hotchpotch/wikipedia-multilingual-ir-pairs huggingface dataset:
突然変異 概要
染色体数の変化は、染色体内のDNA断片が切断されたのち再配列されるという、さらに大規模な変異を伴うことがある。たとえば、ヒト亜科（Homininae）では、2本の染色体が融合してヒト2番染色体が形成された。この融合は他の類人猿の系統では起こっておらず、当該の染色体は依然として独立した状態にある（参照：染色体#染色体の進化）。進化において、このような染色体の再編成は、個体群間の交配の可能性（遺伝子流動）を低下させることで遺伝的差異を保存し、集団の分化を加速して新たな種の形成を促進する役割を担う可能性がある。
トランスポゾンのようにゲノム上を移動可能なDNA配列は、動物や植物の遺伝物質の大部分を占めており、ゲノムの進化において重要な役割を果たしてきた可能性がある。たとえば、ヒトゲノムには100万を超えるAlu配列が存在し、現在では遺伝子発現の制御などの機能に利用されている。これら可動性DNA配列がゲノム内を移動する際には、既存の遺伝子に変異を引き起こしたり、遺伝子を欠失させたりすることで、遺伝的多様性をもたらす可能性がある。
致死性のない突然変異は遺伝子プール内に蓄積し、遺伝的変異を増加させる。こうした変化の中には、自然選択によって頻度が抑制されるものがある一方、他の「より有利な」突然変異は蓄積し、適応的変化を引き起こす場合がある。
突然変異 概要
たとえば、ある蝶（チョウ）が新たな突然変異を持つ子を産むことがある。これらの突然変異の大部分は形質に影響を与えないが、まれに子孫の体色を変化させ、捕食者から見つかりにくく（または見つかりやすく）するような変異が起こる場合もある。この変化が有利であれば、その蝶の生存率と繁殖成功率がわずかに高まり、時間の経過とともにこの変異を持つ個体が集団内で占める割合が増加する可能性がある。
中立突然変異とは、個体の適応度に影響を及ぼさない突然変異と定義される。このような変異は、遺伝的浮動によって時間とともに頻度が増加することがある。大多数の突然変異は、生物の適応度に有意な影響を与えないと考えられている。また、DNA修復機構は、ほとんどの塩基配列の変化を恒久的な変異となる前に修復することができる。さらに多くの生物は、不可逆的に変異した体細胞を除去するアポトーシス経路（細胞死経路）のような仕組みを備えている。
有益な突然変異は、生存率や繁殖成功率を向上させ、進化的適応に寄与することがある。
突然変異 原因
突然変異には、以下の4つの主要な経路によって生じる。（1）自然発生的な突然変異（分子の自発的変化による）、（2）自然発生的なDNA損傷に対する誤りがちな複製バイパス（誤りがちな損傷乗り越え合成（error-prone translesion synthesis）とも呼ばれる）、（3）DNA修復過程におけるエラー、（4）変異原によって誘発される変異である。また、科学的実験の一環として、研究対象の細胞や生物に意図的に突然変異を導入する場合もある。
2017年のある研究では、発がん性の突然変異の66%が偶発的に生じたものであり、29%は環境要因（調査対象は69カ国に及ぶ）、5%は遺伝によるものと報告されている。
ヒトでは、平均して約60個の新たな突然変異が子に受け継がれると報告されているが、父親は加齢に伴ってより多くの変異を子に伝える傾向があり、1歳年を取るごとに、子に伝わる変異が2個ずつ増加するとされる。
自然発生変異（spontaneous mutation）は、健康で汚染のない細胞においても、ゼロではない確率で発生する。たとえば、自然に生じる酸化的DNA損傷は、ヒトでは1細胞あたり1日1万回、ラットでは同じく1日あたり10万回発生すると推定されている。自然発生変異は、次のような特定の機構によって特徴づけられる。
突然変異 原因
脱アミノ化（deamination）加水分解によって正常な塩基が非定型な塩基に変化し、元のアミノ基がケト基に置き換えられる。たとえば、シトシン（C） → ウラシル（U）、アデニン（A） → ヒポキサンチン（HX）などがあり、これらは通常、DNA修復機構によって修正される。一方、5-メチルシトシン（5MeC）→ チミン（T）への変化は、チミンが本来DNAに存在する塩基であるため、修復機構によって変異として認識され難いと考えられている。
自然発生的な突然変異の大部分は、鋳型鎖に存在するDNA損傷を誤って乗り越えて複製を継続する「誤りがちな複製（error-prone replication bypass：損傷乗り越え合成）」によって引き起こされるという証拠が増加している。たとえば、マウスでは突然変異の大部分が損傷乗り越え合成によるものであるとされている。同様に、酵母におけるKunzらの研究では、自然発生的な一塩基置換および欠失の60%以上が損傷乗り越え合成に起因することが示されている。
突然変異 原因
DNAに自然に生じる二本鎖切断は発生頻度が比較的低いものの、その修復過程ではしばしば変異が引き起こされる。二本鎖切断の修復における主要な修復経路は非相同末端結合（non-homologous end joining、NHEJ）である。NHEJでは、両末端の再結合させるために少数のヌクレオチドが除去され、配列末端の整合性がやや不正確なまま結合される。その後、欠損部を埋めるために新たなヌクレオチドが追加される。これにより、NHEJはしばしば突然変異を導入する結果となる。
誘発突然変異（induced mutation）とは、遺伝子が変異原や環境要因と接触した結果、その遺伝子に生じる変化である。
分子レベルにおいて誘発突然変異を引き起こす原因には次のようなものがある。
突然変異 原因
化学物質
ヒドロキシルアミン
塩基類似体（例：ブロモデオキシウリジン：BrdU）
アルキル化剤（例：N-エチル-N-ニトロソウレア：ENU）これらの物質は、DNAが複製中であっても、非複製中であっても、変異を引き起こす可能性がある。一方、塩基類似体は、複製中のDNAに取り込まれた場合にのみ変異を生じさせる。それらの化学的変異原は、特有の作用により、遷移（transition）、転位（transversion）、または欠失（deletion）を引き起こす可能性がある。
DNA付加体を形成する物質（例：オクラトキシンA）
DNA挿入剤（例：臭化エチジウム）
DNA架橋剤
酸化的損傷
亜硝酸アデニン（A）およびシトシン（C）のアミン基をジアゾ基に変換し、水素結合のパターンを変化させる。これにより複製時に誤った塩基対形成が生じる。
放射線
紫外線（UV）（非電離放射線を含む）DNA中の塩基であるシトシンおよびチミンは、放射線によって性質が変化しやすい。紫外線は、DNA鎖内の隣接するピリミジン塩基同士を共有結合させて、ピリミジン二量体を形成させる。また、特に長波長のUVAは、DNAに酸化的損傷を及ぼすこともある。
電離放射線（Ionizing radiation）ガンマ線などの電磁放射線や重イオン粒子など粒子放射線への曝露は突然変異を誘発し、発癌や死に至ることがある。
