやフルクトースなどの糖類がピルビン酸に変換され、若干のATPが生産される。ピルビン酸はその後、いくつかの代謝経路で中間体として利用されるが、もっとも一般的には好気性（酸素を伴う）解糖によってアセチルCoAに変換され、クエン酸回路に入る。クエン酸回路でも若干のATPが作られるが、主な生成物はアセチルCoAが酸化されるときにNAD+から作られるNADHで、老廃物として二酸化炭素が放出される。嫌気性条件下では、代わりに解糖によって乳酸が生成し、乳酸デヒドロゲナーゼ（乳酸脱水素酵素）がNADHをNAD+に再酸化し、解糖で再利用される。グルコース分解のもう一つの代替経路はペントースリン酸経路で、補酵素NADPHを還元して、核酸の糖成分であるリボースなどのペントース糖を生成する。
代謝 異化
脂肪は、加水分解により遊離脂肪酸とグリセロールに異化される。グリセロールは解糖に入り、脂肪酸はβ酸化によって分解されてアセチルCoAを生成し、クエン酸回路に送られる。脂肪酸は炭水化物よりも酸化されたときに多くのエネルギーを放出する。一部の細菌では、β酸化と同様の過程でステロイドを分解し、この分解過程でアセチルCoA、プロピオニルCoA、およびピルビン酸が大量に放出され、これらはすべて細胞内でエネルギーとして利用できる。結核菌（Mycobacterium tuberculosis）は、脂質であるコレステロールを唯一の炭素源として増殖することができ、コレステロールの利用経路に関わる遺伝子は、結核菌の感染ライフサイクルのさまざまな段階において重要であることが分かっている。
アミノ酸は、タンパク質やその他の生体分子の合成に使われたり、エネルギーを作り出すために酸化されて尿素と二酸化炭素になる。酸化経路では、まずアミノ基転移酵素（トランスアミナーゼ）によりアミノ基が除去される。その後、アミノ基は尿素回路に送られ、脱アミノ化された炭素骨格がケト酸の形で残される。これらのケト酸の中には、グルタミン酸の脱アミノ化によって生成するα-ケトグルタル酸のように、クエン酸回路の中間体となるものもある。さらに、糖原性アミノ酸は、糖新生によってグルコースに変換されることもある（後述）。
代謝 エネルギー転換
酸化的リン酸化は、クエン酸回路に見られるように、有機分子から奪った電子を酸素に移動し、放出されたエネルギーでATPを作る。真核生物では、ミトコンドリアの膜にある電子伝達系と呼ばれる一連のタンパク質がこれを行っている。一方、原核生物では、これらのタンパク質は細胞の内膜に存在する。これらのタンパク質は、NADHなどの還元分子からのエネルギーを使って、膜を超えてプロトン（陽子）を送り出す。
プロトンを送り出すことによって、ミトコンドリア膜を隔てたプロトン濃度差が生じ、電気化学的な勾配が生じる。この勾配が動力となって、プロトンはATP合成酵素と呼ばれる酵素の基部を経由してミトコンドリア内に戻される。プロトンの流入によってATP合成酵素の軸サブユニットが回転し、酵素ドメイン活性部位の形が変化し、これによってアデノシン二リン酸がリン酸化され、ATPへ変換される。
代謝 エネルギー転換
化学無機栄養とは、原核生物に見られる代謝の一種で、無機化合物の酸化によってエネルギーを得るものである。これらの生物は、水素、還元硫黄化合物（硫化物、硫化水素、チオ硫酸など）、二価鉄イオン（Fe(II)）、またはアンモニアを還元力源として利用し、これらの化合物を酸化することでエネルギーを得ている。これらの微生物過程は、酢酸生成、硝化、脱窒などの地球規模での生物地球化学的循環において重要な役割を担い、土壌の肥沃度を維持するのに不可欠である。
植物、シアノバクテリア、紅色細菌、緑色硫黄細菌、および一部の原生生物では、太陽光からエネルギーを取り込むことができる。この過程は、後述する光合成の一部として、二酸化炭素を有機化合物に変換することにしばしば関連する。しかし、原核生物では、エネルギー捕捉系と炭素固定系を別々に働かせることもある。紅色細菌や緑色硫黄細菌は、太陽光をエネルギー源として利用するのと同時に、炭素固定と有機化合物の発酵を交互に行うことができる。
代謝 エネルギー転換
さまざまな生物において、太陽エネルギーの捕獲は、プロトン濃度勾配という形でエネルギーを蓄積するという点で、上述の酸化的リン酸化と類似している。このプロトン起電力がATP合成の動力源となる。この電子伝達系を駆動するのに必要な電子は、光合成反応中心 (en:英語版) と呼ばれる光捕集タンパク質から供給される。この反応中心は、光合成色素 (en:英語版) の性質によって2種類に分類され、光合成細菌の多くは1種類しか持たないが、植物やシアノバクテリアは2種類とも持っている。
植物、藻類、シアノバクテリアなどの光合成生物では、光化学系II (en:英語版) が光エネルギーを利用して水から電子を奪って、老廃物として酸素を放出する。この電子はシトクロムb6f複合体に渡され、そのエネルギーを使って葉緑体内のチラコイド膜を超えてプロトンを送り出す。このプロトンが、再び膜を通過して戻ってくることで、先と同様にATP合成酵素を駆動する。電子は光化学系Iを通り、補酵素NADP+を還元するために使われる。この補酵素は、後述するカルビン回路に入るか、さらなるATP生成のために再利用される。
代謝 同化
同化作用とは、異化作用によって放出されたエネルギーを使って、複雑な分子を合成する一連の建設的な代謝過程のことである。一般に、細胞構造を構成する複雑な分子は、より小さくて単純な前駆体が組み合わさって、段階的に構築される。同化作用は3つの基本的な段階からなる。第一に、アミノ酸、単糖、イソプレノイド、ヌクレオチドなどの前駆体の生成、第二に、これらの前駆体をATPからのエネルギーを使って反応型に活性化、第三に、これらの前駆体をタンパク質、多糖、脂質、核酸などの複合分子へ組み立てることである。
生物の同化作用は、細胞内で作られる分子の供給源によって分類される。植物のような独立栄養生物は、二酸化炭素や水という単純な分子から多糖やタンパク質など、複雑な有機分子を細胞内で作ることができる。一方、従属栄養生物は、これらの複雑な分子を作るために、単糖やアミノ酸など、より複雑な化合物の供給源を必要とする。さらに、生物は最終的なエネルギー源によって分類される。光独立栄養生物と光従属栄養生物は光からエネルギーを得ており、化学独立栄養生物と化学従属栄養生物は酸化反応からエネルギーを得ている。
代謝 同化
