國立清華大學
國立清華大學（英語譯名：；縮寫：NTHU），簡稱清華、清大，為中華民國高教深耕計畫遴選出參與全球鏈結全校型計畫的四所大學之一，前身起源於中國北京的清華學堂，1956年於臺灣新竹市復校，與國立陽明交通大學光復校區、工業技術研究院光復院區及新竹科學工業園區相鄰，目前共有12個學院。清華之象徵物為梅花與紫荊，吉祥物為大熊貓，並於每年定期舉辦「清華紫荊季」活動。
該校之組成規模幾經更迭，並自國共內戰後由梅貽琦主導，於1956年在台復校。2016年11月1日，與國立新竹教育大學正式合併。清華現為台灣聯合大學系統成員。
該校校區內有北京清華二校门的等比例縮小複製品，象徵兩校之間淵源深厚、一脈相承，前清華校長劉兆玄於2010年在北京清華演講時所述，兩岸「一筆寫不出兩個清華」。現雙方合作提供MOOC課程、學術訪問制度及雙聯學位課程。在美國的清華校友會亦同時為北京清華與台灣清華之校友服務。在2020年，國立清華大學在《上海交大學術排名》中為401-500名之間。在2021年，國立清華大學在《QS世界大學排名》中為世界第168名 ，在《泰晤士世界大學排名》中為351-400名之間，在《美國新聞與世界報導》中為363名。，在萊頓大學的世界大學論文引用排名（CWTS）中，清華大學排名在全台灣第1名（2014年）。
中華民國政府於第二次國共內戰失利而撤退至臺灣後，接收日本海軍第六燃料廠廠本部300公頃土地。1955年金開英擔任中油總經理，撥用40甲土地給清華大學建校，由來自中國的校長梅貽琦於新竹市主持清華在台復校。復校重建之初首設原子科學研究所，1964年恢復大學部，目前設有理學、工學、原子科學、人文社會、生命科學、電機資訊、科技管理、教育、藝術、台北政經學院TSE等11個學院，共26個一般學系、10個學士班、23個獨立研究所、17個研究中心。位於中國北京的國立清華大學則由中華人民共和國政府接管，更名為清華大學。
在學術研究上，清華自29國130所（2011年4月）增加至49國319所（2020年4月）大學保持校際合作關係，各國交換學生、外籍生、華語學習的互動熱絡。而國立清華大學也與國內的國立陽明交通大學及國立中央大學、國立政治大學三校共同組成台灣聯合大學系統，整合各校資源，共同成立研究中心。此外，復校後的清華和相鄰的交大於1969年開始固定於每年春季舉辦「梅竹錦標賽」，比賽項目包含球類、橋藝、棋類、田徑、拔河等。清華校友與許多知名大學包括台灣大學等，都有協助校友創業活動，以租用辦公室的方式，推廣其創業活動，如清華海峽研究院。
根據汤森路透重要科學指標（Thomson Reuters, Essential Science Indicators），清華在化學、物理、材料科學、工程、計算機科學、生物與生物化學及臨床醫學等七學門被列為論文被引次數世界前1%之研究機構；臺灣在22個評比學門中之5個學門有研究機構躋身世界百強，清華在QS全球大學學科排名中在「材料科學」方面排名世界第37名，居全臺各校所有領域之首。2017年，於「機械工程」方面排名世界第38名，超越台大為全台第一。腦神經科學領域，諾貝爾獎得主DNA之父詹姆斯·杜威·沃森於2010年造訪清華時譽為『世界領先』。清華未來式，校園規劃，續以清華校色紫色及白色重新改造清華湖及校門口，清華湖以紫色意象傳統清華典雅，校門口以白色意象設計象徵未來醫學發展。
1948年（民國37年），梅貽琦校長離開北平前往南京，後出國赴紐約與中華教育文化基金董事會會商清華基金保管及運用事宜，確定國立清華大學將中國對美國的庚子赔款的退款使用剩餘部分存放至美國銀行設立“清華基金”，由梅貽琦校長掌控此基金。 1949年（民國38年）中華民國中央政府遷往台北，梅貽琦校長前往臺灣新竹市復建國立清華大學，至今此基金利息仍每年由銀行撥付給國立清華大學作為開支經費，只有台灣國立清華大學接收此基金。
