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スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
翌日、惑星クリストフシスの市街地においてアナキン・スカイウォーカーとオビ=ワン・ケノービが率いるクローン部隊も圧倒的物量を誇るウォーム・ロースサム将軍のドロイド軍団に追い詰められていた。一度は敵部隊を撃退したアナキン達であったが、敵は強力なシールドを展開して再び進撃を開始。重砲を無力化するシールドを消し去るべくアナキンとヨーダに派遣された新たなパダワン、アソーカ・タノはシールド内部に潜入し、そのままシールド発生装置に向かった。オビ=ワンもロースサム将軍に降伏を申し入れる振りをして時間を稼ぎ、その隙に二人はシールド発生装置の破壊に成功。さらにロースサム将軍もオビ=ワンの手で拘束され、この戦いは共和国軍側の勝利で終わった。また、アナキンはシールドを破壊したアソーカを認め、自分のパダワンとすることを承諾したのだった。
クリストフシスの戦いと同じ頃、銀河外縁部の航路を支配するジャバ・ザ・ハットの息子、ロッタ・ザ・ハットが何者かに誘拐されるという事件が発生。ジャバは共和国にその救出を依頼した。この依頼に対し、パルパティーンとヨーダはハット族の信用を得る事で彼等が支配する宙域を新たな補給航路に出来ると考え、依頼を受諾。ヨーダは惑星クリストフシスでの戦いを終えたオビ=ワンとアナキン、そしてそのパダワン・アソーカにロッタ救出を指示した。
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オビ=ワンはジャバとの交渉に向かい、一方のアナキンとアソーカ率いるクローン部隊は惑星テスへ行き誘拐犯が立て篭ったという崖の上にある寺院に突入しようとしたが即座に交戦状態へ入った。だが、崖の上にある寺院と崖をのぼりながら戦闘する共和国軍はウォーカーを一機破壊されるもスカイウォーカーの見事な作戦で制圧。ロッタの確保に成功。しかし、これはジャバをも分離主義勢力に取り込む事を企図したドゥークーの計画であり、彼はオビ=ワンが立ち去った後にジャバと接触。息子を誘拐したのはジェダイであり、さらにそのジェダイがジャバの命をも狙っていると吹き込み、独立星系連合への加盟を要求した。アナキンとアソーカ達もアサージ・ヴェントレス率いるドロイド1個大隊に包囲され、追い詰められていたが、オビ=ワン率いる212攻撃大隊の救援によりどうにか脱出に成功し、奪ったスパイス密輸船「トワイライト」でそのままタトゥイーンに向かった。しかし、そこでもドゥークーの妨害工作に遭い、アナキン達の乗った宇宙船は墜落。二人は徒歩でジャバの元に向う事になる。
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その頃、ジャバがジェダイに不信を抱いていると知ったアミダラ議員は当時コルサントに居を構えていたジャバの親戚ズィロ・ザ・ハットに再度の交渉の仲介を依頼した。しかし、ズィロはドゥークーと内通しており、全ては両者が仕組んだ事であると判明する。一度はズィロに捕らわれたアミダラであったが、C-3POの呼んだコマンダー・フォックス率いるショック・トルーパー部隊により救出され、ズィロを拘束した。アナキンとアソーカ達もドゥークーおよびマグナ・ガード部隊との激しい戦いの末に無事ロッタをジャバの下へ送り届けた。そしてアミダラの手で全てがジャバに伝えられ、ジャバは共和国軍に支配宙域での通行を許可した。
分離主義評議会の一員で、テクノ・ユニオンの監督者を務めるエマー・ワット・タンバーがトワイレック種族の母星であるライロスを侵略した。この侵略に対して、共和国軍はジェダイ将軍のアイマ＝ガン・ダーイを現地へ派遣し、チャム・シンドゥーラ将軍率いるトワイレック・レジスタンスを手助けした。しかし、分離主義勢力軍の戦力は圧倒的でとうとうライロス上空のダオ提督率いる共和国艦隊が一掃され、地上で戦う兵士たちへの補給がなくなってしまった。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
食料と医薬品不足に苦しむトワイレックの民を救うため、共和国は中立惑星トイダリアに協力を求める。ジェダイ評議会は元老院の任務を終えたばかりのベイル・オーガナ議員に、近くにある惑星トイダリアへ向かうよう要請する。彼を支援するために派遣されたジャー・ジャー・ビンクス代議員と共に、カトゥーンコ王に飛行艇を物資の集積基地として使用できるよう依頼しようというのだ。オーガナとビンクスは王と評議会による公聴会に招かれたが、通商連合のロット・ドッド議員の到着によって交渉は暗礁に乗り上げてしまう。オーガナとビンクスはこの問題における人道的意図を強調するが、ドッドはこの戦争で中立を宣言していたトイダリアがライロスと共和国の兵士への物資補給に応じれば、一方の勢力を支援することになり、自ら掲げた原則を打ち破ることになると指摘する。熟考の末、カトゥーンコは共和国がトイダリアに基地をおくことを公式に拒否したのだった。だがその後、彼は密かにオーガナとビンクスに会い、本心では人道支援は彼の望むところであると告げる。彼はトイダリアによる干渉を秘密にすることを条件に、オーガナの船に予備の食料物資を積み込むことを許可したのだ。オーガナはトラブルメーカーとして並外れた才能を持つジャー・ジャーに、晩餐会の席でドッドの気を逸らすよう指示し、自身は補給物資の積み込み作業を監視したのである。ジャージャーの協力もあり、無事に共和国軍は救援物資をライロスに送ることに成功した。ダーイ将軍はバトル・ドロイドとの戦いで命を落としたが、シンドゥーラ率いる自由の戦士はトイダリアから派遣された補給物資を受け取るまで持ちこたえた。都市ケイズンが陥落した後、シンドゥーラの軍勢は秘密の拠点に身を潜めながらゲリラ戦を続けた。
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ライロスへの密かな人道的支援を行った後、カトゥーンコはトイダリアは中立の姿勢を考え直すことになるかもしれないと考え、ジェダイ・マスター・ヨーダとの会見を提案した。トイダリアンの支配領域に共和国基地を建設する許可とトイダリアを共和国側に引き込む為、ヨーダはカトゥーンコ王と交渉を行おうと、珊瑚衛星ルゴサへ向かった。だが、トイリダリアンの君主カトゥーンコとその護衛兵たちがジェダイの特使の到着を待っていると、一足先にアサージ・ヴェントレスが現れ、彼にドゥークー伯爵のホログラムを示した。ドゥークーはカトゥーンコに共和国の弱さを説き、共和国ではトイダリアを守ることはできないため分離主義勢力との同盟を考えるべきだと主張する。さらにヨーダの交渉を邪魔するため、分離主義勢力はヨーダの乗ってきた軽クルーザーを2隻のフリゲート艦で攻撃した。ジェダイ・マスターは脱出ポッドで船から脱出し、クローン宇宙軍士官ザックは撤退を強いられる。やがてヨーダは3人のクローン・トルーパー、サイア中尉、ジェック、リズと共にルゴサの地表に到達した。そして共和国のフリゲート艦が星系を離れると、ヴェントレスはそれを弱さの証として王に訴えたのだった。だが、彼女の説得はヨーダ自身からのホログラムによる呼び出しによって遮られる。