الدراسات الوراثية على اليهود نسب الأب، كروموسوم Y
لاختبار هذه الفرضية ، اتصل الدكتور مايكل هامر من جامعة أريزونا، وهو باحث في علم الوراثة الجزيئية ورائد في مجال الأبحاث حول الكروموسومات. كان لمقالهم ، الذي نشر في مجلة Nature في عام 1997، بعض التأثير. تم تعريف مجموعة من العلامات الخاصة (تسمى كوهين مودال هابلوتايب أو CMH) على أنها واحدة من المرجح أن تكون موجودة في كوهانيم ، والتي تعرف باسم اليهود المعاصرين المسمى كوهين أو أحد المشتقات ، واقترح أن ينتج هذا عن أصل مشترك من النسب الكهنوتية القديمة من السكان اليهود بشكل عام.
لكن الدراسات اللاحقة  أظهرت أن عدد العلامات الوراثية المستخدمة وعدد العينات (من الأشخاص الذين يقولون كوهين) لم يكن كبيراً بالقدر الكافي. تقول الدراسة الأخيرة ، التي أجراها في عام 2009 كل من هامر وبيهار وآخرون ،  إن 20 من مجموعات هابلوغل 21 كوهين ليس لها مجموعة هابلوغرافية شابة واحدة ؛ خمسة haplogroups تشكل 79.5 ٪ من جميع haplogroups كوهين. من بين هذه المجموعات الخمس الأولى ، تمثل J-P58 (أو J1E) 46.1 ٪ من كوهين وحسابات هابلوغروب الرئيسية الثانية ، J-M410 أو J2a 14.4 ٪. قام كل من Hammer و Behar بإعادة تعريف النمط الفرداني CMH الممتد على النحو الذي تحدده مجموعة من 12 علامة وأن مجموعة هابلوغروب «الخلفية» تحدد أهم الأسطر J1E (46.1٪). هذا النمط الفرداني غائب بين غير اليهود في عام 2099 تم تحليله في الدراسة. قد يبدو هذا الاختلاف من 3000 إلى 1000 سنة مضت. ومع ذلك ، تؤكد هذه الدراسة أن نسب كوهين الحالية تنحدر من عدد صغير من أسلاف الأب.
في ملخص النتائج التي توصلوا إليها ، خلص المؤلفون إلى أن «تقديراتنا لوقت التحالف تدعم أيضًا الفرضية القائلة بأن CMH الممتد يمثل سلالة تأسيسية فريدة من العبرانيين القدماء الذين ورثتهم سُميًا مع الكهنوت اليهودي»
تضع أبحاث علم الوراثة الجزيئية التي نُشرت في عامي 2013 و 2016 لصالح مجموعة هبلوغروب ليفانت J1 (J-M267) مكان Y-chromosomal Aaron ضمن المجموعة الفرعية Z18271 ، وفقًا لتقديرات العمر 2638–3280 عامًا قبل الوقت الحاضر (yBP).
دراسة أجريت عام 2003 على كروموسوم Y بواسطة Behar et al. أشار إلى أصول متعددة لأشكنازي اللاويين، وهي فئة كهنوتية تشكل حوالي 4% من اليهود الأشكناز. لقد وجد أن هابلوغروب R1a1a (R-M17)، وهو أمر غير شائع في الشرق الأوسط أو بين اليهود السفارديين ، ولكن المهيمن في أوروبا الشرقية ، موجود في أكثر من 50 ٪ من اللاويين الأشكنازي ، في حين أن بقية الأبوين من الأشكنازي أصل شرق أوسطي واضح. اقترح بيهار حدثًا مؤسسًا ، على الأرجح يشارك فيه رجل أو قليل من الرجال الأوروبيين ، يحدث في وقت قريب من التكوين الأولي وتسوية مجتمع الأشكنازي كتفسير محتمل. تكهن نيبيل وبيهار وغولدشتاين بأن هذا قد يشير إلى أصل الخزر.
دراسة 2013 من قبل Rootsi et al. وجدت أن R1a-M582 ، الفئة الفرعية المحددة من R1a التي ينتمي إليها جميع عينات الأشكنازي اللاويين مع R1a ، كانت غائبة تمامًا عن عينة مكونة من 922 من أوروبا الشرقية ولم يتم العثور عليها إلا في واحدة من 2,164 عينة من القوقاز ، بينما كانت تتكون من 33.8 تم العثور على٪ من نسبة اللاكيني الأشكنازي R1a أيضًا في 5.9٪ من الشرق الأدنى الذين يحملون R1a. على الرغم من كونها أقل تمثيلًا في الشرق الأدنى ، إلا أنها كانت أكثر تنوعًا منها بين اليهود الأشكناز. روتسي وآخرون. جادل بأن هذا يدعم الأصل العبرية في الشرق الأدنى للنسب الأبوية R1a الموجودة بين اللاويين الأشكنازي: تم العثور على R1a-M582 أيضًا بين السكان الإيرانيين المختلفين ، بين الأكراد من Cilician Anatolia و Kazakhstan ، وبين اليهود من غير الأشكناز.
«لقد أظهرت الدراسات السابقة لكروموسوم Y أن اشكنازي ليفيت ، وهم أعضاء في طائفة كهنوتية يهودية من الوالدين ، يعرضون حدثًا مؤسسًا مميزًا داخل R1a ، وهي مجموعة هبلوغوم Y الأكثر انتشارًا في أوروبا الشرقية. هنا نُبلغ عن تحليل 16 تسلسلًا كاملًا من R1 ونبيّن أن مجموعة من 19 بدائل من النيوكليوتيدات الفريدة تعرف سلالة الأشكنازي R1a. بينما كشفت الدراسة الاستقصائية التي أجريناها على إحدى هذه العينات ، M582 ، في 2834 عينة من عينات R1a عن عدم وجودها في 922 من أوروبا الشرقية ، نظهر أنها موجودة في جميع عينات R1a Ashkenazi Levites ، وكذلك في 33.8 ٪ من الذكور اليهود R1a الأشكناز الآخرين 303 R1a الذكور الشرق الأدنى ، حيث يظهر تنوع أعلى بكثير. علاوة على ذلك ، فإن سلالة M582 تحدث أيضًا عند الترددات المنخفضة في السكان اليهود غير الأشكناز. على النقيض من أصل شرق أوروبا المقترح سابقًا لأشكنازي ليفيت ، فإن البيانات الحالية تشير إلى مصدر جغرافي لسلالة مؤسس ليفيت في الشرق الأدنى ووجودها المحتمل بين العبرانيين قبل الشتات.»