清华源于辛丑条约约定的庚子赔款。1904至1905年（清光绪三十年至三十一年），美国国务卿海約翰认为赔款已超过美國應得到的部分，索要过多，並告訴大清驻美公使梁诚。梁诚得知美国庚款索赔过多后，几番据理力争要求美国退回，促成减免。美国总统罗斯福决定返还赔款基数定为一千余万美元，逐年退还。赔款用于人才培养和赴美留学。1909年（清宣统元年），美国开始退还庚款。为统筹考核留学生，外务部与学部上奏设立“游美学务处”并附设“肄业馆”。7月17日（六月初一）游美学务处正式建立，后任命外务部署左丞、左参议兼学部丞参上行走周自齐担任总办，学部员外郎范源濂和外务部候补主事唐国安，驻美公使馆参赞容揆任驻美学生监督，三年间共组织三批近200人赴美留学。
外务部选定清华园后，修缮工字厅、建造校门、一院、二院、三院、同方部、北院、校医院，1911年竣工，校园占地450亩。1911年2月，肄业馆改称“清华学堂”，由军机大臣那桐题写校名，总办周自齐兼任监督，会办范源濂、唐国安兼任副监督。3月30日（三月初一）暂行开学仪式（中等科），4月1日高等科开学，教师多从美国聘请，游美学务处也迁入工字厅办公。10月，武昌起義爆发，清政府挪用退还赔款弥补军费，学堂经费断绝，原定正式开学仪式取消，11月9日正式停课。
1912年中华民国建立后裁撤游美学务处，学堂改名为清华学校，分中等科四年、高等科四年共计八年学制。唐国安为第一任校长，周诒春为教务长，在校生约500人，教员30余人，以“培植全材，增进国力”为宗旨培养“领袖人才”。1913年春近春园、长春园、部分水磨村并入清华大学。1914年10月，美国建筑师墨菲与（Dana）为学校规划校园，布置留美预备学校和综合大学。1916年至1920年，建成图书馆、体育馆、科学馆、大礼堂等早期建筑。此期间，经费充足、园林优美，学习环境十分理想。学校强调体育锻炼和强健体魄，设立体操课，午后“强迫运动”，开办童子军训练和军事训练（兵操）；参加菲律宾第一届远东运动会；清华、协和、汇文合办的“三角运动会”为北京最早校际大赛。各界名人学者也前来演讲，1914年11月5日，梁启超先生以“君子”为题发表演讲，引述易经中“天行健，君子以自强不息”及“地势坤，君子以厚德载物”，对清华学子给予厚望。后“自强不息、厚德载物”被定为校训。
1913年3月初，唐国安校长病逝，周诒春继任，任内勤勉，增加设备建筑，扩充留美名额，于1918年1月辞职。此后直到1931年校长更迭频繁，史称“清华校长更迭风波”。早期先后有范源濂（美国驻华公使反对）、赵国材（代理）、张煜全、罗忠诒（学生拒绝）、严鹤龄（代理）、金邦正、曹云祥（代理）被任命校长。1924年5月，曹云祥成为正式校长，在任6年中，清华学术得到空前发展，1925年春成立国学研究院，聘请梁启超、王国维、陈寅恪、赵元任等导师。从派遣留学逐步转为培养本国人才，在1925年5月成立大學部，始创四年制學士教育，開始招收大學一年級生，稱為新制生，而留美預備部學生為舊制生，之後清華學校由留美預備部、大學部、國學研究院三個部分組成，並逐步向綜合性大學過渡。至1926年，大學部共成立17個學系，包含中國文學系、西洋文學系、歷史學系、經濟學系、教育心理學系、物理學系、工程學系、體育學系、音樂系等，已經形成大學的初步基礎。
1919年5月4日，五四运动爆发，城内十多所学校示威游行。清华学生组织演讲、会见公使、致电巴黎和会。9日，校内挂半旗，全体同学在体育馆举行“国耻纪念会”，并焚烧校内日货。共同宣誓“愿牺牲生命，以保护中华民国人民、土地、主权”。“五四”运动后，更多新思潮涌入清华，促进了清华学生的觉醒。1926年3月13日，举行纪念孙中山逝世周年大会，李大钊、陈毅来校演讲。3月18日，北京民众为反日本入侵游行请愿，遭段祺瑞政府打压，清华学生韦杰三牺牲，是为三·一八惨案。1927年6月，國學大師王國維憂憤國事，於北京昆明湖自殺，震驚全國。梁啟超亦因病離校就醫。同月教務長張彭春遭反對勢力攻擊而辭職，校園爆發「挽張去惡」風潮，學生遊行要求改造清華。