ジェダイ・マスターは生きていたのだ。地表に到着したヨーダはヴェントレスの存在に気付き、分離主義勢力がジェダイに勝る保護を提供するとしてカトゥーンコの指示を勝ちとそうとしていることを知った。そこでヴェントレスは勝負を提案する。ヨーダが彼女の精鋭部隊から逃れることができればトイダリアは共和国に加わる。だが彼が失敗し、ドロイドが勝てば、トイダリアは分離主義勢力に加わるというのだ。分離主義勢力はトイダリアを手に入れるためにドロイドの軍団をルゴサへ送り込み、ヨーダ達はルゴサでドロイド軍団と戦わなくてはならなくなったが、ヨーダの活躍によってクローンたちに犠牲は出ずにドロイド軍を押し込むことに成功した。ジェダイの戦いぶりに感銘を受けたカトゥーンコはトイダリアを共和国へ加入させることを決定した。ドゥークー伯爵はカトゥーンコに自分の申し出について再考するよう促すが、カトゥーンコは自身の言葉を守れない者とは取引できないと告げる。この結果に激怒した伯爵は、おそらく次は連合を支持する後継者と取引することになるだろうと告げ、ヴェントレスに彼を殺すよう命じたのだった。ヴェントレスはトイダリアン・ロイヤル・ガードを素早く始末し、王に襲いかかろうとしたが、ちょうどそのときヨーダが現れる。ヨーダはフォースでヴェントレスを押さえつけ、クローンがドロイドたちを破壊した。ヨーダはカトゥーンコに挨拶し、単純なフォースを見せつけてヴェントレスを退ける。だが彼女は降伏せず、あらかじめ設置しておいた爆弾で崖崩れを引き起こすと、それを囮にしてソーラー・セーラーで逃走したのだった。カトゥーンコ王はヨーダの申し出を喜んで受け入れ、共和国に参加した。その後、彼らを迎えるリパブリック・ガンシップが到着し、一同は衛星を発ったのである。
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マレヴォランスとは独立星系連合の新型巨大戦艦「サブジュゲーター級重クルーザー」の1隻で、ドゥークー伯爵からグリーヴァス将軍に与えられた艦だった。この艦の最大の特徴は船体の両側にそれぞれ一基ずつ装備された巨大なイオン砲で、それによって敵艦の電子機器を無力化する事が出来た。そしてマレヴォランスはグリーヴァス将軍の指揮のもと多くの共和国の艦隊をイオン砲で行動不能にさせた後に集中砲火を浴びせて壊滅させ、一人の生還者も帰さなかった。そのため、共和国軍はマレヴォランスの情報すら得る事が出来なかったのである。
マレヴォランス戦役の中、アブレガド星系でマレヴォランス撃破のために派遣されたジェダイ・マスターのプロ・クーン指揮下の艦隊がマレヴォランスを追跡するも、返り討ちにあって全滅させられてしまう。しかしアナキン・スカイウォーカー将軍とアナキンの弟子であるアソーカ・タノによってプロ・クーンとクーン指揮下のコマンダー・ウルフ以下数名のクローンが救出され、結果として共和国はマレヴォランスの正体を知る事が出来た。
グリーヴァス将軍はアブレガドでプロ・クーンらの追跡を振り切った後、リンデリア星系を通過しようとした共和国軍の医療船団を待ち伏せした。この襲撃で共和国のペルタ級フリゲート3隻とヴェネター級スターデストロイヤー1隻を破壊され、共和国の艦隊は全滅した。
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リンデリア星系で共和国医療船団が襲撃された直後、アナキンは自身の＜レゾリュート＞で＜マレヴォランス＞破壊作戦を練っていた。アナキンは作戦を立てると、＜レゾリュート＞のハンガーにクローン・パイロットを集めて、＜マレヴォランス＞破壊作戦を説明した。彼は爆撃機の編隊を組んで敵のイオン砲をかいくぐり、グリーヴァス将軍のいるブリッジに直接攻撃を仕掛けるつもりでいた。プロ・クーンはこのリスクが高い作戦に難色を示したが、最終的に自身も護衛機として爆撃隊に同行することにした。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
アナキンが作戦を説明した直後、ユラーレン提督からアナキンはリンデリアで共和国医療船団が待ち伏せされた事を伝えられた。
アナキンはユラーレン提督の情報からグリーヴァス将軍は次にカリーダ・ショールズ医療センターを狙うと予測した。
ユラーレンは即時にカリーダ・ショールズ医療センターに襲撃の警告を伝えた。
オビ＝ワンも＜ネゴシエーター＞でカリーダ・ショールズ医療センターに向かうつもりだったが、カリーダ星雲が邪魔をするため、星雲を迂回してセンターに向かわなければならなかった。
しかし、星雲が邪魔なのは＜マレヴォランス＞も同様で星雲を迂回しながらセンターに行かなければなかった。
アナキンは＜マレヴォランス＞より早く医療センターにつかなくてはならなかったので、自身がBTL-B Y-ウィングからなるシャドウ中隊を率いて、カリーダ星雲を通過することにした。
道中、アナキン率いるシャドウ中隊がカリーダ星雲の「バルモーラ・ラン」を通った時、カリーダ星雲に生息するネブレイ・マンタに出会った。
この生物により、クローン・パイロットのマッチスティックの乗るY-ウィングのスタビライザーが損傷、シャドウ11のアストロメク・ドロイドが破壊されるが、シャドウ中隊はなんとかカリーダ星雲を通過した。
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シャドウ中隊はなんとかカリーダ星雲を抜けたが、すぐに＜マレヴォランス＞が姿を現した。
カリーダ・ショールズ医療センターでは既に半数の負傷したクローントルーパーが撤退の準備を進めていた。
グリーヴァス将軍はシャドウ中隊よりも脱出しようとしていたペルタ級フリゲートに狙いを定めてイオン・パルス砲でフリゲート船団を沈黙させ、ヴァルチャー・ドロイドを＜マレヴォランス＞から発進させ、シャドウ中隊を迎え撃った。
戦いの最中、グリーヴァスは味方のドロイド・スターファイターも巻き添えにして、共和国軍の爆撃機に向けてイオン砲を発射するよう部下のドロイドに命じた。＜マレヴォランス＞からイオン砲が放たれると、スカイウォーカーは機能停止を免れるため巨大なイオン・パルス砲をかわすよう部下たちに命じたが、カリーダ星雲通過時にダメージを追っていたマッチスティックの機が故障し、タグのYウイングと衝突してしまった。また、シャドウ6、7、10のYウイングもイオン・パルス砲にあたり、機能を停止した。
半数のパイロットを失いつつも、シャドウ中隊は＜マレヴォランス＞への攻撃を続け、医療センターを狙う巨大軍艦のブリッジを目指して飛行した。さらに1機のYウイングを失った後、アナキンに同行していたタノは今の戦力で防御の厚いブリッジを狙うより、新しい作戦を考えるべきではないかとアナキンに進言した。
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クーンもアソーカに同調し、医療ステーション攻撃に向けて充填中のイオン砲を叩けば、＜マレヴォランス＞に大ダメージを与えられるかもしれないと提案した。スカイウォーカーはブリッジ攻撃を断念し、イオン・パルス砲に向かう。
シャドウ中隊は発射直前のイオン・パルス砲撃にプロトン魚雷を打ち込み、＜マレヴォランス＞に深刻な損傷を与えることに成功した。
＜マレヴォランス＞は大爆発に見舞われ、武器が全て機能停止、ハイパードライブも使えなくなった。
