明朝治藏歷史
明朝治藏歷史是指朱元璋1368年建明朝於南京，至1644年清兵入關，於北京建立清朝前這期間內與西藏的關係史。
明朝對藏政策主要形式為洪武年間在藏內設置羈縻性質的都司、衛所等軍政機構，封授當地僧俗首領擔任官員，永樂至正德以冊封僧俗首領為主，受冊封者定期朝貢，明朝則給予豐厚回賜。該段歷史具體時間始於洪武五年（1372年）元攝帝師喃加巴藏卜受封，終於崇禎三年（1630年）烏思藏僧人三旦多只等十五人入朝班貢，歷200餘年。有明一代，元朝扶持的薩迦政權勢力逐漸衰微，噶舉派的帕木竹巴政權大體掌握了藏中的政治大權，後期格魯派勢力在固始汗的扶持下不斷坐大，西藏內部各宗派勢力競相發展而鮮有明朝參與。明朝治藏政策常被當代中國學者概括為「多封眾建、因俗以治」，屬於因地制宜的管理模式。明朝朝野所繪地圖常將西藏畫在明朝之外。學者對明朝是否完全统治西藏、明朝对于西藏的统治程度有不同的看法和爭議。爭議部分來自兩種互相衝突的觀點。天朝不能與外國平等交往，凡是外地來使朝貢，天子予以封賞，認為這是政權表示臣服於中國。實際上這種朝貢是以高明的收買換取忠誠。而藏人則忽視朝貢的臣服含義，不認為供施關係代表喪失主權。這兩種觀點的爭議延續至今。
明朝朝野所繪地圖常將西藏畫在明朝之外。據明朝官修《大明一統志》圖敘：「天命統一華夷，幅員之廣，東盡遼左，西極流沙，南越海表，北抵沙漠，四極八表，靡不來庭，而疆理之制，則以京畿府州直隸六部，天下分為十三布政司，...以統諸府州縣，而都司、衛所則錯置於其間，以為防禦。...而邊陲之地，都司、衛所及宣慰、招討、宣撫、安撫等司，與夫四夷受官封、執臣禮者，皆以次具載於志焉。」文中「西極流沙」的流沙河是明朝與西藏的界河。該書卷八十九將西藏（書中稱「西蕃」）列為朝貢、封官的「外夷」（在「華夷」之分中並非「華夏」），不設行政性質的布政司，而設軍事性質的都司、宣慰司及招討司。利瑪竇獻給明神宗的世界地圖經多次重繪，於萬曆三十年（1602年）由太僕寺少卿李之藻出資刊行，稱為《坤輿萬國全圖》。圖中「西番」與「朵甘思」的顏色與大明不同，表明屬於不同國家。17世紀初《王泮題識輿地圖朝鮮摹繪增補本》是明朝地圖，西藏（包括安多、康區）不劃入疆域。《三才圖會》中收錄的《山海輿地全圖》是世界地圖，將「西番」列為「大明國」之外的國家。當時歐洲人所繪中國或亞洲地圖也將西藏畫在中國之外。如荷蘭彼得·凡·德爾於1680年出版與法國首席皇家地理學家於1700年及1706年出版的地圖。
清朝開始有些地圖把西藏畫入中國。據清朝征服西藏後官修《明史·志第十六》記載，明朝疆域「计明初封略，东起朝鲜，西据吐番，南包安南，北距大碛，东西一万一千七百五十里，南北一万零九百四里。自成祖弃大宁，徙东胜，宣宗迁开平於独石，世宗时复弃哈密、河套，则东起辽海，西至嘉峪，南至琼、崖，北抵云、朔，东西万余里，南北万里。」文中「西據吐番」的「吐番」是宋、元、明等時期的史籍中對青藏高原及當地土著的慣稱。
1368年，朱元璋在南京稱帝，建立明朝。1369年，朱元璋派遣官員持詔諭前往西藏，著令各部歸順明朝。詔書說到朱元璋「命將率師，悉平海內。臣民推戴為天下主，國號大明，建元洪武。式我前王之道，用康黎庶。惟爾吐蕃，邦居西土，今中國一統，恐尚未聞，故茲詔示」。同年，明太祖還派遣陝西丞宣布政司的官員許允德前往藏地進行第二次詔諭，「令各族酋長舉故官，至京授職」。
1370年，明朝軍隊攻取洮、岷等州，並進克元朝的吐蕃等處宣慰使司都元帥府（脫思麻宣慰司）的治所河州，吐蕃宣慰使何鎖南普遂降明。元順帝病歿，在此情勢下原先忠於元朝的西北藏族首領陸續歸附明朝。1371年，西藏的世襲封主鎮西武靖王卜納剌（元世祖忽必烈第七子西平王奧魯赤的五世孫）攜帶元朝頒發的印信，率吐蕃諸部首領到南京向明朝納款，表示歸順。明朝收繳了元朝授予他們的印信，分別授予他們為河州衛指揮同知、靖南衛指揮同知，並准予其子孫世襲。屬下官吏也授千戶、所鎮撫等職。1372年，故元攝帝師喃加巴藏卜帶領六十多人赴南京朝見明太祖，表示歸降。喃加巴藏卜被明太祖封為「熾盛佛寶國師」，賜玉印一顆。他還先後兩次向明朝舉薦故元的藏族舊官一百多人，皆被授予各級官職。
1373年正月，當時控制烏思藏大部分地區的帕木竹巴第悉（帕竹政權首領的稱號）釋迦堅贊（即《明太祖實錄》所記的「故元灌頂國師章陽沙加」）在被明太祖封他為灌頂國師後，遣使入朝，貢以佛像、佛書、舍利。在此之後，藏族地方的大小僧俗首領，也紛紛來到首都南京請封，明朝一律授給他們以新的官職和封號。如指揮同知、僉事、宣慰使同知、副使、元帥、招討、萬戶等職，以及國師等封號。對於新封的藏人僧俗首領，明太祖要求他們「自今為官者，務遵朝廷之法，撫安一方；為僧者，務敦化導之誠，率民為善，以共樂太平」。
中國當代學者對於明朝對藏政策的主流見解是「因俗以治」、「多封眾建」、「羈縻懷柔」。
明太祖為此下詔曉諭諸部：
按明朝官制，軍職流官分八等，即：都督及同知、僉事，都指揮使、同知、僉事，正、副留守；而土官則分九等，即：指揮使及同知、僉事，衛、所鎮撫，正、副千戶，百戶，試百戶。自都督府、都指揮司以下各司，包括土司，必須嚴格執行命令，「各統其官兵及其部落，以聽徵調、守衛、朝貢、保塞之令。」但土司之管有如僉事、鎮撫、千戶、百戶等皆無歲祿。各衛所的統轄大權一般都由漢族流官掌握，土官只是「為之佐」。但這一情況在1437年二月發生改變，明朝開始給陝西河州、洮州、西寧等八衛土官發放俸祿。
總的來說，整個安多藏區都在陝西布政司轄區之內。明朝在安多藏區設置的衛所在明朝一代前後期變更較大，以下是明初在安多設置的衛所：除了設置衛所，明朝還封派皇族子弟到安多藏區就藩，如1391年明太祖封十八子莊王朱楩於岷州（今甘肅省境），1392年封十四子肅王朱楧於甘州（今甘肅省境）。1395年正月丙午，河州衛指揮使寧正兵助封於秦州的秦王朱樉征洮州（今甘肅省境）叛番，由此可知分封的藩王是直接插手管理甘肅事務的。
明朝還在宗教寺院周圍設置衛戍。比如岷州衛的大崇教寺，因其地位顯赫，岷州衛動用其七分之一的士卒予以護寺。
明朝先後派許允德、克新、鞏哥鎖南等前往朵甘、烏思藏招撫。1370年，康區的故元鎮西府的鎮西武靖王主動向明朝左副將軍鄧愈請降，後入覲。1371年十月，明朝在康區設置朵甘衛指揮使司。1371年二月，故元攝帝師喃加巴藏卜帶領大批故元舊官來朝進貢，乞授職名。於是其人分別授予了朵甘衛的指揮、僉事及其下屬機構的宣慰使同知、副使、元帥、招討、萬戶等官職。其中，鎖南兀即爾被任命為朵甘衛指揮僉事。同年十月，在送交故元司徒印後，鎖南兀即爾被升任為衛指揮同知。1373年，朵甘衛和烏思藏衛一同升為行都指揮使司，隸屬於西安行都指揮使司，以鎖南兀即爾、管招兀即爾為都指揮同知。同年十二月，增置朵甘思宣慰司及諸招討司、萬戶府、千戶所，以賞竺監藏等七人為朵甘都指揮同知。
在明朝任命當地政教首領行使官府職能的同時，明朝還掌握對當地官員升遷、承襲權力過程中的的審批、允准權。如1430年五月，朵甘都司都指揮使撒力加監藏上奏朝廷，稱年老乞致仕，請求以其子星吉兒監藏代職，明廷乃從其請；1441年四月，朵甘都司大小首領派使入朝，上奏都司內部的人事變更事宜。等等。1372年四月，河州衛向明廷進言，「[[烏思藏]]怕木竹巴故元灌頂國師章陽沙加人所信服」，建議朝廷招撫之。中書省將此建議上報，得到明太祖的允准，「詔章陽沙加仍灌頂國師之號」。章陽沙加即烏思藏帕竹政權的第二任第悉[[釋迦堅贊]]，這次封賞賜印是明朝建立一來首次冊封烏思藏首領。1373年正月，章陽沙加即遣鎖南藏卜向明朝朝貢。同年二月，烏思藏的故元攝帝師喃加巴藏卜亦親自入朝，受封為熾盛佛寶國師，他同時薦舉的六十名故元舊官皆被授以官職。