従来は、突然変異は偶然に生じるか、変異原によって誘発されるものと考えられていた。しかし現在では、細菌を含む「生命の系統樹」全体において、変異を引き起こす分子機構が存在することが明らかになっている。S.M.ローゼンバーグは次のように述べている。『これらの機構は、高度に制御された突然変異の様相を呈しており、ストレス応答によって時間的に上方制御される。細胞や生物が環境に適応できていない、すなわちストレス下にあるときに活性化し、生物の適応を加速させる可能性がある。』これらは自己誘導的な変異誘発機構（self-induced mutagenic mechanism）であり、生物の適応速度を高めることから適応的変異誘発機構（adaptive mutagenesis mechanism）とも呼ばれる。その例には、細菌のSOS応答、異所性染色体内組換え（ectopic intrachromosomal recombination）、染色体の重複など、さまざまな染色体レベルのイベントが含まれる。
突然変異 変異の種類
遺伝子配列は、さまざまな要因により変化しうる。遺伝子変異が健康に及ぼす影響は、その変異が発生した部位、およびそれが必須タンパク質の機能を変化させるかどうかによって異なる。遺伝子構造の変異は、いくつかの種類に分類される。
染色体構造における大規模な変異には、次のようなものが含まれる。
突然変異 変異の種類
染色体再編成（chromosomal rearrangement）染色体構造に生じる大規模な変化で、適応度の低下をもたらすことがある一方、孤立した近交集団において種分化をもたらすこともある。次のような変異型が含まれる。
染色体転座（chromosomal translocation）非相同染色体間で遺伝子領域が交換される。
染色体逆位（chromosomal inversion）染色体内の一部領域の向きが反転する。
非相同染色体間の交差（chromosomal crossover）
介在欠失（interstitial deletion）1本の染色体内でDNAの一部が除去され、もともと離れていた遺伝子が隣接するようになる。たとえば、ヒト星状細胞腫（脳腫瘍の一種）から単離された細胞において、膠芽腫融合遺伝子（Fused in Glioblastoma、FIG）と受容体型チロシンキナーゼ遺伝子（ROS）との間の配列が欠失し、FIG-ROS融合タンパク質が生成されることがある。この異常な融合タンパク質は、恒常的に活性を持つキナーゼ活性を示し、正常細胞から癌細胞へと変化する発癌性の形質転換（現象）を引き起こす。
突然変異 変異の種類
小規模変異は、1つまたは少数のヌクレオチドに影響を及ぼす変異である（影響が1ヌクレオチドのみの場合は、点突然変異（点変異、point mutation）と呼ばれる）。小規模変異には次のような型がある。
挿入（insertion）DNAに1つ以上の余分なヌクレオチドが追加される変異である。通常は、トランスポゾン（転移因子）、または反復配列の複製エラーによって引き起こされる。遺伝子のコード領域に挿入が生じると、mRNAのスプライシングが変化する（スプライス部位変異）か、リーディングフレームがずれる（フレームシフト）ことで、遺伝子産物に重大な影響を及ぼす可能性がある。挿入は、原因となったトランスポゾンの除去によって修復されることがある。
突然変異 変異の種類
置換変異（substitution mutation）化学物質の作用やDNA複製時の誤作動により、1つのヌクレオチドが別のヌクレオチドに置き換わる変異である。この変化は、転移または転換に分類される。
転移一般的に、プリン塩基同士（A ↔ G）あるいはピリミジン塩基同士（C ↔ T）の置換であり、比較的頻度が高い。亜硝酸、塩基の誤対合、あるいはBrdU（変異原性塩基類似体）などによって引き起こされることがある。
転換プリンとピリミジンの間の置換（C/T ↔ A/G）であり、転移よりも発生頻度は低い。たとえば、アデニン（A）からシトシン（C）に変わる場合がある。
点突然変異（点変異）は、DNAの単一塩基対、または遺伝子内の少数の塩基対に対する変化である。点変異は、別の点変異によって元のヌクレオチドに戻る真の復帰変異（true reversion）や、他の部位に生じた相補的な変異によって遺伝子機能が回復する第二点復帰変異（second-site reversion）によって修復されることがある。後述のように、遺伝子のタンパク質コード領域内に生じた点変異は、同義置換または非同義置換に分類される。非同義置換はさらに、ミスセンス変異とナンセンス変異に細分される。
突然変異 変異の種類
変異がタンパク質配列に及ぼす影響は、主にゲノム内のどの位置で生じたか、特にそれがコード領域か非コード領域かによって決まる。プロモーター、エンハンサー、サイレンサーなどの遺伝子の非コード調節配列に生じた変異は、遺伝子発現量を変化させる可能性があるが、タンパク質配列そのものを変化させる可能性は低い。イントロンや、既知の生物学的機能を持たない領域（例：偽遺伝子、レトロトランスポゾン）に生じた変異は、一般的に中立的であり、表現型に影響を及ぼさない。ただし、イントロン内の変異がmRNAスプライシングに影響を与えると、タンパク質産物が変化する可能性がある。
コード領域に生じた変異はタンパク質産物を変化させる可能性が高く、アミノ酸配列への影響に基づいて、次のように分類される。
突然変異 変異の種類
フレームシフト変異DNA配列に3で割り切れない数のヌクレオチドが挿入または欠失されることで生じる変異である。遺伝子が3塩基（コドン）単位で発現するため、このような挿入や欠失はリーディングフレーム（コドンの読み取り枠）をずらし、元の配列とはまったく異なる翻訳結果をもたらす。 挿入や欠失が配列の早い位置で生じるほど、生成されるタンパク質への影響は大きくなる。たとえば、CCU GAC UAC CUA という配列は、プロリン、アスパラギン酸、チロシン、ロイシンをコードする。ここで、CCU の U が欠失すると、配列は CCG ACU ACC UAx となり、プロリン、スレオニン、スレオニン、および別のアミノ酸の一部、あるいは終止コドン（xは次のヌクレオチド）を生じる可能性がある。これに対して、3の倍数の挿入または欠失はインフレーム変異（in-frame mutation）と呼ばれ、リーディングフレーム自体は維持される。
突然変異 変異の種類
点置換変異（point substitution mutation）1つのヌクレオチドが別のヌクレオチドに置き換わる変異であり、同義変異または非同義変異に分類される。
同義置換（synonymous substitution）あるコドンが同じアミノ酸をコードする別のコドンに置換されることで、アミノ酸配列には変化が生じない変異である。これは、遺伝情報の縮重性（degeneracy）に起因する。この変異によって表現型に影響が生じない場合、「サイレント変異」と呼ばれる。ただし、すべての同義置換がサイレントであるとは限らない。なお、イントロンなどの非コード領域に生じた変異も、機能的に影響がない場合はサイレント変異と呼ばれることがあるが、これらは同義置換に分類されない。