1928年，南京国民政府取代北洋政府掌控北京后，任命孫科為清華校長，孫科不就，遂改派罗家伦为校长，易名“国立清华大学”。羅家倫於校長就職演講中，提出要四化辦學（廉潔化、學術化、平民化、紀律化），並實行軍營化管理，遭學校師生拒绝。任职期间，罗家伦对学校组织结构大加整改，延請了蔣廷黻、張奚若、蕭公權、馮友蘭、張子高等幾十位著名教授。1929年4月，羅家倫因查出清華基金帳目虧空，要求改革，與清華大學董事會發生矛盾，提出辭職。同月，清華大學師生發起解散董事會，回歸教育部管轄運動。5月，清華重归教育部管轄；6月，清華大學董事會解散，清華基金改由中華教育文教基金會保管。成立研究院，先辦文法兩科，次辦理工農科。大學部第一屆學生亦於此年畢業。1930年5月，中原大戰爆發，北平落入閻錫山之手，校內親閻錫山勢力醞釀“倒羅運動”，再加上羅家倫長期與學校師生意見不合，5月20日請辭離去。後閻錫山指派與其同為山西人的清華校友喬萬選為清華校長，但是遭到清華師生以反對军阀力量把持校政為由，拒絕喬萬選。6月25日，喬萬選企圖以武力接收清华，遭學生阻擋，並簽下「永不任清華校長」承諾書。清華校務暫由校務會議維持，清華進入長達十至十一月的無校長時期。1931年4月，教育部任命吴南轩為校长，然而吴南轩擅自解聘教授，任用私人，携印入城，断绝学校资金并暗示武力解决，引起全校師生不滿，学生护校委员会和教授会迫使教育部将其撤职。
1931年10月14日，梅贻琦被任命为校长，12月3日，在校長就職典禮上提出“所謂大學者，非謂有大樓之謂也，有大師之謂也”的理念，此理念對清華有著深遠的影響。梅贻琦擔任清華校長長達17年，為清華最久任的校長，且对学校建设贡献巨大，确定了清华著名学府地位，被稱為清華永遠的校長。此時期，梅校長大力延聘名師，讓此時的清華園名師雲集，如文學院的馮友蘭、朱自清、聞一多、陳寅恪、吳宓、金岳霖等；理學院的葉企孫、吳有訓、周培源、陳省身等；法學院有陳岱孫，這些學術大師在清華創造出許多研究成果，如機械系教授王士倬建造了中國第一座航空風洞。在治校理念上，確立了“民主治校原則”，也稱為“教授治校”，清華的教授會、評議會、校務會以及各種專門委員會，多由教授擔任，讓教授能積極參與學校事務。
1935年秋天，在日军危及华北之时，校内成立学生自治会救国委员会，学生蒋南翔草拟《告全国民众书》，喊出：“华北之大，已经安放不得一张平静的书桌了！”1935年12月9日，一二·九运动爆发，清华大批学生参加了该运动，高呼“打倒日本帝国主义”、“停止内战、一致抗日”等口号。1936年，因日軍侵華，學校於長沙獄麓山興建校舍，並將學校珍貴圖書器材南遷，同時決定籌辦特種研究所。2月19日，參予學生運動的救國會與學校教授會為了上學期期末考試補考問題發生對立，教授集體辭職。22日，由學生會與用功讀書學生組成之護校團發起挽留教授。23日，梅校長自南京回校，處分救國會帶頭分子，並慰留所有教授。29日，冀察政務委員長宋哲元派兵進入校園逮捕二十一名左派學運學生，後經校方多方奔走，獲得保釋。12月，西安事變爆發，校園左右派學生對立。28日，由潘光旦教務長宣佈解散校園一切學生運動。
1937年發生七七事变，抗日战争全面爆发。8月5日，日軍即佔領清華園。9月10日，清华奉令与北大、南开在长沙组建国立长沙临时大学。10月25日，临大开学，共有文、理、工、法商等四院十七系，文學院另於南岳上課。1938年1月，因戰爭吃緊，決議搬遷至昆明，临大组织师生分三路艰难到达昆明，校名改为国立西南联合大学，梅贻琦任设常务委员会主席。5月4日，联大开课，三校师生在条件极其艰苦的情况下开展教学、科研工作。1939年因戰局吃緊，政府宣布停付庚款。清華農業、航空、無線電、金屬、社會調查五研究所自行設法維持。8月，清華決定恢復文科研究所，設中文、外文、歷史、哲學四部。1940年，因聯大校園屢遭日軍轟炸，教育部命聯大遷川。8月，聯大決定於四川敘永設立分校，命一年級及先修班新生前往上課。11月，為了培養大後方中小學教師，聯大成立師院附設學校。1941年1月，敘永分校開始上課。4月，清華大學成立卅年，師生於昆明舉行紀念會，出版學報紀念專刊。8月，敘永分校結束運作，學生返回昆明。10月，文科研究所於昆明東郊龍泉鎮司家營成立，由馮友蘭教授出任校長。11月，與盟軍合作於昆明成立譯員訓練班，並成立師範學院初級部。联大期间，学生参与青年从军运动，应征飞虎队翻译，参加中国远征军入缅作战。 清华还单独设立昆明办事处、研究院和特种研究所。特种研究所依靠庚款基金利息，拥有农业、航空、无线电、金属、国情普查五个研究所，服务军事研究。战争中，清华园遭日军野战医院152病院等占据、破坏，留守教职工也被害。
