拜仁慕尼黑2012至2013赛季
拜仁慕尼黑足球會於是該足球俱樂部所參與的第144个足球賽季，同時也是球隊自1965年從升至德國足球甲級聯賽所连续參與的第48次頂級賽季。這次賽季由尤普·海因克斯擔任拜仁慕尼黑足球會主教練，並在賽季開始前陸續簽下了湯姆·施塔克、米切尔·魏泽尔、謝爾丹·沙基里、丹特、克勞迪奧·皮薩羅和馬里奧·曼祖基奇等人，而当德國足球甲級聯賽开赛一個禮拜后又在轉會窗截至之前與哈維·馬丁內斯簽約，以補足原本以巴斯蒂安·史汪斯泰格為主的中場戰力。除了新簽下的球員以及原本就加盟球隊的法蘭克·里貝里、阿揚·羅本和馬里歐·戈梅茲、菲利普·拉姆、曼努埃爾·諾伊爾、熱羅姆·博阿滕與托尼·克羅斯等著名明星球員，使得拜仁慕尼黑足球會成為在歐洲足球球隊中有著豐厚儲備能量的球隊。在賽季開始後不久拜仁慕尼黑足球會便取下9連勝，而在賽季結束後分別奪下德國足球甲級聯賽、歐洲冠軍聯賽與德國足協盃冠軍而成為三冠王球隊。這使得拜仁慕尼黑足球會成為德國第一支三冠王足球球隊外，同時也是在過去5個賽季中繼巴塞罗那與国际米兰取得此項榮譽的球隊。
杰尔丹·沙奇里、克劳迪奥·皮萨罗、汤姆·施塔克、丹特、马里奥·曼祖基奇、米切尔·魏泽尔、卢卡斯·雷德尔以及哈维·马丁内斯在夏季转会至拜仁慕尼黑。其中哈维·马丁内斯的转会费价值4000万欧元，创造了德甲历史上的最高转会费。离开拜仁的则有宇佐美贵史、布雷诺、鲁文·扎特尔迈尔、伊维卡·奥利奇和达尼耶尔·普拉尼奇，此外有汉斯-约尔格·布特退役，以及尼尔斯·彼得森被租借至云达不来梅。布特在7月1日被任命为拜仁慕尼黑青年队的负责人，但他却在8月7日离开这一岗位。在8月9日成为新的继任者。7月2日，俱乐部宣布马蒂亚斯·萨默尔取代担当体育总监，尤普·海因克斯相信2012-13赛季的阵容比前一个赛季的阵容更为强大。
拜仁在7月3日开始季前训练。主席卡尔-海因茨·鲁梅尼格表示，本赛季的首要任务是夺取德甲冠军。在季前友谊赛中，拜仁曾相继战胜翁特哈兴、、特伦蒂诺XI和凯泽斯劳滕，也曾不敌那不勒斯。拜仁还参加了季前的一些锦标赛，并分别夺得英利杯、奥迪俱乐部杯和南部柏龙杯冠军，但在仅以第三名完赛。
季前赛一直持续至八月。拜仁以对阵凯泽斯劳滕的一场热身赛胜利开启了该月份的征程。然后在德国电信杯半决赛中，拜仁于8月4日通过点球大战不敌云达不来梅，并于8月5日在季军争夺战中击败汉堡。拜仁在本赛季的首场正式比赛是8月12日对阵多特蒙德的德国超级杯。凭借马里奥·曼祖基奇和托马斯·穆勒的入球，拜仁以2比1获胜。多特蒙德则由罗伯特·莱万多夫斯基射入一球。德国超级杯就此成为拜仁在新赛季夺得的首项锦标。在随后的友谊赛中，拜仁于8月15日以3比1击败，然后迎来的首轮赛事，于8月20日对阵雅恩雷根斯堡。拜仁以4比0顺利晋级，其中曼朱基齐射入两球，沙奇里和皮萨罗则各有一球入账。8月25日，德甲揭幕，拜仁在首轮比赛中以3比0战胜菲尔特。他们的入球来自于穆勒和曼祖基奇，对手托馬斯·克萊恩的乌龙球则将比分定格在3比0。拜仁在第一轮比赛过后便占据了积分榜首位。8月29日，卡尔·霍普夫纳作为拜仁股份公司的监事会副主席，宣布因健康原因将在2012年12月31日离开俱乐部。霍普夫纳是在1982年10月见到俱乐部刊登于《南德意志报》的招聘广告后开始申请俱乐部的总经理职位。他于1983年1月入职，并在同年7月成为常务董事。欧洲冠军联赛的小组赛阶段抽签在8月30日举行，拜仁被抽中与巴伦西亚、里尔和鲍里索夫同组。
