2019冠狀病毒病日本疫情
本條目解說2019冠狀病毒病疫情在日本的狀況。疫情於2019年末在中華人民共和國湖北省武漢市爆發後，對日本的影響主要產生於2020年及2021年。全國47個都道府縣確診個案總數已超過132萬。
2020年1月9日，世界衛生組織（WHO）發声明，指中国武漢市出現肺炎的聚集性個案，厚生勞動省在官網上將其表述成「武漢肺炎」（-{武漢肺炎}-／-{ぶかんはいえん}- "" ）的個案。
2月1日，「將新型冠狀病毒感染症定為指定感染症等的政令」生效，法律上的疾病名為「新型冠狀病毒感染症」（-{新型コロナウイルス感染症}-／-{しんがたコロナウイルスかんせんしょう}- "" ）。厚生勞動省、日本感染症学会亦如此稱呼。此前，内閣官房曾將其稱為“新型冠状病毒相關感染症”（-{新型コロナウイルスに関連した感染症}-）。2月11日，世界衛生組織（WHO）將疾病命名為「COVID-19」後，醫療相關組織有時會寫作「新型冠狀病毒感染症（COVID-19）」（-{新型コロナウイルス感染症（COVID-19）}-）。
傳媒方面，常簡稱「新型病毒肺炎」（-{新型ウイルス肺炎}-／-{しんがたウイルスはいえん}- "" ）、「新型肺炎」、「新型冠狀病毒」（-{新型コロナウイルス}-）。此外，亦常縮寫稱為「新型冠狀」（-{新型コロナ}-）。
2020年1月16日，日本政府公布，一名住在神奈川縣的30多歲中國籍男性從中國武漢返回後確診，為全國首宗確診個案，標誌第一波2019冠狀病毒病（COVID-19）疫情到來。2月13日，神奈川縣出現全國首宗死亡個案。3月11日至23日，來自歐美的旅客及回國者又引發第二波疫情。4月3日，国内確診個案超過3,000宗。5月3日，国内確診個案超過15,000宗。国立感染症研究所表示，3月後在日本肆虐的病毒大部分來源是歐洲型，武漢型病毒已於3月起逐漸消失。
日本政府已採取各種措施，嘗試阻止及緩和疫情。1月27日，新型冠狀病毒感染症成為。1月30日，首相安倍晉三設立全國對策本部，討論政府如何應對疫情。2月26日，政府請求全國活動中止或縮小規模；2月27日，請求全国小學、初中及高中至4月初。隨著東京都及周邊各縣確診個案激增，當地公立及私立高中大多延長停課至5月31日。
3月1日，厚生勞動省表示健身房、屋形船、自助餐、麻雀館等地發生群聚感染，呼籲不要去「通風不暢的人多地方」（參見「3密」）。醫院內亦有發生傳染事件（院内感染）。3月10日，本次疫情的政府應對措施被指定為歷史的緊急事態，政府有義務記錄会議議事錄等資料，方便將來作出檢討。3月13日，參議院通過，令新型流行性感冒等對策特別措置法可適用於新型冠狀病毒感染症。
受疫情影響，3月11日，東京迪士尼度假區及日本環球影城決定維持關閉，直至另行通知。3月16日，調查顯示，70%的民眾並不期望東京奧運如期舉行。日本政府及國際奧林匹克委員會商討後決定，將原定該年8月在東京舉行的2020年夏季奧運延後至2021年舉行，惟未否認完全取消的可能性。
4月7日，日本政府對東京都、神奈川縣、埼玉縣、千葉縣、大阪府、兵庫縣及福岡縣發布緊急事態宣言，級別等同其他國家的緊急狀態，為期一個月；同月16日，緊急事態宣言發布範圍擴大到全國。截至該年5月，全國疫情仍在擴大，不過新增個案已轉趨減少。5月14日，日本政府解除全國47個都道府縣中39縣的緊急事態宣言，佔全國人口的54%。5月21日，解除大阪府、京都府、兵庫縣的緊急事態宣言。5月25日，所有都道府縣的的緊急事態宣言均告解除。
有醫學專家及傳媒批評政府，稱日本的COVID-19檢測標準過於嚴格，數量亦相對較低。向政府提供建議的醫學專家則認為，應依靠國家的肺炎監測系統，識別及治療重症患者。日本未有進行準確反映所有感染人口的計劃性檢查，5月2日，的研究團隊發表報告，指抽血檢測1000名在4月7日前8日內就診的門診患者後，發現有2.7%的樣本帶有抗体，曾經感染武漢肺炎，推算約150万名神戶市民中，有41,000人曾受感染。5月12日-6月8日，軟銀集團對公司員工及医療機構人員44,066人進行抗体檢測，當中有0.43％的樣本呈陽性（191份）（樣本為自願提交，非隨機採樣）。檢測樣本中有5,850份屬於医療人員，陽性率為1.79％，其他樣本的陽性率則為0.23％。