1945年日本投降后，学校开始修缮清华园。次年联大结束，三校复员。清华在战争伤痕下努力恢复发展，1946年2月，部分系所勉強於北平清華園重新復課。5月4日，西南聯大結束，學生依志願分發，入清華者932人，入北大者644人，入南開者65人。三校於昆明立碑紀念八年之艱苦合作。師生陸續北返，只留下師範學院改為國立昆明師範學院。7月，清華中文系教授聞一多遭國民黨特務刺殺，昆明發生學潮，梅校長赴滇解決。10月10日，正式於清華園上課，收集補充圖書儀器設備，並招考新生。1948年，清华大学扩充农学、气象学、法学、航空工程等院系。同年11月24日，在中国人民解放军进攻下，国民政府教育部督学前来谈迁校事宜，并接走清华5位教师。12月13日，解放军进军至西郊，绕开圆明园和清华、燕大，占领丰台。中央军委主席毛泽东指示保护清华、燕京等校。解放军与国军战于学校墙外，不久后国军退守城內。15日，解放军进驻海淀镇，清华园成为华北地区最早被解放军占领并宣告解放的高校。12月18日，解放军第13兵团政治部张贴布告宣布严加保护学校，阻止抢掠。梅贻琦校长于12月14日因公入城，留在城内，后于21日乘飞机前往南京。12月17日，校务会议推举冯友兰为临时主席，代理主持校务。
1949年中華人民共和國成立，中華民國政府遷守臺灣。梅校長赴歐，後往紐約與中華教育文化基金董事會會商清華基金保管及運用事宜。自1951年開始以清華基金利息協助在美學人研究，並贈送學術書刊儀器給臺灣專科以上學校。1955年，「中美合作研究原子能和平用途協定」正式簽字，政府決定設立原子科學研究機構，發展原子科學之研究，乃電召梅貽琦校長返國籌議。並於同年12月，由行政院組設「國立清華大學研究院籌備委員會」，以教育部長張其昀，清華大學校長梅貽琦，國防、外交、財政、經濟四部代表，暨蔣夢麟、浦薛鳳、錢昌祚，陳雪屏、錢思亮、金開英、洪紳諸先生為委員。
1956年1月1日，即在臺北成立籌備處，以陳可忠為主任；清華在臺復校工作由此開始。原先計畫在臺北南港與新竹擇一選校地，但因南港腹地較小，再加上時任新竹縣長朱盛淇的爭取，清大選在新竹赤土崎建校。校地由中國石油公司提撥約40公頃的原日本海軍燃料廠土地，在原子爐開工後，需要更多校地，因此新竹縣長朱盛淇同意再撥約33公頃土地，此時的清華校地共約78公頃。
1956年清大在臺復校後首次招生，因校舍還未完工，以國立臺灣大學為上課地點，至此清大校務在臺正式運行。1957年，清大在新竹的教學大樓、辦公大樓、教職員工宿舍、學生宿舍等相繼完工，學生於是返回新竹上課。1961年原子爐興建工程完工，此原子爐土木工程部分由校友華泰建築師張昌華負責設計，機械裝置則由中油、臺電、臺灣鋁業公司分別派員操作，並得到經濟部聯合工業研究所的協助，是臺灣第一次由產官學界共同完成的成果。
1962年5月19日，梅校長病逝於臺大醫院後，校務暫由教務長陳可忠代理，1965年陳可忠正式擔任校長，在其任內增設了數學、核工、物理、化學系所，增長了清華的教學組織；1968年，清華圖書館（紅樓）啟用，隨後體育館、大禮堂與新校門等相繼落成；1969年，清華與交大聯合舉辦首次的「梅竹錦標對抗賽」，同年7月陳校長退休，由閻振興校長繼任。
1970年9月，閻校長調任至臺大，繼任校長為徐賢修。1973年，經教育部核准，成立工學院、理學院與原子科學院，清大從原本的原子科學所擴張為理工大學。1975年，張明哲擔任清華校長，在其任內，清大為了整合全校研究及對外合作，規劃成立研究發展委員會。1980年大學部增設中國語文學系，清大逐漸邁向綜合大學之路。
1981年毛高文校長任內，正式設置（1995年修訂清大組織規程時，納入正式編制，更名為研究發展處），是臺灣各大學中第一個研究發展行政單位，下設各研究中心。1983年為配合推動國防科技發展，與中山科學院合作成立自強科學研究中心，為推動跨院所系的教學與研究，成立校內原子科學技術發展中心及科學儀器中心。1984年依行政院「加強培育及延攬高級科技人才方案」，成立材料科學中心，為全臺大學中四大重點科技中心之一。之後陸續成立電腦與通訊科技研發中心（1994年）、積體電路設計技術研發中心（2000年）、奈米與微系統科技中心（2001年）、腦科學研究中心（2002年）、當代中國研究中心（2003年）、能源與環境研究中心（2004年）等校級研究中心。
