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小海線 沿線風景
始発駅の小淵沢駅からは八ヶ岳を見上げる。発車してすぐ広い斜面を大きく曲がりながら登ってゆく。林の中の別荘地を抜けると清里で、駅周辺は1980年頃から観光化が進んだ。この先、車窓が開けて高原野菜の畑地が目立つようになり、野辺山までの間、八ヶ岳が左手に見える。JR鉄道最高地点は中央分水界でもある。最高地点標識を過ぎると、右手の林の中に野辺山電波天文台の大アンテナが見える。この天文台は年末年始を除き毎日見学が可能である。下り勾配にかかり、信濃川上駅からは千曲川沿いの谷間を進み、小海駅までに千曲川を7回横断する。小海駅からは千曲川の右岸を走ってゆく。佐久平に入ると、車窓には市街地と水田が交錯するようになり、通勤・通学路線に変化する。佐久市に入ると千曲川は北西方面に曲がって行く。岩村田駅から中佐都駅までは高架になっており北陸新幹線と国道141号線を乗り越える。乙女駅からはしなの鉄道線と並走し、終点の小諸駅に到着する。
小海線 駅一覧
2023年度の時点で、JR東日本自社による乗車人員集計の対象駅は小淵沢駅、野辺山駅、信濃川上駅、小海駅、八千穂駅、羽黒下駅、臼田駅、中込駅、岩村田駅、佐久平駅、小諸駅である。それ以外の駅は完全な無人駅のため集計対象から外されている（なお、佐久平駅については小海線の区画は無人であるが、接続する北陸新幹線の区画が有人である）。
（ ）内は小淵沢駅起点の営業キロ。
小海線 利用状況
各年度の平均通過人員、旅客運輸収入は以下のとおりである。
2019年度（令和元年度）の平均通過人員が2,000人/日未満の線区（小淵沢駅 - 小海駅間、小海駅 - 中込駅間）の各年度の収支（運輸収入、営業費用）、営業係数、収支率は以下のとおりである。▲はマイナスを意味する。
肥薩おれんじ鉄道
肥薩おれんじ鉄道株式会社（ひさつおれんじてつどう、英: Hisatsu Orange Railway Co., Ltd.）は、熊本県と鹿児島県において肥薩おれんじ鉄道線を運営する第三セクター方式の鉄道会社である。沿線自治体および日本貨物鉄道（JR貨物）が出資している。本社は、熊本県八代市萩原町一丁目1番1号にある。
九州新幹線新八代 - 鹿児島中央間の開業に伴い、鹿児島本線八代 - 川内間が九州旅客鉄道（JR九州）から経営移管され、肥薩おれんじ鉄道線として運営している。新幹線開業に伴う経営分離で発足した他の第三セクター鉄道会社が県境付近のごく一部を除き、単一県内で運営しているのに対し、2023年現在で唯一、主な営業エリアが熊本・鹿児島の複数県にまたがっている。
肥薩おれんじ鉄道 歴史
2015年（平成27年）
3月14日： 八代 - 出水、出水 - 川内間で観光列車「ゆうゆうトレイン」、肥後高田 - 上川内間で「ドリームトレイン」が運行開始。土日祝限定の割引一日乗車券「わくわく切符」発売開始。
3月29日： おれんじ鉄道感謝デー開催。
4月1日： 八代駅の駅業務がNPO法人の業務委託終了に伴い直営に変更。阿久根駅「にぎわい交流館」の管理終了。JR九州との連絡乗車券の発売範囲が変更。
4月29日： 水俣駅駅舎がリニューアルオープン。
7月1日： 八代駅の駅業務管理を直営からNPO法人おれんじサポートステーションへ委託。
7月21日： マイトレイン・鉄道教室の販売を開始。
2017年（平成29年）
3月4日： ダイヤ改正で「ゆうゆうトレイン」八代 － 出水間、「おれんじバー」の運転を休止。
3月12日： 水俣駅前と構内で開業日記念イベント「おれんじ鉄道BIRTHDAYフェスタ2017」を開催。
8月22日： 平成29年7月九州北部豪雨の影響により、この日の運行からクルーズトレイン「ななつ星 in 九州」の乗り入れを取りやめ。
12月1日：　肥薩おれんじ鉄道とその沿線を舞台とした映画「RAILWAYS」シリーズの最新作（第三弾）「かぞくいろ RAILWAYS わたしたちの出発」の制作公開決定を公式発表。2018年1月16日から2月15日にかけて撮影。
肥薩おれんじ鉄道 歴史
2018年（平成30年）
3月11日・12日： くまモン3号ラッピング列車完成とくまモン生誕祭の一環として、出水 - 八代間に3両編成の特別臨時列車を運行。出水 - 八代間で3両編成列車が運行されるのは2004年の経営移管以来約14年ぶり。
3月17日： ダイヤ改正で早朝に八代 - 西出水間の列車が1本増発、停車時間の見直し、一部列車の増結、観光列車・おれんじ食堂のプラン変更。
9月14日： 出水発川内行き最終列車の後に出水発阿久根行き増発列車を期間限定で運行開始。10月26日までの毎週金曜日のみ運行。
10月26日： 映画「かぞくいろ」ラッピング車両の運行開始。25日にマスコミへのお披露目会、26日に出発式が行われた。
肥薩おれんじ鉄道 歴史
2019年（平成31年/令和元年）
3月16日： ダイヤ改正で快速「スーパーおれんじ」と「オーシャンライナーさつま」のJR鹿児島本線への乗り入れを休止。「オーシャンライナーさつま」はそれまで通過駅であった西出水駅が停車駅に加わり、3号が出水駅始発から米ノ津駅始発に変更。「オーシャンライナーさつま」は全列車とも米ノ津駅 - 阿久根駅間が各駅停車となる。
6月23日： 台湾南部を走る台湾鉄路管理局（台鉄）の屏東線および南迴線と姉妹鉄道協定を締結。
10月1日： 消費税率引き上げに伴う運賃改定を実施。駅ナンバリングを導入。駅名標を更新し、ローマ字の書体（英語表記）をワープロ式からヘボン式に変更。
肥薩おれんじ鉄道 歴史
2021年（令和3年）
2月8日： 八代 - 上川内間で日中に限りサイクルトレインの運行を開始。
3月13日： この日のダイヤ改正で快速「スーパーおれんじ」・「オーシャンライナーさつま」の運行を終了（3月7日が運行最終日であった）。
6月18日： 出田貴康4代目社長が退任し、熊本県庁出身の古森美津代が第5代目社長に就任。女性社長は当社初である。
10月7日： 出水 - 川内間で車掌乗務の「くまモン」ラッピング車両3両編成列車を特別運行。往路は一般乗車可能な臨時快速列車として、復路は団体列車として運行され、3両編成列車は2012年11月の終了以来8年ぶりの運行となった。
11月5日： この日より川内→八代の上り列車限定で再びクルーズトレイン「ななつ星in九州」の乗り入れを開始。
12月11日、12日： 博多 - 鹿児島中央間で17年ぶりにJR九州787系電車による特急「リバイバルつばめ号」を運転。11日は下り往路、12日に上り復路が運転された。
2024年（令和6年）
3月10日： 開業20周年記念イベントを開催。新しいマスコットにアイドルキャラクター「ディーゼルガールズ」が公式デビューし、ディーゼルガールズラッピング車両と新制服のお披露目式を敢行。
4月1日：2014年以来、約10年ぶりに乗務員の制服を新制服（3代目）に移行。
9月24日： 野田郷駅で列車脱線事故（「日本の鉄道事故 (2000年以降)#肥薩おれんじ鉄道野田郷駅脱線事故」参照）。
10月1日： 運賃改定実施。消費税関連以外では開業以来初の実施。
2025年（令和7年）
1月22日： 主要6駅の窓口において一部の乗車券をキャッシュレス決済で購入することが可能になる。
