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ジェイアールバス関東 沿革
2018年（平成30年）
3月19日 - あわしまマリンパークで開催される「リアル脱出ゲーム×ラブライブ！サンシャイン!!」の参加者を対象に上野駅発の往復バスの運行を開始。4月22日まで運行。
4月1日 - ジェイアール東日本物流の地域活性化物流有限責任事業組合に加入。4月3日よりいわき号の東京駅行きでJRとまとランドいわきファーム産のトマトを輸送する。
4月27日 - 東京 - 大阪間を運行する「ドリームルリエ号」にプレシャスクラスを6席、アドバンスクラスを10席とした新車両を導入。
4月28日 - 「館山の恵みがつなぐ協議会」と提携し、館山市西岬地区の野菜を東京へ直送する高速バス貨客混載輸送の実証実験を開始。
6月1日 - 小諸支店が小諸市紺屋町から同市与良町に移転。高速バス「佐久・小諸線」の「御幸町」停留所を廃止し、「JRバス小諸支店前」停留所を新設。
6月10日 - 「ドリーム号の日」を制定。
6月15日 - 震災以降、運行休止となっていた「いわき号（小名浜系統）」をハワイアンズ経由に経路変更の上、運行を再開。「みと号」では、交通系ICカード割引を開始。
7月14日 - スウェーデン・スカニア社製二階建てバス「アストロメガ」の運行をバスタ新宿 - TDR線で運行開始。小諸支店では定期観光バス「信州路めぐり号」を運行開始。
ジェイアールバス関東 沿革
8月2日 - 夜行高速バス「ニューブリーズ号」（東京・新宿 - 広島）の中国ジェイアールバスの運行分の代替運行を開始。11月30日東京発にて終了。
9月1日 - 二階建てバス「アストロメガ」を新東名スーパーライナー（東京駅 - 名古屋駅）でも運行開始。
9月10日 - 豪雨被害で運行を停止しているJR西日本広島地区の山陽本線の代行バスの運行に乗務員、車両を派遣。呉線の代行バスを含め12月下旬まで実施。
10月1日 - 鹿嶋、諏訪、三ヶ日の3営業所が支店に昇格。三ヶ日は東名三ヶ日支店となる。
11月1日 - 「青春ドリーム福井号」運行開始。
11月2日 - 滋賀県守山市と提携し、参加者と自転車をバスに載せ守山町まで輸送し、琵琶湖を一周する「ビワイチサイクルツアー」を運行開始した。
12月18日 - 白棚線にて、内閣府が推進する戦略的イノベーション創造プログラム（SIP）「自動走行システム」において、バスの正着制御技術に関する実証実験を20日までの3日間実施。
12月21日 - 「ドリーム高知号」、「ドリーム徳島号」、「ドリーム高松号」及び「夢街道会津号」、「青春ドリーム福井号」、「知多シーガル号」の各夜行便を東京ディズニーランドまで延伸。
ジェイアールバス関東 沿革
12月22日 - ジェイアールバス東北の協力により、車両を借用し、草津・白根・浅間高原線で新幹線E5型「はやぶさ」カラーバスを運行開始。2019年3月末まで運行。
ジェイアールバス関東 沿革
2019年（平成31年／令和元年）
3月31日 - この日の運行をもって、「スカイツリーシャトル」（東京駅 - 東京スカイツリータウン）を廃止。
4月1日 - 館山支店管内の路線バスにて片道通学定期券を発売開始。高速バス「つくば号」、「かしま号」の高速バス定期券をスマートフォンで発売開始。
4月5日 - 定期観光バス「善光寺・戸隠と小布施号」を運行開始。
4月6日 - 定期観光バス「神秘の石の街大谷と世界遺産日光号」を運行開始。
4月30日 - 平成最後のドリーム号として、東京駅 - 大阪駅間で「平成ドリーム令和号」（上下各1便）をアストロメガで特別運行。
5月17日 - 東京・新宿 - 京阪神線をダイヤ改正（「中央道昼特急号」を廃止し、「東海道昼特急号」に変更。「青春昼特急号」および「青春エコドリーム号」（一部）にアストロメガを本格投入。
5月14日 - 栃木県佐野市と公共交通や観光振興、定住促進に関する包括連携協定を締結。
6月1日 - 「知多シーガル号」夜行便をJR東海バスと共同運行の「知多ドリーム号」（TDL・東京駅～太田川駅）に変更の上、毎日運行に変更。「中央ライナー可児号」ではダイヤ改正を実施し、全便東濃鉄道に移管。
6月24日 - 高速バスみと号を活用した客貨混載物流で、茨城県内の企業2社の商品を東京駅エリアの店舗へ配送する実証事業を実施。7月31日まで。
ジェイアールバス関東 沿革
7月16日 - 新宿 - 本庄・伊勢崎線の2往復を群馬中央バス に運行委託開始。また同日より、同線および上州ゆめぐり号、佐久・小諸号の上り便（朝に到着する便を除く）が中野坂上で降車扱いを開始。
8月31日 - この日の運行をもって東京 - 御殿場・箱根線の運行より撤退。
9月30日 - 東名系統での用賀PAにおける乗継乗車券発売終了。
11月1日 - 東京ディズニーランドの各系統夜行便の発着場所を東京ディズニーランド・バスターミナル・ウエストに変更。
12月1日 - ドリーム徳島号とドリーム高知号を再編し、ドリーム高知・徳島号（TDL・東京・新宿～徳島・高知）と季節運行のドリーム阿南・徳島号（東京・新宿～徳島・阿南）とし、ドリーム高知・徳島号の徳島駅～高知駅・はりまや橋間をJR四国バスに、ドリーム阿南・徳島号の全区間を徳島バスにそれぞれ運行委託する。
ジェイアールバス関東 沿革
2020年（令和2年）
2月1日 - 東京 - 成田空港線を京成グループが運行する「東京シャトル」と路線統合し、新たに「エアポートバス東京・成田」として共同運行を開始。
3月1日 - 「ドリーム松山号」が同日をもって運行休止。
3月27日 - 栃木県那須塩原市と公共交通や観光振興、定住促進に関する包括連携協定を締結。
3月31日 - 水都東線及び城東車庫便を廃止。水戸駅 - 赤塚駅南口間は関東鉄道に移管。これにより水戸支店の一般路線バスが全廃。
4月1日 - 千葉交通、成田空港交通との共同運行でJR成田駅東口 - 国際医療福祉大学成田病院・病院南間の路線バスの運行を開始（東関東支店が担当）。栃木県佐野市の生活路線バス「さーのって号」の田沼葛生線、植下高萩線、犬伏線、運動公園循環線の運行受託を開始（佐野支店が担当）。
5月29日 - 公式twitterを開設。
7月3日 - YACYBER株式会社と提携し、バス営業所敷地内に農産物直売所を開設。
7月22日 - 新型コロナウイルス感染拡大防止のため、東京～京都・大阪・三ノ宮（夜行・下りのみ）において、バス乗車前に非接触体温計による検温を開始 。
7月27日 - 宇都宮市内を走る路線バスで市の補助金を活用して1日当たり計2便の増便を開始（2021年3月末までの予定）。
8月1日 - 「ドリーム高松号」が同日をもって運行休止。
ジェイアールバス関東 沿革
8月17日 - 長野県伊那市と少子高齢化などの地域課題解決や相互の発展を目的に包括連携協定を締結。
8月22日 - 成田空港出発の定期観光バスでユーグレナバイオ燃料の使用を開始。
10月2日 - 定期観光バス「ウエルカム成田セレクトバスツアー号」をリニューアルし、「ちょっと千葉旅号」として運行開始。