グリーヴァスは＜マレヴォランス＞に撤退を命じるも、直後にケノービの＜ネゴシエーター＞を含むスター・デストロイヤー艦隊が星系内に到着し、ハイパースペースにジャンプできない＜マレヴォランス＞に容赦ない砲撃を浴びせかけた。スカイウォーカー、タノ、クーンはスター・デストロイヤーに帰艦し、共和国艦隊の支援に備えて戦闘機の燃料補給を行った。
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＜レゾリュート＞に帰艦したスカイウォーカーは、ジェダイ・マスター・ルミナーラ・アンドゥリの部隊に援護を求めたが、彼女は近隣領域で分離主義勢力の援軍と交戦しており、力を貸す余裕がなかった。ユラーレン提督は敵が一向にジャンプする素振りを見せないことから、＜マレヴォランス＞がハイパードライブに損傷を負っていることに気づく。ケノービは有利な状況を活かしてブリッジへの集中砲火を命じたが、勝利が目前に迫ったところで、アミダラ議員のヨットが＜マレヴォランス＞の近くに姿を現した。スカイウォーカーは秘密の妻であるアミダラが戦場に現れたことに動揺し、すぐに逃げるよう指示したが、ナブー・ヨットはトラクター・ビームに捕まって＜マレヴォランス＞のハンガーに引き込まれてしまった。グリーヴァスは銀河元老院議員を人質に取り、＜マレヴォランス＞のハイパードライブが回復するまでの交渉道具に利用するつもりだったのである。議員を救出すべく、スカイウォーカーとケノービは＜トワイライト＞に乗って＜マレヴォランス＞へ潜入する。
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＜マレヴォランス＞のハイパードライブが修復目前であることをアミダラから教わった後、ケノービは艦内のハイパードライブ制御室へ向かい、スカイウォーカーとアミダラは航法コンピューターの破壊工作に向かった。また、アストロメク・ドロイドのR2-D2はレール・ジェットを緊急停止させてC-3POを救い、＜トワイライト＞へ連れ帰った。しかし、艦内の通信をモニターしていたグリーヴァスは、ハイパードライブ制御室にドロイドの大部隊を送り込み、ケノービを迎え撃った。サイボーグの将軍も自らジェダイの始末に出向いたが、ケノービはフォースを使ってドロイデカを押し飛ばし、迫りくるバトル・ドロイドをなぎ倒した。ドロイデカの影に隠れてグリーヴァスのブラスターを凌いだ後、ケノービはハイパードライブの破壊を諦めてグリーヴァスとの対決を生き延びた後、撤収した。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
＜トワイライト＞が＜マレヴォランス＞から発進した直後、巨大軍艦に止めを刺すタイミングを見計らっていたプロ・クーンは、ヴェネター級スター・デストロイヤーに一斉砲撃を命じた。グリーヴァスはジェダイを倒すため自らベルブラブ22スターファイター＜ソウルレス・ワン＞に乗り込んで出撃し、ヴァルチャー・ドロイドを従えて＜トワイライト＞の後を追った。グリーヴァスは＜トワイライト＞の翼にレーザー砲を1発当てたが、アミダラ議員が回転レーザー砲を操作して反撃したため、致命的な一撃を与えることができなかった。戦闘中、グリーヴァスは＜マレヴォランス＞のブリッジにいるドロイドにハイパードライブの起動を命じ、セクター4にある連合軍秘密基地で落ち合うよう指示する。
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R2-D2は＜マレヴォランス＞のハイパードライブ起動を探知したが、敵艦を待ち受ける哀れな末路を知っていたスカイウォーカーは、構わず共和国艦隊に向かって飛び続けた。破壊工作が施された航法コンピューターはセクター4ではなく近くにあるアンターの死の月に針路をロックし、ドロイドたちが座標をリセットする暇もなく月面に直進した。この時、グリーヴァスは合流地点にいるドゥークー伯爵から戦況を尋ねられたが、返答を拒否してホログラム通信を切った。その直後、＜マレヴォランス＞は月に衝突して爆発し、まばゆい光を発して粉々になった。こうして分離主義勢力の誇る新型軍艦の脅威に終止符が打たれ、共和国のヴェネター級艦のブリッジでは勝利を喜ぶ歓声が上がった。
カミーノでは、日々クローン・トルーパーが製造されていた。コマンダー・コーディや、キャプテン・レックス、コマンダー・ウォルフなど、戦場で大きな戦功を挙げる勇敢なトルーパーもいたが、その陰では落伍者も存在していた。
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CT-782（ヘヴィ）、エコー、ドロイドベイト、CT-4040、ファイブスは、ドミノ分隊と呼ばれる分隊のメンバーだった。ドミノ分隊は、同時期に訓練を受けたブラボー分隊などの他の分隊と比較すると、チームワークに大きな問題を抱えていた。賞金稼ぎのブリック教官は彼らを落ちこぼれと嘲るが、もう一人の教官エル＝レスは分隊の才能と可能性を信じていた。訓練の責任者であるシャク・ティは、ブリックに賛成する立場をとった。カミーノアンのラマ・スーはドミノ分隊に対して「失敗作」、いわゆる"問題クローン"の烙印を押し、彼らは実戦投入を認められずにいた。
ドミノ分隊のチームワークは一向に改善せず、仲間を見捨てたせいで、五人は昇格試験を失格とされてしまう。ファイブスとエコーはシャク・ティと面会。他の部隊への転属を願い出たが、シャク・ティはチームワークの大切さについて二人に話し、追試を命じたのだった。
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一方でCT-4040は、ブリック教官と会い挑発を受ける。ブリックの目的は分隊を切り捨てる口実にするためだが、CT-4040はこれを拒否。ブリックからは「そういうやつを『カタップ』(自慢屋)というんだ！」といわれ、CT-4040はそれを気に入り、その瞬間からニックネームを「カタップ」としたのだった。同じころ、CT-782は試験を諦めて脱走しようとしていた。すると遺伝子の不具合がある雑用係のクローン99がCT-782に声をかけ、チャンスを与えられなかった自分と違い彼には可能性が残っていることを諭してヘヴィことCT-782の心を動かした。
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翌日、追試に臨んだヘヴィ、エコー、ドロイドベイト、カタップ、ファイブスの5人は、それまでと打って変わったチームワークの良さを発揮し、分離主義者の刑務所、「シタデル」を想定して作られたコースを攻略。ついに、砦の目の前までやって来た。しかし、砦の前に付くと、壁をよじ登る為のアセンション・ケーブルが無いことに気付く。ブリックがわざと隠したのだ。エル＝レスは中止を申し出るが、シャク・ティは「戦場ではフェアプレーなどありえない」と言い、訓練を続行させた。
ドミノ分隊は即興で作戦を立て、要塞の砲台を破壊して足場に使い、砦の上に立つビーコンを奪取、見事追試をクリアした。
問題クローンたちを認めたブリックは、エル＝レスと共にドミノ分隊にメダルを授与した。ヘヴィは99と再会を約束し、自分のメダルを渡した。シャク・ティは「フォースが共にあるように」と告げ、クローン・トルーパーたちは戦場へと旅立った。