2月18日：米之津川の鉄橋工事をめぐり、漁業協同組合の理事に社員が14時間拘束、叱責された出来事が表面化。出水市議会は漁業共同組合に対して市長が総合調整権を行使できる議案を可決。
7月1日：5代目社長の古森美津代が任期満了に伴い退任し、6代目社長に元熊本県理事の中村誠希が就任。
8月11日：集中豪雨による土砂災害のため全線運休。同月13日から肥後田浦駅 - 川内駅間で運転再開。
8月22日：鉄道線の日奈久温泉 - 肥後田浦駅間で運転再開、不通区間の八代 - 日奈久温泉間は代行バスを運行開始。
9月1日：平日朝の1往復を3両編成に増車し、車掌乗務列車が復活。
肥薩おれんじ鉄道 路線
JR以外の鉄道としては路線延長が九州で最も長い。2006年4月21日の北海道ちほく高原鉄道ふるさと銀河線 (140.0 km) 廃止から、2010年12月4日の青い森鉄道線 (121.9 km) 全線開通（JR東日本からの経営移管）までは日本最長の第三セクター鉄道路線であった。
開業時から、九州新幹線接続と沿線の高校への利便性のために自社線内以外にJR鹿児島本線新八代駅 - 八代駅間と川内駅 - 隈之城駅間に乗り入れ運転している。さらに観光客や沿線地元客誘致の強化のために2013年3月24日から新八代駅 - 川内駅間で観光列車「おれんじ食堂」、同年8月8日からは出水駅 - 八代駅または出水駅 - 川内駅間で「おれんじカフェ」の運行を開始し、「おれんじ食堂」は金曜日・土曜日・日曜日・祝祭日などを中心に、「おれんじカフェ」は貸切専用として運行されている。
2015年3月14日のダイヤ改正では土休祝日に平均速度35km/hで走行する「ゆうゆうトレイン」や、平日に車両、乗務員をレンタルして自由に列車を走らせる「ドリームトレイン（列車レンタル）」の運行を、さらに7月21日からは参加者が実際にダイヤ作成の講習を受けてダイヤを作成して列車を走らせる「マイトレイン・鉄道教室」の販売や運行を開始した。なお、「ゆうゆうトレイン」は2017年3月4日のダイヤ改正ですべて運行休止となっている。
肥薩おれんじ鉄道 路線
2008年のダイヤ改正で土曜日・日曜日などの休日のみ出水駅から熊本駅を結んでいた快速列車「スーパーおれんじ」と鹿児島中央駅を結んでいた快速列車「オーシャンライナーさつま」が設定され、県庁所在地駅の熊本駅と鹿児島中央駅に乗り入れていたが、2019年ダイヤ改正で熊本駅、鹿児島中央駅への乗り入れを休止したのち2021年ダイヤ改正で全ての快速列車の運行を取り止め、以降は全て普通列車とおれんじ食堂のみの運行となっている。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
熊本県と鹿児島県は1991年に、九州新幹線開業後に、鹿児島本線の八代駅 - 川内駅間をJR九州から経営分離し、第三セクター方式の鉄道として運営することで合意した。2000年に両県は具体的な検討を開始したが、収支予測は、熊本県内の区間はいくぶんよいが、鹿児島県内の区間は非常に厳しいとされた。このため、熊本側は県内の収入で鹿児島の面倒を見るのはいかがなものかと主張する一方で、鹿児島側は単県での経営は成り立たないと主張し、議論は2年間も平行線をたどった。2002年2月の合意では、三セク会社は合同で設立し、出資および初期投資の負担は両県で1対1とする、赤字が発生した場合には両県区間の実績を把握し、区間の状況に応じて対応することになった。2002年10月31日に、肥薩おれんじ鉄道が設立された。
新会社の事業基本計画で前提とした2000年の調査数値では、移行区間のローカル列車利用者数は1日6799人、輸送密度1247人/kmだった。近年の数値は漸減していたことから、開業時の輸送密度は1230人/kmと想定された。この数字は、同時期の第三セクター会社と比べると、土佐くろしお鉄道 (1291)、北近畿タンゴ鉄道 (1168)と同レベルで、三陸鉄道 (511)、廃止された北海道ちほく高原鉄道 (302)に比べれば高い。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
初期投資を抑制するために、JR九州からの施設譲渡額は10億円とした。新幹線開業にともなう並行在来線の経営分離で最初のケースとなった、しなの鉄道の軽井沢駅 - 篠ノ井駅間では、この金額が簿価を基準に103億円と高額になり、経営圧迫の元凶となった。肥薩おれんじ鉄道では、JR九州としての路線は廃止するのだから、更地化して他社に譲渡する場合はどうなるかと考え、建物も減価償却を終えて資産価値0で算定したのが、10億円の根拠である。
貨物列車のために残す電化設備の維持費を確保するため、開業後10年間は最低でも年額2億8千万円の線路使用料をJR貨物に保証させた。JR貨物としては、おれんじ鉄道区間を通過できなければ競争力を失うため、この条件を受諾し、1億円の出資もした。従来、JR九州に支払っていた線路使用料と、新たな基準で算定される三セクの線路使用料の差額は、国からJR貨物に調整金が支払われる。
おれんじ鉄道の、役員を含む全社員94人のうち9割を、開業から10年間、JR九州からの出向とした。これにより、人件費の半分はJR九州が負担する。こうした支援策により、開業から9年間は、償却前黒字になると予測された。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
電化設備は残しているが、これは貨物列車用であり、旅客列車はHSOR-100形気動車を導入した。JR九州から中古電車を譲り受けるとすれば、経営分離時に鹿児島本線の南部区間などで使用されていた3両編成では輸送力過剰であり、475系は老朽化していた。単行運転が可能な電車は、量産タイプが無いため生産コストが高く、小浜線に導入されたJR西日本125系電車は1両あたり1億8千万円だった。一方、軽快気動車は標準仕様が確立され1両あたり1億2千万円で、付帯の設備費などを考慮して選択された。
もし、電化設備を取り払う場合は、おれんじ鉄道区間のために、貨物列車牽引用のディーゼル機関車を用意する必要があり、車両新造費、運転・保守の要員、保守設備の確保、作業量の増大などで、高コストの要因になる。こうした点を考慮して、貨物列車は電化、旅客列車は非電化の使い分けが決まった。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
2004年3月にJR九州から経営分離され、第三セクター鉄道として再出発した肥薩おれんじ鉄道だが、八代 - 川内間は開業前の国鉄、JR時代から営業距離が長い割に沿線人口が少ない地域が多く沿線道路も発達していたため、特急列車が運行がメインの路線で普通列車は区間によって1〜3時間に1本程度と少なく、水俣 - 川内間に至っては普通列車は朝7時代から昼過ぎまで5時間近くも運転していなかった時期もあり、また区間列車の水俣、出水などでの接続が悪い、終列車も早いなど利便性が非常に悪かった。そのため、開業時に列車の運行本数を大きく増発して終列車を繰り下げ、区間列車どうしの接続を取るようにして沿線の利便性を高めているが、開業14年目の2018年現在も依然として経営は厳しい状況である。開業当初の計画では初代社長の嶋津忠裕の陣頭指揮の下で初期投資費用や人件費を極力抑えるためにJR九州時代の線路や施設をなるべくそのまま使い、社員も自社社員を必要最小限にとどめてJR九州の出向社員や特定非営利活動法人（NPO法人）等の起用を中心とした「徹底した節約と現状維持」の運営方式で2013年度中に黒字決算にする予定であった。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