10月24日 - 東京駅 - 竹芝地区で燃料電池バスを使用した無料循環バス「JR竹芝 水素シャトルバス」運行開始。
10月28日 - 館山支店の南房州本線・洲の崎線でアニメ「戦翼のシグルドリーヴァ」とのコラボを開始。キャラクターのラッピングバス運行や1日乗車券の限定発売など。
10月31日 - 塩原温泉郷にて2階建てバスオープンバス「めいぷるスカイ」を使用した紅葉巡りツアーを運行（11月30日まで）。
11月7日 - 館山市内の観光名所を巡る「館山市ぐるっとボンネットバスの旅」を運行（11月29日まで）。
11月16日 - ドリーム号史上最大のキャンペーンを開始（2021年3月31日まで）。
11月26日 - 東京から草津温泉バスターミナルまでの高速バス往復と草津温泉の入浴券がセットになった「草津WEB周遊券」を販売開始。
ジェイアールバス関東 沿革
2021年（令和3年）
1月5日 - 館山市からの委託により日東交通と共同で館山市街地循環バスの実証運行を開始（3月5日まで）。
2月15日 - 2月13日夜に発生した福島県沖地震の影響により東北新幹線が不通となったため、緊急支援として「東京 - 仙台線」・「新宿 - 仙台線」・「新宿 - 郡山線」・「新宿 - 会津若松線」をそれぞれ臨時運行（下り：2月22日、上り：2月23日まで）。
3月20日 - 館山支店の洲の崎線で自転車ラックバス（バス前面に自転車を2台積載可能）を運行開始。3月20日、21日はプレ運行（館山～安房白浜）、22日からキャンペーン価格運行（館山～相の浜）、7月22日から通常料金運行（館山～相の浜）。
3月21日 - 栃木県内の一般路線バス（水都西線、塩原線）にSuicaの機能を備えた地域連携ICカード「totra」を導入。
4月1日
「ドリーム高知・徳島号」が廃止。
伊那市長谷地区で乗合タクシー事業を開始。東京～多古・匝瑳線が国際医療福祉大学成田病院に乗り入れ開始。東京～多治見・可児線（中央ライナー可児号）をリニューアル。東京駅まで延伸の上、全便が中津川駅、可児駅に停車。夜行便は「ドリーム可児号」に変更。
4月17日 - 東京駅とムーミンバレーパーク（埼玉県飯能市）を結ぶ高速路線バスを運行開始。
ジェイアールバス関東 沿革
4月18日 - 銚子電気鉄道と共同で高速バス「はさき号」を活用した貨客混載輸送を開始。
4月28日 - 愛知県新城市と地域課題の解決や相互の発展を図ることを目的として、包括連携協定を締結。
4月29日 - 御殿場アウトレット線の1往復を上野駅入谷口まで延伸。
5月1日 - 定期観光バス オープントップバスで行く「信州の旅」を運行開始。 <諏訪支店・小諸支店>
5月10日 - 首都高速道路「呉服橋出入口」廃止に伴い、東京駅を経由・発着する一部路線の運行経路・時刻を変更。
6月7日 - 「つくば号」、「みと号」、「ひたち号」の平日の上り便の都営浅草駅、上野駅の停車を廃止し、運行経路・時刻を変更。
6月30日 - 宇都宮市内の一般路線バスで交通系ICカード利用における日中時間帯の運賃上限制度を開始。
7月1日 - 関東鉄道と共同で「境町 - 東京駅線」を運行開始。
7月22日 - 「新宿なのはな号」全便を君津バスターミナルに停車させ、「新宿君津号」の君津市内の各停留所を廃止し、統合した。
8月20日 - 小諸市にて市内循環線の試験運行を開始（小諸支店が受託受託）。
9月1日 - 白河市にて白河市循環バス「こみねっと」西循環の試験運行を開始（白河支店が運行受託）。
9月11日 - 「秦野丹沢登山号」（東京 - 秦野丹沢登山口大倉）の運行を開始。
ジェイアールバス関東 支店・営業所
JRバス関東では、営業エリア内に17の支店を有する。このうち、東京駅JR高速バス乗り場に併設されている東京営業支店と新城支店を除く各支店は車庫機能を有し、車両が配置されているほか、分車庫・出張所にあたる「営業所」を有する支店もある。
会社発足時に営業所ごとの自主予算制度を導入しており、支店制度を導入した後は支店ごとの独立採算性を重視し、社内では毎年の収支から支店毎にランクが付けられていた。
ジェイアールバス関東 支店・営業所
しかし、この方法では収益性の良い高速バスを担当している支店と一般路線バスのみの支店との格差が大きくなるため、高速バスの担当も各支店に配分する事でバランスを保っている。このため、ほとんどの支店が何らかの形で高速バス運行に関わっている。また、東京発の夜行高速バスの運行を沿線以外の地区の支店の乗務員が担当するケースもある。車両についても各支店に配分されているため、1998年の時点では運用上の都合から東京支店常駐となる車両も存在した。
2003年頃からツアーバスの影響を大きく受けるようになり、支店ごとの独立採算制の方向性も変え、会社全体でのバランスをより重視するようになっている。それまで支店単位で管理していた高速路線は方面別に統括する支店を選定、車両を集中してコントロールするように変更し、ドライバーの勤務と車両の稼働を分離し、より機動的な働きができるようにした。このことを示すように便によっては車両とドライバーの所属が一致していないことがある。
また、支店、営業所が主要高速道路沿線の各地に点在することを生かし、夜行便、昼特急などを新城支店、中央道支店、小諸支店の最寄りの施設で西日本ジェイアールバスの乗務員との交代を行うことで、完全ワンマン運行による輸送の効率化、人件費低減を図っている。これは国鉄バス時代より行われている運行方式である。
支店の権限は大きく、車両の節で後述するように、2007年度までの導入車両は支店ごとに仕様が異なっていた。
※＝Suicaと相互利用カード（PASMO・Kitaca・TOICA・manaca・ICOCA・PiTaPa・SUGOCA・nimoca・はやかけん）が使える路線がある支店・営業所
★＝貸切バス受け付け支店
〇＝認証整備工場をもつ支店
ジェイアールバス関東 高速バス
「JRバス関東の歩みは高速バスを抜きにしては語ることはできない」と言われる 程、会社発足後の高速バス路線開設は多く、全国的にブームのごとく高速バス路線開設が多かった時期の1989年だけで13路線も運行開始しており、1988年の会社発足当時に1000km強だった高速バスの免許キロは、1990年には4,257kmとなっている。こうして次々と路線を開設した結果、夜行高速バスとしては最大手の事業者 となった。高速バスの収入だけで、会社全体の収入の60%（パーセント）を占めている。
その一方、半ば強引とも言える参入により、他社との軋轢を生じた例も少なくない。いわゆる「中央高速バス問題」を始めとして、「ラ・フォーレ号」や「シリウス号」・「ニューブリーズ号」では4社共同運行となり、「らくちん号」では参入予定だった事業者の参入取りやめという事態にもなった。しかし、日本の高速バスにおける黎明期から培った運行・営業のノウハウや、変化への対応力から信頼性は高まり、共同運行事業者も2011年時点では日本最多である。
ジェイアールバス関東 高速バス
