بايرن ميونخ التاريخ
في الأول من يوليو من عام 2013 تسلم بيب غوارديولا دفة القيادة في الفريق البافاري وذلك قبيل انطلاقة موسم 2013–14، كما تعاقد البايرن مع ماريو غوتزه من بوروسيا دورتموند في صفقة قدرت بـ37 مليون يورو، ما جعلها أغلى انتقال للاعب ألماني وقتها (فيما بعد تخطتها قيمة صفقة انتقال أوزيل من ريال مدريد لأرسنال البالغة 50 مليون يورو )، في 24 يوليو 2013 خسر البايرن نهائي السوبر الألماني بمواجهة غريمه بوروسيا دورتموند بنتيجة 4–2 في ملعب الأخير،  ليعود الفريق ويتوج بلقب السوبر الأوروبي في الـ30 من نفس الشهر بتغلبه على تشيلسي الإنجليزي عبر ركلات الجزاء الترجيحية. في 9 نوفمبر 2013 استطاع البايرن كسر رقم هامبورغ القياسي لأكثر عدد من المباريات المتتالية من دون هزيمة في البوندسليغا (36 مباراة). في 27 من نوفمبر 2013 وبعد فوزه على سيسكا موسكو الروسي بنتيجة 3–1 أصبح البايرن الفريق الأول الذي يفوز بـ10 مباريات متتالية في دوري أبطال أوروبا،  وفي 21 ديسمبر 2013 توج العملاق البافاري بلقب كأس العالم للأندية بعد تغلبه على الرجاء البيضاوي المغربي بنتيجة 2–0 في النهائي الذي لعبت على أرضية ملعب مراكش في المغرب. في موسم 2014–15 دافع بايرن ميونخ عن لقبه ونجح في الاحتفاظ به،  وفي الموسم التالي نجح في الاحتفاظ بلقبه ليحقق رقمًا قياسيًا بالفوز به أربع مرات متتاليات دون انقطاع. وفي نهاية موسم 2015–16 غادر غوارديولا الفريق ليتولى تدريب مانشستر سيتي، وخلفه كارلو أنشيلوتي.
انضم هانز ديتر فليك لبايرن ميونخ يوم 1 يوليو 2019 كمدرب مساعد. تحت قيادة كوفاتش كانت بداية بايرن في الدوري غير مرضية، وبعد الخسارة بنتيجة 5–1 أمام آينتراخت فرانكفورت، اتفقت إدارة بايرن مع المدرب كوفاتش على إنهاء العقد القائم بينهما يوم 3 نوفمبر 2019 ليتم بعدها ترقية فليك إلى مدرب مؤقت. استلم فليك زمام تدريب الفريق ليحقق نتائج إيجابية بداية من حسمه التأهل إلى دور الـ16 من دوري أبطال أوروبا 2019–20 مبكرًا قبل جولتين من نهاية مرحلة المجموعات بعد تغلبه على أولمبياكوس (0–2)، والفوز على بوروسيا دورتموند (0–4) ضمن منافسات البوندسليغا، وبعد تحقيق الفوز على فولفسبورغ (0–2) أعلنت إدارة بايرن عن استمرارية فليك كمدرب للفريق حتى نهاية الموسم، مع توالي النتائج الإيجابية وتحسن أداء البافاري بصورة ملحوظة على أرضية الملعب، توصلت إدارة بايرن إلى اتفاق مع فليك يستمر بموجبه كمدرب للفريق حتى 30 يونيو 2023.
تحت قيادة فليك، فاز النادي بالدوري الألماني للمرة 30 في تاريخه بفارق 13 نقطة عن صاحب المركز الثاني، ليفوز بعدها بكأس ألمانيا ويكمل الثنائية المحلية الـ13 في تاريخ البافاري. في بطولة دوري أبطال أوروبا، وصل بايرن لأول نهائي له منذ 2013، بعد سحقه لبرشلونة في ربع النهائي بنتيجة 8–2  والفوز على أولمبيك ليون بنتيجة 3–0 في نصف النهائي. في النهائي، الذي أقيم في مدينة لشبونة خلف أبواب مغلقة بسبب جائحة فيروس كورونا، فاز بايرن على باريس سان جيرمان بهدف لصفر (1–0) من توقيع الفرنسي كينغسلي كومان ليحقق سادس ألقابه في المسابقة وبهذا الانتصار أصبح بايرن ثاني فريق أوروبي يحقق الثلاثية القارية لمرتين. بعد استراحة قصيرة، بدأ الفريق الموسم الجديد بالفوز بكأس السوبر الأوروبي للمرة الثانية في تاريخه، بعد انتصار صعب لبايرن على إشبيلية بنتيجة (2–1) بعد وقت إضافي، وقد سجل هدف الفوز خافي مارتينيز. في فبراير 2021، فاز الفريق بكأس العالم للأندية 2020 (المؤجلة من ديسمبر 2020 بسبب جائحة فيروس كورونا) على حساب تيغريس أونال المكسيكي بنتيجة (1–0)، ليصبح ثاني نادي يحقق السداسية، بعد برشلونة موسم 2009. فشل بايرن في المحافظة على لقبه القاري في النسخة التالية، بعد خروجه من ربع نهائي أمام باريس سان جيرمان بفضل قانون أهداف خارج الأرض، بعد التعادل في مجموع المبارتين بنتيجة 3–3. محليًا، حصل الفريق على لقب الدوري للموسم التاسع تواليًا.
أعلن بايرن ميونخ يوم 27 أبريل 2021، عن مغادرة فليك للفريق في نهاية الموسم، بطلب منه، وتعيين يوليان ناغلسمان خليفة له بدءًا من الموسم المقبل.
حقق ناغلسمان أول ألقابه مع بايرن يوم 17 أغسطس 2021، بعد الفوز على بوروسيا دورتموند في كأس السوبر الألماني 2021. تأهل بايرن من مجموعته في دوري الأبطال بالعلامة الكاملة، لكنه خرج من ربع النهائي أمام فياريال الإسباني، بعد الخسارة 2–1 في مجموع المباراتين. واصل البافاري هيمنته المحلية وتوج بلقبه العاشر تواليًا في الدوري.