しかし、開業2年目の2005年度決算で大幅な赤字に転落して早々に経営安定基金の切り崩しを行うなど、早くも経営危機を迎えている。さらに沿線産業の空洞化、少子高齢化による沿線人口の減少、自動車の普及や国道3号線、南九州西回り自動車道日奈久IC - 芦北IC間の部分開通など高速道路の整備が進み、2004年の開業時には年間188万人（収入額5億2300万円）だった利用者数が、6年後の2010年には37万人減の年間151万人（収入額3億9200万円）にまで落ち込んでしまい、収入全体も8億円に対して支出額は10億円と2億円もの赤字を抱えて経営悪化に繋がっている。2010年の収入の内訳は定期が78.8%、定期外が21.2%で通学客が約7割、観光客が2割を占めており、沿線住民の利用客はわずか1割程度と通学客や観光客に依存せざるを得ない状況になっている。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
2009年7月には2代目社長に古木圭介が就任。2011年10月には本社内に営業部を新設して鉄道利用客以外の収入としてイベント開催の強化、沿線の豊富な観光資源を有効活用するための台湾や韓国などアジア地域を中心とした外国人向けの国内旅行「九州西海岸ウエストコーストツアー」の宣伝と実施、携帯電話専用アプリの「コロニーな生活☆PLUS（コロプラ）」や「おれんじ鉄道で行こう！」への参入、鉄道ファンへの鉄道関連グッズの販売強化、メディアへのプレスリリースの活用、「銀河鉄道999」や「くまモン」、「ぐりぶー」などといった数々のラッピング列車、観光列車おれんじ食堂の運行などの地元誘致活動を頻繁に行って積極的な経営に乗り出しており、2011年度決算からはこれらの鉄道利用客外収入が一般利用客の収入よりも上回って開業以来悪化を辿っていた業績は徐々にだが持ち直し始めている。また、こうした地道な経営努力の結果、2011年度決算には開業7年目にして初めて純利益が1億5700万円の黒字を計上し、おれんじ食堂についても2013年4月と5月の運輸収入は1200万円と好評で、1年間で1万4千人が乗車した。さらにおれんじ食堂の導入で2013年度の輸送人員が139万人と6年ぶりに増加に転じ、売上高も過去最高となる14億6600万円に達した。このため定期外収入が前年比で22.8 - 38%に増加した。しかし、2011年の黒字決算は国の援助強化やJR貨物からの線路使用料の大幅増額によるものが大きく、慢性的な赤字体質から完全に抜けたものとは言えない。2013年6月27日の株主総会において2012年度決算を発表したが、運行支援補助金の減額や人件費、設備投資費などへの投資が影響して前年の黒字から一転して1億8600万円の赤字に転落したことを明らかにした。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
また、2014年度には鹿児島県が設置した経営安定基金が底を着くのが確実になるなど問題も多く、開業の2004年度から2013年末までの10年間で輸送人員は26.1%、運賃収入も18.1%の減少となって損失額が累計12億5200万円に達し、さらに車両や施設の老朽化による大掛かりな補修費用が必要になった事なども加わり、今後2013年度から2022年度までの10年間で収支見込みで33億円の資金不足が見込まれている。
株主総会において、同年9月末限りで古木が社長を退任し、10月より3代目社長に沿線の鹿児島県出水市出身でJX日鉱日石石油基地の代表取締役社長であった淵脇哲朗が内定したことや、3月24日に運行を開始した観光列車「おれんじ食堂」のほかに7月から貸し切り専用列車「おれんじカフェ」の運行を開始する予定で、運輸収入の増加を図る予定であることが公式発表された。
その後、8月8日 から「おれんじカフェ」の運行を開始したほか、9月30日の臨時株主総会において淵脇哲朗の社長就任が決定。同日付けで古木が退任し、10月1日より淵脇が3代目社長に就任した。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
10月1日、乗務員の制服が紺色の新制服に変更された。新制服はおれんじ食堂のデザインを手がけた水戸岡鋭治がデザインを担当しており、3月24日からしばらくはおれんじ食堂限定で着用していたが、この日より開業時より使用されていたグレー基調の制服から新制服に完全統一され、名札もフルネームのものに変更された。
5月3日、前年10月から改装工事をしていた水戸岡鋭治デザインの阿久根駅の駅舎が完成しリニューアルオープンし、新たに「にぎわい交流館阿久根駅」の愛称が付けられた。駅舎内にはオープンテラスカフェやレストラン、土産物屋、イベントスペースなどが設置され、新たな観光客の交流拠点として注目されている。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
6月19日、熊本、鹿児島の両県が今後10年間で27億円の追加支援を行うことを表明した。内訳は熊本県が13億円、鹿児島県が14億円である。これにより廃線の危機は免れたが、両県とも既に鉄道存続のために多額の融資、支援を行っているため今後の支援に消極的になりつつある。また、熊本県側が県と沿線自治体のみの一般会計から全13億円を捻出するのに対し、鹿児島県側は4億円が県と沿線自治体の一般会計から、残りの10億円は県内市町村全体の共有財産から捻出するため、当路線が通らない沿線自治体外からの反発が大きい上に鹿児島市議会も支援に難色を示し、鹿児島県が市議会や沿線外の自治体を説得して7月24日にようやく支援の承認を貰うなど鹿児島県側が追加支援の正式決定までに時間を要している。さらに鹿児島県側が「沿線自治体外の財産から支援するため、財産負担を減らす目的で運賃値上げを必要と考えている」と表明しているのに対し、熊本県側は「今後も県と沿線自治体以外からの支援要請の予定はない。運賃を値上げすればさらに乗客減に歯止めがかからなくなるため、徹底合理化による資金の節制を行って運賃を現状維持のままにするのが一番重要な事だと思う」と運賃値上げに反対の意向を示すなど両県の鉄道に対する温度差が大きく、肥薩おれんじ鉄道にとって鉄道存続のために両県の温度差をいかに解決していくかも大きな課題になっている。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
11月、老朽化していた水俣駅の駅舎リニューアル改装工事に着手した。駅舎のデザインはおれんじ食堂や阿久根駅のデザインを手がけた工業デザイナーの水戸岡鋭治が引き続き担当している。工事費用は総額1億1400万円で、全額環境省と水俣市の補助金が利用されている。
1月、JR九州の豪華観光寝台列車「ななつ星 in 九州」の乗り入れが検討されていることが明らかになった。
3月14日のダイヤ改正では八代 - 出水間・出水 - 川内間を平均速度35km/hで片道2時間から2時間30分をかけてゆっくり走行する「ゆうゆうトレイン」、利用客が車両や乗務員をレンタルして自由に列車の運行区間や時間を設定できる「ドリームトレイン（列車レンタル）」の運行を開始した。