光合成は、太陽光と二酸化炭素（CO2）から炭水化物を合成することである。植物、シアノバクテリア、藻類などでは、酸素光合成によって水を分解し、老廃物として酸素を放出する。このとき、前述の光合成反応中心で作られたATPとNADPHのエネルギーを利用して、CO2を3-ホスホグリセリン酸に変換し、さらにグルコースに変換することができる。この炭素固定反応は、カルビン-ベンソン回路の一部として、RuBisCOという酵素によって行われる。植物では3種類で光合成が行われており、C3型光合成、C4型光合成、CAM型光合成である。これらは、CO2がカルビン回路に送られる経路が異なり、C3型はCO2を直接固定するのに対し、C4型とCAM型光合成はまずCO2を他の化合物に取り込むことで、強い日射しや乾燥した環境に適応する。
光合成原核生物では、より多様な炭素固定化の機構を持っている。これらの生物は、カルビン-ベンソン回路、逆クエン酸回路、またはアセチルCoAのカルボキシル化により炭素を固定できる。また、原核生物の化学合成独立栄養生物では、カルビン-ベンソン回路によってCO2を固定しつつ、無機化合物からのエネルギーで反応を駆動するものもある。
代謝 同化
炭水化物の同化作用では、単純な有機酸をグルコースなどの単糖分子に変換し、さらにデンプンなどの多糖を作る場合がある。ピルビン酸、乳酸、グリセロール、3-ホスホグリセリン酸、アミノ酸などの化合物からグルコースを生成することを糖新生という。糖新生は、ピルビン酸が一連の中間体を経てグルコース-6-リン酸に変換するが、その多くは解糖と共通である。しかし、この経路は単に解糖を逆にしたものではなく、いくつかの段階は非解糖系の酵素によって触媒されるという点に注意を要する。このことは、グルコースの生成と分解を別々に調節することができ、両方の経路が同時に進行する無益回路を防ぐことができる。
代謝 同化
脂肪は一般的なエネルギー貯蔵形態であるが、ヒトなどの脊椎動物はアセチルCoAをピルビン酸に変換する酵素機構を持たないため、貯蔵された脂肪酸を糖新生によってグルコースに変換することができない（植物には必要な酵素機構があるが、動物にはない）。そのため、脊椎動物は長期間の飢餓状態に陥ると、脂肪酸をエネルギー源として代謝できない脳などの組織で、グルコースの代わりに脂肪酸からケトン体を生成してエネルギーを供給しなければならない。一方、植物や細菌など他の生物では、グリオキシル酸回路という代謝経路を持ち、クエン酸回路の脱炭酸段階を迂回してアセチルCoAをオキサロ酢酸に変換し、そこからグルコースを生成することで解決している。グルコースは、脂肪と異なり、通常は血液中のグルコース濃度を維持していた糖新生を通じて組織内で利用可能なエネルギー源として、ほとんどの組織に貯蔵される。
代謝 同化
多糖や糖鎖（グリカンともいう）は、グリコシルトランスフェラーゼ（糖転移酵素）という酵素によって、ウリジン二リン酸グルコース（UDP-Glc）のような反応性の糖-リン酸供与体から単糖が逐次、成長する多糖上の糖受容体性のヒドロキシ基に付加されることによって形成される。基質の環上のヒドロキシ基はいずれも糖受容体となりうるため、生成する多糖は直鎖でも分岐した構造でもよい。生成した多糖は、それ自体が構造的あるいは代謝的な機能を果たすこともあれば、オリゴサッカリルトランスフェラーゼ（オリゴ糖転移酵素）と呼ばれる酵素によって、脂質やタンパク質に転位されることもある。
脂肪酸は、脂肪酸合成酵素によるアセチルCoA単位の重合と、その後に還元することで作られる。脂肪酸のアシル鎖は、アシル基の付加、アルコールへの還元、アルケン基への脱水、さらにアルカン基への再還元という一連の反応によって伸長される。脂肪酸生合成の酵素は大きく2種類に分けられ、動物や菌類では、これらの脂肪酸合成酵素の反応のすべてを単一の多機能なI型タンパク質が担っているのに対し、植物のプラスチド（色素体）や細菌では、経路の各段階を別々のII型酵素が担っている。
代謝 同化
テルペンやイソプレノイドは、カロテノイドを含む脂質の大きな一群であり、植物由来の天然物の中で最大の分類を形成している。これらの化合物は、反応性前駆体であるイソペンテニルピロリン酸やジメチルアリルピロリン酸から供与されたイソプレン単位の結合と修飾によって作られる。これらの前駆体は、さまざまな方法で作られる。動物や古細菌では、アセチルCoAからメバロン酸経路で作られ、植物や細菌では、ピルビン酸とグリセルアルデヒド3-リン酸を基質とする非メバロン酸経路で作られる。これらの活性化イソプレン供与体を用いる重要な反応のひとつにステロール生合成がある。ここでは、イソプレン単位が結合してスクアレンとなり、さらに折り畳まれて一連の環を形成してラノステロールとなる（図を参照）。ラノステロールはその後、コレステロールやエルゴステロールなど、他のステロールに変換される。
生物によって、20種類のアミノ酸を合成する能力において違いがある。ほとんどの細菌や植物では20種類すべてを合成することができるが、哺乳類は11種類の非必須アミノ酸しか合成できないため、残る9種類の必須アミノ酸は食物から摂取しなければならない。細菌の肺炎マイコプラズマ（Mycoplasma pneumoniae）のような単純な寄生生物は、アミノ酸合成ができないため、宿主から直接アミノ酸を摂取している。すべてのアミノ酸は、解糖、クエン酸回路、またはペントースリン酸経路の中間体から合成される。窒素はグルタミン酸とグルタミンから供給される。非必須アミノ酸の合成は、適切なα-ケト酸の形成に依存しており、そのα-ケト酸がアミノ基転移によってアミノ酸を形成する。
タンパク質は、アミノ酸がペプチド結合で直鎖状に結合してできている。さまざまなタンパク質は、固有のアミノ酸残基の並びがあり、その一次構造を決定している。アルファベットを組み合わせて無数の単語ができるのと同様に、アミノ酸をさまざまな配列で組み合わせると、膨大な数のタンパク質ができあがる。タンパク質の合成は、まずアミノ酸をエステル結合で転移RNA（トランスファーRNA）分子に結合させ、活性化することから始まる。これは、アミノアシルtRNA合成酵素によるATP依存的な反応によって行われる。こうしてできたアミノアシルtRNAは、リボソーム酵素の基質となり、リボソームは、伝令RNA（メッセンジャーRNA）の配列情報を利用して、伸長するタンパク質鎖にアミノ酸を順次結合する。
ヌクレオチドは、アミノ酸、二酸化炭素、そしてギ酸から合成されるが、その合成経路は大量の代謝エネルギーを必要とする。そのため、ほとんどの生物は、合成前のヌクレオチドを回収する効率的なシステムを備えている。プリン塩基は、リボースに塩基が結合したヌクレオシドとして合成される。アデニンとグアニンはともに、アミノ酸のグリシン、グルタミン、アスパラギン酸の原子と、補酵素のテトラヒドロ葉酸から転移したギ酸を用いて合成される前駆体ヌクレオシドのイノシン一リン酸から作られる。一方、ピリミジン塩基は、グルタミンとアスパラギン酸から作られるオロト酸から合成される。
代謝 生体異物と酸化還元代謝