截至2020年6月，各地方自治体計算「新型冠狀病毒感染症疫情死亡個案」時，採用的標準並不統一。不過，日本的死亡個案佔人口比例在已發展國家中仍然處於低水平，比英國低70多倍，比美國低40多倍。研究人員分析日本的低死亡率後，認為政府應對，較溫和的病毒變異株，社區免疫的社會效應，及戴口罩等文化習慣，用消毒裝置洗手，基因特質提供的保護，及強制接種卡介結核疫苗帶來的相對免疫力，均可能是原因之一。
7月29日，岩手縣出現2名確診個案，至此，疫情已擴散至日本全國。
因日本官方已說明停泊於橫濱港的國際郵輪鑽石公主號人員並未入境，不計入國內個案，故需分開計算。 2020年3月30日，日本医師会在記者会上指，有愈來愈多的專家覺得「最好發出緊急事態宣言」。至於東京都應何時發出緊急事態宣言，應考慮1日新增確診個案是否超過100宗，感染路徑不明者的比例，患者数與病床数的平衡等條件。
4月1日，日本医師会再次表示應當發出緊急事態宣言。横倉義武会長稱「欧美各國疫情不斷擴大，如若大意，日本也會變成同樣状況」 讀賣新聞 2020年4月2日閲覽。。4月7日，安倍首相引用修例後的新型流行性感冒等對策特措法，向7個都道府縣發出緊急事態宣言。
4月9日，愛知縣的大村知事表示翌日將發出緊急事態宣言，並於4月10日發布愛知縣的緊急事態宣言。與愛知縣相鄰的岐阜縣亦於4月10日自行發出相當於縣緊急事態宣言的非常事態宣言。發出緊急事態宣言後，自治体會依照宣言，在各自治体內實施緊急事態措施，發出停業及自我約束請求。
4月7日緊急事態宣言發出後，愛知縣及京都府請求加入宣言生效區域。菅官房長官則在4月9日及10日的記者会上稱「對於愛知縣等自治体，現時還未到要加入對象地域的地步」。
2021年1月7日，日本首相菅义伟发布“紧急事态宣言”，宣佈东京都和埼玉、千叶、神奈川3县从1月8日起进入为期一个月的紧急事态。1月13日，紧急状态区域擴大至其他7个都道府县。2月28日起，大阪府等6地解除紧急状态，东京都等4地仍然维持紧急状态。3月21日，东京、埼玉、千叶、神奈川的新冠疫情紧急事态宣言解除。
2021年4月23日，鉴于变异病毒导致的感染加剧，日本首相菅义伟发布疫情爆发以来的第三次“紧急事态宣言”，宣布东京都、大阪府、京都府、兵库县等4个都府县进入紧急事态，时间从4月25日持续到5月11日。5月7日，日本政府决定把向东京、京都、大阪、兵库4都府县的紧急事态宣言的期限延长至31日，并追加爱知、福冈两县納入紧急事态宣言地區。5月14日又追加北海道、冈山和广岛。5月23日，緊急事態宣言擴大至冲绳县。5月28日，日本9地的紧急事态宣言延长至6月20日。7月12日至8月22日，東京都第四次進入緊急狀態。8月2日至31日，神奈川县、千叶县、埼玉县和大阪府進入紧急状态。茨城县、栃木县、群马县、静冈县、京都府、兵库县和福冈县从8月20日起进入紧急状态，截止日期为9月12日。8月27日起，北海道、宫城县等8地進入紧急状态。
4月9日，與發表声明，指「已實際感受到急救医療体制的崩潰」。聲明表示，醫院未能接收有發燒等症狀的急救病人，大部分情況都只能安置在救急救命中心，令中心無法接收重症急救患者。
4月26日，日本医師会会長横倉義武強烈擔憂，福岡縣「再差一步即進入」，並指出「3月20日左右即呼籲增加病毒檢測能力，但政府沒甚麼動作」，政府的緊急事態宣言「要是再早點做出判断就好了」。5月26日，日本經濟新聞編輯委員矢野寿彦在同報刊文，認為日本的確診個案及死亡個案等数值與台湾及韓国等相比並不遜色，不過日本應對時不注重數據，措施不盡合理及欠缺連貫，需要分析成功的原因。
6月14日，財務大臣麻生太郎在参議院財政金融委員会回答質詢時，談及日本死亡個案少的原因，指「（海外）有電話打來（問原因），我說是国民質素不同，大家就不說話了」，認為原因在於国民的合作。