さらに3月29日には開業11年を迎えた事への感謝として、沿線7市町や自治体と協賛の元で、終日1乗車300円以上の区間であれば大人300円、子供100円の均一運賃（300円未満の区間は所定運賃）で乗車可能な「おれんじ鉄道感謝デー」を開催した。当日は「にぎわい交流館」内のレストランメニューも割引になり、加えて佐敷駅近くの芦北町民総合センターでNHKのど自慢、津奈木駅、川内駅付近などでもイベントが開催された。感謝デーは今後も沿線7市町にあやかり、2015年度は7回が開催される。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
4月29日、前年11月から駅舎の改装工事を行っていた水俣駅がリニューアルオープンした。リニューアルオープンに伴い駅舎に旬彩カフェ水俣屋がオープンし、新たな観光拠点として注目されている。
6月23日、乗り入れが検討されていた「ななつ星in九州」の試運転のため牽引用の機関車DF200形が単機で肥薩おれんじ鉄道に初めて入線し、数日間かけて八代 - 肥後二見間で運転士の運転習熟のための試運転が実施された。その後、6月27日に「ななつ星in九州」が鹿児島中央から博多まで機関車1両、客車7両のフル編成で試運転を行い、その際に肥薩おれんじ鉄道にも川内から八代に向けて初めて乗り入れ、試運転が実施された。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
しかし高額な車両改修費用などがかさみ、6月29日の株主総会での2014年（平成26年）度決算報告では経常損益が5億円の赤字、純損失も初めて2億を突破した2億1269万円に達し、開業以来過去最悪の赤字となった。また3年連続で赤字決算になり、累積赤字が14億6512万円になった事も報告された。さらに8月24日深夜から翌25日早朝にかけて鹿児島県から熊本県に渡って上陸した台風15号の影響で、全線で倒木や土砂崩れ、架線切断による停電など数十箇所に渡って開業以来最悪の甚大な被害を受け、8月25日始発列車から8月29日夜21時頃まで長時間の運休を余儀なくされた。約5日間程度で復旧したが、復旧費用等で多大な損害を出している。
9月10日、2016年4月よりJR九州の豪華観光寝台列車（クルーズトレイン）「ななつ星in九州」の乗り入れ開始が正式決定し、当社や沿線にとって明るいニュースとなった。現在は肥薩線を経由するルートをおれんじ鉄道経由に変更すると言うもので、九州全体を回る3泊4日コースに組み込まれる。夕方に川内駅を出発し、薩摩高城駅や水俣駅など主要駅に停車して観光案内を行ったり夕食を摂り、八代駅に到着するダイヤが予定されている。
1月24日の大雪では、全線に渡って積雪10 - 20センチ以上の記録的な豪雪となり、翌日25日の午前10時頃まで全線運休となった。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
3月26日のダイヤ改正で「ゆうゆうトレイン」の出水 - 川内間の運行を休止した。また、4月7日から川内から八代までの片道のみ「ななつ星in九州」の乗り入れを開始した。運行開始日の初日は多数の地元住民や鉄道ファンに歓迎されたほか、薩摩高城駅、水俣駅、八代駅などで歓迎記念イベントが開催され、肥後高田 - 八代間の球磨川鉄橋では歓迎の花火が約2分間打ち上げられた。「ななつ星in九州」は毎週木曜日の夕方から夜間にかけて運行される。
肥薩おれんじ鉄道 経営状況
4月14日21:26頃と16日1:25頃に断続的に発生した熊本地震とそれに伴う余震の影響で、14日は地震発生以降運休となった。15日は始発列車から肥後高田 - 川内・隈之城間で運転再開、夕方に八代 - 肥後高田間の点検を終えて全線での運転を再開したが、16日の本震とされる地震発生により翌16日の始発列車から八代 - 肥後高田間が不通となり18日夕方の全線運転再開まで再び肥後高田 - 川内・隈之城間の折り返し運転を余儀なくされた。全線運転再開後も一部列車が運休となったほか、21日午後に鹿児島本線が運転再開するまでは八代 - 新八代間は運休となり、新八代行きも全て八代行きとして運行された。JR線熊本方面へ直通の快速列車スーパーおれんじ号は23日、おれんじ食堂は24日の日中から運転を再開した。地震発生当日は木曜日の夜間であったため、肥後二見駅に運転停車をしていた「ななつ星in九州」や線内の貨物列車が翌日夕方の全線運転再開まで長時間取り残された。また、16日の地震発生では深夜だったことから八代駅に夜間滞泊している車両1両が18日の運転再開まで長時間取り残される事態となった。全通後は27日に九州新幹線の熊本 - 新水俣間が開通するまでは新水俣に運転停車する朝の快速スーパーおれんじ2号熊本行きのみ客扱い（臨時停車）を行ったほか、全線で新幹線の振替輸送を行った。なお、震災により長期間運休していた「ななつ星in九州」は、当線では5月13日金曜日より暫定ダイヤで運行を再開した。
12月20日、2013年から3代目社長として就任していた淵脇哲朗社長が体調不良のため、12月26日付で任期を6ヶ月ほど残して急遽辞任する事が発表された。12月26日に八代市内で臨時株主総会が開かれ、後任は熊本県庁の田嶋徹副知事が2017年6月までの任期で暫定的に社長に就任した。
3月4日にダイヤ改正を実施。列車番号が大きく改番され、「ゆうゆうトレイン（八代 - 出水）」と「おれんじ食堂」の第4便（おれんじバー）が廃止されたが、列車の本数や運転時刻などは改正前とほぼ同じであった。
3月12日、肥薩おれんじ鉄道の開業日（2004年3月13日）を記念した沿線住民と鉄道ファン向けイベント「おれんじ鉄道BIRTHDAYフェスタ2017」が水俣駅構内と水俣駅前ふれあい館で大々的に開催された。このイベントでは、保守基地で軌道モーターカーの運転実演やレール細断実演ショー、使用中止中の3番線（旧山野線の線路）を使用したレールカート（スーパーカート）の体験乗車、現役の若手運転士による鉄道教室「おれんじの「鉄」学」やオリジナルグッズ・鉄道関連備品の販売が行われたほか、観光列車おれんじ食堂も先着申し込み順の体験乗車会（コーヒーとスイーツ付きで500円）を開催し、午前中は水俣 - 出水駅間、午後は水俣駅 - 佐敷駅間で各1往復ずつ臨時運行された。
4月26日、八代市内で臨時株主総会が開催され、前年12月より暫定的に社長職に就いていた熊本県副知事の田嶋徹社長が辞任し、熊本県庁出身の出田貴康が4代目社長に正式に選任され、翌27日より就任した。
12月1日、肥薩おれんじ鉄道とその沿線を舞台とした映画「RAILWAYS」シリーズの最新作（第三弾）「かぞくいろ RAILWAYS わたしたちの出発」の制作公開決定が公式にリリースされた。監督は吉田康弘、出演は有村架純、國村隼、桜庭ななみ。2018年11月23日に熊本県と鹿児島県で先行公開され、それ以外の全国の都道府県でも2018年11月30日に公開された。
12月26日、2018年3月17日に実施予定の春ダイヤ改正の内容が発表された。一般列車は朝6時台に八代発西出水行きの下り列車1本を増発するほか、混雑列車の増結やJR線との接続の改善などのダイヤの見直しを行い、おれんじ食堂も鹿児島県出水市出身で「フレンチの鉄人」で知られるフランス料理人坂井宏行監修のメニューを取り入れるほか、ダイヤ見直しなどの変更が盛り込まれる予定。