すべての生物は、食物として利用できない化合物や、代謝機能を持たないために細胞内に蓄積されると有害となる化合物に常にさらされている。これらの有害となりうる化合物は、生体異物（ゼノバイオティクス）と呼ばれる。合成薬、自然毒、抗生物質などの生体異物は、一連の生体異物代謝酵素によって解毒される。ヒトでは、シトクロムP450オキシダーゼ（酸化酵素）、UDP-グルクロン酸転移酵素、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ（転移酵素）がこれに該当する。この酵素のシステムは3段階で作用し、まず生体異物を酸化し（第1段階）、次に分子上に水溶性基を結合させる（第2段階）。最後に、水溶性に変化した生体異物は細胞外に排出され、多細胞生物ではさらに代謝されてから排出されることもある（第3段階）。生態系では、これらの反応は、汚染物質の微生物による生分解や、汚染土壌や流出油のバイオレメディエーション（生物学的環境修復）において特に重要である。これらの微生物反応の多くは多細胞生物と共通であるが、微生物の種類は驚くほど多様であるため、多細胞生物よりもはるかに幅広い種類の生体異物に対処し、有機塩素化合物などの残留性有機汚染物質も分解することが可能である。
代謝 生体異物と酸化還元代謝
好気性生物に密接に関連する問題として、酸化ストレスが知られている。これは、酸化的リン酸化やタンパク質フォールディング時のジスルフィド結合形成などの過程で、過酸化水素などの活性酸素種が作られることで起こる。これらの有害な酸化物質は、グルタチオンなどの抗酸化代謝物や、カタラーゼ、ペルオキシダーゼなどの酵素によって除去される。
代謝 生命系の熱力学
熱力学の法則 (en:英語版) は生物にも適用され、熱と仕事の移動に関する原則に従わなければならない。熱力学の第二法則は、孤立した系 (en:英語版) ではエントロピー（無秩序）が減少することはない、というものである。生物は驚くほど複雑なので、この法則と矛盾しているように思えるが、すべての生物は周囲と物質やエネルギーを交換する開放系であり、それゆえ生存が可能である。生命系は平衡状態にあるのではなく、むしろ環境のエントロピーを増大させることによって高い複雑性を維持する散逸系である。細胞の代謝では、自然発生的な異化作用と非自然発生的な同化作用の結合によって、これを実現している。熱力学 (en:英語版) の用語で言えば、代謝は無秩序を作り出すことによって秩序を維持しているのである。
代謝 調節と制御
ほとんどの生物の環境は常に変化しているため、代謝反応を細かく制御して、細胞内を一定の状態に維持する必要がある。この状態を恒常性（ホメオスタシス）という。また、代謝調節によって、生物がシグナルに応答し、環境と積極的に相互作用することを可能にする。代謝経路がどのように制御されているかを理解するためには、密接に関連する2つの概念が重要である。第一に、経路内における酵素の調節（regulation）とは、シグナルに応じて酵素の活性をいかに増減させるかということである。第二に、酵素による制御（control）とは、こうした酵素活性の変化が経路全体の速度（経路を通る流束（フラックス））に及ぼす影響のことである。たとえば、ある酵素が大きな活性変化を示しても（すなわち、高度に調節されている）、その活性の変化が代謝経路のフラックスにほとんど影響を及ぼさないのであれば、この酵素は経路の制御には関与していないことになる。
代謝 調節と制御
代謝調節は複数のレベルで行われる。内因性調節では、代謝経路は基質や生成物の量の変化に応じて自己調節する。たとえば、ある生成物の量が減少すると、それを補うために経路を通るフラックスを増加させることがある。この種の調節には、経路内の複数の酵素の活性を調節するアロステリック調節がよく行われる。一方、外因性調節は、多細胞生物において、ある細胞が別の細胞からのシグナルに応じて代謝を変化させるときに起こる。これらのシグナルは通常、ホルモンや成長因子などの水溶性メッセンジャーの形で、細胞表面にある特定の受容体によって検出される。これらのシグナルは、しばしばタンパク質のリン酸化が関与するセカンドメッセンジャー系によって細胞内に伝達される。
外因性制御の例として、インスリンというホルモンによるグルコース代謝の調節がよく知られている。インスリンは、血糖値の上昇に反応して分泌される。インスリンが細胞上のインスリン受容体に結合すると、プロテインキナーゼのカスケードが活性化され、細胞にグルコースを吸収させ、脂肪酸やグリコーゲンといった貯蔵分子に変換させる。グリコーゲンの代謝は、グリコーゲンを分解する酵素であるグリコーゲンホスホリラーゼと、グリコーゲンを合成する酵素であるグリコーゲンシンターゼの活性によって制御されている。これらの酵素は相互に調節され、リン酸化によってシンターゼは抑制されるが、ホスホリラーゼは活性化される。インスリンは、プロテインホスファターゼ（タンパク質脱リン酸化酵素）を活性化し、これらの酵素のリン酸化を低下させることにより、グリコーゲン合成を促進する。
代謝 進化
解糖やクエン酸回路といった、上述の代謝の中心的経路は、生物の3つのドメイン (en:英語版) すべてに存在し、最後の普遍的共通祖先にも存在した。この普遍的共通祖先は原核生物であり、おそらくアミノ酸、ヌクレオチド、炭水化物、および脂質の多様な代謝を行うメタン生成菌であったと考えられる。このような古代の経路がその後の進化においても保持されたのは、解糖系やクエン酸回路などの経路が、最小限の段階で効率よく最終生成物を生成し、これらの反応が特定の代謝問題に対する最適解であった結果であると考えられる。酵素に基づく代謝の最初の経路はプリンヌクレオチド代謝の一部であり、それ以前の代謝経路は古代のRNAワールドとつながっていた可能性がある。
代謝 進化
新しい代謝経路が進化する機構を説明するために、さまざまなモデルが提案されている。たとえば、小規模な祖先経路に新しい酵素が順次追加される方法、経路全体が複製しその後分岐する方法、そして既存の酵素が新しい反応経路に組み込まれる方法である。これらの機構の相対的な重要性は不明であるが、ゲノム研究の結果、経路に含まれる酵素は共通の祖先を持つ可能性が高く、多くの経路が経路中の既存の段階から新たな機能を作り出し、段階的に進化してきたことが示唆されている。第二のモデルとしては、代謝ネットワークにおけるタンパク質構造の進化を追跡する研究に基づくもので、酵素は広範囲に動員され、さまざまな代謝経路において同様の機能を果たすために酵素が借用されたことが示唆されている（MANETデータベースで明らか）。このような動員過程は、進化的な酵素の集成を形成する。第三の可能性は、代謝の一部が「基本単位（モジュール）」として存在し、異なる経路で再利用され、さまざまな分子に対して同様の機能を果たすというものである。