新型冠狀病毒感染症對策專門家会議的状況分析指，截至4月22日，每日新增確診個案已達至455宗，累計確診個案於4月20日超過10,200宗。超過7成的新增個案位於重点實施抗疫政策的13個特定警戒都道府縣（北海道、茨城縣、埼玉縣、千葉縣、東京都、神奈川縣、石川縣、岐阜縣、愛知縣、京都府、大阪府、兵庫縣及福岡縣），當中約8成個案感染路徑不明。3月23日時，有近4成国内個案相信是由海外傳入引發，這一比例於4月起約3個星期已降至0.65%左右。 搭載著3711人（含船員）的豪華郵輪「鑽石公主號」（ 英國倫敦籍），2月3日晚上在橫濱港靠岸。由於船上曾經有一名80歲的香港男子被確診感染新型冠狀病毒，日本厚生勞動省2月3日開始對郵輪實施大規模檢疫。
直至3月2日，船上共公布706人次感染新型冠状病毒，其中至少277人是日本人。有14名美國人在2月17日的美國撤僑包機起飛前確診感染。
3月5日，厚生勞動省公布再多8人於3月1日船上所有人下船後，在政府設施隔離時確診感染，但由於此前統計人數有重複，乘客及船員（除已被撤僑人士等）接受檢測的3618人中，算上這8人，實際感染人數為696人（不含回家或被撤僑後確診人士），當中410人是無症狀感染者。另有1名船員是在郵輪入橫濱港後登船被感染，不計入這696人中。
3月12日，公布再多1名日本人船員確診，郵輪個案增至697宗。新增個案是20餘歲女性，船上為陰性，在埼玉縣和光市的政府隔離設施再測呈陽性。
3月15日，公布再多15宗確診個案，7人是無症狀感染者。船上乘客至今已有11人染病不治，其中7人是日本人。
2月20日，公布2名日本乘客確診感染後不治，亦是郵輪首次有乘客不治。其中一人是住在神奈川縣的87歲男性，10日開始發燒，翌日呼吸困難，下船治療；15日呼吸惡化，插喉，19日血壓降低，呼吸進一步惡化，20日確認死亡，死因為新型冠状病毒及自身的哮喘疾病，是首宗正式死因確定為感染新型冠状病毒的個案。另一人是住在東京都的84歲女性，因持續發燒，12日下船治療，呼吸狀態惡化後，14日開始戴氧氣罩，20日確認死亡，死因為肺炎。厚生勞動省指2人可能是在2月5日前感染。
2月23日，1名曾乘船的80餘歲日本男性死亡，郵輪乘客死亡個案增至3宗。死者有自身疾病，2月5日後，因出現症狀，送院治療，23日不治，死因為肺炎。厚生勞動省一度因未取得家屬同意，未公開他是否感染新型冠状病毒，後於25日證實他有感染。
2月25日，1名住在東京都的86歲日本男性死亡，郵輪乘客死亡個案增至4宗。死者有糖尿病，因出現症狀，2月9日送院治療，翌日確認感染新型冠状病毒。25日不治，死因為肺炎。
2月28日，1名住在東京都的70餘歲日本女性死亡，郵輪乘客死亡個案增至5宗。死者有高血壓及糖尿病，2月6日確診，翌日送院治療。28日不治，死因為肺炎。
3月23日，公布再多2名70餘歲日本男性於22日死亡，郵輪的日本乘客死亡個案增至7宗。
以下截至3月15日。
2020年2月8日，在中國武漢住院的60多歲日本人患者死亡。1月16日左右開始發燒，22日入院，在武漢的醫院診斷為肺炎，1月28日新型冠狀病毒測試呈陽性，高度懷疑感染，但未等到最終確診結果即去世，死因被定義為「病毒性肺炎」。2月10日，中華人民共和國外交部在記者會上介紹感染新型冠狀病毒的在華外國人死亡個案時將其包含在內，但未有回答他是否已確診。
2月4日，泰国当局宣布新增6起确诊病例。泰国卫生部表示，4名泰国人中，有一对曾到日本旅游的情侣。
2月28日，馬來西亞公布一宗日本人個案（馬來西亞個案#24），為住在當地的41歲女性。一名女患者1月时在日本，2月曾到印尼。2月17日开始发烧，20日因肠胃不适且有脱水现象而被送往吉隆坡班台医院（马来语：Hospital Pantai Kuala Lumpur）。其后她病情变化并开始出现COVID-19症状，26日诊治医师安排她进行检测，27日确诊感染COVID-19。
2月28日下午，大韓民國大邱市確診全國首宗日本人個案，為住在當地的50多歲女性。
3月2日上午在雅加达总统府向媒体证实，有2名印尼公民在COVID-19病毒检测中呈阳性。佐科通报称，两名病患为一对年龄分别为64岁和31岁的母女，二人曾与一名已被确诊为COVID-19病例的日本公民接触。
3月13日，埃塞俄比亚确诊该国首例COVID-19病例，为一名日本人。
3月15日，新增3例确诊病例，2名为日本人，1名为本国人。3人均为13日确诊病例的密切接触者。国立感染症研究所「-{病原体検出マニュアル　2019n-CoV Ver2.7}-」 2020年2月25日