近年では、地方支店が東京発着の高速バスを担当していることから、それまで各支店から鉄道を利用して東京へ乗務員を送り込んでいたものを、効率化のため営業便による送り込みとして開設された路線も存在する ほか、主要高速道路の沿線に点在する支店を活用し、運行区間のほぼ中間点で乗務員を交代する独自の運行方式でハンドル時間やワンマン運行の距離でも法令の規定範囲内で乗務員の負荷を軽減した適正運行が行なわれている。また、ドライバーの勤務と車両の稼働を分離し、より機動的な動きができるようになっている。このことを示すように便によっては車両とドライバーの所属が一致していないことがある。また、需要の多い路線には複数の支店が動員されている。
低価格を売り物にする首都圏と各地の都市を結ぶツアーバスに対しては攻めの姿勢を見せており、各種割引運賃の設定などで運賃が多様化している。3列シートには特注のクレイドル（ゆりかご式）シートを採用し、快適性の向上を図っている。また、東京～京阪神系統の夜行便では、4列シート・トイレ付きで低価格の青春エコドリーム号から個室タイプのドリームルリエ号まで多様なニーズに合わせた多彩な車両のラインナップが用意されている。さらに、2018年7月から古参の二階建てバスを置き換える形でヨーロピアンスタイル2階建てバス（Inter City DD型）を導入開始するなど進化を続けている。
ジェイアールバス関東 高速バス
都内の乗降場所の拡大も進めており、従来からのターミナルである東京駅や新宿駅に加え、王子駅、上野駅、新木場駅、谷保駅と、降車専用で池尻大橋や都営浅草駅、中野坂上が追加されている。市町村でのバスターミナルの設置も進んでおり、佐野新都市バスターミナルや多古台バスターミナルなどが設置されている。
東京発着以外の新たな路線展開として、2015年10月1日から長野県内と京都・大阪を結ぶ「青春ドリーム信州号」も開設している。
上野駅入谷口乗降場については、上野湾岸線（上野駅 - TDL）が開業時より使用していたが、同線は廃止後され、常磐道系統の上り便の降車で使用していた（現在は昭和通りの東京メトロ本社前に移動）。その後、つくばセンター～大阪駅間などのドリーム号（上野駅発着に短縮後に廃止）、東京～金沢間の夜行便が使用していたが運行休止、現在は御殿場プレミアム・アウトレット線や自社の貸切ツアーの発着場所として活用されている。
大宮駅西口乗降場については、ONライナー（大宮 - 成田空港）が開業時より使用していたが、同線からJRバスが撤退し、同号の乗降場が移設、さいたま・つくば号（大宮 - つくば）でも使用されたが、同号が廃止されたことにより、バス乗降場として使用されなくなった。
ジェイアールバス関東 高速バス
都市部や観光地などの交通渋滞緩和のため、末端交通機関である自動車等を郊外のバス停に設けた駐車場に停車させ、そこから路線バスや高速バス等の公共交通機関に乗り換えて目的地へ行くパーク＆ライド方式を多くの高速バス路線の停留所で導入している。
2010年3月8日より、従来車内に持ち込みできなかった折りたたみ自転車などの手回り品を有料（500円）で取り扱うサービスを一部路線 で開始している。
2014年12月16日より、ビィー・トランセホールディングスの銀座駅・東京駅 - 成田空港線「THE アクセス成田」に参入し、東京駅の成田空港行き乗り場を八重洲通りからJR高速バスターミナルを変更の上、共同運行するようになった。こちらは好評につき、ダイヤ改正の都度、増便を繰り返した。なお後発参入のため、この路線だけ精神障碍者福祉手帳割引が適用される（逆に茨城県や福島県では、一般路線バスでは唯一対象外の事業者となっている）。さらに2020年2月1日からは京成グループの運行する東京シャトルと統合し、8社共同運行の「エアポートバス東京・成田」に生まれ変わり、1日あたり往復284便を運行する「日本最大のエアポートバス」となった。その後、コロナウイルス感染拡大の影響などで需要が減衰し、大幅に減便されていた。
ジェイアールバス関東 高速バス
バスタ新宿では、2番カウンターがJRバス関東（高速バスネット）の取り扱い窓口になっている（バスタ新宿発着路線のみ発売）。
JRバス東京駅では、2017年12月10日より、きっぷうりばに英語・中国語にも対応したインフォメーションカウンターを開設する。※現在、休止中
高速バスの他会社運行委託については京阪神系統の新城以西を西日本ジェイアールバスに、伊勢崎系統の一部を群馬中央バスに、可児系統を東濃鉄道に、徳島系統を徳島バスに委託している。しかし、西日本ジェイアールバスが実施しているような夜行続行便の観光バス会社への運行委託は当社では実施していない。
2024年度から他バス会社とアライアンス契約（企業同士が戦略的な提携関係を結ぶことで、お互いの強みとなる経営資源を共有し、事業拡大を目指す契約）を結び、ジェイアールバス関東カラーの車両を使用して同路線の運行業務を行い、ジェイアールバス関東はノウハウや販売企画等の提供を行う事業形態を開始した。秩父鉄道観光バス、群馬バス、広栄交通バス（既存の自社路線をJRバスブランドにリニューアル）が同契約を結び各地と草津温泉を結ぶ高速バスの運行を開始している。
ジェイアールバス関東 高速バス
2023年4月現在、バス業界全体で乗務員不足が深刻化しており、当社と共同運行会社においても影響により、いわき号、東京駅～多古台BT線が減便運行となっている。なお、東京駅～多古台BT線ついては2023年11月30日をもって撤退した。
1969年6月10日に日本初の夜行高速バスとして大阪～東京間の運行を開始し、2019年に迎える「ドリーム号運行50周年」を目前としたこの機に、今後も末永くご愛顧いただけるようにという想いを込めて2018年に西日本ジェイアールバスと共同で、6月10日を夜行高速バス「ドリーム号の日」として制定した。記念日制定に伴い、運行49周年である2018年6月10日に一般社団法人日本記念日協会より記念日登録証を授与された。
ジェイアールバステックが当社と共同運行してきた東名ハイウェイバス、御殿場プレミアム・アウトレット線、かしま号は同社の高速バス運行事業終了に伴い、段階的に当社に移管し、2025年7月1日に移管が完了した。
一部路線に、女性専用席を設けている。
ジェイアールバス関東 高速バス
乗務員に対する教育・訓練では、2013年6月に「安全研修センター」（栃木県佐野市）を設置し、高速バスタイプの訓練専用車を導入し、教育、訓練のより一層の充実を図っている。安全研修センターには経験豊富な専任講師が常駐し、新任乗務員の養成をはじめ、全ての乗務員に対する定期的な訓練を統一した基準とカリキュラムに基づいて実施している。訓練専用車では、乗務員の運転操縦や注意配分など安全運転に関わるさまざまなデータの収集が可能で、科学的な視点に基づく教育・訓練と安全対策に役立てている。
車両の安全対策としては、衝突被害軽減ブレーキシステムなど最新の安全装置を搭載した新型車両の導入を積極的に進めており、2022年3月現在、高速線車両の平均車齢は6.9年となっている。また、従来型車両にも安全装置を新たに備え、高速線車両の全車に安全装置を装備している。