1374年七月，明朝置西安行都指揮使司於河州，韋正為都指揮使，總轄河州、朵甘、烏思藏三衛。從烏思藏返京的使者向明太祖報告，「各官公勤乃職，軍民樂業」，因此下詔，「尚慮彼方地廣民稠，不立重鎮治之，何以宣佈恩威。茲命立西安行都指揮使司於河州，其朵甘、烏思藏亦升為行都指揮使司，頒授銀印，仍賜各官衣物。」
1375年，明朝再置[[俄力思軍民萬戶府]]、[[帕木竹巴萬戶府]]，[[烏思藏籠答千戶所]]，設官十三人。此處的[[俄力思]]即為今西藏自治區[[阿里地區]]。中國學者稱由此明朝完成了全藏的招撫任務。但是史伯嶺指出，表面上看來韋正當時是烏思藏最有政治權力的人物，但是西藏史料中從沒提過他。而且朵甘與烏思藏衛的官署並不在當地，而是遠在河州與西寧，並無統治當地的能力。
明太祖時期對西藏僧俗人員的分封，大部分是應求封者的自我介紹而封授的。從數量上看，基本上是以俗官為主而僧官為輔；從官職品級上看，此時期封賜的等級也普遍較低，最高僅為「大國師」和「灌頂國師」。在藏地封授的官職、封號大多是沿用元朝的舊稱。
永樂年間，明朝在藏區建立一套僧官制度，僧官分教王、西天佛子、大國師、國師、禪師、都綱、喇嘛等，每級依受封者的身份、地位進行分封。如明成祖即位的當年，即派侯顯前往烏思藏迎請噶瑪噶舉派的第五世噶瑪巴活佛，後封其為「大寶法王」。1406年，明成祖又遣使入藏封烏思藏帕竹第五任第悉紮巴堅贊為「闡化王」。明封八王中的兩大法王、五大教王都是永樂時期封授的。此外，明成祖依僧官制度還進行了大規模的分封，由此明朝對藏區的各政教勢力由上至下各級首領的分封基本完成。
明朝所封的各教王在襲職嗣位元需要請示明廷的批准。如1423年，為了審查第五世噶瑪巴活佛的轉世靈童，番僧班丹紮失受明朝委派前往藏地工布的咱日山，「審查大寶法王的呼畢勒罕」，這是中央王朝審查藏傳佛教教派[[活佛|轉世靈童]]的最早記錄。
巴臥·祖拉陳瓦的《[[賢者喜宴]]》中記載：「依皇帝（指明成祖）本人思維，動用軍隊，仿行元代故事，將烏思藏納入法治」，但大寶法王認為佛法應「自在自如宣揚，不便派遣漢軍前往」。面對明成祖意在仿效元代薩迦派故事，獨尊噶瑪派，大寶法王認為「倘教派獨留一家，眾生不服，如聽隨其各所信奉，則必感動佛發慈悲心矣，故聽任各自奉行各自之教法，斯乃適當。」
帕竹政權在藏內創立「宗本」制度，明代史籍中稱「宗」為「寨」。永樂時期，藏內各宗已經為各大家族所把持，因此明朝就勢對各宗本予以分封。如1413年二月置烏思藏衛牛兒宗寨，即為帕竹政權的乃東宗。1416年五月置領思奔寨，即仁蚌宗，所封官員喃葛加爾卜即為宗本南喀傑波。
因為元末戰亂，藏內的驛站一度陷於廢弛狀態。因此，1407年三月明成祖下令命帕木竹巴闡化王，「同護教王、贊善王、必力瓦國師、川卜千戶所、必里、朵甘、隴答王（三）衛，川藏等族，複置驛站，以通西域之使」。諭令發佈後，明成祖同時「勅（陝西行都司）都指揮同知劉昭、何銘等往西番、朵甘、烏思藏等處，設立站赤，撫安軍民」。1414年又派遣中官楊三保齎勅往諭闡化王、闡教王、護教王、贊善王以及諸處大小頭目，「令所轄地方驛站有未復舊者，悉如舊設置，以通使命」。驛站恢復之初，明廷為減輕驛站馬匹困難，諭令以徵發之馬或軍馬撥給差民使用。同時在旅途中發放「道里費」，以解民困。經過多年的努力，藏內的驛站全部得到恢復，「自是道路畢通，使者往還數萬里，無虞寇盜矣」。
1373年，烏思藏帕木竹巴的第悉章陽沙迦應招遣使進京，同時故元攝帝師喃加巴藏卜亦親率使團來朝，向明廷薦舉六十名藏地首領。在此情勢下，明太祖依照內地衛所制度在藏區設立了烏思藏衛指揮使司和朵甘衛指揮使司，同時設置宣慰司二、元帥府一、招討司四、萬戶府十三、千戶所四。烏思藏衛指揮使司轄區為衛、藏地區。依明制，設置衛指揮使一員，正三品；衛指揮同知二員，從三品；指揮僉事四員，正四品；衛鎮撫二員，從五品。故元國公南哥思丹八亦監藏為首任指揮同知。
1374年七月，明朝升烏思藏、朵甘二衛為行都指揮使司，頒授銀印，賜各官衣物，明太祖詔諭「勸賞者，國家之大法；報效者，臣子所當為。宜體朕心，益遵紀律」，並任命管招兀即爾為烏思藏都指揮同知。依明制，都指揮使司設都指揮一，正二品；都指揮同知二，從二品；都指揮僉事，正三品。
1374年十二月，熾盛佛寶國師喃加巴藏卜和朵甘行都指揮同知鎖南兀即爾等遣使進京朝貢，上奏第二批舉薦人員名單，請求授予賞竺堅藏等五十六人官職。明太祖「以西番地廣，人獷悍，欲分其勢而殺其力，使不為患，故來者輒授官」。在1465年以前，西藏僧俗首領來京朝貢沒有嚴格的限定，大致是一歲一貢，或兩歲一貢。如《明會典》記載：「西番，古吐蕃地。[[元]]時為郡縣，[[洪武]]初因其舊職。於是烏思藏有闡教王、闡化王、輔教王、贊善王統化番民，又有護教王、大乘法王、大寶法王凡七王，俱賜銀印，令必歲或間歲朝貢。」《明史·西域傳》亦記載：「（贊善王）初，入貢無定期，自永樂迄正統，或間歲一來，或一歲再至。」
由於明朝對來貢的藏族首領不僅在政治上給予優遇，經濟上也回賜豐厚的賞物，由藏地進京朝貢的使臣越來越多，沿途地方不堪重負。同時有假冒濫充的朝貢者。1440年八月，明廷下了第一道免番僧進京朝貢的赦諭。於1442年第一次發現有假冒貢使的現象。
為了整飭朝貢制度，明憲宗即位後，於1465年規定烏思藏番僧三年一貢，並下發一道勅諭給帕竹第悉闡化王，曰：「爾父祖以來，世修職貢。[[洪武]]年間，三年一貢，來朝不過三、四十人，往來道途亦守禮法。近年以來，增加漸多，絡繹不絕，恃朝廷柔遠之意，所至騷擾。察其所以，多有四川等處不逞之途，買求印信，冒作番僧，貪圖財利，壞爾聲名。爾居遐僻，何由得知？茲特勅諭爾，今後仍照洪武舊例，三年一貢，自成化三年為始。所遣之人必須本類，不許過多。所給文書，鈐以王印，其餘國師、禪師等印，皆不許行。惟襲替謝恩者不在三年之限。仍戒來人，毋得夾帶投托之人。朝廷已勅經過關隘官司盤詰辨驗，如有偽冒，就便拿問。如此，則事有定規，人無冒濫，庶不失爾敬事朝廷之意。」
1466年，明朝對朵甘亦規定「如烏思藏例，三年一貢」。1470年四月，明朝再對朝貢人數進行規定，「（烏思藏）每王遣使百人，多不過百五十人，有四川路入，國師以下不許貢」。
西藏進京朝貢人數越來越多，「宣德、正統間，番僧入貢，不過三四十人。天順間遂至二三千人。到成化年間，僅闡化王所遣的貢使一次就多達四百六十多人。1499年，「長河西及烏思藏一時並貢，使者至二千八百人」。
明朝後來對西藏僧俗首領採取了定期、定員、定道、定制的進京朝貢模式，規定「國師以下不許貢」，烏思藏貢使必須由[[雅安|雅州]]入的規定。1609年四月，因「番人混冒，方物濫惡，所奉勅書洗補可疑，而通使歲誘為奸」，明朝革除了[[烏思藏]]大乘法王、大寶法王、護教王、長河西、董卜韓胡等八番的入貢資格，只許闡教王、輔教王入貢。
朝貢路線： [[File:Hongwu1.jpg|thumb|right|洪武皇帝朱元璋]] 「以馬為賦」是以茶換馬的制度。這一制度肇始於1383年。該年正月，明太祖勅諭[[松州 (唐朝)|松州]]（今[[四川省]][[松潘縣]]）指揮僉事耿忠，「西番之民歸服已久，而未嘗責其貢賦，聞其地多[[馬]]，宜計其地之多寡以出賦，如三千戶則三戶共岀馬一匹，四千戶則四戶共岀馬一匹，定為土賦，庶使其知尊君守上奉朝廷之禮也。」四月，耿忠回報：「臣所轄松潘等處安撫各族長官司，宜以其戶口之數，量其民力，歲令納馬置驛，而籍其民充驛夫，以供徭役。」1392年五月，尚膳太監而聶等至河州召必里等族輸馬，「諸族皆感恩意，爭出馬以獻」，得馬340餘匹，這是有記錄的首次征差發馬。同年八月，[[西宁市|西寧衛]]土酋亦令真奔進言，「諸番族皆野居散聚，射獵為食，請歲輸馬二百匹為常賦。」皇帝表示應准。
