حروب فرنسا الدينية الصراع
استُأنفت الحرب. واجه كونديه مركور بالقرب من لاروشال، والملك دي نافار ضد أومال في جيون...وكان الجيز في الشرق لمنع قوات ألمانيا من التقدُم. وكان الملك يُشرف علي كل شيء، ولكن المعارك المختلفة لم تكن حاسمة. ولقد ؟أنزل الملك دي نافار خسائر فادحة علي الملكية بقيادة آن دي جوايوز وذلك في مهركة كوتراس في 22 أكتوبر 1587. جيز حاول اغتيال الجنود البروتستانت الألمان أثناء معركة فيموري (بالقرب من مونتاجري) في 26 أكتوبر 1587 ثو في أونو في 24 نوفمبر 1587. مشهود له بانتصاراته، كان شعب باريس يهلل لجيز ويُذل الملك. لذا يجب علي الملك التخلي عن العاصمة إلي المُتذمرين وذلك في يوم الباريكاد في 12 مايو 1588. أعلنت المدينة أنها مع العُصبة وكسبت مؤسسات جديدة.
استفاد الملك من انحاد الولايات العامة في بلوا لكي يغتال قواد العُصبة، الدوق دي جيز وشقيقه الكاردينال دي لورين في ديسمبر 1588. بعد هاتين الجريمتين، صاح الملك هنري الثالث قائلا : الآن أنا الملك. عند معرفة خبر اغتيال قادة العُصبة أعلنت العُصبة انقطاعها عن أي اتصال مع الملك الطاغي والخائن للقضية الكاثوليكية. أخذ قيادة باريس الدوق دي ماين شقيق الضحيتين والقائد الجديد للعُصبة. وفي فبراير 1589 انتقل إلي باريس اتحاد المجالس العامة حيث يتجمع العديد من الحُكام. أعلن الأطباء من الكلية اللاهوتية بباريس المواضيع الفرنسية المحلولة من أدائهم يمين ولائهم. لم يكن أمام الملك هنري الثالث لكي ينقذ عرشه سوي الاتحاد مع البروتستانت. وتوافق مع الملك دي نافار، ووحدوا قواتهم لمُحاصرة باريس. تم اغتيال هنري الثالث بسان كلود في الأول من أغسطس 1589 من قِبل راهب مُتعصب، مما جعل هنري دي نافار، قائد البروتستانت الملك الجديد لفرنسا.
اعترف السياسيين الكاثوليك مثل البروتستانت بشرعية الملك. وبالإضافة إلي ذلك أعلن هنري الرابع في 4 أغسطس عن عزمه تعلُم الديانة الكاثوليكية وذلك بعد تأثير مايكل دي مونتانيي. ولذلك ترك البروتستانت المُتشددون الملك. لقد كانوا يخشون من تحوله هذا أن يؤدي في نهاية المطاف إلي المزيد من الاضطهاد للبروتستانت. وانقسم البرلمان ما بين متآمرين وملكيين.
استولت العُصبة علي شمال فرنسا وكانت تعتمد علي دهم فيليب الثاني ملك أسبانيا. ورفضت العُصبة الاعتراف بملك بروتستانتي. ومنذ شهر أغسطس 1589 أعلن المتآمرين البارسيين الكاردينال دي بوربون ملكاً لفرنسا. ولكنه توفي في ماية 1590 وترك خلفه فراغ سياسي بين المتآمرين. ثم استقر الجنود الأسبان في بريتاني ولانجدوك. وقد أعطي أوامر مرتين لجيوش ألساندرو فارنيزي المُقيمين في هولندا للعودة إلي فرنسا. تدخل الدوق دي سافوا في بروفنس ودوفين. ومن الناحية البروتستانتية، بعثت لهم الملكة إليزابيث الأولى ملكة إنكلترا المال، وبعث لهم الأمراء الألمان جيوش.