ジェイアールバス関東 高速バス
長距離高速バスの乗務形態では、関西方面は道の駅もっくる新城または小黒川PA、金沢方面は東部湯の丸SAにおいて共同運行の西日本ジェイアールバスの乗務員と交代する国鉄バス時代から継承される独自のワンマン乗継運行を採用することでハンドル時間やワンマン運行の距離でも法令の規定範囲内で乗務員の負荷が軽減される適正運行が行なわれている。また東京支店内に「高速バス運行本部」を設置し、高速バス全体の運行統制を行っている。高速バス全車両ではGPS内蔵通話装置により、運行管理者がバス走行位置把握システムによりリアルタイムでバスの走行箇所を把握するとともに、必要な連絡、指示が出来る体制としている。
社内で運転コンクールを毎年開催しているほか、2017年からはJRバスグループ8社で「全国JRバスグループ運転競技会」を毎年開催している。
2015年4月に高速バス乗務員用タブレット端末を導入した。乗務員が座席管理や運行表（スタフ）の閲覧などに使用しており、ジェイアールバス関東では、最新道路交通情報のインターネット閲覧、緊急時の対処方法や車両点検方法等の各種マニュアルの電子化も進めており、今後もタブレットを活用し、さらなる業務効率化、安全運転の遂行、サービス向上につなげていきたいと考えている。
ジェイアールバス関東 高速バス
携帯電話・スマートフォン充電用の座席コンセントを2013年度導入の新車から導入し、2014年度車からはコンセントをUSBタイプに変更。それ以前の導入車両も一部にコンセントまたはUSBタイプが後付けされている。
2018年1月の諏訪営業所の5台を皮切りにフリーWi-Fiが取り付けられている。東京駅～東京港フェリーターミナル線では、全車両Free Wi-Fi、電源、トイレ付きを売りにしている。
ラッピングバスや車体の側面やリアガラスなどへの広告の掲示を行なっている。ラッピングバスは沿線の市町村や観光施設を中心に様々な業種から受注している。キャラクターを用いたものが多く、広い層からの注目を浴びている。
< >内は共同運行会社
東北道方面
関越道方面
ジェイアールバス関東 高速バス
本庄・伊勢崎ルート（東京・新宿 - ふかや花園・本庄・伊勢崎(・前橋駒形)）<一部便を群馬中央バスへ管理委託>
2009年（平成21年）7月17日 - 開業。1日10往復。
2009年（平成21年）12月1日 - 運賃（大人片道）を2,000円から1,500円に値下げ。
2009年（平成21年）12月11日 - 経路変更。バス停追加（伊勢崎駅入口、坂東大橋北）。
2011年（平成23年）4月1日 - 経路変更。伊勢崎駅に乗り入れ。バス停追加（伊勢崎駅、伊勢崎サンホテル前<2014年11月13日からアパホテル伊勢崎駅南>）および廃止（伊勢崎駅入口）。
2011年（平成23年）12月26日 - 平日ダイヤと土休日ダイヤの二本立てとなる。平日ダイヤは1日8往復に減便。
2012年（平成24年）9月1日 - 伊勢崎オートレース場前まで路線を延長。伊勢崎西部公園バス停は公園内から道路上に移設の上、伊勢崎市民病院北（高速バス乗り場）に変更。座席指定予約制から座席定員制に変更。Suica、PASMOが利用可能になる。
2012年（平成24年）12月1日 - 一部座席（原則前方の20席）を座席指定制に戻す（その場合、Suica、PASMOでの精算は不可）。
2016年（平成28年）4月4日 - 新宿駅の発着場所をバスタ新宿（新宿駅新南口）に変更。
ジェイアールバス関東 高速バス
2019年（令和元年）7月16日 - 2往復を群馬中央バスに運行委託開始（委託便は交通系ICカード利用不可）。あわせて上り便の一部が中野坂上バス停に停車（降車専用））。
2021年（令和3年）3月1日 - 群馬中央バスへの運行委託を4往復に拡大。
2022年（令和4年）10月20日 - 1往復（直営便）を東京駅起終点とするとともに、ふかや花園プレミアム・アウトレットへ乗り入れ開始。
2023年（令和5年）4月1日 - 群馬中央バス委託便の運行区間が、東京駅 - 既存区間(ふかや花園通過) - 前橋駒形（群馬中央バス前橋営業所）間に区間延長。これにより、運休便を除く全運行便が東京駅起終点となる。
圏央道方面
常磐道方面
湾岸線・東関道・館山道方面
中央道方面
東名方面
東北方面
東海・中部方面
京阪神方面（東名、新東名経由）
四国方面
夜行便のバスタ新宿及び東京ディズニーランド発着については発着枠の関係により2号車以降は乗り入れできず通過または非経由となる。このことから東京駅発着・バスタ新宿非経由の2号車や臨時便を別途運行することが多い。
下記の路線で他社に運行を委託している。
他社への委託ではなく、提携の形にて、提携相手がJRバス関東に準じたデザインの車両（当社もしくはJRバス東北からの移管車だが、車両の会社ロゴの「JR」部分について、親会社であるJR東日本正規ロゴから、黒色の一般的なフォントの文字に書き換えられているのが特徴的）で運行しており、JRバス関東は直接運行には関わらず、運行ノウハウや乗車券販売などで間接的にサポートして路線が運行されている（ただし、共通の停留所等ではJRバス関東の路線のひとつとして集約して案内されている）。
2024年から順次アライアンス運行を開始しており、2025年末時点のアライアンス路線は、全て首都圏各地から草津温泉を発着する「ゆめぐり号」のラインナップとなっている。
廃止路線を除き、運行支援業務は継続。ニューブリーズ号については、後述の理由により代替運行の形で一時的に復帰した。
スカイツリーシャトル（東京 - 両国・江戸東京博物館前 - 東武ホテルレバント東京 - 東京スカイツリータウン）<東武バスセントラル>
2012年（平成24年）5月22日 - 運行開始。1日44往復。
2013年（平成25年）4月16日 - 1日36往復に減便。
2014年（平成26年）8月1日 - 朝夕の一部便が「東武ホテルレバント東京」（錦糸町）を経由。ダブルデッカー使用便が朝の東京発1便（1便減便）のみとなる（当該便ではSuica・PASMOの使用及び車内精算は不可）。
2015年（平成27年）4月1日 - 1日22.5往復（下り23本、上り22本）に減便。JRバス関東担当便は下り5本、上り4本のみとなる。
2015年（平成27年）5月11日 - 「両国・江戸東京博物館」バス停を新設（一部便を除き停車）。1日フリーパス券の発売を開始。
2016年（平成28年）12月22日 - 1日12.5往復（下り13本、上り12本）に減便。JRバス関東便は1日4往復となる。
2019年（平成31年）3月31日 - この日の運行をもって廃止。
運行支援業務を行う路線（上記撤退路線を除く）。
ジェイアールバス関東 一般路線バス