新しい代謝経路の進化だけでなく、進化によって特定の代謝機能が失われることもある。たとえば、ある種の寄生生物では、生存に必須でない代謝過程が失われ、代わりに宿主からアミノ酸、ヌクレオチド、炭水化物などを搾取することがある。同様の代謝機能の低下は、内部共生生物にも見られる。
代謝 研究と操作
古典的に、代謝は、単一の代謝経路に焦点を当てた還元主義的なアプローチで研究される。とくに重要な方法は、生体全体、組織、細胞単体などさまざまなレベルでの放射性トレーサーの利用であり、放射性標識された中間体や生成物を同定することで、前駆体から最終産物までの経路を明確にする。そして、これらの化学反応を触媒する酵素を精製し、その動態や阻害剤に対する反応を研究することができる。もう一つの方法は、細胞や組織に含まれる小分子を同定することで、これらの分子の完全な集合をメタボロームと呼ぶ。これらの方法では、単純な代謝経路の構造と機能についての洞察を与えてくれるが、細胞全体の代謝のような、より複雑な系を研究するには十分ではない。
代謝 研究と操作
細胞内の代謝ネットワークは複雑で、数千種類の酵素が存在することもある。右上の図は、わずか43種類のタンパク質と40種類の代謝産物の相互関係を示したものである（ゲノム配列に基づき、最大26,500個の遺伝子を含む一覧が得られる）。しかし、現在ではゲノムデータを用いて生化学反応の完全なネットワークを再構築し、その挙動を説明し予測できる、より包括的な数理モデルを開発することができるようになった。これらのモデルは、経路や代謝産物データなどの古典的な手法によるデータと、プロテオミクスやDNAマイクロアレイ研究による遺伝子発現データを組み合わせた場合に、特に有効である。これらの技術により、ヒトの代謝モデルが作成され、今後の創薬や生化学研究の指針になると期待される。さらに、これらのモデルは、ヒトの病気を共通のタンパク質や代謝産物を持つグループに分類するためのネットワーク解析に利用されている。
細菌の代謝ネットワークは、蝶ネクタイ型の組織構造の顕著な例を示し、幅広い種類の栄養素を取り込み、少数の中間的な共通通貨分子を用いて、多様な生成物や複雑な高分子を作り出すことができる構造となっている。
代謝ネットワークに関する知識は、代謝工学の分野にも応用されている。この分野では、酵母、植物、細菌などの生物を、遺伝子工学的に改変して、バイオテクノロジーにおける有用性を高め、抗生物質などの医薬品や1,3-プロパンジオール、シキミ酸などの工業化学物質の生産を支援する。これらの遺伝子組み換えは、通常、生産エネルギー消費の削減、製品収率の向上、廃棄物の発生を押さえることを目的として行われる。
代謝 歴史
「metabolism（代謝）」という言葉は、フランス語の「métabolisme」または古代ギリシャ語の「μεταβολή」（metabolē）に由来し、「変化」を意味している。これは、「μεταβάλή」（metaballein）から派生したもので、「変化する」という意味である。
アリストテレスの『動物部分論（The Parts of Animals）』には、オープンフローモデルを構築するのに十分なほど、彼の代謝に関する考え方の詳細が書かれている。アリストテレスは、代謝の過程で食物からの物質が各段階に変換し、熱が古典的な火の要素として放出され、残留物が尿、胆汁、糞便として排泄されると考えた。
イブン・アン＝ナフィースは、西暦1260年の著作『Theologus Autodidactus』（預言者の伝記に関するカミルの論考）で、代謝について、『身体とその部分は共に、分解と栄養の絶えない状態にあり、それらは常に永久に変化している 』と述べている。
代謝 歴史
代謝の科学的研究には長い歴史があり、初期の動物全体を調べる研究から、現代の生化学における個々の代謝反応の研究へと、数世紀にもわたって発展してきた。ヒトの代謝に関する最初の対照実験は、1614年にサントーリオ・サントーリオが著書『Ars de statica medicina』の中で発表したものである。彼は、食事、睡眠、仕事、セックス、絶食、飲酒、排泄の前後の体重を記録した。彼は、摂取した食物の大部分が、「不感蒸泄」と名付けた過程で失われることを発見した。
こうした初期の研究では、代謝過程の機構は解明されておらず、生体組織を活性化しているのは生命力という特別な力によると考えられていた。しかし、19世紀、ルイ・パスツールは、酵母による糖のエタノール発酵の研究から、この過程は酵母細胞内の物質が触媒になっていることを突き止め、「発酵体（ferments）」と名付けた。彼は、『アルコール発酵は、細胞の死や腐敗ではなく、酵母細胞の生命や組織化の結果として起こる作用である。』と記した。この発見は、1828年にフリードリヒ・ヴェーラーが発表した尿素を化学的に合成に関する論文とともに、完全に無機的な前駆体から作られた最初の有機化合物として特筆に値する。これによって、細胞内の有機化合物や化学反応が、他の化学分野のものと原理的に変わりないことが証明された。
代謝 歴史
20世紀初頭、エドゥアルト・ブフナーによる酵素の発見により、代謝の化学反応の研究は、細胞の生物学的研究から切り離され、生化学の分野が確立された。その後、ハンス・クレブスが尿素回路を発見し、ハンス・コーンバーグと共同でクエン酸回路とグリオキシル酸回路を発見するなど、近代的な生化学者の貢献によって、生化学の知識は急速に拡大した。現代の生化学研究は、クロマトグラフィー、X線回折、NMR分光法、放射性同位体標識、電子顕微鏡、分子動力学シミュレーションなどの新しい技術の利用により、細胞内の多数の分子や代謝経路の同定と詳細な解析が可能になった。
辛子明太子
辛子明太子（からしめんたいこ）は、スケトウダラの卵巣（鱈子・たらこ）を塩漬け熟成し、塩抜き後に唐辛子、昆布、砂糖、醤油などからなる調味液に漬け込んで発酵させた惣菜である。
辛子明太子 語源
スケトウダラのことを朝鮮語で明太（명태、myeongtae、ミョンテ）と呼ぶことに由来するという。李氏朝鮮時代の『承政院日記』の孝宗三年（1652年）の条に「明太卵」と記載されているのが「明太」という語の現存史料上の初出である。李氏朝鮮時代末期の学者である李裕元が記した『林下筆記』によると、「明太」の語の由来は、明太を釣り上げた明川郡の「太」を氏とした漁師に由来するという。なお、朝鮮半島東南部の方言では、「明太」を「メンテ」と発音する。
東北官話（中国東北部の方言）ではスケトウダラを「明太魚（明太鱼、míngtàiyú、ミンタイユィ）」と呼ぶことがあり、ロシア語でも「минтай（mintaj / mintay、ミンタイ）」と呼ぶことがある。この事からロシア起源と言う説や、逆に朝鮮語がロシアに伝わった説など様々である。
中部地方以北では「辛子明太子」を単に「明太子」と呼び、関西以西では「たらこ」を「明太子」と呼ぶ事が多い。
