信濃国 歴史
武田晴信の死後、その後を継いだ武田勝頼が上杉景勝と同盟を結び、信濃を統一支配したが、天正10年（1582年）、織田信長に敗れて滅亡し、高遠城主仁科盛信らが戦死した。その後は織田家の版図に加えられ、森長可（北信）、滝川一益（東信）、毛利長秀（伊那）、河尻秀隆（諏訪）、木曾義昌（安曇、筑摩）らに与えられた。しかし約三ヵ月後には本能寺の変が起き、信濃においても一向一揆が発生したことで織田家の勢力は瓦解し、権力の空白地帯となった信濃には徳川氏・後北条氏・上杉氏の勢力が進出した（天正壬午の乱）。やがて後北条氏は徳川氏と和解・同盟して領地交換により関東へ撤退した。
この結果、北信濃四郡は上杉氏、それ以外は徳川氏の領国となったが、両者の対立の狭間で真田昌幸が自立し第一次上田合戦を生じた。この対立はのちに徳川家康と豊臣秀吉の対立に転じ、家康が秀吉と和睦し後に臣従することで、天正18年（1590年）に関東に移封されると、徳川方の国衆も随行し、譜代大名や旗本となった者も多かった。信濃は豊臣方の武将の支配下に収まり、仙石秀久（佐久）、石川数正（安曇、筑摩）、毛利秀頼（伊那）、日根野高吉（諏訪）が入封し、木曽は秀吉の蔵入地となった。さらに慶長3年（1598年）に北信濃四郡を治めた上杉景勝が越後から会津に移封されると、北信濃には関一政、田丸直昌が入封したが、秀吉の死後、家康は両者を美濃に移し、代わって配下の森忠政を入封させた。
真田氏はかつては徳川氏に仕えながら豊臣氏の配下に転じ、関ヶ原の戦いにおいて西軍方についたため、徳川秀忠の軍勢は、小山評定から関ヶ原に向けて中山道を進軍する途上、真田昌幸、信繁父子の居城上田城を攻めたが敗れた（第二次上田合戦）。しかし石田三成ら西軍首脳が本戦で敗れたため、昌幸は高野山に流罪となった。その後、東軍の真田信幸が上田から松代城に入った。西軍の真田信繁は豊臣方について後年の大坂の陣で武名を挙げた。
江戸時代は、途中廃絶も含めて松代藩等大小計19藩が置かれた（廃藩置県時点では松代藩の他、松本藩、上田藩、飯山藩、小諸藩、岩村田藩、龍岡藩（田野口藩）、高島藩、高遠藩、飯田藩、須坂藩）。また木曽地方は全域が尾張国名古屋藩領（山村代官所）であり、伊那郡内には美濃国高須藩（竹佐陣屋）及び陸奥国白河藩（市田陣屋）、高井郡内には越後国椎谷藩（六川陣屋）、佐久郡内には三河国奥殿藩（後に藩庁を信濃に移し田野口藩となる）の飛び地があった。その他善光寺、戸隠神社、諏訪大社等の寺社領、天領支配のための中野・中之条・御影・飯島・塩尻の5つの代官所、伊那衆三家を含む旗本知行所（維新まで存続したものは12ヶ所）などが置かれた。
正保元年（1644年）、幕府は正保国絵図の信濃分の作成を松代藩、上田藩、飯山藩、松本藩、飯田藩に命じた。この時代には貞享3年（1686年）の松本藩貞享騒動や宝暦11年（1761年）の上田藩宝暦騒動など大規模な農民一揆が発生した。また、主に北信濃の豪雪地の農村を中心に多くの出稼ぎ労働者を江戸に送り出し、彼らは「信濃者（しなのもの・しなのじゃ）」、「おシナ」あるいは暗喩で「椋鳥」と呼ばれ、「大飯喰らい」「でくのぼう」の象徴として江戸川柳や狂歌に多く詠まれることとなった。天明年間の浅間山大噴火や天明の大飢饉も農民の都市への逃散の一因を成した。文化13年（1816年）には天領代官所に信濃国悪党取締出役が設置され、天保年間からは天領代官が大名・旗本領に立ち入り、他国から流入する無宿者の取締りに従事する事例が増加した。弘化4年（1847年）には善光寺地震が発生し、死者8000-12000人と広範囲に大規模な被害が及んだ。その一方で五郎兵衛用水や拾ヶ堰などの灌漑用水の開削によって、新田開発が進み、信濃一国の石高は慶長3年（1598年）には約40万石であったものが、天保5年（1843年）には約75万石まで増加した。また寛文年間ころから農閑期の農民が担い手となり、中馬という新たな内陸交通手段が発達したが、宿場町の伝馬制を圧迫し、軋轢を生じたため、明和元年（1764年）に幕府は裁許状を発し、条件を付けて公認した。