9月2日对阵斯图加特的德甲是九月的首场比赛，拜仁以6比1大胜。入球分别来自穆勒、托尼·克罗斯、路易斯·古斯塔沃、曼朱基齐和巴斯蒂安·施魏因斯泰格。其中穆勒梅开二度，-{zh-hans:马丁·哈尼克;zh-hk:馬田·夏歷;zh-tw:馬丁·哈尼克;}-则射入斯图加特的唯一入球。拜仁以两连胜继续排名积分榜首。面对美因茨05的比赛在9月15日进行，拜仁以3比1获胜。曼祖基奇、施魏因斯泰格和克罗斯为拜仁入球，美因茨05的入球则来自亞當·扎萊。拜仁接着于9月19日在欧洲冠军联赛面对巴伦西亚，并以2比1取胜。入球队员为施魏因斯泰格和克罗斯。拜仁在9月22日对阵沙尔克04，凭借克罗斯和穆勒的入球，他们以2比0获胜。三日后，拜仁又依靠施魏因斯泰格的入球和曼祖基奇的梅开二度，以3比0击败沃尔夫斯堡。九月的最后一场比赛是在29日对阵云达不来梅，拜仁以2比0胜出，入球者为古斯塔沃及曼祖基奇。
拜仁于10月2日在欧洲冠军联赛面对鲍里索夫，却遭遇了近9场比赛中的首场失利。
拜仁于10月6日对阵霍芬海姆。
拜仁于10月20日对阵杜塞尔多夫。
拜仁于10月23日对阵里尔。
拜仁于10月28日对阵勒沃库森。
拜仁于10月31日对阵凯泽斯劳滕。
拜仁于11月3日对阵汉堡。
拜仁于11月7日对阵里尔。
拜仁于11月10日对阵法兰克福。
拜仁于11月17日对阵纽伦堡。
拜仁于11月20日对阵巴伦西亚。
拜仁于11月24日对阵汉诺威96。
拜仁于11月28日对阵弗赖堡。
拜仁于12月1日对阵多特蒙德。
拜仁于12月5日对阵鲍里索夫。
拜仁于12月8日对阵奥格斯堡。
拜仁于12月14日对阵门兴格拉德巴赫。
拜仁于12月18日对阵奥格斯堡。
欧洲冠军联赛的八分之一决赛抽签在12月20日举行。 结果拜仁抽中面对英超俱乐部阿森纳。
拜仁于1月3日前往卡塔尔开启冬季拉练。 在冬歇期期间，拜仁先后战胜了-{zh-hans:莱科维亚; zh-cn:莱赫维亚; zh-hk:歷基韋亞;}-、沙尔克04、巴塞尔和翁特哈兴。1月16日，佩普·瓜迪奥拉被宣布为拜仁慕尼黑的新任主教练。他将在6月26日，即开启季前训练前接替尤普·海因克斯的职位。1月19日，拜仁以2比0战胜菲尔特开始了下半赛季的征程。入球者为梅开二度的曼祖基奇。 翌日，拜仁又在一场友谊赛中击败亚琛。一月份的比赛以27日对阵斯图加特的德甲而告终。拜仁凭借曼祖基奇和穆勒的入球以2比0获胜。