清大為執行「發展國際一流大學及頂尖研究中心計畫」、整合清華重點領域研究，於2006年陳文村校長任內，合併材料科學中心、奈米與微系統科技中心成為奈微與材料科技中心，成立生物醫學科技研發中心（2007年）、人文社會研究中心（2007年）、基礎科學研究中心（2008年）。此外，1997年行政院國家科學委員會在清華校園中，設有國家理論科學研究中心，分為數學組與理論物理組，與校內、外學者互動頻繁；清華為鼓勵研究成果轉為產業價值，1999年成立創新育成中心，績效優異。
清大為給學生先入學、瞭解志趣後再選系之機會，在陳文村校長任內，推行各學院院招生，強調跨院系教育、大一不分系，於2006年先增設理學院、科技管理學院學士班，逐年推至各學院，迄2009年，全校所有學院均設有院招生學士班。另外在2008年陳校長任內，創立臺灣第一個強調住宿學院（Residential College）教育的「清華學院」，擷取世界頂尖大學住宿學院之精神，融合清華特色，帶給清華學子嶄新的學習與校園生活環境。
1980年代以來，兩岸清華交流日漸頻繁；1995年沈君山校長率團訪問北京清華，簽定「海峽兩岸清華大學交流合作備忘錄」，交往日益熱絡；2009年陳文村校長再次率團訪問北京清華，簽定「兩岸清華大學學術交流與合作備忘錄」暨「兩岸清華大學教師與學生交流協議」，除加強兩校之師生、學術交流外，並各自提撥基金，支持兩岸清華共同研究計畫之進行；次年北京清華顧秉林校長率團回訪新竹清華，兩岸清華交流與合作更加密切。
2002年，入選中華民國教育部最初7所重點研究型大學之一。
2006年以來，在教育部推出的「發展國際一流大學及頂尖研究中心計畫」及「邁向頂尖大學計畫」，清大獲選為重點補助的學校，正穩健地邁向世界一流學府之林。
东晋谢混作《》诗，有“景昃鸣禽集，水木湛清华”（“湛”通“沉”，音chén），意指“夕阳斜照，鸣叫的鸟儿归林；清澈的水色与华美的草木，已经淹没在暮色之中。”原为感叹时光流逝之意，后引申出“水木清华”一词，并赋予“池水清澈，树木华美”之意，今日工字厅后匾额即为“水木清华”四字。明万历年间建皇家园林清华园（今畅春园），后废。清康熙年间建熙春园，后分为近春园、熙春园两部，咸丰帝为熙春园亲书匾额改为“清华园”。1910年，游美学务处将附属肄业馆改为学堂，依据所在地而定名“”（Tsing Hua College），后沿袭更名“清华学校”（Tsing Hua School）。1928年6月，南京國民政府掌控北京后准备改办大学，由于清华接收美国退还庚款，对罗家伦校长的委任状中定名为“清华大学”，未加“国立”二字，后经罗家伦多次争取，最终定名为国立清华大学。 清華一直以紫，白二色作為自己的顏色，是否經過學校正式決議，目前尚未查知，但在最早的英文校歌上（1916年以前）即已有了這樣的句子： ""
當時的中文譯文是：
"噫清華，嘻清華，吾校巋巍， "美哉吾校旗，願日增汝之光輝。"
在1917年以前，學校曾把白色的「自強不息」校徽，印製在紫色的質地上作為校旗，在各種慶典上懸掛。而在一般場合，特別是印刷品上，則恆以長三角形紫白二色參半，印以中英文校名的旗幟為多。1923年，聞一多曾在長詩「園內」裡寫道：
清華的校旗，用了傳統的紫白二色，紫色為底，中間為英文校名縮寫「TH」所組成的圖案，中間有一“清”字，上有「國立清華大學」字樣。\transpose c ees \relative c'清華大學的校訓為「自強不息，厚德載物」。源於周易乾坤二卦，卦辭是「天行健，君子以自強不息；地勢坤，君子以厚德載物」。因於1914年（民國3年）冬，梁啟超先生到清華演講，講題為「君子」，即以此辭為中心內容，激勵清華學子發憤圖強，並把此二卦辭作了如下的詮解：
接著，梁啟超先生又引申勉勵清華學生說：
這次演講以後，學校即以此八字為校訓，作圖制徽沿用至今，並於於2008年2月後陸續成立了「厚德書院」、「載物書院」、「天下書院」等住宿學院。
人們習慣把紫荊和丁香視為清華的校花，但未見諸典籍，可能只是一種約定俗成。