辺境の星、リシ・ムーンでは晴れてクローン・トルーパーになれたドミノ分隊が、他の分隊と共にオナイナー軍曹の下に配属されていた。ヘヴィ、エコー、ファイヴス、カタップ、さらにドロイドベイトは戦いの無い任務にうんざりしていた。外で暴れまわることを願うヘビーに対し、軍曹はカミーノに最も近いこの基地の重要性を説いた。
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その頃、キャプテン・レックスとコマンダー・コーディが新兵のいる最後の星、リシ・ムーンへ視察に向かっていた。その頃リシでは流星群が飛来、ヘヴィがシールドを起動する。しかし、これにはグリーヴァス将軍とアサージ・ヴェントレスの策略によって内部にドロイドを搭載したボーディング・シップ2機が紛れ込んでいた。内部にいたBXシリーズ・ドロイド・コマンドー（コマンド・ドロイド）はまず基地の歩哨（CT-327）をスタン・バトンで即死させると、ゲリラ交戦を始めた。オナイナーは、まずドミノ分隊のドロイドベイトと別の分隊のナブを送り出したが、二人とも即死。軍曹もレーザーで撃たれてしまう。基地制圧が完了するとコマンド・ドロイドはグリーヴァス将軍に基地制圧を報告した。
ドロイドベイト以外のドミノ分隊は辛うじて外に逃げ出すが、カタップが怪物リシ・イールに捕食されてしまう。基地が乗っ取られたことを知らないレックス達は基地に入ろうとするものの、待ち構えていたコマンドー・ドロイドから奇襲を受け、シャトルを破壊されながらもなんとか脱出に成功する。脱出した先には生き残った三人の新兵がいたが、そこで再びリシ・イールが襲撃。それをレックスはハンド・ブラスターの一発で仕留める。そしてレックスとコーディは新兵達をまだ実戦による傷や汚れのない装甲服を身につけた「シャイニー（ピカピカ組）」と呼んで基地の奪還作戦を立てた。
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レックスがコマンドー・ドロイドに成りきりセキュリティを突破、正面ゲートから侵入しコーディや「ピカピカ組」はドロイドたちを全滅、基地の奪還に成功した。
だが、基地奪還後、間もなくグリーヴァス将軍のカミ―ノ攻撃用艦隊がリシ・ムーンに到着する。レックス達は共和国艦隊に警告しようとするも、通信装置には異常なしの信号を送り続けるよう細工が施してあり修正不可能であった。さらにドロイドからの応答がない様子を見てグリーヴァスは、次にOOMコマンダードロイド率いる増援部隊を向かわせる。これに気づいた五人のクローンは、一年のほとんどが冬であるこの星の寒さを凌ぐために基地に設置された暖房の燃料である液体ティバナで基地と増援部隊ごと爆破させることを計画した。そうすれば、基地からの信号が途絶え共和国艦隊が異変に気づくからだ。
こうして再び、生き残ったクローン達と増援のドロイド部隊との間で交戦が始まった。しかし、肝心の起爆装置の遠隔スイッチが作動しなくなってしまう。ヘヴィは一人基地に残って修理を試み、ドロイドたちが侵入するとお気に入りの武器であるヘヴィ・ロータリー・キャノンを使い一人で果敢に応戦した。足を撃たれ動けなくなったヘヴィは自らを犠牲に手動で液体ティバナを爆発させる。
ヘヴィの勇敢な行動により、リシ基地が爆発し、アナキンの艦隊が異変に気付いたのである
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基地の異変に気付いたアナキンはすぐに艦隊をリシ・ムーンに向かわせた。これによりグリーヴァスの艦隊と共和国の艦隊がリシ・ムーン上空で鉢合わせし砲撃戦を繰り広げることとなったが、分離主義者側に分が悪いとみたグリーヴァス将軍によって、分離主義勢力の艦隊は撤退、ヴェントレスが潜入中のカミーノが奇襲を受けることはなく、アナキンたちにカミーノの危機が伝わったのだ。そしてアナキンの旗艦レゾリュートに戻ったレックスは、ファイヴスとエコーを第501大隊の隊員に任命した。
カミーノを襲撃するという計画を知ったアナキンとオビ＝ワンは、シャク・ティと、ラマ・スーの待つカミーノの首都・ティポカシティに向かい、戦いに備えていた。第501大隊のファイブスとエコーは、99と再会。ヘヴィの事を尋ねる99号に、二人はヘヴィがリシ・ムーンで奮闘し、戦死したことを告げる。99はヘヴィの死に悲しみ、二人にヘヴィが訓練所を卒業したときにくれたメダルを見せた。
カミーノにグリーヴァスの艦隊が到着。アナキンはファイターを飛ばして以前のマレヴォランスへの攻撃に参加していたパイロット・ブロードサイドと共に、グリーヴァス艦隊を攻撃。オビ＝ワン曰く"簡単に"やり過ごす事ができた。
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しかし、戦いの際にカミーノの海に戦艦の破片が落下。海中にて準備していたアクア・ドロイドは、破片に偽装された船の部品を組み立て、カミーノへの攻撃を開始する。グリーヴァスに率いられたトライデント・ドリルは建物を攻撃。この襲撃で、ARCトルーパーのハヴォックが死亡。また、グリーヴァスを倒そうとしたARCトルーパー・コルトも、ヴェントレスのフォースにはかなわず、ライトセーバーで刺殺された。ヴェントレスは、グリーヴァスの前から立ち去り、入れ替わりにオビ＝ワンがやって来た。
一方で、エコーとファイブスは、キャプテン・レックス、コマンダー・コーディ、戦闘要員ではないが力になりたいという99、さらには訓練生と共にドロイドを撃破したものの、この戦いで99が背後から撃たれて戦死した。
グリーヴァスはオビ＝ワンと戦い、DNA保管室に向かったヴェントレスはアナキンと対決。グリーヴァスは逃走する。ヴェントレスもジャンゴ・フェットのDNAサンプルを盗もうとしたが、アナキンたちに止められ、作戦は失敗。シャク・ティと、ARCトルーパー・ブリッツの活躍もあり、共和国軍は、大勝利を収めたのだった。戦いの後、レックスとコーディはファイブスとエコーの活躍をたたえ、二人を正式にARCトルーパーに任命したのだった。
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惑星ファリーンが分離主義勢力の進行を受けた。この時、ファリーンで共和国軍と分離主義勢力が戦闘を繰り広げたものの共和国部隊は全滅し、グリーヴァス将軍率いる部隊は次なる目標をボサウイに決めた。
圧倒的な勢いで惑星ファリーンを陥落させたグリーヴァス将軍は6隻のミュニファスント級フリゲートからなる艦隊を率いてボサウイへ侵攻する。一方、共和国側はアナキン・スカイウォーカー将軍とその弟子アソーカ・タノ率いるヴェネター級スターデストロイヤー3隻を派遣してボサウイ防衛に当たらせた。
戦闘が始まるとボサウイを取り囲む小惑星帯にAT-TE部隊を配置し、敵が小惑星帯に入った所を背後から攻撃するというアナキンの奇策が功を奏し、連合軍艦隊は大混乱に陥り全滅、グリーヴァス将軍一人が辛くも逃げ延びた。こうして戦いは共和国軍の大勝に終わったが、戦闘の最後にアナキンのドロイドR2-D2が行方不明になるというトラブルが発生してしまう。