一般路線については、一部の枝線の廃止はあったものの発足後しばらくは国鉄バスから引き継いだ路線をそのまま運行していた。1993年11月に一般路線の総距離の40%に相当する35路線87区間・総延長591.6kmの路線を、1998年までに廃止することを表明し、地元との協議により同意が得られた路線は廃止が進められ、1988年の会社発足当時に約1,700km強だった路線バスの免許キロは、1997年には1,214kmに減少している。廃止の理由としては、以下のような理由が挙げられていた。
廃止対象となった路線の一部は、自治体からの補助金により運行が継続されたり、一部路線では運行主体を自治体とし、運行受託として路線自体は存続されているケースもみられる。また、観光路線などでは季節運行により存続しているケースもある。
国鉄時代から運行される路線では、昔ながらの旧道を運行する区間が多く存在するのが特徴である。
旧国鉄一般路線縮小の一方、規制緩和以降は大型ショッピングセンターアクセス路線や深夜バスなど収益性の高い新規路線の開拓も限定的ながら行われた。
ジェイアールバス関東 一般路線バス
小諸支店では高速バスとの直通運行が行なわれており、収支が厳しい中、限られた車両数で効率良く地域の輸送を維持している。宇都宮支店では沿線イベントや真岡鉄道のSL運行に合わせた臨時バスの運行など特需対応を積極的に行なっている。館山支店では沿線住民から意見を募るなどして、花火大会に合わせた臨時便の運行や金曜日のナイトバスの運行、大型スーパーへの買い物バスの運行、乗り継ぎに配慮した路線の延伸などで地域に寄り添ったきめ細かな対応で積極的に利便性向上を図っている。成田空港支店（旧東関東支店）では成田空港や空港関連施設へのアクセス改善や新規開業病院への路線開設など新たな需要創出に積極的である。東京支店では他支店の高速バスの東京折り返し待機の間合い活用等による東京駅 - 国際展示場駅・東京ビッグサイト・東京港フェリーターミナル線を他支店とともに運行している。
2018年6月1日よりJR東日本が発売している訪日外国人旅行者向けフリーきっぷ「JR EAST PASS」でフリーエリア内のJRバス（関東・東北）が運行する路線バスの利用可能になった。
水戸支店では収益の改善が見込まれないことから、2020年3月31日をもって一般路線から完全撤退した。
ジェイアールバス関東 一般路線バス
館山支店では2020年10月28日からオリジナルアニメーション「戦翼のシグルドリーヴァ」とのコラボを実施していた。館山駅のJRバス待合所にポスターを掲示したり、洲の崎線・南房州本線では各キャラクターの場面写のラッピングバスを運行した（運行車両の廃車により2021年10月中に終了）。これに合わせ日東交通とアニメコラボの共通1日乗車券も限定発売している。2021年3月20日からは洲の崎線で自転車をバス前面に2台積載可能な自転車ラックバスの運行を開始した。一般路線を対象とした様々な営業施策を実施している。
2021年12月20日より、東京都内完結の一般路線バス「東京駅 - 国際展示場駅・東京ビッグサイト・東京港フェリーターミナル線」の運行を開始した。
土浦・成田空港・長野原・佐野・宇都宮・西那須野・白河・館山の各支店、古河営業所の各一般路線ではSuica並びに相互利用カードで乗車できる。
定期券がスマートフォンで購入できる「スマホ定期」を発売している。
ジェイアールバス関東 一般路線バス
宇都宮支店の水都西線では、2023年（令和5年）8月26日に宇都宮ライトレール宇都宮芳賀ライトレール線（ライトライン）が開業したことで、宇都宮と清原、芳賀地域を結ぶという使命を同路線へと譲るため、JR宇都宮駅方面へ乗り入れる茂木系統は朝夕の僅かな本数の運行となり、新たに宇都宮市、芳賀町より運行を受託する各地域の循環バス路線を含め、LRTのフィーダー路線に転換し、大きな転機を迎えた。
土浦、阿見、つくば地区では関東鉄道（バス）との共通乗車扱いや両社の路線持ち替え、共同運行化も行われている。
ジェイアールバス関東 一般路線バス
東京駅〜東京港フェリーターミナル線（東京駅 - 国際展示場駅 - 東京ビッグサイト - 東京港フェリーターミナル）
2021年12月20日、1日13往復にて運行開始。高速道路は走行しない。東京港フェリーターミナル発の始発便のみ、オーシャン東九フェリーの到着時刻に合わせて運行される。
都営バスなどよりは運賃が割高であるが、高速バス車両を使用し、座席定員制で全車両がトイレ、Free Wi-Fi、コンセント付きであることを売りにしている。東京港フェリーターミナルを発着する路線バスは、2003年に廃止された都営バス海02系統以来の乗り入れとなった。
訪日外国人旅行者向けフリーきっぷ「JAPAN RAIL PASS」および「JR EAST PASS」では乗車できない。
2023年12月1日より下り5本、上り6本に減便。
2024年8月1日より下り2本、上り2本に減便。以降は東京ビッグサイトでのイベント開催時も臨時増発を行わなくなった。
多古線（成田駅 - 三里塚 - 航空科学博物館 - （芝山千代田駅） - 多古台BT - 八日市場駅）
※芝山千代田駅は2往復のみ経由
成田駅 - （さくらの山） - （インパレスホテル） - 三里塚 - （空の駅風和里 しばやま） - （ひこうきの丘） - 航空科学博物館 - 成田空港（第2ターミナル・第1ターミナル） - 貨物管理ビル前 - 第7貨物ビル（乗降には入構許可証が必要）
高遠線（上伊那農業高校 - 伊那中央病院 - JRバス車庫 - 伊那北駅 - 伊那バスターミナル - 高遠駅 - さくらの湯 - 高遠高校 - 伊那藤沢 - 古屋敷 - 杖突峠 - 茅野駅）
高遠駅 - 古屋敷間は伊那市営バス藤沢線（伊那市交通協議会路線）として運行
伊那北駅 - 上農高校直行バス（伊那北駅発3本、上農高校発1本）の区間運行もある。
古屋敷 - 茅野駅間は高遠さくら祭り時期内よに運行される「臨時快速バス」（茅野駅 - 高遠駅）および登山シーズン運行の「南アルプスジオライナー」（茅野駅 - 高遠駅 - 戸台パーク(仙流荘)）のみ不定期運行
夏季登山シーズンの土日祝日を中心に伊那バスターミナル - 高遠駅 - 戸台パーク(仙流荘)の早朝便「モーニングジオライナー」も運行
廃止路線
コミュニティバス、路線バスなどの受託運行。
ジェイアールバス関東 貸切バス
貸切バスは福島県・栃木県・茨城県・千葉県・東京都・群馬県・長野県の各地を出発、又は到着する行程であれば利用が可能である。本社営業部と白河、宇都宮、佐野、土浦、成田空港、館山、東京、長野原、小諸、伊那の各支店で受け付けている。
ジェイアールバス関東 定期観光バス
現在は運行されていない。
以前は関東や信州エリアで観光地を巡る定期観光バスを運行していた。2020年秋からは二階建オープントップバスを使用したコースも運行されていた。
ジェイアールバス関東 乗車券・カード類（高速バス）
近距離高速路線でSuicaを導入している。
JR高速バス路線では、つくば号、みと号、かしま号、マイタウン・ダイレクトバスTDR・新浦安ルート、新宿 - TDR（TDR発のみ）、エアポートバス東京・成田（空港行きのみ）、マロニエ東京号、マロニエ新宿号、境町 - 東京線の運賃および房総なのはな号と新宿なのはな号の車内運賃において交通系ICカードを使用した支払いが可能。一部の路線ではICカード割引運賃も設定されている。