辛子明太子 歴史
昔の朝鮮半島の文献によると、明卵漬の製造は発酵させることをベースとしていた。塩漬けして発酵させた後、トウガラシ粉とニンニクを加えてまぶした。塩漬けさせて発酵させるため、水分が抜けて、タラコの身が引き締まるが、塩辛い味である。
太平洋戦争前の朝鮮半島においては、日本人が明太子の製造卸問屋を経営していたことを示す資料と記録がある。明治40年（1907年）頃に樋口伊都羽（ひぐちいづは）が創業したもので、朝鮮半島の代表的な明太子製造問屋であった。樋口は漁業に携わっていたが、漁民の自家用以外は捨てられるだけのスケトウダラの卵巣を日本向けに商品化することを考えつき、「明太子製造元祖ヒ(マルヒ)、創業明治40年、樋口伊都羽商店」という看板を掲げて釜山で商売を始めた。商売は繁盛し、輸出先は日本本土のほか日本統治時代の台湾、中国へと広がった。樋口は終戦までの38年間経営していた。
日露戦争直後から太平洋戦争中にかけて、鉄道省（後の日本国有鉄道→現・JRグループ）は下関と当時日本領であった朝鮮の釜山との間に関釜連絡船を運航していた。また、中国との定期連絡船も存在し、スケトウダラ（明太魚）の辛子漬け（明太卵漬け）を運んでいた。朝鮮側の連絡船では釜山を経由して、明太の卵巣の辛子漬け（「明卵漬（明卵젓 / 명란젓、myeongnanjeot、ミョンナンジョッ）」）が下関へ輸入された。
辛子明太子 歴史
朝鮮半島に住んでいた日本人は明卵漬を「メンタイ」と呼んだ。当時「メンタイ」と呼ばれた明卵漬は、塩漬けにした卵巣に唐辛子を振りかけて作る「まぶし型」で製造されていた。
ふくやの川原俊夫が若いころに釜山で食べた明卵漬の記憶を基に、「明卵漬」「まぶし形」を戦後にそのまま売ろうとしたが、日本人には辛すぎて売れず、調味液を白砂糖や黒砂糖、角砂糖、ザラメ、蜂蜜など出来る限りの甘味を加えたり、酒やかつおぶしや昆布の出汁でうま味やコクも加えたりするなど試行錯誤をし、「辛子明太子」を開発した。これを「十日恵比須神社大祭」で商売繁盛の日である1949年（昭和24年）1月10日に「味の明太子」として販売した。
ふくやは約10年かけて生み出した製造法を独占せずに他企業へ教えた。そのため、日本全国へ明太子が普及した。1960年代には多くの同業者が設立された。
1962年（昭和37年）頃、ふくやの斜め前と隣の2軒の店が、教えられた製造法で明太子を販売するようになった。1967～68年（昭和42～43年）ごろには製造法を俊夫から教えられた大手の明太子メーカーが次々と開業した。
辛子明太子 歴史
ふくやの社員たちが「商標登録や製法特許を取るべきだ」と訴えると、俊夫は漬物を引き合いに、「漬物にはさまざまな味がある。同じ大根でも白菜でも、漬け方ひとつで味は変わる。家庭ごとでも味が違う。そんな漬物に商標はあるか？製法特許はあるか？明太子だって誰が作ってもいいではないか」と説得している。
1975年（昭和50年）に東海道・山陽新幹線が博多駅まで繋がり、その後に設立された福さ屋が新幹線駅や東京の三越百貨店等へ販路を築き、全国的に知れ渡るようになった。近年では料亭や老舗醤油メーカーなども明太子を扱うようになり、良質の原材料を贅沢に使用した高級品の研究も進んでいる。1980年代には土産物の販売ルート以外にも、百貨店やスーパーマーケットなどで広く販売されるようになり、全国でおにぎり・パスタの具として広く利用・販売されている。2007年（平成19年）には、おにぎりなどの加工用辛子明太子の出荷量が、ついに土産用の辛子明太子の出荷量を逆転した。
2016年（平成28年）にふくやの川原正孝社長は、「ふくやだけが明太子を独占販売していれば、恐らく（日本全国へ）広がらなかったと思います」とし、製造法を他社へ教え続けた俊夫を支持している。
類似の派生商品として、2018年11月、辛子明太子（めんたいこ）製造販売「蔵出しめんたい本舗」が2018年（平成30年）11月、ニシンの卵（数の子）を辛い調味液に漬け込んだ「数太子（すうたいこ）」を開発。数の子ならではの食感、うまみ、辛さが特長で、おせち料理や歳暮向け高級食品として販売。
辛子明太子 販売形態と産地
辛子明太子は、その形状によって販売価格・流通経路が大きく異なる。
卵巣の形を保ったままのものは「真子（まこ）」といい、比較的高値で取引される。主に贈答や接待に用いられる。皮が切れたものを「切れ子（きれこ）」と称し、比較的安価で家庭用として好まれる。さらにまったく形がなく粒のみのものを「ばら子（ばらこ）」という。ばら子はパック詰めにして業務用に使用されたり、チューブに入れたりして販売されている。辛子明太子は冷凍・冷蔵保管が必要な商品が多いが、ふくやは常温で3年保存できる油漬け缶詰を開発し、2016年（平成28年）に発売している。
切れ子には少し切れただけのものから、ばら子に近いようなものまで多種が存在する。なお、真子・切れ子・ばら子の品質には特に違いはない。さらに、明太子の原料は戦前の頃に比べはるかに細く痩せてしまったといわれるが、細い明太子に別のばらこを注入する技法も生み出された。
辛子明太子 販売形態と産地
明太子の産地について、原料となるスケトウダラの卵は日本近海、アメリカ合衆国アラスカ沖、ロシア近海などで獲れたものが中心であり、スーパーで見かけるものの多くがアメリカ産・ロシア産となっている。
近年比較的安価で売り出されている「原産地 中国」と表記されたものを見かけるが、これは上述の卵を中国で加工した製品であり、中国産の原料卵を日本で加工しているわけではない。なお2009年頃、不況や中国をめぐる食品問題のあおりを受け、中国に工場を構える業者の多くが撤退を開始していたが、近年再び中国加工のものが増え始めてきた。
辛子明太子 食べ方
副菜としてそのまま、もしくは好みにより軽く焼いて食卓に供する。また、酒肴やおにぎり、お茶漬けの具材としても好まれる。NTTドコモ「みんなの声」における「好きなごはんのお供ランキング」では、「辛子明太子」が一位であった。
洋食に取り入れられることも多く、ほぐした辛子明太子をマヨネーズと和えて「めんたいマヨネーズ」としたり、バターライスに混ぜたり、たらこスパゲッティに用いたりすることもある。
また、パン屋では明太子をバターやマーガリン、マヨネーズ等と合わせてペースト状にし、フランスパンに塗った「明太子フランス」がよく売られている。
五条家
五条家（ごじょうけ、正字体：五條）は、日本の家名。以下の2家がある。
USB延長ケーブル
USB延長ケーブル（USBえんちょうケーブル、USB extension cable）は周辺機器の一つであり、パーソナルコンピュータやNASなどのハードウェアのUSBポートと、USBに対応したUSBメモリや、外付けHDD、プリンターなど周辺機器のUSBポートを接続する際に、パソコンと機器がはなれていて、付属ケーブルでは届かない時に、長さを補うために使われるケーブルのこと。また、USB A端子が直接本体に直付けされているUSBメモリなどを容易に接続できるようにするために使う。