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R2-D2が行方不明になったが、オビ=ワンはアナキンにグリーヴァス将軍の通信傍受基地を発見するよう命令する。アナキンには新たなアストロメク、R3-S6が支給されるが、失敗を繰り返すR3を「ドジゴー（ドジな金色のドロイド）」と呼んでいた。アナキンは感情表現の豊かでアストロメクドロイドとしても優秀なR2を追憶する。そしてR3と共にスカイトップ・ステーションを捜索していると、R2の声が通信チャンネルで入ってきた。これを追跡したアナキンは分離主義勢力のスカイトップ・ステーションを発見したのである。
アソーカ・タノが通信傍受基地の原子炉を探していると、スカイトップ・ステーションでグリーヴァスに発見され対決することになった。その頃アナキンはR2-D2を発見。マグナガード・ドロイドを全滅させ、R2を取り戻し、キャプテン・レックスのいるメインハンガーへ向かった。同じ頃グリーヴァスとの対決で劣勢に陥っていたアソーカは、ドロイドの棚の上に隠れていた。すると、同行していたR3が独立星系連合によりクラッキングされたスパイであることが判明する。それまでこのドロイドが行っていた「ドジ」も意図的な妨害工作だったのである。
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アソーカが捕縛され、メインハンガーでは戦いが起きていた。しかし、アソーカがグリーヴァスの元から逃げ出すと、メインハンガーへ行き、マスターを救助する。そしてR2がR3を大破すると、崩壊するスカイトップステーションからアナキン、アソーカ、キャプテン・レックス、R2、デナル軍曹、その他のクローン1名が脱出した。
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惑星ローディアが危機に瀕していたため、元老院のパドメ・アミダラと代議員ジャー・ジャー・ビンクスは実態調査のために、C-3POをつれ、ローディアに向かった。ローディアを代表する元老院議員であるオナコンダ・ファーはパドメの父が若いころに携わっていた難民救済運動を手助けしていた縁でパドメの一家とは家族ぐるみの付き合いをしており、パドメにとっては伯父同然の存在だったのである。しかしローディアに到着すると、パドメが助けようとしていたはずのオナコンダ・ファーがヌート・ガンレイの説得を受け分離主義勢力に介入してしまったことを知る。メイン・ハンガーに残されたジャー・ジャーと3POはクラブ・ドロイドの攻撃を受け、議員を救出しようとするが、パドメの宇宙船から発見されたジェダイのローブをまとったジャー・ジャーはやってきたヌート・ガンレイにジェダイと誤認されてしまう。ドロイドの攻撃を抑えたジャー・ジャーは、何度か死亡したかに思われつつも生き延びていた。水中生物の協力を得たジャー・ジャーと救援に駆け付けたグリーン中隊がガンレイを逮捕すると、パドメは「オナコンダが共和国への翻意を示したのはガンレイを捕縛するための演技であった」という体裁を整え、彼が共和国に戻れるよう取り計らった。これを受けてオナコンダは共和国に戻り、パドメに謝罪した。
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ローディアで捕縛されたガンレイがジェダイクルーザー・トランクィリティでルミナーラ・アンドゥリィとアソーカ・タノにより連行されると、ドゥークーは、アサージ・ヴェントレスにガンレイの救出を命じた。クルーザーが攻撃を受け、ルミナーラとコマンダーグリーが通路に向かい、アソーカは、ガンレイ救出にやってきたヴェントレスと戦うことになる。アソーカは閉じ込められ、ガンレイが救出されかけるが、寸前でルミナーラが現れ、形勢が逆転する。アソーカは、ヴェントレスを相手にジェダイ・マスター一人では勝てないことを知っていたが、ルミナーラは、一人で暗殺者を追ってしまう。そんなアソーカにセネイト・コマンドー・キャプテン・アーガイアスが「よき兵士は正しいと思ったら行動をためらわない。」と助言する。それを聞いたアソーカは、ルミナーラの応援に駆けつけた。しかし、これは分離主義勢力と内通していたアーガイアスの仕掛けた罠であった。ヴェントレスが脱出すると、アーガイアスが内通者としての本性を現し、ヴェントレスとガンレイを連れて逃走してしまったのだ。
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アーガイアスとヴェントレスによって奪還されたガンレイを追い、ヴァセック3にたどり着いたキット・フィストーとナダール・ヴェップはガンレイを守るドロイドたちを倒すが、ガンレイは既にこの星を立ち去っていた。ガンレイを捕まえられなかった代わりに、ドゥークーはグリーヴァスをこの星に呼び戻した。グリーヴァスはキット・フィストーらの迎撃を受けるが、平然と対処し、クローンを次々と一掃していった。ついにグリーヴァスがペットである巨獣ゴアをけしかけ、キット、ナダール、クローン・キャプテンを襲わせるが、ジェダイは生き残り、ゴアを返り討ちにして殺してしまった。ナダールが力を身につけてきていると、グリーヴァスが現れ、師と弟子は離れ離れになってしまう。とうとうナダールも殺害され、キットは単身ヴァセック3を脱出した。
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アナキン・スカイウォーカーはドゥークーの捕縛を試みるも、行方不明となってしまう。彼のマスターであるオビ＝ワン・ケノービは、スカイウォーカーからの最後の連絡があった座標へ向かい、そこにあった分離主義者のフリゲート艦に向かう。フリゲート内で合流した2人は目標を達成するためにドゥークーのところへ向かい、それと同時にアナキンのクルーザー「レゾリュート」がフリゲートに砲撃を開始する。だがドゥークーはソーラー・セーラーで船を脱出してしまう。彼を追うためアナキン達はシーシピード級シャトルでソーラー・セーラ―を攻撃する。伯爵の船はダメージを負い惑星ヴァンコアに墜落するが、ジェダイの船も戦闘でダメージを負い、制御を失って同様に惑星ヴァンコアへ墜落した。
先に墜落したドゥークーを捜索していたとき、スカウォーカーとケノービは猛獣ガンダークの棲む洞窟に閉じこめられる。彼らはガンダークや地下から噴き出す毒ガスに苦しめられたが、駆け付けたパダワン・アソーカ・タノとクローン・トルーパー部隊に救出された。
一方ドゥークーはヴァンコアに不時着にした後、ホンドー・オナカー率いるウィークウェイの海賊団と遭遇し、彼らの拠点フローラムへ連れていかれた。
惑星フローラムへとウィークウェイの海賊に連れて行かれた独立星系連合の国家主席ドゥークー伯爵はその場でホンド―たちに拘束されてしまう。
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共和国は国家主席ドゥークー伯爵の身柄を引き取るため、海賊の首領ホンドー・オナカーと取引することになり、海賊が望むスパイスを届けるという条件を呑む決定を下す。この任務を引き受けた外交チームの出発に先立ち、ジェダイ将軍のオビ＝ワン・ケノービとアナキン・スカイウォーカーが海賊基地へ派遣され、囚人が本物のドゥークー伯爵であることを確認した。しかし、儲けを3倍にしようと企んだオナカーは、2人のジェダイも捕まえてドゥークーと一緒の牢獄に入れた。一方、最高議長シーヴ・パルパティーンはカーラス元老院議員、ジャー・ジャー・ビンクス代議員に海賊との交渉を任せ、コマンダー・ストーンのクローン・トルーパー部隊を護衛役に割り当てた。彼らはスカイウォーカーとケノービも海賊に捕まっていることを知らないまま、スパイスを載せたニュー級シャトルでフローラムへ向かった。