通勤・通学定期券を発売している。定期券での深夜便（つくば号座席指定便）の利用については差額の支払いが必要になる。座席指定予約制のかしまサッカー号では定期券が利用できない。
2019年4月1日よりつくば号、かしま号、境町～東京線の定期券はスマホアプリ「バスもり！」で購入できるようになった。
同社の高速バスが利用できる企画乗車券には次のようなものがある。
ジェイアールバス関東 乗車券・カード類（高速バス）
運行会社の窓口での発売に加え、コンビニ端末やインターネットなどを活用する「発車オ〜ライネット」に参加しているが、2006年には同社が中心になってシステム開発した「高速バスネット」の運用を開始した。このシステムでは、ITを活用したリアルタイムで予約・販売できるほか、同システムで完売した便についても「マルス」や「発車オ〜ライネット」の管理している空席を販売できる仕組みにより販売（売れ残り）リスクの軽減を図っている。さらに、路線によっては「高速バスネット」で事前に予約・購入やクレジットカード決済をすると、運賃を割り引くなどの特典を実施している。特に同社とJRバス他社との共同路線については、「高速バスネット」への移管が進められている。ただし、つくば号、みと号、かしま号、東京～富里・多古線、みと号、新宿～TDR線（TDR発のみ）、マイタウンダイレクトバスTDR・新浦安ルート、エアポートバス東京・成田（成田空港行きのみ）などの一部の近距離路線については先着制・予約不可となっている。
中央高速バス諏訪・岡谷線については、運行の主体がアルピコ交通および京王バスであるため、京王電鉄バスが運営するハイウェイバスドットコムでの予約・販売となっている。
ジェイアールバス関東 乗車券・カード類（高速バス）
一部の路線では、往復割引、学生割引、団体割引、大人の休日会員割引なども設定されている。東名ハイウェイバスの東京駅～東名富士間、静岡駅間、浜松駅間、名古屋駅間と静岡駅～名古屋駅間では都市間往復割引きっぷを発売している。JRの周遊券での高速バス利用については、周遊券の廃止に伴い、この制度自体がなくなった。
早期購入割引、得割、トク特割、往復割引、大人の休日会員割引については「お得なきっぷを取り揃えています」に詳細が記載されている。
2016年6月1日より、京阪神線、草津温泉線、佐久・小諸線、佐野線、伊勢崎線、長野～関西線、箱根線、館山線、御殿場アウトレット線、金沢線、知多半田線、吉川・松伏線において、高速バスの乗車券（指定席）にQRコードを添付することにより、乗車時の乗務員による乗車券チェックを簡素化、よりスムーズに乗車できるようにするとともに、高速バスネットWEBサイトでの乗車変更や払戻しの出来る時期を拡大している。
2021年4月より、バスと旅先のアクティビティのチケットのセットなどをWEBアプリで購入することが可能となる新たなシステム「高速バスネットプラス」を運用開始した。高速バス往復チケットと周遊券や施設利用券などのセットを格安で販売している。
ジェイアールバス関東 乗車券・カード類（高速バス）
2023年7月5日より、高速バスネットにおいて、モバイル決済導入した。対応ブランドはau PAY、d払い、楽天ペイ、PayPay。乗車券購入時のWEB決済におけるQRコードによるモバイル決済方式となっている。
東京駅八重洲南口のJRバス窓口では、昼行便の座席指定制及び予約定員制の便の乗車日当日のキャンセル待ちの受付も行なっている。但し、東京駅発車後にも乗車停留所がある便や一部の路線は除く。
その他、高速バスを利用すると、乗り場周辺の飲食店やマッサージ、サウナ等が割引となるサービス利用券の配布などの各種サービスも実施されている。
2025年12月1日より、高速バス「新宿・東京～佐野新都市線（マロニエ号）」、「新宿～佐久・小諸線」において、完全キャッシュレスバスの実証運行を実施する。
この実証運行は、国土交通省の「令和7年度 完全キャッシュレスバス実証運行」の実証実験事業者の採択を受け、実施する。
持続可能な公共交通サービスの提供を実現するため、実証運行を通じて、完全キャッシュレスバスにおける効果や課題を検証する。
ジェイアールバス関東 乗車券・カード類（一般路線バス）
一般路線の一部でSuicaを導入している。宇都宮支店管内一般路線では古くから3社共通バスカードを導入していたが、2021年春に交通系ICカード「totra（トトラ）」へ移行した。
それらとは別にスマートフォンアプリを使用した定期券や回数券も導入しており、路線や地域実情に合わせながら必ずしもSuicaに拘らない乗車券の電子化に積極的である。
近距離高速バス及び土浦・成田空港・長野原・佐野・宇都宮・西那須野・白河・館山の各支店、古河営業所の各一般路線ではSuica並びに相互利用カードで乗車できる。
当初は利用できるカードはSuica・PASMOに限定されていたが、2013年3月23日の交通系ICカード全国相互利用開始と同時に10種類の相互利用に拡大した。
土浦支店の一部路線で交通系ICカード割引運賃も設定されている。
栃木県内（宇都宮支店・西那須野支店）の一般路線（那須塩原市ゆ～バス除く）は2021年3月21日にSuicaの機能を備えた地域連携ICカード「totra」を導入。当社では宇都宮支店、西那須野支店で発売する。
「totra」の宇都宮ライトレールとバスとの連絡定期券は、宇都宮支店・西那須野支店でそれぞれ発売する（宇都宮ライトレール区間のみの定期券は発売不可）。
通常の区間指定の定期券の他、以下の種類が存在する。
ジェイアールバス関東 乗車券・カード類（一般路線バス）
LRT⇔路線バスと宇都宮市地域内交通の乗継割引をtotra利用者限定で宇都宮市・芳賀町による施策により実施している。totraを使ってLRTと路線バス (関東自動車・ジェイアールバス関東) を乗り継ぐと、2乗車目の公共交通の運賃から大人100円・小児50円が割引される。LRTまたは路線バス⇔宇都宮市地域内交通と乗り継いだ場合は大人200円・小児100円が割引される。
宇都宮市内では「totra（トトラ）」などの交通系ICカードを使って日中（午前9時～午後4時）に路線バスを利用すると、1乗車の運賃の上限が400円になるバスの上限運賃制度がある。
福島県浜通り・県南地域において、地域連携ICカード「LOCOCA」が導入され、それに伴い、白河支店の一般路線において、交通系ICカードの利用が可能となった。
2017年3月末限りでJR東日本の駅窓口（白河・新白河・磐城棚倉・成田・佐原・土浦・軽井沢）での定期券委託発売を終了。JRバス支店窓口での一般路線バスの定期券の販売も白河、西那須野、宇都宮の各支店を除き、2025年3月31日をもって終了。
それと前後してスマートフォンアプリ「バスもり!コンシェルジュ」（現バスもり!）による「スマホ定期券」を日本で初めて導入した。Suicaなどの交通系ICカードの仕組みを使わず、従来の紙製定期券と同様の提示による乗降方法をとる。