通常のUSBケーブルは片方がパソコン側のUSB A端子でもう片側が機器側のB端子（もしくはミニB端子）であるが、USB延長ケーブルは両方がA端子で、一方がオス、もう一方がメスとなっている。ただし、USB規格においてはケーブルの一方はA端子、もう一方はB端子と規定されているため、両端にA型のオスとメスがついているUSB延長ケーブルは規格に則っておらずUSBロゴをつけることがゆるされていない。USBロゴが付いたものもあるが、これは、規格違反を承知で勝手につけたものである。
USB延長ケーブル
周りにいろいろなオブジェをつけることも容易であり、実際にスパゲッティ型のUSBケーブルも開発・販売されている。USBメモリなどに付属している事が多く、家電量販店などで販売しているものは長さが50～150cm程度のものが多い。
また、ごくまれにUSB規格で定められている5m以上の距離に延長するためにリピータがついている製品も存在するが、USB接続機器の中にはリピーターを挟むと動作しないものもあるので注意が必要である。
昌泰の変
昌泰の変（しょうたいのへん）は、昌泰4年1月25日（901年2月16日）、左大臣藤原時平の讒言により醍醐天皇が右大臣菅原道真を大宰員外帥として大宰府へ左遷し、道真の子供や右近衛中将源善らを左遷または流罪にした事件。
昌泰の変 概要
一般的にその背景には時平と道真の確執が主な理由とされるが、それだけが理由ではない。
宇多上皇は醍醐天皇に譲位した後も、『寛平御遺誡』という君主の心構えを新帝に説くばかりでなく、道真を始め源善・中納言源希・蔵人頭平季長・侍従藤原忠平といったいわゆる「寛平の治」の推進役だった一種の側近集団を新帝の周囲に配置して新帝の政策を主導しようと図った。これに対して時平や大納言源光ら上級貴族のみならず、藤原清貫・藤原菅根・三善清行ら中下級貴族を含めた激しい反発があったともいわれる。
その一方で醍醐天皇の即位当時、仁明天皇の嫡流子孫である貞辰親王（清和天皇皇子）や元良親王（陽成天皇皇子）らを皇位継承者に擁立する動きに強い警戒感を抱いていた宇多法皇は自分の同母妹為子内親王を醍醐天皇の妃として男子出生を願ったが内親王は早世した。そこで醍醐天皇は藤原時平と相談してその妹である藤原穏子の入内を進めた。だが、宇多法皇はこれを時平が外戚の地位を狙うものとして強く反発した。阿衡事件（阿衡の紛議）の苦い経験から、藤原氏腹の皇子の誕生を望まなかった宇多上皇と藤原氏との連携によって政権の安定を図る醍醐天皇の路線対立が明確になっていった。
昌泰の変 概要
やがて、宇多法皇が道真の娘婿でもある斉世親王を皇太弟に立てようとしているという風説が流れると、宇多上皇や道真の政治手法に密かに不満を抱いていた醍醐天皇と藤原時平、藤原菅根（折りしも病死した平季長の後任の蔵人頭に就任していた）らが政治の主導権を奪還せんとしたのである。1月25日、突如醍醐天皇の宣命によって道真は大宰員外帥に降格された。
この政変で道真・善（出雲権守に左遷）を排斥、変の翌年に連座を免れた源希も病死、同じく藤原忠平も政治の中枢から事実上追われることになり、醍醐天皇・藤原時平派の政治的勝利に終わった。直後に醍醐天皇は穏子を女御に格上げして事実上の正妃として遇し、その所生の皇子による直系継承によって藤原氏の支持を得た皇位継承を図ることとなる。これは、宇多上皇が進めてきた藤原氏の抑制方針を大きく変えるものであった。天皇や時平は「延喜の治」と呼ばれる自らが主導する政治改革を目指すものの、変からわずか8年後に時平が急死、続いて醍醐天皇も病気がちとなり、政治権力の中心は再度宇多法皇と藤原忠平の手中に帰する事になった。
昌泰の変 概要
この政変を巡っては、道真の死後に起きた天変地異が道真の怨霊の仕業と考えられて（→清涼殿落雷事件）、道真の名誉回復とともに政変に関する資料が廃棄されたと考えられていること、また醍醐天皇の治世が理想的な親政として評価された余りに、皇位継承を巡って宇多法皇と醍醐天皇の間に温度差があったことなどが軽視されたことなどにより、真相については十分に明らかになっていない面が多い。
昌泰の変直後の延喜元年（901年）9月に、道真と並んでこの時代の知の双璧と呼ばれ、ただし栄達はしていなかった学者の大蔵善行が、門下生たちから盛大に七十の賀を祝福された。この”門下生たち”こそが藤原時平派閥であり、大蔵一門と出世を争い、変で追放された人々は菅原道真門下生である。すなわち、大蔵一門と菅原一門の対立という図式も成立する。
高円宮杯全日本ユースサッカー選手権大会
高円宮杯全日本ユースサッカー選手権大会（たかまどのみやはい・ぜんにほん-せんしゅけんたいかい）は、日本サッカー協会が主催する中学生（第3種）、高校生（第2種）年代の選手を対象に学校のサッカー部と地域のクラブチーム（JリーグやJFLなどの社会人リーグ所属チーム傘下のクラブユースチーム含む）全てのチームに門戸を開けて対戦する公式戦。年代別に2つの大会が存在する。大会の名は2002年に急死した高円宮憲仁親王（日本サッカー協会名誉総裁）を記念してつけられた。
大徳絵里
大徳 絵里（だいとく えり、1981年9月24日 - ）は、日本のフリーアナウンサー。
大徳絵里 略歴
2008年1月1日、学生時代から交際を続けていたというTBSアナウンサーの蓮見孝之と2月に結婚する予定であることがスポーツニッポンで報じられた。そして2月22日に蓮見が勤務するTBSが正式に結婚を発表した。当初「結婚後も本人は東北放送に在籍してアナウンサーを続ける」とスポニチをはじめ各スポーツ紙が伝えていたが、3月26日放送の「ウォッチン!みやぎ」の中で、同月末をもって東北放送を退社することを発表する。
津田禎
津田 禎（つだ ただし、1964年2月21日 - ）は、青森テレビの社員で、元アナウンサー、報道部記者。
津田禎 来歴・人物
岩手県江刺市（現・奥州市江刺）出身。血液型はO型。岩手県立金ケ崎高等学校を経て、1987年に東洋大学文学部中国哲学文学科卒業後、ATVに入社（同期アナは2021年に退社した福士珠美）した。1990年代に報道部へ異動したが、2000年代にアナウンサーへ復帰した。愛称は「つんちゃん」。2016年から2017年までは大阪支社、2018年は弘前支社長、2022年時点では八戸支社長として活動していた。その後、本社総合戦略局営業戦略部の部長に異動。
ヘアスタイルはスキンヘッドに近い丸刈りで、おでこのところはあまり髪の毛が生えていない。これをネタに、ATV地上デジタルテレビジョン放送の宣伝では、女子アナが「デジタルになると（メイクにも）気が抜けなくなるよ。」といった後に、津田が「気」と「毛」を聞き違いしたかのように「毛が抜けないんだってー」と自分の頭をくしで叩きながら言っていた。また、記者時代は髭を生やしていた。