وفي 1589-1590 ضاعف هنري الرابع عملياته بالقرب من باريس ونورماندي. وبعد انتصاره في معركة آرك تقدم بحصاره أمام باريس. وبعد انتصاره اللامع في إيفري حاول مُحاصرة باريس للمرة الثالثة. وبعد عدة أسابيع من الحصار، اضطر هنري الرابع من رفع خيمه ولذلك بسبب الجيش الأسباني الذي بعثه ألساندرو فارنيزي ليفك حصار باريس. وجدد المحاولة في ليلة 20 و 21 يناير 1591 لكي يستثمر باريس بالحيلة ؛ وذلك من خلال بعثه برجاله مُتخفيين في زي تجار الدقيق، وقد لقيت هذه المحاولة فشلها وسُمي ذلك اليوم يوم الطحين.
لقد حاصر روان، وأرسل جيشاُ لفتح الطريق أمامه إلي هولندا البروتستانتية وآخر ليمنع الدوق مركور من نزع السيادة من بريتاني. وعلي الجبهة الجانوبية، تمكن الدوق دي مونمورانسي من هزم عائلة جوايوز.
وفي 1593 اتحدت الولايات العامة التابعة للجامعة بباريس. ويُطالبون بملك كاثوليكي. ورفضوا إعطاء تاج فرنسا للوريثة إيزابيل ابنة فيليب الثاني ملك إسبانيا وإليزابيث من فالوا. وكان الدوق دي سفوا والدوق دي لورين والجيز أيضاً والبوربون كانوا في صف الكاثوليك. وفَهم هنري الرابع أنه لن يكون مقبولاً لو ظل بروتستانتيا ً. أعلن اعتناقه الكاثوليك وتبرأ في كاتدرائية سانت دينيس في 27 يوليو 1593. هذا التحول فتح أمامه الأبواب بباريس في 1594. قُدس في شارتر في 27 فبراير 1594. واعترف البابا بشرعية الخلافة في 7 ديسمبر 1595. استقر بشكل دائم في العاصمة. انتهي هنري الرابع من استعادة مملكته. وأعلن رسمياً الحرب علي أسبانيا، وبدأت حملة في بروجوندي الأمر الذي أدي إلي تحطم أخر القوات المسلحة للعُصبة في معركة فونتين فرانسواز.
هُزكت مايين، وتوقف العُصبة النبيلة تدريجياُ عن التواجد. وفي عام 1596 تسارع الدوق الشاب دي جيز في مُحاصرة مارسيليا. ويمكن أن يجعل هنري الرابع مدخله في مدينة ليون التي كانت عكس باريس تُرحب به كثيراً. فإذا خضع تشارلز دي ماين وفرانسوا جوايوز إلي الملك، لن يكون لديهم حاكم لبريتاني، الدوق دي ماركور الذي يدعم القوة المتآمرة علي بريتاني حيث فيليب الثاني يستقر الجيش الأسباني.
تم استعادة الشرق، هنري الرابع يحاول حماية حدوده الشمالية من الأسبان. واستعادة المواجهات في لاوون الوضع لصالحه ولكن مُحاصرة الأسبان المفاجئ لأميان جعل الجميع يتسائلون. وتخلي عنه البروتستانت الذين يعتبروا أنفسهم ظلموا من الملك، حاول هنري الرابع أخذ أميان التي وضع بها الكثير من الموارد العسكرية. جاءت قوات الجيش الأسبانية لمُساندة القوات المُحاصرة، وبعد الكثير من التضحيات اتخذت المدينة.
في عام 1598 تم إقرار معاهدة سلام ما بين فرنسا وأسبانيا وهي معاهدة سلام فرنيس. انتقل هنري الرابع إلي أنجر لإعداد مرسوم جديد للتهدئة ويقدم في نانت والدوق دي ماركور. وقد حل مشكلة البروتستانت من خلال اعتماد مرسوم تسامح وهو مرسوم نانت. وهو يعتمد علب المراسيم الصادرة خلال فترة الحروب الدينية. وقد حصل المًصلحين علي حرية العبادة والعقيدة المحودة، والمساواة المدنية مع الكاثوليك. تم توفير الضمانات القضائية بموجب الدستور «المحاكم منتصفة الأحزاب» في أربع مدن. وأخيراً لحمايتهم لديهم بعض الأماكن لمدة ثماني سنوات، وتُجدد الامتيازات في 1606. ولكن أعداد البروتستانت قد قلت بشدة، وفي نهاية الحروب الدينية لم يكن سوي مليون بفرنسا.