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フローラムの大気圏に入った直後、シャトルは海賊のバーブ・メンティアによって撃墜された。ターク・ファルソを筆頭とする海賊の裏切り者一派が、オナカーには秘密でスパイスを横取りしようと考えたのである。カーラスがシャトルの墜落で命を落としたため、ビンクスが代理で外交チームを率いることになった。彼らは一度ファルソの一味にスパイスを奪われたが、ビンクスの活躍によってスパイスが海賊に渡る事は阻止され、海賊基地の動力供給装置を破壊することにも成功する。ジェダイは拘束具を逃れてビンクスと合流したが、そのころドゥークーは既に基地から逃げ出していた。伯爵がいなくなった今、これ以上海賊と関わる理由もないと判断したジェダイは、復讐されないことに驚くオナカーを尻目にフローラムを去っていった。
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ジェダイ将軍アイラ・セキュラ率いる共和国宇宙軍が、惑星クエルの大気圏高層で分離主義勢力宇宙艦隊と交戦した。両軍の主力艦から出撃したスターファイター中隊が激しい航空戦を繰り広げ、双方が多大な犠牲をはらうも、次第にアイラ率いる第327星間兵団が劣勢になる。分離主義勢力を指揮するタクティカル・ドロイドの司令官、TF-1726の指示によってミュニファスント級スター・フリゲートのターボレーザー砲撃により2隻のヴェネター級スター・デストロイヤーを撃墜され、残りはアイラの旗艦である「リバティ」のみとなり、さらに「リバティ」に止めを刺すべくB2-RPバトル・ドロイドがフリゲートから出撃する。その時、ジェダイ・ナイト・アナキン・スカイウォーカーの「レゾリュート」が救援に駆け付け、「リバティ」へLAAT/iガンシップを送り出した。スカイウォーカー、パダワンのアソーカ・タノ、クローン・キャプテンCT-7567（レックス）率いる第501軍団の兵士たちは、バトル・ドロイドの直接攻撃を受けていた「リバティ」に乗り込み、セキュラやコマンダーCC-5052（ブライ）と合流した。艦内に侵入したバトル・ドロイドと戦いながらハンガー・ベイへ向かっていたとき、スカイウォーカーは爆風から仲間を守ろうとして重傷を負った。セキュラ、タノはスカイウォーカーを改造型カンセラー級クルーザーに運び込み、数名のクローンとともに「リバティ」から脱出する。しかし、彼らのフリゲートはヴァルチャー・ドロイドの攻撃で故障し、ハイパードライブが誤作動した。戦場に残されたウルフ・ユラーレン提督は戦闘を中止し、ジェダイのジャンプ位置の特定・捜索を開始した。
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ジェダイ将軍アイラ・セキュラ、アナキン・スカイウォーカー、パダワン・アソーカ・タノ、クローン・コマンダー・ブライ、キャプテン・レックスは故障したリパブリック・フリゲートでマリダンに不時着し、ルアメンの平和主義者テー・ワット・カーが治める村に辿り着いた。カー長老はクローン戦争からの中立を望んでいたが、重傷を負っていたスカイウォーカーの治療を手助けした。それからしばらく後、分離主義者のロク・ダード将軍が新兵器デフォリエーターのテストをするためマリダンを訪れた。デフォリエーターは機械を一切傷つけることなく生命体だけを滅ぼすことのできる大量破壊兵器だった。
ダード将軍がルアメンの村でデフォリエーターをテストしようとしていることを知ったジェダイは、ダードの基地から盗んだ偏向シールド発生装置を使って村を防衛した。遠距離からのデフォリエーター発射を無効化した後、ジェダイとクローンは白兵戦でバトル・ドロイドの大隊を迎え撃つ。戦いの終盤には村のバリケードが破れれるも、テー・ワット・カーの息子、ワグ・トゥーたちも侵略者の撃退に力を貸したことで、彼らはこの戦いで分離主義者の新兵器を破壊することに成功。ダード将軍を逮捕した。
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クローン戦争中、銀河共和国はパントラン議会の依頼を受けて極寒惑星オルトー・プルトニアに軍事施設グリッド・ステーションを設立した。一方、独立星系連合もこの惑星に密かに基地を設置していた。しかし、両勢力の基地はオルトー・プルトニアの原住種族であるタルズによって襲撃され、生存者を1人も残さず壊滅する。
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グリッド・ステーションとの連絡が途絶えた後、ジェダイ最高評議会はジェダイ将軍のオビ＝ワン・ケノービとアナキン・スカイウォーカー、クローン・トルーパー部隊をオルトー・プルトニアに派遣し、真相を調査させることに決めた。ケノービとスカイウォーカーはパントランの政治家であるリヨ・チューチー元老院議員、パントラン議会の書記長を務めるチー・チョーらを伴い、極寒惑星に降り立った。惑星の雪原にLAAT/iガンシップを着陸させると、ケノービとスカイウォーカーはグリッド・ステーションの近くでチョー書記長やチューチー議員と顔を合わせ、ともに基地の中へ足を踏み入れた。基地の司令センターの周囲には氷結したクローン・トルーパーたちの死体が散乱しており、チョー書記長は連合軍がこの星へ侵入したに違いないと決めつけた。しかし、床に落ちていたクローンのヘルメットが槍で貫かれていることに気づいたケノービは、書記長の説を否定した。クローン・キャプテンCT-7567（レックス）の報告で、付近に分離主義者の基地があることが明らかになると、ケノービとスカイウォーカーはクローン数名を連れフリーコ・バイクで現地へ赴く。彼らはXTビートル・トランスポート2台を連結させた前哨基地の中へ入り、ここでも共和国基地と同様の襲撃が行われたことを知った。ケノービはB1バトル・ドロイド685が残したホログラム通信記録を発見し、襲撃者の正体がこの星の先住民であることを突き止める。その後、ケノービとスカイウォーカーはタルズの村を訪れてメドチャ・ウォントと出会い、部族を率いるタイ＝セン酋長に対面を求めた。タルズは銀河ベーシック標準語を話せなかったが、スカイウォーカーは2種族が握手している絵を描いて友好を求め、パントランの代表者との話し合いに参加してほしいと伝えた。グリッド・ステーションに戻った後、ケノービとスカイウォーカーはオルトー・プルトニアに先住民がいたことをチョー書記長やチューチー議員に伝えた。チョーはタルズを攻撃して追い払うべきだと主張したが、ジェダイが話し合いの約束をつけてきたため、仕方なく会合場所に同行した。彼らはフリーコ・バイクやBARCスピーダーに乗って分離主義勢力前哨基地の近くへ向かい、タイ＝セン酋長と対面する。タイ＝センはプロトコル・ドロイドC-3POによるタルジ語の通訳を介して共和国やパントランに対する友好の意を表明し、あまり自分たちの土地に長逗留してほしくないと伝えた。するとチョーは穏やかな雰囲気を破って会話に割って入り、オルトー・プルトニアはパントランの保護領であり、タルズが自分たちに出て行けなどと命じる権利はないと言い放ってタイ＝センを激怒させた。ジェダイやチューチー議員の願いもむなしく交渉は決裂し、チョーとタイ＝センは種族間の戦争開始を宣言する。キャプテン・レックスはチョーの指令に従うべきかどうかスカイウォーカーに意見を求め、書記長の身を守るよう指示された。チョー、レックス、クローン兵士たちがフリーコ・バイクやBARCスピーダーに乗って去った後、スカイウォーカー、ケノービ、チューチーは戦いを止める方法について話し合った。ジェダイの助言のもと、チューチーは書記長の決定を覆すため母星パントラに連絡を取り、下院議長にオルトー・プルトニアの現状を報告した。
