ファラオ 王権
タアウセレトの後即位したのはセトナクトという人物であった。この人物の出自については不明であるが、大ハリス・パピルスによると、第19王朝末期から第20王朝にかけては王位継承問題が紛糾し、公に認められない王 イリウスウが即位したが、神々に選ばれた者セトナクトがイリウスウを追放し、真の王としてエジプトを治めるようになったとのことである。セトナクトの治世はわずかに2–3年だっため、周囲より推戴されて王になったときにはすでに老齢であった可能性もあるとされているが、セトナクト王の即位はスムーズに行われた。
セトナクトの後を継いだのは、ラメセス3世であった。王はカルナックを始め国内各地に神殿を増築・建設したり、王家の谷に自身の王墓、王妃の谷に数人の王子の墓を築くなどの公共事業を行ったことによって国民生活に豊かさをもたらした。
ラメセス3世は、治世5, 11年にリビア人と、治世8年に海の民と戦った。治世5年にはリビア人が王朝が交代し王権が弱体化したのを見て、治世8年には、海・陸同時に海の民が攻めてきたが、どちらも打ち破ることに成功した。
このようにラメセス3世はいずれの戦いにも勝利したが、そもそもこの戦いはエジプト側の防衛戦であり、パレスチナ方面には一部海の民を定住させてしまうなど、実は辛うじて守り抜いたといった状況であった可能性がある。松本 (1998)は、この時エジプトはすでに第18王朝のような大国ではなくなってしまっていたため、侵攻されてしまったという考え方を示している。しかし、エジプトはこの3度の戦争の後、一時平和な時代を迎えた。
しかしこのような平和な時代も、ラメセス3世の治世の晩年になると終わりを告げる。内政の綻びの発生、すなわち王権が低下したことの好例として、「人類史上最初のストライキ」が挙げられる。この原因は王墓の造営に従事する職人たちへの給与の遅延である。この事態になった原因は、国庫の収入が不足したことではなく、官僚の腐敗によるものだとされる。通常宰相は上下エジプトにそれぞれ一人置かれるが、この時は宰相タアがどちらも兼ねていたのである。老齢となったラメセス3世は体力の衰えにより政治面に気を配ることができず、役人の中で汚職が頻発したとされる。
ラメセス3世治世末期は、官僚だけでなく王宮まで統率できなくなっていた。ラメセス3世妃の一人ティイは自身の息子を次王に就けようとし、王の暗殺を計画。王は首の付け根を鋭利な刃物で傷つけられ即死し、その30年余りの治世に終止符が打たれた。ラメセス3世の死をもって新王国の栄光あった時代は終わり、国は急速に衰えてゆく。ラメセス4世以降、ラメセス11世までの80年間で、ラメセスの名を持つ王が8人も即位した。そのうち、9世と11世を除けばいずれも在位は10年未満であり、国内は官僚の不正・飢饉・物価高騰・リビア人の襲撃などで大いに混乱していた。政府の信用は失墜し、国民は自分の利益のみを追求するようになった。このころになると、本来では厳重に警備されているはずの王家の墓を標的とした墓泥棒が頻発した。墓泥棒は警備員を買収し、盗掘を行ったのである。このような墓泥棒すら王権は抑えられなくなっていた。ラメセス9世治世17年には、たった40年前ほどのラメセス3世妃の墓すら荒らされた。
しかしながら、社会情勢が混乱しているにも拘わらずラメセス9世はデルタ地帯（ペル・ラメセス）にあって平和に暮らしていたのではないかと考えられている。王自身は下エジプトに建築物を残しているが、実際の権力はテーベのアメン大司祭が握っていたとされる。これにより、右の図のように、アメン大司祭が王と同じ大きさで描かれることも黙認されるようになった。ラメセス11世の死去とともに、イアフメス1世より480年余り続いたエジプト新王国時代は終焉を迎えた。
ラメセス11世の治世19年、アメン大司祭ヘリホルはテーベを自身が実効支配できていると確信。ヘリホルは、ラメセス11世の兄妹ネジェメトを妻に迎え、王家とのかかわりも持っていた。彼は王権の形骸化にかこつけ、ラメセス11世を無視して新たな年号「ウェヘム・メスウト」を制定。さらに、テーベの再建にも取り組み、先の時代に盗掘された墓のミイラを集めてセティ1世墓に改めて葬りなおし、盗掘者も逮捕し厳しい刑を科した。