また、地元局のIBC岩手放送アナウンサー試験を受けた際に落ちた経験があり、その関係で時々IBCのテレビ・ラジオの番組にお情けで登場することがたまにあった。
高円宮杯 JFA 全日本U-15サッカー選手権大会
高円宮杯 JFA 全日本U-15サッカー選手権大会（たかまどのみやはいジェイエフエイぜんにほんアンダーフィフティーンサッカーせんしゅけんたいかい）は、日本サッカー協会 (JFA) が主催して毎年11-12月に開く中学生年代（第3種登録）の選手を対象としたサッカーの公式戦。
大会名は当主（高円宮憲仁親王）が1987年からJFA名誉総裁を務めている高円宮家から優勝杯（高円宮杯）が下賜されていることに由来する。1989年に高円宮杯全日本ユース(U-15)サッカー選手権大会（たかまどのみやはいぜんにほんユース（アンダーフィフティーン）サッカーせんしゅけんたいかい）として第1回大会が開かれ、さらに2017年11月1日に日本サッカー協会 (JFA) が発表した「JFAブランディング」の一環としてJFA主催の2018年以降全ての大会名称に "JFA" の文字を加えること となったことから、現在の大会名となっている。
高円宮杯 JFA 全日本U-15サッカー選手権大会 概要
当大会は中学校の部活動として行っているサッカー部と、Jリーグ、日本フットボールリーグの傘下チームを含む地域のクラブチームのジュニアユースチーム全てに参加の門戸を開放し、都道府県予選→地域予選を勝ち上がった32チームによって争う。中学生年代においてはクラブユースが部活動をリードし続けてきたため、中学校サッカー部の優勝は1991年の第3回大会を最後に途絶えている。
決勝は12月29日に国立競技場で開催されてきたが、2011年大会は九州で開催されることになり、それに伴い決勝も大分銀行ドームで開催されることになった。2012年大会は滋賀県と大阪府で開催され、決勝はJ-GREEN堺にて行われる。
高円宮杯 JFA 全日本U-15サッカー選手権大会 開催方式
※以下は2012年度の大会を参考とする。なお2013年から地域リーグおよび県リーグ以下のリーグ名称に「高円宮杯」を冠することになった。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜
『だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜』（だんじょんしょうてんかい でんせつのけんはじめました、英:Sarara's Little Shop）は、1998年10月29日に講談社から発売されたPlayStation用ゲームソフト。ジャンルはロールプレイングゲーム。藤浪智之がゲームデザインとシナリオ、佐々木亮がキャラクターデザインを担当し、キノトロープ、株式会社シエスタなどが開発を担当した。音楽は堀内一史【ebi】／美音里が担当。
アニメパートは、オー・エル・エムが制作し、演出・作画監督を毛利和昭が担当している。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 ストーリー
あなたは新米の魔女。パートナーである猫と共に、見知らぬ町へやってきたばかりです。ここはダンジョンと冒険でにぎわう町。冒険者相手の道具屋をはじめようと思いつき、ちいさなお店を開くところから、あなたの物語は、はじまります……。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 概要
ダンジョンのある山の麓の「だんじょんの町」（名称変更可能）へやってきた主人公が、勇者や騎士、盗賊、魔法使いなどといったファンタジーRPGのおなじみのキャラクターたちを相手に「道具屋」を経営する。また自分自身もそのキャラクターたちとダンジョン探検をすることができる。
ファンタジーRPGの世界の道具屋を主人公にしたゲームであり、ドラゴンクエストIVの第3章（トルネコのシナリオ）のイメージに近い。本作が既存のファンタジーRPG作品の集合的なイメージから生まれたオマージュであることは、シナリオ中でも明に暗に語られている。
ゲーム中には「お得意様」キャラクターが複数登場し、商品をうまく売買したり、一緒にダンジョンで冒険すると「お得意様度（隠しパラメータ）」が上がって行く。お得意様度が上昇すると関連するさまざまなイベントが発生したり、シナリオの展開が変わったりすることがある。
主人公サララには冒険者レベルと商人レベルが設定されている。ダンジョン探索をしてモンスターを倒し経験点を貯めることにより、冒険者レベルが上がり、冒険者としての能力値が上がる。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 概要
商人レベルは「商店会本部」に会費を納入することで上がっていく。商人レベルが上がると、商店会本部、教会、盗賊ギルドから仕入れられる商品の種類が増える。
商店会本部からの仕入れ額は定価の半額となっているが、定価販売や割増販売などのがめつい商売をしていると商品がなかなか売れず、お得意様度も上がらないので、割引や半額での販売が基本となる。故に、商店会本部から仕入れた物を売っているだけではなかなかお金を稼ぐことができない（値切られて仕入れ額を割り込む事も多い）。効率良く稼ぐ為には、モンスターを倒して稼いだり、ダンジョン探索で入手したアイテムを販売する必要がある。
お得意様を探索パーティーに加えると、以前お得意様が買い上げた武器や防具を装備して登場する。すでに所持している装備より弱いものを売った場合には持ち替えないことがある（また、特定レベルに達すると持ち物が変わっていることがある）。だが、実際にはレアな装備品は売らずに所持しておき、パーティを組んだ後に貸し出したほうが得である（貸した物は町に帰ると戻ってくる）。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 概要
ダンジョンは2D表示でロマンシング サ・ガシリーズのようにモンスターのシンボルキャラクターが表示され、ぶつかるとコマンド選択式の戦闘になるタイプ。戦闘では普通に戦う以外にも交渉してアイテムの売買や交換をすることができる。ただでアイテムをくれと言われたり、逆にアイテムをくれたりする場合もある。交渉の結果次第では戦闘を避けたり、冒険の役に立つ情報を聞くことも可能。たまにモンスター側から交渉を持ちかけてくることがある。
ダンジョンのより深い階層まで探索すると、お得意様が単価の高い物を売りにくるようになり、店の運営を助ける。こうして探索と店番が相互に影響を及ぼしながら、サララの全体的なステータスが上がっていく。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 登場するキャラクター