1393年二月，明朝為各藏族部落「特製金銅信符，族頒一符。遇有使者徵發，比對相合，始許承命。否者，械至京師，罪之。」「又制[[金]][[銅]]信符，命曹國公李景隆賫入番，與諸番要約，篆文上曰：‘皇帝聖旨’，左曰‘和當差發’，右曰‘不信者斬’。」
依金銅信符制，明朝三年一次下徵發馬，該制度用以完善、強化「以馬充賦」的賦稅制度。至1449年，金牌制停止使用，改派行人視察茶政。1488年，再罷行人巡茶，改由御史視察。1497年，經都御史楊一清奏請，金牌制度再次恢復，但此時民間私販盛行，官方交換已經不能和明初等量齊觀。
[[File:Haiwan bingcha.jpg|thumb|[[普洱茶]]是茶馬互市的重要交易內容]] [[茶馬互市]]是起始於[[唐]][[宋]]時期的一種漢藏之間古老貿易形式。
由於藏地需要大量的[[茶葉]]，明朝便執行以茶葉換馬匹的政策。而後，明朝逐漸發展出「以茶制番」的目的。如[[正德 (明朝)|正德]]年間都御史[[楊一清]]在上疏中奏：「以馬為科差，以茶為酬價，使之遠夷（為）臣民，不敢背叛。如不得茶，則病且死，以是羈縻之，實賢於數萬甲兵，此制西番以控北夷之上策也。」1536年，巡茶御史[[劉良卿]]亦奏：「諸蕃之飲食，莫切於吾茶，得之則生，不得則死。故嚴法以禁之，易馬以酬之。禁之而使彼有所畏，酬之而使彼有所慕。此所以制番人之死命，壯中國之藩籬，斷匈奴之右臂者。」藏人求茶之心可從其遣使來報中看出端詳，如烏思藏輔教王使臣沙加星吉等奏：「為乞討食茶事，臣烏思藏地方，僧眾數多，食茶甚少，今來進貢，專討食茶。望朝廷可憐見，給予食茶勘合，前去湖廣等處支茶應用，並乞與官船腳力等項回還便益。」
茶馬貿易機構：[[安多]]地區盛產馬匹，明朝就此先後在當地設置五個茶馬司，如：明初官制，茶馬司有大使一人，秩正九品，副使一人，秩從九品。洪武中期，升其秩為正六、正七品。
明朝除在藏族地區設置衛所外，還利用藏傳佛教在藏族地區的深遠影響，大力封授各派宗教首領和人士，推行僧綱制度，通過宗教加強明朝對廣大藏區的影響。當時藏傳佛教在西藏派系頗多，除控制衛藏政權的帕竹噶舉派以外，尚有勢力遍及川、康、衛藏的[[噶玛噶举派]]，以及勢力仍強的[[薩迦派]]和後來居上的[[格魯派]]等。明朝治藏政策的核心被概括為「多封眾建，因俗以治」。「多封眾建」與「因俗以治」互為表裏、相互支撐，即「多封眾建」為表，則「因俗以治」作為其政情民俗的基礎和政策理念為裏；若「因俗以治」為表，則「多封眾建」作為其政策措施的支撐為裏。在明朝對這些藏傳佛教的宗教首領人士的封授中，以永樂年間、宣德年間加封的「三大法王」和闡化王、護教王、贊善王、輔教王、闡教王等五個王最為重要，其次為大國師、國師及禪師等。明朝在藏區所封的「王」則與一般意義的「王」有所不同。在藏區所封的「王」既是掌管一方的地方首領，又往往具有佛教僧人的身份；既有掌管一方地區行政的世俗的王的成分，也與宗教的法王相類似的成分。其中「三大法王」的封號，均由師徒或轉世相傳承，無須再聽朝命。而五王及灌頂國師等，其職號的承襲、替代都必須由承襲者遣使或親自入朝申請承襲，上繳原頒印信、誥敕，旨准後方頒賜新的印信、誥敕，至此完成襲職手續。重要首領，特別是諸王的承襲一般均由朝廷遣專使往封。 明成祖不但封藏傳佛教領袖為大寶法王、大乘法王等，而且對他們的弟子也封給大國師、國師的名號。從明成祖到景泰帝、成化帝，明朝封了許多藏族僧人為大國師、國師等，並賜給封誥和印章，明朝所封授的大國師、國師等職，不僅僅是一個名號，而且還有品級。一般大國師為秩四品，國師為五品，禪師為六品，他們在京城，還給以俸祿，所以當時留居北京的藏傳佛教僧人很多，其開支全由光祿寺供應。1435年明宣宗去世，明英宗即位，年方九歲。當時明朝為節約開支，曾下令減少在京居留的藏族僧人。據統計當時在北京各寺院中僅官府認為應當減去的藏族僧人即達1100多人。明英宗掌政後仍然大量封授藏族僧人，在憲宗成化、孝宗弘治、武宗正德年間更達到高峰，憲宗成化末年有時一次升職授職的藏族僧人達數十人之多，明武宗還專門在西華門內修建了一座「豹房」，同藏族僧人一起誦經、研習經典，以致於有記載說明武宗通曉梵（藏）語，他還自封為大慶法王，自己給自己頒發了一枚「定為天字一號」的「大慶法王西天覺道圓明自在大定慧佛」的金印，自稱是噶瑪巴在漢地的轉世。1515年明武宗派太監劉允到西藏齎送番供等物，迎請[[第八世噶瑪巴·米覺多傑|第八世噶瑪巴]]。劉允這次出使，動員大批人力財力，嚴重擾亂地方，耗費巨大，結果被第八世噶瑪巴拒絕。由於明世宗崇信道教，排斥藏傳佛教，到明世宗嘉靖時藏族僧人在北京的活動才進入低潮。
[[File:Karmapa5.jpg|thumb|得銀協巴（1384年–1415年）]] [[File:Daci Fawang.PNG|thumb|right|明朝授予大慈法王的唐卡]] 大寶法王
「大寶法王」是[[噶瑪噶舉派]]的[[第五世噶瑪巴·德新謝巴|第五世噶瑪巴得銀協巴]]。他在[[康區]]一帶巡遊傳法，很有名聲，於是明成祖在他正式即位的當年「遣司禮監少監侯顯齎書、幣往烏思藏，征尚師哈立麻。蓋上在藩邸時，素聞其道行卓異，至是遣人征之」。噶瑪巴得知消息後，於1406年從[[楚布寺]]出發。當年七月，噶瑪巴在康區噶瑪寺見到了[[侯顯]]等使者，領受詔書，即隨侯顯等人一道前往[[南京]]。他們經[[青海]]一路於十一月抵河州。然後經[[陝西]]、[[河南]]、[[安徽]]，乘船入[[長江]]，於1407年[[藏曆]]正月抵達南京，駐錫靈谷寺。噶瑪巴先率領僧眾在靈谷寺設十二壇城為明太祖夫婦作超度法事十四天，後在皇宮中設壇為明成祖傳授了無量灌頂，講經譯經。明成祖對噶瑪巴活佛表現了非常的倚重和尊崇，授予了他超過明太祖對藏傳佛教首領加封的慣例的封號。
1407年三月丁已，明成祖封得銀協巴為「萬行具足十方最勝圓覺妙智慈善普應佑國演教如來大寶法王西天大善自在佛」，命他領天下釋教，賜印、誥及金、銀、鈔、彩幣、織金珠袈裟、金銀器皿、鞍馬，並封其徒孛隆逋瓦桑兒加領真為「灌頂圓修淨慧大國師」、高日瓦領禪伯為「灌頂通悟弘濟大國師」、果欒羅葛羅監藏巴里藏卜為「灌頂弘智淨戒大國師」，並設盛宴於華蓋殿，宴請噶瑪巴師徒。噶瑪巴得銀協巴在[[南京]]、[[五臺山]]等地停留達一年多，於1408年四月辭歸，明成祖賜給他白金、彩幣、佛像等物，派中官護送。
大乘法王
「大乘法王」是[[薩迦派]]都卻拉章的貢噶紮西，其為故元帝師貢噶堅贊貝桑布之孫，元封「中興釋教大元國師」大元卻吉堅贊之子。薩迦勢力在藏中失勢之後，遷到達倉宗。貢噶紮西幼年學佛，後到前、後藏朝佛巡禮，講經說法，成為薩迦款氏家族成員在宗教活動方面的代表人物，聲名遠揚。明成祖兩次遣使召他進京。年屆六十的貢噶紮西不聽旁人勸阻，決心進京，其於1412年四月由薩迦寺動身，1413年二月抵達南京。他在多次講論佛法，明成祖封其為「萬行圓融妙法最勝真如慧智弘慈廣濟護國演教正覺大乘法王西天上善金剛普應大光明佛」，賜給管領僧眾、護持釋迦牟尼教法之詔書及金印。此後，他離京去往[[北京]]、[[五臺山]]等地，然後再回到南京，為明成祖傳授灌頂及經咒、護持等。明成祖賜其銀質喜金剛像、大威德像、鈴、金剛杵等大量法器，再有大藏經、供器、僧帽、袈裟等，以及各種珍寶、金器、銀器、綢緞、大小帳幕、茶葉、牛、馬、騾等財物。貢噶紮西於1414年正月離開朝廷，十二月回到薩迦寺。