1月16日、映画『かぞくいろ RAILWAYS わたしたちの出発』の撮影が開始され、2月15日に終了するまで約1ヶ月間に渡って沿線で映画撮影が行われた。
鹿児島県内の43市町村でつくる県市町村振興協会が、2013年度から10年計画で行ってきた助成が2022年度末で期限切れを迎えた。2023年、鹿児島県と沿線の3市（薩摩川内、阿久根、出水）は、JR貨物の運行により「県全体が貨物輸送で恩恵を受けている」ことを主張して助成の継続の要請。同年12月23日、県市町村振興協会は臨時理事会を開き、全県支援の継続を決定したが、2023年度から5年間で最大7億1900万円、支援終了後は財政支援をしないとの条件を付けた。
肥薩おれんじ鉄道 組織
組織は主に本社部門と運輸部門に分かれており、本社の総務部は熊本県八代市、営業部、運輸部の運転課、輸送指令室、検修課、工務課および電気課は鹿児島県出水市、工務課と電気課の出先機関は熊本県葦北郡芦北町と鹿児島県阿久根市に所在している。
総務課
財務、資産運営や人事関係を担当。
経理課
社員の賃金、清算などを担当。
営業課
ホームページの運営のほか、各種イベントや企画乗車券の立案、企画、発行、開催などを担当。
旅行事業課（おれんじ食堂・おれんじカフェのパーサー、アテンダント）
旅行企画（おれ旅ツアーや外国人向けツアー）、観光列車「おれんじ食堂」の乗務、団体乗車、貸切列車の受付や手配、添乗などを担当。旅行業登録番号は熊本県知事第2-207号。
運転課（運転士）
列車の運転を担当。八代駅 - 川内駅間の乗務のほかにJR九州線内の八代駅 - 新八代駅間、川内駅 - 隈之城駅間も乗務する。営業距離が長いため八代駅 - 川内駅間の通し列車は運転士一人が全線を運転することはなく、出水駅と起点の八代駅で交代を行う。なお快速「スーパーおれんじ」や「オーシャンライナーさつま」は、八代駅でJR九州熊本鉄道事業部熊本乗務センター所属の運転士、川内駅で鹿児島鉄道事業部鹿児島乗務センター所属の運転士とそれぞれ交代を行っていた。
肥薩おれんじ鉄道 組織
運転統括指令室（運転指令所）
肥薩おれんじ鉄道全線の営業指令と輸送指令を担当するが、八代駅および川内駅の構内はJR九州が指令権を有し、「博多総合指令センター（博多指令）」の管轄下となっている。そのため「博多指令」と区別する必要がある場合は「おれんじ指令」の呼称を用いる。
車両課
出水駅構内の車両基地にて車両の入換、連結と分割作業、点検、補修、改造、車体のラッピング作業などを担当。
工務課
出水駅構内に本部があるほか、佐敷駅構内に熊本県側の施設整備・保全を受け持つ佐敷工務センター、阿久根駅構内に鹿児島県側の施設整備・保全を受け持つ阿久根工務センターがあり、それぞれの工務員が線路の保守、点検を担当。
電気課
出水駅構内に本部および電気指令所（前述の運転統括指令室に併設）があるほか、佐敷駅構内に熊本県側の施設整備・保全を受け持つ佐敷工務センター、阿久根駅構内に鹿児島県側の施設整備・保全を受け持つ阿久根工務センターがあり、それぞれの工務員が電気、信号・通信設備の保守、点検を担当。
肥薩おれんじ鉄道は社員研修施設を持たず、運転士の甲種内燃車運転免許および機関士の甲種電気車運転免許を取得するための教育や適性検査はJR九州に委託され、社員研修センターが役目を担っている。
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
大人普通旅客運賃（小児半額・10円未満切り上げ）。2024年10月1日改定。
乗車券は普通乗車券から割引乗車券、団体乗車券、企画乗車券、おれんじ食堂指定席乗車券まで様々な乗車券を発売しており、主に自動券売機か有人駅の出札窓口で購入する。JR線連絡乗車券や一部の企画乗車券はJR九州の自動券売機や駅窓口、みどりの窓口、旅行センターでも購入可能である。逆に企画乗車券によっては当社線で購入不可の乗車券もある。運転士は「おれんじ18フリーきっぷ」（※青春18きっぷ提示時に限る）の発売を行っている。無人駅から乗車する場合は車内で整理券を取り、下車駅で運賃を支払う方式である。現金のほかにおれんじ鉄道が発行している「おれんじ券」や薩摩川内市が発行している「高齢者おでかけ支援助成券」も乗車券購入や運賃に利用できる。ただし、回数券や定期券購入には使用できない。また、青春18きっぷやジャパンレールパスでの乗車も不可であるが、代替として前者は「おれんじ18フリーきっぷ」、後者は「1DAY TRAIN PASS」「2DAYs TRAIN PASS」（共に訪日外国人観光客専用）の購入が可能である。
普通乗車券（自動券売機（普通乗車券のみ）・出札窓口）
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
自動券売機で発行されるバーコード式乗車券と出札窓口で発行される裏地が白い軟券乗車券の2種類があり、どちらも金額式である。ほかに補充券（区間記入式片道補充券、乗降駅に○を付けるタイプの簡易式片道補充券、補充往復乗車券、障がい者割引などの出札補充券）も発売されている。JR九州と連絡運輸を行っており、連絡乗車券も購入できる（特急「36ぷらす3」の運行開始時より肥薩おれんじ鉄道線を介した通過連絡運輸の乗車券も発売されている）。自動券売機発行の自社線内乗車券のみバーコード式で、JR線連絡乗車券や出札窓口で発行する軟券式の普通乗車券はバーコードは対応していない。自動券売機はレシップ製のタッチパネル式券売機で有人駅の佐敷駅、水俣駅、出水駅、阿久根駅、川内駅のみに設置されており、他の有人駅は出札窓口で対応している。なお、水俣駅や阿久根駅の自動券売機は早朝と夜間は閉鎖される駅舎の中にあるため、駅舎が閉鎖される早朝や深夜の時間帯は購入出来ない。また、川内駅の自動券売機は改札口外のJR線きっぷ売り場のみ設置されており、ホームのおれんじ鉄道乗り場には設置されていない。そのため、JR鹿児島本線からおれんじ鉄道に直接乗り換える場合は、おれんじ鉄道乗り場の出札窓口で乗車券を購入する。水俣駅と阿久根駅は駅舎が閉鎖される時間、川内駅は駅係員が不在の時間帯は列車内で整理券を取り、下車駅で運転士にJR乗車券と整理券を提示のうえ運賃を支払う。
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
ICカード乗車券の取り扱い
おれんじ鉄道ではSUGOCAや熊本地域振興ICカード（くまモンのICカード）などのICカード乗車券では直接乗車できない。そのため、新八代駅や隈之城駅などJR九州線の各駅からICカード乗車券で直接おれんじ鉄道に乗車した場合は乗車した駅から下車駅までの全額か、会社境界駅である八代駅または川内駅から下車駅までの運賃を現金で精算する。この場合は運転士または駅係員に運賃を支払った後にICカード精算証明書を発行してもらい、最寄りとなるJR九州在来線有人駅で証明書を提出してカード処理をしてもらう必要がある。
八代駅、日奈久温泉駅、佐敷駅、水俣駅、出水駅、阿久根駅、川内駅の窓口ではQRコード決済「PayPay」で、八代駅、佐敷駅、水俣駅、出水駅、阿久根駅、川内駅の窓口ではSUGOCAなどの交通系ICカード、nanaco、楽天Edy、クレジットカードで普通乗車券、定期乗車券、企画乗車券が購入可能になっている。