二月的比赛始于2日对阵美因茨05的联赛。拜仁以3比0获胜，入球者为曼祖基奇和梅开二度的穆勒。拜仁接着于2月9日面对沙尔克04。凭借着大卫·阿拉巴的梅开二度，以及施魏因斯泰格和马里奥·戈麦斯的入球，拜仁取得4比0的大胜。然后拜仁在2月15日以2比0战胜沃尔夫斯堡。入球者为曼祖基奇和阿尔扬·罗本。2月19日，拜仁在欧洲冠军联赛十六强的首回合比赛中对阵阿森纳。凭借着克罗斯、穆勒和曼祖基奇的入球，拜仁以3比1获胜。为阿森纳取得入球的则是卢卡斯·波多尔斯基。回到联赛后，拜仁于2月23日以6比1大胜云达不来梅。入球队员分别来自罗本、哈维·马丁内斯、戈麦斯和弗兰克·里贝里，其中戈麦斯独中两元，对方的西奥多·格布雷·塞拉西也送出一记乌龙球。-{zh-hans:凯文·德布劳内;zh-hk:奇雲·迪布尼;zh-tw:凱文·德布勞内;}-则为不来梅射入挽回颜面的一球。二月的收官之战是2月27日对阵多特蒙德的德国杯四分之一决赛。拜仁凭借罗本的入球以1比0获胜并晋级。
三月的首场比赛是3日对阵霍芬海姆的德甲。得益于戈麦斯射入的全场唯一入球，拜仁以1比0小胜，并就此创造了连续583分钟不失球的联赛新纪录 3月9日，拜仁面对杜塞尔多夫，并以3比2获胜。穆勒、里贝里和热罗姆·博阿滕分别为拜仁建功。杜塞尔多夫的入球则来自和。在3月13日对阵阿森纳的欧冠十六强次回合比赛中，对手依靠-{zh-cn:奥利韦尔·吉鲁;zh-hk:奧利華·基奧特;zh-tw:奧利弗·吉魯;}-和-{zh-hans:劳伦·科斯切尔尼;zh-hk:羅倫·哥斯尼;zh-tw:勞倫·科斯切爾尼;}-的入球以2比0获胜。但拜仁仍然依靠客场进球制优势晋级。欧冠的四分之一决赛抽签在3月15日举行，拜仁抽中的对手为尤文图斯。在3月16日面对勒沃库森的联赛中，拜仁以2比1获胜。双方的入球队员分别为戈麦斯和-{zh-hans:西蒙·罗尔费斯;zh-hk:西蒙·路菲斯;zh-tw:西蒙·羅爾費斯;}-，而对方的菲利普·-{zh-hans:沃尔沙伊德;zh-hk:禾爾舒捷特;zh-tw:沃爾沙伊德;}-则为拜仁献上一记乌龙球。三月的最后一场比赛是30日对阵汉堡的联赛，拜仁以9比2狂胜对手。沙奇里、施魏因斯泰格、皮萨罗、罗本和里贝里分别为拜仁建功，其中皮萨罗独中四元和罗本梅开二度。汉堡的入球则来自-{zh-hans:杰弗里·布鲁马;zh-hk:謝菲·布馬;zh-tw:傑弗里·布魯馬;}-和海科·-{zh-hans:韦斯特曼;zh-hk:韋斯達文;zh-tw:韋斯特曼;}-。
4日对阵尤文图斯的欧冠四分之一决赛首回合开启了拜仁的四月征程。凭借阿拉巴和穆勒的入球，拜仁以2比0轻取对手。其中阿拉巴的入球是在开场尚不足1分钟内完成。在比赛中，克罗斯的外展肌撕裂，并在第16分钟被罗本换下。拜仁接着在4月6日的第28轮联赛面对法兰克福，他们以1比0获胜。这场胜利也意味着拜仁以创纪录的最短时间夺得德甲冠军。古斯塔沃领到了个人的第五张黄牌，使得他在第29轮对阵纽伦堡的比赛中停赛。对阵尤文图斯的次回合比赛在4月10日举行。曼祖基奇和皮萨罗的入球使得拜仁以相同的比分再次战胜对手。随着拜仁晋级，历史上首次有两支德国俱乐部出现在欧冠半决赛。曼祖基奇在比赛早段领到的一张争议黄牌使他必须缺席半决赛首回合。