大慈法王
明朝時期格魯派興起，[[釋迦也失]]代表其師[[宗喀巴]]應詔入朝，被封為「大慈法王」。明成祖通過帕竹第悉、內鄔宗本等人的介紹和明朝入藏使者的報告而注意到格魯派的創始人宗喀巴。明成祖二次派人入藏召宗喀巴進京，但召宗喀巴其門下弟子代他入朝進京。
釋迦也失同入藏使者侯顯等啟程前往內地。其經山南、康區、理塘，抵達成都附近。當一行人進入[[成都]]府城內時，接到明成祖的詔書，曰：「今聞上師你已離西土，不顧途中風雨烈日寒暑，漸次已行數萬里之遙，前來此處，故朕心甚悅，難以言說。現今複遣人於途中贈禮迎接，以示緣起，以表朕心。」1413年11月，釋迦也失等到達北京城附近時，受到九門提督等官員的歡迎。在大小官員的接送下，釋迦也失下駐海音寺（或法音寺），再次受到明成祖的詔諭，詔諭表示明成祖十分高興釋迦也失「不計數萬里之路，跋山涉水，觸風冒雨，歷盡艱辛前來，」考慮到其「遠途而來，身體疲乏」，諭示釋迦也失面聖時可免行禮。明成祖在大善殿接見了釋迦也失，還為他舉行了盛大的接風宴會，並多次給予賞賜。1415年4月，明成祖「命尚師釋迦也失為妙覺圓通慧慈普應顯教灌頂弘善西天佛子大國師，賜之誥命。」釋迦也失在京期間，用醫藥和傳授灌頂的辦法治好了明成祖的重病。
此外，還在[[五臺山]]建了六座寺院，這些寺院按照藏傳佛教格魯派的修行次第修習佛法。1416年，釋迦也失回到[[拉薩]]後，建造了拉薩三大寺之一的[[色拉寺]]。1425年5月，釋迦也失再次進京（此時明朝已經遷都北京），在北京居住十餘年，期間宣德皇帝封其為「萬行妙明真如上勝清淨般若弘照普慧輔國顯教至善大慈法王西天正覺如來自在大圓通佛」。釋迦也失於1435年在返藏途中去世，享壽82歲。
『闡化王』
1406年三月壬辰，明成祖派遣使者齎詔封烏思藏帕木竹巴吉剌思巴監藏巴里藏卜（即紮巴堅贊）為灌頂國師闡化王，賜紐玉印、誥命，仍賜白金五百兩、綺□、衣三襲、錦綺五十匹、彩絹百匹、茶二百斤。以後帕竹政權的歷任第悉，都擁有闡化王的封號。
『贊善王』
1406年，明成祖令智光和尚出使烏思藏，靈藏僧人著思巴兒監藏遣使隨智光來朝，被封為灌頂國師。第二年又被封為贊善王，並賜金印、誥命。贊善王的轄地在今天四川德格一帶。
『護教王』
1406年，館覺地方的政教首領宗巴斡即南哥巴藏卜遣使入貢，被永樂皇帝封為灌頂國師，並賜以誥命。1407年，宗巴斡即南哥巴藏卜派遣使者入朝謝封，又被明成祖封為護教王，並賜金印、誥命，仍享有國師稱號。館覺地方即是今天昌都地區的貢覺縣。
『輔教王』
1413年，明成祖封思達藏地方（今西藏日喀則地區的吉隆縣境內）薩迦派首領南渴烈思巴（按《薩迦世系史》，他是款氏家族成員，全名為南喀勒貝洛追堅贊貝桑布）為輔教王，並賜誥印、彩幣。此後貢使雙方往來不絕，楊三保、侯顯都曾被派往頒賜，而輔教王轄下的許多僧人也都前來朝貢，有的還留在北京任職。
『闡教王』
1406年，止貢地方的止貢噶舉首領鎖南藏卜派使者朝貢，成祖封鎖南藏卜為灌頂國師，賜予衣服、錢幣等優厚的賞賜。1413年，成祖又加封他為灌頂慈慧淨戒大國師，並封其僧人領真巴兒吉監藏為闡教王，賜以印誥、彩幣，命其管理止貢地方。
[[File:Tsongkhapa.jpg|thumb|宗喀巴的画像]]
西藏學者主張封號是一種外交儀式，並不表示明朝統治西藏。達賴喇嘛也給蒙古統治者或清朝皇帝封號。1578年（明[[萬曆]]年間），[[第三世達賴喇嘛]]索南嘉措與[[俺答汗]]會面，俺答汗為索南嘉錯上尊號為「聖識一切瓦齊爾達喇達賴喇嘛」，為[[觀音菩薩]]的化身，此為達賴喇嘛一詞的出處。索南嘉措為俺答汗上尊號為「轉千金法輪咱克喇瓦爾第徹辰汗」，承認他為[[成吉思汗]]的化身。1637年（明[[崇禎]]年間），[[第五世達賴喇嘛]]贈予[[固始汗]]「丹增卻傑」（[[威利轉寫]]：Tenzin Choekyi Gyalpo，意為「執教法王」）的封號。
国际上對明朝实质统治西藏与否或其實際性質方面存在不同的理解，常见的争议如下：
美国[[藏学]]家[[特瑞尔·威利]]因《[[明史]]》中未有對[[格魯派]]創始人[[宗喀巴]]及其黃帽派的記載，而認為作為明朝官方歷史的《明史》受到了[[審查]]，從而扭曲了歷史真面目。而且宗喀巴所創立的格魯派，一直到1642年消滅了第悉藏巴政權後才奪取到藏中的權力，而明朝在兩年之後的1644年即被[[李自成]]推翻。
藏學家認為明朝皇帝和喇嘛之間的見面是「[[施主]]與[[僧人]]」之間的進貢，而不只是政治上下屬向上級[[朝貢]]的關係。他還認為納貢的項目是佛教用品，而這彰示了「宗教實質的關係」。[[夏格巴·旺秋德丹|夏格巴]]在其《[[西藏政治史]]》裡面也說「在蒙古成吉思汗和俺答汗時代，漢人的明朝和滿洲人的清朝，西藏和中國在施主和僧侶的關係上合作得很好」。[[政治協商會議|政協]]副主席[[阿沛·阿旺晋美]]在研究過該書引用藏文的歷史資料或漢文的歷史資料後，認為夏格巴對史料完全採取了斷章取義、取其所需的態度。認為明朝沒有行使對西藏的任何直接的政治控制，納貢的內容幾乎都具有宗教特色。Patricia Ann Berger認為[[永樂皇帝]]封授喇嘛主要是想重新確立元朝建立者[[忽必烈]]與其帝師[[八思巴]]之間建立的中藏關係。認為西藏喇嘛之所以造訪明廷，多是為了加強喇嘛的大批富貴的隨眾同明朝商人官員之間的貿易。高馬士認為明朝對西藏執行一種[[自由放任|放任主義]]政策並限制朝貢喇嘛的隨員的數目，西藏人保持對明朝的納貢關係是因為他們從皇帝施主那獲得財富和權力。也認為西藏人急迫地答應明朝的邀請，是因為他們所收穫的禮物的價值要遠大於朝貢物品的本身。
王家偉和尼瑪堅贊認為儘管明朝皇帝確曾向西藏藏傳佛教的喇嘛經常施捨財物，然而中國皇帝和西藏法王除了保持宗教上的檀越關係之外，更有著政治上的上下主屬關係。[[明太祖]]于1374年7月便設西安行都指揮使司於河州，升河州衛指揮使韋正為都指揮使，總轄河州、朵甘、烏思藏三衛。後來又升朵甘、烏思藏二衛為行都指揮使司。當年12月熾盛佛寶國師喃加巴藏卜及朵甘行都指揮同知鎖南兀即兒等遣使來朝，又奏舉土官賞竺監藏等五十六人。明太祖遂設朵甘宣慰司一、招討司六、萬戶府四、千戶所十七，以賞竺監藏等分別為指揮同知、宣慰司使、招討司官、萬戶、千戶等。而除了在藏族地區設置衛所，委任藏族僧俗首領外，明朝還大力封授各派宗教首領和人士，推行僧綱制度，通過宗教加強明朝對廣大藏區的影響。明封「三大法王」和「五大教王」教派囊括當時藏中從東部到西部最有實力的幾大派系，即[[後藏]]的[[薩迦]]，前藏的[[西藏歷史#帕竹(乃東)政權|帕竹]]和[[止貢]]、在[[前藏]]部分地區和[[西康]]大部分地區擁有相當影響的[[噶玛噶举派|噶瑪噶舉]]；以及在帕竹政權扶植下異軍突起的[[格魯派]]。