非同義置換（nonsynonymous substitution）あるコドンが、異なるアミノ酸をコードするコドンに置換され、アミノ酸配列が変化する変異である。非同義置換は、ナンセンス変異とミスセンス変異に分類される。
突然変異 変異の種類
ミスセンス変異（missense mutation）ヌクレオチドの変化によって異なるアミノ酸が翻訳される変異である。これにより、生成されるタンパク質が機能を喪失することがあり、表皮水疱症、鎌状赤血球症、SOD1遺伝子媒介性の筋萎縮性側索硬化症（ALS）などの疾患の原因となる。ただし、化学的に類似したアミノ酸への置換（例：リシン → アルギニン）の場合は、タンパク質の機能への影響は少なく、表現型に変化を与えない中立的変異となることもある。
ナンセンス変異（nonsense mutation）点変異により、mRNA上に未成熟終止コドン（premature stop codon、ナンセンスコドン）が生じ、タンパク質の翻訳が途中で終了する。この結果、切断された非機能的なタンパク質が産生されることが多い。この種の変異は、先天性副腎過形成症などの疾患と関連している。 (en:詳細は英語版 Stop codon の「変異と疾患」を参照)
ある変異により、変異タンパク質とその直接的な相互作用因子との間で、機能の正確性に変化が生じた場合、その変異は「機能に影響を与える変異」に分類される。相互作用因子には、他のタンパク質、分子、核酸などが含まれる。機能へ影響を与える変異にはさまざまなものがあり、変化の内容に応じて次のような型に分類される。
突然変異 変異の種類
機能喪失型変異（loss-of-function mutation）不活性化変異（inactivating mutation）とも呼ばれ、遺伝子産物の機能が部分的または完全に失われる（機能低下または不活性化）変異である。アレルが完全に機能を失っている場合は「ヌルアレル」（null allele）と呼ばれ、ミュラーのモルフ分類ではアモルフ（amorph）またはアモルフィック変異（amorphic mutation）に該当する。この変異に伴う表現型は通常、潜性（recessive、劣性）である。ただし、生物が一倍体である場合や、正常な遺伝子産物の量が不十分で表現型に変化が生じる場合（ハプロ不全）は例外となる。機能喪失型変異による疾患には、ギテルマン症候群や嚢胞性線維症などがある。
突然変異 変異の種類
機能獲得型変異（gain-of-function mutation）活性化変異（activating mutation）とも呼ばれ、遺伝子産物の作用が強化されたり、新たに異常な機能を獲得する変異である。新たなアレルが生じた場合、元のアレルと新規アレルを持つヘテロ接合体では、新規アレルが発現する。このため、遺伝学的には顕性表現型（dominant phenotype、優性表現型）とされる。ミュラーのモルフ分類では、機能獲得型変異はハイパーモルフ（hypermorph、遺伝子発現量の増加）やネオモルフ（neomorph、新規機能）に該当する。
突然変異 変異の種類
ドミナントネガティブ変異（dominant negative mutation）アンチモルフ変異（anti-morphic mutation）とも呼ばれ、変異型の遺伝子産物が野生型アレルの産物と拮抗的に作用し、分子機能を阻害する（しばしば不活性型）。この変異は、顕性または半顕性（semi-dominant）の表現型をもたらすことが多い。ヒトでは、p53、ATM、CEBPA、PPARγなどの遺伝子におけるドミナントネガティブ変異は、癌との関連が指摘されている。マルファン症候群は、ヒト15番染色体上のFBN1遺伝子（細胞外マトリックスの構成タンパク質フィブリリン-1をコード）における変異によって引き起こされる疾患であり、ドミナントネガティブ変異およびハプロ不全の例である。
抑圧突然変異（suppressor mutation）別の変異によって生じた表現型への影響を抑圧する（打ち消す）変異であり、二重変異体が正常な表現形を示すようになる。抑圧突然変異は2種類に分類され、元の変異と同一遺伝子内で起こる「遺伝子内型（intragenic）」と、元の変異産物と相互作用する別の遺伝子に起こる「遺伝子外型（extragenic）」がある。この種の変異に関連する代表的な疾患として、アルツハイマー病がある。
遺伝学において、突然変異はその影響に応じて、有害、有益、中立的に分類されることがある。
突然変異 変異の種類
中立的（neutral mutation）この種の変異は、生物に対して有害でも有益でもない影響を及ぼす。このような変異は世代を通じて一定の速度で蓄積し、分子時計の基礎となる。分子進化の中立説では、中立的突然変異が分子レベルでの大部分の変異における遺伝的浮動の要因になるとされる。動物や植物では、ゲノムの大部分が非コード領域または明確な機能を持たない反復配列（いわゆるジャンクDNA）から構成されているため、ほとんどの突然変異は中立的であると考えられている。
大規模スクリーニングによる突然変異の影響評価
数千から数百万におよぶ突然変異を対象とした大規模スクリーニングでは、有害な変異が多くを占める一方、一定数の有益な変異も確認されている。たとえば、大腸菌（Escherichia coli）の全遺伝子欠失スクリーニングでは、変異の約80%が適応度を低下させ、約20%が向上させた。ただし、これらの多くは環境条件に依存しており、成長への影響はごく小さかった。なお、遺伝子欠失は遺伝子全体を除去するものであり、一般的に点変異よりも大きな影響を及ぼす傾向がある。一方、肺炎レンサ球菌（Streptococcus pneumoniae）に対するトランスポゾン挿入スクリーニングでは、76%の変異体が中立的とされ、16%が適応度を著しく低下させ、6%が有益と評価された。
突然変異 変異の種類
このような分類は明らかに相対的であり、ある程度人為的な側面も持つ。ある突然変異が、環境変化によって有害から無害へ転じることもある。また、有害／有益と中立との間には連続的な勾配が存在し、多くの変異は影響がごく小さく、通常は無視できるが、特定の条件下では重要な役割を果たすこともある。さらに、多くの形質は数百に及ぶ遺伝子（あるいは遺伝子座）によって制御されており、各遺伝子座の寄与はごくわずかである。たとえば、ヒトの身長は数百種類の遺伝的多様性によって決定されるが、栄養の影響を除けば、各変異体の影響は極めて小さい。動物や植物の分類群における体長の多様性が示すように、身長（または体長）そのものも、環境条件によって有益かどうかが異なる場合がある。
突然変異 変異の種類