1916年除夕，聞一多所在的中等科曾以「Much Ado about Nothing」為劇名，參加校內演劇競賽獲優勝獎，這個劇的中文題名即為「紫荊魂」，可能也與讚頌紫荊的品性有關。至今清華校園活動裡，「紫荊魂」一劇依然常被重新演出。
把這兩種花視為校花，首先是由於它們與校旗，校色的顏色一致，（紫荊花為紫色，丁香花分為紫白二色）；其次是由於這兩種花都是在校慶日前後盛開。亦有校友曾在校友通訊上建議，定紫荊或丁香為校花。
2011年，「99學年度第4次校務會議」決定清華校花為梅花，為了紀念梅貽琦校長而來。且梅竹賽行之多年，梅花已成為清大之精神象徵，也用在各種清華紀念品之上。
設有校本部及南大校區等2個校區。2016年11月1日，與國立新竹教育大學合併，國立新竹教育大學改稱「國立清華大學南大校區」，教育與學習科技學系、特殊教育學系、體育學系、幼兒教育學系、教育心理與諮商學系、英語教學系、環境與文化資源學系、臺灣語言研究與教學研究所、數理教育研究所以及原國立清華大學學習科學研究所成立「國立清華大學竹師教育學院」，音樂學系和藝術與設計學系成立「國立清華大學藝術學院」，中國語文學系、應用數學系、應用科學系、人力資源及數位學習科技研究所4系所自106學年度起停招，並於合校過渡期成立「國立清華大學南大校區系所調整院務中心」。合校初期竹師教育學院與藝術學院仍在南大校區上課，未來規劃將兩院遷至校本部，南大校區改為「清華創意與大學臍帶園區」。
2007年曾規劃設置宜蘭校區，並於同年12月開始動工整地。但因缺乏後續興建資金，2014年6月國立清華大學在行政院環保署環評專案審查會議中宣布無限期停工，後續移交國立宜蘭大學接手。
2019年與桃園市政府簽訂為期3年的「醫療暨教育研發園區合作意向書」，計畫籌設具國際醫學中心等級的清華醫院。
現有18棟學生宿舍，可容納約6000名學生住宿。大學部宿舍計有文齋、靜齋、雅齋與慧齋（以上為女生宿舍）、禮齋、義齋、華齋、誠齋、碩齋、信齋、（以上為男生宿舍）、新齋（男女混和之宿舍，其中1至4樓為男宿，5樓以上為女宿，有門禁限制）、仁齋、實齋（以上為男女混和之宿舍，其中仁齋1至3樓為男宿，4樓為女宿；實齋1至2樓為男宿，3樓為女宿）。研究生宿舍計有雅齋、善齋（以上為女生宿舍）平齋、明齋、清齋（以上為男生宿舍），另有鴻齋為男女混合之宿舍，2008年8月底，完成2棟共1000床學生宿舍供研究所學生居住，定名為學齋及儒齋；住宿率提高至55％以上。
其中大學部1、2年級有新生保障優先住宿權，3年級以上則視空床數進行抽籤。另碩2以上之碩士班和博2以上博士班也擁有優先住宿權。
清華現有超過100個學生社團，社團的類別包括服務性、音樂性、學藝性、體育性、自治性及綜合性。另經常舉辦的活動，包括社區服務、電影欣賞、專題演講及座談、團康聯誼、藝術演出、競賽活動等，寒暑期並舉辦各類型營隊。同時，為培養具有國際觀、奉獻與服務精神的清華人，2007年開辦暑期國際志工。
體育設施包括體育館、游泳池、田徑場、及羽球、網球等各類球場，每學年均舉辦全校性之游泳比賽、越野賽跑及運動大會等。越野賽跑於2007年更名為環校路跑，路線由校外移至校內；全長4600公尺，於每年校慶前一天之週六舉行。
設有多種獎學金，其中「還願獎學金」，係以照顧經濟有困難的同學為前提，並提供全額學雜費及生活費的補助；「逐夢獎學金」則以協助表現特出的大學生和研究生有機會去追逐夢想。
每年皆舉辦全校性的公司說明會、企業聯展及職涯規劃系列講座等活動；平時亦接受各界委託甄選人才。
與臺北榮民總醫院新竹分院合作設立國立清華大學附設診所，提供醫療服務。(2019年12月31日前為新竹馬偕醫院經營)
梅竹賽是清華與交通大學之間，一年一度的校際競賽。從1969年開始舉辦，當時名稱為「梅竹錦標對抗賽」，梅竹錦標賽，係分別紀念清華前校長梅貽琦與交大前校長淩竹銘，「梅」代表清華，「竹」代表交大，項目則包含了球類、棋橋、中英文辯論、拔河等。約於每年的3月舉辦，歷年來雖然因故停辦過數次，但梅竹賽依然是兩校每年共同的傳統盛事。飲水思源，梅竹賽的緣起，當回溯至民國50年代；清華與交大在臺復校後，因兩校校地位置相鄰，且學生人數相近，而學生之背景與就讀的科系性質亦相似，所以兩校同學彼此之間在生活、課業與活動的往來就相當的頻繁，因而不斷的有聯誼活動。在梅竹賽開辦當時，兩校為其應名「梅竹賽」或「竹梅賽」爭論不休。最後清華張致一教授從口袋拿出了一元硬幣道：「出現梅花則稱梅竹，出現壹圓那面則稱竹梅。」銅板落定，梅竹之名從此便正式確定。