需要指出的是，明初設置的朵甘、烏斯藏等衛所都屬于[[羈縻]]性質，即封賜原地方世襲首領為衛所的官員，和內地行省的流官制不是同類性質的，除了原有的政權外，并沒有實際的衛所機構存在。永樂時期，衛所已退居次席，而代之以對三法王、五教王為首的僧俗首領的大量冊封。明朝規定只有朱姓才可以封王，對於其他民族的政治首領，在他們表示臣服明朝的條件下，也可以被封為王。而明朝封給藏人首領的王號，既有掌管一方地區行政得世俗的王的成份，也有與宗教的法王相類似的成份。三法王和五教王中的三位都在烏斯藏，而明朝在烏斯藏是否設過僧綱司，學術界對此尚無研究，但從史料記載看，明朝在烏斯藏地區有封授都綱的官職給一些藏轉佛教的僧人。但是由於僧綱司往往依附于法王、教王之下，加上明朝中葉以后烏斯藏地區各地方勢力和教派勢力的鬥爭日益尖銳，僧綱司在烏斯藏地區實際上難以發揮明朝政府所期望的管束僧眾的作用，因此烏斯藏的僧綱司系統在藏漢文史料中都缺乏詳細的記載。
[[File:Altan Khan.jpg|thumb|「順義王」——俺答汗]] [[File:朵兒只唱圖記.png|thumb|明神宗賜予三世達賴喇嘛的「朵兒只唱圖記」]]
[[米凱爾·范·瓦爾特·范·普拉赫]]認為除了「喇嘛-施主」的關係之外，明朝對西藏沒有多少興趣，並把西藏看成一個西方獨立的王國。杜齊卻認為雖然「除了少數幾個皇帝之外，明朝都沒有像元朝那樣尊崇佛教，但這並不使他們放棄對西藏的主權，相反地他們繼續主張擁有蒙古在西藏時的主權。」在明朝建立的第二年，明太祖[[朱元璋]]就兩次派員持詔諭前往西藏，著令西藏各部歸順明朝，「令各族酋長舉故官，至京授職」。洪武三年四月，明太祖在冊封諸皇子為藩王時，因是年藏區尚未歸附，故而推遲了奉賞功臣的典禮。高淑芬和陳慶英由此認為明太祖對爭取藏族地區是非常重視的。1371年，世襲西藏的元鎮西武靖王卜納剌就攜帶元朝頒發的印信，到南京向明朝納款，表示歸順。明朝在收繳了元朝授予他的印信后，任命他為靖南衛指揮同知。同時，故元攝帝師朗喀貝桑波亦於洪武六年到南京入朝歸順，其被封為熾盛佛寶國師，賜予玉印一顆。于此，明太祖下詔諭曰：
王家偉和尼瑪堅贊因此認為「開國不久的[[明朝]]，通過下發詔諭、接受入朝、封授官職等方式，很快就使[[元朝]]時期[[藏區]]各地的政教首領和官員們臣服，從而把全國藏區置於朝廷的統一治理之下，對原先歸屬元朝的西藏地方取得了統治權。」史伯嶺则認為“明朝第一位皇帝发送给西藏人的通知明朝已经建立的信件，类似于由他发送给其他外国的信件，证明了明朝统治者并不认为西藏是‘中国’的；在里面，皇帝将西藏当作一个非常獨立於中国的国家。”《劍橋中國明代史》也认为没有什么证据能证明其后的永乐皇帝曾有试图（像元朝那样）重建对西藏的统治的意图。Smith认为明朝早期或許希望與西藏建立像元朝一樣的政治關係，但實際上明朝除了希望西藏能夠對蒙古施加影響之外，對西藏並沒有太多興趣。而且西藏与蒙古持续保持下来的关系要比明朝与西藏的关系在政治上要強得多。
明末時期，[[蒙古人]]在西藏勢力日漸強大。第一世、二世[[達賴喇嘛]]被認為沒有和明朝有任何聯繫。而這前兩世達賴喇嘛是自[[索南嘉措]]於1578年被蒙古[[俺答汗]]尊為「聖識一切瓦齊爾達喇達賴喇嘛」而成為「第三世達賴喇嘛」之後，死後由索南嘉措追封為第一世、二世達賴喇嘛的。高馬士因此認為明朝皇帝對西藏態勢表現出「明顯的漠不關心」。他還認為明朝對西藏缺少關心使得蒙古人能抓住機會重掌西藏和填充其政治真空。則說，在大量蒙古人轉為信仰藏傳佛教之後，中國人只是帶著興趣觀看著，但幾乎沒有中國人篤信[[藏傳佛教]]。
然而尊索南嘉措為「達賴喇嘛」的俺答汗，其已於1571年臣服於明朝，被授予「順義王」封號。（但Smith認為俺答汗仍處於明朝的統治範圍之外。）俺答汗同時勸索南嘉措向明朝納貢，於是索南嘉措寫信給明朝內閣首輔[[張居正]]請求准予確立朝貢關係，信中稱：「我保佑皇上，晝夜念經…我與皇上和大臣晝夜念經，祝贊天下太平，是我的好心。」1579年8月至9月，明朝准許三世達賴喇嘛定期入貢，並於1587年十月定卯，授予[[索南嘉措|三世達賴喇嘛]]「朵兒只唱」（Dorjechang，意為「金剛持」）的名號，給予敕命圖書，並邀請他到北京，但是三世達賴喇嘛接受邀請後於1588年在去往北京的途中去世。（也有回西藏的途中的說法）湯瑪斯·賴爾德則記載索南嘉措在知曉[[萬曆]]皇帝邀他進京後，因早前的責任而對皇帝的邀請表示婉拒，儘管當時他離北京只有400公里。
1616年三月，萬曆皇帝派專人進藏，封四世達賴喇嘛[[云丹嘉措|索南羅追]]以「普持金剛佛」的封號及印信，並邀請其去漢地。冊封使團在[[哲蚌寺]]的大經堂受到接待。索南羅追為建立緣起，接受了邀請。此外，《四世達賴喇嘛傳》也記載：「火龍年（1616年）三月，明朝萬曆皇帝派來了以索南羅追為首的許多漢人，賜予達賴喇嘛‘普持金剛佛’的封號、印信和僧官制服。他們將達賴喇嘛迎請到[[哲蚌寺]]的甲吉康（漢人公所）裡…轉達了明朝皇帝邀請他去漢地的旨意。達賴喇嘛為締結善緣，接受了邀請。」但在他真正準備動身前，1616年12月四世達賴喇嘛在哲蚌寺突然圓寂，時年28歲。當時傳言說四世達賴喇嘛是被藏巴汗彭錯南傑派人害死的，因為其二者之間的權力鬥爭。
[[File:Gushi Khan Fresco.jpg|thumb|幫助五世達賴喇嘛奪取藏中政權的固始汗]] [[特瑞爾·威利]]認為明朝對西藏眾多喇嘛毫無鑒別的「封王」不應視為於元朝對之的分封，因為蒙古人扶持的[[薩迦政權]]在明朝建立之前已經被[[帕竹政權]]推翻了。Helmut Hoffman認為明朝通過週期性的特使派遣和對喇嘛首領進行名義上的封授來對西藏維持表面上的統治，但並沒有實際介入西藏的治理。並認為明朝授予在西藏已經取得權力的藏人以封號，這僅僅是對政治現實的承認。[[黎吉生]]則認為明朝沒有對西藏統治家族（[[帕木竹巴]]、[[仁蚌巴]]、[[藏巴汗]]等政權）的承繼有控制權。杜齊亦認為「漢族對西藏的[[主權]]只限於從法律上批准和承認那些事實上已存在的特權和權力。明朝自然想更換前代的封文，他們幾乎認可了所有元代的封文，承認了高官顯貴們的世襲權。只有少數例子他們猶疑不決過或者乾脆拒絕任命某些合法的職位佔有者。」[[谭其骧]]教授認為“明朝对东北辽东边墙以外，对青藏高原的统治是很薄弱的，只是一种[[羁縻]]关系而已，真正的统治是谈不上的。我们要说老实话，现在把明朝对西藏关系来比之于元朝对西藏的关系，清朝对西藏的关系，这是不行的，是远远赶不上的。”
明朝對西藏政權更迭没有任何反应。第一任[[闡化王]][[扎巴坚赞 (帕竹)|扎巴堅贊]]手下的大臣[[諾布桑波]]嗣任[[仁蚌宗]]宗本后，就開始大規模擴張仁蚌家族的領地。之后仁蚌家族通過和朗氏家族通婚，逐漸掌握了[[帕竹]]政權的實權，甚至到了能操縱幾任帕竹[[第悉]]廢立的程度。[[諾布桑波]]的父親[[南喀杰波]]曾在1416年被封為領思奔（即仁蚌）行都指揮使司的都指揮僉事，諾布桑波承襲了這一職務，但之后直到仁蚌巴覆滅的一百余年中，仁蚌家族掌握了前后藏的實際統治權，卻再沒有請求明朝的封賜。而明朝對闡化王的權力和領地被篡奪也毫無辦法，所能做的只是承襲舊制，繼續冊封后續帕竹繼承人為闡化王而已。仁蚌家族在1565年被新崛起的辛廈巴[[辛廈巴|才旦多吉]]擊敗，才旦多吉的孫子[[彭措南杰]]于1618年控制了前后藏，建立了[[藏巴第悉政權]]，以及之后[[彭措南杰]]之子[[丹迥旺波|噶瑪丹迥旺波]]在1642年被蒙古和碩特部的[[固始汗]]擊敗，固始汗擁戴五世達賴喇嘛建立[[甘丹頗章政權]]，也同樣沒有和明朝建立聯繫。