突然変異の「適応度効果の分布」（distribution of fitness effects：DFE）を、突然変異誘発実験や分子配列データに基づく理論モデルを用いて推定しようとする試みがなされてきた。DFEは、 強い有害変異、ほぼ中立的変異、有利変異といった異なる種類の変異の相対的な出現頻度を明らかにするために用いられる。この指標は、遺伝的変異の維持、ゲノムの劣化速度、異系交配を伴う有性生殖の維持、性と遺伝的組換えの進化など、さまざまな進化論的問題に深く関わる。また、重篤な影響が予想される変異の分布と、軽微または影響がないとされる変異の分布との差（歪度など）を追跡することで、DFEの性質を推定することも可能である。要約すれば、DFEは進化動態を予測するうえで重要な役割を果たす。DFEを研究する方法としては、実験的手法・理論モデル・解析的手法などが用いられてきた。
突然変異 変異の種類
変異誘発実験DFEを直接調べる方法として、変異を人工的に誘導し、各変異体の適応度への影響を測定する手法がある。この手法は、ウイルス、細菌、酵母、ショウジョウバエなどで実施されている。たとえば、多くのウイルスの研究では、部位特異的変異誘発（site-directed mutagenesis）によって点変異を生じさせ、各変異体の相対的適応度を測定している。大腸菌では、転位因子Tn10の誘導体をランダムに挿入するトランスポゾン変異誘発法を用いて、挿入変異体の適応度を直接測定した研究がある。酵母では、変異誘発法とディープシークエンシングを組み合わせて高品質な系統的変異体ライブラリを構築し、高速処理方式（ハイスループット）で適応度を測定する方法が開発されている。ただし、多くの変異は影響が非常に小さく、実験では検出が困難であり、また実験手法は中程度以上の影響を持つ変異のみを検出しやすい傾向がある。DNA配列解析は、こうした微少な影響を持つ変異に関する貴重な情報を提供する。
突然変異 変異の種類
分子配列解析機能喪失型変異、機能転換型変異、機能獲得型変異、および機能保存型変異の簡略図。DNAシークエンシング技術の急速な発展により、膨大な配列データが利用可能となっており、今後もさらに増加が見込まれている。DNA配列データからDFEを推定する手法が確立されており。種内および種間の配列差異を調べることで、中立的・有害・有利な変異のDFEに関する特性を推定できる。特に、この手法により、変異誘発実験ではほとんど検出できない、ごく微少な影響を持つ変異の効果を推定できるようになる。
突然変異 突然変異率
突然変異率（mutation rate）は種によって大きく異なり、それを決定づける進化的要因については、現在も研究が進められている。
ヒトでは、1世代あたりのde novo変異（新生変異）は1ゲノムあたり約50～90個とされている。すなわち、各個体には両親に存在しなかった約50～90個の新たな変異が蓄積される。この数値は、両親と少なくとも1人の子から成る数千組の「ヒトトリオ」に対する全ゲノム配列決定により推定されたものである。
RNAウイルスのゲノムは、DNAではなくRNAを基盤としており、DNAと同様に二本鎖構造を持つものもあれば、一本鎖構造のものも存在する。これらのウイルスの一部、たとえば一本鎖RNAウイルスであるヒト免疫不全ウイルス（HIV）では、複製が非常に高速に行われるうえ、ゲノムの正確性を検証する機構を欠いている。このように誤りが生じやすい複製過程により、しばしば突然変異が生じる。
突然変異 突然変異率
新生変異（de novo変異）の発生率は、生殖細胞系列・体細胞系列を問わず、生物種によって異なる。同一種内であっても個体間で変異率に差が見られる。全体として、de novo変異の発生率は遺伝的に継承される変異に比べて低く、遺伝的変異の中でも稀な形式に分類される。多くの観察結果において、de novo変異発生率は父親の年齢と正の相関を示すことが報告されている。有性生殖を行う生物では、精子提供者の生殖細胞系列における細胞分裂回数が多いことから、これは de novo変異の発生率の違いを説明する要因の一つとされている。配偶子形成の過程、とりわけ精子が急速に生成される場合には、DNA複製時のエラーが発生しやすくなる。このとき、DNA修復機構が十分に機能しない場合には、de novo変異が修復されないまま複製される可能性がある。この仮説は、精子形成の高速化に伴って変異確率が上昇すること、そして細胞分裂の間隔が短いためDNA修復が効率的に行われないことという、2つの観察結果に基づいている。さらに、生物の発生過程に影響を与えるde novo変異の発生率は、環境要因によっても上昇することがある。たとえば、一定以上の放射性元素への曝露によってゲノムに損傷が生じ、突然変異率が高まる可能性がある。ヒトでは、生涯にわたる過剰な紫外線曝露が皮膚細胞のゲノムに変異を引き起こし、皮膚癌の発症原因となることが知られている。
突然変異 突然変異率
突然変異は、その結果に関して（確率的に）完全に「ランダム」であるという前提が、長らく広く受け入れられてきた。しかし、この前提は誤りであることが示されている。変異の頻度はゲノム内の領域によって大きく異なり、DNA修復機構や変異の偏りはさまざまな因子と関連していることが明らかとなっている。たとえば、モンローらの研究では、モデル植物であるシロイヌナズナ（Arabidopsis thaliana）を対象に、機能的に重要な遺伝子は、そうでない遺伝子に比べて変異の頻度が低いことが示された。すなわち、変異は「植物にとって有利となるようなかたちで非ランダムである」と報告されている。また、従来「突然変異は適応度に関してランダムである」とする主張を支えてきた古典的な実験、たとえば、フラクチュエーションテスト（fluctuation test）やレプリカ平板法（replica plating）は、より限定的な主張、すなわち「突然変異は外部の選択的制約に対してランダムである」ことを支持しているに過ぎず、適応度全体に対するランダム性を証明するものではないとされている。
突然変異 疾患の原因
DNAのコード領域における変異は、タンパク質配列に誤りを生じさせ、部分的または完全に機能を失ったタンパク質を生じることがある。細胞が正常に機能するためには、数千種類のタンパク質が適切な時期と場所で正しく働く必要がある。そのため、生体内で重要な役割を担うタンパク質に変異が生じた場合、医学的な疾患につながる可能性がある。ショウジョウバエの異なる種間の遺伝子比較に基づく研究では、変異によってタンパク質が変化する場合、その多くは有害であることが示唆されている。具体的には、アミノ酸多型の約70％が有害な影響を及ぼし、残りは中立的あるいはわずかに有益であると推定されている。一方、遺伝子の塩基配列が変化しても、それによって作られるタンパク質に変化をもたらさない変異も存在する。酵母を用いた研究によれば、非コード領域における点突然変異のうち有害なものは7%、コード領域では12％にとどまり、残りの変異は中立的またはわずかに有益であるとされている。
突然変異 疾患の原因