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チョー書記長とレックスの率いるスピーダー部隊は、雪の降る峡谷でナーグラッチにまたがったタルズの戦士と相対した。チョーから攻撃を命じられたレックスは、スカイウォーカー将軍の指令は書記長の護衛だけだと反論したが、タルズの攻撃が激しさを増したため応戦を余儀なくされた。タルズは投げ槍を使ってチョーのグループを攻撃し、数名のクローンを殺害する。レックスがタルズのナーグラッチと衝突してフリーコ・バイクから降りると、チョーと他の兵士たちもレックスのリードに従って乗り物から降り、車両を並べて防衛用の円陣を形成した。しかし、タルズはバリケードの中に向けて次々と槍を投げ込み、チョー書記長を警護していた2名のパントラン・ガードの命を奪う。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
タルズは投げ槍の攻撃を継続しつつ、ナーグラッチにまたがった戦士を円陣の中へ突撃させた。レックスはハンド・ブラスターで応戦し、数名の戦士を倒したが、彼ら全員を撃退することはできず、チョーと部下たちに退却を命じた。チョーは未開の部族に背を向けて逃げ出すのを拒んだが、その後すぐ投げ槍に胸を貫かれ、致命傷を負う。レックスはチョーに止めを刺そうとするタルズを倒し、書記長をBARCスピーダーの機体に乗せて戦場から走り去った。その頃、グリッド・ステーションから飛翔したLAAT/iガンシップの中では、ケノービ、スカイウォーカー、チューチーがパントラン議会のメンバーと連絡を取っていた。パントラン議会はタルズに宣戦布告したチョー書記長の行動を越権行為とみなし、彼を解任することに決めた。議会からパントランの全権大使に任命されたチューチー議員は、経験豊かなジェダイたちにタルズとの交渉を頼んだが、ケノービはこの問題を解決できるのは当事者である議員だけだと答えた。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
レックスとクローン・トルーパーの生存者たちは峡谷の中をスピーダーで走り抜けたが、途中でタイ＝センの戦士たちに待ち伏せされ、棍棒の攻撃で数名のトルーパーを失った。間もなく共和国の兵士たちは崖の端に達し、氷でできた橋を通過しようとしたが、両勢力が接近したことで橋が崩れ落ち、2名のトルーパーがスピーダーもろとも崖の底に落下してしまった。崖の行き止まりに追い詰められたレックスたちは、スピーダー・バイクから降りて防衛線を張り、ブラスターで数名のタルズ戦士を倒した。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
タルズの部族がクローン・トルーパーの生存者に最後の攻撃を仕掛けようとしていたとき、ジェダイのLAAT/iガンシップが戦場に到着し、レックスたちの近くに着陸した。スカイウォーカーやケノービがガンシップから降りてくると、レックスはこの戦いで11名の部下を失ったことを報告した。息も絶え絶えのチョーは、自分が死んでもタルズとの戦いを続けるようチューチーに命じたが、彼女は議会が書記長を解任したことを伝え、タルズと和解するつもりだと答えた。チョーは議会の対応に驚き、ショックを受けながら息を引き取った。その後、チューチーはC-3POを引き連れて両勢力の間に歩みだし、タイ＝センと一対一の対話に臨む。彼女は、民のために死ぬのは尊い犠牲だが、民のために生きるのはそれ以上に尊いことだと語り、槍を地面に突き刺してこれ以上戦う意思がないことを表明した。するとタイ＝センも自らの槍を地面に刺し、彼女の言葉に応えた。チューチーはこの先オルトー・プルトニアを対等な交渉相手として扱うつもりだと告げ、種族間に和平をもたらした。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
惑星ナブーでグンガンの家畜が謎の変死を遂げる事件が発生し、分離主義者の偵察ドロイドが発見される。パドメとジャージャーがナブーに向かい秘密のラボの存在を突き止めるが、ドクター・ヴィンディに捕まってしまう。ヴィンディはこの秘密ラボでかつて絶滅したはずである猛毒の致死性ウイルス「ブルー・シャドー・ウイルス」を空気中で増殖できるようにし、それをつめた爆弾を銀河中にばらまきウイルスを広めようとしていた。ナブーが危機にさらされていることを聞いたアナキン・スカイウォーカーとオビ＝ワン・ケノービさらにパダワン・アソーカはヴィンディの基地を発見。グンガン族のペッピ・バウとともにヴィンディを逮捕し、ブルー・シャドー・ウイルスの爆弾もすべて処理した。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
ナブーの危機を救うと、アナキンたちはシャトルでヌーボ・ヴィンディを連行しようとする。そんな中、制圧した地下のラボで、一体のドロイドが爆弾を所持していることが発覚した。ヴィンディを首都のシードまでつれてゆくと、地下のラボでは爆弾が爆発し、アソーカとパドメ、さらにジャー・ジャーとレックスその他のクローンがウイルスに感染してしまう。これを聞いたアナキンとオビ＝ワンはアイエゴに行き、ウイルスの解毒剤になる「リークサの根」を発見するが、アイエゴには「ドロル」と呼ばれる幽霊の噂が広がっていた。ためしにアナキンとオビ＝ワンは星を出ようと試みるが、分離主義者が仕掛けたレーザーに狙われてしまう。
アイエゴ評議会にそのことを報告すると、オビ＝ワンは廃棄されたバトルドロイドを再プログラミングし所持していたいわゆるドロイドオタクのジェイボ・フッドからヴァルチャー・ドロイドを借り受ける。ジェイボはヴァルチャー・ドロイドをリモコンで操れるようにしていた。これを駆使してレーザーの発電機を破壊すると、二人はナブーに戻り、ウイルスに感染したジェダイ・パダワンと議員、クローン兵を医療基地まで送り届けた。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