清華非常重視大學部教育，在參考美國哈佛大學、麻省理工學院、耶魯大學等著名學府大學部教育後，陳文村校長於2007年7月成立「大學部教育改進工作小組」，由材料系陳力俊教授擔任召集人（2008年8月電機系王小川教授接任），針對清華教育目標以及校園生活、基礎教育、共同必修、通識教育作全盤檢討，提出整體性改進方案（2009年12月完成「大學部教育改進白皮書」），並陸續施行。為培養學生對社會的關懷，增進自我探索能力與行動力，於2008年2月成立「清華學院」，招募一批有想法有熱情的大二、大三生成為第零級的學院人，同年8月招收「清華學院」第一屆150位大一新生。
「清華學院」在學校正規課程之外，更進一步有系統的讓住在一起的學生，經由輔導，擴大生活體驗，思辯重要議題，增進社會參與，培養獨立思考能力，計劃執行力與挫折復原力以及人際互動與合作精神。相當程度的取法英國劍橋大學與牛津大學，美國哈佛大學與耶魯大學等名校住宿學院（Residential College）的作法，提供學生一般大學稀有的學習經驗。使學生成為有自主力、實踐力的學習者。其中，老師不是主角，只是潛能的激發者與引導者。學校致力於結合校內、外與校友資源，提供學生有效的學習環境，讓學生在其中找到自己的目標。由於其成效著卓，已於2010學年度起擴大招生，將原「清華學院」改稱「厚德書院」，強調社會關懷，另外設立「載物書院」，提供學生跨領域學習的輔導與幫助，內部設置以學生為主體的學研小組「跨領域研究中心 」，總共招收約達百分之十八的大一新生為學院學生。
目前住宿書院共有「厚德書院」、「載物書院」、「天下書院」三所，各自帶有不同的發展取向，如厚德書院提倡社會關懷，載物書院主打創新創業，天下書院著重國際交流。住宿書院底下包含服務學習課程及小組活動，如動物園志工，人權法律扶助等，提供在校學生從做中學的服務經驗。曾經於書院出現過的小組活動包含“議題小組”，讓學生在其中參與農村；“批判性刊物”、“新住民關懷”等活動，讓清華學生對社會能有更進一步的體認；“團體採訪”帶領學生碰觸他人的生命故事，進而反思自己的生命。在其中，學院以學生為主體，讓學生彼此「先成為人，再成為公民，然後成為士農工商。」
清華大學有多條路線供師生搭乘，以利往返各校舍、校區、聯盟學校，或其他機構。如校園巴士 (校本部內行駛)、校區區間車 (校本部和南大校區間運輸)、台聯大系統專車 (前往交大、中央、陽明)、中研院區間車 (前往中央研究院)、同步－國衛院區間車 (前往同步輻射中心、科技生活館)。2019年11月1日起，新竹市公車83路開通，可前往新竹轉運站、南大校區。
「繁星計畫」為清華於2006年陳文村校長任內，為縮減城鄉差距、培養更多不同面向的優秀人才、使校園的氛圍更多元而推動，方式為採用各高中「推薦保送」方式辦理單獨招生，給予城鄉高中平等之機會；每一所高中可推薦一名符合清華設定之在校成績條件、且通過大學學科能力測驗檢定標準的應屆畢業生，清華則以高中在校成績及學測級分分發比序後，公告錄取，不需甄試。2006年清華首度實施此計畫的結果，於2007年3月放榜，來自全臺150所高中的學生共150名獲得錄取。其中的32所高中，分別屬於16個縣市，這些學校在過去四年來不曾有畢業生進入清華就讀；有10個縣市內的平均家庭收入，遠低於臺灣的平均家庭收入。這些數字，說明了繁星計畫對於平衡城鄉差距、以及資源分配不均的現象，起著調整和改善的作用，清華也能藉此培養更多不同面向的人才，使校園更加多元化。為幫助家境清寒學生專心致力於學業，清大設有「繁星獎學金」；於繁星新生入學之前舉辦「 繁星啟航營」，並有專屬導師協助新生儘快融入校園生活與學習環境。根據清華繁星錄取生之追蹤分析發現，繁星學生入學後之學習表現，不亞於其他入學管道學生，甚至有更突出之表現，清華確實也達到招收優秀學生、培養優秀人才的目的。