生殖細胞に変異が存在する場合、その変異は子孫に受け継がれ、体のすべての細胞に存在することになる。このような変異は、遺伝性疾患の原因となる。特に、生殖細胞におけるDNA修復遺伝子に変異がある場合、それを有する個体は癌の発症リスクが上昇する可能性がある。DNA修復不全に関連する生殖細胞系列の変異については、「DNA修復不全」の記事に34種類が一覧として記載されている。その一例が白皮症であり、OCA1またはOCA2遺伝子の変異によって起こる。この疾患を持つ人々は、複数種の癌や他の疾患に罹患しやすく、視力障害を伴うことも多い。
DNA損傷は、DNA複製時のエラーを引き起こす原因となり、それが遺伝子変異を通じて遺伝性疾患につながることがある。各細胞には、DNA損傷を認識し修復する複数の経路が備わっており、酵素によってこれらの損傷は修復される。DNAは多様な要因によって損傷を受ける可能性があるため、DNA修復は、生体が疾患から身を守るための重要な仕組みである。しかし、DNA損傷が変異として固定された場合、元の正確なヌクレオチド配列が失われるため、修復機構はそれを認識できず、変異は修復できなくなる。
突然変異 疾患の原因
一方、変異は生物の体細胞に生じることもあり、このような体細胞変異は、同一個体内におけるその細胞のすべての子孫細胞に受け継がれる。特定の変異が体細胞内で世代を重ねて蓄積されると、正常細胞が癌細胞へと悪性転換する原因の一つである。
たとえば、機能喪失型変異のヘテロ接合変異（1つの正常な遺伝子コピーと、1つの変異したコピーを持つ細胞）の場合、正常なコピーがある場合は通常どおり機能することがある。しかし、その正常コピーが体細胞内で自然発生的に変異を起こすと、細胞の機能が失われる可能性がある。このような変異は、生物において頻繁に発生しているが、発生率を定量的に測定することは困難である。しかし、この発生率の測定は、癌の発症リスクを予測するうえで重要である。
点突然変異は、DNA複製中に自然に発生する場合があるが、変異原の影響によって発生頻度が上昇することもある。変異原には、紫外線、X線、極端な高熱などの物理的要因のほか、塩基対の配置を誤らせたり、DNAの二重らせん構造を損なったりする化学物質も含まれる。癌と関連する変異原は、癌の発症機構やその予防法を理解するうえで、広く研究対象とされている。
突然変異 有益な突然変異と条件突然変異
タンパク質配列に変化をもたらす突然変異は、生物にとって多くの場合、有害となる。しかし、特定の環境下においては、有益な効果をもたらすこともある。たとえば、突然変異によって野生型よりも特定の環境ストレスに対する耐性が高まったり、より速く繁殖できるようになる場合がある。このような突然変異は、自然選択によって集団内に広まりやすくなる。ただし、同じ突然変異であっても、ある条件下では有益でありながら、別の条件下では不利益になることもある。そうした具体例を次にあげる。
HIV耐性
ヒトのCCR5遺伝子における32塩基対の欠失（CCR5-Δ32）は、ホモ接合体の場合にHIV感染に耐性を付与し、ヘテロ接合体では後天性免疫不全症候群（AIDS）の発症を遅らさせる効果がある。この変異がヨーロッパ人集団において比較的高頻度で存在する理由の一つとして、14世紀半ばにヨーロッパで流行した腺ペストへの耐性をこの変異がもたらした可能性が指摘されている。この変異を持つ人々は感染後の生存率が高く、その結果として集団内で頻度が上昇したと考えられている。この仮説は、腺ペストの影響を受けなかった南部アフリカにおいてこの変異がほとんど見られない理由の説明にも用いられている。一方、より新しい仮説では、この変異に対する選択圧は腺ペストではなく、天然痘によってもたらされた可能性があるとされている。
突然変異 有益な突然変異と条件突然変異
マラリア耐性
有害変異の例として、鎌状赤血球症がある。これは、赤血球内の酸素運搬物質であるヘモグロビンが異常な形状をとることで発症する血液疾患である。サハラ以南アフリカの先住民の3分の1は、この疾患の原因となるアレルを1つ保有している（鎌状赤血球形質）。この形質を持つことで、マラリアが流行する地域においては生存上の利点となる。これは、マラリア原虫（Plasmodium）が感染した赤血球が鎌状に変形することで、原虫の寄生が阻止されるためである。
抗生物質耐性
ほぼすべての細菌は、抗生物質に曝露されると抗生物質に対する耐性を獲得する。実際、多くの細菌集団には、抗生物質という選択圧のもとで有利となる突然変異がすでに存在している。このような変異は細菌にとっては有益であるが、その感染を受ける宿主にとっては不利益となる。
ラクターゼ活性持続性
一部の人類は、ある突然変異によって、離乳後もラクターゼという酵素を発現し続けるようになった。この酵素は乳糖の分解を担っており、これにより成人でも乳製品を消化できるようになる（ラクターゼ活性持続性）。この変異は、近年の人類進化における最も有益な変化の一つと考えられている。
突然変異 進化における役割
自然発生的な新生変異（de novo変異）は、生物集団に新たな遺伝的性質をもたらすことで、進化的変化を促進する複合的な要因の一つである。しかし、変異によって生じる遺伝的多様性の影響は、一般に「弱い」進化的圧力（evolutionary force）と考えられている。無作為に生じる変異は、あらゆる有機生命体の遺伝的多様性の基盤であるとはいえ、この力は他の進化的要因とともに評価されるべきである。自然発生的なde novo変異が種分化を引き起こすような決定的な事象となるかどうかは、自然選択、遺伝子流動、遺伝的浮動などの影響を受ける。たとえば、変異率が高い小規模な集団では遺伝的変異が増加しやすく、これが将来の世代で種分化を促す可能性がある。一方で、大規模な集団では新たに導入された変異形質の影響は小さくなる傾向があり、多くの場合、有害な変異アレルの頻度は時間の経過とともに選択圧によって減少する。
突然変異 代償性の病原性変異
「代償性の病原性変異」（compensated pathogenic deviation）とは、ある種では病原性を引き起こす原因となるアミノ酸残基が、別の種の機能的に等価なタンパク質中では野生型の残基として存在していることを指す。第一の種ではそのアミノ酸残基が疾患の原因となるにもかかわらず、第二の種では他の一つ以上のアミノ酸置換によりその病原性が打ち消されている（代償）ため、同じ残基が病原性を示さない。このような代償性変異は、同一タンパク質内で起こることもあれば、相互作用する別のタンパク質内で起こる場合もある。
突然変異 代償性の病原性変異
このような代償性変異の影響を理解することは、生物集団において固定化された有害変異の存在を考える上で重要である。有害変異が集団内で固定化されると、集団の適応度（fitness）が低下することがある。有効個体数とは、実際に繁殖に寄与する個体の数を指す。この数の増加と遺伝的多様性の減少とは相関する傾向がある。集団内の有害アレルが適応度に及ぼす影響を評価するには、その集団が臨界有効個体数（critical effective population size）に対してどの位置にあるかを考慮する必要がある。集団の有効個体数が臨界値を下回る場合、適応度は急激に低下するが、臨界値を上回る場合には、代償性アレルの働きにより、たとえ有害変異が存在しても適応度が維持される、あるいは向上することもありうる。