但是，明朝對西藏採取「因俗而治、眾建多封」的辦法。根據明朝的政治制度，西藏政教首領進京朝貢的事務由[[禮部]]負責，重要管理的任免由[[吏部]]負責，更重大的事件則由[[皇帝]]直接處理。徐明旭認為，由於歷史的慣性作用，西藏的僧俗首領都把取得中國皇帝的封賞當做向他人證明其合法性的必要條件。反之，明朝對不承認其權威的首領進行懲罰。例如闡化王[[阿格旺布]]請明朝皇帝敕封，使者到時他已去世，喇嘛們就要求明朝使者將他的「敕文」轉交其子[[阿旺札西札巴]]，違反了明朝規矩。明朝即令[[四川]]巡撫將敕封使者逮捕至京要斬首。後明廷諒使者也是藏人，不懂明朝規矩，改為充軍[[陝西]]。阿旺札西札巴於1518年正式擔任第悉，1563年明朝才敕封為闡化王。而輔教王[[南渴烈思巴]]（[[薩迦派]]首領，[[款氏家族]]成員，全名為南喀勒貝洛追堅贊貝桑布）1456年，[[南渴烈思巴]]派遣使者來朝貢，上陳自己年老，請求以其子[[喃葛堅粲巴]][[藏卜]]代替其位，因此得到皇帝允許，賜以[[誥印]]、金冊、彩幣、[[袈裟]]、法器等。1388年，[[帕竹]]政權灌頂國師[[鎖南札思巴]]噫監藏卜上表稱病，推薦其弟[[吉剌思巴]]監藏巴藏卜代其職，[[明太祖]]亦許之。《明實錄》還記載1431年，鎮守河州（今甘肅境內）都督同知[[劉昭 (明朝)|劉昭]]奏：「羅思囊族西番千戶阿失吉為親弟工噶所殺，而據其地，按問已引服，當斬。」上曰：「殺兄非常罪，斬之。梟其首以徇，使遠人知其法。」羅思囊族是甘肅的藏族部落，金暉因而認為明朝能執掌西藏的執法權。《明史》劉昭列傳並未記載此事。第悉藏巴的[[彭措南杰]]之所以被十世[[噶玛巴]][[第十世噶瑪巴·確映多傑|却英多吉]]指定为前后藏的统治者，亦是因为该黑帽系拥有明朝[[明代宗]]赐予的诏书，诏书规定噶玛巴可以委任适合的人员担任僧俗官职。但也有說法是：[[藏巴汗]]於1618年率兵攻入[[內鄔棟]]王宮，徹底推翻了帕竹政權，正式宣布[[噶瑪噶舉派]]黑帽系第十世法王[[第十世噶瑪巴·確映多傑|卻英多吉]]為第司，將首府設在[[日喀則]]，但實際權力仍控制在[[藏巴汗]]手上。
1413年，大乘法王[[貢噶札西]]進京為爭取[[明成祖]]發佈命令讓[[帕竹政權]]把薩迦大殿交還給[[薩迦派]]掌管。《江孜法王傳》記載：尤其是在這一年（1413年，[[藏曆]]水蛇年），燕王皇帝陛下派侯大人、宋大人為首的五位宣旨大人攜帶…命前藏人（帕竹首領）把薩迦大殿交還給薩迦法座的詔令。1413年5月，明成祖派[[侯顯]]等人從京城出發進藏，以向[[烏思藏]]許多首領傳達旨意，其中帶去了命令帕竹第悉交出薩迦大殿給予原主薩迦派的詔書，12月侯顯等人到達西藏，在頗章孜宣讀詔書，薩迦派舉行了十分隆重的慶典。陳慶英認為此事則反映出明朝中央對西藏政教勢力之間的爭執有決定處理的權力，西藏薩迦派和帕竹派之間長期未能解決的問題是由明朝皇帝發佈詔書才實際解決的。而1407年，明成祖令闡化王與護教王，贊善王及藏區各地首領恢復從[[前藏|前]][[後藏]]到[[河州]]的沿途[[驛站]]。1414年又派宦官[[楊三保]]入藏。「令闡化、護教、贊善三王及川卜、川藏等共修驛站、諸未復者盡復之」。所謂恢復驛站，除了驛站設施的修復外，同時也要令沿途藏區籍民供應徭役。1410年，明成祖發佈上諭對西藏掌握政權的人士和各個教派的首要的高僧大德等僧俗貴族賜予官爵、名號，發給讓他們掌管一方權力的詔書，而且還規定「不遵聖旨，法律絕不寬貸」。[[恰白·次旦平措]]因此認為「在這個基礎上，明朝的歷代皇帝對西藏的政教大事的管理情況可以清楚地反映出來。」但史伯嶺则认为「无论是西藏史料还是中国史料中都没有任何迹象表明这些（被明朝廷封授过的）藏人是代表明廷行使权力或行事的。坦白地说，明朝在西藏并无政治权威 - 明朝并没有在西藏设置任何条例或法令，或是在西藏征税，等等。」
達瓦諾布說中國的共產主義學者認為明朝基本沿用了元朝的舊制去統治藏區，但他認為這項政策在[[安多]]、[[西康|康區]]（即「内藏」）是真的，然而不適用於[[烏思藏]]、[[阿里地区|阿里]]（即「外藏」），這些地區先後是被「三個相繼的民族主義政權」所統治。認為「現在中國用明朝與西藏東部首領的聯盟作為明朝統治了西藏的證據，但事实上在蒙古人離開後明朝并沒有派軍隊代替他們的位置」。
洪武初年，明太祖為安撫應招前來歸附朝貢的藏區各僧俗首領，逐授予他們以各種官職和封號，這些官職大抵有：烏思藏或朵甘思都指揮司同知、指揮僉事、宣慰司使、巡檢司巡檢、招討司官、萬戶、正副十戶、百戶等等。而「五大教王」的贊善、闡教、闡化、輔教四王皆出自藏西的烏思藏。大明成化六年，明朝作出四項規定。第一項便是限制這四王只得三年一貢。[[佐藤長]]亦言到「最早的三大法王其勢力範圍各自佔有東部、中部和西部西藏。明朝一向熟知在此三大地域中最大宗派為准，其設置了三大法王，於其間的小空間配置了五名教王，當是依據當時西藏的現實、瞭解了全部情況後的決策。當我們知道這些教王的封爵幾乎都在永樂時代授予時，對於明成祖關於西藏的政策推行得如何妥當，更加感歎不止了。」
[[File:Chos kun Skyabs.png|thumb|right|400px|明太祖封搠思公失監為俄力思軍民元帥府元帥而下的詔諭]] 1373年，明太祖下詔封搠思公失監為[[俄力思軍民元帥府]]元帥職。[[中央档案馆|中國國家檔案局]]於2008年從檔案中找出15條史料，想要證明中國政府有效管轄西藏七百多年，此詔書是其中明代的兩條史料之一。但是明實錄並未記載此詔書，而是在兩年之後（1375年）才記載成立俄力思軍民元帥府，任命官員。因此搠思公失監於1373年可能並未奉詔。史伯嶺認為，這顯示了這種儀式性的任命並不代表聽命臣服於明朝。
而對於烏思藏的人事任命，明代的歷史典籍中的記錄亦不勝枚舉。如1385年正月丙寅，明太祖授西番班竹兒為烏思藏都指揮使。正月壬午，以烏思藏俺不羅衛指揮使古魯監藏為烏思藏衛俺不羅衛行都指揮使司指揮僉事。1426年十月丙寅，明宣宗升烏思藏公哥兒寨官忍昝巴、札葛爾卜寨官領占巴、頭目昝卜巴俱為都指揮僉事，給賜銀印、誥命。等等。
明朝并未在烏思藏地区驻军，对于明朝在烏思藏地区设置的軍事结构，史伯嶺認為这些「几乎完全只存在于纸面上」。他表示，「明朝为西藏设置的主要行政单位是位于[[河州]]的西安行都指揮使司，但河州位于[[甘肃]]，离烏思藏很远。同时西安行都指揮使（理论上總轄河州、朵甘、烏思藏三衛）韋正之名在任何西藏史料中都無法找到，在中国的史料中也很少提及。很明显这个所謂的行政单位只是對邊疆進行禮節上的統治。因此，明代史料中描述的对藏人的封授并不能认为明朝在西藏拥有实际的政治权力。」《劍橋中國明代史》亦指出：「無論是在經濟領域，還是在政治領域，西藏人都未覺得他們是明朝廷臣民。另外，他們無須中國（明朝）居中調解而維持著與其他國家和民族的關係。」
[[伊佩霞]]認為西藏猶如[[李氏朝鮮|朝鮮]]等明朝的鄰國一樣，對明朝是朝貢體系下的身份，而明朝對之並不設置軍隊。則說「在蒙古軍隊離開西藏後，明朝軍隊沒有替代他們」。王家偉和尼瑪堅贊也說明朝「對西藏地方的治理，雖然也有嚴厲之處，如對犯法的西藏地方官員判罪處刑等，但沒有像元朝那樣派兵攻打西藏以及經常在藏駐紮軍隊等。」達瓦諾布認為明朝致力於應付北方蒙古的威脅，沒有更多的軍事力量來強化它繼承元朝的各片領土主權的主張；相反，明朝以「[[儒家]]式的外交手段」對外進行大量封賞饋賜。史伯嶺則說明朝和西藏之間微妙的關係是最後一次「一個統一的中國不得不處理一個獨立的西藏」，明藏之間邊界存在潛在的軍事衝突，明朝對外政策的西藏部分，其終極目標不是以征服為目標，而是避免任何形式的威脅。