2006年清華繁星計畫公告後，新穎之招生理念獲得各界高度認同，教育部呼籲其他「發展國際一流大學及頂尖研究中心計畫」（五年五百億計畫）及「獎勵大學教學卓越計畫」之獲選學校加入此計畫。從2006年試辦4年以來，繁星計畫對於導引學生就近入學、推動高中就學社區化、促進城鄉教育均衡發展以及豐富大學校園多元文化等方面，都有顯著成效。2010年教育部正式以繁星計畫取代現行的「學校推薦」甄選入學，更名為「繁星推薦」。招生沿用繁星計畫各高中「推薦保送」方式辦理，臺灣各大學均可參加「繁星推薦」甄選入學，招生名額大幅擴增，對偏鄉高中、社區高中之優質學生提供更佳的升學機會。
自2013年陳力俊校長任內起，為進一步協助社經地位相對弱勢、資源較為缺乏，但具有潛力的學生，能有機會進入清華接受教育，清華於102學年度大學甄選入學個人申請，增設「旭日組」招生，以更細膩的方式照顧弱勢。
旭日組招生的意義象徵「暗夜已盡，旭日東昇」，希望能給予社經地位弱勢，但具有強烈學習熱忱的學生一個機會，透過書面審查及個人面談，全方位聆聽學生在資源相對不足情形下的成長歷程與學習動機，優先錄取在逆境中積極向上的低收入戶學生。也配合辦理旭日獎學金，藉由旭日計畫、繁星計畫、申請入學、指考分發、特殊選才、單獨招生等管道進入本校就讀的大學部學生，若符合經濟弱勢條件、特殊境遇家庭子女，以及與相關學業條件，將可申請每年十萬元獎學金，至多4年，經委員會審定後核發，讓經濟弱勢生就讀期間可安心就學。
自2013年迄今，旭日計畫招生成果為：102學年度錄取8名；103學年度錄取8名；104學年度錄取15名；105學年度錄取25名；106學年度錄取40名；107學年度錄取140名。
「拾穗計畫」為清華於2015年賀陳弘校長任內首度推行的特殊選才計畫，清華是全台灣第一所以特殊選才為招生管道之一的學校。拾穗計畫招生目的為──讓無法經現行招生管道入學，或透過現行招生管道入學相對不利，但具特殊才能、特殊優良行為，或逆境向上之生命經驗，且具強烈學習熱誠、符合清華選才需求之學生，有機會到清華就讀。參與拾穗計畫的學生不需要通過學測考試，藉由校內甄選申請管道，使大學選才更多元化，並帶著教改理念，賀陳弘校長曾表示：「我們設計特殊選才制度，讓1%不一樣的學生有機會進入清華。大學有責任，測試社會接受改變的底線。」
歷年拾穗計畫招生成果：104學年度招收10名，占大一新生名額比率0.66%；105學年度招收16名，占大一新生名額比率1.04%；106學年度招收30名，占大一新生名額比率1.47%；107學年度招收53名，占大一新生名額比率2.69%；108學年度招生59名，占大一新生名額比率2.99%。
清華自2015年首辦特殊選才「拾穗計畫」，為了符合這些特殊入學之學生的需求，在2018年擬定「學士班實驗教育方案」，讓學生能提出自己獨特的大學規畫。
實驗方案的修業內容包括一般課堂學習、跨校修課、非典型課堂課程(自主專題實作等)、校外各機構實習，與國際交換學習，鼓勵學生跨領域、跨場域、跨區域學習，除仍得修習校訂的28個必修學分之外，幾乎沒有其他限制，在實驗教育計畫書上，學生必須自己思考、規畫課程，主動找老師討論、申請資源，並說明所規畫的課程與專題的相關性、學分數等。實驗教育方案強調由學生與輔導小組討論課程規畫、訂定畢業專題，再經由學校設立的學習審議小組審議，協助學生更聚焦規畫學習內容，學校也為每個實驗學生設學習輔導小組，由1位校內專任教師擔任主責老師，另有2至4位校內外的教師或業師加入小組，陪學生走過修業期 ，而校方也設計了輔導及退場機制，若實驗生不適應這套模式，可與輔導小組討論後回到原來考上的系所，入學時不分系的學生，則可回到其大二分流的系所。
2019年开办的將星計畫全名「清華學院學士班（將星計畫）」，是清大與國防部合辦的單獨招生。每年錄取10名，包括陸、海、空軍各2名，及資通電軍4名。將星生進入清大後，大一不分系，大二再依其興趣分流到電機、資工、材料、經濟、人社、教育等系。求學4年期間學雜費全免，可領每月1萬2千元生活費及每學期5千元的書籍費，畢業後以少尉任官，起薪近5萬元。且所有將星生不論軍種，未來只要通過體檢，都可接受飛行官訓練。未來還將安排學生到歐美頂尖軍校交換一個學期，開拓視野，與國外軍事生交流，並學習最新的軍事科技。  2021年正積極籌設學士後醫學系與附屬醫院，以及半導體研究學院最快2022年春季班入学。