欧冠半决赛的抽签在4月12日举行，拜仁抽中的对手为巴塞罗那。拜仁在4月13日面对纽伦堡。比赛中，埃姆雷·詹首发完成了他的德甲首秀。沙奇里则在第71分钟被皮埃尔·霍伊别尔替换上场，后者也顺利完成德甲首秀。同时，霍伊别尔还以17岁251天的年龄，打破了阿拉巴17岁255天的记录，成为拜仁历史上最年轻的德甲出场球员。凭借博阿滕、戈麦斯、拉芬拿和沙奇里的入球，拜仁以4比0获胜。德国杯方面，拜仁在4月16日举行的半决赛以6比1轻取沃尔夫斯堡。曼祖基奇、罗本、沙奇里和戈麦斯分别为拜仁建功，其中戈麦斯在9分钟内完成帽子戏法。-{zh-hans:迭戈;zh-hant:迭戈;zh-hk:迪亞高;zh-tw:迪亞哥;zh-mo:迪亞高;}-则射入沃尔夫斯堡的唯一入球。4月20日，拜仁在对阵汉诺威96的联赛中再以6比1大胜。拜仁的入球来自里贝里、戈麦斯和皮萨罗，其中戈麦斯和皮萨罗均有两球入账。凭借这场胜利，拜仁追平了多特蒙德所创造的单季积81分的纪录，并打破了单赛季26场胜利的最高胜场纪录。4月23日，拜仁宣布成功签入马里奥·格策。他们激活了这名球员价值3700万欧元的最低解约金条款，迫使多特蒙德必须放人。对阵巴塞罗那的欧冠半决赛首回合于4月23日举行，凭借戈麦斯、罗本的入球和穆勒的独中两元，拜仁以4比0取胜。媒体批评当值主裁判、匈牙利人-{zh-hans:维克托·考绍伊; zh-hk:域坨·卡斯沙爾;}-对-{zh-hans:赫拉德·皮克;zh-hk:謝拉特·碧基;zh-tw:杰拉德·皮奎;}-在第15分钟、-{zh-hans:阿莱克西斯·桑切斯;zh-hk:阿歷斯·山齊士;zh-tw:阿萊克西斯·桑切斯;}-在第32分钟的禁区内犯规未予判罚，并允许戈麦斯的越位入球生效。四月的最后一场比赛是27日对阵弗赖堡的联赛，拜仁依靠沙奇里的入球以1比0小胜。伴随着这场胜利，拜仁以积84分刷新了德甲的单季最高积分记录。
五月的首场比赛是1日对阵巴塞罗那的欧冠半决赛次回合。对方球员-{zh-hans:塞尔希奥·布斯克茨;zh-hant:塞爾希奧·布斯克斯;zh-hk:沙治奧·布斯基斯;zh-tw:塞爾吉奧·布斯克茲;}-、-{zh-hans:哈维尔·马斯切拉诺;zh-hk:查維亞·馬斯查蘭奴;zh-tw:哈維爾·馬斯切拉諾;zh-mo:查維亞·馬斯卓蘭奴;}-、卡莱斯·-{zh-hans:普约尔;zh-hk:佩奧爾;zh-tw:普約爾;}-和-{zh-hans:埃里克·阿比达尔;zh-hk:艾力·艾比度;zh-tw:艾力克·阿比達;}-均因伤缺阵，头牌利昂内尔·-{zh-hans:梅西; zh-hk:美斯; zh-tw:梅西;}-也未参加比赛。曼朱基齐从停赛中恢复并取代了戈麦斯的位置，老将丹尼尔·范比滕则顶替了身患感冒的丹特。得益于罗本和穆勒的入球，以及-{zh-hans:皮克;zh-hk:碧基;zh-tw:皮奎;}-的乌龙球，拜仁以3比0取胜。拉姆、施魏因斯泰格、哈维·马丁内斯、古斯塔沃、丹特和戈麦斯均仅身背一面黄牌，得以参加2013年欧洲冠军联赛决赛。拜仁接着在5月4日于德甲面对多特蒙德，比赛以1比1平局收场。-{zh-cn:凯文·格罗斯克罗伊茨; zh-hk:奇雲·哥斯基奧斯;}-和戈麦斯分别为各自球队建功。拉芬拿则领到第二黄牌被罚下场。他最终无缘参加余下的两场德甲比赛。