また、王と同等の権限を持ったヘリホルは、儀式で用いるためのレバノンスギを調達してくるようウェンアメンという者に命じた。ウェンアメンは幾多の困難を乗り越え、何とか目的を果たすことができたようだが、その道中では外国人に対等に接してもらうことができなかった。このことより、エジプトの国力、すなわち王権の低下が対外的にも現れており、この後のエジプトへの外国人による侵入の兆候を見ることができる。
ヘリホルはウェヘム・メスウト7年までには亡くなるが、上エジプトはアメン大司祭が治めるという仕組みを作り上げた。テーベ王朝・アメン大司祭国家の成立である。
一方北では、軍司令官で下エジプトの宰相であったスメンデス1世が都をペル・ラメセスから自身の任地、サイスに移し政治を行った。これを、第21王朝と呼ぶ。このころは第3中間期、すなわち「混乱期」との分類がされているが、実際にはスメンデス1世は、前述のウェンアメンの航海の時にも援助をしているなどアメン大司祭国家と良好な関係を持った。またスメンデス1世が、カルナック神殿の一部が水浸しになったとき、3000人の労働者を派遣している記録も残されている。
これらの政治的つながりに加え、両政府は婚姻でも関係を結んだ。スメンデス1世の死後はヘリホルの息子、アメンエムニスウが継ぎ、アメン大司祭職はパネジェム1世が得る。しかし、このパネジェム1世の息子が次の第21王朝ファラオ、プスセンネス1世である説もあるほど、密な婚姻関係が結ばれていた。
第21王朝のプスセンネス2世の後は、リビア人傭兵のシェションク1世が継いだ。ここで、彼は革新的な政治的行動をする。息子イウプトをアメン大司祭につけ、アメン神殿の仕組みを通してエジプト全土を一人の支配下に置こうと画策した。さらに、イウプトは「軍の最高司令官」の称号を併せ持ち、軍をも統率した。加えて、アメン第3司祭・第4司祭、ヘラクレオポリス軍司令官にも血族を任命するなど、確固たる政治的基盤を築いた。これは第18王朝などの王がしたような、王自身が専制的な君主として絶大な権力を持った方法と対照的であり、シェションク1世はアメン神殿や軍の力を借りて王権を維持した。
シェションク1世には旧約聖書 歴代誌 12:2, 12:9や列王記 14:25-26に王シシャクとして記録されてあるようにエルサレムに攻め上り、数々の宝物と至宝「ソロモン王の金の盾」を奪い取るほど余裕があったのではないかと考えられている。
以降はシェションク1世の息子オソルコン1世に王位が継承されるが、その中でもアメン大司祭は重要な職であり続けた。例えば、オソルコン2世に対してテーベのアメン大司祭ホルスィエセも王権を主張し、カルトゥーシュを使用するなどの事件もあった。
その後、シェションク3世の治世8年、リビア人パディバステト1世がデルタ地帯中部、レオントポリスに都をおき、王権を主張。第23王朝を興す。それに加え、第24王朝　(記録されている王は2王だけである)も並立し、後の第25王朝と合わせて、エジプト本土に第22・23・24・25王朝が並立する時期が12年間存在するなど政治的に不安定な時代であり、史実はつまびらかではない。
この状況を打開するのは、ヌビア人クシュ王国の王、ピアンキであった。このころのヌビア人はアメン＝ラー神を崇拝しており、外国人でありながらエジプトの文化・宗教を否定しなかったため、ごく短期間でテーベの政治・軍事・宗教の実権を握ることに成功した。加えて、ピアンキは妹のアメンイルディス1世を在任中のアメンの聖妻の養女にし、大司祭オソルコン3世に代わりアメン神殿の最高権力を手中に収めた。この後のシャバカ王、シャバタカ王、タハルカ王も第22王朝のシェションク1世と同じように、アメンの聖妻を通して権力を確立させた。