範囲は以下の通りである。連絡乗車券の自社での発売はその区間の有人駅のみで行われる。
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
かつては全ての有人駅から全ての連絡駅を経由してJR九州への連絡乗車券、連絡定期乗車券が購入できたが、2015年4月1日より九州新幹線連絡乗車券は八代駅と川内駅乗り換えのみに縮小となり、新水俣駅と出水駅の乗り換え乗車券と定期乗車券は購入不可となった。在来線についても開業時からの八代、川内乗り換えの全てのJR九州各駅との連絡乗車券、連絡定期乗車券が発行出来る駅は八代、出水、川内の3駅のみに限られるようになり、それ以外の有人駅では上表の通りとなっている。ただし企画乗車券は除く。
バーコード式で、無人駅・有人駅問わず全駅で停車中に車内（入口側ドア）整理券発行機で発行される。整理券番号は起点側のJR新八代駅が0番、八代駅が1番の順で、終点の川内駅が28番、JR隈之城駅が29番である。下車駅で運賃箱に整理券を投入すると運賃額が表示され、運賃を支払う仕組みである（八代駅・日奈久温泉駅・佐敷駅・水俣駅・西出水駅・野田郷駅・阿久根駅・川内駅の営業時間内の場合は駅係員に運賃を支払う〈一部列車を除く〉）。また、整理券で乗車する場合、出水駅を超えて下車する場合は行き先によって支払い方法が若干違う。
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
回数券は11枚綴りで10枚分の金額のもの（有効期限3か月間）と6枚綴りで1割引のもの（有効期限1か月）の2種類、定期券は通勤（青色）、通学（黄色）、65歳以上の高齢者用の割引シルバー定期券「いきいきシルバーパス」（オレンジ色）の3種類を発行している。通学定期券についてはおれんじ鉄道線内区間は1種類だが、JR九州との連絡定期券は中学生、高校生、大学生の3種類が発売されている。定期乗車券の発売範囲は上記の連絡乗車券の発売範囲に準じている。
肥薩おれんじ鉄道で購入できる企画乗車券
おれんじ食堂指定席乗車券
おれんじ食堂は全車指定席のため、事前に出札窓口に予約を依頼するか予約センターに直接電話で予約申し込みをして購入する。1号車（ダイニングカー）の予約は出発日の1か月前から3日前まで、2号車（リビングカー）は出発当日まで予約を受け付けている。JR九州みどりの窓口や各旅行センターでも購入可能だが、みどりの窓口は2号車のみ購入可能（肥後田浦駅を除く有人駅の出札窓口・JR九州みどりの窓口・各旅行センター）。
肥薩おれんじ鉄道で購入できない企画乗車券
以下は他社でのみ発売し、肥薩おれんじ鉄道路線内でも有効な企画乗車券である。
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
JR・おれんじぐるりんきっぷ
JR九州との共同企画。福岡ワイド、熊本エリア、鹿児島エリア、熊本・鹿児島エリアの4種類が購入でき、おれんじ鉄道線内は熊本エリア版が「八代 - 水俣」、鹿児島エリア版が「川内 - 出水」、福岡ワイド版、熊本・鹿児島エリア版が「八代 - 川内」が乗降自由のフリー乗車区間となっている。JR九州の乗車券指定区間内の各駅や旅行センターで購入できる。
南九州・肥薩おれんじ鉄道フリーきっぷ
南九州旅行のパックツアーに組まれたフリーパスで、肥薩おれんじ鉄道全線の他にJR九州鹿児島本線の熊本駅 - 八代駅間、川内駅 - 鹿児島駅間、指宿枕崎線の鹿児島中央駅 - 指宿駅間、日豊本線の鹿児島駅 - 宮崎駅間、肥薩線の隼人駅 - 霧島温泉駅間、日南線の南宮崎駅 - 南郷駅間の特急列車を含む全ての列車が乗り放題の割引フリー乗車券。指定席タイプで発売されているが、自由席か指定席かは自由に選択可能で、有効期限が2日間から4日間まで3種類発売されている。旅行ツアーのオプション的な乗車券のため、肥薩おれんじ鉄道やJR九州では発売しておらず、キップ単品での購入も不可。JTBや近畿日本ツーリスト、阪急交通社などの旅行会社のみで取り扱っており、南九州旅行ツアー申し込みの際に購入できる。
かつて発売されていた企画乗車券
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
つばめ・おれんじぐるりんきっぷ
2004年3月13日から2011年3月11日まで発売された、JR九州の共同企画の往復型割引乗車券。内容や種類は現在発売されている「JR・おれんじぐるりんきっぷ」とほぼ同じであるが、熊本エリア版と熊本・鹿児島エリア版は「九州新幹線つばめ」と「特急リレーつばめ」の乗車券がセットになっていた。2011年3月12日の九州新幹線全線開通に伴い、同日より現在の「JR・おれんじぐるりんきっぷ」にリニューアルされて発売を終了した。おれんじ鉄道の有人駅では扱っておらず、JR九州の乗車券指定区間内の各駅や旅行センターで購入できた。
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
つばめ・おれんじ 出水つるきっぷ
2006年12月1日から2007年2月28日まで期間限定発売された2日間有効の往復型割引乗車券。区間は「北九州市内 - 出水」、「福岡市内 - 出水」、「熊本 - 出水」の3種類が設定発売され、前述の「つばめ・おれんじぐるりんきっぷ（現在の「JR・おれんじぐるりんきっぷ」）」の拡大版であった。片道は全区間とも特急列車（九州新幹線つばめ・リレーつばめ・九州横断特急・くまがわ）を含むJR線列車のみの利用、もう片道はJR九州線区間「鹿児島本線内の各駅 - 八代」が特急列車（リレーつばめ・九州横断特急・くまがわ）を含んだJR線列車の利用、「八代 - 出水」がおれんじ鉄道の列車利用で、おれんじ鉄道線内の「八代 - 出水」はフリー乗降区間となっており、往路、復路にどれを使うかはその都度選択可能であった。おれんじ鉄道の有人駅では扱っておらず、JR九州の各駅や旅行センターなどで購入できた。
肥薩おれんじ鉄道 運賃・乗車券
おれ鉄・くま鉄2日間フリー乗車券
熊本県、くま川鉄道との3社共同企画「肥薩おれんじ鉄道・くま川鉄道でめぐる、くまもと県南めぐりん宝さがしの旅キャンペーン」とのタイアップで2014年11月22日より発売された、八代駅 - 袋駅間2日間乗り放題の期間限定フリー乗車券。企画終了に伴い2015年2月28日発売分を以て発売を終了した。熊本県内の有人駅で購入可能だが乗車券自体は会社単独のため、この乗車券でくま川鉄道は乗降できなかった（くま川鉄道の乗車券も当社線は乗降不可）。くま川鉄道側のフリー乗車券は人吉温泉駅で購入する必要があった。
おれんじレールパス
ジャパンレールパスの一つである「JR九州レールパス」とのキャンペーン商品。JR九州レールパス利用者の外国人向けの一日フリー乗車券で、アジア諸国など外国からの旅行客への知名度向上を目的として、2016年2月22日から3月21日までの期間限定で300名限定で発行されたJR九州、鹿児島県とのタイアップ乗車券。JR九州レールパスを購入した旅行客にクーポンが付随し、クーポンに必要事項を書いて八代駅、水俣駅、出水駅、川内駅の各駅に渡せば引き換えが出来た。
コロプラ☆一日乗り放題きっぷ