冒険者レベルのほかにキャラクター固有の能力（力、頭、速、体の4つ）が設定されている。この能力はレベルが上がっても変化することがない。
サララ（名称変更可能）
新米の魔女。箒で空を飛ぶことはできず、派手な魔法も一切使えないが、あらゆるアイテムの名称と使い方がわかる能力を持つ。一部のシナリオを除いてほとんど台詞が無い。
能力はすべて平均的だが、ゲームシステムの都合上パーティーで最もレベルが高いことが多い。また、魔法系アイテムの効果が固定されており、ゲーム後半は戦士役に回ることが多くなる。
チョコ（名称変更可能）
サララのパートナーの猫。サララとだけ会話することができ、冒険や商売のアドバイスをしてくれる。
「お得意様」は、冒険者の場合はメインになるキャラクターと、その他ふたりの3人でグループとなっている。ダンジョンで同行することができ、その場合主人公と合計で4人のパーティとなる。
バランスのとれたパーティー。ダンジョン探索でも、武器・防具・道具をバランスよく入手できる。
アスカ
自称「勇者」の女の子。一人称は「ボク」。来店確率が非常に高い。
勇者なので魔王退治の情報を得るためには目に付くあらゆる物を調べ、動物にも話しかける。
レベルアップすると立ち絵の見た目もグレードアップして行く。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 登場するキャラクター
店では基本的に装備品、回復系のアイテムを買っていく。「ダンジョンで手に入れた」装備品を売りに来ることも多い。行動時間は昼間で、魔王グループとは鉢合わせすることがない。
魔王グループのアイオンとシルエットが対になるようにデザインされている。
成長すると彼女も回復魔法を使えるようになるため、安定している。
ジェド
神官の青年。先祖が勇者を裏切ったという伝説を背負っている。それに伴って、勇者に対してはある使命を負っている。
魔王に対しては憎しみに近い感情を持っている。魔王グループとのお得意様度がある程度に上がると、忠告をしに来る。
「魔軍に対抗できるもの」として装備品、神聖系アイテムを買っていくことが多い。
回復担当になることが多いが、成長すれば光属性の攻撃魔法も使える。
ヤッコフ
魔法使いのお爺さん。
節々でジェドをたしなめる発言をすることがある。
回復系、魔法系のアイテムを買っていく。
炎系の攻撃魔法と一通りの味方補助魔法を習得する。
物理攻撃力に特化したパーティーだが、レベルが上がると回復魔法も使えるようになる、優秀なパーティー。ダンジョン探索では武具を入手しやすい。また、3人とも来店確率が高い。
ライアット
お城の新米騎士。正義感が強く、真面目な性格。オーロラ姫に恋をしている。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 登場するキャラクター
装備品のほかに、「かわいい置物」を買いに来ることがある。アイテムを売りにくることも多く、本人のキャラクターからは意外なものもしばしば。徹夜勤務が多いらしく、朝方に「何か甘いもの」を買いにくることがある。
能力的には可もなく不可もないが、成長すれば回復役もそれなりにこなせるようになる。攻撃面では他2人より弱い。
ハイライン
お城の騎士団に所属する青年。女性が大好きで、守備範囲は非常に広い。さらに動物のオス、メスでも勘で見分けられる。
サファイヤを口説いているシーンがあり、そこにはある熱意が感じられる。チャチャに声をかけていることもある。
装備品のほかに、「かっこ良さに磨きのかかる」アイテムを買いに来ることがある。
力の値が高く全体攻撃技を数多く習得する。
フンボルト
お城の騎士団長のお爺さん。ライアットやハイラインの上司でもある。話が長く、若い頃の武勇伝を話し出すと止まらない。愛馬の名前はたくさんある。
店では装備品の売り買いが多い。「こう見えても信心深い」らしく、神聖なアイテムを買っていくことも多い。
老いてなお、と言うべきか体力が非常に高く力もある。
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 登場するキャラクター
盗賊ギルドと敵対する、女性盗賊の3人組。素早さが高いが、やや打たれ弱く戦闘能力は決して高くない。夕方から朝にかけて表を歩いていることが多く、比較的3人とも来店確率が高い。お得意様度が上がると盗賊ギルドを乗っ取るイベントが発生し、闇市の販売価格が良心的になる。ダンジョン探索では非売品のレアアクセサリーや道具類を入手しやすい傾向がある。
ルビィ
世界征服を狙う女盗賊で、グループのリーダー的存在。真っ赤なボディコンとピンヒールのブーツを身に付ける、お洒落で派手好きな性格。一見、明るく楽天的だが、鋭い洞察力と思索力、大きな情報網の持ち主であり、凄腕の盗賊。その情報網故に初対面の前から主人公のことを知っており、当初から彼女に対して好意的。実は暗い過去を持っているらしい。レアアイテムや小物類を買っていくことが多い。
敵のアイテムを盗む特技を習得し、素早さが高いがそれ以外のステータスはやや低い。
サファイア
盗賊にして暗殺者。無口でクールな性格だが、ルビィには絶対的な信頼を置いて「ボス」と慕っており、冷静な判断と知略、魔法力で彼女を助ける。掘り出し物や魔法のアイテムの売買が多いが、ルビィに頼まれて買い出しやってくることも。
冷属性攻撃と回復魔法を習得するが、非常に打たれ弱い。
ガーネット
だんじょん商店会 〜伝説の剣はじめました〜 登場するキャラクター
筋肉質で男勝りな女盗賊。典型的な戦士系能力で、一人称は「あたい」。サファイアと同じくルビィに従っている。豪快で細かいことはあまり気にしない性格であり、武具を買っていくことが多い。
体力はルビィよりややマシな程度である。覚える特技はほぼ攻撃系。
唯一、メンバーが2人のグループ。魔法に特化したグループだが物理攻撃力は低いので、サララのサポートが不可欠。ダンジョン探索では軽装備品や防護服（ローブなど）、魔法系アイテムを入手しやすい。
ウィル
修行中の魔法使い。師匠はラオ。魔法の研究に夢中で他の事は眼中に無く、非道な研究にもさして罪悪感を抱かないことがある（ラオはそれゆえに彼を半人前扱いしている節がある）。魔法系アイテムや魔法の研究に役立つ道具を求めて来店してくる他、師匠から金の工面を頼まれてアイテムを売りにくることがある。
雷系の攻撃魔法を使いこなし、それなりに力もあるがやはり魔法系武器との相性が良い。一方打たれ強さはワーストクラス。
チェルシー
見習いシスター。大人しめの性格。あがり症で不器用なので自己嫌悪に陥りがち。幼馴染みのウィルの事が好きだが、彼のニブさにやきもきしている。ぬいぐるみなどのファンシー系のアイテムや、「うまくいえない不安がある」と神聖なアイテムを買っていくことが多い。