突然変異 代償性の病原性変異
RNA分子の機能はその立体構造に依存しているため、RNAの構造は進化的に高度に保存されている。したがって、RNAの安定した構造を損なうような変異は、他の代償性変異によって補われる必要がある。RNAにおいては、塩基配列を「遺伝子型」、立体構造を「表現型」とみなすことができる。RNAはタンパク質に比べて構成が比較的単純であるため、その構造は計算機的に高精度で予測可能である。このような特徴から、RNAフォールディング・アルゴリズムを用いた計算機シミュレーションによって、RNAにおける代償性変異の研究が広く行われている。
突然変異 代償性の病原性変異
代償性的変異は、ある変異の表現型への影響が、他の遺伝子座に存在する変異に依存するという遺伝現象「エピスタシス（epistasis）」によって説明される。エピスタシスは当初、異なる遺伝子間の相互作用として考えられていたが、近年では同一遺伝子内での「遺伝子内エピスタシス（intragenic epistasis）」についても研究が進んでいる。代償性の病原性変異の存在は、「符号エピスタシス（sign epistasis）」によって説明される。これは、有害な変異の影響が、他の遺伝子座における別のエピスタティック変異の存在によって打ち消される現象である。あるタンパク質における有害変異（D）と代償性変異（C）を想定すると、CはDと同じタンパク質内、または相互作用する別のタンパク質内に存在しうる。Cの適応度への影響は中立的またはやや有害である可能性があり、この場合Cは集団内に存続しうる。一方で、Dはそれ単独では集団内に維持されないほど有害である。しかし、CとDが同時に存在する場合、それらの複合的な適応度効果は中立的または有利となる。このように、代償性変異はタンパク質進化に新たな適応経路をもたらす。すなわち、個体が低い適応度の谷を通って、ある適応度ピークから別のピークへと移動することを可能にする。
突然変異 代償性の病原性変異
DePristoら（2005年）は、代償的病原性変異（compensatory pathogenic deviation：CPD）の動態を説明する2つのモデルを提唱した。第一のモデルでは、Pは病原性アミノ酸変異、Cは中立的な代償性変異である。この場合、代償性変異Cが先に発生し、その後に病原性変異Pが生じたとき、Pは集団内に固定される可能性がある。第二のモデルでは、PとCはいずれも有害変異であり、それらが同時に出現した場合には、適応度の谷が形成されるとされる。Ferrer-Costaら（2007年）は、公開データベースから取得した代償的変異およびヒト病原性変異のデータセットを用いて、CPDの発生要因を解析した。その結果、タンパク質構造における位置や構造的制約が、代償性変異の生起に影響を及ぼすことが示唆された。
突然変異 代償性の病原性変異
Lunzerらは、酵素イソプロピルリンゴ酸デヒドロゲナーゼ（isopropylmalate dehydrogenase：IMDH）の2つのオルソログタンパク質間で異なるアミノ酸を相互に置換する実験を行った。彼らは、大腸菌のIMDHにおいて、緑膿菌（Pseudomonas aeruginosa）のIMDHに見られる野生型アミノ酸168個を導入した。その結果、これらの置換の3分の1以上が、大腸菌におけるIMDHの酵素活性を損なうことが明らかとなった。これは、同一のアミノ酸配列であっても、遺伝的背景により異なる表現型が生じうることを示している。Corriganら（2011）は、黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus）がリポタイコ酸を欠いていても、代償性変異により正常な増殖が可能であることを示した。全ゲノム解析の結果、この細菌においてサイクリック-ジ-AMPホスホジエステラーゼ（Cyclic-di-AMP phosphodiesterase：GdpP）が破壊されると、細胞壁ポリマーの消失が補償され、通常の細胞成長が可能となることが判明した。
さらに、細菌は適応度への影響が軽微またはほとんどない代償性変異を通じて薬剤耐性を獲得する場合がある。Gagneuxら（2006年）は、リファンピシン耐性を持つ結核菌（Mycobacterium tuberculosis）の実験室株では適応度の低下が見られる一方、臨床株ではそのような低下が観察されないことを報告した。また、Comasら（2012年）は、臨床株と実験室由来の変異株との全ゲノム比較を行い、リファンピシン耐性における代償性変異の役割と寄与を明らかにしようとした。その結果、耐性株にはrpoAおよびrpoC遺伝子に変異が存在することが判明した。同様の研究では、リファンピシン耐性を持つ大腸菌における代償性変異と細菌の適応度との関連が調査された。この研究により、薬剤耐性は細菌の適応度と関連しており、適応度コストが高い場合には転写エラーの頻度が増加することが示された。
Gongらは、異なる時期に得られたインフルエンザの核タンパク質の遺伝子型データを収集し、それらを発生時期に基づいて時系列順に整理した。次に、39種類のアミノ酸置換を抽出し、それらを祖先型に近い遺伝子背景に導入した。その結果、39個の置換のうち3つが祖先的背景において適応度を著しく低下させることが判明した。代償性変異とは、集団の適応度に対して中立的または正の影響を与える新たな変異である。これまで研究により、生物集団が有害な変異の影響を補うように進化することが可能であることが示されている。BurchとChaoは、バクテリオファージφ6が小規模な変化（進化ステップ）を通じて進化するかどうかを検証することで、適応進化におけるフィッシャーの幾何モデルを評価した。その結果、バクテリオファージφ6の適応度は一時的に急激に低下するものの、その後、小さなステップを経て回復することが明らかとなった。また、ウイルスの核タンパク質は、アルギニンからグリシンへのアミノ酸置換によって、細胞傷害性Tリンパ球（cytotoxic T lymphocytes：CTL）による免疫認識を回避することがある。しかし、この置換はウイルスの適応度を低下させる可能性がある。代償的な共変異（compensatory co-mutation）は、こうした適応度の低下を抑制し、CTLによる認識の回避を助ける働きを持つ。変異の影響は大きく3つに分類できる。（1）適応度を低下させる有害な変異（2）代償性変異によって適応度を高める変異（3）相殺的な作用により適応度への影響がほとんどない中立的な代償性変異である。
突然変異 ヒトの進化と疾患への応用