幕末になると、東海地方から南信濃に平田国学が移入され、水戸学の影響も加わって、俄かに勤王・攘夷思想が盛んになった。嘉永6年（1853年）に黒船が来航し、幕府から松代藩は品川台場の警固、松本藩、飯田藩、田野口藩は浦賀の警固を命ぜられ、重い負担を強いられた。文久元年（1861年）の和宮の中山道下向では松代藩、上田藩、高遠藩が乗輿警衛を、その他諸藩が沿道守衛を命じられた。元治元年（1864年）には天狗党の乱が関東から京へ向けて信濃国内を通行したが、実際に交戦したのは高島藩、松本藩のみで、それ以外の藩は天狗党に畏怖し通行を黙認した。同年、開国派の松代藩士佐久間象山は京都で尊王攘夷派に暗殺された。慶応3年（1867年）には東海地方から「ええじゃないか」と御札降りの騒動が信濃国全体に波及し、庶民の間に世直しの機運が醸成された。
戊辰戦争では外様の松代藩・須坂藩はいち早く倒幕を表明、その他の譜代諸藩は、当初日和見の態度をとる藩が多く、積極的な佐幕論は見えない中、次第に官軍に恭順していった。慶応4年（1868年）官軍より信濃諸藩に赤報隊の捕縛命令が下り、下諏訪宿で相楽総三らが処刑された。4月下旬、越後から進出した衝鋒隊が飯山城下を占領すると、信濃諸藩は東山道先鋒総督府の岩村精一郎の軍監に入り、連合してこれを撃退し、そのまま北越戦争、会津戦争に転戦した。賞典禄は松代藩3万石、須坂藩5000石、松本藩3000石、上田藩3000石、金禄は奥殿藩5000両、高遠藩2000両等であった。明治維新に前後して、折柄の贋金の流通による経済の混乱も相まって信濃各地で木曽騒動、上田騒動、会田・麻績騒動、松代騒動などの世直し一揆が多発し、中でも最大規模の中野騒動では県庁舎が焼失し、県庁の長野移転の契機となった。
「旧高旧領取調帳」に記載されている明治初年時点での国内の支配は以下の通り（1,774村・786,062石余）。太字は当該郡内に藩庁が所在。国名のあるものは飛地領。
水内郡（225村・110,270石余） - 幕府領（中野代官所・松代藩預地）、松代藩、飯山藩、越後椎谷藩
高井郡（153村・86,336石余） - 幕府領（中野代官所・松代藩預地）、松代藩、須坂藩、越後椎谷藩
埴科郡（40村・25,162石余） - 幕府領（中之条代官所）、松代藩
更級郡（125村・59,050石余） - 幕府領（中之条代官所）、旗本領、松代藩、上田藩
小県郡（154村・76,998石余） - 幕府領（中之条代官所）、旗本領、上田藩、小諸藩、岩村田藩
佐久郡（210村・98,319石余） - 幕府領（御影代官所・中之条代官所）、旗本領、岩村田藩、小諸藩、田野口藩
筑摩郡（236村・84,451石） - 幕府領（塩尻代官所を経て松本藩預地）、松本藩、高遠藩、高島藩、尾張名古屋藩
安曇郡（179村・64,235石余） - 松本藩
諏訪郡（157村・43,779石余） - 高島藩
伊那郡（295村・137,459石余） - 幕府領（飯島代官所・松本藩預地・千村氏預地）、旗本領、高遠藩、飯田藩、陸奥白河藩、美濃高須藩
明治2年
2月30日（1869年4月11日） - 伊那郡を除く国内の幕府領の一部（中野・中之条・御影の各代官所）が伊那県の管轄となる。
このころ国内の旗本領および幕府領の一部（松本藩預地）が伊那県の管轄となる。
6月22日（1869年7月30日） - 任知藩事にともない田野口藩が改称して竜岡藩となる。
9月 - 伊那郡の幕府領（千村氏預地・知久氏預地）が伊那県の管轄となる。
明治4年
6月2日（1871年7月19日） - 竜岡藩が廃藩。佐久郡の領地は中野県の管轄となる。
7月14日（1871年8月29日） - 廃藩置県により藩領が高遠県、飯田県、高島県、松本県、松代県、上田県、飯山県、須坂県、小諸県、岩村田県および名古屋県、椎谷県の飛地となる。
9月 - 国内の名古屋県の管轄地域が伊那県の管轄となる。
7月25日（1871年9月9日） - 長野県成立。
11月20日（1871年12月31日） - 第1次府県統合により、埴科郡・高井郡・水内郡・佐久郡・更級郡・小県郡が長野県、筑摩郡・伊那郡・諏訪郡・安曇郡が筑摩県の管轄となる。
現代では、旧信濃国の領域は、ごくわずか（旧神坂村・旧山口村）が岐阜県中津川市に編入されているほかは、長野県の領域と一致している。広大な県域を持つ長野県では、地域間、特に長野市と松本市との対立の歴史がある。そのため、県を表す名称としては、長野市を由来とする「長野県」よりも、「信州」「信濃」の名称がニュートラルであるとして好まれる傾向にある（県歌「信濃の国」、信州大学など）。