共和国軍は長らく侵略されていたライロスを開放するため、ライロス進行を開始する。アナキン・スカイウォーカー率いるヴェネター級スターデストロイヤー3隻がライロスの封鎖線を開放するため、ライロス上空でマー・トゥークのライロス封鎖艦隊と交戦する。アソーカ率いるブルー中隊、「アックス」「スラマー」「キックバック」「タッカー」「スウープ」が出撃するが、名将マー・トゥーク率いる軌道封鎖艦隊は共和国軍を罠にかけ、4隻の増援艦隊で共和国軍を包囲、戦闘機の自爆作戦で猛攻を掛ける。これによりアソーカが率いるブルー中隊は壊滅し、ヴェネスター級スターデストロイヤー「レディーマー」が撃沈されるという大損害を受ける。アソーカと「スランマー」と「スゥープ」は辛くも旗艦「レゾリュート」に着艦することができたが、「レゾリュート」は被弾しユラーレン提督は重傷を負っていた。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
共和国軍は作戦を練り直し、再び封鎖戦突破を試みる。損傷が激しいヴェネター級「ディフェンダー」号にアナキンとR2だけが乗り、マー・トゥークのルクレハルク級バトル・シップに特攻。キャプテン・トゥークは辛うじて脱出に成功するが旗艦は轟沈、アソーカは「レゾリュート」の艦底を盾に戦闘機を発進、混乱した艦隊を壊滅させた。やがてレックスのシャトルがアナキンを回収し、オビ=ワンとメイス・ウィンドウ率いるアクラメイター級揚陸艦が到着、ライロスの封鎖線は突破されたのだった。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
メイス・ウィンドゥとオビ＝ワン・ケノービがライロスに向かうと、オビ＝ワンはガンシップに乗り、地上に上陸しようとする。メイスはアクラメーターI級アサルト・シップで都市ナバットへの上陸を試みるが、プロトン砲の弾幕を浴び1隻が大破。メイスとコマンダーポンズはいったん引き返す。メイスはオビ＝ワン・ケノービに、ナバットの都市を制圧しプロトン砲を無力化でき次第、地上攻撃部隊の着陸ゾーンを確保せよと告げる。オビ＝ワンはゴースト中隊を率いてナバットへ攻め込む。ナバット周辺に着陸する前、いくつかのガンシップがプロトン砲によって撃墜されるがオビ＝ワンたちは無事、ナバットに上陸、街を偵察することになった。偵察中、コマンダー・コーディ―は街の広場で住民のトワイレック達がつかまっているのを発見した。オビ＝ワンはホログラムを通じてウィンドゥに報告を行い、人質の存在が攻略を難しくしているが、不可能ではないと告げる。彼は人質を危険に晒すことなく銃砲を無力化させる作戦を思いついたが、この会話は偵察ドロイドを介してTX-20のもとへ送られていた。ドロイドは会話の主がケノービであることに気付き、陽動作戦の名手として知られる彼についての研究を開始したのだった。一方、ほかの場所を偵察していたクローンのワクサーとボイルは壊れた家の中でトワイレックの少女であるヌーマと出会う。ヌーマと彼らは次第に仲良くなった。またTX-20は、飢えたガットカーに共和国部隊を襲わせるという作戦を考えていた。共和国兵士たちの動きを見ていたTX-20はガットカーを放つよう命じる。そのころコーディからの通信を受けた2人のクローンは自分たちがかなり遅れていることに気付き、必死に言い訳を考えていた。だが、そこに突如としてガットカーが現れ、2人のクローンとヌーマは全速力で家に戻ることを強いられた。そしてヌーマがクローンたちに抜け道を示し、彼らは間一髪で地下道へと入っていったのである。他のクローントルーパーも攻撃を受けるが、オビ＝ワンはフォースを使って猛獣をなだめ、頭上の橋で隔てられた路地へと誘い込む。そしてコーディと部下たちが橋に向けて発砲し、オビ＝ワンが飛び避ける間にガットカーたちを瓦礫の下敷きにしたのだった。クローンたちは猛獣を始末したが、TX-20は彼らが消耗したことを知っていた。すると突然、ワクサーとボイルがヌーマを抱いて、近くの通りのハッチから姿を現した。オビ＝ワンはトゥイレッキ語でヌーマと話し、囚人たちのところへ案内してもらうことになる。コーディとその部下たちが陽動作戦を行い、その間にオビ＝ワン、ワクサー、ボイルがトゥイレックの囚人たちを解放するのだ。そしてオビ＝ワンが囚人たちを解放すると、ヌーマは叔父のニリム・ブリルと再会することができた。またオビ=ワンもプロトン砲を一基奪ったことで、他のプロトン砲を破壊することに成功する。だが、TX-20のキャノンからの砲撃で彼らのキャノンが破壊され、オビ＝ワンは地面に叩きつけられる。そしてヌーマがクローンの友人たちとオビ＝ワンを助けるために駆け寄った。TX-20は勝利を宣言し、彼らをあざ笑いながらオビ＝ワンとヌーマに照準を合わせる。だがそのとき、大勢のトゥイレックたちがタンクに群がり、TX-20をバラバラに引き裂いたのだった。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
TX-20が破壊されているとともにナバット上空にアクラメーター級艦が着陸し、メイス・ウィンドゥがオビ＝ワンの勝利をねぎらった。だが彼らの次の任務、すなわち首都レスーの奪回とライロスの解放はさらに難解なものだった。ワクサーとボイルはヌーマに別れを告げる。ヌーマが再び彼らを「ネラ」と呼ぶと、オビ＝ワンが翻訳し、「ネラ」は「兄弟」の意味だと告げた。そして彼らはこの惑星の解放に向け、太陽に方へと去っていったのである。
スター・ウォーズの戦い一覧 旧銀河共和国時代（1000BBY-19BBY）
ライロスに無事、共和国軍部隊を展開することに成功したメイス・ウィンドゥは部下を引き連れて、AT-TEウォーカーで断崖の道を前進していた。敵の砲撃により複数の犠牲者やAT-TEが失われる。しかし、メイスの部隊は崖近くに潜んでいた分離主義勢力の戦車部隊をライトニング中隊の助けもあって撃退しレッスーには確実に進んでいた。だがそのとき、メイスの近くに偵察ドロイドがおりメイスとコマンダー・ポンズを監視しており、共和国部隊が予想より早く首都レッスーに到達する見込みであること、そして彼らが首都奪回のために援軍を必要としていることに気付いたのだった。レッスーの司令センターで状況を見極めていたワット・タンバーは、戦術ドロイドTA-175と協議し、不利な状況ではあったが退却を拒否した。タンバーは、ウィンドゥに都市を奪回する兵力はないと考えていたのだ。彼はドロイドの全軍を都市へ配置するよう命じ、橋の防衛体制を固めた。一方、ウィンドゥ率いるAT-TE部隊とホログラムを通じて会議を行っていたアナキン・スカイウォーカーは、メイス、パルパティーン最高議長、ヨーダ、ユラーレン提督、オーン・フリー・ター議員に、彼の戦闘機部隊がライロス周辺の宙域を制圧したことを報告する。ウィンドゥも、オビ＝ワン・ケノービがジクジュアン砂漠を奪回したことを確認しており、これでライロスの南半球を制圧したことになると付け加えた。残された任務はレッスー奪回だけとなったのだ。しかし共和国部隊は疲弊しており、メイスはチャム・シンデューラ率いる「トワイレックの自由の戦士たち」の助力を求めることを決断する。だがパルパティーンはシンデューラが過激派だったことを指摘し、彼の行動は予想できないと主張した。ター議員も彼とは戦争前からのライバルであり、今でもその関係は変わっていなかった。彼はシンデューラが権力を求めていると主張する。ウィンドゥは政治的判断はターに委ねたが、人々を助けるためにしなければならないことはするつもりでいた。パルパティーンは代わりとなる援軍の派遣を要求するが、ユラーレン提督は避ける兵力がないという。ウィンドゥはシンデューラの助けなしで勝利はないと主張したのだった。