コミックマーケット 歴史
同人誌の印刷業務を一手に引き受け、市場規模の拡大と共に急成長してきた印刷業者は、相次ぐコミケの開催中止や延期に伴う受注減少で打撃を受け、中には従業員の勤務日数縮小や来年度の新卒採用を見送ったり、会社自体の廃業や倒産などの影響が発生した。
その一方で、2020年9月17日には「マンガファンを愛するコミックマーケットに感謝と更なる発展を祈って」として、第49回日本漫画家協会賞特別賞がコミックマーケット準備会に贈られている。
2021年3月8日、3月7日までの予定だった1都3県に出された緊急事態宣言が3月21日までの2週間の延長になった影響により、イベントにおいて10,000人を収容人数の上限とする経過措置期間が2021年GWまで延長される可能性を考慮してC99（旧C99）の開催を延期し、2021年冬のC99（新C99）開催を目指すことを正式に決定した。
延期発表後、4月12日に東京都に蔓延防止等重点措置が発動されたのち、4月23日に緊急事態宣言が発令・同月25日に施行された結果、東京都からの通告で東京ビッグサイトの使用が禁じられた。
2021年8月2日、2019年冬以来2年ぶりとなるコミックマーケット99（新C99）を同年12月30日から31日までの2日間で開催することを発表した。翌C100以降も2日間開催となる。コミックマーケットの2日間開催は、2005年冬のC69以来16年ぶりのことである。なお、新型コロナウイルスの感染状況の経過次第では再延期の可能性も示唆していた。
強制的ではしないとしながらもワクチンの接種を奨励し、11月12日に来場者予定を55,000人とするのに合わせて『ワクチン・検査パッケージ』の導入と技術実証に参加することを表明した。これにより、C99の入場には2回接種してから14日を経過したことを示す『ワクチン接種証明』（予防接種済証、ワクチン接種証明書、接種記録書及びTOKYOワクションアプリのいずれか）又は『PCR検査結果での陰性証明』が必要条件となった。
C99の冊子版カタログについては印刷しなかったことから、冊子版カタログで初めて欠番が発生した。また、フリー入場の廃止およびアーリーチケットの導入、東西間のホール移動制限、無銭参加するコスプレカメラマンが後を絶たなかったことによる防災公園の使用取りやめおよび「有明防災フェア」の同時開催取りやめなど、新たな感染症対策を講じた。11月10日には、Cygamesから『ウマ娘 プリティーダービー』の性的描写および暴力的描写に関する二次創作の禁止が発表された。この影響は多岐に渡り、多くの印刷会社がウマ娘の成人向けの製本や、書店での委託を禁止する方針を固め、多くのサークルがウマ娘の成人向け作品の頒布を自粛するほど影響が大きかった。
そして同年12月30日・31日、ついにコミックマーケット99（新C99）が開催された。当初、不安視されていた徹夜組や、国際展示場駅における始発ダッシュが確認できなかったことから、フリー入場の廃止およびアーリーチケットの導入による一定の成果を挙げることができた。その一方で、感染症対策を理由に参加を辞退したサークルも少なくなかった。
C99では、会場への新たなアクセス手段として、ジェイアールバス関東が東京駅 - 国際展示場駅 - 東京ビッグサイト - 東京港フェリーターミナル間の路線バスの運行を開始した。C99期間中は多くの利用があり、東京駅や東京ビッグサイトには乗り場に係員が配置され、混雑状況により臨時便の運行もされた。また、江ノ島電鉄300形の夜間試運転の際に騒がせた、江ノ電自転車ニキことHome taco barの店主がサークルとして参加し、話題を集めた。2020年秋季にテレビアニメが放送され、なおかつ東京ビッグサイトが虹ヶ咲学園として登場した関係上、『ラブライブ!虹ヶ咲学園スクールアイドル同好会』のコスプレをしたコスプレイヤーが激増した。
2022年夏開催のC100では記念ロゴが作られ、準備会は「C100で頒布するものに限り、C100記念ロゴを使用しても良い」という特例が設けられた。TYPE-MOONの竹箒がC74以来の出展、C95のカタログ表紙を描いたワダアルコもサークル参加、「3月のライオン」等で知られる羽海野チカが1999年のC57以来の出展、羽海野チカのサークルにはマフィア梶田が売り子として参加し、大熱狂に包まれた。また、2022年1月17日よりゆうちょ銀行ATMの利用手数料が設定されたことを受けて、準備会から「東京ビッグサイトにあるゆうちょ銀行のATMで金を引き出す際、曜日と時間によっては手数料を取られます」と改めて注意喚起が出された。
2022年冬開催のC101では参加可能人数を拡大、2022年のトレンドとなったテレビアニメ『ぼっち・ざ・ろっく！』の作者であるはまじあきが参加したことにより、列が非常に長くなったことを確認し、はまじが準備会にスペースの位置を移動するよう要望を出したほどであった。『仮面ライダー龍騎』で秋山蓮 / 仮面ライダーナイトを演じた松田悟志がサークル参加し、コスプレ広場にも顔を見せ、仮面ライダー王蛇のコスプレをしたコスプレイヤーとの共演が実現する。その後、『仮面ライダーギーツ』のコスプレをしたコスプレイヤーも加わった。また、同年インターネット・ミームになった『車道で叫ぶ米津玄師を叫びながら撥ねる宮本浩次』というマニアックなコスプレも登場。この撥ねられる米津玄師のコスプレや、チェンソーマンのキャラクターとともに小走りで行進する米津玄師のコスプレが香港のメディアでも取り上げられるなど話題になった。『ブルーアーカイブ』の統括プロデューサーであるキム・ヨンハが来日し、Yostarブースとブルーアーカイブの同人誌を扱うサークルを視察した。これがきっかけでC102でブルアカを扱うサークルが急増し、C103でジャンルコードが独立した。