1370年，明軍攻佔河州，次年在當地設立軍事衛所河州衛，任命原吐蕃宣慰使[[何鎖南普]]為衛指揮同知，其子孫世襲其職。1374年，明太祖在河州設置西安行都指揮司，轄區最初包括整個藏區，後專管今[[青海]]東部，[[甘肅]]南部和[[四川]]北部的藏區。在次第平定川西之後，明朝在川西設置茂州、威州、汶州等州縣以流官管理民政，龍州等府以土官管理民政，並設置茂州衛、松州衛、威州衛、洮州衛、岷州衛等管理地方的軍政。1373年，明朝設置朵甘衛。後升朵甘衛為朵甘行都指揮使司，轄區包括今[[青海]]南部、[[西藏]]東部和[[四川]]西部的藏區。而對於[[烏思藏]]和[[阿里地區]]，明朝沒有派駐軍隊，而是派許允德進藏招諭吐蕃十八族歸順，烏思藏攝帝師喃加巴藏卜則於1372年親到南京表示歸順。同年，明太祖朱元璋派員入藏，封帕木政權二代第悉釋迦堅贊為灌頂國師，賜玉印。次年，釋迦堅贊派人朝貢。在此情形下，明朝於1373年設置烏思藏衛，後再升為烏思藏行都指揮使司，轄區包括今西藏大部。1375年，明朝再設立俄力思軍民元帥府，轄區為[[阿里地區]]。由此，元朝的[[烏思藏納里速古魯孫等三路宣慰使司都元帥府]]轄地都劃入明朝轄區。對於明朝沒有在烏思藏派駐軍隊，牙含章則解釋為「當時統治西藏地方的帕竹政權和平地規順了明朝中央政權，‘不勞師旅之征’，後來西藏地方也沒有遭到嚴重的外敵入侵事件，國防始終安全，所以明朝中央政權沒有必要向西藏派駐軍隊。」達瓦諾布則指出[[卫藏]]（烏思藏與阿里）地区100多年处于持续的动荡状态。即使如此，明朝自始至终未向这些地区出兵。相反，「如果是元朝，他们将会对外藏（即卫藏）地区进行军事干涉来保护他们所喜欢的喇嘛政权，或是為了展現他們對一个被征服的地区的政治慾望。」
明初时期，明朝亦數次在[[青海]]、[[四川]]等地的藏区用兵平亂。1373年5月，[[鄧愈]]和皇帝一個養子[[沐英]]受命進行一次懲罰性的討伐，目的在嚴懲拒不承認明朝統治的一位西藏或藏族酋長。討伐軍深入今[[青海湖]]地區，甚至西進遠到[[崑崙山]]。鄧愈捨命地追趕這個酋長和他的徒眾，斬殺了數以千計的人，俘獲了十餘萬頭牲口。沐英也因此被封為[[侯爵]]。1378年11月，已經封侯的沐英再次被任命帶領討伐軍去平定[[西藏]]和[[四川]]的動亂。到了1379年10月，沐英共俘敵3萬名和20萬頭家畜。1390年，四川地區的左軍都督瞿能在藍玉的指揮下同樣被派往征討侵襲四川的藏人。然而，没有证据显示明军曾进入[[卫藏]]地区。達瓦諾布表示，「卫藏地区在长达几乎130年的时间内处于混乱状态，但明朝却未发兵去征服西藏或者向西藏派驻军队。明朝在这期间对西藏的反应是典型的儒家对‘西域’的反应。」
明朝后期，卫藏各种政治势力纷纷联络引入蒙古各部的力量，战乱不休。比如1621年格魯派請來在青海的土默特蒙古軍隊在拉薩打敗第司藏巴的軍隊，噶瑪丹迥旺波繼任第司藏巴后，聯絡在青海的卻圖汗共同對付格魯派，而五世達賴喇嘛和四世班禪共同聯絡在新疆的和碩特蒙古固始汗，最終消滅了第司藏巴和康區的白利土司，統一了藏區。
[[宋代]]以來，漢、藏地區間逐漸形成[[茶馬互市]]關係。[[濮德培]]認為漢地自身不能出產足夠的強壯軍馬，從而需要靠邊疆的衛所維持政府主導的「[[茶葉]]-[[馬匹]]」交易市場。而西藏人也需要大量茶葉，不僅是日常的飲用也同樣用於宗教儀式的活動。明朝政府因此在今甘肅臨夏、天水、臨潭、四川雅安、松潘等漢、藏交界的地區專門設立茶馬司，統一管理茶馬市場。王家偉和尼瑪堅贊因此認為「明代茶馬互市的日趨繁榮，不僅密切了[[藏族|藏]]、[[漢族|漢]]兩族以及藏族與其他兄弟民族之間的經濟關係，也進一步加強了明朝中央政府統轄西藏地方的政治地位。」然而，范·普拉赫認為明朝皇帝只是滿足于同西藏統治者維持友好的關係，並互派外交使團以處理中國對馬匹的急需。《劍橋中國明代史》将永乐年间明朝与西藏的关系归类于明朝的“对外关系”中的，和对蒙古的关系并列。王家偉和尼瑪堅贊反對將藏區派遣來京人員稱為「[[外交]]使團」，因為西藏的烏思藏與朵甘司是明朝中國的兩個轄區，這兩區中的政教首領是受明朝敕封、臣屬於皇帝的官員，他們本人或派員赴京，是中國內部的事，是「內交」而非「外交」。此外，王家偉和尼瑪堅贊還批評范·普拉赫將「進貢回賜」與「茶馬互市」、「徵發馬賦」混為一談，因為明朝獲取所需馬匹的兩個主要途徑，一是「茶馬互市」，一是「徵發馬賦」。茶馬互市，是以茶為報酬換取馬匹；而徵發馬賦，是賦役性質，亦由官府給以一定的酬值。然而明朝對烏思藏地區徵收的賦稅額度很小，常賦每年僅徵取200匹馬匹。明朝政府規劃一定的土地，由藏民專事放牧養馬，到期向政府交納一定數量的馬以領回相應的涼茶和其他生活用品，政府不再征派其他的捐稅。明朝政府還使用「金牌信符」的方式保證茶馬互市中的廉政。「金牌信符」被授予征馬官員和藏民，凡要征馬，必須以符印對驗牌納馬換茶。
有明一代，[[西藏歷史#帕竹(乃東)政權|帕木竹巴政權]]在明代保持著對西藏主要地區的控制權，其首領稱為「[[第巴|第悉]]」（degsi）。帕竹政權第一代第悉是[[絳曲堅贊]]。他元朝時是西藏所封的十三個萬戶長之一，獲皇帝「賜子孫可以世襲之誥敕」。1349年絳曲堅贊派使者到大都朝貢，[[元順帝]]封其為大司徒。絳曲堅贊採取了松贊干布時期的行政規劃，改元朝時的「十三萬戶」為「[[宗 (行政區)|宗]]」（dzong），首領稱「」（dzong dpon）。《劍橋中國明代史》認為「絳曲堅贊的目的是重建[[唐代]]的前[[吐蕃]]王国，重新树立西藏人的[[民族主义]]和消灭蒙古[[宗主权]]的一切痕迹」。范·普拉赫更說絳曲堅贊的志向是通過重置世俗機構以「重建西藏帝國時代的榮耀」、「推廣國家的文化與傳統」。 [[File:灌頂國師闡化王.png|thumb|「灌頂國師闡化王」之封印]] 但在西藏的所有史料中，「絳曲堅贊」一名前面絕大部分都被冠以「[[大司徒仁波切|大司徒]]」或「司徒」的元朝官名，而很少冠以西藏本地的「第悉」官職名。王家偉和尼瑪堅贊因此認為「被中央政府授封的‘大司徒’官職，對他來說，較之西藏地方的‘第悉’官職更為重要，更需經常見諸書文。有了皇帝所封的此一官職名稱，絳曲堅贊的身份大為提高，統治西藏地方更為有力。從這裡也證明了元末朝廷和西藏帕木竹巴王朝之間仍是上下主屬關係。」絳曲堅贊本人亦在遺囑中說道：「過去均受東方皇帝關懷，如果繼續關懷，則應遵從皇帝法令，迎送宣旨之欽差。」王家偉和尼瑪堅贊認為「絳曲堅贊對元朝皇帝的尊崇之情已極為明顯，根本沒有獨立於朝廷之外的意思。」
至[[明朝]]時期，絳曲堅贊的侄子釋迦堅贊世襲為[[西藏歷史#帕竹(乃東)政權|帕木竹巴政權]]的第二代第悉，控制住烏思藏大部分地區。明朝剛一開國，就對西藏最有權力的貴族帕木竹巴給予特殊的優待。明軍1370年攻克河州後，河州衛在瞭解過烏思藏的情形下，向明太祖建議對釋迦堅贊給以封賞，明太祖於是下詔封給他「灌頂國師」之號，並遣使賜玉印及彩緞、表裏。藏文史籍《王統世系水晶明鑒·賢者頸飾》亦記載：大皇帝封章陽大國師為…貢瑪傑波大司徒勤國，賜灌頂國師名位和印信，詔令西藏三區僧俗百姓知曉。而釋迦堅贊則於1373年正月遣使入朝，貢以佛像、佛書、舍利。而公元1406年，明成祖更加敕封第五代第悉札巴堅贊為「灌頂國師闡化王」，賜玉印、白金、誥命、錦帛、巴茶等，命其掌管西藏三個[[卻喀]]的百姓。《王系幻化鑰匙》同時記載：大明皇帝燕王向札巴堅贊頒賜了金印和王的詔書。「闡化王」則是明封五王之首。以後帕竹政權的歷任第悉，都擁有闡化王的封號。明朝還對宗本制度的各「宗本」分授官職。如札巴堅贊屬下的貴族、柳梧宗本南喀桑布、仁蚌宗本南喀傑波，都被明朝封為烏思藏行都指揮使司的都指揮僉事，賜給誥印，使各宗本成為朝廷的命官。