ジェイアールバス関東 乗車券・カード類（一般路線バス）
2025年4月1日より「平日学期定期券」、「学期定期券」を発売開始。「特殊定期券」及び「回数券」は、2025年4月30日をもって発売終了。
回数券は2025年4月30日をもって発売終了。支店ごとに発売していた回数券が異なった。
2025年4月1日に各窓口での一般路線バス磁気(紙)定期券の発売を終了し、スマートフォンで定期券をご購入できる「スマホ定期券」を導入している。スマートフォンを利用できない利用者については「定期券郵送サービス」（手数料・送料は有料）も実施している。
サンキュー♥ちばフリーパス
期間限定発売
ジェイアールバス関東の館山駅～汐留橋～安房神戸～布良崎神社～白浜の屛風岩～長尾橋～野島崎灯台口～安房白浜、館山駅～城山公園前～西岬～洲の崎～伊戸～南房パラダイス～相の浜、八日市場駅～航空科学博物館～JR成田駅、成田空港～JR成田駅、多古台BT～佐原駅のの路線バスも利用可能
JR東日本の千葉県内の主な駅と久里浜駅（指定席券売機のみ）で発売するが、一部、取扱いしていない箇所もある。
ジェイアールバス関東 車両
三菱・UDトラックス（旧:日産ディーゼル）・日野・いすゞ・スカニアの5メーカーを保有している ほか、ネオプラン製、カルサン社製等の輸入車の導入実績がある。
支店ごとに実情に合わせて車両仕様が決定されており、1992年度までは支店の判断により、同時期導入の車両でも国鉄バス色と高速バス色のどちらで導入するかが異なっていた。
地域により乗降方式やICカード対応有無などの違いがあるため、各ドア脇の表記が入口・出口・出入口・締切と異なり、「IC」ステッカーも有り・無しなど、所属支店・営業所によって違いがある。また、座席配置も観光地では2人がけ座席が多いタイプ、都市部では座席数が1人がけ座席が多いタイプなどの違いがある。さらに白河支店では車体が若干長い長尺車を好んで導入している。
長野原支店や小諸支店のように観光輸送の比率が高い支店では、高速車や貸切車から転用したハイデッカー車を導入することがある。また、館山支店や小諸支店では高速バスとの直通便があり、同便の一般路線区間や高速バスの間合い運用主体の東京駅～東京港フェリーターミナル線もハイデッカー車で運行する。宇都宮支店では、以前は栃木県バス協会との申し合わせによりエリア内の他社に合わせて方向幕の位置も他の地区と異なる仕様で、部内やバスファンからは「宇都宮仕様」と呼ばれることがあった。
ジェイアールバス関東 車両
近年では中古購入（過去には都営バス・川崎市営バス・横浜市営バス・西武バス・京浜急行バス・東急バス・立川バス・国際興業バス・しずてつジャストライン・東濃鉄道などの中古購入実績あり）が多く、最近では、2009年に東急バスから三菱ふそう・ニューエアロスターノーステップバスを購入したのを皮切りに、2020年現時点では国産4メーカーとも購入実績がある。また、2010年にはJR東海バスから日野・ブルーリボンシティハイブリッドノンステップバスを購入している。
2016年度より再び一般路線車の新車購入が再開され、2016年度はいすゞ・エルガノンステップバスが6台（宇都宮支店に3台、土浦支店に1台、東関東支店に2台）投入されている。2017年度以降は日野・ブルーリボンと日野・レインボーが購入されている。
また、長野原支店では1994年以降に高速バスの車両を大改装した上で水戸岡鋭治がデザインを担当した「イエローバス」を運行したことがあった（詳細は志賀草津高原線#イエローバスを参照）。西那須野支店では「もみじバス」を既存車両の塗装変更 及び新車 で導入した。また、棚倉支店では、車体に白河市・表郷村（現在は白河市に合併）・棚倉町の名物を描いた通称「だるまバス」を運行したことがあった。
ジェイアールバス関東 車両
2014年には、国鉄バス時代（1960年 - 1971年）の塗装を復刻した「復刻デザイン路線バス」（L538-02503）を登場させた。2017年4月より白棚線にて開業60周年を記念して、鉄道時代に運行していた国鉄C1225型の蒸気機関車をイメージした「SLラッピングバス」（L527-03502）を運行している（白河支店の1輌）。また、2018年1月に高遠線が開業70周年を迎えるのを機に、国鉄時代の塗色を復活させた復刻塗装バス（L538-99206）を中央道支店で2023年8月まで運行していた。
長野原支店では2018年冬期から毎年冬期の繁忙期輸送にジェイアールバス東北青森支店より新幹線E5系はやぶさカラーのハイデッカー車2台を借用して志賀草津高原線の臨時急行便で運行している。2020年度冬季輸送は同社からの車両の借り入れ無し。
2019年度末時点のノンステップバス導入率は約61％（適用除外車両を除く）である。車両更新にあたっては地域の事情にあわせてノンステップバスへの置き換えを進めていくとしている。
行先表示機は方向幕タイプからLEDタイプに置き換わったが、2019年から中古購入車も含め、黒地に白文字表示の液晶タイプが採用されるようになった。LEDタイプでも駅や空港などの行き先にピクトグラムを付けて表示することが多くなった。
ジェイアールバス関東 車両
2023年現在、新たに投入される一般路線車は中古購入車がメインとなっているが、伊那支店には登山輸送などでの使用を見越した着席重視型で2人掛けシートの多い所謂”ワンロマ”タイプ、長野原支店には鉄道線との連絡輸送のための一度に65人を輸送可能なハイデッカー車、など各支店の路線の特性に合わせた車両が選択されている。
成田空港支店の新型エルガの1台がユーグレナ社のバイオディーゼル燃料「サステオ」を使用して運行されている。
2024年11月に秩父鉄道観光バスより譲渡された60席仕様の日野セレガ1台を茶色ベースの新しいカラーリング「スパ・ブラウン」に変更し、長野原支店の一般路線に導入した。
最新の安全装置を搭載した新型車両の導入を積極的に進めており、2022年3月現在、高速線車両の平均車齢は6.9年となっている。また、従来型車両にも安全装置を新たに備え、高速線車両の全車に安全装置を装備している。
ジェイアールバス関東 車両
会社発足直後に高速バス路線の増強が行われたため、続々と新車が投入され、その中でも三菱ふそう製はまとまった台数で購入され、同社製の比率が高くなった。特に夜行高速バスへの参入が多かった1988年（昭和63年）から1990年（平成2年）までの期間には、三菱ふそう・エアロクィーンMだけで41台が導入されている。1999年には西日本車体工業製車体を架装した日産ディーゼル（現・UDトラックス）製の夜行高速バス車両を導入し、2000年から2005年まで昼行高速バス車両でも同社製が導入された（夜行高速バス車両は2006年まで導入）。開設当初のスーパーニュードリーム号や青春ドリーム号、初期の楽座シート搭載車でも同メーカー製が選択された。S型ボディやC型ボディの車両を購入した支店もありバリエーションが豊富であった。
