翔鶴 (空母) 歴史
南雲機動部隊が攻撃を受けていたころ、日本軍攻撃隊もアメリカ軍機動部隊を空襲し 第二航空戦隊（空母隼鷹）や第二艦隊と共同で空母ホーネットと駆逐艦1隻撃沈、エンタープライズ大破という戦果をあげている。その一方、村田少佐を含む艦攻10機、関少佐を含む艦爆22機、零戦12機、搭乗員計54名を失った。随伴駆逐艦も不時着機搭乗員救助にあたった。午後5時、南雲司令部は駆逐艦「嵐」（第4駆逐隊司令有賀幸作大佐）に移乗して翔鶴から離れた。なお、有馬（翔鶴艦長）は徹底追撃と戦果拡大の必要を痛感しており、翔鶴で逃走するアメリカ軍機動部隊を追撃することを主張した。自艦を被害担当艦（囮）にして、他艦の攻撃を支援をしようという有馬の特攻精神だったという。だが草鹿龍之介機動部隊参謀長に「飛行甲板の大破した空母で戦えるのか」と退けられている。
艦上戦死者144名、航空隊戦死者54名を出して大破した翔鶴は、駆逐艦「舞風」と「初風」に護衛されて避退した。10月28日、トラックに帰港した。有馬（翔鶴艦長）と大林末雄大佐（瑞鳳艦長）は戦艦「大和」の連合艦隊司令部を訪ね、戦闘状況を報告した。このあと、山本長官と宇垣参謀長は翔鶴を自ら視察した。後日（翌年3月28日）、有馬は海兵43期の同期生で友人の高木惣吉（当時、海軍省教育局長）に心情を打ち明け、南太平洋海戦時の状況について「山本長官は間もなく戦死された。それなら思い切って遠慮せず本心を吐露すればよかった。残念でたまらない」と語ったという。
10月29日、昭和天皇は南太平洋海戦における連合艦隊の戦果を称える勅語を贈る。
この後、南太平洋海戦で損傷した空母2隻（翔鶴、瑞鳳）、重巡2隻（熊野、筑摩）は駆逐艦8隻に護衛されて内地へ帰投、11月6-7日にそれぞれの母港へ到着した。
横須賀に到着後は同地で修理を行うが、この間、東条英機首相が視察に訪れている。日本海軍は、真珠湾攻撃・珊瑚海海戦・南太平洋海戦における2隻（翔鶴、瑞鶴）の奮戦に対し3回の感状を授与した。また二度の大海戦における2隻（翔鶴、瑞鶴）の被害の差から、瑞鶴は幸運艦と呼ばれた。瑞鶴乗組員達は翔鶴について、「実に運の悪い艦だ」と噂していたという。一方、福地周夫（翔鶴運用長）は「海軍軍人の立場からいうと、（瑞鶴は）逃げ隠れていて戦うことができずに、かえって不運だったと思っている。翔鶴の方が武運に恵まれて幸運だった」・「敵が攻めて来ているのに隠れていて、しかも、僚艦が攻撃されているのに知らん顔をして戦わなかった『瑞鶴』を、単に運がよかったとばかりは思わない」と著している。珊瑚海海戦の時も、「瑞鶴は隠れていて無事で、まことに幸運でした」と報告したら山本長官は喜んだだろうか……と指摘している。
南太平洋海戦後の11月11日、第三艦隊司令長官は南雲中将から小沢治三郎中将に交代する。
内地での練成により、消耗した翔鶴航空隊も定数を満たした。
1943年（昭和18年）2月16日、有馬（翔鶴艦長）は海軍航空本部教育部長へ転任した。後任の翔鶴艦長は、2月12日まで空母隼鷹艦長を務めていた岡田為次大佐となった。
3月20日、翔鶴は空母龍鳳（12月中旬、被雷。修理完了）および駆逐艦4隻（浜風、漣、響、波風）と共に内海西部へ回航される。3月25日、前年の珊瑚海海戦における南洋部隊機動部隊の戦果に感状が贈られた。
6月30日、アメリカ軍がレンドバ島に来攻。機動部隊はトラック進出となった。これは兵力増強によりレンドバ島奪還を図ろうというものであったが、戦況から結局奪還作戦は実施に至らなかった。「翔鶴」、「瑞鶴」、重巡洋艦「利根」、「筑摩」、「最上」などは7月10日に内海西部を出発し、7月15日にトラックに着いた。この際、「翔鶴」はミレ増強部隊約600名を運んだ。
11月11日、「翔鶴」、「愛宕」、「高雄」は駆逐艦島風と玉波に護衛されてトラックを出発、15日に横須賀へ到着して修理整備を実施した。
11月17日、松原博大佐が、翔鶴艦長に任命された。
11月26日、3隻（翔鶴、島風、玉波）はトラックへ向け出撃する。空母千歳と駆逐艦2隻（秋月、谷風）と合流後、翔鶴隊は12月1日トラック泊地へ到着した。
12月6日、第三艦隊司令部は、臨時に旗艦を軽巡洋艦大淀に変更した。

12月10日、翔鶴をふくめトラック泊地在泊の大型艦に対し本土回航命令が出される。