コロニーな生活☆PLUS（コロプラ）との提携企画乗車券。鉄道とコロプラがGPSで連動しており、おれんじ鉄道を全線走破するための一日フリー乗車券。全線を走破すると特典として様々な限定アイテムが手に入る。また、購入特典として「コロプラ☆乗り物コロカ【肥薩おれんじ鉄道】」が手に入る。有人駅のほかに列車内でも購入可能な切符であったが、2016年3月31日の発売を以て終了した。
感謝のきっぷ「Happy Birthday Ticket」
2016年1月30日に発売を開始した割引乗車券。乗客の誕生日に八代駅 - 川内駅間のどの区間でも1名あたり往復1000円（子供500円）で乗車できる割引キップ。購入日や使用日が対象乗客の誕生日と同じ月の間（1日から31日まで）であれば購入、使用できる。有人駅の窓口のほか、車内でも購入できる。最大8名までまとめて乗車できるが、往復乗車が前提のため片道のみの使用はできず、途中下車も出来ない（肥後田浦駅、西出水駅を除く有人駅の出札窓口・列車内）。2017年8月31日の発売をもって終了した。
期間限定 1day のれる切符
2021年7月17日から販売を開始した常時使用可能の全線乗り放題の割引一日フリー乗車券。新型コロナウイルス感染症の感染拡大で大きな影響を受けた沿線自治体の活性化を図る目的で設定された。値段は大人1500円、子供とシニア（65歳以上）は750円で、有人駅だけでなく列車内でも購入できるほか、スマートホンで購入および利用できるデジタル乗車券としても販売している。設定当初は2021年12月31日までの販売であったが、好評のため2022年3月31日まで延長された。
精算証明書（新八代駅・川内駅）
終着駅である新八代駅、八代駅、川内駅、隈之城駅の4駅のうち新八代駅と川内駅は出口がJR改札口しか無いため、改札口の外に出るための証明書である。乗車券や整理券で精算した場合に運転士や駅係員からこの証明書を受け取り、JR線の改札係員に渡して改札口を出る。八代駅は独立した改札口があり、隈之城駅は終日無人駅で運転士が運賃を収受するため発行されない。また、この証明書でJR線列車に乗車した場合は、熊本側は下車駅から八代駅 - 新八代駅の運賃を差し引いた額の運賃を、鹿児島側は川内駅からの運賃をそれぞれ下車駅で支払う。
肥薩おれんじ鉄道 車両
接続するJR鹿児島本線から貨物列車の直通運転があるため本線全区間で交流電化設備が維持されているが、旅客車両は経費節減のため高価な交流電車を避けて気動車を採用している。
肥薩おれんじ鉄道 トータルデザイン
ロゴマークの一般公募を行った際に、およそ900点の中から川西康之（現：株式会社イチバンセン代表取締役）の作品が選ばれ、その後、各種サイン類のほか、きっぷや定期券、名札、ポスター、駅名標、さらに焼酎のボトルに至るまで様々なデザインを担当した。当時、初代社長を務めた嶋津忠裕は、のちにえちごトキめき鉄道の初代社長に就任しており、川西がそのトータルデザインを手掛けるきっかけともなった。
なお、「おれんじ食堂」の運転開始以降、乗務員の制服や各駅のリニューアルにおいてJR九州などのデザインで知られる水戸岡鋭治によるデザインが多数採用されている傾向にある。
肥薩おれんじ鉄道線
肥薩おれんじ鉄道線（ひさつおれんじてつどうせん）は、熊本県八代市の八代駅から鹿児島県薩摩川内市の川内駅に至る肥薩おれんじ鉄道の鉄道路線である。駅ナンバリングで使われる路線記号はOR。
肥薩おれんじ鉄道線 概要
元は九州旅客鉄道（JR九州）鹿児島本線の一部で、2004年（平成16年）3月13日の九州新幹線新八代駅 - 鹿児島中央駅間開業の際に並行在来線として肥薩おれんじ鉄道へ経営移管された。第三セクター鉄道に転換された整備新幹線の並行在来線で、営業エリアが複数の県にまたがっているのは、隣接県の末端区間だけの例を除けば本路線が唯一である。整備新幹線開業による並行在来線の第三セクター鉄道への経営移管は本州以外では初事例で、2016年3月26日の北海道新幹線開業に伴い江差線がJR北海道から道南いさりび鉄道に経営移管されるまでは、本州以外で唯一の事例であった。
全線が交流電化されているが、自社車両による旅客列車は交流専用電車の新造・購入費および維持費削減の観点から電気運転を行わず軽快気動車により運行されている。貨物列車は経営移管後も引き続き第二種鉄道事業者である日本貨物鉄道（JR貨物）の電気機関車牽引により運行されている。
肥薩おれんじ鉄道線 概要
九州新幹線開業までは、当線の区間にも特急列車などの優等列車が設定されていた。この新幹線開業まで運行されていた特急「つばめ」は新幹線連絡の「リレーつばめ」となって新八代駅発着に変更され、夜行特急「ドリームつばめ」は廃止、寝台特急「なは」は熊本駅発着に、早朝と深夜に出水 - 西鹿児島（現・鹿児島中央）間で運行されていた通勤ライナー「さわやかライナー出水」と「ホームライナー出水」は川内駅発着の「さわやかライナー川内」と「ホームライナー川内」にそれぞれ変更され、土曜・休日運行の快速列車と観光列車「おれんじ食堂」、JR九州からの直通する特急列車「36ぷらす3」を除いて通過駅を伴う列車は消滅した。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
定期旅客列車は普通列車のみの運行で、平日朝の1往復を除いたすべての列車で運転士のみが乗務するワンマン運転を行っている。編成は単行（1両編成）が基本だが朝夕ラッシュ時や沿線イベントなどで多客が見込まれる場合は2両編成に増車して運転され、逆に夏休み期間などは平日朝夕でも一部の列車が2両編成から1両編成に減車される。車両の増結・分割は主に車庫のある出水駅のほか、昼間に車両留置のある八代駅でも行われている。夜間は基地のある出水駅のほか、八代駅・川内駅にも車両の滞泊が設定されている。2004年の開業当時からしばらくは出水駅 - 川内駅間で3両編成の車掌乗務列車が平日の朝夕ラッシュ時に各1往復ずつ運行されていたが、利用者の減少に伴い徐々に短縮され、最後まで残った朝の1往復の車掌乗務列車が2013年3月のダイヤ改正で廃止されて全て最大2両編成のワンマン列車のみの運行となった。その後、2025年9月1日より平日朝の米ノ津発隈之城行き下り列車1本と隈之城発出水行き上り列車1本が3両編成に増車され、再び車掌乗務列車が復活した。なお、車掌業務は運転士ではなく営業部社員が担当している。
このほか、2013年3月からは金・土・祝日を中心に観光列車「おれんじ食堂」が、2020年10月からは週1回、JR九州からの直通特急列車「36ぷらす3」が運行されている。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
また、おれんじ鉄道は国鉄鹿児島本線時代から本州と九州の鹿児島県までの物流の大動脈という一面も持ち合わせており、列車による貨物輸送も盛んで、JR九州からおれんじ鉄道への移管後も深夜帯を中心に多数の貨物列車が運行されている。
基本的に毎週木曜日、博多から鹿児島中央行きの特急「36ぷらす3」が、片道のみ乗り入れる。但し肥薩おれんじ鉄道線内のみの利用はできない。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