1997年から2004年までは車両調達価格の低廉化にも力を入れ、車内設備も簡略化されていた。常磐道や東関東道の近距離路線を中心に低馬力仕様のハイデッカー、ミドルデッカーも多く導入された。他のJRバスとの同一仕様車両による共同発注も実施している。また、貸切車に便所を追設の上、昼行高速車に転用した車両も存在した。
ジェイアールバス関東 車両
その一方で、定員が多く、乗客1人あたりのコスト低減を図ることができるダブルデッカーを導入している。1991年開業の「ドリームふくふく号」では初めて夜行高速バスにダブルデッカーを導入、その後需要の多い「ドリーム神戸号」にも同車種を導入し、ダブルデッカーによるワンマン運行を実現した。その後、東北・東海・近畿・中国・四国方面にも投入され、夜行便の主力車種となっている。1993年にはヨンケーレ（ベルギー）製も2台導入した。三菱ふそうでのエアロキングの生産中止に伴い、ダブルデッカー車は2010年度を最後に同車種の新車導入が止まり、老朽化による廃車も進み保有台数が徐々に減少し、使用路線も減少していた。2018年7月14日より、スカニア/J-InterCityDD が新たに登場したこともあり、ダブルデッカー車の導入が再開された。
ジェイアールバス関東 車両
また、JRバスの中では輸入車両の導入台数が最も多く、1990年に東京駅 - 東京ディズニーランド間の「ファンタジア号」に、ネオプラン・スカイライナーを中古で導入したのを皮切りに続々と新たなメーカーの新たな車種を導入していった。
1996年からは、ダブルデッカーほど車両価格は高くないが座席数が通常のスーパーハイデッカーよりも多く確保できるという理由 で「ドリームふくふく号」へボルボ・アステローペを就役させ、徐々に増車し、同車の導入台数は25台に達した。さらに1997年からは夜行高速バス車両としても座席数の多くとれる ネオプラン・スカイライナーを導入、さらに2000年には全長15 mの長大バスである、ネオプラン・メガライナーもお目見えした。なお、ネオプラン社製の車両は、現在は全て引退している。日本に輸入された4台のメガライナーのうち、2台が火災事故を起こしたことから国土交通省の指示で運行を終了、残りの車両もドイツに返却された。先述の通り、2018年7月14日より、スカニア・J-InterCityDDが新たにラインナップに加わった。
ジェイアールバス関東 車両
2004年度後期以降、快適性と安全性をさらに追求し、従来型に比べて格段に広い「楽座シート」やマイナスイオン発生装置付空気清浄機を装備、安全性を配慮した各種最新安全装置を搭載した車両の導入が進んでいる。
かつて「上州ゆめぐり号」（一部の便は除く）および「知多シーガル号」には、前部2列目までがGシート（3列）のプレミアムコーチを投入していた（現在は一般車両に改造）。「超得割青春号」には、貸切車を改造したトイレ無し車両を使用していた（運行終了）。
三菱ふそう製は2013年度に館山支店に3台配置された三菱ふそう・エアロエース以降に新車導入がなく、新車導入は日野・セレガに統一されている。2014年度車にいすゞ・ガーラが2台存在するのはドリームルリエ導入時に種車として捻出したセレガと西日本ジェイアールバスのガーラをトレードしたものである。
ジェイアールバス関東 車両
2011年度からは、東京支店、鹿嶋支店、東関東支店、館山支店、土浦支店、水戸支店、佐野支店にメーカー標準品のハイエンドシート・補助席無しの44座席仕様の日野・セレガを多数導入している。2012年度には、東京支店にトイレ無しの49座席＋補助席11席仕様車両を3両導入し、スカイツリーシャトルや新宿湾岸線などに投入していたが、現在は3台とも貸切車や一般路線車に転用されている。2013年度には、旧国鉄バスの塗装を施した、復刻デザインバス「青いつばめ」と「赤いつばめ」の運行を開始。前者は「東名ハイウェイバス」ほか、後者は「いわき号」ほかに投入された（2015年7月12日をもって運行終了）。
2014年度には、東京・新宿 - 京阪神間に3列完全独立型シート28席仕様の「グランドリーム号」、「グラン昼特急号」用新型車両を4両を導入した。
ダブルデッカー車両は、1階席のプレミアムシートに仕切りカーテンを装備した豪華仕様のプレミアム車両、3列シート車両、4列シート車両（青春タイプ）、4列シート車両（エコドリームタイプ）が存在する。導入車種は、三菱ふそう・エアロキングに統一し、2008年度に青春ドリーム・昼特急用で4両、2009年度に青春エコドリーム号用で4両、2010年度にプレミアムドリーム・昼特急用で2両を導入した。2023年夏より4列シート車両（青春タイプ）の新車導入が再開された。
ジェイアールバス関東 車両
2016年度には、中距離高速路線用として、後部一面に広いパウダールームを設置し、シートもシートメーカー（天龍工業）と共同でリクライニングポイントを少し上げ、シートピッチの数値以上の居住性を確保した新車（日野セレガ・ハイデッカー）を25台購入した。これらを小諸、草津、会津若松の各線に投入して評価を行った上で2017年度以降も導入、いわき、日立、東名高速線などにも投入。また、JRバスの都市間高速バスでは初となる車両左側中央部に車椅子乗降用のリフトを装備する車両（日野セレガ・ハイデッカー）も1台購入した。
2017年度導入車からは、座席の枕カバーの材質をレザー製に変更した。
2017年3月31日から、東京と大阪を結ぶ夜行高速バス「ドリーム号」に最上級のプレシャスクラス（2列シートエリア4席）とアドバンスクラス（3列シートエリア14席）を併せ持つ「ドリーム ルリエ (Relier) 」を新規投入した。この専用車両には、2011年度導入の日野セレガ・ハイデッカーが2台改造された（うち1台は西日本JRバスに移籍）。さらに2018年4月27日から、ルリエ号が増強され、新たにプレシャスクラス6席、アドバンスクラス10席の仕様の新車両を追加投入した。この追加車両にも、2011年度導入の日野セレガ・ハイデッカーが2台改造された（うち1台は西日本JRバスに移籍）。
ジェイアールバス関東 車両
2018年度には、はとバスの全面的な協力のもと、スカニア社・バンホール社が共同開発したアストロメガ（InterCityDD）の導入を開始した。車内は4列シートで座席数は58席と車椅子1台である。導入後、バスタ新宿～東京ディズニーリゾート間、東京駅～名古屋駅間で運行し、2019年5月17日からは東京・新宿～京阪神線（青春昼特急号、青春エコドリーム号）にも投入する（2019年4月26日から青春エコドリーム号2号車にてプレ運行を開始し、4月30日には平成ドリーム令和号で運行）。2019年4月13日、14日には春の白棚線沿線ツアーにもインターシティDDを使用した。InterCityDDは2018年度に5台、2019年度頭に1台を青春エコドリーム仕様で導入。新タイプのグランエコ仕様を2019年度に3台、2021年度に2台を導入した。2023年度は青春エコドリーム仕様を追加している。老朽化したエアロキングを置き換えている。
四季島バスやスカニアInterCityDDに採用していたフルカラーデジタル行先表示器が2019年度のハイデッカー新車でも採用された。