ヒトゲノムにおいて、de novo変異の頻度と特性はヒトの進化に関する重要な要因として研究されてきた。ヒトリファレンスゲノムと比較すると、典型的なヒトゲノムは約410万～500万個所の遺伝子座で差異を持ち、その遺伝的多様性の大部分は集団の約0.5%に共有されている。また、典型的なヒトゲノムには、集団の0.5%未満でしか観察されない4万～20万の稀少な多様体も含まれており、これらはヒト進化の歴史において少なくとも一度のde novo生殖細胞系列変異に由来すると考えられている。de novo変異は、ヒトの遺伝性疾患が持続する要因の一つとしても研究されている。近年の次世代シークエンシング（Next generation sequencing：NGS）の進歩により、ゲノム内のあらゆる種類のde novo変異が直接解析可能となり、これらの検出は稀少疾患および一般的な遺伝性疾患の原因解明に大きな知見をもたらしている。現在のところ、ヒトの生殖細胞系列における一塩基多型（SNV）の平均変異率は1.18×10-8と推定されており、世代ごとに約78個の新生変異が生じるとされる。親子間の全ゲノム解析により世代間の変異率の比較が可能となり、特定の遺伝性疾患の起源に関する可能性の絞り込みが行われている。
突然変異 遺伝学用語の改訂
日本では、2010年代後半から遺伝学用語の見直しが進められている。たとえば、「突然変異（mutation）」に関しては、その表現が誤解を招く可能性や差別的なニュアンスを含むとされ、より中立的で機能的な「変異」への置き換えや使い分けが提案されている。
なお、本記事では、国際的に広く使用されている学術的な用語との整合性を考慮し、従来の用語を使用している。
昭和島ジャンクション
昭和島ジャンクション（しょうわじまジャンクション）は、東京都大田区にある首都高速道路の1号羽田線と湾岸分岐線を結ぶジャンクションである。湾岸線空港中央 - 大黒間開通前は、羽田トンネルの渋滞緩和のため上り線空港西入口から昭和島ジャンクションまで羽田可動橋が連絡していた。
昭和島ジャンクション 連絡している道路
首都高速道路
1号羽田線羽田方面⇔1号羽田線浜崎橋JCT方面・湾岸分岐線東海JCT方面
昭和島ジャンクション 隣
首都高速1号羽田線
(105,106)平和島出入口/PA/TB - 昭和島JCT - (107)空港西出入口
首都高速湾岸分岐線
昭和島JCT - 東海JCT
中部アフリカ
中部アフリカ（ちゅうぶアフリカ、英語: Central Africa、フランス語: Afrique centrale）は、アフリカ大陸を5つの地域に分けた場合の1地域を指す用語である。赤道付近の南北に位置することから、赤道アフリカと呼ばれることもある。
中部アフリカ 概要
アフリカは、文化圏および人種の違いから、サハラ砂漠の南北で大きく2つに分けられるが、当該エリアは、南側のブラック・アフリカ（サブサハラ・アフリカ）に入る。そのうちの、ニジェール川流域より東側（おおよそ西経10度以東）、タンザニア西部地域に南北に走る大地溝帯よりも西側（おおよそ西経30度以西）、そしておおよそ南緯10度以北の範囲が、「中部アフリカ」と呼ばれる。この地域は、北はシャリ川、中部にウバンギ川、南部はコンゴ川の支流が行き渡り、コンゴ川の流域面積は、アマゾン川とその支流に次いで世界第2位である。
この地域にある国々は、中部アフリカ諸国経済共同体 (Communauté Économique des États de l'Afrique Centrale , 略称 CEEAC , 英語名 Economic Commuunity of Central African States) を結成している（他地域の国も構成国となっている）。また、旧フランス植民地の6カ国は、中部アフリカ経済通貨共同体 (Communauté Économique et Monétaire de l'Afrique Centrale , 略称 CEMAC) を結成し、共通通貨CFAフランを使用している。
中部アフリカ 主要都市
アンゴラ
カメルーン
中央アフリカ
コンゴ民主共和国
コンゴ共和国
赤道ギニア
ガボン
サントメ・プリンシペ
チャド
東海ジャンクション (東京都)
東海ジャンクション（とうかいジャンクション）は、東京都大田区東海にある首都高速道路の湾岸線と湾岸分岐線を結ぶジャンクションである。
東海ジャンクション (東京都) 連絡している路線
首都高速道路
湾岸線千葉方面⇔湾岸線浮島JCT方面・湾岸分岐線
東海ジャンクション (東京都) 隣
首都高速湾岸線
(B16,B17)空港中央出入口 - 空港北TN - 東海JCT - 大井PA（西行き） - (B18,B19)大井南出入口
首都高速湾岸分岐線
昭和島JCT - 東海JCT
大井ジャンクション
大井ジャンクション（おおいジャンクション）は、東京都品川区八潮にある首都高速道路の湾岸線・1号羽田線・中央環状線を結ぶジャンクションである。
大井ジャンクション 概要
2013年（平成25年）11月19日までは湾岸線両方向から1号羽田線上りに向かう一方通行のジャンクションであったが、中央環状線接続に伴うジャンクションの運用変更により、同日20時をもって湾岸線西行き（横浜方面）から1号羽田線上りに向かう連結路が閉鎖された。また、中央環状線接続工事に伴い、2012年（平成24年）7月17日に大井PAが横浜寄りに移転した。
2015年（平成27年）3月7日に中央環状線が接続。接続後は、湾岸線西行きから中央環状線外回りへ、湾岸線東行きから1号羽田線上りと中央環状線外回りの双方へ、中央環状線内回りから湾岸線両方向へ、それぞれ連絡する。
2016年（平成28年）6月8日以降、湾岸線東行きから1号羽田線上りに向かう連絡路が、1号羽田線 東品川桟橋・鮫洲埋立部更新工事に伴い長期間閉鎖されていたが、2019年（令和元年）9月29日に上り線う回路へ暫定接続されたことで閉鎖が解除された。
2019年（平成31年）4月15日には、2018年（平成30年）5月20日に行なわれた大井本線料金所の廃止を受け、当JCTの分岐点が500m手前（横浜寄り）へと移設されるとともに、この区間に設置されていた大井南入口が中環大井南入口として中央環状線外回り行き専用に転換された。
大井ジャンクション 隣
首都高速湾岸線
(B18,B19)大井南出入口（東行きは出口のみ）/大井TB（廃止） - 大井JCT - 大井PA（東行き） - (B21)大井出入口
首都高速1号羽田線
(101,102)芝浦出入口 - 大井JCT - （(103)勝島出入口）
首都高速中央環状線
大井JCT /(C18)中環大井南出入口 - (C20)五反田出入口 - 大橋JCT
脱輪
脱輪 （だつりん） とは、
1.の脱輪では、運転免許の取得の際の検定では、脱出不能とならないまでも、路肩の縁石に乗り上げただけで脱輪とみなされることがままある。オートバイでは一本橋から落ちることも指す。検定不合格の要因になる。
2.の脱輪では、脱輪したタイヤが歩行者等に当たって傷害、または死亡する事故も発生している。三菱ふそうトラック・バスが同社の大型車の設計不良を隠蔽し問題となった。
有明ジャンクション
有明ジャンクション（ありあけジャンクション）は、東京都江東区（一部港区）にある、首都高速道路の高速湾岸線と11号台場線を結ぶジャンクション。