八代駅と川内駅でJR線から接続を取るダイヤが設定されているため運行間隔は一定していないが、おおむね1時間あたり1本程度の運転である。八代駅 - 川内駅間全線を通しで運転する列車のほか、始発・最終を中心にして車庫のある出水駅発着の区間列車が八代方面・川内方面に多数設定されている。区間列車はこれ以外にも毎日運転で早朝6時台の米ノ津発隈之城行きの列車が1本、8時台に八代駅 - 肥後高田駅間の列車が1往復設定されているほか、平日のみの運用として5時台に出水発隈之城行、6時台に隈之城発米ノ津行と折り返しの7時台米ノ津発野田郷行、夕方の米ノ津発川内行が1本ずつそれぞれ設定されている。この平日朝の米ノ津駅発着列車は2005年3月1日のダイヤ改正で出水商業高等学校の通学利便のため米ノ津行きの列車が新設され、2011年3月14日からは折り返しの列車が設定された。さらに沿線の学校通学生へのアンケート結果を元に、2018年3月17日からは早朝6時台に八代発西出水行下り列車1本（折り返しの上り列車となる西出水 - 出水間は回送）が新たに設定され沿線高校への通学の利便性が向上した。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
利用客の利便性を考慮して、一部列車が鹿児島本線八代駅 - 新八代駅（九州新幹線発着・八代白百合学園高等学校最寄駅）間および川内駅 - 隈之城駅（れいめい中学校・高等学校最寄）間に乗り入れている。このうち隈之城駅発の普通列車は八代駅まで運転する列車が朝に2本、肥薩おれんじ鉄道を経由して新八代駅まで通しで運転するJR九州駅始発終着の列車が夕方に1本設定されている。
2021年3月ダイヤ改正では八代駅 - 新八代駅間の運行形態の見直しに伴い、日中を中心とした新八代始発の川内行きや隈之城行き列車が八代駅から延長される形で増便された（その代わり、利用者が少ない夜間の新八代始発の列車が八代始発に短縮される形で減便している）。また、最終列車の行き先に「最終○○（行き先）」と表示されるとともに放送案内されるようになり、最終列車がより明瞭化された。なお、八代19時台発の6257Dは終点の出水駅で川内行き最終列車に連絡するため「出水連絡 最終川内」と2段表示される。
JR線への直通列車に関しては乗務員の交代は行われないが、JR九州から車両使用料を受け取っている。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
2013年3月24日より新八代駅 - 川内駅間に運行が開始された快速列車。肥薩おれんじ鉄道初の全席指定列車である。沿線の水俣地域の振興事業の一つとして、車窓からの美しい景色を楽しみつつ「ゆったり、のんびりとしたスローライフな旅を楽しむ」ことをコンセプトして設定された。車両はダイニングカーとリビングカーの2両固定編成で、新製ではなく既存車両のHSOR-114AとHSOR-116Aを改造したものが充当されており、デザインは工業デザイナーの水戸岡鋭治が担当している。列車名の通り沿線の特産品で作られた料理やデザートが提供され、美しい景色を見ながら食事を楽しむとともに、ウェルカムドリンクサービス、コーヒーとお菓子の自由配布、主要駅で駅構内や街に出て沿線の特産品の買い物が楽しめるサービス（マルシェ）、乗務員（パーサーやアテンダント）による観光案内や不定期のサプライズイベント、制服を貸し出しての記念写真サービス（子供限定）、景色がよい区間での低速走行や一旦停止サービス、乗車記念パスポートの配付、鹿児島県出身のジャズアーティスト松本圭使、博多俊輔などによるピアノの生演奏サービス（3号サンセットディナーのみ）などが行われている。そのほか沿線の地酒、ワイン、カクテルなどのアルコール類、ノンアルコールドリンクやソフトドリンク、オリジナルグッズの販売も行われている。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
メニューについてはグルメ雑誌「食楽」を発行している徳間書店と提携している。車内は全車禁煙。外部からの弁当などの食品の持ち込みは可能だが、列車内で提供された料理やデザートの持ち帰りはできない（ただし、ビュッフェで自由配布されているクッキーなどのお菓子は持ち帰り可能である）また、リビングカーは座席扱いとなるため同社の企画乗車券で乗車ができる（一部乗車不可な企画乗車券もある）が、ダイニングカーは旅行商品としての取り扱いになるため企画乗車券では乗車はできない。
座席や料理の予約については2013年の運行開始からしばらくは出水営業部内の予約センター、同社線の有人駅（肥後田浦駅をのぞく）、JR九州の主要駅窓口や旅行センター、契約旅行代理店のみで行っていたが、2018年3月17日からのホームページのリニューアルに伴い、同年4月19日からはホームページからのWeb予約を開始し、パソコンからの直接予約も出来るようになった。Web予約では座席の選択も可能となっている。
停車駅は新八代駅 - 八代駅 - 日奈久温泉駅 - 佐敷駅 - 津奈木駅 - 新水俣駅 - 水俣駅 - 出水駅 - 阿久根駅 -  薩摩高城駅 - 川内駅で、毎週金、土、日、祝日の運行である。 ただし、それ以外の運休日であっても事前に貸切予約をして料金を支払えば、貸切扱いで運行する事も出来る。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
運転開始当初は、新八代発川内行が2本（おれんじ食堂1号、3号）、川内発新八代行が1本（おれんじ食堂2号）が設定されており、1号車は原則として全区間乗車だが、2号車は区間乗車が可能で、3号は川内行となる日と出水行になる日があった。
1号は出水発川内行、2号は川内発新八代行、3号は新八代発川内行（日にちによって出水行になる）とダイヤが大幅に変更され、新たにそれまで通過していた薩摩高城駅に停車するようになった。さらに1号は朝食列車として「BREAKFAST（ブレックファスト）」、2号は昼食列車として「SPECIAL（スペシャル）」、3号はスイーツ・夕食列車として新八代駅 - 出水駅間に「SWEETS（スウィーツ）」、出水駅 - 川内駅間に「SINFONIA（シンフォニア）」、新八代駅 - 川内駅間に「MEGUMI（メグミ）」の愛称が付けられた。平日の指定日に限り、片道29万円からの貸し切り料で貸し切り運転をすることも可能である。
肥薩おれんじ鉄道線 運行形態
運転区間と時間を大幅に変更して3便から4便に増発し、1号は出水駅発新八代駅行「ブレックファスト」、2号は新八代駅発川内駅行「スペシャルランチ」、3号は川内駅発新八代駅行で前半（川内駅 - 出水駅）「ライトミール」、後半（出水駅 - 新八代駅）「サンセットディナー」、全区間「クルージングディナー」、4号は新八代駅発出水駅行「おれんじバー」となった。3号前半「ライトミール」は軽食（アフタヌーンティー）と昼食（ランチ）が選択できる。また4号「おれんじバー」は原則として金曜日のみ運転で食事は提供されず、アルコール類を含むワンコインドリンクとおつまみのみが提供される。
車両検査の実施に伴い2016年1月1日から3月24日までは運休となり、3月25日から運行を再開した。
運行区間は変わらないが、新水俣駅 - 水俣間では桜並木の横を通るため4月の桜開花の時期に合わせて期間限定で徐行運転を行い、その他にも八代 - 肥後高田間（球磨川、晩白柚などの柑橘畑の鑑賞）、湯浦 - 津奈木間（奇岩・重盤岩（ちょうはんがん）の鑑賞）など徐行区間を多く増やしたために運行時間が若干変更になった。
基本的なダイヤ設定は2016年版とほぼ同じだが、途中駅での発着時間が若干変更となり、4号「おれんじバー」が運行休止となった。