帕竹政權的每一代新舊第悉的換任都向明朝呈請批准，給與敕書，更換信印。帕竹政權每三年需向明朝進貢一次「方物」，其即為交納一定數量的賦稅。1407年，朝廷特諭帕竹政權闡化王吉剌思巴監藏巴里藏卜，會同護教王、贊善王等藏族首領，主持複置驛站事宜，以通使者。同時還派遣陝西行都司都指揮同知等人赴西藏「設立站赤，撫安軍民」。1414年，明朝又遣中官楊三保持諭闡化王及甘、青、川等地藏區大小首領，「令所轄地方，驛站有未復舊者，悉如舊設置，以通使命」。內地與西藏地区的交通驛站經過這樣多次的修復與增設，「自是道路畢通，使臣往還數萬里，元虞盜賊矣」！ 而明朝對藏的影響也體現在於帕木竹巴對西藏官員的職位和薪俸的嚴格分配都仿明制，在各級官員服裝佩戴的詳細規定方面，每個官員都有一種特別及個人的服裝和標誌。
但是，史伯嶺认为「明朝对藏人的封授以及与受封者的交流明显被明朝视为外交事务，这些事务是一個同处理南洋国家事务的外交部门負責的。不能将这些简单的封授宣称为明朝对西藏拥有主权。研究過这些封授事件之後可以清楚看到，封授的接受者在受封前已经在西藏持有权力或影响力。因此，这些封授并未赋予权力，而是承认已有的权力，故这些封授只能被看作是类似于一种時常可見的一个国家对另一个国家的国民封授荣誉、职位或奖励的情况。」《劍橋中國明代史》亦提到「根据西藏的史料，得银协巴在他逗留南京期间曾劝说永乐帝不要试图重建对西藏的统治。没有什么证据能证明永乐帝曾有此意图；一切迹象表明，[[第五世噶瑪巴·德新謝巴|得银协巴]]是作为一个具有巨大实力的宗教人物而被邀请的。」
[[宗喀巴]]是黃帽[[格魯派]]的創始人。1407年，[[明成祖]]遣使邀請宗喀巴前往南京並納貢，但宗喀巴因年老體弱，經不起長途跋涉，加上正忙於修建三大寺，對皇帝的邀請表示婉拒。同時，1408年六月，宗喀巴給明成祖寫了一封回信，請明朝的使者帶回。在這封回信裡，宗喀巴對收到皇帝賜予的大量禮品表示衷心感謝，對皇帝的邀請則予以婉拒，表示：
1413年，明成祖命使者侯顯等再次齎詔入藏召請宗喀巴。宗喀巴對眾使者解釋說「自己去漢地的阻礙大而必要性小」，他並給皇帝寫了說明情況的回信，準備了回贈的禮品，請使者們帶回。因此，「很可能是明朝的使者們想到了請宗喀巴派一名弟子代替他入朝的辦法」，於是侯顯等使者請宗喀巴派一名殊勝弟子前往並得到宗喀巴同意後，釋迦也失遂同侯顯等同行前往內地。1413年11月，宗喀巴親傳弟子釋迦也失作為其師的代表到達北京城附近，永樂帝派人送來聖旨，對釋迦也失「不計數萬里之路，跋山涉水，觸風冒雨，歷盡艱辛前來，」表示十分高興，考慮到上師「遠途而來，身體疲乏」，諭示上師面聖時可免行禮。1415年4月，明成祖「命尚師釋迦也失為妙覺圓通慧慈普應顯教灌頂弘善西天佛子大國師，賜之誥命。」1425年5月釋迦也失再次到北京，在北京居住十餘年，此期間宣德皇帝封他為「萬行妙明真如上勝清淨般若弘照普慧輔國顯教至善大慈法王西天正覺如來自在大圓通佛」。
[[File:Yongle-Emperor1.jpg|thumb|永樂皇帝朱棣]] [[File:Dabao Fawang.png|thumb|大寶法王的封印]] 1403年3月10日，永樂皇帝「遣司禮監少監侯顯齎書、幣往烏思藏，征尚師哈立麻（即噶玛噶举派五世[[噶瑪巴]]活佛，[[第五世噶瑪巴·德新謝巴|得銀協巴]]）。蓋上在藩邸時，素聞其道行卓異，至是遣人征之」。《明代名人傳》記載四世噶瑪巴[[第四世噶瑪巴·若佩多傑|乳必多吉]]曾拒絕洪武皇帝的邀請，但《劍橋中國明代史》記載他應[[洪武皇帝]]的邀請，於1372年至1373年間的冬季抵達南京，乳必多吉四世活佛並擔任抵京教團的教長。陳慶英還記載他是元朝攝帝師喃加巴藏卜向明太祖舉薦元故官六十余人中之一，並被封為「灌頂國師」。得銀協巴獲得消息後，於1406年從[[楚布寺]]出發。當年7月，得銀協巴在康區噶瑪寺見到了侯顯等使者，領受詔書，即隨侯顯等人一道前往南京。1407年4月10日，得銀協巴抵達南京。新近即位的永樂皇帝對噶瑪巴活佛表現了超乎尋常的倚重和尊崇，他行出南京的皇宮來迎接噶瑪巴並且沒有要求噶瑪巴行磕頭之禮。Karma Thinley還記載[[永樂皇帝]]賜噶瑪巴比自己靠左、稍高的上位。Rossabi也記載[[忽必烈]]在佛事活動中，忽必烈坐在一個比西藏法師更低的平臺上。達瓦諾布因此認為永樂皇帝是想跟從蒙古皇帝尊重其西藏[[薩迦]]喇嘛的傳統。
1407年噶瑪巴抵京後，他除了率領僧眾在南京靈谷寺設十二壇城為[[明太祖]]夫婦作超度法事十四天外，還在皇宮中設壇為明成祖傳授無量灌頂，講經譯經。1409年2月，明成祖封得銀協巴為「萬行具足十方最勝圓覺妙智慈善普應佑國演教如來大寶法王西天大善自在佛」，命他領天下[[釋教]]，賜印、誥及金、銀、鈔、彩幣、織金珠袈裟、金銀器皿、鞍馬，並封其徒孛隆逋瓦桑兒加領真為「灌頂圓修淨慧大國師」、高日瓦領禪伯為「灌頂通悟弘濟大國師」、果欒羅葛羅監藏巴里藏卜為「灌頂弘智淨戒大國師」，並設盛宴於華蓋殿，宴請噶瑪巴師徒，以示慶祝。Rossabi記載，在獲得永樂皇帝「法王」的封號之後，得銀協巴還建議皇帝同樣也對藏傳佛教其他教派予以封授。
藏文資料顯示得銀協巴曾勸勉永樂皇帝不要試圖像早先的蒙古人那樣用軍事武力管治西藏。史伯嶺則記載得銀協巴是拒絕了永樂皇帝試圖在明藏之間建立如同元藏之間的聯盟的建議。Thinley還記載永樂皇帝曾計劃派軍隊入藏以強行扶持噶瑪巴至西藏眾佛教教派的統治地位，但得銀協巴勸止了他。但陳學霖認為幾乎沒有證據可以證明這曾是皇帝的意圖。陳學霖認為永樂皇帝對得銀協巴的邀請主要是出於宗教目的。其他可能的目的或者還有依靠噶瑪巴活佛幫助皇帝合法化他備受爭議的繼位方式。和表現他對其父母[[明太祖]]夫婦的思念和孝心。蔡石山還認為得銀協巴通過卜吉預凶的手法，顯示上天支持永樂皇帝對明朝皇位的繼承，以此來幫助證明其皇位的正統性。
[[File:Karmapa.png|thumb|left|400px|成化皇帝頒給噶瑪巴的敕諭]] 《法主歷輩噶瑪巴傳略如意寶樹》中記載：「一般來說，除了漢地的皇帝以外，其他人無權委派官吏。但是皇帝考慮到漢藏兩地距離遙遠，所以授權法主得銀協巴可以委派法主的拉德和米德的官員，並說皇帝對法主給以支持。此外還任命了國師和司徒等官職。」
1415年8月15日，得銀協巴突患重病而去世，第六世活佛[[第六世噶瑪巴·通瓦敦殿|通哇敦丹]]繼承「大寶法王」的封號。從1426年到1450年的二十多年中，通哇敦丹先後八次遣使向明朝進貢，明朝曾召請他進京，但未能成行。1426年四月甲申，「賜如來大寶法王等使臣指揮使公哥等。金織文綺、襲衣等物有差。」當時通哇敦丹年僅十一歲，由詔書可見明朝承認他自動地繼承了得銀協巴的「大寶法王」的封號。
1471年，七世噶瑪巴[[第七世噶瑪巴·確札嘉措|卻紮嘉措]]派人向成化皇帝進貢佛像。皇帝為此頒賜詔書，曰：「皇帝聖旨，諭烏思藏大寶法王噶瑪巴為首之人眾：你等世代居住西土，順合天意，恭敬朝廷，謹守職司，獻納貢品，歷時已久，今更勤謹。此次複潛使者來，貢獻方物，如是忠順之心，殊堪嘉獎。今值使者返回，賞賜爾等綢緞等物，以表朕回報之意，使到之日，可自領受。…成化七年正月二十九日」  [[Category:明朝治藏历史| ]] [[Category:汉藏关系]]