ヴィッセル神戸 歴史
DF槙野が現役引退を表明したほか、FWボージャンが契約満了に伴い退団。GK伊藤とDF櫻内がFC今治、GK飯倉が横浜FM、DF小林友がセルティック（スコットランド）、MF小林祐が札幌、MF郷家が仙台、MF井上が横浜FC、FW藤本が鹿児島、FW小田がハート・オブ・ミドロシアンFCへ完全移籍。前年徳島へ期限付き移籍していたMF櫻井は引き続き徳島へ期限付き期限を延長した。
戦力補強として、京都からDF本多勇喜、東京VからMF井出遥也、C大阪からFWジェアン・パトリッキが完全移籍で加入し、湘南から齊藤未月、ポルティモネンセSC（ポルトガル）からFW川﨑修平が期限付き移籍で加入した。東福岡高校からMF浦十蔵、びわこ成蹊スポーツ大学からMF泉柊椰が入団。ユースからDF寺阪尚悟、MF安達秀都、FW冨永虹七が昇格。シーズン開幕後、町田から高橋祥平が期限付き移籍で加入。9月3日、ガラタサライSK（トルコ）を退団した元スペイン代表のMFフアン・マタ、フェレンツヴァーロシュTCからハンガリー代表のMFバーリント・ヴェーチェイを完全移籍で獲得。
前年終盤にフィットした大迫をターゲットとするサッカーに移行。現代サッカーらしい走れて強い選手を集めた。攻撃では大迫や武藤が個人レベルの高さを発揮し、怪我なく戦い続けたことで、チームは首位を走ったが、消化試合数が1試合少ない中、迎えたシーズン前半戦折り返しのセレッソ大阪戦で敗戦。首位から陥落したものの2位で折り返した。シーズン途中の7月に入団以来クラブの顔としてプレーしてきた主将MFイニエスタとサンペールが双方合意の元で退団し、ムゴシャが古巣仁川へ移籍した。
大迫、山口、武藤、酒井ら元日本代表の実力者がハードワークを厭わなかったことでチームは一丸となった。前線からの守備を志向する同じスタイルの相手との対戦では、元日本代表のメンタル、経験、技術の差で競り勝つことができた。MF齊藤未月が不運な大怪我を負った以外は怪我人が少なく、シーズン後半戦もチームは安定し、28節からの上位対決を全て制した。
大迫は11月12日に埼玉スタジアム2002で行われた第32節の浦和戦で、後半アディショナルタイムにゴールキーパーの西川周作がセットプレーで上がっていた隙を突き、前川からのロングボールを受けてそのまま流し込み、1997年に永島昭浩が記録して以来26年ぶりとなるシーズン22ゴール目を決め、チームのJ1最多得点記録に並んだ。その後、第33節の名古屋戦では井出遥也と武藤嘉紀がゴールを決め、2-1で勝利。創設29年目、Jリーグ参入27年目で悲願のJ1リーグ初優勝を果たし、2019年度の天皇杯に続く2つ目のタイトルを獲得した。参入20年目だった2012年の広島を上回る最も遅い初優勝となった。また前年13位からの優勝は、昇格1年目で優勝した柏とG大阪の例を除いては、2019年の横浜FM（前年12位）を上回る最大の躍進となった。シーズンオフに開催されたJリーグアウォーズでは、クラブ史上最多の4人（酒井、山口、武藤、大迫）がベストイレブンに選ばれ、大迫は神戸所属選手として初めての最優秀選手賞（MVP）受賞となり、個人3冠（得点王・ベストイレブン・MVP）を達成した。
吉田体制3年目。
前年シーズン途中加入したMFフアン・マタをはじめ、FW川﨑修平、MFバーリント・ヴェーチェイ、MF新井瑞希、DF高橋祥平、GK廣永遼太郎、GKフェリペ・メギオラーロが契約満了に伴い退団。6シーズン在籍したDF大﨑玲央がエミレーツ・クラブへ完全移籍し、GK坪井湧也（磐田）、DF尾崎優成（愛媛）、MF泉柊椰（大宮）、MF安達秀都（盛岡）、FW冨永虹七（讃岐）がそれぞれ他クラブへ期限付き移籍でクラブを離れた。