6隻（空母〈翔鶴〉、戦艦〈大和〉、駆逐艦〈山雲、秋雲、風雲、谷風〉）は12月12日にトラックを出発、翔鶴は17日横須賀に帰着した。
1944年（昭和19年）1月17日、3隻（翔鶴、秋雲、風雲）は横須賀を出発して内海西部へ移動した。2月6日、空母2隻（翔鶴、瑞鶴）は巡洋艦2隻（筑摩、矢矧）と駆逐艦5隻と共に内地を出発する。シンガポール（昭南）着後、リンガ泊地へ進出した。その後、第十戦隊所属の艦艇と共に訓練に従事した。
日本の敗色が濃くなった1944年（昭和19年）3月1日、日本海軍は第一機動艦隊（司令長官小沢治三郎中将、参謀長古村啓蔵少将）を編成し、小沢中将は翔鶴を旗艦としたこれにともない瑞鳳は第三航空戦隊に編入（千歳、千代田、瑞鳳）、第一航空戦隊は空母2隻（翔鶴、瑞鶴）となる。
3月10日、飛行甲板に装甲を施した新鋭空母の大鳳が第一航空戦隊に編入された。4月15日、小沢中将は大鳳に移動し将旗を掲げた。アメリカ軍潜水艦の行動により日本艦隊の駆逐艦は次々に撃沈され、またビアク島の戦いを巡る渾作戦でも消耗を重ねた。
6月、アメリカ軍のサイパン島襲来に伴い日米両軍の間でマリアナ沖海戦が生起する。翔鶴の航空戦力は零式艦上戦闘機34、天山艦上攻撃機12（3機は偵察機）、彗星艦上爆撃機18、二式艦上偵察機10、九九式艦上爆撃機3、計77機だったという。小沢機動部隊（直率隊）が抱える問題の一つに、大型空母3隻（大鳳、翔鶴、瑞鶴）と巡洋艦3隻（第五戦隊〈羽黒、妙高〉、第十戦隊〈矢矧〉）に対し、護衛駆逐艦の数が少なすぎることだった。わずか7隻（第10駆逐隊〈朝雲〉、第17駆逐隊《磯風、浦風〉、第61駆逐隊〈初月、秋月、若月〉、秋月型〈霜月〉）である。
6月19日11時20分、航空機の発進中にアメリカ潜水艦カヴァラが発射した魚雷6本のうち、3乃至4本が翔鶴の右舷に命中した（左舷後部に命中との証言あり）。カヴァラは給油部隊を発見して追跡を開始、17日夕刻に小沢機動部隊を発見して位置情報を報告。アルバコアなどの僚艦を呼び寄せると同時に、攻撃の機会をうかがっていたのである。カヴァラ側によれば日本側は全く気付いておらず、潜望鏡露出4回、距離1000mまで接近して発射したという。
翔鶴は複数の魚雷命中によって3軸運転となり、電力が失われ速力も低下した。石塚(矢矧水雷長)によれば、翔鶴は被雷後も速度を落とさず航行しており、そのうち隔壁の破れる音と共に煙突から蒸気が噴出、矢矧座乗中の第十戦隊司令官木村進少将が「翔鶴は止まらなくては駄目だ」と叫ぶ一幕もあったという。翔鶴艦内では左舷への注水作業により傾斜の復旧作業が実施されたが、注水のしすぎによって逆に左舷に傾斜してしまった。また前部に命中した魚雷によって艦首が著しく沈下した。また、エレベーターも故障して途中で止まっていた。その後、魚雷被弾時に気化した航空燃料が艦内に充満、それに引火して大爆発と大火災が発生。14時1分乃至14時10分に沈没した。沈没地点は、日本側によれば北緯12度0分 東経137度46分﻿ / ﻿北緯12.000度 東経137.767度﻿ / 12.000; 137.767、アメリカ側によれば北緯11度50分 東経137度57分﻿ / ﻿北緯11.833度 東経137.950度﻿ / 11.833; 137.950となっている。沈没時、乗組員は飛行甲板後部に集まっていたが、急激に前のめりになって沈下をはじめたため滑り台のようになり、飛行甲板に空いたエレベーターの穴に多数の乗組員が落ちてしまった。1,272名の乗組員が戦死、翔鶴艦長の松原大佐を含む脱出者は護衛艦（矢矧、浦風、秋月）等に救助されている。翔鶴の艦歴は2年10か月であった。
翔鶴の沈没から間もなく、小沢機動部隊の旗艦大鳳もアメリカ潜水艦アルバコアから受けた雷撃が原因で大爆発を起こして沈没した。
また6月20日の空襲で小沢機動部隊は空母飛鷹とタンカー2隻を喪失、他艦（瑞鶴、隼鷹、千歳、千代田、榛名、摩耶）等も損傷した。空母3隻（翔鶴、大鳳、飛鷹）の喪失により、日本の空母戦力は機動部隊として艦隊運用できる隻数・搭載機・乗員の確保が困難となり、事実上、空母機動部隊として作戦運用できる能力を失った。翔鶴生存者は救助艦から姉妹艦瑞鶴と重巡摩耶等に移乗し、日本本土へ向かった。
1945年（昭和20年）8月31日、戦艦4隻（山城、武藏、扶桑、大和）、空母4隻（翔鶴、信濃、瑞鶴、大鳳）は帝国軍艦籍から除籍された。