5月6日，在拜仁慕尼黑股份公司的监事会定期会议中，拜仁协会主席兼拜仁股份公司董事长乌利·赫内斯提出临时辞职。监事会决定拒绝赫内斯的辞呈。拜仁慕尼黑宣布与监事会成员卡尔-海因茨·鲁梅尼格和安德烈亚斯·容格续签合同，其中鲁梅尼格获得一份期至2016年12月30日的三年合同，而容格则获得一份期至2016年6月30日的两年合同。此外，拜仁还宣布约尔格·瓦克尔将在2013年7月1日加入监事会。拜仁于5月11日对阵奥格斯堡。凭借穆勒、沙奇里和古斯塔沃的入球，他们以3比0获胜。拜仁在本赛季德甲的最后一场比赛是5月18日对阵门兴格拉德巴赫。拜仁以4比3获胜。为拜仁建功的分别是马丁内斯、罗本和梅开二度的里贝里。馬丁·施特蘭茨爾、-{zh-hans:迈克·汉克;zh-hk:米克·漢基;zh-tw:邁克·漢克;}-和-{zh-hans:霍瓦尔·努尔特韦特;zh-hk:哈華德·諾特維迪;zh-tw:哈瓦德·諾德維特;}-则代表门兴格拉德巴赫入球。对阵多特蒙德的欧冠决赛在5月25日举行，拜仁以2比1获胜，他们由曼祖基奇率先入球，尽管多特蒙德的-{zh-hans:伊尔卡伊·京多安;zh-hk:伊基·根度簡;zh-tw:伊爾卡伊·京多安;}-迅速扳平比分，但罗本在终场前的绝杀还是确保拜仁获得冠军。赛后，拜仁在伦敦的酒店举行了一个盛大派对。派对包括一个1800人的自助餐和延长营业至凌晨5点的酒吧。评估拜仁此时的价值达到8.6亿美元，超过曼联成为榜首。随后，对阵斯图加特的德国杯决赛在6月1日举行，拜仁凭借穆勒的入球和戈麦斯的梅开二度以3比2获胜。-{zh-hans:马丁·哈尼克;zh-hk:馬田·夏歷;zh-tw:馬丁·哈尼克;}-也代表斯图加特独中两元。
巴西足协坚持要求丹特及古斯塔沃在当地时间6月1日16:00前赶赴巴西国家队的训练营报到。训练营是为备战2013年洲際國家盃。然而拜仁对阵斯图加特的德国杯决赛恰好于6月1日举行。巴西足协扬言将开除两位球员，倘若他们没有在规定的时间内报到。根据国际足联的章程，俱乐部必须让球员在赛事开赛前14天赶赴国家队报到。拜仁发出“礼节性”的信函请求让球员参加决赛，但这遭到了巴西足协“礼节性”的拒绝。拜仁试图与巴西足协达成“友好的解决方案”却以失败告终。拜仁CEO鲁梅尼格对国际足联、巴西足协和德国足协发表指责。德国足协则对巴西足协发表指责。路易斯·菲利佩·-{zh-hans:斯科拉里; zh-hk:史高拉利; zh-tw:斯科拉里;}-表示拜仁也存在过错，因为巴西足协声称已提前5日、10日和15日去信要求放人，并宣称它们在提前15日的通知中是如何“原本愿意谈判”。皇家西班牙足协则没有对哈维·马丁内斯强制执行有关规则，使得这名球员得以顺利参加德国杯决赛。
拜仁在本赛季打破或追平了30项联赛纪录。