「1つのポジションに2人以上の選手が欲しい」と吉田が要望していた通りの大型補強が行われ、川崎からFW宮代大聖、セルティックからMF井手口陽介、長崎からMF鍬先祐弥、鹿島からDF広瀬陸斗、浦和からDF岩波拓也、千葉からGK新井章太と、他クラブの主力クラスを獲得。前年期限付き移籍で湘南から加入していたMF齊藤未月も完全移籍で獲得。そのほか新卒でGK髙山汐生、DF本間ジャスティン、MF山内翔が入団した。7月9日には讃岐に期限付き移籍していたFW冨永虹七が復帰。8月13日にはシャルルロワSC（ベルギー）からMF森岡亮太が2015年以来8年半ぶりに復帰した。
前年に続いて戦術は明確で大きな変更はなく、より手数をかけずにゴールに迫る事を志向した。勝てない時期もあったがシーズン中盤以降に順位を上げ、クラブ新記録となる6連勝も達成した。リーグ戦2試合を残して2位に勝ち点3差をつけ2連覇を射程圏内に捕らえた。
JリーグYBCルヴァンカップは5月22日の3回戦でカターレ富山に敗退したが、天皇杯は11月23日の決勝戦でガンバ大阪を1-0で下し、2019年度大会以来5大会ぶり2度目の優勝。
勝利すれば自力でのリーグ優勝が決まる最終節の湘南戦では宮代と武藤、扇原のゴールで3-0で勝利し、J1リーグと天皇杯優勝の2冠を達成し4つ目のタイトルを獲得。Jリーグ史上初のリーグ連覇と国内2冠の同時達成となった。
吉田体制4年目。
6シーズン在籍し、主将を務めていたMF山口蛍がJ2長崎へ電撃移籍したほか、DF初瀬亮が海外移籍し、DF菊池流帆が町田へ移籍した一方、「経営的な観点から黒字化する」と永井SDが語るように例年に比べ選手補強はJ1に昇格した岡山から神戸ユース出身DF本山遥ほかG大阪を退団していたDF松田陸新卒含む6名となった。シーズン開幕後に町田からFWエリキ、CDサンタ・クララからMFグスタボ・クリスマンをそれぞれ期限付き移籍で獲得した。
前年の9月に始まったACLエリート2024/25は8試合を戦って5勝1分2敗で3位で終えたが、山東泰山が最終節に棄権した事で、山東泰山戦の勝利が無効となり5位に転落。ベスト16で4位の光州FCと対戦し、3月5日に御崎公園競技場での第1戦を2-0で勝利した一方、3月12日の光州ワールドカップ競技場で2失点してしまい延長戦に持ち込まれると、延長後半12分にヤシル・アサニにペナルティーエリア外から左足を一閃され万事休す。ホームでの2点リードを守れずに逆転でベスト16敗退となってしまった。
6月の特別登録期間で横浜FMから永戸勝也、夏の移籍では秋田から小松蓮、グールニク・ザブジェから宮原勇太、登録期間終了後にACLエリート2025/26限定の登録として権田修一を獲得。
JリーグYBCルヴァンカップはACLエリート出場のためベスト8横浜FC戦からの参加となり、控えで挑んだ1st Legアウェイで2-0で敗れ、主力を投入した2nd Legホームはトゥーレルの退場で1人少なくなり大迫のゴールで1-0で勝利するも2戦合計2-1で敗退。
シーズン開幕前から主力選手の負傷離脱者が後を絶たず、ACLエリート2024/25との過密日程も相まってリーグ戦でもターンオーバーを敷くなど選手層の薄さに苦しみ、エリキを獲得した第6節湘南戦でリーグ初勝利を挙げるなど開幕スタートダッシュを決められず。徐々に主力選手が復帰し復調を見せ、優勝争いに参加するも、10月に入ったシーズン終盤戦で未勝利が続き、第36節G大阪戦に引き分けた事で残り2試合で首位鹿島との勝ち点差7を逆転する事が不可能となり、2007～09鹿島以来のリーグ3連覇の夢は途絶えた。
天皇杯は2回戦高知に4-1と危なげなく勝利するが、3回戦甲府、4回戦東洋大、準々決勝相模原と3試合連続で90分で決着付かず延長・PK戦で勝ち進むなど控え選手のクオリティに苦しむ。当日ノエビアスタジアムが使用不可のためパナソニックスタジアム吹田で行われた準決勝広島戦はフルメンバーで戦い2-0の勝利で2年連続の決勝進出。
連覇を懸けた決勝町田戦は前半からミスが目立ち2失点、後半にも1失点し宮代のゴールで1点返すも反撃とはならず3-1で敗戦。準優勝となり、2025年内に獲得可能なタイトルは全て取る事が出来ず無冠となった。
11月30日のFC東京戦後のホーム最終戦セレモニーにて、吉田孝行監督の今シーズン限りでの退任が発表された。