しかし、第25王朝はタハルカの甥、タネトアメンの治世に崩壊を迎える。タハルカの治世20年、すでに数回エジプトに侵攻を繰り返していたアッシリアがとうとう主要都市メンフィスをも奪い、タハルカは南に退かざるを得なかった。アッシリアは第24王朝の末裔ネコ1世を擁立し、デルタ地帯を治めさせたのである。タハルカの後を継ぎ即位したタネトアメンはすぐさまデルタ地帯に侵攻、ネコ1世を討ってメンフィスまで奪回する。しかしながら、前664年にはアッシュルバニパルの攻撃でテーベまで落ち、タネトアメンは出身国であるクシュに引き下がるのであった。
アッシュルバニパルは自国が危うくなったため、ネコ1世の後継者、プサメティク1世にエジプトの管理を任せて撤退する。ここより第26王朝に区分される。しかし、プサメティク1世はアッシリアからの独立を図る。王は、娘を在任中のアメンの聖妻の養女にし、上エジプトの実権を握っていたテーベ市長に娘を嫁がせるなどして、やはり政治面より王権を確実にした。
次代ネコ2世の時代になると、エジプトは一時国力を盛り返す。前609年にはシリア・アッシリアに遠征し、旧約聖書列王記下 23:29 にあるようにメギドの戦いにおいてヨシア王を殺し、ユダ王国を支配し朝貢を課している。しかし、前605年にはバビロニアのネブカドネザル2世がエジプトに臣従していたユダ王国を攻略し、エジプト軍も打ち破ってしまう。これによりエジプトのシリア・パレスティナ地方の支配はたったの4年で終わってしまった。ネブカドネザルはこれに乗じてエジプトを攻めようとしたが、エジプト側は辛くも防衛した。
これを継いだプサメティク2世も娘をアメンの聖妻の養女にするなど、アメン神殿との関係を強化することを怠らなかった。次のウアフイブラー（アプリエス）王は将軍イアフメス2世（アマシス）にクーデターを起こされ、幽閉後処刑された。あとを継いだプサメティク3世も攻め込んできたアケメネス朝ペルシアのカンビュセス2世を防衛することができずエジプトを征服され、これまた処刑されて第26王朝は終わることとなる。
第27王朝はペルシア支配の時代であり、エジプト人はこれに大いに反発した。この原因として、今までのヌビア人などの外国人支配者たちはすべて「エジプト化」したのに対して、ペルシアはアラム語を広め、エジプト文化を尊重しなかったので国民の自尊心・愛国心を傷つけた。そのため、120年余りの支配で反乱が多発している。
前404年、ダレイオス2世が死去するとそれに乗じてエジプト人アミュルタイオスが王を名乗る（第28王朝）が、数年のうちにメンデス・第29王朝のネフェリテス1世に処刑されてしまう。王は王位を正当化するために架空の祖先・家系を作り出し、記録したのであった。
しかし第29王朝も、前380年に将軍ネクタネボ1世がクーデターを起こしたため、20年未満で倒れる。ネクタネボ1世は、同じくクーデターを起こし政権を奪取した中王国のアメンエムハト1世とは違い、むしろ武力によるクーデターを誇った。この背景には、外国人侵攻の危機にさらされていたエジプトでは、すでに武力を持つ者を王として認めざるを得ない状況であったと考えられている。加えて、ネクタネボ1世はエジプト風の即位名“ケペルカラー”を名乗り、エジプト国内で建築事業を盛んに行い、人々に経済的安定をもたらした。彼は、伝統的な信仰を盛んにし、国民の愛国心に訴える方法で支持を得たのである。
しかしながら1代後のネクタネボ2世の時代、前343年に再びペルシアのアルタクセルクセス3世に支配されてしまい、エジプトで2500年以上続いた王朝時代は終焉を迎えたのであった。第30王朝以降、エジプトは将校団を率いたナセルが1952年に解放するまで、実に2300年もの間、外国人に支配されることとなる。この2度目のペルシア支配（第31王朝とも）は短く、アルゲアス朝のアレクサンドロス大王が征服し、大王の将軍の一人プトレマイオス1世が即位。プトレマイオス朝が300年ほど統治し、クレオパトラ7世の崩御に伴い、エジプトはローマの属州アエギュプトゥスとして編入されるのであった。