この先湾岸線の横浜方面には危険物積載車両の通行が禁止されている東京港トンネルがあるため、浦安方面から来た当該車両は11号台場線へ迂回する必要がある。同様に11号台場線から来た当該車両は浦安方面へしか行くことができない。なお危険物積載車両通行規制は当JCTから東扇島出入口まで続いている。
11号台場線はオートバイの二人乗りが禁止されている。
有明ジャンクション 隣
首都高速湾岸線
(B22)臨海副都心出入口 - 有明JCT - 東雲JCT - (B23)有明出入口
首都高速11号台場線
(1101)台場出入口 - 有明JCT
卒業検定
卒業検定（そつぎょうけんてい）とは、運転免許を取得するために、指定自動車教習所を卒業する際に、最後に必ず行われる技能に関する試験の名称である。道路交通法第99条の5の規定に基づき実施される。略称は卒検（そつけん）。
この試験に合格すると、指定自動車教習所を卒業したことになり、指定自動車教習所から卒業証明書が交付される。卒業検定合格日から起算して1年以内に卒業証明書を運転免許試験場に持参すれば、道路交通法第97条の2第2項の規定により運転免許試験場での技能試験が免除される。
ただし、有効期間内に適性試験や学科試験に合格しなければ、教習所からやり直しするか、あるいは一発試験を受験する事になる。
卒業検定 概要
すべての教習を終了し、みきわめに合格したら受験資格が得られる。卒業検定は運転免許試験場での技能試験（一発試験）に準じた要領で実施される。
得点および採点
採点方法は修了検定とほぼ同じ。この欄では、持ち点と合格得点のみを記す。
得点は最初に個々の持ち点として100点ある。そこから減点方式で採点し、検定終了時に総合得点が70点（第二種免許は80点）以上あれば合格となる。検定課題と採点基準は、道路交通法施行規則に基づく警察庁の通達が基準となっている。
試験は運転だけではない。車への乗り降りも採点対象である。周囲の安全を確認せずに乗り降りすると減点される。
内容
大型自動車・中型自動車・準中型自動車・普通自動車の場合、最初(普通一種・準中型のみ最後)の縦列駐車または方向変換が（第二種免許は更に鋭角も含まれる）所内で行われる他は、全て路上（公道）で実施される。
自動二輪車、牽引（けん引）自動車、大型特殊自動車の場合は仮免許が存在しないため、技能教習・卒業検定はすべて所内で実施される。
自動二輪車の場合、検定員が塔などの高所から採点する方法と車の助手席に同乗したり受験生とは別のバイクを運転して後方から追尾する方法などが行われている。
また自動二輪車の場合は法規走行と課題走行があり教習所によっては、まとめて行う場合と法規走行で減点超過をしていない者に課題走行をする二部構成と方法が異なる。
卒業検定 概要
普通自動車免許、準中型自動車免許の場合、路上試験は、前半は試験説明で指定されたコースを走行する。2012年3月までは後半は自分で設定した終了地点までの経路を地図と照らし合わせて検定員に示した上で検定員の指示を受けずに自分だけの運転で走行（自主経路設定）したが、4月から廃止され、代わりに路端への停車及び発進が施行された。
所内試験は、縦列駐車か方向転換（右バックまたは左バック）の合計3項目のうち1項目（教習所の方針によって縦列駐車と方向転換の両方を行うこともある）、事前に指定されている方を行う。ただし、この3項目すべてができるようにならないと「みきわめ」に合格できない（卒業検定の受験資格を得られない）ので、すべて習得する必要がある。
卒業検定 概要
二輪特別課題
急制動（大型自動二輪車と普通自動二輪車（普通自動二輪車小型限定は除く）は40km/hで11m（湿潤時14m）以内、普通自動二輪車小型限定は30km/hで8m（湿潤時11m）以内で停止）
一本橋（大型自動二輪車は10.0秒以上、普通自動二輪車（普通自動二輪車小型限定は除く）は7.0秒以上、普通自動二輪車小型限定は5.0秒以上で通過）
スラローム（大型自動二輪車は7.0秒以内、普通自動二輪車（普通自動二輪車小型限定は除く）は8.0秒以内で通過。普通自動二輪車小型限定はスラロームなし）
波状路（大型自動二輪車は5.0秒以上で通過。普通自動二輪車と普通自動二輪車小型限定は波状路なし）
第二種運転免許（大型・中型・普通）の課題
路上走行および駐停車禁止場所および指定場所への停車措置（大型・中型自動車は駐停車禁止場所への停車は行わない）及び目標物にドアを合わせての停車措置(普通車は後部ドア、中型・大型は中央付近のドア)
鋭角（最低1回以上、最大でも3回以下の切り返しで通過を行う）
方向変換または縦列駐車
後方間隔（大型・中型自動車のみ。後退して車体後部の中央部分と後方障害物との距離を50cm以内で停止。方向変換または縦列駐車が完了後、再び後退して続けて行う。）
転回（普通第二種免許のみ）
大型特殊自動車第二種免許およびけん引第二種免許は、道路交通法施行規則別表第四に教習に関する規定が存在しないため、指定自動車教習所で教習及び技能検定は行われていない。したがって必ず運転免許試験場での技能試験（一発試験）を受験して合格しなければ、免許を取得することができない。
卒業検定 その他
通常、路上教習では「仮免許練習中」の標識を付けるが、卒業検定では使われずに代わりに「運転技能検定中」などの標識が掲げられる。また車の上部や側面に「検定中」と示すこともある。
検定の日程も普通は平日（午前に試験の説明、実施、合格発表、午後に卒業式、免許申請のやり方の説明）が一般的であるが、教習所によっては午後に検定を行うところもあったり、土日祝日も行っていたりするところもある。
自動二輪車と大型特殊一種（教習所によって異なる）以外の車種は公平性を保つために受験者と試験官（検定員）の他に他の受験者を乗せ実施するのが義務づけられている。また、教習所によっては指定地点まで試験官（検定員）が運転する教習所もある。
ソニック・クルーザー
ソニック・クルーザー (Sonic Cruiser) はアメリカ合衆国の航空機メーカー、ボーイング社が開発を構想していた旅客機。2006年を目処に実用化する予定であったが、経済性の悪さとアメリカ同時多発テロ事件の影響により、2002年12月に開発中止を決定。実質エアバスA380に対抗する旅客機だった。
ソニック・クルーザー 計画の推移
ボーイング社はエアバスがA380の開発を開始して約3ヵ月後の2001年3月26日、エアバスA380に対抗して長年計画していた、ボーイング747を改良した747Xの開発を延期した。そして誰もが全く予想していなかった、高速で巡航できる中型機の開発を優先すると発表した。その中型機の概要として、巡航速度はマッハ0.95以上、巡航高度は40,000ft（約12,000m）以上、客席数は100～300席（ボーイング737～767-300クラス）、航続距離は7,500～9,000nm（約16,600km）以上とされるものだった。
しかし、概要として諸元にかなり幅があることと、機体の大まかなサイズも発表されないなど、ボーイングの新型機発表にしては全てが曖昧だった。これは具体的な機体サイズなどが確定する前にアメリカの新聞社がこの話をかぎつけ、特ダネとして発表しようとしており、それを知ったボーイング社が出し抜かれるのを防ぐため急遽発表を行ったためとしている。