2023年夏開催のC102では、コロナウイルスが5類に移行したことにより、入場制限を撤廃した。この年の4月1日に国際展示場駅まで延伸した東京BRTは、新橋駅と国際展示場駅の間を約17分で結び、運賃も220円とゆりかもめより安く、より多くの人を運べる連節バスも運行しており、多数の利用客を集めたことで臨時便も出したが、新橋行きの途中バス停で乗れない事態が多発、C103以降で途中停留所に停車しない直通特急が設定される契機となった。
2024年夏開催のC104では、テレビアニメ『ガールズバンドクライ』のキャラクターデザインを務めた手島nariがサークルとして出展し、完売した時は拍手が起こった。漫画『2.5次元の誘惑』がちょうどテレビアニメが放送中だったため、ヒロインである天乃リリサが扮するキャラクターであるリリエルのコスプレが多数見受けられたほか、東京ビッグサイト駅と国際展示場駅でゲーム「天使たちのステージ」の大規模プロモーションを実施した。
2024年11月16日より放送開始の大塚製薬「ボディメンテ」のテレビCMでは、同年冬開催のC105に向けて奮闘する同人作家と、準備会スタッフとして参加しながらSNSで作家を応援するファンを描いた内容になっており、それぞれを門脇麦と富田望生が演じ、一部の場面では東京ビッグサイトでも撮影を実施、BGMには『サクラ大戦』主題歌「檄!帝国華撃団」のインストゥルメンタルアレンジが用いられている。大塚製薬はコミケへのドリンク提供で10年来の付き合いがある事から準備会もCM制作に協力している。
2025年夏開催予定のC106については、大阪で開催予定のGOOD COMIC CITY 31 大阪との一部日程重複になることが、コミックマーケット準備会と赤ブーブー通信社の共同リリースで発表された。これはコミケの会場である東京ビッグサイトが2023年12月から2028年2月中旬（予定）までの期間に大規模改修工事を実施、この影響で2025年度は西展示棟と東1〜3ホールが休館する時期が発生、これに伴うイベント開催スケジュールがタイトになっている関係で準備会が希望する日程が確保できなかった事に加え、コミックシティ側も大阪開催と東京開催の重複を避ける日程をとったものの、コミケと日程が重複する事になり、さらに大阪開催の会場であるインテックス大阪も2025年日本国際博覧会（大阪・関西万博）の開催に伴い、同所で関連して行われる他の催事が多数ある事から再調整が出来なかった事による。なお両者では今回に関しては何らかの連携を行う事を検討するとしている。
1990年代に入ると技術革新により各種同人作品の制作が容易となったことなどから、コミックマーケット参加者は急激に増加した。東京秋葉原・大阪日本橋を中心として日本全国に同人誌専門店などが増えインターネットなどを通じてより手軽に同人誌が入手できるようになっている（中には、コミックマーケット開催前に同人誌専門店で販売されるケースもある）。また、取扱ジャンルの細分化が進んだ状況としても日本全国の同人作品の制作者とファンが一堂に会する同人イベント最大の場として存続している。中にはこのイベントでしか扱っていないマイナージャンルもある（例：漫画研究会のサークル）。また、「モノづくり」をテーマともしているジャンルも存在しており、京都大学機械研究会OBのサークルが紹介されている。
近年、コミケを題材に制作されたドラマや秋葉原、池袋周辺などが注目された関連で社会的に広く認知されるイベントになった。開催日の前後にはコミックマーケットがテレビのニュースや個人のSNSでとりあげられることも多い。その一方、予備知識を持たない興味本心だけの参加者の増加もしている。そういった参加者向けに運営側は注意事項等を公式サイトで公開している。
その一方で参加者の驚異的とも言える増大によるイベント巨大化、企業との関係、さらには法令による「有害図書」規制やコスプレ、二次創作、パロディ表現にまつわる表現（とりわけ性的表現）との関係、イベントにおける多大な頒布・売買行為の税務上処理などいくつかの課題も内包している。そのため、1996年以降は一部の「コミックマーケットSP」以外は別会場の例外はあるが、主に東京国際展示場（東京ビッグサイト）であることが多い所からも会場管理の東京都や警視庁（管轄：深川警察署・2008年以降は東京湾岸警察署）との調整も行っている。コミックマーケットは以前の漫画マニア向けイベントから一般化が進み、参加者数は3日開催で55万人、4日開催で75万人（C97）を超え、開催日数にあわせてサークル参加者も増大した大イベントとなっており、施設の効率的な運用方法や行政からの指導などの対策すべき問題も多く存在している。
しかし前述のとおり、新型コロナウイルス感染拡大に伴う事象の変化と、徹夜組・始発ダッシュ組を排除する対策の方針により、C99以降はホールの拡大により会期が2日間に短縮され、一般参加者にも入場料が求められるようになり、入場券は事前抽選制へ移行し当日券の発売もなくなった。このため来場者数そのものが急減しC99の来場者数は2日間で11万人になった。一般参加の制限が無くなったC102（この回より当日券の販売を再開）では例年にない猛暑のため般参加者が減少した。このためC102の来場者数は26万人と最盛期であったC97の75万人の1/3まで減少した。2023年12月に開催されたC103の来場者数はやや増加し27万人であった。